Для начала создайте кристаллы внутри пластин NC2. Затем войдите в систему I-SPY B, используя предоставленный идентификатор Diamond Fed ID, и выберите Proposals. Прокрутите список или введите номер предложения в строку поиска, чтобы найти нужное предложение.
Как только предложение будет найдено, выберите отгрузку из выпадающего меню под номером предложения. Откроется окно отправления, в котором будут отображены все отправления, связанные с предложением. Чтобы создать новое отправление, нажмите кнопку «Добавить отправление» в правом верхнем углу экрана и введите название отправления.
Затем выберите автоматизированный имидж-сканер и нажмите кнопку «Добавить отправление» в левом нижнем углу экрана, чтобы подтвердить отправку. Перейдите в окно отправления и нажмите «плюс добавить контейнер», после чего появится страница добавления контейнера. Теперь выберите подходящий тип пластины в раскрывающемся меню типа контейнера.
Введите штрих-код и название контейнера в соответствии с инструкциями персонала пучковой линии для экспериментальных пластин. Выберите имидж-сканер VMXi 20 градусов Цельсия из выпадающего меню запрошенного тепловизора, а затем выберите график визуализации Фибоначчи в раскрывающемся меню графика визуализации. В раскрывающемся меню экрана кристаллизации выберите экран кристаллизации.
Затем выберите правильное имя пользователя из выпадающего меню владельца. Нажмите «Просмотр» и введите точный контактный адрес в поле электронной почты. Введите сведения о табличке в поле для комментариев.
Выберите соответствующий образец из выпадающего меню белка и используйте аббревиатуру, зарегистрированную в UAS и одобренную Diamond в экспериментальном предложении. Введите то же имя в поле имени образца, а остальные поля оставьте пустыми. Щелкните значок пластины с плюсом, чтобы повторить образец на всю пластину и заполнить весь контейнер зелеными квадратами.
Нажмите плюс добавить контейнер в нижней части страницы, чтобы зарегистрировать табличку. Перенесите пластину в соответствующий тепловизор, где она будет храниться и получать изображения. Визит будет сгенерирован, когда контейнер будет сохранен в имидж-сканере, а пользователь получит электронное письмо со ссылкой на табличку и ее изображения.
Чтобы просмотреть результаты визуализации, перейдите к интересующему вас предложению. Выберите контейнеры в раскрывающемся меню под номером предложения и просмотрите список доступных контейнеров. Выберите фильтр, пластины, если присутствуют другие типы держателей образцов.
Чтобы сузить область поиска, используйте параметр Мой контейнер, чтобы отобразить только релевантные контейнеры, связанные с текущим идентификатором пользователя. Наведите курсор на строку и щелкните левой кнопкой мыши, чтобы выбрать нужный контейнер. После этого появится новое окно, показывающее обзор пластины.
Выберите каплю в левой части представления пластины, чтобы просмотреть ее недавнее изображение. Перемещайтесь между каплями с помощью клавиш со стрелками или выбирайте их по отдельности с помощью мыши или курсора. Чтобы вручную добавить точки для сбора данных, нажмите кнопку плюсовой точки.
Наведите курсор на нужную точку интереса. Сделайте выбор и дождитесь появления красного крестика. После того, как все точки отмечены, нажмите кнопку «плюс финиш».
Нажмите кнопку с плюсиком, чтобы добавить регионы для сбора данных с помощью сканирования сетки. Щёлкните по верхней левой точке, перетащите её вниз вправо, чтобы создать область, которая будет сканироваться на линии луча. Нажмите кнопку «Плюс готово» после того, как все нужные области будут установлены.
Обратите внимание на синие крестики на изображениях капель, которые представляют собой кристаллические объекты, автоматически обнаруженные CHIMP. Чтобы просмотреть оценку CHIMP для кристаллизационных капель, установите флажок «Показать автоматические баллы» и выберите кристалл в раскрывающемся списке классов. После того, как все точки и регионы будут отмечены в отношении дропов, нажмите кнопку «Подготовиться к сбору данных» внизу страницы.
Просмотрите список предварительно выбранных или автоматически идентифицированных образцов. Чтобы добавить отдельные точки или области, нажмите кнопку с плюсом или нажмите кнопку добавить текущую страницу в очередь, чтобы добавить все отображаемые выборки. Затем щелкните фильтр точек и установите флажок Выбрать все, чтобы применить одни и те же параметры ко всем выборкам в текущем списке образцов в очереди.
Используйте фильтры для точки, региона, вручную и авто. Для регионов выберите сканирование сетки, цифровой мультиметр с шагом 10 микрон, 100% передача. Для других точечных экспериментов выберите соответствующие параметры в раскрывающемся меню.
Для сбора данных об осцилляциях выберите цифровой мультиметр с омега-сканированием 10 градусов, 10% передачи, чтобы максимально увеличить сбор данных. После выбора правильных параметров эксперимента для всех образцов нажмите кнопку контейнера очереди. Как только планшет достигнет верхней части очереди, он будет представлен в Beamline для сбора данных, а затем возвращен в хранилище образцов.
Затем найдите электронное письмо со ссылкой для доступа к соответствующим данным. Выберите пример управления группами в раскрывающемся меню под номером предложения и найдите список групп, если другие пользователи уже создали их. Чтобы создать новую группу, нажмите кнопку плюс создать образец группы.
Щелкните отправление в раскрывающемся меню на странице создания группы образцов, чтобы просмотреть образец. После нажатия на контейнер найдите график, показывающий обзор пластины. Нажмите на отдельную каплю или соответствующую букву строки или номер столбца.
После выбора всех скважин, связанных с отдельной группой, введите имя группы в поле Имя группы образцов и нажмите кнопку Сохранить группу образцов. Нажмите кнопку Просмотреть группу выборки на этой странице, чтобы вернуться к списку уже созданных групп выборок, связанных с предложением, и продолжить обработку данных.
