В центре внимания автора: Оптимизация визуальной динамики для упрощения моделирования молекулярной динамики с помощью Gromacs

Наша цель — предоставить академическому сообществу инструмент, облегчающий подготовку и моделирование с использованием молекулярной динамики. Можно ли предусмотреть эту цель в нашем веб-приложении? Можно ли новичку эффективно им пользоваться?

Мы стремимся ответить на эти вопросы с помощью нашего программного обеспечения. Молекулярная динамика сопряжена со многими проблемами. Среди них выделяются подготовка к параметризации лигандов, кривая обучения рекомендациям по моделированию, время моделирования и проведение нового анализа.

В основном мы рассматриваем кривую обучения для начала исследований по созданию секретного конвейера, который будет направлять всех пользователей, от начинающих до продвинутых. Высокий спрос на доступ к этому инструменту свидетельствует о пробеле в исследованиях в области бионауки. Мы считаем, что разработка этого инструмента представляет собой значительный прогресс в использовании и изучении молекулярной динамики.

Следовательно, больше людей смогут использовать эти тесты в своих исследованиях. В будущем мы планируем расширить возможности параметризации и выполнения сложного моделирования с большим количеством силовых полей.