Tracez les courbes bourgeonnantes avant l’alignement à l’aide de la fonction utilitaire Python en entrant la commande dans une nouvelle cellule. Ensuite, tracez les courbes bourgeonnantes après l’alignement. Utilisation de la fonction utilitaire Python.
Utilisez la comparaison de graphiques linéaires fournie dans le flacon d’utilitaires Python pour effectuer des comparaisons de graphiques linéaires sur le bloc de données original, aligné ou aligné et interpolé. En tapant la commande dans une nouvelle cellule, importez un fichier de liste de gènes CSV ou TSV dans le bloc-notes à l’aide de la commande dans une nouvelle cellule. Ensuite, utilisez la comparaison de carte thermique de tracé de fonction fournie dans le fichier d’utilitaires Python pour effectuer une comparaison de carte thermique sur le bloc de données interpolé aligné et aligné en phase en tapant la commande dans une nouvelle cellule.
Une comparaison des données transcriptomatiques alignées et non alignées a montré qu’avant l’alignement, le premier pic d’expression des expériences de microréseaux semblait aligné avec le deuxième pic de l’expérience RNA-seq. Cependant, après l’alignement, les premiers pics du cycle cellulaire de chaque jeu de données sont correctement alignés. La comparaison des données de phase du cycle cellulaire entre des expériences avec des périodes variables a montré des différences de période visibles dans les courbes bourgeonnantes non alignées.
Alors que l’alignement des horloges rendait les trois courbes remarquablement similaires, ce qui rendait possible la comparaison des données expérimentales, les données de phase du cycle cellulaire pour chaque point de ligne de vie comparable n’étaient pas identiques entre les deux conditions. La comparaison des données transcriptomiques entre des expériences avec des périodes variables a montré qu’avant l’alignement, la dynamique de transcription de CDC20 ne se chevauchait pas. Mais après l’alignement, les pics se sont produits sur la même phase du cycle cellulaire, mais les formes des courbes étaient différentes.
Les gènes ont été tracés sous forme de cartes thermiques dans le même ordre pour les trois conditions pour les non-alignés et les alignés.
