Plott de spirende kurvene før justering ved hjelp av Python-verktøyfunksjonen ved å skrive inn kommandoen i en ny celle. Deretter plotter du de spirende kurvene etter justering. Bruke Python-verktøyfunksjonen.
Bruk den medfølgende sammenligningen av plottlinjediagram i hetteglasset med Python-verktøy for å utføre linjegrafsammenligninger på den opprinnelige, justerte eller justerte og interpolerte datarammen. Ved å skrive inn kommandoen i en ny celle, importerer du en CSV- eller TSV-genlistefil til notatboken ved hjelp av kommandoen i en ny celle. Deretter bruker du den medfølgende funksjonsplottvarmekartsammenligningen i Python-verktøyfilen for å utføre en varmekartsammenligning på den justerte interpolerte og fasejusterte datarammen ved å skrive kommandoen inn i en ny celle.
En sammenligning av justerte og ikke-justerte transkriptomatiske data viste at før justering syntes det første topputtrykket av mikroarray-eksperimentene på linje med den andre toppen av RNA-seq-eksperimentet. Etter justering er imidlertid de første cellesyklustoppene i hvert datasett riktig justert. Sammenligning av cellesyklusfasedataene på tvers av eksperimenter med varierende perioder viste synlige periodeforskjeller i de ujusterte spirende kurvene.
Mens klokkejustering fikk de tre kurvene til å se bemerkelsesverdig like ut, noe som gjorde sammenligninger av eksperimentelle data mulig, var cellesyklusfasedataene for hvert sammenlignbart livslinjepunkt ikke identiske mellom de to forholdene. Sammenligning av transkriptomiske data på tvers av eksperimenter med varierende perioder viste at før justering var transkripsjonsdynamikken til CDC20 ikke-overlappende. Men etter justering skjedde toppene på samme cellesyklusfase, men formene på kurvene var forskjellige.
Genene ble plottet som varmekart i samme rekkefølge for alle tre forholdene for både ujustert og justert.
