Интеграция работы молекулярной сети в 2D-ВЭЖХ-МС для анализа образцов маятникового аконита

Чтобы начать подготовку данных, экспортируйте необработанные масс-спектральные данные 2D ВЭЖХ-МС. Затем для подключения к FTP-серверу GNPS в интерфейсе WINSCP на странице Session Configuration введите информацию о подключении. После заполнения информации нажмите кнопку «Старт» для установки соединения с FTP-сервером GNPS.

Создавайте молекулярные сети, открывая веб-браузер и посещая веб-сайт GNPS. Новым пользователям необходимо зарегистрировать учетную запись, а затем войти в систему. В главном интерфейсе веб-сайта GNPS нажмите «Создать молекулярную сеть» в разделе «Анализ данных».

На странице Создание задачи нажмите кнопку выбора входных файлов, затем выберите и загрузите файл данных. На вкладках Опции рабочего процесса задайте различные параметры, которые генерируют молекулярную сеть или MN. Эти параметры включают алгоритм извлечения пиков, значение пика над ходом, метод вычисления сходства и так далее. После внесения соответствующих настроек параметров по мере необходимости нажмите кнопку «Отправить» внизу страницы, чтобы запустить задачу.

После выполнения задачи найдите созданные задачи на вкладке Задания и нажмите на название рабочего процесса, чтобы просмотреть результаты анализа. На веб-сайте представлены диаграммы MN, заменители, симбиотические сети и другая связанная с этим информация. Четырьмя алкалоидными компонентами в образцах APB, идентифицированных MN, были аконитин, 14-бензоиллаконин, 14-O-ацетилнеолин и гипаконитин.

Четыре соединения имели одно и то же родительское ядро. Аконитин, 14-бензилаконин, 14-бензоиллаконин и гипаконитин были похожи, различались только заместители.