Name: identification and characterization of metastatic factors by gene transfer into the novel rip-tag; rip-tva murine model
Uploaded: 2017-10-16T12:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Identification and Characterization of Metastatic Factors by Gene Transfer into the Novel RIP-Tag; RIP-tva Murine Model at JoVE.com

Wij danken Harold Varmus, Brian C. Lewis, Douglas Hanahan, Danny Huang, Sharon Pang, Megan Wong en Manasi M. Godbole. Y.C.N.D. wordt ondersteund door DOD grant W81XWH-16-1-0619 en NIH grant 1R01CA204916.

ethische verklaring: experimenten op dieren werden uitgevoerd overeenkomstig de richtsnoeren en voorschriften uiteengezet door het Institute for Animal Care en gebruik Comité van Weill Cornell geneeskunde.
 1. keuze van aviaire retrovirale vectoren (RCASBP A gebaseerde of RCANBP(A)-based) <ul style="list-style: none;"> <li>vectoren is afgeleid van Rous Sarcoom virus 11. Aviaire retrovirale vectoren cDNAs kunnen leveren (&#8804; 2.5 kb), korte haarspeld RNAs (shRNAs...

<ol>
	<li>Vogelstein, B., Kinzler, K. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+multistep+nature+of+cancer.">The multistep nature of cancer.</a> Trends Genet. 9 (4), 138-141 (1993).</li><li>Walrath, J. C., Hawes, J. J., Van Dyke, T., Reilly, K. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genetically+engineered+mouse+models+in+cancer+research.">Genetically engineered mouse models in cancer research.</a> Adv Cancer Res. 106, 113-164 (2010).</li><li>Khanna, C., Hunter, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Modeling+metastasis+in+vivo.">Modeling metastasis in vivo.</a> Carcinogenesis. 26 (3), 513-523 (2005).</li><li>Du, Y. C., Lewis, B. C., Hanahan, D., Varmus, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assessing+tumor+progression+factors+by+somatic+gene+transfer+into+a+mouse+model:+Bcl-xL+promotes+islet+tumor+cell+invasion.">Assessing tumor progression factors by somatic gene transfer into a mouse model: Bcl-xL promotes islet tumor cell invasion.</a> PLoS biology. 5 (10), e276 (2007).</li><li>Hanahan, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Heritable+formation+of+pancreatic+beta-cell+tumours+in+transgenic+mice+expressing+recombinant+insulin/simian+virus+40+oncogenes.">Heritable formation of pancreatic beta-cell tumours in transgenic mice expressing recombinant insulin/simian virus 40 oncogenes.</a> Nature. 315 (6015), 115-122 (1985).</li><li>Fisher, G. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Development+of+a+flexible+and+specific+gene+delivery+system+for+production+of+murine+tumor+models.">Development of a flexible and specific gene delivery system for production of murine tumor models.</a> Oncogene. 18 (38), 5253-5260 (1999).</li><li>Orsulic, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+RCAS-TVA-based+approach+to+designer+mouse+models.">An RCAS-TVA-based approach to designer mouse models.</a> Mamm Genome. 13 (10), 543-547 (2002).</li><li>Tuveson, D., Hanahan, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Translational+medicine:+Cancer+lessons+from+mice+to+humans.">Translational medicine: Cancer lessons from mice to humans.</a> Nature. 471 (7338), 316-317 (2011).</li><li>Choi, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bcl-xL+promotes+metastasis+independent+of+its+anti-apoptotic+activity.">Bcl-xL promotes metastasis independent of its anti-apoptotic activity.</a> Nat Commun. 7, 10384 (2016).</li><li>Naik, P., Karrim, J., Hanahan, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+rise+and+fall+of+apoptosis+during+multistage+tumorigenesis:+down-modulation+contributes+to+tumor+progression+from+angiogenic+progenitors.">The rise and fall of apoptosis during multistage tumorigenesis: down-modulation contributes to tumor progression from angiogenic progenitors.</a> Genes Dev. 10 (17), 2105-2116 (1996).</li><li>Hughes, S. H., Greenhouse, J. J., Petropoulos, C. J., Sutrave, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Adaptor+plasmids+simplify+the+insertion+of+foreign+DNA+into+helper-independent+retroviral+vectors.">Adaptor plasmids simplify the insertion of foreign DNA into helper-independent retroviral vectors.</a> J Virol. 61 (10), 3004-3012 (1987).</li><li>Petropoulos, C. J., Payne, W., Salter, D. W., Hughes, S. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Appropriate+in+vivo+expression+of+a+muscle-specific+promoter+by+using+avian+retroviral+vectors+for+gene+transfer+[corrected].">Appropriate in vivo expression of a muscle-specific promoter by using avian retroviral vectors for gene transfer [corrected].</a> J Virol. 66 (6), 3391-3397 (1992).</li><li>Dunn, K. J., Williams, B. O., Li, Y., Pavan, W. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neural+crest-directed+gene+transfer+demonstrates+Wnt1+role+in+melanocyte+expansion+and+differentiation+during+mouse+development.">Neural crest-directed gene transfer demonstrates Wnt1 role in melanocyte expansion and differentiation during mouse development.</a> Proc Natl Acad Sci USA. 97 (18), 10050-10055 (2000).</li><li>Loftus, S. K., Larson, D. M., Watkins-Chow, D., Church, D. M., Pavan, W. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Generation+of+RCAS+vectors+useful+for+functional+genomic+analyses.">Generation of RCAS vectors useful for functional genomic analyses.</a> DNA Res. 8 (5), 221-226 (2001).</li><li>Bromberg-White, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Delivery+of+short+hairpin+RNA+sequences+by+using+a+replication-competent+avian+retroviral+vector.">Delivery of short hairpin RNA sequences by using a replication-competent avian retroviral vector.</a> J Virol. 78 (9), 4914-4916 (2004).</li><li>Harpavat, S., Cepko, C. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=RCAS-RNAi:+a+loss-of-function+method+for+the+developing+chick+retina.">RCAS-RNAi: a loss-of-function method for the developing chick retina.</a> BMC Dev Biol. 6 (2), (2006).</li><li>Huse, J. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+PTEN-regulating+microRNA+miR-26a+is+amplified+in+high-grade+glioma+and+facilitates+gliomagenesis+in+vivo.">The PTEN-regulating microRNA miR-26a is amplified in high-grade glioma and facilitates gliomagenesis in vivo.</a> Genes Dev. 23 (11), 1327-1337 (2009).</li><li>Ahronian, L. G., Lewis, B. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Generation+of+high-titer+RCAS+virus+from+DF1+chicken+fibroblasts.">Generation of high-titer RCAS virus from DF1 chicken fibroblasts.</a> Cold Spring Harb Protoc. 2014 (11), 1161-1166 (2014).</li><li>Green, M. R., Sambrook, J., Sambrook, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Molecular cloning: a laboratory manual. , (2012).</li><li>Du, Y. C., Lewis, B. C., Hanahan, D., Varmus, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assessing+tumor+progression+factors+by+somatic+gene+transfer+into+a+mouse+model:+Bcl-xL+promotes+islet+tumor+cell+invasion.">Assessing tumor progression factors by somatic gene transfer into a mouse model: Bcl-xL promotes islet tumor cell invasion.</a> PLoS Biol. 5 (10), 2255-2269 (2007).</li><li>Du, Y. C., Chou, C. K., Klimstra, D. S., Varmus, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Receptor+for+hyaluronan-mediated+motility+isoform+B+promotes+liver+metastasis+in+a+mouse+model+of+multistep+tumorigenesis+and+a+tail+vein+assay+for+metastasis.">Receptor for hyaluronan-mediated motility isoform B promotes liver metastasis in a mouse model of multistep tumorigenesis and a tail vein assay for metastasis.</a> Proc Natl Acad Sci USA. 108 (40), 16753-16758 (2011).</li><li>Guernet, A., Grumolato, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=CRISPR/Cas9+editing+of+the+genome+for+cancer+modeling.">CRISPR/Cas9 editing of the genome for cancer modeling.</a> Methods. , (2017).</li></ol>

In deze studie beschreven we een krachtige muismodel, RIP-Tag; RIP-tva, om de somatische gene levering via aviaire retrovirussen voor de identificatie en karakterisering van metastatische factoren. Hoewel RIP-Tag; RIP-BTW muizen alvleesklier neuro-endocriene tumoren ontwikkelen, metastatische factoren geïdentificeerd in het muismodel van deze ook uitzaaiingen van andere soorten kanker kunnen bevorderen.
Onze aanpak heeft het voordeel van de invoering van somatische genetisch...

De meeste kankers ontstaan van somatische mutaties 1. Conventionele genetisch gemodificeerde Muismodellen (GEMM) hebben belangrijke inzichten in de bijdrage van specifieke genetische wijzigingen op tumorvorming 2verstrekt. Zij hebben echter verschillende beperkingen. Het grote nadeel van deze modellen is dat ze niet de sporadische aard van tumor vorming bij de mens, waarin slechts sommige cellen binnen een weefsel genetische wijzigingen verwerven repliceren. De mutaties in transgene en knockout muizen zijn ook germline met potentieel tot ontwikkeling beïnvloeden. Bovendien, het genereren van deze Muismodellen is duur en tijdrovend.
Metastase is een belangrijke kwestie op het gebied van kanker. Modelleren van metastase moeizaam in GEMM. Spontane metastase is zeldzaam in de muis. Doordringendheid is variabel en latentie is lang in GEMM van metastase 3. Experimentele metastase modellen dienst directe injectie van cellen in de circulatie van muizen, zodat de eerste stappen in de gemetastaseerde opeenvolging worden geëlimineerd.
Om te overwinnen sommige van de bovenstaande beperkingen in het bestuderen van metastatische factoren in muismodellen, hebben we een muismodel van bitransgenic, RIP-Tag; RIP-BTW4. De strategie is gebaseerd op de combinatie van het gebruik van een sterk gesynchroniseerd tumor progressie muismodel, RIP-Tag 5, en de receptor voor aviaire leukose deelgroep-A virus, tva 6,7. Deze RIP-Tag; RIP-BTWmuismodel kunt genen somatically worden ingevoerd in een interne bitransgenic muis stam. Met het onderdrukken van de tumor onderdrukkende functie van Rb en p53 SV40 T-antigeen ontwikkelen muizen alvleesklier neuro-endocriene tumoren in een soortgelijke wijze als menselijke tumorvorming, met stadia, met inbegrip van hyperplasie, angiogenese, adenoom en carcinoom invasief. Dit model van de RIP-Tag is zeer leerzaam voor ons begrip van de kenmerken van de kanker, niet beperkt tot de alvleesklier neuro-endocriene tumoren. Het is ook gebruikt in preklinische proeven 8.
Presenteren we een protocol voor somatische genenoverdracht via injectie van aviaire retrovirussen intracardiacally in RIP-Tag; RIP-BTW muizen. Succesvolle besmetting met aviaire retrovirussen RCASBP afkomstige vereist actief delende cellen van de doelgroep. Daarom kozen we voor RIP-Tag; RIP-BTW muizen op 7 weken van leeftijd, wanneer hyperplasie in ongeveer 50% van de alvleesklier eilandjes ontwikkelt. Linker ventriculaire intracardiac injectie van hoge titer virussen is vereist om de efficiëntie van een infectie van 10-20% 4te bereiken. Deze leveringsmethode vermindert de significante verdunning van virale deeltjes binnen verkeer voordat virussen alvleesklier eilandjes bereiken.
Met behulp van deze aanpak, hebben wij eerder aangetoond dat Bcl-xL kanker uitzaaiingen onafhankelijk van haar anti-apoptotic functie 4,9 bevordert. Deze anti-apoptotic-onafhankelijke metastatische functie werd niet waargenomen als Bcl-xL was uitgedrukt via een transgenic in alle alvleesklier β-cellen in de hele tumorigene ontogenie in de RIP-Tag; RIP-Bcl-xL muis model 10. Daarom biedt onze muismodel een unieke gelegenheid om te identificeren en te karakteriseren genen functies als uitgedrukt in een later stadium van tumorvorming. Omdat 2-4% van de eilandjes uitgroeien tot tumoren in de RIP-Tag; RIP-BTW bitransgenic Muizen zonder virale infectie en niet alle de Premaligne laesies zijn besmet met de RCASBP-afgeleide aviaire retrovirussen, alleen de factoren die een selectief voordeel bieden in de natuurlijke loop van tumorvorming kunnen worden geïdentificeerd. Metastatische factoren met name zal gemakkelijkst worden herkend door deze methode, omdat metastase aan alvleesklier lymfeklieren of andere organen normaal gesproken niet in RIP-Tag treedt; RIP-BTW muizen.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="747">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:339px;">RCASBP-Y DV plasmid</td>
			<td style="width:123px;">Addgene</td>
			<td style="width:119px;">11478</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">RCAS-RNAi plasmid</td>
			<td style="width:123px;">Addgene</td>
			<td style="width:119px;">15182</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">DMEM</td>
			<td style="width:123px;">Corning</td>
			<td>10-013-CV</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">fetal bovine serum</td>
			<td>Atlanta Biologicals</td>
			<td>25-005-CI</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">L-glutamine, 100x</td>
			<td style="width:123px;">Corning</td>
			<td>25-005-CI</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Penicillin-Streptomycin solution, 100x</td>
			<td style="width:123px;">Corning</td>
			<td>30-002-CI</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="24">
			<td height="24" style="height:24px;">PBS-/-, 1X</td>
			<td style="width:123px;">Corning</td>
			<td>21-040-CV</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Superfect</td>
			<td>Qiagen</td>
			<td>301305</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Polyallomer centrifuge tube</td>
			<td>Beckman Coulter</td>
			<td>326823</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:339px;">0.45 mm Nalgene 
			Syringe Filters with PES Membrane</td>
			<td style="width:123px;">Thermo Scientific</td>
			<td style="width:119px;">194-2545</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:339px;">Insulin Syringes&#160;</td>
			<td style="width:123px;">BD</td>
			<td>329461</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">synaptophysin</td>
			<td style="width:123px;">Vector Laboratories</td>
			<td>VP-S284</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">VECTASTAIN Elite ABC HRP Kit (Peroxidase, Rabbit IgG)&#160;</td>
			<td style="width:123px;">Vector Laboratories</td>
			<td>PK-6101</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">AmpliTaq DNA Polymerase with Buffer II</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>N8080153</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">MyTaq DNA Polymerase</td>
			<td>Bioline</td>
			<td>BIO-21106</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

identification and characterization of metastatic factors by gene transfer into the novel rip-tag; rip-tva murine model

Metastatische kanker is verantwoordelijk voor 90% van de sterfgevallen bij patiënten met solide tumoren. Er is een dringende noodzaak om de bestuurders van uitzaaiing van kanker beter te begrijpen en te identificeren van nieuwe therapeutische doelen. Voor het onderzoek naar de moleculaire gebeurtenissen die de progressie van de primaire kanker naar metastase rijden, hebben we een muismodel van bitransgenic, RIP-Tag; RIP-BTW. In dit muismodel drijft de rat insuline promotor (RIP) de uitdrukking van het antigeen SV40 T (Tag) en de receptor voor deelgroep een virus van aviaire leukose (tva) in de alvleesklier β-cellen. De muizen ontwikkelen alvleesklier neuro-endocriene tumoren met 100% doordringendheid door duidelijk omschreven fasen die vergelijkbaar met menselijke tumorvorming, met stadia zijn, met inbegrip van hyperplasie, angiogenese, adenoom en carcinoom invasief. Omdat RIP-Tag; RIP-BTW muizen niet gemetastaseerde ziekte ontwikkelen, genetische wijzigingen die bevordering van metastase kunnen gemakkelijk worden geïdentificeerd. Somatic gene transfer in het tva-uiten, alvleesklier β prolifererende Premaligne laesies is bereikt door middel van intracardiac injectie van aviaire retrovirussen herbergen de gewenste genetische wijziging. Een titer van &#62; 1 x 108 besmettelijke eenheden per ml is geschikt geacht voor in vivo infectie. Daarnaast kunnen aviaire retrovirussen infecteren cellijnen afgeleid van tumoren in RIP-Tag; RIP-BTW muizen met een hoog rendement. De cellijnen kunnen ook worden gebruikt om te karakteriseren de metastatische factoren. Hier laten we zien hoe deze muismodel gebruiken en cellijnen om te beoordelen van de functies van kandidaat-genen in de uitzaaiing van de tumor.

De in vivo en in vitro besmettingsgraad van RIP-Tag; RIP-BTW tumorcellen door RCASBP gebaseerde virussen zijn ~ 20% resp. ~ 80% 20. In de RIP-Tag; RIP-BTW muismodel, ongeveer 4% van de 400 alvleesklier eilandjes in elke muis zal natuurlijk uitgroeien tot tumoren 20; Daarom is er voldoende hoeveelheid tumorcellen in elke muis voor histologisch en fenotypische analyse van het potentiële effect van de genen ...

Watch this Scientific Journal Video about Identification and Characterization of Metastatic Factors by Gene Transfer into the Novel RIP-Tag; RIP-tva Murine Model at JoVE.com

Identification and Characterization of Metastatic Factors by Gene Transfer into the Novel RIP-Tag; RIP-tva Murine Model

We presenteren een protocol om aan te tonen van een roman somatic gene transfersysteem met behulp van RIP-Tag; RIP-BTW muismodel om te bestuderen van de functie van genen in metastase. De aviaire retrovirussen zijn intracardiacally om ervoor te zorgen genenoverdracht in pre-maligne, noninvasive laesies van de cellen van de alvleesklier β in volwassen muizen geleverd.

Identificatie en karakterisering van metastatische factoren door genenoverdracht in de roman RIP-Tag; RIP-BTW lymfkliertest Model

Metastatic cancer accounts for 90% of deaths in patients with solid tumors. There is an urgent need to better understand the drivers of cancer metastasis ...

Research

JoVE Journal

Cancer Research

Identification and Characterization of Metastatic Factors by Gene Transfer into the Novel RIP-Tag; RIP-tva Murine Model

Advanced Animal Model of Colorectal Metastasis in Liver: Imaging Techniques and Properties of Metastatic Clones

Geavanceerde diermodel van colorectale metastase in de lever: Imaging technieken en eigenschappen van gemetastaseerde Clones

Patients with a limited number of hepatic metastases and slow rates of progression can be successfully treated with local treatment approaches1,2. ...

A Syngeneic Mouse Model of Metastatic Renal Cell Carcinoma for Quantitative and Longitudinal Assessment of Preclinical Therapies

Een Syngenische muismodel van gemetastaseerd niercelcarcinoom voor Kwantitatieve en Longitudinale Evaluatie van de preklinische therapieën

Renal cell carcinoma (RCC) affects &#62; 60,000 people in the United States annually, and ~ 30% of RCC patients have multiple metastases at the time of ...

A Mouse Model of Fatigue Induced by Peripheral Irradiation

Een muismodel van vermoeidheid geïnduceerd door Peripheral Bestraling

Cancer-related fatigue (CRF) is a distressing and costly condition that often affects patients receiving cancer treatments, including radiation therapy. ...

Virus Delivery of CRISPR Guides to the Murine Prostate for Gene Alteration

Virus levering van CRISPR gidsen voor de lymfkliertest prostaat voor Gene wijziging

With an increasing incidence of prostate cancer, identification of new tumor drivers or modulators is crucial. Genetically engineered mouse models (GEMM) ...

Enrichment and Characterization of the Tumor Immune and Non-immune Microenvironments in Established Subcutaneous Murine Tumors

Verrijking en karakterisering van de Tumor immuun en niet-immune Microenvironments in gevestigde subcutane lymfkliertest tumoren

The tumor immune microenvironment (TIME) has recently been recognized as a critical mediator of treatment response in solid tumors, especially for ...

Three-Dimensional Bone Extracellular Matrix Model for Osteosarcoma

Driedimensionale bot extracellulaire Matrix Model voor Osteosarcoom

Osteosarcoma (OS) is the most common and a highly aggressive primary bone tumor. It is characterized with anatomic and histologic variations along with ...

Murine Model of Metastatic Liver Tumors in the Setting of Ischemia Reperfusion Injury

Murine model van gemetastaseerde lever tumoren in de setting van ischemie reperfusie letsel

Liver ischemia and reperfusion (I/R) injury, a common clinical challenge, remains an inevitable pathophysiological process that has been shown to induce ...

Analyzing Tumor Gene Expression Factors with the CorExplorer Web Portal

Het analyseren van tumor genexpressie factoren met de CorExplorer Web Portal

Differential gene expression analysis is an important technique for understanding disease states. The machine learning algorithm CorEx has shown utility ...

Mapping the Structure-Function Relationships of Disordered Oncogenic Transcription Factors Using Transcriptomic Analysis

Het in kaart brengen van de structuur-functierelaties van ongeordende oncogene transcriptiefactoren met behulp van transcriptomische analyse

Many cancers are characterized by chromosomal translocations which result in the expression of oncogenic fusion transcription factors. Typically, these ...

Discovery of Metastatic Regulators using a Rapid and Quantitative Intravital Chick Chorioallantoic Membrane Model

Ontdekking van gemetastaseerde regulatoren met behulp van een snel en kwantitatief intravital chick chorioallantoic membraanmodel

Recent advances in cancer research has illustrated the highly complex nature of cancer metastasis. Multiple genes or genes networks have been found to be ...