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Visualisation des micro-organismes du sol grâce aux lames de contact et à la microscopie

Overview

Source : Laboratoires du Dr Ian poivre et Dr Charles Gerba - Université de l’Arizona
Auteur mettant en évidence : Bradley Schmitz

Sol compose de la mince couche à la surface de la terre, contenant les facteurs biotiques et abiotiques qui contribuent à la vie. La partie non biologique comprend des particules inorganiques variant en taille et en forme qui déterminent la texture du sol. La portion biotique incorpore les résidus végétaux, racines, matières organiques et micro-organismes. Diversité et l’abondance des microbes du sol est large, car un seul gramme de sol contient 107-8 bactéries, actinomycètes 106-8 , 105-6 champignons, 103 levure, 10 protozoaires de4-6 , 10 algues3-4 et 53 nématodes. Les facteurs biotiques et abiotiques forment ensemble des architectures autour des racines des plantes, appelées la rhizosphère, qui offrent des conditions favorables pour les micro-organismes du sol.

Les facteurs biotiques et abiotiques promouvoir la vie dans les sols. Toutefois, elles contribuent aussi stressante dynamique qui limitent les microbes. Les stress biotiques implique une concurrence entre vie à adapter et à survivre dans des conditions environnementales. Par exemple, les microbes peuvent sécréter des substances toxiques ou inhibitrices pour nuire voisine de micro-organismes. Penicillium notatum est un champignon notoire, car elle réduit la compétition pour les nutriments en produisant un antimicrobien, lesquelles les humains récoltent pour créer la pénicilline pharmaceutique. Aux stress abiotiques proviennent des propriétés physiques ou chimiques limitant la survie microbienne, comme la lumière, humidité, température, pH, éléments nutritifs et texture.

Procedure

1. sol microcosme préparation

  1. Recueillir le sol de jardin de la surface (0-6 "profondeur), et peser 150 g de sol dans deux tasses distinctes.
    1. Si le sol a haute densité de la matière organique, peser 100 g.
  2. Une tasse de l’étiquette « traitement » et l’autre « contrôle. »
  3. Calculer la quantité d’eau nécessaire pour modifier la teneur en humidité.
    1. Teneur en eau est souvent à proximité de la capacité au champ.
      Equation 1...</div><style data-emotion=.css-f1q1l5{display:-webkit-box;display:-webkit-flex;display:-ms-flexbox;display:flex;-webkit-align-items:flex-end;-webkit-box-align:flex-end;-ms-flex-align:flex-end;align-items:flex-end;background-image:linear-gradient(180deg, rgba(255, 255, 255, 0) 0%, rgba(255, 255, 255, 0.8) 40%, rgba(255, 255, 255, 1) 100%);width:100%;height:100%;position:absolute;bottom:0px;left:0px;font-size:var(--chakra-fontSizes-lg);color:#676B82;}

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Results

Champignons d’affichage épais hyphes filamenteux (Figure 2). Actinomycètes affichent hyphes minces et filamenteuses. Bactéries présentent de petites cocci ou formes de tige. On les retrouve souvent en touffes, sur les particules du sol, ou doublure hyphes fongiques. Les particules de sol affichent formes irrégulières, sombres (Figure 3).

Figure 2
La figure 2. Contact image de diapositi...

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Application and Summary

L’essai de contact diapositive, également dénommé le slide enterré, est une technique simple utilisée pour observer qualitativement biote du sol. Cet essai montre qualitativement les interactions spatiales entre les hyphes fongiques, filaments d’actinomycètes, bactéries et saletés. Individus ou industrie peut employer ce dosage pour recueuillir des connaissances sur la santé du sol notamment en ce qui concerne l’agriculture, jardinage, compostage, enseignant et étudiant. Cependant, cette technique ne quan...

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References
  1. Pepper, I. L., & Gerba, C P. 'Contact Slide Assay.' Environmental Microbiology A Laboratory Manual. 2nd ed. Elsevier 19-25 (2004).
  2. Pepper, I. L., Gerba, C. P., & Gentry, T. J. 'Earth Environments.' Environmental Microbiology. 3rd ed. Elsevier 59-88 (2014).
  3. Rossi, G., Ricardo, S., Gesue, G., Stanganelli, M., and Want, T.K. Direct Microscopic and bacteriological investigations of the soil. Soil Science. 41, 52 – 66 (1936).
Tags
Soil MicroorganismsContact Slide AssayMicroscopyVisualizationSoil ChangesEnvironmental StressesRhizosphereAbiotic ComponentsInorganic ParticlesBiotic ComponentsPlant ResiduesRootsOrganic MatterMicroorganismsWater In Soil PoresBacteriaCocciBacilliFilamentous FormsFungal SpeciesYeastMolds

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0:00

Overview

1:12

Principles of Soil Microorganisms

2:41

Soil Slide Microcosm Preparation

5:12

Slide Staining and Microscopy

6:47

Microscopy Results

7:32

Applications

9:40

Summary

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