Name: kinetic measurement and real time visualization of somatic reprogramming
Uploaded: 2016-07-30T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Kinetic Measurement and Real Time Visualization of Somatic Reprogramming at JoVE.com

الكتاب أشكر تشاد ماك آرثر لإجراء مناقشات مفيدة.

1.Solution وإعداد المتوسطة <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> الطابق السفلي غشاء مصفوفة (تنقية من Engelbreth-هولم-سرب ورم) <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ببطء ذوبان الجليد مصفوفة الغشاء القاعدي (5 مل) على الجليد في 4 درجات مئوية خلال الل...

<ol>
	<li>Yamanaka, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Induced+pluripotent+stem+cells:+past,+present,+and+future.">Induced pluripotent stem cells: past, present, and future.</a> Cell Stem Cell. 10, 678-684 (2012).</li><li>Robinton, D. A., Daley, G. Q. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+promise+of+induced+pluripotent+stem+cells+in+research+and+therapy.">The promise of induced pluripotent stem cells in research and therapy.</a> Nature. 481, 295-305 (2012).</li><li>Kamata, M., Liang, M., Liu, S., Nagaoka, Y., Chen, I. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Live+cell+monitoring+of+hiPSC+generation+and+differentiation+using+differential+expression+of+endogenous+microRNAs.">Live cell monitoring of hiPSC generation and differentiation using differential expression of endogenous microRNAs.</a> PLoS One. 5, e11834 (2010).</li><li>Vendrell, M., Zhai, D., Er, J. C., Chang, Y. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Combinatorial+strategies+in+fluorescent+probe+development.">Combinatorial strategies in fluorescent probe development.</a> Chem Rev. 112, 4391-4420 (2012).</li><li>Aasen, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Efficient+and+rapid+generation+of+induced+pluripotent+stem+cells+from+human+keratinocytes.">Efficient and rapid generation of induced pluripotent stem cells from human keratinocytes.</a> Nat Biotechnol. 26, 1276-1284 (2008).</li><li>Quintanilla, R. H., Asprer, J. S., Vaz, C., Tanavde, V., Lakshmipathy, U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=CD44+is+a+negative+cell+surface+marker+for+pluripotent+stem+cell+identification+during+human+fibroblast+reprogramming.">CD44 is a negative cell surface marker for pluripotent stem cell identification during human fibroblast reprogramming.</a> PLoS One. 9, e85419 (2014).</li><li>Papp, B., Plath, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Reprogramming+to+pluripotency:+stepwise+resetting+of+the+epigenetic+landscape.">Reprogramming to pluripotency: stepwise resetting of the epigenetic landscape.</a> Cell Res. 21, 486-501 (2011).</li><li>Nefzger, C. M., Alaei, S., Knaupp, A. S., Holmes, M. L., Polo, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell+surface+marker+mediated+purification+of+iPS+cell+intermediates+from+a+reprogrammable+mouse+model.">Cell surface marker mediated purification of iPS cell intermediates from a reprogrammable mouse model.</a> J Vis Exp. , e51728 (2014).</li><li>Xu, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Immortalized+fibroblast-like+cells+derived+from+human+embryonic+stem+cells+support+undifferentiated+cell+growth.">Immortalized fibroblast-like cells derived from human embryonic stem cells support undifferentiated cell growth.</a> Stem Cells. 22, 972-980 (2004).</li><li>International Stem Cell Initiative. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+human+embryonic+stem+cell+lines+by+the+International+Stem+Cell+Initiative.">Characterization of human embryonic stem cell lines by the International Stem Cell Initiative.</a> Nat Biotechnol. 25, 803-816 (2007).</li><li>Singh, U., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Novel+live+alkaline+phosphatase+substrate+for+identification+of+pluripotent+stem+cells.">Novel live alkaline phosphatase substrate for identification of pluripotent stem cells.</a> Stem Cell Rev. 8, 1021-1029 (2012).</li><li>Naujok, O., Lenzen, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+critical+re-evaluation+of+CD24-positivity+of+human+embryonic+stem+cells+differentiated+into+pancreatic+progenitors.">A critical re-evaluation of CD24-positivity of human embryonic stem cells differentiated into pancreatic progenitors.</a> Stem Cell Rev. 8, 779-791 (2012).</li><li>Ramirez, J. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Brief+report:+benchmarking+human+pluripotent+stem+cell+markers+during+differentiation+into+the+three+germ+layers+unveils+a+striking+heterogeneity:+all+markers+are+not+equal.">Brief report: benchmarking human pluripotent stem cell markers during differentiation into the three germ layers unveils a striking heterogeneity: all markers are not equal.</a> Stem Cells. 29, 1469-1474 (2011).</li><li>Huang, H. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Epithelial+cell+adhesion+molecule+(EpCAM)+complex+proteins+promote+transcription+factor-mediated+pluripotency+reprogramming.">Epithelial cell adhesion molecule (EpCAM) complex proteins promote transcription factor-mediated pluripotency reprogramming.</a> J Biol Chem. 286, 33520-33532 (2011).</li><li>Kolle, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+human+embryonic+stem+cell+surface+markers+by+combined+membrane-polysome+translation+state+array+analysis+and+immunotranscriptional+profiling.">Identification of human embryonic stem cell surface markers by combined membrane-polysome translation state array analysis and immunotranscriptional profiling.</a> Stem Cells. 27, 2446-2456 (2009).</li><li>Thyagarajan, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Creation+of+engineered+human+embryonic+stem+cell+lines+using+phiC31+integrase.">Creation of engineered human embryonic stem cell lines using phiC31 integrase.</a> Stem Cells. 26, 119-126 (2008).</li></ol>

This study provides strategies for monitoring and tracking of the reprogramming process using flow cytometry and real-time imaging-based analysis. The critical steps in the protocol are initiating reprogramming, measuring reprogramming progression based on marker expression and real-time monitoring of reprogramming. Any reprogramming method of choice can be used but here we focus on Sendai based reprogramming of human fibroblasts. The advantage of this method is the ease of use and consistent high efficiency of reprogram...

الناجم عن الخلايا الجذعية المحفزة المشتقة من المريض (iPSCs) هي أدوات واعدة لعلاج الخلايا وفحص المخدرات. أنها توفر مصدر ذاتي للخلايا لعلاج. وبالإضافة إلى ذلك، فإنها تشمل مجموعة واسعة جدا من خلفيات وراثية، مما يتيح لفي المختبر تحليل مفصل للأمراض الوراثية وراء ما الخطوط الحالية الخلايا الجذعية الجنينية (ESC) سيسمح. وقد أدت التطورات الحديثة في تطوير العديد من الطرق لتوليد iPSCs، بما في ذلك إعادة برمجة مع فيروس سينداي، البلازميدات episomal أو من mRNAs 1،2. والجدير بالذكر أن ترتبط طرق برمجة مختلفة مع مستويات الكفاءة والأمان متفاوتة، ومن المرجح أن تختلف في الطرق الأخرى التي تؤثر في مدى ملاءمتها لمختلف التطبيقات. مع توافر مجموعة متنوعة من تقنيات برمجة، أصبح من المهم وضع أساليب لتقييم عملية إعادة البرمجة. معظم الطرق الحالية تعتمد على التفتيش النوعي للالتشكل أو تلطيخمع الأصباغ والأجسام المضادة خلايا محددة الجذعية. واحد طريقة تم تطويرها مؤخرا يجعل من استخدام للصحفيين مضان lentiviral التي تعتبر حساسة لmiRNAs-PSC معين أو من mRNAs خلية محددة متباينة 3. هذه الطرق مراقبة تسهل اختيار وتعظيم الاستفادة من تقنيات إعادة برمجة لحالات مختلفة. على سبيل المثال، تم استخدام CDy1 باعتباره التحقيق الفلورسنت لiPSCs في وقت مبكر من أجل كشف عن جهري إعادة برمجة 4. القدرة على مراقبة ومقارنة التجارب برمجة مختلفة هو أمر حاسم لاكتساب فهم أفضل لعملية نفسها أيضا. على سبيل المثال، فمن المعروف الآن أن بعض أنواع الخلايا الجسدية هي أسهل لإعادة برمجة من غيرها 5، وأن الخلايا تمر عبر دول وسيطة خلال إعادة برمجة 6-8. وللأسف، فإن الآليات الكامنة وراء عملية إعادة برمجة لا تزال غير مفهومة تماما، وبالتالي، تبقى الاختلافات الدقيقة بين طرق برمجة أيضا أن defined. وبالتالي، فإن أساليب الرصد والتقييم، ومقارنة الأحداث برمجة أن تكون حاسمة لمجال الخلايا الجذعية. الأساليب المذكورة في هذا البروتوكول تسمح رصد وتقييم عملية إعادة برمجة وتوضح كيف أن هذه التقنيات يمكن أن تستخدم للمقارنة بين مجموعات مختلفة من الكواشف إعادة برمجة. ينطوي النهج الأول التدفق الخلوي التحليلات باستخدام مزيج من الأجسام المضادة ضد الإيجابية والسلبية الخلايا الجذعية المحفزة (PSC) علامات. الثانية الأزواج نهج التصوير في الوقت الحقيقي وقياس مجموع التقاء (منطقة في المئة السطح الخلايا المغطاة) والتقاء إشارات علامة (المنطقة في المئة السطح بواسطة إشارات الفلورسنت المغطاة).

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="795">
	<tbody>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">DMEM, high glucose, GlutaMAXSupplement, pyruvate</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">10569-010</td>
			<td style="width:88px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">Fetal Bovine Serum, embryonic stem cell-qualified, US origin</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">16141-061</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">MEM Non-Essential Amino Acids Solution (100X)</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">11140-050</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">Trypsin-EDTA (0.05%), phenol red&#160;</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">25300-054</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">Mouse (ICR) Inactivated Embryonic Fibroblasts</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">A24903</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">Attachment Factor Protein (1X)</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">S-006-100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">DMEM/F-12, GlutaMAX supplement</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">10565-018</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">KnockOut Serum Replacement</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td align="right" style="width:147px;">10828010</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">2-Mercaptoethanol (55 mM)</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">21985-023</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">Collagenase, Type IV, powder</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">17104-019</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">TrypLE Select Enzyme (1X), no phenol red&#160;</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">12563-011</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">DPBS, no calcium, no magnesium&#160;</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">14190-144</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="61">
			<td height="61" style="height:61px;width:297px;">Geltrex LDEV-Free, hESC-Qualified, Reduced Growth Factor Basement Membrane Matrix</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">A1413302</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">Essential 8 Medium</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">A1517001</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">FGF-Basic (AA 1-155) Recombinant Human Protein</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">PHG0264</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">UltraPure 0.5M EDTA, pH 8.0</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">15575-020</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">Bovine Albumin Fraction V (7.5% solution)</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">15260-037</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">HEPES (1 M)</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">15630-080</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL)</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">15140-122</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">InSolution Y-27632</td>
			<td style="width:263px;">EMD Millipore</td>
			<td align="right" style="width:147px;">688001</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">CytoTune-iPS Sendai Reprogramming Kit</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">A1378001</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">CytoTune-iPS 2.0 Sendai Reprogramming Kit</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">A16517</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">Countess II Automated Cell Counter</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">AMQAX1000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">Countess Cell Counting Chamber Slides</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">C10228</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">BJ ATCC Human Foreskin Fibroblasts, Neonatal</td>
			<td style="width:263px;">ATCC</td>
			<td style="width:147px;">CRL-2522</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">DF1 Adult Human Dermal Fibroblast</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">N/A</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">BG01V/hOG Cells Variant hESC hOct4-GFP Reporter Cells</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">R7799-105</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">IncuCyte ZOOM</td>
			<td style="width:263px;">Essen BioScience</td>
			<td style="width:147px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">SSEA-4 Antibody, Alexa Fluor 647 conjugate (MC813-70)</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">SSEA421</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="61">
			<td height="61" style="height:61px;width:297px;">SSEA-4 Antibody, Alexa Fluor 488 conjugate (eBioMC-813-70 (MC-813-70))</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">A14810</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">SSEA-4 Antibody (MC813-70)</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">41-4000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">TRA-1-60 Antibody (cl.A)</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">&#160;41-1000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">CD44 Rat Anti-Human/Mouse mAb (clone IM7), PE-Cy5 conjugate</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">A27094</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">CD44 Alexa Fluor 488 Conjugate Kit for Live Cell Imaging</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">A25528</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">CD44 Rat Anti-Human/Mouse mAb (Clone IM7)</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">RM-5700 (no longer available)</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">Goat anti-Mouse IgG (H+L) Secondary Antibody, Alexa Fluor 488 conjugate</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">&#160;A-11029</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">Goat anti-Rat IgG (H+L) Secondary Antibody, Alexa Fluor 594 conjugate</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">&#160;A-11007</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">Alkaline Phosphatase Live Stain</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">A14353</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">TRA-1-60 Alexa Fluor 488 Conjugate Kit for Live Cell Imaging</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">A25618</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">CD24 Mouse Anti-Human mAb (clone SN3), FITC conjugate</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">MHCD2401</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">beta-2 Microglobulin Antibody, FITC conjugate (B2M-01)</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">A15737</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">EpCAM / CD326 Antibody, FITC conjugate (VU-1D9)</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">A15755</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">CD73 / NT5E Antibody (7G2)</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">41-0200</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">VECTOR Red Alkaline Phosphatase (AP) Substrate Kit</td>
			<td style="width:263px;">Vector Laboratories</td>
			<td style="width:147px;">SK-5100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">Zeiss Axio Observer.Z1 microscope&#160;</td>
			<td style="width:263px;">Carl Zeiss</td>
			<td style="width:147px;">491912-0003-000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">FlowJo Data Analysis Software</td>
			<td style="width:263px;">FLOJO, LLC</td>
			<td style="width:147px;">N/A</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">Attune Accoustic Focusing Cytometer, Blue/Red Laser</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:147px;">Use Attune NXT&#160;</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">S3e\ Cell Sorter (488/561 nm)</td>
			<td style="width:263px;">BIO-RAD</td>
			<td align="right" style="width:147px;">1451006</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">Falcon 12 x 75 mm Tube with Cell Strainer Cap</td>
			<td style="width:263px;">Corning</td>
			<td align="right" style="width:147px;">352235</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">Falcon 15 mL, high-clarity, dome-seal screw cap</td>
			<td style="width:263px;">Corning</td>
			<td align="right" style="width:147px;">352097</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">Falcon T-75 Flask</td>
			<td style="width:263px;">Corning</td>
			<td align="right" style="width:147px;">353136</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">Falcon T-175 Flask</td>
			<td style="width:263px;">Corning</td>
			<td align="right" style="width:147px;">353112</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">Falcon 6-well dish</td>
			<td style="width:263px;">Corning</td>
			<td align="right" style="width:147px;">353046</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">HERAEUS HERACELL CO2 ROLLING INCUBATOR</td>
			<td style="width:263px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td align="right" style="width:147px;">51013669</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:297px;">Nonstick, RNase-free Microfuge Tubes, 1.5 mL</td>
			<td style="width:263px;"></td>
			<td style="width:147px;">AM12450</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:297px;">HulaMixer Sample Mixer</td>
			<td style="width:263px;"></td>
			<td style="width:147px;">15920D</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

kinetic measurement and real time visualization of somatic reprogramming

Somatic reprogramming has enabled the conversion of adult cells to induced pluripotent stem cells (iPSC) from diverse genetic backgrounds and disease phenotypes. Recent advances have identified more efficient and safe methods for introduction of reprogramming factors. However, there are few tools to monitor and track the progression of reprogramming. Current methods for monitoring reprogramming rely on the qualitative inspection of morphology or staining with stem cell-specific dyes and antibodies. Tools to dissect the progression of iPSC generation can help better understand the process under different conditions from diverse cell sources. 
This study presents key approaches for kinetic measurement of reprogramming progression using flow cytometry as well as real-time monitoring via imaging. To measure the kinetics of reprogramming, flow analysis was performed at discrete time points using antibodies against positive and negative pluripotent stem cell markers. The combination of real-time visualization and flow analysis enables the quantitative study of reprogramming at different stages and provides a more accurate comparison of different systems and methods. Real-time, image-based analysis was used for the continuous monitoring of fibroblasts as they are reprogrammed in a feeder-free medium system. The kinetics of colony formation was measured based on confluence in the phase contrast or fluorescence channels after staining with live alkaline phosphatase dye or antibodies against SSEA4 or TRA-1-60. The results indicated that measurement of confluence provides semi-quantitative metrics to monitor the progression of reprogramming.

مراقبة حركية إعادة برمجة باستخدام التدفق الخلوي CD44 هو علامة الليفية في حين SSEA4 هو علامة PSC 6،10. كما هو متوقع من هذا النمط التعبير، التدفق الخلوي الخلايا الليفية BJ يدل على SSEA4 - CD44 ...

Watch this Scientific Journal Video about Kinetic Measurement and Real Time Visualization of Somatic Reprogramming at JoVE.com

Kinetic Measurement and Real Time Visualization of Somatic Reprogramming

يصف بروتوكول المعروضة في هذه الدراسة أساليب لرصد الوقت الحقيقي لتقدم برمجة عن طريق قياس الحركية من علامات الخلايا الجذعية المحفزة الإيجابية والسلبية باستخدام تحليل التدفق الخلوي. ويشمل البروتوكول أيضا على تقييم القائم على التصوير من التشكل، وعلامة أو التعبير مراسل خلال جيل التوجيهية.

الحركية قياس وفي الوقت الحقيقي التصور من إعادة برمجة الجسدية

Somatic reprogramming has enabled the conversion of adult cells to induced pluripotent stem cells (iPSC) from diverse genetic backgrounds and disease ...

Research

JoVE Journal

Developmental Biology

Stable and Efficient Genetic Modification of Cells in the Adult Mouse V-SVZ for the Analysis of Neural Stem Cell Autonomous and Non-autonomous Effects

مستقر وكفاءة التحوير الوراثي للخلايا في الكبار ماوس V-SVZ لتحليل العصبية الخلايا الجذعية الذاتية الحكم والآثار لغير المتمتعة بالحكم الذاتي

Relatively quiescent somatic stem cells support life-long cell renewal in most adult tissues. Neural stem cells in the adult mammalian brain are ...

Evaluation of Injury-induced Senescence and In Vivo Reprogramming in the Skeletal Muscle

Evaluation of Injury-induced Senescence and In Vivo Reprogramming in the Skeletal Muscle

تقييم الضرر الناجم عن الشيخوخة و في فيفو إعادة برمجة في العضلات الهيكلية

Cellular senescence is a stress response that is characterized by a stable cellular growth arrest, which is important for many physiological and ...

Multi-Photon Time Lapse Imaging to Visualize Development in Real-time: Visualization of Migrating Neural Crest Cells in Zebrafish Embryos

تصوير مرور الوقت فوتون متعددة لتصور التنمية في الوقت الحقيقي: التصور لترحيل الخلايا العصبية كريست في الأجنة الزرد

Congenital eye and craniofacial anomalies reflect disruptions in the neural crest, a transient population of migratory stem cells that give rise to ...

Real-time Measurement of Epithelial Barrier Permeability in Human Intestinal Organoids

قياس النفاذية الحاجز الظهارية في أورجانويدس المعوية البشرية في الوقت الحقيقي

Advances in 3D culture of intestinal tissues obtained through biopsy or generated from pluripotent stem cells via directed differentiation, have resulted ...

Direct Lineage Reprogramming of Adult Mouse Fibroblast to Erythroid Progenitors

توجيه نسب إعادة برمجة الماوس الكبار تنتجها الخلايا الليفية لموروث محمر

Erythroid cell commitment and differentiation proceed through activation of a lineage-restricted transcriptional network orchestrated by a group of cell ...

Hemogenic Reprogramming of Human Fibroblasts by Enforced Expression of Transcription Factors

الأرقاء أعاده برمجه الخلايا الليفية البشرية عن طريق التعبير القسري من عوامل النسخ

The cellular and molecular mechanisms underlying specification of human hematopoietic stem cells (HSCs) remain elusive. Strategies to recapitulate human ...

A Layered Mounting Method for Extended Time-Lapse Confocal Microscopy of Whole Zebrafish Embryos

طريقه تركيب طبقات لتمديد المجهر البؤري المجهري لأجنه الزبرافيش الكاملة بفواصل زمنيه طويلة

Dynamics of development can be followed by confocal time-lapse microscopy of live transgenic zebrafish embryos expressing fluorescence in specific tissues ...

Real-time Bioluminescence Imaging of Notch Signaling Dynamics during Murine Neurogenesis

في الوقت الحقيقي التصوير الضوئي التلالؤ من الدرجة ديناميات الإشارات اثناء التكوين العصبي Murine

Notch signaling regulates the maintenance of neural stem/progenitor cells by cell-cell interactions. The components of Notch signaling exhibit dynamic ...

Real-Time Imaging of CCL5-Induced Migration of Periosteal Skeletal Stem Cells in Mice

التصوير في الوقت الحقيقي من الهجرة الناجمة عن CCL5 من الخلايا الجذعية الهيكل العظمي البيريوستال في الفئران

Periosteal skeletal stem cells (P-SSCs) are essential for lifelong bone maintenance and repair, making them an ideal focus for the development of ...

Direct Reprogramming of Mouse Fibroblasts into Melanocytes

إعادة البرمجة المباشرة للخلايا الليفية للفأر في الخلايا الصباغية

The loss of function of melanocytes leads to vitiligo, which seriously affects the physical and mental health of the affected individuals. Presently, ...