Name: screening for melanoma modifiers using a zebrafish autochthonous tumor model
Uploaded: 2012-11-13T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Screening for Melanoma Modifiers using a Zebrafish Autochthonous Tumor Model at JoVE.com

Ve James Neiswender; Kristen Kwan ve bu çalışmada kullanılan plazmid hediyeler için geç Chi-Bin Chien;; antikor boyama ile ilgili yardım için James Lister ve David Raible Biz kimin laboratuar bu teknikleri başlangıçta geliştirilen Dr Leonard I. Zon ederim mikroenjeksiyon video. Bu çalışma CJC için NIH hibe R00AR056899-03 tarafından finanse edilmiştir

1. Melanom Onset Değiştiricileri için Tarama <ol><li> PCR ilgi genlerinin tüm uzunlukta açık okuma çerçevesi (GOI) yükselterek ve BP klonaz II (Invitrogen) kullanılarak pDONR 221 içine yeniden birleştirilmesini ile orta ağ geçidi giriş klonlar oluşturur. MiniCoopR vektörü (Şekil 1A) mitfa organizatörü altında ilgi genleri yerleştirmek rekombinasyona p5E_mitfa, pME_GOI, Tol2kit # 302 p3E_SV40polyA 6 ve miniCoopR 5 Multisite Geçidi teknoloj...

<ol>
	<li>Beroukhim, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+landscape+of+somatic+copy-number+alteration+across+human+cancers.">The landscape of somatic copy-number alteration across human cancers.</a> Nature. 463, 899-905 (2010).</li><li>Curtin, J. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Distinct+sets+of+genetic+alterations+in+melanoma.">Distinct sets of genetic alterations in melanoma.</a> N. Engl. J. Med. 353, 2135-2147 (2005).</li><li>Lin, W. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Modeling+genomic+diversity+and+tumor+dependency+in+malignant+melanoma.">Modeling genomic diversity and tumor dependency in malignant melanoma.</a> Cancer Res. 68, 664-673 (2008).</li><li>Patton, E. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=BRAF+mutations+are+sufficient+to+promote+nevi+formation+and+cooperate+with+p53+in+the+genesis+of+melanoma.">BRAF mutations are sufficient to promote nevi formation and cooperate with p53 in the genesis of melanoma.</a> Curr. Biol. 15, 249-254 (2005).</li><li>Ceol, C. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+histone+methyltransferase+SETDB1+is+recurrently+amplified+in+melanoma+and+accelerates+its+onset.">The histone methyltransferase SETDB1 is recurrently amplified in melanoma and accelerates its onset.</a> Nature. 471, 513-517 (2011).</li><li>Kwan, K. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Tol2kit:+a+multisite+gateway-based+construction+kit+for+Tol2+transposon+transgenesis+constructs.">The Tol2kit: a multisite gateway-based construction kit for Tol2 transposon transgenesis constructs.</a> Dev. Dyn. 236, 3088-3099 (2007).</li><li>Rosen, J. N., Sweeney, M. F., Mably, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microinjection+of+Zebrafish+Embryos+to+Analyze+Gene+Function.">Microinjection of Zebrafish Embryos to Analyze Gene Function.</a> J. Vis. Exp. (25), e1115 (2009).</li><li>Westerfield, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> The zebrafish book. A guide of the laboratory use of zebrafish (Danio rerio). , (2000).</li><li>White, R. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Transparent+adult+zebrafish+as+a+tool+for+in+vivo+transplantation+analysis.">Transparent adult zebrafish as a tool for in vivo transplantation analysis.</a> Cell Stem Cell. 2, 183-189 (2008).</li><li>Traver, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Transplantation+and+in+vivo+imaging+of+multilineage+engraftment+in+zebrafish+bloodless+mutants.">Transplantation and in vivo imaging of multilineage engraftment in zebrafish bloodless mutants.</a> Nat. Immunol. 4, 1238-1246 (2003).</li></ol>

MiniCoopR yöntem zebrafish melanosit ilgi genlerinin ifadesini sağlar. Bu yaklaşım zebrafish mitfa geni hücre-özerk davrandığını aslında yararlanır. Bu nedenle, miniCoopR vektör tarafından kurtarıldı melanosit minigene ve fiziksel birleştiğinde ilgilendiren herhangi bir gen içeren kesin. Kurtarılan melanosit açıkça görülebilir ve tek hücreli embriyolar olarak enjekte edilmiştir hayvanlarda elde edilebilir. Kimerizmin Belirtilen derecesi seçilir, ve bu kesim aşarak hayvanlar tümör ...

<table border="1"><tbody><tr><td> Reaktif Adı </td><td> Şirket </td><td> Katalog numarası </td><td> Yorumlar </td></tr><tr><td> Ağ Geçidi rekombinasyon reaktifler </td><td> Invitrogen </td><td></td><td></td></tr><tr><td> miniCoopR </td><td></td><td></td><td> Referans 5 </td></tr><tr><td> Mitfa antikor </td><td></td><td></td><td> Referans 5 </td></tr><tr><td> FITC keçi anti-tavşan IgG antikoru </td><td> Invitrogen </td><td></td><td></td></tr><tr><td> Vectashield </td><td> Vektör Labs </td><td> H-1000 </td><td></td></tr><tr><td> casper Zebra balığı </td><td></td><td></td><td> Referans 9 </td></tr><tr><td> 701N 10 ul Şırınga </td><td> Hamilton / Fisher </td><td> 14-824 </td><td> &amp;nbsp; </td></tr><tr><td> 40 um bir filtreden </td><td> BD Falcon / Fisher </td><td> 352340 </td><td></td></tr><tr><td> FBS </td><td> Invitrogen </td><td> 26140079 </td><td></td></tr></tbody></table>

screening for melanoma modifiers using a zebrafish autochthonous tumor model

Insan kanserlerini Genomik çalışmalar tümörler 1,2,3 değişmiş genler hakkında bilgi bir zenginlik vermiştir. Bu çalışmalardan kaynaklanan bir zorluk birçok genin değişmiş olduğunu ve bu dönüşüm sırasında tesadüfen ortaya çıktığını gelen tümörogenez sürdü genetik bozukluklardan ayırt etmek zor olabilir. Bu ayrım çizmek için bunu kantitatif tümörler inat ve yaymak için izin tümör gelişimini ve diğer süreçlere değişmiş bir gen etkisini ölçebilen bir test olması faydalıdır. Burada melanom başlatılması ve bakımı için gerekli adımları kapsayan bir otokton tümör modeli 4 kullanarak zebrafish aday melanom değiştiriciler çok sayıda taranması için hızlı bir araç sunuyoruz. Bu tahlilde önemli bir reaktif olan bir ağ geçidi rekombinasyon kaset için çiftler mitfa melanosit şartname faktörünün bir vahşi-tip kopya miniCoopR vektör ki, burada aday haline melanomaliler genler 5 recombined. MiniCoopR vektör promotör, açık okuma çerçevesi ve yabani-tip mitfa geninin 3&#39;-çevrilmemiş bölge içeren bir mitfa kurtarıcı minigene sahiptir. Bu bizi bir aday melanom modifiye tam boy açık okuma çerçeveleri ile yapılar yapmak için olanak sağlar. P53 (lf);; mitfa (lf) zebrafish embriyolar: Bu bireysel klonlar daha sonra tek hücre Tg (BRAF V600E mitfa) enjekte edilebilir. MiniCoopR vektör Tol2-aracılı transgenesis 6 ile entegre ve melanosit kurtarır alır. Fiziksel mitfa kurtarıcı minigene birleştiğinde Çünkü, aday genler dönüştürmek ve tümörler dönüşecek bazıları kurtarıldı melanosit olarak ifade edilmiştir. Melanom başlatılması ve melanom hücre özelliklerini bir aday genin etkisi melanom sağkalım eğrileri, invazyon deneyleri, antikor boyama ve transplantasyon yöntemleri kullanılarak ölçülebilir.

Tek hücreli Tg (mitfa: BRAF V600E); p53 (lf); mitfa (lf) zebrafish embriyolar melanom onkogen mitfa promotör kontrolü altında SETDB1 5 veya EGFP, her içeren miniCoopR vektörü ile enjekte edildi. Melanosit kurtarma olan embriyolar seçilir ve olgunlaşması için izin verildi. Melanosit kurtarma ile yaş hayvanların 2 ayda 4 mm 2 den büyük seçilmiştir. Hayvanlar melanomlar için haftalık tarandı. Yetişkinler için tümör oluşumunda eğrileri S...

Watch this Scientific Journal Video about Screening for Melanoma Modifiers using a Zebrafish Autochthonous Tumor Model at JoVE.com

Screening for Melanoma Modifiers using a Zebrafish Autochthonous Tumor Model

Bir zebrafish otokton tümör modeli kullanılarak melanoma düzenleyiciler için ekran için hızlı bir şekilde sunulmaktadır. Bu melanosit aday melanom genlerin ifadesi için izin miniCoopR vektör yararlanır. Melanom sağkalım eğrileri, bir işgal testi, ölçek melanosit antikor boyama için bir protokol ve bir melanom nakli tahlil elde bir yöntem tarif edilmiştir.

Bir Zebra balığı Otokton Tümör Modeli kullanılarak Melanom Değiştiricileri için Tarama

Genomic studies of  human cancers have yielded a wealth of information about genes that are altered  in tumors1,2,3. A challenge arising from these ...

Research

JoVE Journal

Medicine

Multi-photon Imaging of Tumor Cell Invasion in an Orthotopic Mouse Model of Oral Squamous Cell Carcinoma

Oral Skuamöz Hücre Karsinomu Ortotopik Fare Modeli Tümör Hücre Invasion Multi-foton Görüntüleme

Loco-regional invasion of head and neck cancer is linked to metastatic risk and presents a difficult challenge in designing and implementing patient ...

Assessing Teratogenic Changes in a Zebrafish Model of Fetal Alcohol Exposure

Fetal Alkol Pozlama bir Zebra balığı Modelinde teratojenik değişiklikler değerlendirilmesi

Fetal alcohol syndrome (FAS) is a severe manifestation of embryonic exposure to ethanol. It presents with characteristic defects to the face and organs, ...

Human Neuroendocrine Tumor Cell Lines as a Three-Dimensional Model for the Study of Human Neuroendocrine Tumor Therapy

İnsan Nöroendokrin Tümör Terapi Çalışmaları Üç Boyutlu Model İnsan nöroendokrin tümör hücre hatlarında

Neuroendocrine tumors (NETs) are rare tumors, with an incidence of two per 100,&#x200A;000 individuals per year, and they account for 0.5% of all human ...

Patient Derived Cell Culture and Isolation of CD133+ Putative Cancer Stem Cells from Melanoma

Patient Derived Cell Culture and Isolation of CD133+ Putative Cancer Stem Cells from Melanoma

Hasta Türetilen Hücre Kültürü ve CD133 İzolasyonu<sup&gt; +</supMelanom dan&gt; sağlayan olası Kanser Kök Hücreleri

Despite improved treatments options for melanoma available today, patients with advanced malignant melanoma still have a poor prognosis for ...

A Zebrafish Model of Diabetes Mellitus and Metabolic Memory

Diabetes Mellitus ve Metabolik Belleğinin Zebrafish Modeli

Diabetes mellitus currently affects 346 million individuals and this is projected to increase to 400 million by 2030. Evidence from both the laboratory ...

A Novel High-resolution In vivo Imaging Technique to Study the Dynamic Response of Intracranial Structures to Tumor Growth and Therapeutics

A Novel High-resolution In vivo Imaging Technique to Study the Dynamic Response of Intracranial Structures to Tumor Growth and Therapeutics

Yeni Bir Yüksek çözünürlüklü<em&gt; In vivo</emTümör Büyüme ve Tedavi için İntrakranial Yapıların Dinamik Tepki Eğitim&gt; Görüntüleme Tekniği

We have successfully integrated previously established Intracranial window (ICW) technology 1-4 with intravital 2-photon confocal microscopy to develop a ...

A Possible Zebrafish Model of Polycystic Kidney Disease: Knockdown of wnt5a Causes Cysts in Zebrafish Kidneys

A Possible Zebrafish Model of Polycystic Kidney Disease: Knockdown of wnt5a Causes Cysts in Zebrafish Kidneys

Polikistik Böbrek Hastalığı Olası Zebra balığı Modeli: demonte<em&gt; Wnt5a</em&gt; Zebra balığı Böbrekler Kistler Nedenler

Polycystic kidney disease (PKD) is one of the most common causes of end-stage kidney disease, a devastating disease for which there is no cure. The ...

Three-dimensional Co-culture Model for Tumor-stromal Interaction

Tümör-stromal Etkileşim için üç boyutlu Co-kültür Modeli

Cancer progression (initiation, growth, invasion and metastasis) occurs through interactions between malignant cells and the surrounding tumor stromal ...

Isolated Hepatic Perfusion as a Treatment for Liver Metastases of Uveal Melanoma

Uveal Melanom Karaciğer Metastazlı için bir tedavi olarak izole Karaciğer Perfüzyon

Isolated hepatic perfusion (IHP) is a procedure where the liver is surgically isolated and perfused with a high concentration of the chemotherapeutic ...

Evaluation of Tumor-infiltrating Leukocyte Subsets in a Subcutaneous Tumor Model

Bir deri altı tümör modelinde tümör-süzücü lökosit subsetleri Değerlendirilmesi

Specialized immune cells that infiltrate the tumor microenvironment regulate the growth and survival of neoplasia.&#160; Malignant cells must elude or ...