Настройка фазового контрастного анализа изображений для непрерывного мониторинга кинетики и роста нейритов

Для начала просканируйте сосуд и получите изображения. Выберите отсканированный сосуд для анализа. Выберите Запустить анализ, а затем Создать новое определение анализа.

Выберите Neurotrack. Затем выберите Каналы изображений. После этого выберите репрезентативный набор изображений для выполнения анализа.

Затем перейдите в раздел Настройка сегментации и с помощью ползунка настройте чувствительность сегментации в сторону большего количества фона или большего количества ячеек. Для очистки отрегулируйте всю заливку, чтобы удалить все отверстия в маске тела ячейки, размер которых меньше области, указанной пользователем. Чтобы настроить размер, увеличьте или уменьшите желтую маску на указанное количество пикселей.

Выберите минимальное значение ширины ячейки, чтобы определить размер, при котором тела клеток будут считаться нейритами. Установите минимальное и максимальное значение площади тела клетки. Чтобы уменьшить маскировку дефектов небольших судов и мусора, выбирайте между вариантами «Нет», «Лучше» и «Лучший».

Затем увеличьте чувствительность для обнаружения более мелких нейритов. Нажмите кнопку Предварительный просмотр текущего изображения, чтобы визуализировать сегментированное изображение. После уточнения настроек для всех выбранных изображений нажмите «Далее».

Выберите время сканирования и колодец для анализа. Назначьте имя определения и, при необходимости, примечания к анализу. Нажмите «Далее» и «Завершить».