Чтобы начать слияние генов, связанных с заболеванием, поместите ранее сохраненные файлы TXT из пяти баз данных, содержащие название травы, идентификатор ингредиента, идентификатор гена и скрипт Disease. R в той же папке. Откройте код R.
Скопируйте и вставьте путь, по которому хранится файл TXT, в строку, где находится setwd в коде R. Откройте программу R. Запустите измененный код R и нажмите кнопку Сохранить.
Установите ген и назовите файл Disease.txt. Откройте веб-сайт диаграммы Венна. В разделе Ввод скопируйте и вставьте уже сохраненное текстовое содержимое в список.
Присвойте содержимому имя в соответствии с соответствующей базой данных. и нажмите кнопку Отправить. Нажмите «Сохранить изображение как PNG» под изображением и сохраните текстовый результат в той же папке.
Разместите символ alltargets.. txt и болезнь. txt в той же папке.
Откройте код R. Скопируйте и вставьте путь, по которому хранится файл txt, в строку, где находится setwd в коде R. Откройте программу R.
Запустите измененный код R и нажмите кнопку Сохранить. Установите ген и назовите файл Drug_Disease.txt. Откройте веб-сайт диаграммы Венна.
В разделе Ввод скопируйте и вставьте символ alltargets.symbol. txt и болезнь. txt в список и назовите файлы.
Нажмите «Сохранить изображение в формате PNG» под изображением и сохраните текстовые результаты в той же папке. Откройте веб-сайт строки и нажмите Multiple protein. Нажмите «Обзор» и загрузите DrugDisease.
txt файл. затем выберите Homo sapiens в разделе «Организмы». Нажмите ПОИСК, а затем ПРОДОЛЖИТЬ.
Теперь нажмите «Настройки» и установите минимально необходимую оценку взаимодействия на наивысшую степень достоверности. В опции «Отображение сети» установите флажок «Скрыть отключенные узлы в сети», затем нажмите «ОБНОВИТЬ>Настроить узлы на схеме сети так, чтобы не было перекрытия или перекрытия». Нажмите «Экспорт», а затем «Загрузить как растровое изображение с высоким разрешением», чтобы получить карту взаимодействующей сети белков в формате PNG, Загрузите файл TSV в виде короткого табличного текста.
Сохраняйте файлы PNG и TSV в единой папке.