Summary
Abstract
Introduction
Protocol
Representative Results
Discussion
Acknowledgements
Materials
References
Bioengineering
פרוטוקול זה מתאר את טכניקות המיקרו-פבריקציה הנדרשות לבניית התקן אלקטרופורציה מיקרופלואידי במעבדה על שבב. מערך הניסוי מבצע טרנספקציות מבוקרות ברמת תא בודד בזרימה רציפה וניתן להרחיב אותן לתפוקות גבוהות יותר עם בקרה מבוססת אוכלוסייה. ניתן ניתוח המציג את היכולת לעקוב באופן חשמלי אחר מידת החדירה של קרום התא בזמן אמת.
החידושים הטיפוליים הנוכחיים, כגון טיפול בתאי CAR-T, מסתמכים במידה רבה על העברת גנים בתיווך ויראלי. למרות יעילותה, טכניקה זו מלווה בעלויות ייצור גבוהות, מה שהביא להתעניינות בשימוש בשיטות חלופיות להעברת גנים. אלקטרופורציה היא גישה אלקטרו-פיזיקלית, לא ויראלית, להעברה תוך-תאית של גנים וחומרים אקסוגניים אחרים. עם יישום שדה חשמלי, קרום התא מאפשר באופן זמני העברה מולקולרית לתוך התא. בדרך כלל, אלקטרופורציה מבוצעת בקנה מידה מאקרו כדי לעבד מספר גדול של תאים. עם זאת, גישה זו דורשת פיתוח פרוטוקול אמפירי נרחב, שהוא יקר כאשר עובדים עם סוגי תאים ראשוניים וקשים להעברה. פיתוח פרוטוקולים ממושך, יחד עם הדרישה למתחים גדולים כדי להשיג עוצמות שדה חשמלי מספיקות כדי לחדור לתאים, הובילו לפיתוח התקני אלקטרופורציה בקנה מידה זעיר. התקני מיקרו-אלקטרופורציה אלה מיוצרים בטכניקות מיקרו-פבריקציה נפוצות ומאפשרים בקרה ניסיונית רבה יותר עם פוטנציאל לשמירה על יכולות תפוקה גבוהות. עבודה זו מתבססת על טכנולוגיה מיקרופלואידית-אלקטרופורציה המסוגלת לזהות את רמת החדירה של קרום התא ברמת תא בודד תחת זרימה רציפה. עם זאת, טכנולוגיה זו הוגבלה ל -4 תאים מעובדים בשנייה, ולכן גישה חדשה להגדלת תפוקת המערכת מוצעת ומוצגת כאן. טכניקה חדשה זו, המסומנת כבקרת משוב מבוססת אוכלוסיית תאים, בוחנת את תגובת חלחול התא למגוון תנאי פעימת אלקטרופורציה וקובעת את תנאי פולס האלקטרופורציה המתאימים ביותר לסוג התא הנבדק. לאחר מכן נעשה שימוש במצב תפוקה גבוהה יותר, שבו הדופק 'האופטימלי' הזה מוחל על השעיית התא במעבר. השלבים לייצור המכשיר, להגדרה ולהפעלה של הניסויים המיקרופלואידיים ולניתוח התוצאות מוצגים בפירוט. לבסוף, טכנולוגיית מיקרו-אלקטרופורציה זו מודגמת על ידי העברת קידוד פלסמיד DNA עבור חלבון פלואורסצנטי ירוק (GFP) לתאי HEK293.
חידושים טיפוליים עכשוויים במחקר ביו-רפואי, כגון טיפול בתאי CAR-T (קולטן אנטיגן כימרי מהונדס) ועריכה גנטית באמצעות קריספר (רצפי דנ"א חוזרים פלינדרומיים קצרים בין-מרחביים באופן קבוע)/Cas9, מסתמכים במידה רבה על היכולת להעביר חומר אקסוגני הן בהצלחה והן ביעילות לחלל התוך-תאי1. בטיפול CAR-T, תקן הזהב לביצוע שלב העברת הגנים בייצור טיפול תאי הוא שימוש בווקטורים נגיפיים2. למרות שהעברת גנים בתיווך ויראלי היא שיטת העברה יעילה, יש לה גם כמה חסרונות. אלה כוללים עלויות ייצור, ציטוטוקסיות, אימונוגניות, פוטנציאל מוטגנזה/גידול ומגבלות גודל על הגנים שיסופקו3. מגבלות אלה הובילו למחקר ופיתוח של טכנולוגיות אספקה חלופי....
הערה: על המשתמשים לסקור את כל MSDS עבור החומרים והחומרים המתכלים המשמשים בפרוטוקול זה. יש ללבוש PPE מתאים בכל שלב וטכניקה סטרילית המשמשת במהלך הניסוי. סעיפים 1-7 דנים בייצור המכשיר.
1. ייצור מכשירים - עיצוב מסכה
הערה: עיין באיור 2 להמחשה של תה.......
איור 4 מדגיש את עקרונות הפעולה מאחורי זיהוי חלחול הממברנה ברמת התא הבודד עבור משרעת פעימה אחת. לאחר תחילת ניסוי האלקטרופורציה, אלגוריתם זיהוי התאים קובע סף אופטימלי לזיהוי תאים באמצעות שיטת זיהוי מבוססת שיפוע נקודה אחר נקודה. לאחר מכן המערכת מנטרת באופן רציף (1) אחר שינוי ש?.......
המתודולוגיה המוצגת בפרוטוקול זה מתמקדת בעיקר במיקרו-פבריקציה של התקן מיקרופלואידי המשולב לאחר מכן במערך ניסויי מיוחד של אלקטרופורציה. המונח 'מתכון', המשמש לעתים קרובות כאשר מתארים את הפרטים של תהליך המיקרו-פברייקציה, רומז על החשיבות של מעקב/אופטימיזציה של כל שלב כדי לייצר בהצלחה מכשיר מת.......
המחברים רוצים להודות על תמיכה כספית של הקרן הלאומית למדע (NSF CBET 0967598, DBI IDBR 1353918) והכשרת הבוגרים של משרד החינוך האמריקאי בתחומים מתפתחים של דיוק ורפואה מותאמת אישית (P200A150131) למימון הסטודנט לתואר שני J.J.S. על המלגה.
....Name | Company | Catalog Number | Comments |
150-mm diameter petri dishes | VWR | 25384-326 | step 6.1.1 to secure wafer |
24-well tissue culture plates | VWR | 10062-896 | step 10.3.6 to plate electroporated cells |
33220A Waveform/Function generator | Agilent | step 9.2.3 electroporation pulse generator | |
4'' Si-wafers | University Wafer | subsection 2.1 for microfluidic channel fabrication | |
6-well tissue culture plates | VWR | 10062-892 | step 8.1.8 to plate cells |
Acetone | Fisher Scientific | A18-4 | step 2.1.2 for cleaning and step 5.1 photoresist lift-off |
Allegra X-22R Centrifuge | Beckman Coulter | steps 8.1.4 , 8.3.2. and 8.3.3. to spin down cells | |
AutoCAD 2018 | Autodesk | subsection 1.1. to design transparency masks | |
Buffered oxide etchant 10:1 | VWR | 901621-1L | subsection 3.1 for HF etching |
CCD Monochrome microscope camera | Hamamatsu | Orca 285 C4742-96-12G04 | step 11.2.3. for imaging |
CMOS camera- Sensicam QE 1.4MP | PCO | subsection 9.3 part of the experimental setup | |
Conductive Epoxy | CircuitWorks | CW2400 | subsection 7.6. for wire attachement |
Conical Centrifuge Tubes, 15 mL | Fisher Scientific | 14-959-70C | step 8.1.4. for cell centrifuging |
Dektak 3ST Surface Profilometer | Veeco (Sloan/Dektak) | step 2.1.15 and 5.4 for surface profilometry | |
Disposable biopsy punch, 0.75 mm | Robbins Instruments | RBP075 | step 6.2.3 for inlet access |
Disposable biopsy punch, 3 mm | Robbins Instruments | RBP30P | step 6.2.3 for outlet access |
DRAQ5 | abcam | ab108410 | step 11.2.2. for live cell staining |
Dulbecco’s Modified Eagle’s Medium | ThermoFisher Scientific | 11885084 | step 8.1.2. part of media composition |
E3631A Bipolar Triple DC power supply | Agilent | step 9.2.1.-9.2.2.part of the experimental setup | |
Eclipse TE2000-U Inverted Microscope | Nikon | subsection 9.3. part of the experimental setup | |
EVG620 UV Lithography System | EVG | step 2.1.9. and 2.2.7. for UV Exposure | |
Fetal Bovine Serum | Neuromics | FBS001 | step 8.1.2. part of media composition |
FS20 Ultrasonic Cleaner | Fisher Scientific | subsection 5.1. for photoresist lift-off | |
Glass Media Bottle with Cap, 100mL | Fisher Scientific | FB800100 | step 8.2.1. for buffer storage |
Glass Media Bottle with Cap, 500mL | Fisher Scientific | FB800500 | step 8.1.2.for media storage |
HEK-293 cell line | ATCC | CRL-1573 | subsection 8.1 for cell culturing |
HEPES buffer solution | Sigma Aldrich | 83264-100ML-F | step 8.2.1 part of electroporation buffer composition |
Hexamethyldisilazane | Sigma Aldrich | 379212-25ML | step 2.2.3 adhesion promoter |
HF2LI Lock-in Amplifier | Zurich Instruments | subsection 9.2 part of the experimental setup | |
HF2TA Current amplifier | Zurich Instruments | subsection 9.2 part of the experimental setup | |
Isopropyl Alcohol | Fisher Scientific | A459-1 | step 2.1.2 for cleaning, step 2.1.14 for rinsing wafer following SU-8 development, and step 6.3.1 for cleaning PDMS |
IX81 fluorescence microscope | Olympus | step 11.2.3 for imaging | |
L-Glutamine Solution | Sigma Aldrich | G7513-20ML | step 8.1.2. part of media composition |
M16878/1BFA 22 gauge wire | AWC | B22-1 | subsection 7.5 for device fabrication |
Magnesium chloride | Sigma Aldrich | 208337-100G | step 8.1.2 part of electroporation buffer composition |
MF 319 Developer | Kayaku Advanced Materials | 10018042 | step 2.2.9. photoresist developer |
Microposit S1818 photoresist | Kayaku Advanced Materials | 1136925 | step 2.2.4 positive photoresist for electrode patterning |
Microscope slides, 75 x 25 mm | VWR | 16004-422 | step 2.2.1 electrode soda lime glass substrate |
Model 2350 High voltage amplifier | TEGAM | 2350 | step 9.2.5. part of the experimental setup |
National Instruments LabVIEW | National Instruments | data acquisition | |
Needle, 30G x 1 in | BD Scientific | 305128 | step 10.1.1. part of the system priming |
PA90 IC OPAMP Power circuit | Digi-key | 598-1330-ND | Part of the custom circuit |
Penicillin-Streptomycin | Sigma Aldrich | P4458-20ML | step 8.1.2. part of media composition |
Plasmid pMAX-GFP | Lonza | VCA-1003 | step 8.3.4. for intracellular delivery |
Plastic tubing, 0.010'' x 0.030" | VWR | 89404-300 | step 10.1.2. for system priming |
Platinum targets | Kurt J. Lesker | subsection 4.2. for physical vapor deposition | |
Potassium chloride | Sigma Aldrich | P9333-500G | step 8.2.1. part of electroporation buffer composition |
Pump 11 PicoPlus microfluidic syringe pump | Harvard Apparatus | MA1 70-2213 | step 10.1.4. for system priming |
PVD75 Physical vapor deposition system | Kurt J. Lesker | subsection 4.1. for physical vapor deposition | |
PWM32 Spinner System | Headway Research | steps 2.1.6 and 2.2.2. for substrate coating with photoresist | |
PX-250 Plasma treatment system | March Instruments | subsection 7.2 for PDMS and glass substrate bonding | |
SDG1025 Function/Waveform generator | Siglent | step 9.2.2. part of the experimental setup | |
Sodium hydroxide | Sigma Aldrich | S8045-500G | step 8.2.1. part of electroporation buffer composition |
SU-8 2010 negative photoresist | Kayaku Advanced Materials | Y111053 | step 2.1.7. for microfluidic channel patterning |
SU-8 developer | Microchem | Y010200 | step 2.1.12. for photoresist developing |
Sucrose | Sigma Aldrich | S7903-1KG | step 8.2.1. part of electroporation buffer composition |
Sylgard 184 elastomer kit | Dow Corning | 3097358-1004 | step 6.2.1 10 : 1 mixture of PDMS polymer and hardening agent |
Syringe, 1 ml | BD Scientific | 309628 | step 8.3.4. part of system priming |
SZ61 Stereomicroscope System | Olympus | subsection 7.3. for channel and electrode alignment | |
Tissue Culture Treated T25 Flasks | Falcon | 353108 | step 8.1.2 for cell culturing |
Titanium targets | Kurt J. Lesker | subsection 4.2. for physical vapor deposition | |
Transparency masks | CAD/ART Services | steps 2.1.9. and 2.2.7. for photolithography | |
Trichloro(1H,1H,2H,2H-perfluorooctyl)silane | Sigma Aldrich | 448931-10G | step 6.1.2. for wafer silanization |
Trypsin-EDTA solution | Sigma Aldrich | T4049-100ML | steps 8.1.3. and 8.3.1. for cell harvesting |
ABOUT JoVE
Copyright © 2024 MyJoVE Corporation. All rights reserved