A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
هنا، نقدم البروتوكولات لتركيب نوكليوسدس ديساكهارايد من ريجيوسيليكتيفي س-جليكوسيلاتيون من رايبونيوكليوسيدز عن طريق حماية مؤقتة من بهم 2 '، 3'-ديول مويتيس الاستفادة من إستر بورونيك دوري. ينطبق هذا الأسلوب على عدة نوكليوسدس غير المحمية مثل الادينوسين جانسين، سيتيديني، أردين، 5-ميثيلوريديني و 5-فلوروريديني لإعطاء المقابلة ديساكهارايد نوكليوسدس.
من المعروف أن ديساكهارايد نوكليوسدس، التي تتكون من مويتيس ديساكهارايد ونوكليوباسي، كمجموعة قيمة من المنتجات الطبيعية بعد بيواكتيفيتيس المتنوعة. على الرغم من أن س-glycosylation الكيميائية استراتيجية مفيدة عموما لتوليف نوكليوسدس ديساكهارايد، يتطلب إعداد ركائز مثل الجهات المانحة glycosyl ومتقبلون مملة التلاعب مجموعة حماية وتنقية في كل خطوة الاصطناعية. ومن ناحية أخرى، مجموعات بحثية عديدة أفادت أن برونك وبرينك اﻻسترات بمثابة حماية أو تنشيط مجموعة من مشتقات الكربوهيدرات لتحقيق أسيليشن ريدجو و/أو تراكما أحيائياً فراغي النوعية، الألكلة، silylation، وجليكوسيليشن. في هذه المقالة، نبدي إجراءات ريجيوسيليكتيفي س-جليكوسيليشن من رايبونيوكليوسيدز غير المحمية استخدام حمض برونك. الأسترة 2، 3-ديول رايبونيوكليوسيدز مع حمض بورونيك يجعل الحماية المؤقتة ديول، ويلي س-جليكوسيلاتيون مع إحدى الجهات مانحة glycosyl حضور فتولوينيسولفينيل تصاريح تريفلات، كلوريد والفضة ريجيوسيليكتيفي رد فعل 5 '-هيدروكسيل مجموعة تحمل نوكليوسدس ديساكهارايد. ويمكن تطبيق هذا الأسلوب إلى نوكليوسدس المختلفة، مثل جانسين الادينوسين، سيتيديني، أردين، 5-ميتيلوريديني و 5-فلوروريديني. تمثل هذه المادة والفيديو المصاحبة معلومات مفيدة (مرئي) س-جليكوسيليشن من نوكليوسدس غير المحمية وعلى النظير لتركيب نوكليوسدس ديساكهارايد، ليس فقط، بل أيضا مجموعة متنوعة من الناحية البيولوجية ذات الصلة المشتقات المالية.
نوكليوسدس ديساكهارايد، التي يصرف نوكليوزيد ومجموعة الكربوهيدرات مرتبطة عبر س-glycosidic السندات، وتشكل فئة قيمة التي تحدث طبيعيا الكربوهيدرات المشتقات1،2 ،3،،من45،،من67. على سبيل المثال، أنها أدرجت في الجزيئات البيولوجية مثل الحمض الريبي النووي النقال (نقل الحمض النووي الريبي) و poly(ADP-ribose) (ADP = الادينوسين diphosphate)، وكذلك في بعض العوامل المضادة للبكتيريا وغيرها من المواد النشطة بيولوجيا (مثلاً، أدينوفوستينس، أميسيتينس، ازوميسين)5،،من68،9،10،11،،من1213، 14،،من1516،17،،من1819. ومن ثم فمن المتوقع ديساكهارايد نوكليوسدس ومشتقاتها لتكون مركبات الرصاص لبحوث اكتشاف المخدرات. منهجيات لتركيب نوكليوسدس ديساكهارايد تصنف إلى ثلاث فئات؛ الانزيمية س-جليكوسيليشن20،21، الكيميائية N-جليكوسيليشن5،9،16،،من2223، 24، والكيميائية س-جليكوسيلاتيون7،9،14،،من1618،19،24، 25،،من2627،،من2829،30،31،32،33، 34،35،،من3637. على وجه الخصوص، س-glycosylation الكيميائية سيكون وسيلة فعالة لتوليف تراكما أحيائياً فراغي النوعية والتوليف على نطاق واسع من نوكليوسدس ديساكهارايد. وقد أظهرت الأبحاث السابقة أن س-جليكوسيليشن 2-ديوكسيريبونوكليوسيدي 2 مع ثيوجليكوسيل المانحة 1، باستخدام المزيج من كلوريد-تولوينيسولفينيل فوالفضة تريفلات، تتيح المطلوب ديساكهارايد نوكليوزيد 3 (الشكل 1؛ ع = أريل وجزء من الغرام = مجموعة حماية)38.
وأثر هذه النتائج، قررنا وضع س-جليكوسيليشن من رايبونيوكليوسيدز تطبيق نظام المروج تريفلات كلوريد/فضة-تولوينيسولفينيل ف. في حين كانت عدة أمثلة على س-جليكوسيليشن من رايبونيوكليوسيدز المحمية جزئيا أظهرت7،،من914،،من1618،19 24، ،32،34،،من3335،،من3637، والاستخدام غير المحمية أو محمية بشكل مؤقت وذكر ماما رايبونيوكليوسيدز كما يقبلون جليكوسيل س-جليكوسيليشن. ولذلك، تطوير ريجيوسيليكتيفي س-جليكوسيليشن من رايبونيوكليوسيدز غير المحمية أو محمية بشكل مؤقت سوف توفر طريقة اصطناعية أكثر فائدة دون حماية التلاعبات مجموعة من رايبونيوكليوسيدز. من أجل تحقيق ريجيوسيليكتيفي س-جليكوسيليشن من رايبونيوكليوسيدز، ركزنا على مركبات البورون، نظراً لأن العديد من الأمثلة أسيليشن ريدجو و/أو تراكما أحيائياً فراغي النوعية، الألكلة، silylation، وجليكوسيليشن من الكربوهيدرات المشتقات يساعده برونك أو حمض برينك قد أفاد39،،من4041،42،،من4344،45 ،46،،من4748،،من4950. في هذه المقالة، نبدي إجراء توليف ديساكهارايد نوكليوسدس استخدام ريجيوسيليكتيفي س-جليكوسيليشن في 5 '-هيدروكسيل مجموعة من رايبونيوكليوسيدز عن طريق إستر برونك وسيطة. الاستراتيجية المعروضة هنا، أن تتيحها إستر بورونيك المتوسطة 6 الأسترة ريبونوكليوسيدي 4 مع بورونيك حمض 5، مما يسمح ريجيوسيليكتيفي س-جليكوسيلاتيون على 5-هيدروكسيل مجموعة مع ثيوجليكوسيل المانحة 7 إعطاء 8 (الشكل 1ب) نوكليوزيد ديساكهارايد51. درسنا أيضا التفاعل ريبونوكليوسيدي وحمض برونك بالتحليل الطيفي الرنين المغناطيسي النووي (الرنين المغناطيسي النووي)، لمراقبة تشكيل إستر برونك. الأسترة جعل إستر برونك ورد فعل glycosylation تتطلب الظروف لا مائي لمنع التحلل المائي لاستر برونك والجهة المانحة جليكوسيل. في هذه المقالة، ندلل على الإجراءات النموذجية للحصول على شروط اللامائى glycosylation نجاح ردود الفعل للباحثين والطلاب ليس فقط في الكيمياء ولكن أيضا في مجالات أخرى من مجالات البحث.
ملاحظة: جميع البيانات التجريبية [الرنين المغناطيسي النووي، سبيكتروسكوبيس الأشعة تحت الحمراء (IR)، سبيكتروسكوبيس الشامل (مللي ثانية)، وتناوب الضوئية، وعنصري تحليلات البيانات] من المركبات المركبة أفيد ورقة سابقة51.
1-إجراءات س-جليكوسيليشن ردود الفعل
2-deprotection β-28 (الشكل 2)
3-الرنين المغناطيسي دراسات دورية إستر برونك (الشكل 3 و 4)
ويرد في الجدول 160،61نتائج س-glycosylation أردين 10 مع ثيومانوسيدي α-9 . دخول 1، س-جليكوسيلاتيون 10 مع α-9 في حالة عدم وجود مشتقات حمض بورونيك أدت إلى تشكيل خليط معقد. وفي دخول 2، 10 وفينيلب?...
والغرض من هذه المخطوطة إظهار طريقة اصطناعية ملائمة لإعداد نوكليوسدس ديساكهارايد باستخدام رايبونيوكليوسيدز غير المحمية دون التلاعب مجموعة حماية مملة. نحن تقرير هنا عن ريجيوسيليكتيفي س-جليكوسيليشنز من نوكليوسدس عن طريق المؤقتة 2 '، 3'-ديول الحماية دوري إستر برونك (الش?...
الكتاب ليس لها علاقة بالكشف عن.
ومولت هذه البحوث بمعونة من وزارة التربية والتعليم، والثقافة والرياضة، والعلوم والتكنولوجيا (يأمرون) اليابان (رقم 15 ك 00408، 24659011، 24640156، 245900425، و 22390005 لشين أوكي)، بمنحه من "البحوث الكيميائية الحيوية في طوكيو" مؤسسة، طوكيو، اليابان، وصندوق طوس (جامعة طوكيو للعلوم) لمجالات البحوث الاستراتيجية. نود أن نشكر نوريكو صوابي (كلية للعلوم الصيدلانية، جامعة طوكيو للعلوم) لقياسات أطياف الرنين المغناطيسي، توفيق هاسيغاوا (كلية العلوم الصيدلية، جامعة طوكيو للعلوم) لقياسات الكتلة الأطياف وماتسو توموكو (معهد بحوث للعلوم والتكنولوجيا، جامعة طوكيو للعلوم) لقياسات تحاليل عنصري.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Silver trifluoromethanesulfonate | Nacalai Tesque | 34945-61 | |
Phenylboronic acid (contains varying amounts of anhydride) | Tokyo Chemical Industry | B0857 | |
p-Methoxyphenylboronic acid | Wako Pure Chemical Industries | 321-69201 | |
4-(Trifluoromethyl)phenylboronic acid (contains varying amounts of anhydride) | Tokyo Chemical Industry | T1788 | |
2,4-Difluorophenylboronic acid (contains varying amounts of anhydride) | Tokyo Chemical Industry | D3391 | |
Cyclopentylboronic acid (contains varying amounts of Anhydride) | Tokyo Chemical Industry | C2442 | |
4-Nitrophenylboronic acid (contains varying amounts of anhydride) | Tokyo Chemical Industry | N0812 | |
4-Hexylphenylboronic acid (contains varying amounts of anhydride) | Tokyo Chemical Industry | H1489 | |
Adenosine | Merck KGaA | 862. | |
Guanosine | Acros Organics | 411130050 | |
Cytidine | Tokyo Chemical Industry | C0522 | |
Uridine | Tokyo Chemical Industry | U0020 | |
5-Fluorouridine | Tokyo Chemical Industry | F0636 | |
5-Methyluridine | Sigma | M-9885 | |
Methylamine (40% in Methanol, ca. 9.8mol/L) | Tokyo Chemical Industry | M1016 | |
N,N-dimethyl-4-aminopyridine | Wako Pure Chemical Industries | 044-19211 | |
Acetic anhydride | Nacalai Tesque | 00226-15 | |
Pyridine, Dehydrated | Wako Pure Chemical Industries | 161-18453 | |
Acetonitrile | Kanto Chemical | 01031-96 | |
1,4-Dioxane | Nacalai Tesque | 13622-73 | |
Dichloromethane | Wako Pure Chemical Industries | 130-02457 | |
Propionitrile | Wako Pure Chemical Industries | 164-04756 | |
Molecular sieves 4A powder | Nacalai Tesque | 04168-65 | |
Molecular sieves 3A powder | Nacalai Tesque | 04176-55 | |
Celite 545RVS | Nacalai Tesque | 08034-85 | |
Acetonitrile-D3 (D,99.8%) | Cambridge Isotope Laboratories | DLM-21-10 | |
Trifluoroacetic acid | Nacalai Tesque | 34831-25 | |
TLC Silica gel 60 F254 | Merck KGaA | 1.05715.0001 | |
Chromatorex | Fuji Silysia Chemical | FL100D | |
Sodium hydrogen carbonate | Wako Pure Chemical Industries | 191-01305 | |
Hydrochloric acid | Wako Pure Chemical Industries | 080-01061 | |
Sodium sulfate | Nacalai Tesque | 31915-96 | |
Chloroform | Kanto Chemical | 07278-81 | |
Sodium chloride | Wako Pure Chemical Industries | 194-01677 | |
Methanol | Nacalai Tesque | 21914-74 | |
JEOL Always 300 | JEOL | Measurement of NMR | |
Lamda 400 | JEOL | Measurement of NMR | |
PerkinElmer Spectrum 100 FT-IR Spectrometer | Perkin Elmer | Measurement of IR | |
JEOL JMS-700 | JEOL | Measurement of MS | |
PerkinElmer CHN 2400 analyzer | Perkin Elmer | Measurement of elemental analysis | |
JASCO P-1030 digital polarimeter | JASCO | Measurement of optical rotation | |
JASCO PU-2089 Plus intelligent HPLC pump | JASCO | For HPLC | |
Jasco UV-2075 Plus Intelligent UV/Vis Detector | JASCO | For HPLC | |
Rheodyne Model 7125 Injector | Sigma-Aldrich | 58826 | For HPLC |
Chromatopac C-R8A | Shimadzu | For HPLC | |
Senshu Pak Pegasil ODS | Senshu Scientific | For HPLC | |
p-Toluenesulfenyl chloride | Prepared Ref. 38 | ||
Phenyl 6-O-acetyl-2,3,4-tri-O-benzyl-1-thio-a-D-mannopyranoside (a-9) | Prepared Ref. 52 | ||
4-Metylphenyl 2,3,4,6-tetra-O-benzoyl-1-thio-b-D-galactopyranoside (b-21) | Prepared Ref. 53 | ||
4-Metylphenyl 2,3,4,6-tetra-O-benzoyl-1-thio-b-D-glucopyranoside (b-31) | Prepared Ref. 57 | ||
4-Metylphenyl 2,3,4,6-tetra-O-benzoyl-1-thio-a-D-Mannopyranoside (a-32) | Prepared Ref. 67 | ||
6-N-Benzoyladenosine (14) | Prepared Ref. 54 | ||
2-N-Isobutyrylguanosine (16) | Prepared Ref. 55 | ||
4-N-Benzoylcytidine (20) | Prepared Ref. 56 |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionExplore More Articles
This article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved