Секвенирование и идентификация многовидовой биопленочной микробиоты из образцов ризосферы

Для начала создайте многовидовую биопленку ризосферы и получите суспензию клеток микробиоты. Смешайте триптих соевый отвар с минимальным количеством солей глицерина, глутаматной среды в соотношении один к одному. Инкубируйте клеточную суспензию в среде при температуре 30 градусов Цельсия в течение ночи, чтобы активировать бактерии.

Поместите фильтры из нейлоновых элементов 100 микрометров на 24-луночную пластину. Инокулируйте бактериальную суспензию в три реплики и культивируйте биопленку пленки в течение 36 часов при температуре 30 градусов Цельсия. Снимите фильтр, содержащий биопленку пленки, и добавьте два миллилитра буфера PBSS в новую 24-луночную клеточную пластину.

Поместите фильтр в пластину, чтобы промыть биопленку и удалить свободные клетки. После идентификации и культивирования основных пяти видов в биопленке инкубируют 31 комбинацию синтетических сообществ в среде. После указанной процедуры наблюдались значительные градиенты биопленкообразующей способности от микробиоты почвы ризосферы огурцов.

Биопленочное ампликонное секвенирование подтвердило наличие различных видов в пленке.