Komutu yeni bir hücreye girerek Python yardımcı programı işlevini kullanarak hizalamadan önce tomurcuklanan eğrileri çizin. Ardından, hizalamadan sonra tomurcuklanan eğrileri çizin. Python yardımcı programı işlevini kullanma.
Orijinal, hizalanmış veya hizalanmış ve enterpolasyonlu veri çerçevesi üzerinde çizgi grafik karşılaştırmaları yapmak için Python yardımcı programları şişesinde sağlanan çizim çizgi grafiği karşılaştırmasını kullanın. Komutu yeni bir hücreye yazarak, komutu yeni bir hücrede kullanarak not defterine bir CSV veya TSV gen listesi dosyası alın. Ardından, komutu yeni bir hücreye yazarak hizalanmış enterpolasyonlu ve faz hizalanmış veri çerçevesi üzerinde bir ısı haritası karşılaştırması yapmak için Python yardımcı programları dosyasında sağlanan işlev grafiği ısı haritası karşılaştırmasını kullanın.
Hizalanmış ve hizalanmamış transkriptomatik verilerin karşılaştırılması, hizalamadan önce mikroarray deneylerinin ilk tepe ifadesinin RNA-seq Deneyinin ikinci zirvesi ile aynı hizada göründüğünü göstermiştir. Ancak, hizalamadan sonra, her veri kümesinin ilk hücre döngüsü zirveleri uygun şekilde hizalanır. Hücre döngüsü faz verilerinin deneyler arasında değişen periyotlarla karşılaştırılması, hizalanmamış tomurcuklanma eğrilerinde görünür dönem farklılıkları göstermiştir.
Saatlerin hizalaması, üç eğrinin oldukça benzer görünmesini sağlayarak deneysel verilerin karşılaştırılmasını mümkün kılarken, karşılaştırılabilir her yaşam çizgisi noktası için hücre döngüsü fazı verileri iki koşul arasında aynı değildi. Transkriptomik verilerin farklı periyotlarla yapılan deneyler arasında karşılaştırılması, hizalamadan önce CDC20'nin transkript dinamiklerinin örtüşmediğini göstermiştir. Ancak hizalamadan sonra, zirveler aynı hücre döngüsü fazında meydana geldi, ancak eğrilerin şekilleri farklıydı.
Genler, hem hizalanmamış hem de hizalanmış olmak üzere her üç koşul için de aynı sırayla ısı haritaları olarak çizildi.
