Hassas kesimli Canlı Pulmoner Dendritik Hücreler Visualize'a Fare Akciğer Dilimleri

Özet

Bu hassas kesim Akciğer dilimleri (PCLS) üretilmesi ve akciğerde çeşitli immün hücre tipleri lokalizasyonunu görselleştirmek için bunları immünolojik boyama için bir yöntem tarif eder. Bizim protokol, çeşitli koşullar altında konum ve birçok farklı hücre tiplerinin fonksiyonunu görselleştirmek için uzatılabilir.

Özet

alerjenler ve patojenlerin solunması akciğer immün hücre tiplerinde çeşitli birden çok değişiklik ortaya çıkarmaktadır. Akış sitometrisi bağışıklık hücreleri üzerinde hücre yüzey proteinlerinin kantitatif analizi için güçlü bir tekniktir, ancak bu akciğer içinde, bu hücrelerin lokalizasyonunda ve göç desen hakkında bilgi vermez. Benzer şekilde, kemotaksi deneyleri, in vitro olarak kemotaktik faktörlere yanıt hücrelerinin değişim potansiyelini araştırmak için yapılabilir, ancak bu deneyler, sağlam akciğer kompleks ortam yeniden yoktur. Bu yukarıda sözü edilen tekniklerin aksine, akciğer içinde tek tek hücre tiplerinde konumu hali hazırda ticari olarak temin edilebilir, flüoresan etiketli antikorlar ile boyanması, hassas-kesim Akciğer dilimleri (PCLS) üretilmesi ve konfokal mikroskopi ile bölümleri görselleştirme ile görselleştirilebilir. PCLS canlı her ikisi için kullanılan ve akciğer dokusunun sabit ve dilimler bütün bir lob kesiti kadar büyük alanları kapsayabilir edilebilir. Başarıyla dendritik hücrelerin farklı tipleri, makrofajlar, nötrofiller, T hücreleri ve B hücreleri gibi, örneğin lenfatik endotelyal gibi yapısal hücreleri dahil olmak üzere akciğerde hücre tipleri, çeşitli konumunu görselleştirmek için bu protokolü kullanılır, ve adres epitel hücreleri. Hücreler akciğer içinde hareket etmesi ve kararlı bir halde ve enflamasyon sırasında birbirleri ile nasıl etkileşime, canlı, üç boyutlu akciğer dokusunda dendritik hücreleri ve T hücreleri arasındaki gibi hücresel etkileşimler, görselleştirmek için yeteneği, ortaya çıkarabilir. gibi akış sitometrisi ve kantitatif PCR gibi başka prosedürler ile bir arada kullanıldığında Böylece, PCLS akciğerin allerjik ve enflamatuar hastalıkların altında yatan hücresel etkinlikleri kapsamlı bir anlayış katkıda bulunabilir.

Giriş

Bu tür lipopolisakarit (LPS) gibi pro-enflamatuar uyarılara solunması sonra, orada içinde, bağışık hücrelerin koordineli hareketi ve akciğer. Örneğin, nötrofiller hızla akciğer parankimi ve hava yoluna alınsın. Buna ek olarak, geleneksel bir dendritik hücreler (CDCS) olarak bilinen bir profesyonel antijen sunan hücreler, nispeten karmaşık göç ^{desen, 1, 2} geçer. CDCS yüzey işaretleyici, kendi ekranında CD11c kısmen, akış sitometrisi kullanılarak tespit dayalı olabilir. DClerin Farklı alt-kümeleri CD103 ve CD11b ³ ayırıcı yüzey ifadesi ile ayırt edilebilir. Nefes yoluyla antijene aldıktan sonra, bir CDCS akciğer çıkmak ve antijen-spesifik T hücrelerinin ⁴ peptidleri sunan akciğer lenf düğümleri (LN) lenf damarları içinden yer değiştirmektedir. Bu adaptif bağışıklık r başlatılmasında kritik bir erken olaydıresponses. Bilinmeyen nedenlerden dolayı, ancak, inhale antijenleri elde tüm CDCS akciğere bırakmaz ve bu hücrelerin ^çoğunun, birkaç ay ⁵ için bu organda ⁶ kalır. Monosit türevli CD11c ⁺ kemokin reseptörü, CCR7 yoksun hücreler, bölgesel LN ^{7, 8} göç etmek mümkün olduğu için bu gözlem, bu hücrelerin gelişim kökenli ile açıklanabilir. CDCS göç potansiyeli de akciğer içindeki anatomik pozisyona göre, en azından kısmen, tespit edilir gibi görünmektedir. Bununla birlikte, akciğerdeki CDCS bu farklı popülasyonlarda kesin yeri tam olarak karakterize edilmemiştir. Akciğer içinde ve yöneltmek moleküllerin bağışıklık hücre lokalizasyonu iyileştirilmiş bir bilgi, akciğerin bağışıklık sistemi aktive olur nasıl daha iyi anlamak için gereklidir.

PCLS olmak artıyorakciğer yapısının ^{9, 10} yapısal bütünlüğünü korurken, ly, hücresel konum ve hücre-hücre etkileşimleri görselleştirmek için bir eks vivo yaklaşımı olarak da kullanılır. PCLS fareler, sığır, maymun, koyun, at, ve insanlar ¹¹ dahil olmak üzere birçok türün, akciğerlerini incelemek için kullanılmıştır. Bu tekniğin önemli bir avantajı, yaklaşık 20 dilim böylece ayrı ayrı deneyler için gerekli hayvan sayısını azaltmak, bir fare akciğer Tek bir lobdan elde hazırlanabilir olmasıdır. DCler, makrofajlar, nötrofiller ve T hücreleri dahil olmak üzere hemen hemen tüm immün hücre tipleri, PCLS içinde mevcut olan ve normal yapısını korur.

PCLS de asetilkolin ¹² veya metakolin ¹³ ile tedaviden sonra, kalsiyum sinyal ve solunum yolu düz kas hücrelerinin kasılma incelemek için kullanılabilir. Bu yaklaşımda, akciğer sadece küçük bir kısmı, birmikroskobik alyzed ancak bir çalışma PCLS hava yolu daralması ölçümleri dilim dilim sadece yaklaşık% 10 farklılık gösterir ve bu varyans intakt hayvanlarda ¹⁴ akciğer fonksiyon testleri kullanılarak görülenle kıyaslanabilir olduğunu bildirdi. Diğer araştırmacılar, LPS ¹⁵ ile inkübe edildikten sonra, sitokin ekspresyon ve hücre yüzey markörlerinin değişiklikleri incelemek için bir eks vivo yaklaşımı olarak PCLS kullandık. PCLS aynı zamanda küçük içi asinar arterlerde pulmoner hipoksik vazokonstriksiyon bir ex vivo modelinde kullanılmıştır. Bu damarlar kesilmiş arter segmentler veya kalmanın damar ¹⁶ analizinden kayıtları gibi diğer prosedürler, ulaşılamıyor akciğer kısmında yer almaktadır. Bizim laboratuvar öncelikle bir in vivo ateşli güdünün ardından bağışıklık hücresi kalıcı halde canlı akciğer dokusunda lokalize edilmesini ve görselleştirmek için PCLS kullanmıştır. aşağıdaki gibi biz bunun için geliştirdik yöntemlerdir.

Protokol

Bu yazıda anlatılan Hayvan deneysel prosedürler NIEHS Hayvan Bakım ve Kullanım Komitesi (IACUC) tarafından onaylanmıştır.

1. Akciğer hazırlanması

1. Kurumsal Hayvan Bakımı ve Kullanımı Komiteleri tarafından sağlanan yönergelere uygun olarak spesifik patojen free koşullarda yaş 6 ve 12 hafta arasında Ev fareleri.
   NOT: görüntülenmistir fareler her araştırmacının ilgi alanlarına bağlı olarak naif veya tedavi olabilir. Burada, 50 uL bir toplam hacimde bir taşıyıcı olarak fosfat tamponlu tuzlu su (PBS) kullanılarak, naif farelerde ve 100 ug ovalbumin (OVA) ve 0.1 ug lipopolisakkarit (LPS) ile tedavi edilen farelerde bağışıklık hücresi lokalizasyonunu tarif etmektedir. oropharyngeally solunum yolları içine OVA / LPS aşılamak için, hayvanlar izofluran teneffüs ile anestezi uygulandı ve dikey olarak bir lastik bant ile dişleri ile süspansiyon haline getirildi. dil forseps ile yavaşça tutulur ve yutma önlemek için bir tarafa yapılan ve 50 # edildi181; ağız boşluğu arka biriken OVA / LPS çözeltisi L önceden ¹⁷ tarif.
2. sodyum pentobarbital (100 mg / kg) intraperitonal enjeksiyonu ile fare euthanize ve polistiren tabanına hayvan pin.
3. çeneye karın kadar ortasından deri ve periton keserek makas ile karın boşluğuna açın. forseps veya makas donuk kenarı ile bir kenara bağırsak çekin ve akciğer uzak kan akıtmak için inferior vena cava makasla kesme. akciğerler kesmek için dikkatli olmak göğüs kafesinin genişlemesine izin vermek üzere makas sivri ucu ile diyafram ile delikler.
4. Şeffaf tükürük bezleri ve forseps ile altta yatan trakea uzak çekerek manuel dokuyu kapma ve uzakta trakeadan diğer doku. tra olsa tüm yol kesmek için dikkatli olmak, ince forseps veya makas kullanılarak kıkırdak en kalın bandın ön tarafında Nefes borusunda küçük bir kesi olunChea. kesik, bir 20 G iğne ile geçmesine imkan vermek için yeterince büyük olmalıdır.
5. iğnenin ucundan ileriye boru, yaklaşık 1 cm bırakarak, polietilen boru donanımının bir bölümü üzerine bir 1.5 inç, 20 G iğne kaydırın. agaroz kadar iğne içinden sıcak 0.8 mL (40 ° C),% 2 düşük bir erime noktasına çizerek şırınga, son konik bir 1 ml şırınga iğne takılır ve yük için yaklaşık 45 ° 'lik bir açı ile hortumu kesilir.
6. Trakea kesi içine boru ucunu yerleştirin ve yavaş yavaş akciğerlere agaroz enjekte edilir. iğne ya da şırınga hareket olmadan, iğne trakeanın kalmasını sağlamak için polistiren tabanına şırınga bantlayın.
   NOT: Enjeksiyondan sonra, akciğerler göğüs içinde büyük ve şişirilmiş olacaktır. Doğru lob, ilk önce sol lobu genişletin. Sadece bir lob genişletir, iğne (bronş geçen) çok derin olarak yerleştirilen edilmiş ve devam etmeden önce hafifçe çekmek için gerekli olacaktır. bu bölümüProsedür agaroz katılaşmaya başlamadan önce, nispeten hızlı bir şekilde yapılması gerekir.
7. En az 10 dakika süreyle bir baz ve bir soğuk odada yine hava borusu içinde yerleştirilmiş bir şırınga ya da buzdolabı, fare yerleştirin. Gerekirse, hayvan birkaç saate kadar, hatta video mikroskobu ile görüntü hücre göçü geçmeden eğer orada tutulabilir.
8. Fare soğuk sonra, dikkatli bir şekilde makas kullanılarak agaroz şişirilmiş akciğerler eksize ve buz gibi soğuk PBS ile 3 cm uzunluğunda bir tabağına yerleştirin. buz üzerinde tutun.
9. Doku dilimleme için istenen lobu (örneğin sağ superior lob) seçin. Emin (o trakea bağlanır) akciğerin iç kısmı tabak yüz aşağı olduğundan emin olun.
   Not: lob kullanılmıştır ve pistonu oryantasyon görünür olacak damar ve solunum yollarının boyutunu belirleyecektir. Burada anlatılan oryantasyon büyük hava yollarının görselleştirme ve parankimindeki için idealdir. Fareler bir büyük sol lobu ve sağda dört küçük dilimleri vardır. İçinuygun bir boyut olduğu için değil, aynı zamanda inhalasyon ajanları içindeki eşit dağılması nedeniyle orofaringeal veya intranazal aspirasyon yoluyla akciğerlere alerjenlere açıklanması sonrasında PCLS görüntüleme, sağ superior lob genellikle kısmen kesitli edilir. Ancak, diğer lob, özellikle sol lob da incelenebilir. Fare suşları veya tedaviler karşılaştırırken, aynı lobu karşılaştırmak önemlidir.

2. Akciğer Dilimleme

NOT: üreticinin talimatlarına göre metal blok, pistonu ve metal şırınga soğutma, otomatik dilimleme makinesi kullanılarak dilimleri olun.

1. Pistonun üzerine çok amaçlı küçük bir damla, hiçbir işletilen jel superglue koyun ve tutkal metal şırınga kenarlarına dokunmasına izin için özen, dairesel bir hareketle tutkal yayıldı. tutkal, şırınganın tarafı ile temas ettiği şırınga tutkal ve dalma pistonunu olacaktır.
2. Hemen yapıştırıcı ile piston kapsayan sonra, yavaşça kavramakAşağı trakea tarafı forseps ile eksize lob, fazla sıvının çıkması, ve dikkatli bir şekilde pistonun üzerine yerleştirmek için bir doku üzerine hafifçe sürün. Pistonun kenarının ötesine uzanan herhangi bir ilave dokusu kesin.
3. Metal şırınganın kenarları yukarı ve doku üzerinde, böylece oluşturma aşağı pistonu hareket iyi derin birkaç santimetre daha fazla, alt yapıştırılmış akciğer. Metal şırınga altındaki etrafında Teyp etapta bu konumda tutun.
4. sadece lobun üst kaplayacak şekilde dikkatli bir şekilde de içine, 40 ° C'de,% 2 az eriyen agaroz dökün.
5. buz soğukluğunda soğutma bloğu metal şırınga Surround ve 1 lob ve agaroz serin - 2 dakika.
   Not: çevreleyen dokudan agaroz daha kısa bir zaman soğutma bir düzensiz kesme PCLS neden olabilir, dilimleme sırasında agaroz parçalanmasına neden olabilir.
6. Otomatik dilimleyicinin içine numune şırınga yükleyin ve buz PBS ile tampon tankı doldurun. hizalama Numune şırınga ile motorlu sürücü adım ve alttan bant parçasını çıkarın. step motor sürücü sadece pistonun arkasına dokunana kadar hızlı ileri (FF) konumuna getiriniz.
7. Numune şırınga ile taze bıçak hizalayın. dilimleyici Set doku kalınlığı, sürekli / tek bir dilim, salınım ve hızı. Örneğin doku kalınlığı: 150 um, sürekli kesme (devam). salınım: 9, ve hızı: 3 - 4. başlar. Yukarıdaki ayarları belirli otomatikleştirilmiş dilimleyici özelliklerine ayarlanması gerekebilir.
8. bunlar tampon tankına dökülmesini ve buz soğuk PBS içeren bir 24-çukurlu plaka içinde koyun gibi ince bir spatula ya da fırça kullanılarak, her seferinde PCLS bir toplar.
   NOT: deneyler arasında tutarlılığı sağlamak amacıyla dilimleri tutmak önemlidir. Her akciğer, yaş, cinsiyet ve ağırlığına bağlı olarak farklı olmasına rağmen, ^10. dilim, örneğin, genel olarak benzer solunum aygıtı elde edilir.

ove_title "> 3. Antikor Boyama

1. ki potansiyel floresan spektral üste binme ve bir mikroskop tespit alma yetenekleri, ilgi konusu hücre türüne göre fluoresan ışığı ile işaretlenmiş antikor paneli tasarlama.
   NOT: Bir örnek olarak, DC alt seti tespiti için bir panel: CD11c / alfa X integrin - BrilliantViolet (BV), 605 (Uyarım: 405 nm, tepe emisyon: 605 nm), CD324 / E-kadherin - Alexa 488 (AF488 ) (Uyarım 488 nm, tepe emisyon: 519 nm), CD88 / C5Ra1 - Fikoeritrin (PE) (Uyarım 561 nm, tepe emisyon: 578 nm), CD103 / alfa e integrin - Allofikosiyanin (APC), (Uyarım: 633 nm Peak emisyon: 660 nm). Floresans spektral görüntüleyici araçları (Malzeme listesi) panelleri tasarlamak üzere kullanılır.
2. istenen antikorları ihtiva eden bir antikor kokteyli olun.
   1. Statik PCLS görüntüleme için, 1.5 ml microcentrifu 800 uL boyama tamponu, 100 uL Fc blocker, 50 uL normal fare serumu ve 50 ul normal sıçan serumu eklemek1 mL toplam hacim için yükümlülüğüne tüpü. canlı hücre görüntüleme, yerine boyama tamponu% 10 FBS (Leibovitz-10) ihtiva eden 800 uL Leibovitz ortamı (1 kez) kullanın.
   2. Her bir antikorun bir istenen son konsantrasyonunu ayarlamak için antikor ekleyin. 3 cm'lik çanak antikor çözüm aktarın ve kullanıma hazır oluncaya kadar karanlıkta tutun.
      Not: (- 5 ug / mL, genellikle 1) son konsantrasyonları gerekir her bir antikor için optimize edilmesi.
3. Bu tür büyük solunum yolları veya akciğer periferinde gibi ilgi, bir anatomik bölgenin bir PCLS seçin ve 1 ml antikor çözeltisi ihtiva eden 3 cm tabak içinde yer.
4. 30 ya da 60 dakika boyunca yavaş yavaş sallanan buz üzerinde karanlıkta leke PCLS,.
5. Statik PCLS görüntüleme için, canlı hücre görüntüleme için bölüm 4. geçin bölüm 5 geçin.

PCLS 4. Statik Görüntüleme

1. antikorlarla PCLS 60 dakika inkübasyondan sonra, t çanak antikor çözüm kaldırmak ve durulamao 1 mL buz gibi soğuk PBS ile iki kez dilimler.
2. 3 cm yuvarlak cam alt tabak üzerine pipetle 50 uL PBS ile yıkandı. Bir spatula ya da fırça kullanılarak, düz kadar yavaşça dilim manipüle damla lekeli PCLS transferi ve yayılmış. Bir pipet ile PBS çıkarın. dilim mümkün olduğu kadar düz olmalıdır. Yukarıdaki prosedürler photobleaching önlemek için hızla yapılması gerekir.
3. dilime oda sıcaklığı montaj orta 1 damla yerleştirilir ve hafifçe plakasının her bir oyuğuna, cam bir lamel bırakın. Görüntüleme önce bir saat kadar 4 ° C'de karanlıkta PCLS tutun.
4. Konfokal mikroskop altında görüntülerken, bir 20X objektif (Malzeme Listesi bakınız) kullanın. "Dışbükey" ayarında doku kenarlarını bulmak ve işaretlemek için "çini" aracını kullanın. Bu karo taramanın süresini azaltmaya yardımcı olacaktır.
5. z yığın aralığı belirlenmesinde, özellikle de kenarlarında, dilimin çok alanlarda kontrol grubu aralıkları buuygundur.
   NOT: z aralığı, doku tamamen düz bir şekilde almak çok zordur, çünkü dokunun kendisinin kalınlığından daha büyük olması gereken muhtemel olacaktır. dilim darbe ve eğrileri karşılamak için 250 um - Örneğin, bir 150 mikron kalınlığında PCLS ile, z-yığın aralığı muhtemelen 200 ayarlanması gerekecektir. 20X objektif ile 12 saat - z-yığın aralığı ve doku boyutuna bağlı olarak, her bir tam akciğer tarama 7 arasında sürer. Her akciğer tektir ve ayarları her deney için ayarlanmalıdır.

PCLS 5. Canlı Hücre Görüntüleme

1. antikorlarla PCLS 30 dakika inkübasyondan sonra, çanak antikor çözüm kaldırmak ve Leibovitz-10 soğuk 1 mL'si ile iki kere dilimleri yıkayın.
2. Pipet taze 50 uL Leibovitz-10 bölmeli coverglass (8 yuva) uzunlamasına bir içine. , Orta PCLS aktarmak için bir spatula kullanın dilim düz olana kadar yavaşça manipüle ve yaymak. yukarıdaki prosedürlerihtiyaç photobleaching önlemek için hızla yapılacak.
3. Bir pipet kullanarak 50 mcL orta çıkarın. dilim mümkün olduğu kadar düz yatan tutulmayacaktır.
   Not: dilim kenarları bölmenin duvarına dikey olarak ters çevrilmiş durumunda kabul edilebilir bir durumdur. Bundan başka, eğer varsa, bir metal platin ağırlığı bir sonraki aşamaya geçmeden önce, dilim sabitlemek için kullanılabilir. kesilmiş ve küçük ağırlıkların içine bükülebilir platin tel biri, örneğin bağlı Malzeme Listesi bakınız.
4. 4 ° C soğuk oda içinde, bir faktör-düşük büyüme, 100 uL Leibovitz-10 ile fenol kırmızısı içermeyen hücre dışı matrisin 100 uL karıştırın. Bunun için önceden soğutulmuş pipet uçları kullanın veya hücre dışı matris ucu sertleşir.
   Not: matris ve ortamın Bu oran (1: 1), doku-kültür koşullarında PCLS basılı kadar yoğun bir jel oluşturur.
5. Yavaşça karıştırmak için matris pipet ve dikkatle jel lu üstüne gider emin olarak PCLS üstünde pipetdilim ng ve dilim jel üstünde yüzerek gelmez. Jel plakanın altına doğru aşağı PCLS ankraj, bir ağırlık olarak çalışması gerekir.
6. Dikkatli bir şekilde 37 ° C inkübatör odacıklı coverglass aktarmak ve matris ~ 5 dakika boyunca katılaşmaya sağlar.
7. Konfokal mikroskop önceden ısıtılmış aşamasında üzerine tüm odacıklı coverglass aktarın. görüntüleme boyunca 37 ° C'de bölmeyi muhafaza edin. Leibovitz ortamı kullanıldığında _CO2 kaynağı cep inkübasyon sırasında gerekli değildir.
8. çerçeveler arasında arzu edilen aralığına göre z-yığın aralığı ve kiremit aralığını ayarlayın. konfokal mikroskop altında görüntülerken, bir 20X objektif (Malzeme Listesi bakınız) kullanın. (Örneğin, bir 2x2 merkezli ızgara) "merkezli grid" ayarını kullanarak, dokuda ilgili bölgeyi belirtmek için "çini" aracını kullanın.
9. z yığın aralığı ayarı da, ayar aralıkları uygun dilimin çok alanlarda kontrol edin.
   NOT: zrange dokunun kalınlığını eşit olasılıkla. Her akciğer tektir ve ayarları her deney için ayarlanmalıdır. 2x2 çini ve 10 Z-yığınları, genellikle yaklaşık 1 kare / 2 dakika ile sonuçlanacaktır. Emin olun otomatik odaklanma fonksiyonu görüntüleme döneminde xy ve z-sürüklenme en aza indirmek için deneye başlamadan önce devreye girer.

Sonuçlar

C57BL / 6 farelerinden alınan iki DC alt-konumunu, CD11b ^hi CDCS ve CD103 ⁺ CDCS, PCLS belirlemek için kesilmiş ve CD11c özgü monoklonal antikor (mAb) ile boyanmıştır, CD88, CD103, CD324 ve (E-kadherin). CD324 leke hava yolu epitelial hücreler ile antikorlar ve CD88 makrofajlar ve nötrofiller, ancak CDCS ⁸ gösterilir. Bu, CD11c ⁺ makrofajlardan CDCS ayırt etmek ve hava yolları (Şekil 1), her hücre t?...

Tartışmalar

Burada açıklanan protokol başlangıçta akciğer içinde CDCS iki alt kümelerinin yerleri görselleştirmek için geliştirilmiştir. Bununla birlikte, bu protokol, hali hazırda hücre canlılığı ve akciğer üç-boyutlu yapısını muhafaza ederken, bir çok farklı hücre tipleri incelemek için adapte edilebilir. İkinci özellik hücre kültürü sistemleri üzerinden önemli bir avantaj olduğunu ve nadir hücre tiplerinin tanımlanması kolaylaştırır. yöntem, akciğer PCLS oluşturulmasına dayanır ve...

Malzemeler

Name	Company	Catalog Number	Comments
C57BL/6J mice	Jackson Laboratory	000664
Prox1-TdTomato transgenic mice	Jackson Laboratory	018128	B6;129S-Tg(Prox1-tdTomato)12Nrud/J
OT-II OVA-specific TCR x Nur77-GFP transgenic mice	Jackson Laboratory	004194, 016617	B6.Cg-Tg(TcraTcrb)425Cbn/J x C57BL/6-Tg(Nr4a1-EGFP/cre)820Khog/J
Rag1 knock-out mice	Jackson Laboratory	002216	B6.129S7-Rag1tm1Mom/J
Ovalbumin, Low Endo, Purified	Worthington Biochemical Corporation	LS003059
Lipopolysaccharides from Escherichia coli	Sigma-Aldrich Co.	L2630-25MG
Polyethylene tubing (Non-Sterile) 100 ft	BD Diagnostic Systems	427421	0.86 mm inside diameter, 1.27 mm outside diameter
GeneMate Sieve GQA Low Melt Agarose	BioExpress	E-3112-125	2% solution dissolved in PBS at 70 °C and held at 40 °C.
Compresstome VF-300	Precisionary Instruments, Inc.	VF-300
Double Edge Stainless Razor Blade	Electron Microscopy Sciences	72000	Disposable; 250/box. Blade should be changed for every lung.
Krazy Glue All Purpose Instant Gel	VWR	500033-484	Commonly available for $3/tube in local drugstores
Leibovitz's L-15 Medium, no phenol red	ThermoFisher Scientific	21083027
Normal Rat Serum (NRS)	Jackson ImmunoResearch Inc.	012-000-120
Normal Mouse Serum (NMS)	Jackson ImmunoResearch Inc.	015-000-120
Fetal bovine serum (FBS)	Hyclone	SH30071.03HI
Staining Buffer	Made in House	N/A	PBS w/ 0.5% bovine serum albumin, 0.1% NaN3, pH 7.4
Fc Blocker (anti-CD16/32 antibodies)	Made in House	N/A	Supernatant of cultured hybridoma cell line 2.4G2
Anti-mouse CD11b eFluor 450	eBioscience	48-0112-80	Anti-mouse CD11b eFluor 450 (clone: M1/70)
Anti-mouse CD11c Brilliant Violet 605	BioLegend	101237	Brilliant Violet 605 anti-mouse CD11c (clone: M1/70)
Anti-mouse CD11c Phycoerythrin	eBioscience	12-0114-82	PE conjugated anti-mouse CD11c (clone: N418)
Anti-mouse CD11c Allophycocyanin	BD Phamingen	550261	APC-labeled anti-mouse CD11c 9clone: HL3)
Anti-mouse CD88 Phycoerythrin	BioLegend	135806	PE anti-mouse CD88 (clone: 20/70)
Anti-mouse CD103 Allophycocyanin	eBioscience	17-1031-82	Anti-mouse CD103 APC (clone: 2E7)
Anti-mouse CD90.2/Thy1.2 eF450	eBioscience	48-0902-82	Anti-mouse CD90.2 eFluor 450 (clone: 53-2.1)
Anti-mouse CD172a/Sirp1a Allophycocyanin	eBioscience	17-1721-82	Anti-mouse CD172a APC (clone: P84)
Anti-mouse CD324 Brilliant Violet 421	BD Horizon	564188	BV421 mouse anti-E Cadherin (clone: 5E8 also known as 5E8-G9-B4)
Anti-mouse CD324 Alexa Fluor 488	eBioscience	53-3249-82	Anti-CD324 (E-Cadherin) Alexa Flour 488 (clone: DECMA-1)
Anti-mouse CD324 Alexa Fluor 647	eBioscience	51-3249-82	Anti-CD324 (E-Cadherin) Alexa Flour 647 (clone: DECMA-1)
Glass Bottom Microwell Dishes 35 mm petri dish, 14 mm Microwell, No. 1.5 coverglass	MatTek Corperation	P35G-1.5-14-C
Nunc Lab-Tek Chambered Coverglass	ThermoFisher Scientific	155411PK	Pack of 16
15 mm Coverslip, No. 1.5 Glass Thickness	MatTek Corperation	PCS-1.5-15
Bare Platinum Wire	World Precision Instruments	PTP201	0.020" (0.5 mm) diameter cut into ~1 cm long pieces and bent into an "L" shape
ProLong Gold Antifade Mountant	ThermoFisher Scientific	P36934	Keep at 4 °C, warm to room tempterature before use.
Matrigel Growth Factor Reduced (GFR) Basement Membrane Matrix, Phenol Red-Free, *LDEV-Free	Corning	356231
Zeiss 880 multi-photon laser-scanning microscope	Carl Zeiss		Zen Black software version 8.1, 2012 (Zeiss)
Plan-Apochromat 20X/0.8 M27 objective lends	Carl Zeiss	420650-9901-000