Name: profiling volatile compounds in blackcurrant fruit using headspace solid-phase microextraction coupled to gas chromatography-mass spectrometry
Uploaded: 2021-06-09T14:00:00
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लेखकों Servicios Centrales de Apoyo HS-SPME / GC-MS माप के लिए Malaga विश्वविद्यालय से एक ला Investigación धन्यवाद. हम वाष्पशील परिमाणीकरण में सारा फर्नांडेज़-पलासिओस कैम्पोस की सहायता को स्वीकार करते हैं। हम फल सामग्री प्रदान करने के लिए गुडबेरी के कंसोर्टियम के सदस्यों को भी धन्यवाद देते हैं।

1. फलों की कटाई
<ol><li>पर्याप्त फल सामग्री और परिवर्तनशीलता सुनिश्चित करने के लिए जीनोटाइप और / या उपचार प्रति 4 से 6 पौधों के बीच बढ़ें।</li>
	<li>यदि संभव हो, तो एक ही तारीख को नमूनों की कटाई करें; यदि पर्याप्त फल स?...

<ol>
	<li>Klee, H. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Improving+the+flavor+of+fresh+fruits:+Genomics,+biochemistry,+and+biotechnology.">Improving the flavor of fresh fruits: Genomics, biochemistry, and biotechnology.</a> New Phytologist. 187 (1), 44-56 (2010).</li><li>Ferr&#227;o, L. F. V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genome-wide+association+of+volatiles+reveals+candidate+loci+for+blueberry+flavor.">Genome-wide association of volatiles reveals candidate loci for blueberry flavor.</a> New Phytologist. 226 (6), 1725-1737 (2020).</li><li>Klee, H. J., Tieman, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+genetics+of+fruit+flavour+preferences.">The genetics of fruit flavour preferences.</a> Nature Reviews Genetics. 19, 347-356 (2018).</li><li>Vallarino, J. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+quantitative+trait+loci+and+candidate+genes+for+primary+metabolite+content+in+strawberry+fruit.">Identification of quantitative trait loci and candidate genes for primary metabolite content in strawberry fruit.</a> Horticulture Research. 6, 4 (2019).</li><li>Jung, K., Fastowski, O., Poplacean, I., Engel, K. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Analysis+and+sensory+evaluation+of+volatile+constituents+of+fresh+blackcurrant+(Ribes+nigrum+L.)+fruits.">Analysis and sensory evaluation of volatile constituents of fresh blackcurrant (Ribes nigrum L.) fruits.</a> Journal of Agricultural and Food Chemistry. 65 (43), 9475-9487 (2017).</li><li>Vallarino, J. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genetic+diversity+of+strawberry+germplasm+using+metabolomic+biomarkers.">Genetic diversity of strawberry germplasm using metabolomic biomarkers.</a> Scientific Reports. 8, 14386 (2018).</li><li>Zhang, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Insights+into+the+major+aroma-active+compounds+in+clear+red+raspberry+juice+(Rubus+idaeus+L.+cv.+Heritage)+by+molecular+sensory+science+approaches.">Insights into the major aroma-active compounds in clear red raspberry juice (Rubus idaeus L. cv. Heritage) by molecular sensory science approaches.</a> Food Chemistry. 336, 127721 (2021).</li><li>Farneti, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Exploring+blueberry+aroma+complexity+by+chromatographic+and+direct-injection+spectrometric+techniques.">Exploring blueberry aroma complexity by chromatographic and direct-injection spectrometric techniques.</a> Frontiers in Plant Science. 8, 617 (2017).</li><li>Tikunov, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+genetic+and+functional+analysis+of+flavor+in+commercial+tomato:+the+FLORAL4+gene+underlies+a+QTL+for+floral+aroma+volatiles+in+tomato+fruit.">The genetic and functional analysis of flavor in commercial tomato: the FLORAL4 gene underlies a QTL for floral aroma volatiles in tomato fruit.</a> The Plant Journal. 103 (3), 1189-1204 (2020).</li><li>Tieman, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+chemical+genetic+roadmap+to+improved+tomato+flavor.">A chemical genetic roadmap to improved tomato flavor.</a> Science. 355 (6323), 391-394 (2017).</li><li>S&#225;nchez-Sevilla, J. F., Cruz-Rus, E., Valpuesta, V., Botella, M. A., Amaya, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Deciphering+gamma-decalactone+biosynthesis+in+strawberry+fruit+using+a+combination+of+genetic+mapping,+RNA-Seq+and+eQTL+analyses.">Deciphering gamma-decalactone biosynthesis in strawberry fruit using a combination of genetic mapping, RNA-Seq and eQTL analyses.</a> BMC Genomics. 15, 218 (2014).</li><li>Kumar, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genome-wide+scans+reveal+genetic+architecture+of+apple+flavour+volatiles.">Genome-wide scans reveal genetic architecture of apple flavour volatiles.</a> Molecular Breeding. 35, 118 (2015).</li><li>Bauchet, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+major+loci+and+genomic+regions+controlling+acid+and+volatile+content+in+tomato+fruit:+implications+for+flavor+improvement.">Identification of major loci and genomic regions controlling acid and volatile content in tomato fruit: implications for flavor improvement.</a> New Phytologist. 215 (2), 624-641 (2017).</li><li>S&#225;nchez, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+integrative+'+omics'+approach+identifies+new+candidate+genes+to+impact+aroma+volatiles+in+peach+fruit.">An integrative ' omics' approach identifies new candidate genes to impact aroma volatiles in peach fruit.</a> BMC Genomics. 14, 343 (2013).</li><li>Hummer, K. E., Dale, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Horticulture+of+Ribes.">Horticulture of Ribes.</a> Forest Pathology. 40 (3-4), 251-263 (2010).</li><li>Vagiri, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Phenols+and+ascorbic+acid+in+black+currants+(Ribes+nigrum+L.):+Variation+due+to+genotype,+location,+and+year.">Phenols and ascorbic acid in black currants (Ribes nigrum L.): Variation due to genotype, location, and year.</a> Journal of Agricultural and Food Chemistry. 61 (39), 9298-9306 (2013).</li><li>Marsol-Vall, A., Kortesniemi, M., Karhu, S. T., Kallio, H., Yang, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Profiles+of+volatile+compounds+in+blackcurrant+(Ribes+nigrum)+cultivars+with+a+special+focus+on+the+influence+of+growth+latitude+and+weather+conditions.">Profiles of volatile compounds in blackcurrant (Ribes nigrum) cultivars with a special focus on the influence of growth latitude and weather conditions.</a> Journal of Agricultural and Food Chemistry. 66 (28), 7485-7495 (2018).</li><li>Varming, C., Petersen, M. A., Poll, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+isolation+methods+for+the+determination+of+important+aroma+compounds+in+black+currant+(Ribes+nigrum+L.)+juice,+using+nasal+impact+frequency+profiling.">Comparison of isolation methods for the determination of important aroma compounds in black currant (Ribes nigrum L.) juice, using nasal impact frequency profiling.</a> Journal of Agricultural and Food Chemistry. 52 (6), 1647-1652 (2004).</li><li>Andersson, J., von Sydow, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+aroma+of+black+currants+I.+Higher+boiling+compounds.">The aroma of black currants I. Higher boiling compounds.</a> Acta Chemica Scandinavica. 18, 1105-1114 (1964).</li><li>Andersson, J., von Sydow, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+aroma+of+black+currants.+III.+Chemical+characterization+of+different+varieties+and+stages+of+ripeness+by+gas+chromatography.">The aroma of black currants. III. Chemical characterization of different varieties and stages of ripeness by gas chromatography.</a> Acta Chemica Scandinavica. 20, 529-535 (1966).</li><li>Andersson, J., von Sydow, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+aroma+of+black+currants+II.+Lower+boiling+compounds.">The aroma of black currants II. Lower boiling compounds.</a> Acta Chemica Scandinavica. 20, 522-528 (1966).</li><li>Marsol-Vall, A., Laaksonen, O., Yang, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effects+of+processing+and+storage+conditions+on+volatile+composition+and+odor+characteristics+of+blackcurrant+(Ribes+nigrum)+juices.">Effects of processing and storage conditions on volatile composition and odor characteristics of blackcurrant (Ribes nigrum) juices.</a> Food Chemistry. 293, 151-160 (2019).</li><li>Del Castillo, M. L. R., Dobson, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Varietal+differences+in+terpene+composition+of+blackcurrant+(Ribes+nigrum+L)+berries+by+solid+phase+microextraction/gas+chromatography.">Varietal differences in terpene composition of blackcurrant (Ribes nigrum L) berries by solid phase microextraction/gas chromatography.</a> Journal of the Science of Food and Agriculture. 82 (13), 1510-1515 (2002).</li><li>Azzi-Achkouty, S., Estephan, N., Ouaini, N., Rutledge, D. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Headspace+solid-phase+microextraction+for+wine+volatile+analysis.">Headspace solid-phase microextraction for wine volatile analysis.</a> Critical Reviews in Food Science and Nutrition. 57 (10), 2009-2020 (2017).</li><li>Vallarino, J. G., Antonio, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Acquisition+of+volatiles+compounds+by+gas+chromatography-mass+spectrometry+(GC-MS).">Acquisition of volatiles compounds by gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS).</a> Plant Metabolomics: Methods and Protocols. 1778, 225-239 (2018).</li><li>Moreira, N., Lopes, P., Cabral, M., Guedes de Pinho, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HS-SPME/GC-MS+methodologies+for+the+analysis+of+volatile+compounds+in+cork+material.">HS-SPME/GC-MS methodologies for the analysis of volatile compounds in cork material.</a> European Food Research and Technology. 242, 457-466 (2016).</li><li>Rambla, J. L., L&#243;pez-Gresa, M. P., Bell&#233;s, J. M., Granell, A., Alonso, J. M., Stepanova, A. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Metabolomic+profiling+of+plant+tissues.">Metabolomic profiling of plant tissues.</a> Plant Functional Genomics and Protocols, Methods in Molecular Biology. 1284, 221-235 (2015).</li><li>Abbas, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Volatile+terpenoids:+multiple+functions,+biosynthesis,+modulation+and+manipulation+by+genetic+engineering.">Volatile terpenoids: multiple functions, biosynthesis, modulation and manipulation by genetic engineering.</a> Planta. 246 (5), 803-816 (2017).</li><li>Kolosova, N., Gorenstein, N., Kish, C. M., Dudareva, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regulation+of+circadian+methyl+benzoate+emission+in+diurnally+and+nocturnally+emitting+plants.">Regulation of circadian methyl benzoate emission in diurnally and nocturnally emitting plants.</a> Plant Cell. 13 (10), 2333-2347 (2001).</li><li>Dudareva, N., Pichersky, E., Gershenzon, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biochemistry+of+plant+volatiles.">Biochemistry of plant volatiles.</a> Plant Physiology. 135 (4), 1893-1902 (2004).</li><li>Borges, R. M., Ranganathan, Y., Krishnan, A., Ghara, M., Pramanik, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=When+should+fig+fruit+produce+volatiles?+Pattern+in+a+ripening+process.">When should fig fruit produce volatiles? Pattern in a ripening process.</a> Acta Oecologica. 37 (6), 611-618 (2011).</li><li>Jarret, D. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+transcript+and+metabolite+atlas+of+blackcurrant+fruit+development+highlights+hormonal+regulation+and+reveals+the+role+of+key+transcription+factors.">A transcript and metabolite atlas of blackcurrant fruit development highlights hormonal regulation and reveals the role of key transcription factors.</a> Frontiers in Plant Science. 9, 1-22 (2018).</li><li>Li, B., Lecourt, J., Bishop, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Advances+in+non-destructive+early+assessment+of+fruit+ripeness+towards+defining+optimal+time+of+harvest+and+yield+prediction-a+review.">Advances in non-destructive early assessment of fruit ripeness towards defining optimal time of harvest and yield prediction-a review.</a> Plants. 7 (1), 3 (2018).</li><li>Ul-Hassan, M. N., Zainal, Z., Ismail, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Green+leaf+volatiles:+Biosynthesis,+biological+functions+and+their+applications+in+biotechnology.">Green leaf volatiles: Biosynthesis, biological functions and their applications in biotechnology.</a> Plant Biotechnology Journal. 13 (6), 727-739 (2015).</li><li>Gaston, A., Osorio, S., Denoyes, B., Rothan, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Applying+the+Solanaceae+strategies+to+strawberry+crop+improvement.">Applying the Solanaceae strategies to strawberry crop improvement.</a> Trends in Plant Science. 25 (2), 130-140 (2020).</li><li>Gilbert, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identifying+breeding+priorities+for+blueberry+flavor+using+biochemical,+sensory,+and+genotype+by+environment+analyses.">Identifying breeding priorities for blueberry flavor using biochemical, sensory, and genotype by environment analyses.</a> PLoS ONE. 10 (9), 0138494 (2015).</li><li>Bueno, M., Resconi, V. C., Campo, M. M., Ferreira, V., Escudero, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Development+of+a+robust+HS-SPME-GC-MS+method+for+the+analysis+of+solid+food+samples.+Analysis+of+volatile+compounds+in+fresh+raw+beef+of+differing+lipid+oxidation+degrees.">Development of a robust HS-SPME-GC-MS method for the analysis of solid food samples. Analysis of volatile compounds in fresh raw beef of differing lipid oxidation degrees.</a> Food Chemistry. 281, 49-56 (2019).</li><li>Burzynski-Chang, E. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HS-SPME-GC-MS+analyses+of+volatiles+in+plant+populations-quantitating+compound+&#215;+individual+matrix+effects.">HS-SPME-GC-MS analyses of volatiles in plant populations-quantitating compound &#215; individual matrix effects.</a> Molecules. 23 (10), 2436 (2018).</li></ol>

फलों की सुगंध के लिए प्रजनन लंबे समय से जटिल आनुवांशिकी और जैव रसायन द्वारा अस्थिर यौगिकों के संश्लेषण और उचित फेनोटाइपिंग के लिए प्रौद्योगिकियों की कमी के अंतर्निहित द्वारा बाधित किया गया है। हालां...

स्वाद किसी भी फल के लिए एक आवश्यक गुणवत्ता विशेषता है, जो उपभोक्ता स्वीकृति को प्रभावित करता है और इस प्रकार विपणन क्षमता को काफी प्रभावित करता है। स्वाद धारणा में स्वाद और घ्राण प्रणालियों का एक संयोजन शामिल है और रासायनिक रूप से यौगिकों की एक विस्तृत श्रृंखला की उपस्थिति और एकाग्रता पर निर्भर करता है जो खाद्य पौधों के हिस्सों में जमा होते हैं, या वीओसी के मामले में, पके हुए फल 1,2 द्वारा उत्सर्जित होते हैं। जबकि पारंपरिक प्रजनन ने उपज और कीट प्रतिरोध जैसे कृषि लक्षणों पर ध्यान केंद्रित किया है, स्वाद सहित फलों की गुणवत्ता में सुधार, आनुवंशिक जटिलता और इन विशेषताओं को ठीक से फेनोटाइप करने में कठिनाई के कारण लंबे समय से उपेक्षित किया गया है, जिससे उपभोक्ता असंतोष 3,4 हो गया है। मेटाबोलोमिक प्लेटफार्मों में हाल की प्रगति फलों के स्वाद और सुगंध 5,6,7,8 के लिए जिम्मेदार प्रमुख यौगिकों की पहचान और मात्रा निर्धारित करने में सफल रही है। इसके अलावा, जीनोमिक या ट्रांसक्रिप्टोमिक उपकरणों के साथ मेटाबोलाइट प्रोफाइलिंग का संयोजन फलों के स्वाद के अंतर्निहित आनुवांशिकी के स्पष्टीकरण की अनुमति देता है, जो बदले में प्रजनन कार्यक्रमों को बढ़ी हुई ऑर्गेनोलेप्टिक विशेषताओं के साथ नई किस्मों को विकसित करने में मदद करेगा2,4,9,10,11,12,13,14।
Blackcurrant (Ribes nigrum) जामुन उनके स्वाद और पोषण गुणों के लिए अत्यधिक सराहना की जाती है, जो यूरोप, एशिया और न्यूजीलैंड के समशीतोष्ण क्षेत्रों में व्यापक रूप से खेती की जाती है। अधिकांश उत्पादन खाद्य उत्पादों और पेय पदार्थों के लिए संसाधित किया जाता है, जो नॉर्डिक देशों में बहुत लोकप्रिय हैं, मुख्य रूप से जामुन के ऑर्गेनोलेप्टिक गुणों के कारण। फल का तीव्र रंग और स्वाद एंथोसायनिन, शर्करा, एसिड और पके हुए फलों में मौजूद वीओसी के संयोजन का परिणाम है16,17,18। Blackcurrant volatiles का विश्लेषण 1960 के दशक 19,20,21 पर वापस चला जाता है। हाल ही में, कई अध्ययनों ने ब्लैककरेंट वीओसी पर ध्यान केंद्रित किया है, फल सुगंध धारणा के लिए महत्वपूर्ण यौगिकों की पहचान की है और वीओसी सामग्री पर जीनोटाइप, पर्यावरण, या भंडारण और प्रसंस्करण स्थितियों के प्रभाव का आकलन किया है5,17,18,22,23।
इसके कई फायदों के कारण, उच्च-थ्रूपुट वाष्पशील प्रोफाइलिंग के लिए पसंद की तकनीक एचएस-एसपीएमई / जीसी-एमएस 24,25 है। एक सिलिका फाइबर, एक बहुलक चरण के साथ लेपित, एक सिरिंज डिवाइस पर घुड़सवार है, एक संतुलन चरण तक पहुँचने तक फाइबर में volatiles के सोखना की अनुमति देता है। हेडस्पेस निष्कर्षण मैट्रिक्स 24 में मौजूद गैर-वाष्पशील यौगिकों से फाइबर की रक्षा करता है। एसपीएमई अत्यधिक परिवर्तनीय सांद्रता में मौजूद वीओसी की एक उच्च संख्या को सफलतापूर्वक अलग कर सकता है (भागों प्रति अरब भागों प्रति मिलियन) 25। इसके अलावा, यह एक विलायक-मुक्त तकनीक है जिसके लिए सीमित नमूना प्रसंस्करण की आवश्यकता होती है। एचएस-एसपीएमई के अन्य फायदे स्वचालन में आसानी और इसकी अपेक्षाकृत कम लागत हैं।
हालांकि, इसकी सफलता सीमित हो सकती है, वीओसी की रासायनिक प्रकृति, निष्कर्षण प्रोटोकॉल (समय, तापमान और नमक एकाग्रता सहित), नमूना स्थिरता, और पर्याप्त फल ऊतक 26,27 की उपलब्धता के आधार पर। यह पेपर एचएस-एसपीएमई द्वारा अलग किए गए ब्लैककरेंट वीओसी के लिए एक प्रोटोकॉल प्रस्तुत करता है और एक आयन ट्रैप मास स्पेक्ट्रोमीटर के साथ युग्मित गैस क्रोमैटोग्राफी द्वारा विश्लेषण किया जाता है। पौधे की सामग्री की मात्रा, नमूना स्थिरता, और निष्कर्षण और क्रोमैटोग्राफी की अवधि के बीच एक संतुलन को ब्लैककरेंट नमूनों की उच्च संख्या को संसाधित करने में सक्षम होने के लिए प्राप्त किया गया था, उनमें से कुछ इस अध्ययन में प्रस्तुत किए गए थे। विशेष रूप से, वीओसी प्रोफाइल और / या पांच किस्मों ('एंडेगा', 'बेन ट्रॉन', 'बेन गैरन', 'बेन गैर्न', 'बेन तिरन', और 'टिहोप') के क्रोमैटोग्राम को उदाहरण डेटा के रूप में प्रस्तुत और चर्चा की जाएगी। इसके अलावा, एक ही प्रोटोकॉल को अन्य फल बेरी प्रजातियों जैसे स्ट्रॉबेरी (Fragaria x ananassa), रास्पबेरी (Rubusidaeus), और ब्लूबेरी (Vaccinium spp.) में वीओसी माप के लिए सफलतापूर्वक अभ्यास में रखा गया है।

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>10 mL screw top headspace vials</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>10-HSV</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>18 mm screw cap Silicone/PTFE</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>18-MSC</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>5 mL Tube with HDPE screw cap</td>
			<td>VWR</td>
			<td>216-0153</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Centrifuge</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>75002415</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methanol for HPLC</td>
			<td>Merck</td>
			<td>34860-1L-R</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>N-pentadecane (D32, 98%)</td>
			<td>Cambridge Isotope Laboratories</td>
			<td>DLM-1283-1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium chloride</td>
			<td>Merck</td>
			<td>S9888</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SPME fiber PDMS/DVB</td>
			<td>Merck</td>
			<td>57345-U</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Stainless grinding jars for TissueLyser</td>
			<td>Qiagen</td>
			<td>69985</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TissueLyser II</td>
			<td>Qiagen</td>
			<td>85300</td>
			<td>Can be subsituted by mortar and pestle or cryogenic mill</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Trace GC gas chromatograph-ITQ900 ion trap mass spectrometer</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Triplus RSH autosampler with automated SPME device</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>1R77010-0450</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Water for HPLC</td>
			<td>Merck</td>
			<td>270733-1L</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Xcalibur 4.2 SP1</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td></td>
			<td>software</td>
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profiling volatile compounds in blackcurrant fruit using headspace solid-phase microextraction coupled to gas chromatography-mass spectrometry

वहाँ वाष्पशील कार्बनिक यौगिकों (VOCs) प्रजनन किस्मों या संवर्धित organoleptic विशेषताओं के साथ cultivars के उद्देश्य से पके फलों द्वारा उत्सर्जित को मापने में एक बढ़ती रुचि है और इस प्रकार, उपभोक्ता स्वीकृति बढ़ाने के लिए. उच्च-थ्रूपुट मेटाबोलोमिक प्लेटफार्मों को हाल ही में विभिन्न पौधों के ऊतकों में चयापचयों की एक विस्तृत श्रृंखला को मापने के लिए विकसित किया गया है, जिसमें फलों के स्वाद और सुगंध की गुणवत्ता (वोलेटिलोमिक्स) के लिए जिम्मेदार प्रमुख यौगिक शामिल हैं। गैस क्रोमैटोग्राफी-मास स्पेक्ट्रोमेट्री (जीसी-एमएस) के साथ मिलकर हेडस्पेस सॉलिड-फेज माइक्रोएक्सट्रैक्शन (एचएस-एसपीएमई) का उपयोग करने वाली एक विधि को पके हुए ब्लैककरेंट फलों द्वारा उत्सर्जित वीओसी की पहचान और परिमाणीकरण के लिए यहां वर्णित किया गया है, एक बेरी को इसके स्वाद और स्वास्थ्य लाभों के लिए अत्यधिक सराहना की जाती है।
ब्लैककरेंट पौधों के पके फल (रिबेस निग्रम) को काटा गया था और सीधे तरल नाइट्रोजन में जमे हुए थे। एक ठीक पाउडर का उत्पादन करने के लिए ऊतक समरूपता के बाद, नमूनों को पिघलाया गया और तुरंत सोडियम क्लोराइड समाधान के साथ मिलाया गया। centrifugation के बाद, supernatant एक headspace कांच की शीशी सोडियम क्लोराइड युक्त में स्थानांतरित किया गया था। VOCs को तब एक ठोस चरण माइक्रोएक्सट्रैक्शन (SPME) फाइबर और एक आयन ट्रैप मास स्पेक्ट्रोमीटर के लिए युग्मित एक गैस क्रोमैटोग्राफ का उपयोग करके निकाला गया था। प्रत्येक VOC के लिए एक विशिष्ट m/z आयन का उपयोग करके, शिखर क्षेत्र को एकीकृत करके परिणामी आयन क्रोमैटोग्राम पर वाष्पशील परिमाणीकरण किया गया था। सही VOC एनोटेशन की पुष्टि नमूनों के समान परिस्थितियों में चलने वाले शुद्ध वाणिज्यिक मानकों के प्रतिधारण समय और द्रव्यमान स्पेक्ट्रा की तुलना करके की गई थी। विपरीत यूरोपीय स्थानों में उगाए गए पके हुए ब्लैककरेंट फलों में 60 से अधिक वीओसी की पहचान की गई थी। पहचाने गए वीओसी में, प्रमुख सुगंध यौगिकों, जैसे कि टेरपेनोइड्स और सी 6 वाष्पशील, को ब्लैककरेंट फल की गुणवत्ता के लिए बायोमार्कर के रूप में इस्तेमाल किया जा सकता है। इसके अलावा, विधि के फायदे और नुकसान पर चर्चा की जाती है, जिसमें संभावित सुधार शामिल हैं। इसके अलावा, बैच सुधार और बहाव तीव्रता को कम करने के लिए नियंत्रण के उपयोग पर जोर दिया गया है।

विभिन्न परिस्थितियों या स्थानों के तहत उगाई जाने वाली फल फसलों के एक बड़े सेट में उच्च-थ्रूपुट वीओसी प्रोफाइलिंग या अलग-अलग जीनोटाइप से संबंधित सटीक सुगंध फेनोटाइपिंग के लिए आवश्यक है। यहां, ब्लैककर?...

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Profiling Volatile Compounds in Blackcurrant Fruit using Headspace Solid-Phase Microextraction Coupled to Gas Chromatography-Mass Spectrometry

एक हेडस्पेस सॉलिड-फेज माइक्रोएक्सट्रैक्शन-गैस-क्रोमैटोग्राफी प्लेटफ़ॉर्म को यहां तेजी से, विश्वसनीय और अर्ध-स्वचालित वाष्पशील पहचान और पके हुए ब्लैककरेंट फलों में परिमाणीकरण के लिए वर्णित किया गया है। इस तकनीक का उपयोग फलों की सुगंध के बारे में ज्ञान बढ़ाने और प्रजनन के उद्देश्य से बढ़े हुए स्वाद के साथ cultivars का चयन करने के लिए किया जा सकता है।

Headspace ठोस चरण Microextraction गैस क्रोमैटोग्राफी-मास स्पेक्ट्रोमेट्री के लिए युग्मित का उपयोग कर Blackcurrant फल में प्रोफाइलिंग वाष्पशील यौगिकों

There is an increasing interest in measuring volatile organic compounds (VOCs) emitted by ripe fruits for the purpose of breeding varieties or cultivars ...

फलों की सुगंध में सुधार प्रजनन कार्यक्रमों में मुख्य उद्देश्यों में से एक है। इसके लिए, हमें एक विश्वसनीय तकनीक की आवश्यकता है जो हमें फलों में वाष्पशील घटकों को मापने की अनुमति देती है। यह तकनीक तेज और अर्ध-स्वचालित है, जिससे प्रति दिन 22 नमूनों को मापने की अनुमति मिलती है।इसके अलावा, यह अपेक्षाकृत सस्ता है और न्यूनतम नमूना प्रसंस्करण की आवश्यकता होती है। इस विधि को सभी फलों की प्रजातियों के लिए आसानी से लागू किया जा सकता है, जैसे कि आर्थिक रूप से महत्वपूर्ण बेरी फसलें। इसके अलावा, पता लगाए गए यौगिक के पुस्तकालय आकार को आसानी से बढ़ाया जा सकता है।शुरू करने के लिए, वेड जमे हुए नमूने वाले पांच मिलीलीटर ट्यूब में सोडियम क्लोराइड समाधान का एक मिलीलीटर जोड़ें। ट्यूब को हिलाएं जब तक कि नमूना पूरी तरह से पिघला हुआ और homogenized न हो जाए। फिर कमरे के तापमान पर पांच मिनट के लिए 5, 000 बार ग्राम पर सेंट्रीफ्यूज।1, 000 माइक्रोलीटर पिपेट टिप के अंत में कटौती करें और हेडस्पेस फ़ाइल युक्त सोडियम क्लोराइड में supernatant को स्थानांतरित करने के लिए इसका उपयोग करें। हेडस्पेस फ़ाइल वाले प्रत्येक नमूने में आंतरिक मानक के पांच माइक्रोलीटर जोड़ें। एक GC-MS ऑटो सैंपलर में बंद हेडस्पेस फ़ाइल रखें, कमरे के तापमान पर, एक स्वचालित HS-SPME/17 बार पर आंदोलन के साथ 52 डिग्री सेल्सियस पर 10 मिनट के लिए हेडस्पेस फ़ाइलों को पूर्व-इनक्यूबेट करें जी हेडस्पेस में फाइबर को उजागर करने के लिए शीशी में एक एसपीएमई डिवाइस डालें और 17 बार आंदोलन के साथ 50 डिग्री सेल्सियस पर 30 मिनट के लिए वीओसी निष्कर्षण करें जी वाष्पशील desorption के लिए स्प्लिटलेस मोड में 250 डिग्री सेल्सियस पर एक मिनट के लिए इंजेक्शन पोर्ट में फाइबर का परिचय दें। फिर 250 डिग्री सेल्सियस पर पांच मिनट के लिए नाइट्रोजन के साथ एक एसपीएमई सफाई स्टेशन में फाइबर को साफ करें। एक आयन जाल द्रव्यमान स्पेक्ट्रोमीटर के रूप में पता लगाता है पांडुलिपि में वर्णित करने के लिए युग्मित एक गैस chromatograph के साथ VOCs का विश्लेषण करें।कच्चे GC-MS प्रोफ़ाइल फ़ाइलें खोलें। यौगिकों की पहचान करने के लिए, प्रामाणिक मानकों से प्राप्त प्रतिधारण सूचकांकों के साथ प्रतिधारण समय, द्रव्यमान स्पेक्ट्रा और कोवाट्स रैखिक प्रतिधारण अनुक्रमणिकाओं की तुलना करें। प्रत्येक वाणिज्यिक मानक के लिए, आयनों को चार्ज करने के लिए सबसे प्रचुर मात्रा में द्रव्यमान में प्रतिधारण समय को एनोटेट करें।फिर प्रत्येक VOC के लिए Z आयन द्वारा एक विशिष्ट M का चयन करें। वाद्य भिन्नता और तीव्रता बहाव को कम करने के लिए आंतरिक मानक के सापेक्ष प्रत्येक VOC के शिखर क्षेत्र की गणना करें। बैच प्रभाव सुधार के लिए, एक ही रन में विश्लेषण किए गए नियंत्रण नमूने में संबंधित शिखर क्षेत्र के लिए प्रत्येक नमूने के वीओसी पीक क्षेत्र को सामान्य करें।एचएस-एसपीएमई / जीसी-एमएस द्वारा प्राप्त एक पके हुए ब्लैककर्रेंट फल वाष्पशील कुल आयन क्रोमैटोग्राम प्रोफ़ाइल ने एस्टर, एल्डिहाइड, अल्कोहल, कीटोन्स, टेरपेन्स और फ्यूरान से संबंधित 63 वीओसी की पहचान की, जो एक पुस्तकालय के आधार पर था जिसे बेरी फल प्रजातियों को प्रोफ़ाइल करने के लिए विकसित किया गया था। देखी गई सबसे प्रचुर मात्रा में चोटियों में से कुछ दो मोनोटेरपीन, लिनालूल और टेर्पिनोल, और दो सी 6 यौगिकों, 2-हेक्सेनल और 3-हेक्सेनल के अनुरूप हैं। शुद्ध वाणिज्यिक मानकों के स्पेक्ट्रा के साथ उनकी तुलना में काले वर्तमान प्रोफाइल से प्राप्त बड़े पैमाने पर स्पेक्ट्रा 2-हेक्सेनल और टेर्पिनोल के लिए दिखाया गया है।चार अलग-अलग काले वर्तमान किस्म के वीओसी प्रोफाइल के पीसीए से पता चला है कि पर्यावरण वाष्पशील सामग्री को दृढ़ता से प्रभावित करता है, क्योंकि पीसी 1 उनके स्थान के आधार पर नमूनों को अलग करता है। PC2 के साथ प्रभावी जीनोटाइप को देखा जा सकता है, क्योंकि बेन तिरान स्पष्ट रूप से शेष किस्मों से अलग है। लिनालूल और 2-हेक्सेनल की सापेक्ष सामग्री चार मूल्यांकन किए गए काले वर्तमान किस्म में पुष्टि करती है कि लिनालूल सामग्री आमतौर पर स्कॉटलैंड की तुलना में पोलैंड में अधिक थी, जबकि 2-हेक्सेनल ने विपरीत प्रवृत्ति दिखाई।लिनालूल का अनुपात बेन तिरन कल्टीवर्स में सबसे अधिक था, 2-हेक्सेनल में बेन ट्रॉन कल्टीवर्स में सबसे अधिक था। जमे हुए सामग्री के साथ शुरू करना महत्वपूर्ण है, एक उचित वाष्पशील निष्कर्षण को आश्वस्त करने के लिए एक ठीक पाउडर में जमीन। एक बार निकाले जाने के बाद, नमूना को ऑटो सैंपलर में रखा जाना चाहिए, जितनी जल्दी हो सके।इस विधि को अन्य चयापचय मंच के साथ जोड़ा जा सकता है ताकि अन्य महत्वपूर्ण चयापचय की पहचान की जा सके, भोजन के स्वाद या पोषण मूल्य के लिए, बढ़ी हुई ऑर्गेनोलेप्टिक विशेषता के साथ किस्मों को प्रजनन करने के लिए।

Research

JoVE Journal

Biochemistry

Sheathless Capillary Electrophoresis&#8211;Mass Spectrometry for Metabolic Profiling of Biological Samples

Sheathless Capillary ElectrophoresisÃƒÆ’Ã‚Â¢ÃƒÂ¢Ã¢â‚¬Å¡Ã‚Â¬ÃƒÂ¢Ã¢â€šÂ¬Ã…â€œMass Spectrometry for Metabolic Profiling of Biological Samples

Sheathless केशिका वैद्युतकणसंचलन मास जैविक नमूने मेटाबोलिक रूपरेखा के लिए स्पेक्ट्रोमेट्री

In metabolomics, a wide range of analytical techniques is used for the global profiling of (endogenous) metabolites in complex samples. In this paper, a ...

Resolving Affinity Purified Protein Complexes by Blue Native PAGE and Protein Correlation Profiling

ब्लू मूल निवासी पृष्ठ और प्रोटीन सहसंबंध रूपरेखा द्वारा समानता शुद्ध प्रोटीन परिसरों का समाधान करना

Most proteins act in association with others; hence, it is crucial to characterize these functional units in order to fully understand biological ...

A Tandem Liquid Chromatography&#8211;Mass Spectrometry-based Approach for Metabolite Analysis of Staphylococcus aureus

A Tandem Liquid ChromatographyÃƒÆ’Ã‚Â¢ÃƒÂ¢Ã¢â‚¬Å¡Ã‚Â¬ÃƒÂ¢Ã¢â€šÂ¬Ã…â€œMass Spectrometry-based Approach for Metabolite Analysis of Staphylococcus aureus

की Metabolite विश्लेषण के लिए एक अग्रानुक्रम तरल क्रोमैटोग्राफी मास स्पेक्ट्रोमेट्री आधारित दृष्टिकोण<em&gt; स्ताफ्य्लोकोच्चुस</em

In an effort to thwart bacterial pathogens, hosts often limit the availability of nutrients at the site of infection. This limitation can alter the ...

Deep Proteome Profiling by Isobaric Labeling, Extensive Liquid Chromatography, Mass Spectrometry, and Software-assisted Quantification

Isobaric लेबलिंग, व्यापक तरल क्रोमैटोग्राफी, मास स्पेक्ट्रोमेट्री, और सॉफ्टवेयर असिस्टेड ठहराव द्वारा डीप Proteome profile

Many exceptional advances have been made in mass spectrometry (MS)-based proteomics, with particular technical progress in liquid chromatography (LC) ...

Rapid Collection of Floral Fragrance Volatiles using a Headspace Volatile Collection Technique for GC-MS Thermal Desorption Sampling

जीसी-एमएस थर्मल डेकोर्पशन सैंपलिंग के लिए हेडस्पेस अस्थिर संग्रह तकनीक का उपयोग करके पुष्प खुशबू वोलेटाइल्स का रैपिड कलेक्शन

Fragrances of many flower families have been sampled and the volatiles analyzed. Knowing the compounds that make up the fragrances can be an important ...

Nitropeptide Profiling and Identification Illustrated by Angiotensin II

Nitropeptide प्रोफ़ेशनल और पहचान एंजियोटेन्सिन द्वितीय द्वारा सचित्र

Protein nitration is one of the most important post-translational modifications (PTM) on tyrosine residues and it can be induced by chemical actions of ...

Absolute Quantification of Cell-Free Protein Synthesis Metabolism by Reversed-Phase Liquid Chromatography-Mass Spectrometry

उलट-चरण तरल क्रोमैटोग्राफी-मास स्पेक्ट्रोमेट्री द्वारा सेल मुक्त प्रोटीन संश्लेषण चयापचय का निरपेक्ष क्वांटिफिकेशन

Cell-free protein synthesis (CFPS) is an emerging technology in systems and synthetic biology for the in vitro production of proteins. However, if CFPS is ...

Label-Free Immunoprecipitation Mass Spectrometry Workflow for Large-scale Nuclear Interactome Profiling

बड़े पैमाने पर परमाणु इंटरैक्टूम प्रोफाइलिंग के लिए लेबल-फ्री इम्यूनोप्रिसिप्रिशन मास स्पेक्ट्रोमेट्री वर्कफ्लो

Immunoaffinity purification mass spectrometry (IP-MS) has emerged as a robust quantitative method of identifying protein-protein interactions. This ...

Quantitative Analysis of the Cellular Lipidome of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry

Quantitative Analysis of the Cellular Lipidome of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry

सचारोमाइसेस सेरेविसी के सेलुलर लिपिडोम का मात्रात्मक विश्लेषण टैंडेम मास स्पेक्ट्रोमेट्री के साथ मिलकर तरल क्रोमेटोग्राफी का उपयोग करके

Lipids are structurally diverse amphipathic molecules that are insoluble in water. Lipids are essential contributors to the organization and function of ...

Untargeted Liquid Chromatography-Mass Spectrometry-Based Metabolomics Analysis of Wheat Grain

गेहूं के अनाज का अलक्षित तरल क्रोमेटोग्राफी-मास स्पेक्ट्रोमेट्री-आधारित मेटापोलोमिक्स विश्लेषण

Understanding the interactions between genes, the environment and management in agricultural practice could allow more accurate prediction and management ...