Method Article
ويصف هذا البروتوكول تبلور بلورات الجليد المجهرية وهيدرات الكلاثرات في أجهزة الموائع الدقيقة، مما يتيح تبادل السوائل حول البلورات المشكلة. وهذا يوفر إمكانيات لا مثيل لها لدراسة عملية التبلور وآليات ربط المثبطات.
يعد الوصف الميكانيكي الدقيق لتبلور المياه أمرا صعبا ويتطلب بعض العناصر الرئيسية: التحكم الرائع في درجة الحرارة للسماح بتكوين بلورات مجهرية واحدة ونظام مجهري مناسب مقترن بالمرحلة الباردة. تضيف الطريقة الموضحة هنا ميزة مهمة أخرى تتضمن تبادل المحاليل حول بلورات هيدرات الجليد والكلاثرات. يتكون النظام الموصوف من مزيج من الأدوات الفريدة والمطورة محليا ، بما في ذلك الموائع الدقيقة ، والمراحل الباردة عالية الدقة ، والفحص المجهري الفلوري. تم تصميم المرحلة الباردة لأجهزة الموائع الدقيقة وتسمح بتكوين بلورات ثلجية / هيدرات بحجم ميكرون داخل قنوات الموائع الدقيقة وتبادل المحاليل حولها. دقة درجة الحرارة واستقرار المرحلة الباردة هي ميليكلفن واحد ، وهو أمر بالغ الأهمية للتحكم في نمو هذه البلورات الصغيرة. يستخدم هذا النظام المتنوع لدراسة العمليات المختلفة لتبلور الجليد والهيدرات والآلية التي يتم من خلالها تثبيط نمو هذه البلورات. يصف البروتوكول كيفية تحضير أجهزة الموائع الدقيقة ، وكيفية زراعة البلورات المجهرية والتحكم فيها في قنوات الموائع الدقيقة ، وكيف أن استخدام تدفق السوائل حول بلورات الجليد / الهيدرات يوفر رؤى جديدة في تبلور الماء.
تحمي البروتينات المضادة للتجمد (AFPs) والبروتينات السكرية المضادة للتجمد (AFGPs) مختلف الكائنات الحية المتكيفة مع البرد من أضرار الصقيع1. تمنع AFPs و AFGPs (المعممة باسم AF (G) Ps) نمو بلورات الجليد عن طريق الارتباط بشكل لا رجعة فيه بأسطحها وتثبيط المزيد من النمو بسبب تأثير Gibbs-Thomson 2,3,4,5. تسمى الفجوة الناتجة التي تتشكل بين درجة حرارة الانصهار ، والتي لم تتغير إلى حد كبير ، ودرجة حرارة التجمد المكتئبة حديثا بالتباطؤ الحراري (TH) وتمثل معلمة قابلة للقياس تتوافق مع نشاط AFP6. إن استخدام AFPs لمنع نمو الجليد له تطبيقات بعيدة المدى ومتنوعة ، مما يوفر تعزيزا محتملا في مختلف المجالات ، بما في ذلك الحفظ بالتجميد ، وجودة الأغذية المجمدة ، وحماية المحاصيل المعرضة للبرد.
يؤدي تبلور الماء في درجات حرارة منخفضة وضغوط عالية في وجود جزيئات عضوية صغيرة إلى تكوين هيدرات كلاثرات (أو هيدرات غاز) ، حيث يكون الهيدرات الأكثر وفرة هو هيدرات الميثان7. قد يؤدي تبلور هيدرات الميثان في خطوط تدفق الغاز / النفط إلى حدوث سدادات ، مما قد يسبب انفجارات بسبب اشتعال الغاز8،9،10. تشمل الجهود الحالية لمنع تبلور الهيدرات في خطوط التدفق استخدام مثبطات الديناميكا الحرارية (الكحول والجليكولات) والحركية (البوليمرات بشكل رئيسي)11،12،13،14. كما وجد أن ال AFPs ترتبط ببلورات هيدرات الكلاثرات وتمنع نموها ، مما يشير إلى الاستخدام المحتمل ل AFPs لإعاقة تكوين المقابس ، وبالتالي توفير حل أكثر اخضرارا15.
الموائع الدقيقة هي طريقة سائدة تستخدم لدراسة خصائص السوائل في أحجام العينات الصغيرة (وصولا إلى fL) التي تتدفق عبر شبكة من القنوات الدقيقة16. تتبع القنوات الدقيقة نمطا تم إنشاؤه على رقاقة السيليكون (القالب) باستخدام الطباعة الحجرية17. من المواد الشائعة الاستخدام لتصنيع أجهزة الموائع الدقيقة polydimethylsiloxane (PDMS) ، وهي غير مكلفة وبسيطة نسبيا للعمل معها في مختبرات البحوث. يتكون تصميم الميزات (القنوات) فيما يتعلق بالغرض المحدد للجهاز ؛ وبالتالي ، يمكن استخدامه لمجموعة متنوعة من التطبيقات ، بما في ذلك استشعار الحمض النووي18 ، والتشخيص الطبي19 وعمليات التبلور3،20،21.
يصف هذا البروتوكول طريقة فريدة من نوعها للموائع الدقيقة لزراعة بلورات الجليد والهيدرات بحجم ميكرون مع مثبطات مختلفة ، بما في ذلك AFPs و AFGPs. بالنسبة لهذه التجارب ، تم استخدام هيدرات Tetrahydrofuran (THF) لمحاكاة خصائص هيدرات غاز الميثان22 ، والتي تتطلب معدات متخصصة للتحكم في الضغط ودرجة الحرارة23. تم استخدام AF (G) Ps المسمى بالفلورسنت لتصور وتحليل امتزاز البروتينات على سطح الكريستال ، وإلى جانب التصوير الفلوري ، سمح نهج الموائع الدقيقة بالحصول على السمات الرئيسية لعملية ربط هذه الجزيئات بالأسطح الكريستالية.
1. تصنيع جهاز الموائع الدقيقة
2. إعداد جهاز الموائع الدقيقة
3. تشكيل بلورات واحدة في قنوات الموائع الدقيقة
4. قياس نشاط التباطؤ الحراري (TH)
ملاحظة: هذه الخطوة اختيارية.
5. تبادل الحل حول بلورات واحدة
6. تجارب مع هيدرات كلاثرات
تبادل الحلول مع بلورات الثلج
يتم عرض تبادل حل ناجح حول بلورة الجليد في الشكل 3. يشير الطابع الزمني لكل لقطة إلى أن تبادل الحلول كان سريعا نسبيا. ومع ذلك ، فإن التبادل الأبطأ ممكن. ويلاحظ بوضوح شدة التألق القادمة من جزيئات AFGP الممتزجة بالجليد بعد اكتمال التبادل (الشكل 3، على اليمين). ويرصد تحليل كمي لتركيز ال AFP على سطح الجليد باستخدام أداة معينة لمنطقة الاهتمام (الشكل 4). في هذه التجربة4 ، تم استخدام AFP من النوع الثالث (QAE isoform) المخفف في 50 mM Tris-HCl (الرقم الهيدروجيني 7.8) و 100 mM NaCl. يتم تبادل المحلول حول بلورة ثنائية الشكل ، ويتم مراقبة شدة التألق في المحلول وعلى الجليد. يتم تقليل المخطط الأحمر الذي يشير إلى إشارة التألق في المحلول بعامل 100 أثناء تبادل المحلول ، بينما تظل الإشارة المحسوبة (المخطط الأخضر) على سطح الجليد ثابتة. تم الحصول على الإشارة المحسوبة للجزيئات الممتزجة بالجليد عن طريق طرح الإشارة القادمة من المحلول (مضروبة في ثابت يتعلق بسمك قناة الموائع الدقيقة) من الإشارة القادمة من الجليد4.
تبادل المحلول مع هيدرات THF
أجريت تجارب الموائع الدقيقة مع هيدرات THF بشكل مشابه للتجارب مع الجليد. بعد السماح لبلورات الهيدرات بامتصاص جزيئات المثبطات من المحلول ، تم حقن محلول خال من المثبطات في القنوات. يعرض الشكل 5 هيدرات THF بعد تبادل المحلول مع نوعين من المثبطات: AFGP1-5 المسمى بإيزوثيوسيانات الفلوريسين (FITC) (الشكل 5A) والسافرانين O (انظر جدول المواد) ، وهي صبغة فلورية26 (الشكل 5B). هذا هو أول شيطان من AFGP ملزمة لسطح هيدرات كلاثرات.
الشكل 1: تمثيل تخطيطي لقنوات الموائع الدقيقة المستخدمة في هذه الدراسة. يتضمن كلا التصميمين مدخلين ومنفذا واحدا. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 2: هيدرات THF التي تشكلت في قناة الموائع الدقيقة بعد تبريد درجة الحرارة إلى ~-2 درجة مئوية. مورفولوجيا جميع البلورات المقدمة هي رباعي السطوح. ومع ذلك ، يتم توجيه بعض البلورات بشكل مختلف. شريط المقياس = 20 ميكرومتر. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 3: تجربة تمثيلية تعرض تبادل المحلول حول بلورة جليدية واحدة في قناة ميكروفلويدية. في البداية ، احتوى الحل على AFGP1-5 المسمى ب FITC ، ولم يتم ملاحظة AFGPs الممتزجة بالجليد. بعد استبدال المحلول بمحلول خال من AFGP ، تم اكتشاف البروتينات التي تم امتصاصها سابقا إلى سطح الجليد بوضوح (الصورة على اليمين). شريط المقياس = 25 ميكرومتر. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 4: تحليل كمي ونوعي لتركيز AFP على سطح الجليد. (أ) بلورة جليدية بتركيز محلول AFP مرتفع (قبل تبادل المحلول). (ب) نفس البلورة بعد استبدال محلول وكالة فرانس برس بمحلول عازل خال من ال AFP. شريط المقياس = 20 ميكرومتر (C) التحليل الكمي لشدة التألق على سطح الجليد (أسود) وفي المحلول (أحمر) أثناء تبادل المحلول. يمثل المنحنى الأخضر الكثافة المحسوبة على سطح الجليد. تم تكييف الشكل بإذن من المرجع4. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 5: بلورات هيدرات THF المفردة في قنوات الموائع الدقيقة بعد تبادل المحلول المحيط بها (A ، AFGP1-5) أو (B ، Safranine O). الصورة الواردة في (B) مستنسخة من المرجع26. شريط المقياس = 25 ميكرومتر. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
تم تصميم هذا البروتوكول للاستفادة من مزيج من تدفق الموائع الدقيقة مع البلورات المجهرية من أجل الكشف عن رؤى جديدة حول نمو البلورات وتثبيطها. تتيح المرحلة الباردة27 التي يتم التحكم في درجة حرارتها بدقة ميليكلفن التحكم في بلورات مجهرية مفردة تقع داخل قنوات الموائع الدقيقة ، مما يسمح بتبادل المحاليل حولها. في حين أن تصنيع أجهزة الموائع الدقيقة قياسي ومشابه للممارسات الشائعة17,18 ، فإن التحكم في نمو وذوبان البلورات داخل الجهاز فريد وجديد. المكون الأكثر أهمية في هذا النظام هو التحكم الرائع في درجة الحرارة ، والذي يتم تحقيقه باستخدام مبردات Peltier الكهروحرارية ، وردود الفعل من الثرمستور الموجود بالقرب من العينة ، ووحدة تحكم في درجة الحرارة عالية الدقة تحكم حلقة التغذية المرتدة.
خطوة حاسمة أخرى هي تبادل الحل نفسه ، حيث قد تذوب البلورات أو تنمو أثناء هذه العملية. وبالتالي ، يجب ضبط درجة الحرارة أثناء تبادل المحلول لمنع النمو / الذوبان. يتداخل تكوين البلورات في قنوات الموائع الدقيقة مع تدفق السائل ويشكل التحدي الرئيسي لهذا النظام ؛ وبالتالي ، يجب التحكم في نمو هذه البلورات. هنا ، تم تركيب ليزر الأشعة تحت الحمراء (980 نانومتر) على المجهر المقلوب وتم استخدامه لإذابة بلورات الجليد / الترطيب غير المرغوب فيها محليا28. إذا تعذر استخدام مثل هذا الليزر ، فيمكن تسخين الموصلات المعدنية لجهاز الموائع الدقيقة بواسطة مبرد كهروحراري إضافي من Peltier ، والذي سيذيب الجليد في مدخل / مخرج الجهاز.
تتضمن الطريقة الموضحة هنا أدوات مطورة منزليا (المرحلة الباردة) وتتطلب التدريب ، حيث أن بعض الخطوات المذكورة أعلاه تشكل تحديا. نظرا لأن تركيز المحلول المحيط بالبلورات قد يتغير حتى عندما لا يكون التدفق مقصودا ، فإن خطوة المعايرة البسيطة5 يمكن أن توفر تقديرا موثوقا به للتركيز بناء على إشارة التألق. حل آخر ممكن للتدفق غير المرغوب فيه (أثناء قياسات TH ، على سبيل المثال) هو صمامات الموائع الدقيقة ، الموضحة في المرجع4.
تم استخدام هذا النظام أيضا لاستكشاف سلوك نمو الجليد D 2 Oفي سائل H2O ، وهي دراسة كشفت عن ظاهرة جديدة للأسطح الجليدية المجهرية الصدفية27. وبالتالي ، يمكن استخدام الموائع الدقيقة في دراسة الأنظمة البلورية المختلفة التي تستجيب بشكل جيد للتغيرات في درجات الحرارة.
اي
يتم تقديم شكر وتقدير إلى الجهات المانحة لصندوق أبحاث البترول التابع للجمعية الكيميائية الأمريكية لدعم هذا البحث (رقم المنحة 60191-UNI5). يود المؤلفون أن يشكروا البروفيسور إيدو براسلافسكي على ريادته في استخدام أجهزة الموائع الدقيقة لدراسة البروتينات المضادة للتجمد والجليد. المؤلفون ممتنون للبروفيسور آرثر ديفريس والبروفيسور كونراد مايستر والبروفيسور بيتر ديفيز لتقديم عينات من البروتين المضاد للتجمد.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
0.22-micron filters | Fisher Scientific | ||
90-degree bent blunt needles | 18 Gauge | ||
Antifreeze proteins and antifreeze glycoproteins | A gift | See references 5 and 28 | |
Blunt needles | 18 Gauge and 20 Gauge | ||
Bovine Serum Albumin (BSA) | Sigma-Aldrich | ||
Cold stage | Home made | ||
Cover slips | Globe Scientific | 18 X 18 mm, 0.14 mm thickness | |
Glass syringe | |||
Infrared laser 980 nm | Opto Engine LLC | ||
Inverted microscope, Eclipse Ti - S | Nikon | ||
Invisible tape | Staples | ||
lint-free wipe | Kimwipes | ||
Newport 3040 temperature controller | Newport | ||
NIS-Elements Imaging Software | Nikon | ||
Oil vacuum pump | Harrick Plasma | ||
Plasma cleaner | Harrick Plasma | PDC-32G | |
Polydimethylsiloxane (Dow Corning Sylgard 184 Silicone Elastomer kit) | Dow Corning Syglard | ||
Safranine O | Sigma-Aldrich | S2255-25G | |
Sapphire disc | Ted Pella Inc | 16005-1010 | 25.4 mm diameter, 0.3 mm thickness |
sCMOS Camera, Neo 5.5 | Andor | ||
Tetrahydrofuran (THF) | Sigma-Aldrich | 401757-100ML | |
Tygon Microbore tubing for microfluidic device | Cole-Parmer | 0.020" ID, 0.060"OD, 100 ft/roll. | |
Tygon tubing for water circulation and nitrogen gas | Cole-Parmer | 1/8” ID, 3/16” OD |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved