تصوير المواد العضوية المشتقة من سرطان القولون والمستقيم المناعي في هيدروجيل الببتيد لتقييم آثار الببتيدات ذاتية التجميع على التصاق الخلايا

للبدء ، قم بتصوير العينات العضوية المشتقة من SW1222 الملطخة باستخدام مجهر epifluorescence عند 10x. استخدم فقط قنوات Rhod و DAPI. قم بتشغيل برنامج ImageJ وانقر على المكون الإضافي ، متبوعا بوحدات الماكرو.

ثم قم بتشغيل محول ImageJ ROI. py من موقع Cell Pose GitHub. عندما تظهر نافذة ، حدد الملف الأول من مجلد النقطتين العضوي وانقر فوق فتح.

ثم اختر seg. NPY المقابلة للملف الأول ، وانقر فوق فتح. بعد ذلك ، اضغط على تحديد الكل في نافذة مدير عائد الاستثمار واضغط على قياس.

الآن ، انقر فوق ملف ، متبوعا بحفظ باسم في نافذة النتائج لحفظ النتائج. كرر تحويل الصورة لنفس الصورة في المجلد الخاص بالتجويف العضوي للقولون. بعد ذلك ، قم بتحميل برنامج Origin Pro ، وانقر فوق البيانات ، متبوعا بملف الاستيراد لتحديد موقع معالج الاستيراد.

حدد كلا ملفي CSV المطابقين للخصائص العضوية وخصائص شكل التجويف لنفس الصورة. انسخ الخصائص على شكل تجويف في عمود نتائج المستعمرة لإقران كل قياس لومن مع مستعمرته المقابلة. في عمود جديد ، قسم مناطق التجويف والمستعمرة للحصول على مساحة التجويف النسبية للمستعمرة المقابلة لها.

حدد العمود المقابل لدائرية كل مستعمرة ومنطقة التجويف. ثم ، انقر بالتتابع على قطعة الأرض ، 2D الأساسية ، ومبعثر. انقر بزر الماوس الأيمن على نافذة المؤامرة واختر تفاصيل المؤامرة.

انقر فوق علامة التبويب centroid pro وحدد خيارات القراءة إظهار نقطة centroid لمجموعة فرعية ، والاتصال بنقاط البيانات ، وإظهار القطع الناقص. كان للخلايا المستزرعة في 2D تباين كبير جدا في دائرية المستعمرة. كان للخلايا المستزرعة في Matrigel توزيع أكثر شمولا للحجم النسبي للتجويف.