Hem in vitro hem de fare modellerinde embriyonik kök hücre farklılaşması sırasında erken hücre kaderi kararlarını kontrol eden mekanizmaları deşifre etmeye odaklanıyoruz. Karmaşık düzenleyici ağlar, geliştirme sırasında farklılaşmaya rehberlik eder ve sinyal yollarının, transkripsiyon faktörlerinin ve epigenetik düzenleyicilerin etkileşiminin farklı hücre kaderlerini nasıl desteklediğini araştırırız. Farelerde dinamik ve hızlı gastrulasyon sürecini incelemek, embriyo başına az sayıda hücre ve çöp başına istenen genotipe sahip sınırlı sayıda embriyo nedeniyle teknik olarak zordur.
Literatür, vahşi tip veya floresanla aktive edilmiş hücre sıralanmış embriyo popülasyonları kullanılarak tek hücrelerin çalışmasını kapsamlı bir şekilde gösterse de, soy mutasyonlarına sahip embriyoların kapsamlı bir analizi hala sınırlıdır. Protokolümüz, soy mutasyonlarını barındıran gastrulasyon yapan embriyolardan tek hücreli omik veri kümeleri oluşturma imkanı sunar. Fare işleme deneyimi olmayan veya sınırlı olan veya erken embriyo manipülasyonu veya tek hücre yaklaşımlarını öğrenmek isteyen bilim adamlarına yardımcı olacaktır.
Protokolümüz, kalp gelişimi de dahil olmak üzere gastrulasyon ve erken organogenez ile ilgili yeni bilimsel soruların yanıtlanmasına yardımcı olacaktır. Soy taahhüdünde belirli bir genin rolünün analizini kolaylaştıracak tek hücre çözünürlüğünde soya özgü mutant embriyoları analiz etmek için bir boru hattı sağlıyoruz. Bu metodolojiyi, hızlı ve dinamik gastrulasyon süreci sırasında hücre kaderi kararlarının düzenleyici mekanizmalarını anlamak için kullanmayı umuyoruz.
