Для начала откройте программное обеспечение для анализа данных. В левом верхнем углу нажмите на кнопку «Файл» и выберите «Открыть». Чтобы выбрать нужные файлы, щелкните правой кнопкой мыши по имени файла и выберите свойства.
Затем выберите состояние калибровки. В выпадающем списке выберите внутреннюю калибровку для масс-спектрометра. Убедитесь, что все ошибки имеют значение менее одной части на миллион.
После этого выберите внутреннюю калибровку мобильности и убедитесь, что погрешность составляет менее одной части на миллион. Затем щелкните правой кнопкой мыши по хроматограмме и выберите «Редактировать хроматограмму». В поле «Тип» нажмите на выпадающее меню и выберите «Извлеченная ионная хроматограмма».
В разделе Фильтр выберите все МС, а в режиме сканирования выберите все, чтобы увидеть пики интересующей молекулы, а не только ее фрагменты. Существует два варианта фильтра для выбора молекулы: массы или формулы. Если выбраны массы, выберите теоретическое значение M вместо Z интересующей молекулы, которое в данном случае равно 829,7985.
Если выбрана формула, выберите формулу для молекулы и интересующей формы ионов, которыми в данном случае является аммоний. Для ширины выберите плюс или минус один. Что касается полярности, убедитесь, что она поддерживает положительный режим.
В разделе Подвижность выберите значения от 1,455 до 1,465, чтобы изолировать интересующую молекулу и отфильтровать молекулы, не попадающие в эти значения. После выбора параметров нажмите «Изменить», а затем «ОК» в правом верхнем углу. Через короткое время программное обеспечение обработает выборку и выведет хроматограмму.
Щелкните правой кнопкой мыши на базовой линии начала координат интересующего пика и перетащите, удерживая его до конца, чтобы получить живой массовый спектр фрагментов в течение этого времени удержания. Щелкните правой кнопкой мыши в левой части экрана на мобилограмме и выберите «Редактировать мобилограмму». Появится окно с именем «Редактировать трассы мобилограммы».
Выполните действия, описанные ранее. В качестве времени хранения введите время хранения пика интереса. Выбрав параметры, нажмите «Добавить» и нажмите «ОК» в правом верхнем углу.
Подождите, пока программное обеспечение обработает выборки и выведет хроматограмму. Для извлечения ионов повторяйте шаги, показанные ранее, до тех пор, пока не будет сформирован список ионов. В нижней части окна MS выберите профиль MS и фрагмент MS, чтобы обеспечить спектральное представление ионов при полном сканировании и пассивном сканировании.
Для просмотра спектра щелкните правой кнопкой мыши и выберите «Копировать составные спектры». Данные о спектре, которые отображаются справа, могут предоставить дополнительную информацию о соединении, такую как разрешение, разрешающая способность, интенсивность и отношение сигнал/шум. Чтобы обработать данные, вручную интегрируйте хроматограмму и пики подвижности, чтобы получить ценную информацию об интересующей молекуле.
Щелкните правой кнопкой мыши, найдите и выберите соединения вручную, хроматограмму или мобилограмму. Щелкните левой кнопкой мыши и выделите нужную вершину. Полученная информация включает в себя время удержания, площадь, соотношение сигнал/шум и мобильность.