Name: biochemical titration of glycogen in vitro
Uploaded: 2013-11-24T19:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Biochemical Titration of Glycogen In vitro at JoVE.com

Biz bize florasan spektrometre kullanmak için izin verdiği için ve onun yardım için Dr Thierry Pourcher minnettarız. Laboratuvar Ligue Nationale Contre le Cancer (équipe labellisée) tarafından finanse edilen, Dernek la Recherche contre le Kanser, Institut National du Yengeç (Inca) dökmek, Agence Nationale la Recherche, METOXIA (AB programı FP7), Centre dökmek A. Lacassagne, Centre National de la Recherche Scientifique, Institut National de la Sante et de la Recherche Médicale ve Nice Üniversitesi ( <a href="http://www.unice.fr/isdbc/" target="_blank">http://www.unice.fr/isdbc/</a> ). Biz eleştirel okuma ve editoryal düzeltme için Dr M Christiane Brahimi-Horn teşekkür ederim.

Glikojenin Biyokimyasal titrasyonu 1.. Cell Lysis <ol><li> 100 mm çaplı tabak başına 0.5-2 x 10 6 konsantrasyonunda tohum hücreleri. </li><li> Tedavi: hücreleri inkübe 24,% 1 veya% 0.1 O 2,% 94 ya da ayarlanmış bir Bug-Box anaerobik çalışma istasyonu (Ruskinn Teknoloji Biotrace International Plc, Bridgend, UK) düşük oksijen konsantrasyonu (hipoksi) 48 ya da 72 saat % 94.9 N 2 ve% 5 CO 2. Buna paralel olarak, (% 21 O 2,% 5 ...

<ol>
	<li>Pelletier, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glycogen+Synthesis+is+Induced+in+Hypoxia+by+the+Hypoxia-Inducible+Factor+and+Promotes+Cancer+Cell+Survival.">Glycogen Synthesis is Induced in Hypoxia by the Hypoxia-Inducible Factor and Promotes Cancer Cell Survival.</a> Front Oncol. 2, (2012).</li><li>Alonso, M. D., Lomako, J., Lomako, W. M., Whelan, W. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+new+look+at+the+biogenesis+of+glycogen.">A new look at the biogenesis of glycogen.</a> FASEB J. 9, 1126-1137 (1995).</li><li>Bollen, M., Keppens, S., Stalmans, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Specific+features+of+glycogen+metabolism+in+the+liver.">Specific features of glycogen metabolism in the liver.</a> Biochem. J. 336 (Pt 1), 19-31 (1998).</li><li>Parker, G. J., Koay, A., Gilbert-Wilson, R., Waddington, L. J., Stapleton, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=AMP-activated+protein+kinase+does+not+associate+with+glycogen+alpha-particles+from+rat+liver.">AMP-activated protein kinase does not associate with glycogen alpha-particles from rat liver.</a> Biochem. Biophys. Res. Commun. 362, 811-815 (2007).</li><li>Sullivan, M. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nature+of+alpha+and+beta+particles+in+glycogen+using+molecular+size+distributions.">Nature of alpha and beta particles in glycogen using molecular size distributions.</a> Biomacromolecules. 11, 1094-1100 (2010).</li><li>Chee, N. P., Geddes, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+structure+of+liver+glycogen.">The structure of liver glycogen.</a> FEBS Lett. 73, 164-166 (1977).</li><li>Roach, P. J., Depaoli-Roach, A. A., Hurley, T. D., Tagliabracci, V. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glycogen+and+its+metabolism:+some+new+developments+and+old+themes.">Glycogen and its metabolism: some new developments and old themes.</a> Biochem. J. 441, 763-787 (2012).</li><li>Moses, S. W., Bashan, N., Gutman, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glycogen+metabolism+in+the+normal+red+blood+cell.">Glycogen metabolism in the normal red blood cell.</a> Blood. 40, 836-843 (1972).</li><li>Agbanyo, M., Taylor, N. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Incorporation+of+3-deoxy-3-fluoro-D-glucose+into+glycogen+and+trehalose+in+fat+body+and+flight+muscle+in+Locusta+migratoria.">Incorporation of 3-deoxy-3-fluoro-D-glucose into glycogen and trehalose in fat body and flight muscle in Locusta migratoria.</a> Biosci. Rep. 6, 309-316 (1986).</li><li>Louzao, M. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term="Fluorescent+glycogen"+formation+with+sensibility+for+in+vivo+and+in+vitro+detection.">"Fluorescent glycogen" formation with sensibility for in vivo and in vitro detection.</a> Glycoconj. J. 25, 503-510 (2008).</li><li>Sheehan, D. C. H., B, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Theory and practice of histotechnology. , (1980).</li><li>Baba, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Production+of+monoclonal+antibody+that+recognizes+glycogen+and+its+application+for+immunohistochemistry.">Production of monoclonal antibody that recognizes glycogen and its application for immunohistochemistry.</a> Kokubyo Gakkai Zasshi. 60, 264-287 (1993).</li></ol>

In vitro olarak glikojen biyokimyasal titrasyon hücreleri glikojen içerik doğru bir ölçümü sağlar. Diğer bazı teknikler (bir glikojen antikor ile PAS, immunofloresans, vb.) Ile karşılaştırıldığında, bu titrasyon çok özel, hassas ve tekrarlanabilir. Bu radyoaktivite, ancak florasan spektrometre gerektirdiğinden Ayrıca, yöntem uygundur. Ancak, bu teknik, nicel ve hücre içinde glikojen dağılımı hakkında bilgi sağlamaz. Bu yazıda tarif edilen tek...

Glikojen pek çok hücre sitoplazması içinde mevcut olan glikoz kalıntısının bir multibranched polimerdir. Bu hücrelerde enerji depolama ana biçimlerinden biridir ve glikoz metabolizmasında önemli bir rol oynar. Çoğu memeli hücreleri hızla metabolik stres sırasında glikoliz ve ATP üretimini teşvik etmek için glikoz içine bozulmuş olabilir ve mağaza glikojen, üretebiliriz. Hepatositler böylece vücuda glikoz sürekli tedarik sağlayan kan şekeri seviyesini düzenlemek için glikojen büyük miktarda üretir. Bunun aksine, diğer hücreler (kas, kırmızı kan hücreleri, vs) glikojen konsantrasyonu, nispeten düşüktür. Bununla birlikte, lokal olarak, bu miktarlar hücreler birden besin yoksun bir ortama maruz kaldıklarında kısa vadede enerji sağlamak için yeterlidir. Glikojen sentezi ve glikojen dökümü tüm dokularda aynı adımlar (Şekil 1) takip eder. İlk olarak, glikozglikoz taşıyıcılannın (gluts) ile hücrelere girer ve hızla fosfoglukomutaz glikoz-1-fosfat (G1P) glukoz-6-fosfat (G6P) dönüştürülür. G1P sonra UDP-glikoza modifiye edilir ve UDP-glikoz karbon C1 glycogenin, glikojen ankraj protein tirosin artığı bağlanmıştır. Bu molekül, bir glikojen primer olarak, glikojen sentaz üzerinden bir α (1 → 4) bağı ile terminal glikoz için UDP-glikoz eki ile uzatılır. 11 den fazla glikoz kalıntısının doğrusal bir zincir meydana getirildiği zaman, son olarak, dallanma enzimi, bir at α (1 → 6) bağı vasıtasıyla bir zincirin glikoz 6 glikoz kalıntısı, en az oluşan bir terminal oligosakkarit aktarır. Bu işlemin tekrarlanması tur başına 6.5 glükoz ile bir sarmal oluşturmak dalları ihtiva eden büyük bir fraktal bir yapı verir. Glikojen uyumlu eylem glukoza ters hidrolize olabilirBir dalın glikoz son artık ile glikojen molekülü arasındaki sınır glikosidik α (1 → 4) hidrolize α (1 → 6) bağlı ve glikojen fosforilaz hidrolize eden enzimler dallara ayrılmayı giderme bölgesinin. Glikojenolizin olarak bilinen bu reaksiyon, (ATP tüketimine yansıtan) AMP seviyelerinin arttırılması ile aktive ve glikoz ve ATP 2,3 ile inhibe edilir. Elektron mikroskobu ile, glikojen molekülü bir çok hücre tipinde çapı 15-30 nm olarak β serbest parçacıklar (ya da glikojen monopartıcles) &#39;de tarif edilmiştir. Hepatositler gibi özel hücre tiplerinde, β parçacıklar 80 nm ila 200 nm, 4, maksimum çapı da değişebilir α partiküller olarak bilinen rozetler, oluşturulması için bir kompleksi içine monte edilebilir </sup&gt;. Bu parçacıklar β α parçacıkların büyük kümeler oluşturmak için bağlı oldukları şekilde hala tam olarak aydınlatılamamıştır. Bazı kanıtlar β parçacıklar kovalent bağlama 5, hidrojen bağlanması, ya da protein-protein etkileşimleri yoluyla 6 ile bağlanmış olabilir kanıtlamak eğilimindedir. Hücrelerinde depolanmış olan glikojen miktarı, bir çok parametreye bağlıdır: (I) glikojen sentezini başlatır hücrede glycogenin miktarı, protein fosforilasyon / defosforilasyon düzenlenir glikojen sentaz ve fosforilazın (II) aktivitesi, (III) konsantrasyonu örneğin damar sistemi glukoz kaynağı ve hücreleri tarafından glikoz alımının gibi çeşitli parametrelere bağlıdır hücrelerin, glikoz. Glikojen depoları sıkı enerji metabolizmasını düzenleyen hormonlar tarafından, ara metabolitleri yoluyla biyosentetik hormonların allosterik yönetmelikle düzenlenir ve besin algılama sinyal yollarının 7 tarafından edilir. Bu olmak önemlidirdaha tüm vücut ve hücresel düzeyde glikojen metabolizmasının önemini anlamak için biyolojik numunelerde glikojen ölçmek mümkün. Biz burada glikojen için in vitro deneyinde bir hassas, yeniden üretilebilir ve uygun biyokimyasal açıklar. Bu teknik, glikojen özel hidroliz öncesi ve sonrası glikoz miktar floresan dayanmaktadır. Diğer yöntemler hücrelerde glikojen seviyesini tahmin etmek vardır, ama bunların çoğu kantitatif değildir. Hücrelerde glikojen ölçümü için tarif edilen birinci tekniklerden biri glikojen 8,9 halinde [14C]-glükoz dahil ölçümüne dayanıyordu. Radyoaktivite kullanılması işlemek için bu işlem daha zor hale getirir ama glikojen içine ve dış dallarına ve molekülün çekirdek glikoz kalıntısının dağılımı arasında ayırt glikoz dahil oranını temin etme avantajına sahiptir (aynı zamanda bir gerektirir Ek β-amylolysis ve kromatografik adım). Başka bir teknik, daha yakın zamanda geliştirilmiştir ve 2-NBDG eklenmesi dayanır (2 - {N-[7-nitrobenz-2-oksa-1 ,3-diazol-4-il] amino}-2-deoksiglukoz), bir glikojen 10 içine 2-deoksiglukoz floresan türevi. Ölçülen floresans yoğunluğu üretilen glikojen miktarını yansıtır ve bir floresan okuyucu ile ölçülebilir. Hücredeki floresan dağılımı da konfokal mikroskopi ile değerlendirilebilir. Diğer nonquantitative teknikler arasında, Periyodik asit-Schiff boyama (PAS) belki de en yaygın olanıdır. Bu, sabit hücrelerde, parafin içinde doku bölümleri ya da dondurulmuş olarak glikojen tespiti için de kullanılabilir. Mor Bu histolojik teknik renkler olmayan özel polisakkaritler, glikolipitler, glikoproteinler, selüloz ve nötr müsinler. Bu testin özgüllüğü özel olarak glikojen digests diastaz, sabit hücre veya doku kesitlerinin tedavisi ile arttırılabilir. Daha sonra,glikojen nitel düzeyi (karbonhidrat dışında glikojen makro molekülleri modifiye edilmiş) hidrolize örnekler hidrolize olmamış örnekleri (her karbonhidrat değiştirilmiş makro moleküller) karşılaştırılması ile tahmin edilebilir. Glikojen biyokimyasal deneylerde farklı PAS boyanması ve mikroskopik analizleri, dağınık ya da hücrenin belirli bir kısmı içinde konsantre edilebilir hücrede glikojen dağılımı hakkında bilgi sağlar. Hatta farklı koşullar arasında glikojen birikiminin PAS boyama tahminler farklar da, ancak, bu 11 kantitatif değildir. Bir monoklonal fare antikoru başlangıçta in vitro antijen 12 hücrelerinde glikojen ve saflaştırılmış glikojen ile tepkimeye gösterildiği gibi çene kondiler kıkırdak kullanılarak yapılır. Bu antikor özel olarak glikojen ilgili şeker zincirleri kabul ettiği gibi, bu PAS boyanması daha özel bir şekilde immünohistokimya ile glikojen tespiti için yararlı bir araçtır. </p&gt; Elektron mikroskopisi hücreleri ve glikojen depolama derecesinin değerlendirilmesinde glikojen tanelerinin görüntülenmesini sağlayan bir başka tekniktir. Aslında, glikojen β parçacıkların elektron yoğun granüller 1 gibi bir elektron mikroskobu ile kolayca tanınabilir.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="always">
		<tbody>
		 <tr>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>REAGENTS</td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>DMEM</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>31966.047</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>Glycogen Assay Kit</td>
			<td>Abcam</td>
			<td>ab65620 </td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>PBS</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		 </tr>
		<tr>
 	<td></td>
 <td></td>
 <td></td>
 <td>EQUIPMENT</td>
	 </tr>
		 <tr>
			<td>Material Name</td>
			<td>Company</td>
			<td>Catalogue Number</td>
			<td>Comments (optional)</td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>Fluorescence Spectrometer</td>
			<td>PerkinElmer</td>
			<td>LS 50B</td>
			<td></td>
		 </tr>
		</tbody>
 </table>

biochemical titration of glycogen in vitro

Glikojen omurgalı hayvanlarda glikoz ana enerjik polimerdir ve önemli bir tüm vücut metabolizmasında rol hem de hücresel metabolizmada oynar. Glikojen tespit etmek için birçok yöntem zaten var ama sadece birkaç nicel vardır. Burada glikoamilaz glukoza glikojen özel bozulması dayanır Abcam Glikojen deney takımı kullanılarak bir metodu tarif etmektedir. Glukoz sonra özellikle floresan üretmek için OxiRed prob ile reaksiyona giren bir ürün için oksitlenir. Titrasyon doğru, hassas ve hücre ekstreleri veya doku bölümleri üzerinde elde edilebilir. Bununla birlikte, diğer tekniklerin aksine, bu hücrede glikojen dağılımı hakkında bilgi vermemektedir. Bu tekniğin bir örneği olarak, normoksiyada kuluçkaya iki hücre hatları, Çin hamsteri akciğer fibroblast CCL39 ve insan kolon karsinoma LS174, hipoksi karşı (% 21 O 2) (1% 2 O) burada glikojen titrasyonu açıklar. Biz hipoksi bir sig olduğunu varsaydıknal o hücreleri 1, hayatta kalmak için sentez ve mağaza glikojen hazırlar.

Tümör hücrelerine karşı tümörler sinyaller oksijen (hipoksi) hayatta kalmak üzere, daha sonra besin tüketimi işlemek için enerji depolamak için ihtiyaç bir düşük düzeyde. Glikojen memeli hücrelerinde glikoz ana enerji polimer olduğu için, hipoksi glikojen depolama düzenleme incelenmiştir. Tablolar 1, 2 ve 3 &#39;de gösterildiği gibi, hücre lizatları içinde glikojen konsantrasyonunun hesaplanması ve standardizasyon floresans ham veriler üzerinde gerçekleşti...

Watch this Scientific Journal Video about Biochemical Titration of Glycogen In vitro at JoVE.com

Biochemical Titration of Glycogen In vitro

Burada in vitro glikojen titrasyonu için bir doğru, tekrarlanabilir ve uygun biyokimyasal yöntem açıklanmaktadır. Bu teknik Abcam Glikojen deney kiti kullanır ve floresan ile titrasyon glikoz ve glikoz glikojen ardışık hidrolizi dayanmaktadır.

Glikojenin Biyokimyasal titrasyonu<em&gt; In vitro</em

Glycogen is the main energetic polymer of glucose in vertebrate animals and plays a crucial role in whole body metabolism as well as in cellular ...

Research

JoVE Journal

Biology

Biochemical Titration of Glycogen In vitro

Titration of Human Coronaviruses Using an Immunoperoxidase Assay

Immunoperoksidaz Testi İnsan coronavirüsleri Titrasyon

Determination of infectious viral titers is a basic and essential experimental approach for virologists. Classical plaque assays cannot be used for ...

Zebrafish Brain Ventricle Injection

Zebra balığı Beyin Ventrikül Enjeksiyon

Proper brain ventricle formation during embryonic brain development is required for normal brain function.  Brain ventricles are the highly conserved ...

Collecting Variable-concentration Isothermal Titration Calorimetry Datasets in Order to Determine Binding Mechanisms

Cilt Mekanizmaları belirleme Sipariş Değişken konsantrasyon İzotermal Titrasyon Kalorimetre Veri Kümeleri toplanıyor

Isothermal titration calorimetry (ITC) is commonly used to determine the thermodynamic parameters associated with the binding of a ligand to a host ...

Biochemical Reconstitution of Steroid Receptor&#x2022;Hsp90 Protein  Complexes and Reactivation of Ligand Binding

Biochemical Reconstitution of Steroid ReceptorÃƒÂ¢Ã¢â€šÂ¬Ã‚Â¢Hsp90 Protein  Complexes and Reactivation of Ligand Binding

Steroid Reseptör Biyokimyasal Sulandırma Ligand • Protein Hsp90 Kompleksleri ve Yeniden bağlayıcı

Hsp90 is an essential and highly abundant molecular chaperone protein that has been found to regulate more than 150 eukaryotic signaling proteins, ...

Blood Collection for Biochemical Analysis in Adult Zebrafish

Yetişkin Zebra balığı Biyokimyasal Analiz için Kan Alma

The zebrafish has been used as an animal model for studies of several human diseases. It can serve as a powerful preclinical platform for studies of ...

Isolation of Ribosome Bound Nascent Polypeptides in vitro to Identify Translational Pause Sites Along mRNA

Isolation of Ribosome Bound Nascent Polypeptides in vitro to Identify Translational Pause Sites Along mRNA

Ribozom Bağlı Doğan Polipeptitler İzolasyonu<em&gt; In vitro</em&gt; MRNA boyunca Translasyonel Duraklat Siteleri Belirleme

The rate of translational elongation is non-uniform. mRNA secondary structure, codon usage and mRNA associated proteins may alter ribosome movement on the ...

Biochemical and High Throughput Microscopic Assessment of Fat Mass in Caenorhabditis Elegans

Biochemical and High Throughput Microscopic Assessment of Fat Mass in Caenorhabditis Elegans

Fat Kütle Biyokimyasal ve Yüksek Verimli Mikroskobik Değerlendirme<em&gt; Caenorhabditis Elegans</em

The nematode C. elegans has emerged as an important  model for the study of conserved genetic pathways regulating fat metabolism as  it relates to human ...

Biochemical Assays for Analyzing Activities of ATP-dependent Chromatin Remodeling Enzymes

ATP-bağımlı Kromatin Tadilat Enzimler Faaliyetlerinin Analizi için biyokimyasal Tahliller

Members of the SNF2 family of ATPases often function as components of multi-subunit chromatin remodeling complexes that regulate nucleosome dynamics and ...

High-throughput Titration of Luciferase-expressing Recombinant Viruses

Lusiferaz ifade eden rekombinant virüsler yüksek verimlilik Titrasyon

Standard plaque assays to determine infectious viral titers can be time consuming, are not amenable to a high volume of samples, and cannot be done with ...