بينما ينص قانون مندل للفصل على أن الأليلين لجين واحد منفصلان إلى أمشاج مختلفة ، يبقى سؤال مختلف عن كيفية توارث الجينات المختلفة. على سبيل المثال ، هل الجين الخاص بالنباتات الطويلة موروث مع جين البازلاء الخضراء؟ طرح مندل هذا السؤال من خلال تجربة تهجين ثنائي الهجين ؛ و هو تهجين يكون فيه كلا الوالدين متماثلين لسمتين متميزتين ينتج عنه جيل F₁ متغاير الزيجوت لكلتا السمتين.

لنفكر في نباتين متماثلين ، أحدهما يحتوي على بازلاء صفراء مستديرة (التركيب الوراثي YYRR) والآخر يحتوي على بازلاء خضراء مجعدة (yyrr). في الجيل F₁ ، وجد أن جميع النباتات أظهرت كلاً من الصفات السائدة (الأصفر والدائرية ؛ YyRr). ومع ذلك ، في الجيل F₂ ، كان للنباتات مجموعات من السمات التي حدثت بنسبة يمكن التنبؤ بها: لكل ١٦ نباتاً ، ٩ كانت صفراء ودائرية ، و ٣ صفراء ومتجعدة ، و ٣ خضراء ومستديرة ، و ١ كانت خضراء و متجعدة. من هذه النتيجة ، اقترح مندل أن إدراج الأليل الأخضر في الأمشاج لم يكن له أي تأثير على ما إذا كانت تلك الأمشاج ستتلقى الأليل المستدير أو المتجعد: كل مجموعة كانت متساوية في الاحتمال. ينص قانون مندل للتشكيلة المستقلة على أن الجينات لا تؤثر على بعضها البعض فيما يتعلق بالفرز إلى الأمشاج.

يعرف العلماء الآن أن التصنيف المستقل يحدث لأن الكروموسومات تتزاوج عشوائياً خلال الانقسام الاختزالي الأول ، على طول لوحة الطور. نتيجة لذلك ، ستفرز الجينات الموجودة على الكروموسومات المختلفة بشكل مستقل. هذا يعني أيضاً أن جينين مقيمين على نفس الكروموسوم ينتهكان قانون التصنيف المستقل ، خاصةً عندما يكونان قريبان جداً من بعضهما البعض ، حيث سيتم توريثهما معاً دائماً تقريباً. توصف هذه الظاهرة بـ ”الارتباط“. على مستوى الكروموسوم. لا تُظهر الجينات المرتبطة نسبة ٩: ٣: ٣: ١ في الجيل F₂ للتهجين ثنائي الهجين.