3.17 : Ligand Binding and Linkage

تحتوي البروتينات التفارغية على أكثر من موقع ارتباط رابط؛ ويؤثر ارتباط الرابط بأي من هذه المواقع على ارتباط الروابط بالمواقع الأخرى. وعندما يكون البروتين متمايزاً، فإن مواقع الارتباط الخاصة به تسمى مقترنة أو مرتبطة.  ؛ في حالة الإنزيمات، يُعرف الموقع الذي يرتبط بالركيزة بالموقع النشط ويُعرف الموقع الآخر بالموقع التنظيمي. عندما يرتبط الرابط بالموقع التنظيمي، يؤدي ذلك إلى تغييرات توافقية في البروتين يمكن أن يؤثر على الموقع النشط للبروتين.

يمكن أن تؤدي روابط المواقع الملزمة إلى تنظيم إيجابي أو سلبي لربط الروابط بالمواقع الأخرى.  ؛ في الحالات التي يفضل فيها كلا الترابطين الارتباط بنفس الشكل للبروتين، فإن الارتباط في أحد المواقع يزيد من ألفة الموقع الآخر للرابط الخاص به. يُعرف هذا بالارتباط الإيجابي. من ناحية أخرى، إذا كانت الروابط تفضل الارتباط بتشكيلات مختلفة، فإن ربط رابط واحد سيجعل من الصعب على الترابط الثاني الارتباط بالبروتين. وهذا ما يعرف بالارتباط السلبي.

روابط مواقع الربط يمكن أن تنظم وظيفة البروتين.  ؛ على سبيل المثال، غالباً ما يتم تنظيم نشاط الإنزيم من خلال آلية التغذية الراجعة حيث يمكن أن يعمل المنتج النهائي للعملية الكيميائية الحيوية كمثبط. UTP و CTP، المنتجات النهائية لمسار تخليق البيريميدين، تمنع نشاط ATCase، الإنزيم الذي يحفز الخطوة الأساسية الأولى في هذا المسار. إن ارتباط UTP و CTP بالإنزيم ينظم بشكل سلبي الموقع التحفيزي المرتبط عندما يكون تركيز البيريميدين مرتفعاً، بالنسبة لتركيز البيورينات في الخلية. تُعرف هذه الظاهرة باسم تثبيط التغذية المرتدة وهي ضرورية في الحفاظ على الكميات الصحيحة من المستقلبات في الكائن الحي.