وقدمت التمويل لهذا البحث من قبل مؤسسة الصرع الأمريكية، كلية بايلور لمركز البحوث الطبية الحيوية التكاملية (CIBR) البذور جوائز المنحة (ZH) الطب الحاسوبية و؛ NIH-K23 NINDS NS044936 غرانت (الدائرة)؛ . ومؤسسة عائلة ليف (الدائرة) وساعد الحصول على البيانات من قبل: اليزابيث بيرس (UCLA).

1. الموضوعات <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> يشمل مجتمع الدراسة من 36 مواضيع 3 مجموعات: الحق TLE (ن = 11)، غادر TLE (ن = 12)، والاصحاء (ن = 13). الحصول على موافقة خطية من علم جميع المواد الدراسية. يتبع المبادئ التوجيهية الدراسة من جامعة كاليفورنيا في لوس أنجلوس (UCLA) مجلس المراجعة المؤسساتي. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> يجب أن تكون المجموعات موضوع الصرع المرضى الذين هم المرشحين لاستئصال الفص الصدغي الأمامي على النحو الذي يحدده الفيديو EEG الرصد والتصوير بالرنين المغناطيسي الدماغ، والتصوير PET، واختبار النفسية العصبية. ينبغي على المرضى الاستمرار الأدوية المعتادة أثناء الفحص الرنين المغناطيسي الوظيفي، وينبغي ألا يتم فحصها فورا بعد الاستيلاء. تأكد من أن جميع المواد لديها الرنين المغناطيسي الدماغ طبيعية وخالية من المرض العصبية (بخلاف الصرع في مجموعات المرضى) أو تستخدم الأدوية العصبية. </li></ol> 2. التصوير <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> استخدام نظام التصوير بالرنين المغناطيسي 3 تسلا للتصوير. الحصول على شرائح المحوري للصور الفنية باستخدام مستو ايماج صدىوأشارت جي (برنامج التحصين الموسع) وتسلسل للصور التشريحية باستخدام التدرج مدلل (SPGR) التسلسل. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> أداء التصوير الوظيفي باستخدام المعلمات التالية: TR = 2،000 ميللي ثانية، TE = 30 مللي ثانية، فوف = 210 مم، مصفوفة = 64 × 64، شريحة سمك 4 مم، 34 شرائح. استخدام المعلمات التالية لالتصوير ذات الدقة العالية الهيكلية: TR = 20 ميللي ثانية، TE = 3 ميللي ثانية، فوف = 256 مم، مصفوفة = 256 × 256، شريحة سمك 1 مم، 160 شرائح. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> كل دورة التصوير يجب أن تستمر 20 دقيقة. اطلب من المشاركين للاسترخاء مع عيون مغلقة. لم يكن يحتاج إلى مدخلات السمعية الخاصة. </li></ol> 3. تجهيزها من البيانات BOLD <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Preprocess البيانات باستخدام الرنين المغناطيسي الوظيفي FSL (مكتبة البرامج fMRIB) برنامج الإصدار 4.1.6 (أكسفورد، المملكة المتحدة، www.fmrib.ox.ac.uk / FSL) 13،14. وينبغي أن تشمل خطوات تجهيزها التالية: استخدم FSL MCFLIRT لإزالة حركة الرأس قطعة أثرية 15. استخدام BET FSL لإزالة الأنسجة nonbrain 16 مع خيار BET-F لملفات BOLD. هذا واحد يساعد المدى وخطوات تحليل urther على أنسجة المخ وحدها. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> في الفذ، تشغيل تحليل معالجة الحد الأدنى مع التسجيل. حدد &quot;تحليل المستوى الأول&quot; وتغيير &quot;تحليل كامل&quot; إلى &quot;ما قبل احصائيات&quot; من أعلى اثنين من الأزرار. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ضمن علامة التبويب احصائيات ما قبل، قم بإلغاء &quot;BET استخراج الدماغ&quot; وحدد &quot;لا&quot; ل &quot;تصحيح الحركة&quot; (وهذه كانت قد فعلت أعلاه). تسجيل ظيفية (BOLD) الصور إلى التشريحية (SPGR) الصور، ومن ثم على مستوى (MNI) الصورة. هذه النتائج في توليد مصفوفات التحول، والتي تستخدم في وقت لاحق خلال تحليل لتشوه البذور المختارة في الفضاء القياسية في الفضاء الدماغ في هذا الموضوع. </li></ol></li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> استخدام مصفوفة التحول ولدت (المسمى &quot;standard2example_func.mat&quot;) وتحويل السائل النخاعي ورويس المادة البيضاء في الفضاء BOLD الفردية. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> استخراج سلسلة زمنية من السائل النخاعي ورويس المادة البيضاء باستخدام الأمر fslmeants،باستخدام العائد على الاستثمار في الفضاء تخضع الفردية كقناع. تطبيع سلسلة زمنية المستخرجة باستخدام برنامج &quot;R&quot;. وتستخدم هذه السلسلة الزمنية كمعاملات تراجع في وقت لاحق GLM لإزالة إشارات مصطنعة المقابلة من التحليل. </li></ol></li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> الخطوة التالية هي إزالة الحركة المتعلقة التحف الموضوع. لالانحدار من المعلمات الحركة، تعيين التالية ضمن FSL الفذ قبل تشغيله. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ضمن علامة التبويب بيانات، استخدم لتصحيح الحركة وملف استخراج الدماغ كمدخلات، تعيين قيمة TR لتتوافق مع مجموعة البيانات الخاصة بك. تعيين تمريرة عالية تصفية باستخدام 100 مرشح ثانية. سوف تمرير تصفية عالية إزالة إشارات من أي مصلحة، والتي هي من التردد المنخفض جدا. وسيتم تطبيق مرشح تمرير منخفض لإزالة الإشارات عالية التردد لاحقا في الخطوة 4.1. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ضمن علامة التبويب احصائيات ما قبل، اختر &quot;بلا&quot; تحت عنوان &quot;تصحيح الحركة&quot;، كما تم القيام به بالفعل. ازل &quot;BET استخراج الدماغ&quot;، كما تم القيام به بالفعل. أداء تجانس المكانيةباستخدام 5 ملم ذات العرض الكامل نصف الحد الأقصى (FWHM). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ضمن علامة التبويب الإحصائيات وتتراجع المعلمات حركة 6 و مشتقاتها الزمنية. حدد &quot;لا&quot; للالتفاف وتحقق &quot;تطبيق تصفية الزمانية.&quot; استخدام إخراج FSL MCFLIRT للحصول على ملفات نص المعلمات الحركة، التي يمكن أن تكون المدخلات ثم إلى نموذج تحليل FEAT إلى التراجع هذه في النموذج الخطي العام (GLM) </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> أيضا إضافة CSF والإشارات المادة البيضاء التي تم استخراجها وتطبيع في الخطوات السابقة إلى GLM. حدد &quot;لا&quot; للالتفاف، إضافة المشتقة الزمنية، وإلغاء &quot;تطبيق تصفية الزمنية&quot;. </li></ol></li></ol> 4. الأساليب الإحصائية <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> مخلفات من تجهيزها المذكورة أعلاه ينبغي أن تستخدم لارتباط القائم على البذور. يجب أن يمرر هذه المخلفات الأولى من خلال مرشح تمرير منخفض من 0.1 هرتز، ثم تهين بطرح نفسه، قسمة الناتج على الانحراف المعياري، ومن ثم تحجيم بإضافةينبغي تحديد 100. بذور بقطر 6 ملم في MNI الفضاء القياسية باستخدام برنامج MRICron. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> الخلفي والأمامي بذور يجب أن تتوافق مع الإحداثيات التالية: (1) المنطقة RSP / PCUN (س = 2، ص = -60، ض = 36) و (2) قشرة الفص الجبهي بطني إنسي (vmPFC؛ س = 3، ص = 60، ض = -1). وقد تم تحديد هذه المواقع المصنفة ضمن ضوابط صحية وتتحول إلى فضاء الموضوع في الخطوة التالية 17-19. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> وينبغي بعد ذلك أن تتحول البذور لفرد مساحة كل موضوع في المخ وظيفية من MNI الفضاء القياسية. لهذا، استخدم مصفوفة التحول إنشاؤها أعلاه (المسمى &quot;standard2example_func.mat&quot;) لتحويل البذور من معيار (MNI) مساحة للفرد وظيفية (BOLD) الفضاء. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> استخدام fslmeants الأمر لاستخراج سلسلة زمنية من تهين وتحجيم المتبقية، وذلك باستخدام البذور في الفضاء تخضع الفردية كقناع سابقا. تطبيع سلسلة زمنية المستخرجة باستخدام الناعمةوير &quot;R&quot;. </li></ol></li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ينبغي أن تحسب الارتباط الجزئي بين voxels البذور وجميع voxels الدماغ الأخرى بشكل منفصل لكل موضوع لكل شوط. لهذا، في واجهة المستخدم الرسومية FSL الفذ، حدد &quot;تحليل المستوى الأول&quot;، ثم &quot;الإحصائيات + احصائيات ما بعد&quot;. ضمن علامة التبويب بيانات، يجب استخدام المتبقية تهين وتحجيم سابقا كمدخل إلى الفذ. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> تعيين تمريرة عالية تصفية قطع إلى 10،000، كما هو بالفعل مرت المتبقية عالية في 100 ثانية. ضمن علامة التبويب الإحصائيات، إلغاء تحديد &quot;استخدام FILM prewhitening&quot;، واستخدام البذور السلاسل الزمنية استخراج وتطبيع سابقا في GLM. ضمن علامة التبويب بعد احصائيات، تعيين عتبة Z-القانون الأساسي المطلوب إلى قيمة 2.0. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> قبل تشغيل تحليل مجموعة الجمع بين أشواط داخل الموضوعات، Z وفيشر تحويل ينبغي أن يقوم على COPE (التباين تقديرات معلمة) ملف الناتجة عن تحليل الارتباط تشغيل سابقا (الخطوة 4.3). تسجيل نسخة الاب البياناتام في &quot;ريج&quot; دليل تحليل الفذ القيام به في الخطوة 3.1 في المدى ارتباط الخطوة 4.3. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> تشغيل تحليل مستوى أعلى من خلال الجمع بين أشواط داخل كل موضوع. لهذا، في واجهة المستخدم الرسومية FSL الفذ، حدد &quot;تحليل المستوى العالي&quot;، ثم &quot;الإحصائيات + احصائيات ما بعد&quot;. ضمن &quot;بيانات&quot; علامة التبويب، اختيار &quot;المدخلات هي الدلائل FEAT المستوى الأدنى&quot; وأدخل أشواط الموضوع من الخطوة 4.4. ضمن &quot;الإحصائيات&quot; علامة التبويب، اختيار &quot;الآثار المختلطة: عملية شريان الحياة بسيطة&quot;. إعداد نموذج يعني كما أثر؛ أدخل قيمة 1 لكل من المدى في هذا الموضوع. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> الجمع بين البيانات عبر أشواط بين الموضوعات، والعادية المربعات (OLS) وينبغي استخدام تحليل بسيط آثار مختلطة. لهذا، في واجهة المستخدم الرسومية FSL الفذ، اختر &quot;تحليل المستوى العالي&quot;، و &quot;الإحصائيات + احصائيات ما بعد&quot;. ضمن علامة التبويب بيانات، اختر &quot;المدخلات هي الدلائل FEAT المستوى الأدنى&quot; وأدخل أشواط المواضيع &#39;جنبا إلى جنب من الخطوة 4.5. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ضمن علامة التبويب الإحصائيات، اختر &quot;الآثار المختلطة: عملية شريان الحياة بسيطة&quot; &#39;إعداد النموذج بوصفه 3 مجموعات؛ أدخل قيمة 1 للمجموعة ينتمي كل موضوع، 0 خلاف ذلك. وينبغي أن يتم تحليل مجموعة على كل فوكسل باستخدام ANOVA في اتجاه واحد مع ثلاثة مستويات والذي يتفق مع المجموعات الثلاث (الحق TLE، غادر TLE، والاصحاء). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> إلى عتبة الصور إحصائية Z استخدام الكتلة تشكيل عتبة Z&gt; 2.0 وتصحيح عتبة هامة مجموعة من ع = 0.05 20. للحصول على الصحيح ض القيم على الخريطة الارتباط، Z عكس فيشر تحويل ينبغي أن يقوم على النتائج. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> يجب مقارنة التناقضات المحددة التالية (1) الحق TLE&gt; ضوابط؛ (2) ترك TLE&gt; ضوابط؛ (3) الحق TLE&gt; ترك TLE؛ (4) ترك TLE&gt; الحق TLE؛ (5) التحكم&gt; الحق TLE؛ (6) التحكم&gt; ترك TLE؛ (7) TLE (يمين مجتمعة واليسار)&gt; السيطرة؛ و (7) التحكم&gt; TLE (يمين مجتمعة واليسار). </li></ol>

<ol>
	<li>Biswal, B. B., Yetkin, F. Z., Haughton, V. M., Hyde, J. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Functional+connectivity+in+the+motor+cortex+of+resting+human+brain+using+echo-planar+MRI.">Functional connectivity in the motor cortex of resting human brain using echo-planar MRI.</a> Magn. Reson. Med. 34, 537-541 (1995).</li><li>Fox, M. D., Greicius, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Clinical+applications+of+resting+state+functional+connectivity.">Clinical applications of resting state functional connectivity.</a> Front. Syst. Neurosci. 4, 1-13 (2010).</li><li>Laufs, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Electroencephalographic+signatures+of+attentional+and+cognitive+default+modes+in+spontaneous+brain+activity+fluctuations+at+rest.">Electroencephalographic signatures of attentional and cognitive default modes in spontaneous brain activity fluctuations at rest.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100, 11053-11058 (1073).</li><li>Shmuel, A., Leopold, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neuronal+correlates+of+spontaneous+fluctuations+in+fMRI+signals+in+monkey+visual+cortex:+Implications+for+functional+connectivity+at+rest.">Neuronal correlates of spontaneous fluctuations in fMRI signals in monkey visual cortex: Implications for functional connectivity at rest.</a> Hum. Brain Mapp. 29, 751-761 (2008).</li><li>Margulies, D. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Resting+developments:+a+review+of+fMRI+post-processing+methodologies+for+spontaneous+brain+activity.">Resting developments: a review of fMRI post-processing methodologies for spontaneous brain activity.</a> Magn. Mater. Phys. Biol. 23, 289-307 (2010).</li><li>Biswal, B. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Toward+discovery+science+of+human+brain+function.">Toward discovery science of human brain function.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107, 4734-4739 (2010).</li><li>Haneef, Z., Lenartowicz, A., Yeh, H. J., Engel, J., Stern, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effect+of+lateralized+temporal+lobe+epilepsy+on+the+default+mode+network.">Effect of lateralized temporal lobe epilepsy on the default mode network.</a> Epilepsy Behav. 25, 350-357 (2012).</li><li>Pillai, J. J., Williams, H. T., Faro, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Functional+imaging+in+temporal+lobe+epilepsy.">Functional imaging in temporal lobe epilepsy.</a> Semin. Ultrasound. CT MR. 28, 437-450 (2007).</li><li>Blumenfeld, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Positive+and+negative+network+correlations+in+temporal+lobe+epilepsy.">Positive and negative network correlations in temporal lobe epilepsy.</a> Cereb. Cortex. 14, 892-902 (2004).</li><li>Dupont, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dynamic+perfusion+patterns+in+temporal+lobe+epilepsy.">Dynamic perfusion patterns in temporal lobe epilepsy.</a> Eur. J. Nucl. Med. Imaging. 36, 823-830 (2009).</li><li>Fransson, P., Marrelec, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+precuneus/posterior+cingulate+cortex+plays+a+pivotal+role+in+the+default+mode+network:+Evidence+from+a+partial+correlation+network+analysis.">The precuneus/posterior cingulate cortex plays a pivotal role in the default mode network: Evidence from a partial correlation network analysis.</a> Neuroimage. 42, 1178-1184 (2008).</li><li>Buckner, R. L., Andrews-Hanna, J. R., Schacter, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+brain's+default+network.">The brain's default network.</a> Ann. N. Y. Acad. Sci. 1124, 1-38 (2008).</li><li>Woolrich, M. W., Ripley, B. D., Brady, M., Smith, S. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Temporal+autocorrelation+in+univariate+linear+modeling+of+FMRI+data.">Temporal autocorrelation in univariate linear modeling of FMRI data.</a> Neuroimage. 14, 1370-1386 (2001).</li><li>Forman, S. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Improved+assessment+of+significant+activation+in+functional+magnetic+resonance+imaging+(fMRI):+use+of+a+cluster+size+threshold.">Improved assessment of significant activation in functional magnetic resonance imaging (fMRI): use of a cluster size threshold.</a> Magn. Reson. Med. 33, 636-647 (1995).</li><li>Jenkinson, M., Bannister, P., Brady, M., Smith, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Improved+optimization+for+the+robust+and+accurate+linear+registration+and+motion+correction+of+brain+images.">Improved optimization for the robust and accurate linear registration and motion correction of brain images.</a> Neuroimage. 17, 825-841 (2002).</li><li>Smith, S. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fast+robust+automated+brain+extraction.">Fast robust automated brain extraction.</a> Hum. Brain Mapp. 17, 143-155 (2002).</li><li>Raichle, M. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+default+mode+of+brain+function.">A default mode of brain function.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98, 676-682 (2001).</li><li>Uddin, L. Q., Kelly, A. M., Biswal, B. B., Castellanos, F. X., Milham, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Functional+connectivity+of+default+mode+network+components:+correlation.">Functional connectivity of default mode network components: correlation.</a> Hum. Brain Mapp. 30, 625-637 (2009).</li><li>Singh, K. D., Fawcett, I. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Transient+and+linearly+graded+deactivation+of+the+human+default-mode+network+by+a+visual+detection+task.">Transient and linearly graded deactivation of the human default-mode network by a visual detection task.</a> Neuroimage. 41, 100-112 (2008).</li><li>Worsley, K. J., Evans, A., Marrett, S., Neelin, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+three-dimensional+statistical+analysis+for+CBF+activation+studies+in+human+brain.">A three-dimensional statistical analysis for CBF activation studies in human brain.</a> J. Cereb. Blood Flow Metab. 12, 900-918 (1992).</li><li>Spencer, S. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neural+networks+in+human+epilepsy:+evidence+of+and+implications+for+treatment.">Neural networks in human epilepsy: evidence of and implications for treatment.</a> Epilepsia. 43, 219-227 (2002).</li><li>Greicius, M. D., Srivastava, G., Reiss, A. L., Menon, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Default-mode+network+activity+distinguishes+Alzheimer's+disease+from+healthy+aging:+evidence+from+functional+MRI.">Default-mode network activity distinguishes Alzheimer's disease from healthy aging: evidence from functional MRI.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101, 4637-4642 (2004).</li><li>Kennedy, D. P., Redcay, E., Courchesne, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Failing+to+deactivate:+resting+functional+abnormalities+in+autism.">Failing to deactivate: resting functional abnormalities in autism.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103, 8275-8280 (2006).</li><li>Garrity, A. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Aberrant+&amp;#34;default+mode&amp;#34;+functional+connectivity+in+schizophrenia.">Aberrant &amp;#34;default mode&amp;#34; functional connectivity in schizophrenia.</a> Am. J. Psychiatry. 164, 450-457 (2007).</li><li>Mannell, M. V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Resting+state+and+task-induced+deactivation:+A+methodological+comparison+in+patients+with+schizophrenia+and+healthy+controls.">Resting state and task-induced deactivation: A methodological comparison in patients with schizophrenia and healthy controls.</a> Hum. Brain Mapp. 31, 424-437 (2010).</li><li>Jones, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Age-related+changes+in+the+default+mode+network+are+more+advanced+in+Alzheimer+disease.">Age-related changes in the default mode network are more advanced in Alzheimer disease.</a> Neurology. 77, 1524-1531 (2011).</li><li>Kobayashi, Y., Amaral, D. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Macaque+monkey+retrosplenial+cortex+II.+Cortical+afferents.">Macaque monkey retrosplenial cortex II. Cortical afferents.</a> J. Comp. Neurol. 466, 48-79 (2003).</li><li>Dupont, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dynamic+perfusion+patterns+in+temporal+lobe+epilepsy.">Dynamic perfusion patterns in temporal lobe epilepsy.</a> Eur. J. Nuclear Med. Mol. Imaging. 36, 823-830 (2009).</li><li>Laufs, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Temporal+lobe+interictal+epileptic+discharges+affect+cerebral+activity+in+&#8220;default+mode&#8221;+brain+regions.">Temporal lobe interictal epileptic discharges affect cerebral activity in &#8220;default mode&#8221; brain regions.</a> Hum. Brain Mapp. 28, 1023-1032 (2007).</li><li>Morgan, V. L., Gore, J. C., Abou-Khalil, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Functional+epileptic+network+in+left+mesial+temporal+lobe+epilepsy+detected+using+resting+fMRI.">Functional epileptic network in left mesial temporal lobe epilepsy detected using resting fMRI.</a> Epilepsy Res. 88, 168-178 (2010).</li><li>Gotman, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Generalized+epileptic+discharges+show+thalamocortical+activation+and+suspension+of+the+default+state+of+the+brain.">Generalized epileptic discharges show thalamocortical activation and suspension of the default state of the brain.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102, 15236-15240 (2005).</li><li>Hamandi, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=EEG-fMRI+of+idiopathic+and+secondarily+generalized+epilepsies.">EEG-fMRI of idiopathic and secondarily generalized epilepsies.</a> Neuroimage. 31, 1700-1710 (2006).</li><li>Pittau, F., Grova, C., Moeller, F., Dubeau, F., Gotman, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Patterns+of+altered+functional+connectivity+in+mesial+temporal+lobe+epilepsy.">Patterns of altered functional connectivity in mesial temporal lobe epilepsy.</a> Epilepsia. 53, 1013-1023 (2012).</li><li>Liao, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Default+mode+network+abnormalities+in+mesial+temporal+lobe+epilepsy:+a+study+combining+fMRI+and+DTI.">Default mode network abnormalities in mesial temporal lobe epilepsy: a study combining fMRI and DTI.</a> Hum. Brain Mapp. 32, 883-895 (2011).</li><li>Pereira, F. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Asymmetrical+hippocampal+connectivity+in+mesial+temporal+lobe+epilepsy:+evidence+from+resting+state+fMRI.">Asymmetrical hippocampal connectivity in mesial temporal lobe epilepsy: evidence from resting state fMRI.</a> BMC Neurosci. 11, 1-13 (2010).</li><li>Dupont, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bilateral+hemispheric+alteration+of+memory+processes+in+right+medial+temporal+lobe+epilepsy.">Bilateral hemispheric alteration of memory processes in right medial temporal lobe epilepsy.</a> J. Neurol. Neurosurg. Psychiatr. 73, 478-485 (2002).</li><li>Vlooswijk, M. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Functional+MRI+in+chronic+epilepsy:+associations+with+cognitive+impairment.">Functional MRI in chronic epilepsy: associations with cognitive impairment.</a> Lancet Neurol. 9, 1018-1027 (2010).</li><li>McCormick, C., Quraan, M., Cohn, M., Valiante, T. A., McAndrews, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Default+mode+network+connectivity+indicates+episodic+memory+capacity+in+mesial+temporal+lobe+epilepsy.">Default mode network connectivity indicates episodic memory capacity in mesial temporal lobe epilepsy.</a> Epilepsia. 54, (2013).</li><li>Zhang, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Altered+spontaneous+neuronal+activity+of+the+default-mode+network+in+mesial+temporal+lobe+epilepsy.">Altered spontaneous neuronal activity of the default-mode network in mesial temporal lobe epilepsy.</a> Brain Res. 1323, 152-160 (2010).</li><li>Horovitz, S. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Decoupling+of+the+brain's+default+mode+network+during+deep+sleep.">Decoupling of the brain's default mode network during deep sleep.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106, 11376-11381 (2009).</li><li>Deshpande, G., Kerssens, C., Sebel, P. S., Hu, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Altered+local+coherence+in+the+default+mode+network+due+to+sevoflurane+anesthesia.">Altered local coherence in the default mode network due to sevoflurane anesthesia.</a> Brain Res. 1318, 110-121 (2010).</li></ol>

ويتم تمويل المنح من قبل الدكتور إنجل NIH P01 NS02808، R01 NS33310، وU01 NS42372، وبراءات الاختراع WO 2009/123734A1، وWO 2009/123735A1، يتلقى الإتاوات من MedLink، ولترز كلوير، بلاكويل، وإلسفير، وتلقت الأتعاب من ميدترونيكس ، ولترز كلوير، وأفضل الأطباء. وقد عمل الدكتور ستيرن كمستشار دفعت لUCB ووندبيك. الدكتور ستيرن هو رئيس تحرير MedLink الأعصاب، وتلقت الإتاوات من ترز كلوير ومن ماكجرو هيل. المؤلفين المتبقية ليس لها الإفصاحات أو تضارب المصالح أن يعلن.

ويعتقد أن يكون الصرع مرض الشبكة، وشذوذات في الشبكات المعنية موجودة خلال المضبوطات والنشبات في الدولة 21. وقد استخدم الرنين المغناطيسي الوظيفي على أساس مهمة لتحليل تشوهات اللغة وشبكات الذاكرة في TLE 8. FcMRI ديه المزايا الكامنة في دراسة DMN 12 كما هو شبكة تن...

وظيفية الربط التصوير بالرنين المغناطيسي (fcMRI) هو نهج تحليلية حديثة نسبيا لبيانات الرنين المغناطيسي الوظيفي يحدد مقدار العلاقة بين مناطق الدماغ المختلفة استنادا إلى تشابه مستواها الأوكسجين في الدم تعتمد (BOLD) إشارة السلاسل الزمنية - وهذا ما يسمى &quot;وظيفية&quot; الاتصال، و تمييزها عن الربط التشريحية التي توضح وجود اتصالات فعلية بين المناطق (مثل ألياف المادة البيضاء). في تطبيق خاص لهذا النهج، يتم جمع سلسلة زمنية عندما لا تعمل المشارك في مهمة أو في ما يسمى ب &quot;دولة يستريح&quot;. على الرغم من وصف لأول مرة في عام 1995 1، كان هناك اهتمام هائل في fcMRI مما أدى إلى ما يقرب من 1،000 المطبوعات ذات الصلة تقنية في عام 2012. fcMRI له فوائد جوهرية على الرنين المغناطيسي الوظيفي القائم على المهمة في (1) أنه ليس هناك مهمة محددة يتعين القيام بها، ( 2) التعاون الموضوعليس من الضروري، (3) مجموعات البيانات يمكن استخدامها لعدة شبكات الاستعلام مختلفة، (4) إشارة إلى نسبة الضوضاء أفضل من المحتمل بسبب وجود خلافات في علم الطاقة الدماغية المعنية، و (5) من التحايل يفند المتعلقة مهمة 2 الحالي. كدليل على مفهومها، وقد تبين أن التغييرات fcMRI لتتوافق مع التغيرات في EEG 3 وامكانات الحقل المحلية 4 في الدماغ. وتشمل تقنيات التحليل fcMRI تقنيات ROI / القائم على البذور، وتحليل عنصر المستقلة (ICA)، وتحليل نظرية الرسم البياني، جرانجر تحليل السببية، وأساليب المحلية (السعة تقلبات منخفضة التردد، وتحليل التجانس الإقليمي)، وغيرها 5. لا تقنية واحدة حتى الآن أظهرت تفوق واضح على آخر، على الرغم من أن الأساليب الأكثر شعبية هي القائمة على البذور وطرق ICA 6. ووصف القائم على البذور fcMRI يرتبط التقلبات الزمانية في إشارة BOLD من جزء انتقاؤه من الشبكة المفترضة تحت الدراسة &quot;SEED1؛ أو &quot;المنطقة ذات الاهتمام (ROI)&quot; لجميع الأجزاء الأخرى من الدماغ. ويعتقد أن مناطق الدماغ التي تبين BOLD ربط إشارة إلى منطقة البذور لترسيم أجزاء من الشبكة المعنية. في المقابل، يستخدم ICA تحليل البيانات مدفوعة خالية من نموذج لاستخراج مناطق الدماغ مرتبطة المكانية والزمان (مكونات المستقلة، والمرحلية) من خلال تحليل خصائص إشارة الدورة الدموية في الدماغ كله 5. في المخطوطة الحالية، وقدم وصفا للأساليب المستخدمة في دراسة نشرت في وقت سابق من حالة الراحة تحليل الربط القائم على البذور من DMN في TLE 7. TLE هو الشكل الأكثر شيوعا من الصرع الكبار. بالإضافة إلى المضبوطات، ويسبب ضعف TLE شبكات الدماغ متعددة بما في ذلك الذاكرة والسلوك والفكر، والوظيفة الحسية 8. وتشكل DMN صنف الدماغي subserving واعية، والإدراك للدولة يستريح. وقد ذكرت وDMN أن تشارك في المضبوطات يرتبط بانخفاض consciousness 9،10. بالإضافة إلى ذلك، قرن آمون هو هيكل الرئيسيين المشاركين في TLE ولقد كان يعتقد أن يكون عنصرا من عناصر DMN. ومع ذلك، فإن التواصل بين PCC إلى تشكيل الحصين أضعف من المكونات مع DMN أخرى، مثل الفص الجبهي الإنسي والقشور الجداري السفلي. هذا يشير إلى أن الحصين هو إما الشبكة الفرعية للDMN أو 11،12 شبكة المتفاعل. هذه القواسم المشتركة بين TLE وDMN رفع احتمال ان يتم تبديل DMN اتصال وظيفية في TLE. هذا التحليل يقارن DMN من الموضوعات مع TLE لضوابط صحية لاكتساب نظرة ثاقبة إشراك DMN في TLE. التواصل بين البذور وضعها في مراكز رئيس DMN - المناطق محور الأمامي والخلفي وقد تم تحليل 12. وضعت البذور في المحور الخلفي يتألف من retrosplenium / precuneus (RSP / PCUN) وكذلك محور الأمامي تتكون من قشرة الفص الجبهي بطني إنسي (vmPFC) في المرضى الذين يعانون من TLE وصحية ضوابط لتحديد الخلفي والأمامي من الشبكات الفرعية DMN.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
	<tbody>
		<tr>
			<td>MRI machine</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Linux workstation with image analysis software installed</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

network analysis of the default mode network using functional connectivity mri in temporal lobe epilepsy

الاتصال ظيفية التصوير بالرنين المغناطيسي (fcMRI) هو أسلوب الرنين المغناطيسي الوظيفي الذي يدرس التواصل بين مناطق المخ المختلفة استنادا إلى ارتباط تقلبات إشارة BOLD مع مرور الوقت. صرع الفص الصدغي (TLE) هو النوع الأكثر شيوعا من الصرع الكبار ويشمل شبكات الدماغ متعددة. وتشارك شبكة الوضع الافتراضي (DMN) في واعية، والإدراك حالة الراحة، ويعتقد أن تتأثر في TLE حيث تسبب نوبات انخفاض الوعي. تم فحص DMN في الصرع باستخدام البذور مقرها fcMRI. واستخدمت المحاور الأمامية والخلفية من DMN كما البذور في هذا التحليل. تظهر النتائج انفصال بين الأمامي والخلفي من محاور DMN في TLE أثناء حالة القاعدية. بالإضافة إلى ذلك، زيادة الربط DMN إلى مناطق أخرى من الدماغ في الجهة اليسرى TLE جنبا إلى جنب مع انخفاض في اتصال الحق TLE يتم الكشف عنها. يوضح تحليل كيف يمكن استخدام fcMRI القائم على البذور لبحث شبكات الدماغي في اضطرابات الدماغ مثل TLE.

ويبين الشكل 1 كشف DMN مع اتصال من البذور الخلفي (RSP / PCUN، والألوان الأحمر والأصفر) والبذور الأمامي (vmPFC، والألوان الزرقاء والخضراء) ويقارن الشبكات وجدت في المجموعات موضوع مختلف (أرقام 1A-C) وبين بعضها البعض، وهي ضوابط صحية لجميع المرضى مقارنة مع TLE (أر...

Watch this Scientific Journal Video about Network Analysis of the Default Mode Network Using Functional Connectivity MRI in Temporal Lobe Epilepsy at JoVE.com

Network Analysis of the Default Mode Network Using Functional Connectivity MRI in Temporal Lobe Epilepsy

ووضع الشبكة الافتراضي (DMN) في صرع الفص الصدغي (TLE) يتم تحليلها في حالة الراحة في الدماغ باستخدام اتصال الوظيفية القائمة على البذور التصوير بالرنين المغناطيسي (fcMRI).

تحليل شبكة من وضع الشبكة الافتراضية باستخدام التصوير بالرنين المغناطيسي الوظيفي الربط في صرع الفص الصدغي

Functional connectivity MRI (fcMRI) is an fMRI method that examines the connectivity of different brain areas based on the correlation of BOLD signal ...

network-analysis-default-mode-network-using-functional-connectivity

Research

JoVE Journal

Medicine

17.8K Views.  Baylor College of Medicine.  ووضع الشبكة الافتراضي (DMN) في صرع الفص الصدغي (TLE) يتم تحليلها في حالة الراحة في الدماغ باستخدام اتصال الوظيفية القائمة على البذور التصوير بالرنين المغناطيسي (fcMRI). 

Video: Network Analysis of the Default Mode Network Using Functional Connectivity MRI in Temporal Lobe Epilepsy

Generation of Subcutaneous and Intrahepatic Human Hepatocellular Carcinoma Xenografts in Immunodeficient Mice

In vivo experimental models of hepatocellular carcinoma (HCC) that recapitulate the human disease provide a valuable platform for research into disease pathophysiology and for the preclinical evaluation of novel therapies. We present a variety of methods to generate subcutaneous or orthotopic human HCC xenografts in immunodeficient mice that could be utilized in a variety of research applications. With a focus on the use of primary tumor tissue from patients undergoing surgical resection as a starting point, we describe the preparation of cell suspensions or tumor fragments for xenografting. We describe specific techniques to xenograft these tissues i) subcutaneously; or ii) intrahepatically, either by direct implantation of tumor cells or fragments into the liver, or indirectly by injection of cells into the mouse spleen. We also describe the use of partial resection of the native mouse liver at the time of xenografting as a strategy to induce a state of active liver regeneration in the recipient mouse that may facilitate the intrahepatic engraftment of primary human tumor cells. The expected results of these techniques are illustrated. The protocols described have been validated using primary human HCC samples and xenografts, which typically perform less robustly than the well-established human HCC cell lines that are widely used and frequently cited in the literature. In comparison with cell lines, we discuss factors which may contribute to the relatively low chance of primary HCC engraftment in xenotransplantation models and comment on technical issues that may influence the kinetics of xenograft growth. We also suggest methods that should be applied to ensure that xenografts obtained accurately resemble parent HCC tissues.

Human tumor xenografts in immunodeficient mice are valuable tools to study cancer biology. Specific protocols to generate subcutaneous and intrahepatic xenografts from human hepatocellular carcinoma cells or tumor fragments are described. Liver regeneration induced by partial hepatectomy in recipient mice is presented as a strategy to facilitate intrahepatic engraftment.

جيل من تحت الجلد والخلايا الكبدية داخل الكبد سرطان Xenografts الإنسان في الفئران العوز المناعي

In  vivo experimental models of hepatocellular carcinoma (HCC) that recapitulate  the human disease provide a valuable platform for research into disease  ...

Developing Neuroimaging Phenotypes of the Default Mode Network in PTSD: Integrating the Resting State, Working Memory, and Structural Connectivity

Complementary structural and functional neuroimaging techniques used to examine the Default Mode Network (DMN) could potentially improve assessments of psychiatric illness severity and provide added validity to the clinical diagnostic process. Recent neuroimaging research suggests that DMN processes may be disrupted in a number of stress-related psychiatric illnesses, such as posttraumatic stress disorder (PTSD).
Although specific DMN functions remain under investigation, it is generally thought to be involved in introspection and self-processing. In healthy individuals it exhibits greatest activity during periods of rest, with less activity, observed as deactivation, during cognitive tasks, e.g., working memory. This network consists of the medial prefrontal cortex, posterior cingulate cortex/precuneus, lateral parietal cortices and medial temporal regions.
Multiple functional and structural imaging approaches have been developed to study the DMN. These have unprecedented potential to further the understanding of the function and dysfunction of this network. Functional approaches, such as the evaluation of resting state connectivity and task-induced deactivation, have excellent potential to identify targeted neurocognitive and neuroaffective (functional) diagnostic markers and may indicate illness severity and prognosis with increased accuracy or specificity. Structural approaches, such as evaluation of morphometry and connectivity, may provide unique markers of etiology and long-term outcomes. Combined, functional and structural methods provide strong multimodal, complementary and synergistic approaches to develop valid DMN-based imaging phenotypes in stress-related psychiatric conditions. This protocol aims to integrate these methods to investigate DMN structure and function in PTSD, relating findings to illness severity and relevant clinical factors.

This protocol describes the complementary neuroimaging techniques of resting state structural connectivity, task-induced deactivation, and structural connectivity analyses to examine the default network in post-traumatic stress disorder. The use of synergistic methods could potentially lead to improved diagnostics and assessments of severity, outcome, and other relevant clinical factors.

تطوير تصوير الأعصاب الظواهر من وضع الشبكة الافتراضية في اضطراب ما بعد الصدمة: إدماج الدولة يستريح، الذاكرة العاملة، والربط الهيكلي

Complementary structural and functional neuroimaging techniques used to examine the Default Mode Network (DMN) could potentially improve assessments of ...

MRI-guided dmPFC-rTMS as a Treatment for Treatment-resistant Major Depressive Disorder

Here we outline the protocol for magnetic resonance imaging (MRI) guided repetitive transcranial magnetic stimulation (rTMS) to the dorsal medial prefrontal cortex (dmPFC) in patients with major depressive disorder (MDD). Technicians used a neuronavigation system to process patient MRIs to generate a 3-dimensional head model. The head model was subsequently used to identify patient-specific stimulatory targets. The dmPFC was stimulated daily for 20 sessions. Stimulation intensity was titrated to address scalp pain associated with rTMS. Weekly assessments were conducted on the patients using the Hamilton Rating Scale for Depression (HamD17) and Beck Depression Index II (BDI-II). Treatment-resistant MDD patients achieved significant improvements on both HAMD and BDI-II. Of note, angled, double-cone coil rTMS at 120% resting motor threshold allows for optimal stimulation of deeper midline prefrontal regions, which results in a possible therapeutic application for MDD. One major limitation of the rTMS field is the heterogeneity of treatment parameters across studies, including duty cycle, number of pulses per session and intensity. Further work should be done to clarify the effect of stimulation parameters on outcome. Future dmPFC-rTMS work should include sham-controlled studies to confirm its clinical efficacy in MDD.

Here we outline the procedure for MRI-guided repetitive transcranial magnetic stimulation to the dorsomedial prefrontal cortex as an experimental treatment for major depressive disorder.

التصوير بالرنين المغناطيسي موجهة dmPFC-rTMS كعلاج للمقاومة للعلاج اضطراب اكتئابي

Here we outline the protocol for magnetic resonance imaging (MRI) guided repetitive transcranial magnetic stimulation (rTMS) to the dorsal medial ...

Network Analysis of Foramen Ovale Electrode Recordings in Drug-resistant Temporal Lobe Epilepsy Patients

Approximately 30% of epilepsy patients are refractory to antiepileptic drugs. In these cases, surgery is the only alternative to eliminate/control seizures. However, a significant minority of patients continues to exhibit post-operative seizures, even in those cases in which the suspected source of seizures has been correctly localized and resected. The protocol presented here combines a clinical procedure routinely employed during the pre-operative evaluation of temporal lobe epilepsy (TLE) patients with a novel technique for network analysis. The method allows for the evaluation of the temporal evolution of mesial network parameters. The bilateral insertion of foramen ovale electrodes (FOE) into the ambient cistern simultaneously records electrocortical activity at several mesial areas in the temporal lobe. Furthermore, network methodology applied to the recorded time series tracks the temporal evolution of the mesial networks both interictally and during the seizures. In this way, the presented protocol offers a unique way to visualize and quantify measures that considers the relationships between several mesial areas instead of a single area.

This protocol describes a procedure to track the evolution of mesial network measures in temporal lobe epilepsy (TLE) patients. It is based on the combination of intracranial recordings with a novel numerical technique for data analysis. Specifically, we present a protocol for network analyses of foramen ovale recordings.

تحليل شبكة الثقبة البيضوية الكهربائي تسجيلات في الفص الصدغي الصرع المرضى المقاوم للأدوية

Approximately 30% of epilepsy patients are refractory to antiepileptic drugs. In these cases, surgery is the only alternative to eliminate/control ...

The Pilocarpine Model of Temporal Lobe Epilepsy and EEG Monitoring Using Radiotelemetry System in Mice

Temporal lobe epilepsy (TLE) is a common neurological disorder in adulthood. For translational studies of chronic epilepsy, pilocarpine-induced status epilepticus (SE) is frequently selected to recapitulate spontaneous recurrent seizures (SRS). Here we present a protocol of SE induction by intraperitoneal (i.p.) injection of pilocarpine and monitoring of chronic recurring seizures in live animals using a wireless telemetry video and electroencephalogram (EEG) system. We demonstrated notable behavioral changes that need attention after pilocarpine injection and their correlation with hippocampal neuronal loss at 7 days and 6 weeks post-pilocarpine. We also describe the experimental procedures of electrode implantation for video and EEG recording, and analysis of the frequency and duration of chronic recurrent seizures. Finally, we discuss the possible reasons why the expected results are not achieved in each case. This provides a basic overview of modeling chronic epilepsy in mice and guidelines for troubleshooting. We believe this protocol can serve as a baseline for suitable models of chronic epilepsy and epileptogenesis.

This manuscript describes a method of inducing status epilepticus by systemic pilocarpine injection and of monitoring spontaneous recurrent seizures in live animals using a wireless telemetry video and electroencephalogram system. This protocol can be utilized for studying the pathophysiologic mechanisms of chronic epilepsy, epileptogenesis, and acute seizures.

نموذج Pilocarpine صرع الفص الصدغي ورصد EEG باستخدام نظام راديوتيليميتري في الفئران

Temporal lobe epilepsy (TLE) is a common neurological disorder in adulthood. For translational studies of chronic epilepsy, pilocarpine-induced status ...

Whole-brain Segmentation and Change-point Analysis of Anatomical Brain MRI&#8212;Application in Premanifest Huntington's Disease

Recent advances in MRI offer a variety of useful markers to identify neurodegenerative diseases. In Huntington&#39;s disease (HD), regional brain atrophy begins many years prior to the motor onset (during the &#34;premanifest&#34; period), but the spatiotemporal pattern of regional atrophy across the brain has not been fully characterized. Here we demonstrate an online cloud-computing platform, &#34;MRICloud&#34;, which provides atlas-based whole-brain segmentation of T1-weighted images at multiple granularity levels, and thereby, enables us to access the regional features of brain anatomy. We then describe a regression model that detects statistically significant inflection points, at which regional brain atrophy starts to be noticeable, i.e. the &#34;change-point&#34;, with respect to a disease progression index. We used the CAG-age product (CAP) score to index the disease progression in HD patients. Change-point analysis of the volumetric measurements from the segmentation pipeline, therefore, provides important information of the order and pattern of structural atrophy across the brain. The paper illustrates the use of these techniques on T1-weighted MRI data of premanifest HD subjects from a large multicenter PREDICT-HD study. This design potentially has wide applications in a range of neurodegenerative diseases to investigate the dynamic changes of brain anatomy.

Whole-brain Segmentation and Change-point Analysis of Anatomical Brain MRI&amp;#8212;Application in Premanifest Huntington&#039;s Disease

This paper describes a statistical model for volumetric MRI data analysis, which identifies the &#34;change-point&#34; when brain atrophy begins in premanifest Huntington&#39;s disease. Whole-brain mapping of the change-points is achieved based on brain volumes obtained using an atlas-based segmentation pipeline of T1-weighted images.

الدماغ كل تجزئة وتحليل التغيير-نقطة من الدماغ التشريحية التصوير بالرنين المغناطيسي – التطبيق في مرض هنتنغتون بريمانيفيست

Recent advances in MRI offer a variety of useful markers to identify neurodegenerative diseases. In Huntington&#39;s disease (HD), regional brain atrophy ...

Harvest of Endothelial Cells from the Balloon Tips of Swan-Ganz Catheters after Right Heart Catheterization

A variety of pathologies lead to pulmonary hypertension (PH), which is defined as a mean pulmonary artery pressure exceeding 25 mmHg at rest. To further diagnose and manage PH, patients undergo repeated right heart catheterizations (RHC) wherein a Swan-Ganz catheter is advanced into a branch of the pulmonary artery and a balloon is inflated to wedge the catheter tip. This article illustrates a protocol whereby pulmonary artery endothelial cells (PAECs) may be harvested from the balloon tips of Swan-Ganz catheters after RHC, and purified with an anti- CD146 affinity column technique to purify putative PAECs. These cells might be used to provide an in situ snapshot of the biological state of the pulmonary vasculature endothelium to complement hemodynamic measurements obtained during RHC. Harvested and purified PAECs may be used for either cell culture or for subsequent analytical assays such as flow cytometery.

This protocol describes the removal and purification of pulmonary artery endothelial cells (PAECs) that adhere to the balloon tips of Swan-Ganz catheters while they are wedged in the pulmonary artery during right heart catheterization and remain adherent to the deflated balloon following removal from the patient's body.

حصاد خلايا بطانية من تلميحات البالون من سوان-غانز القسطرة بعد قسطرة القلب الصحيح

A variety of pathologies lead to pulmonary hypertension (PH), which is defined as a mean pulmonary artery pressure exceeding 25 mmHg at rest. To further ...

Normothermic Ex Vivo Pancreas Perfusion for the Preservation of Pancreas Allografts before Transplantation

Pancreas transplantation (PTx) is a curative treatment for people who live with the burden of a diagnosis of diabetes mellitus (DM). However, due to organ shortages and increasing numbers of patients being listed for PTx, new strategies are needed to increase the number of available grafts for transplantation. 
Static cold storage (SCS) is considered the gold standard for standard criteria organs. However, standard criteria donors (SCD) are becoming scarce and new strategies that can increase the rate of organ acceptance from extended criteria donors (ECD) are urgently needed. 
Normothermic ex vivo perfusion (NEVP) is one of the strategies that has become increasingly popular over the past couple of decades. This preservation method has already been used successfully in other organs (liver, kidneys, and lungs) but has been minimally explored in pancreas transplantation. The few papers that describe the method for pancreas show little success, edema being one of the major issues. The following manuscript describes the successful NEVP method and setup developed by our group to perfuse swine pancreas.

Normothermic Ex Vivo Pancreas Perfusion for the Preservation of Pancreas Allografts before Transplantation

Normothermic ex vivo machine perfusion (NEVP) has scarcely been explored for the preservation of pancreas allografts. We present an innovative preservation technique for pancreas allografts before transplantation.

نضح البنكرياس خارج الجسم الحي للحفاظ على الطعم الخيفي للبنكرياس قبل الزرع

Pancreas transplantation (PTx) is a curative treatment for people who live with the burden of a diagnosis of diabetes mellitus (DM). However, due to organ ...

استكشاف مرض مجرى الهواء المسد في عمليات زرع الرئة

Murine Intrapulmonary Tracheal Transplantation: A Model for Investigating Obliterative Airway Disease After Lung Transplantation

Murine intrapulmonary tracheal transplantation (IPTT) is used as a model of obliterative airway disease (OAD) following lung transplantation. Initially reported by our team, this model has gained use in the study of OAD due to its high technical reproducibility and suitability for investigating immunological behaviors and therapeutic interventions.
In the IPTT model, a rodent tracheal graft is directly inserted into the recipient's lung through the pleura. This model is distinct from the heterotopic tracheal transplantation (HTT) model, wherein grafts are transplanted into subcutaneous or omental sites, and from the orthotopic tracheal transplantation (OTT) model in which the donor trachea replaces the recipient's trachea. 
Successful implementation of the IPTT model requires advanced anesthetic and surgical skills. Anesthetic skills include endotracheal intubation of the recipient, setting appropriate ventilatory parameters, and appropriately timed extubation after recovery from anesthesia. Surgical skills are essential for precise graft placement within the lung and for ensuring effective sealing of the visceral pleura to prevent air leakage and bleeding. In general, the learning process takes approximately 2 months.
In contrast to the HTT and OTT models, in the IPTT model, the allograft airway develops airway obliteration in the relevant lung microenvironment. This allows investigators to study lung-specific immunological and angiogenic processes involved in airway obliteration after lung transplantation. Furthermore, this model is also unique in that it exhibits tertiary lymphoid organs (TLOs), which are also seen in human lung allografts. TLOs are comprised of T and B cell populations and characterized by the presence of high endothelial venules that direct immune cell recruitment; therefore, they are likely to play a crucial role in graft acceptance and rejection. We conclude that the IPTT model is a useful tool for studying intrapulmonary immune and profibrotic pathways involved in the development of airway obliteration in the lung transplant allograft.

تسليط الضوء على المؤلف: التحقيق في العوامل الرئيسية لالتهاب القصيبات المسد بعد زرع الرئة

The murine intrapulmonary tracheal transplantation (IPTT) model is valuable for studying obliterative airway disease (OAD) after lung transplantation. It offers insights into lung-specific immunological and angiogenic behavior in airway obliteration after allotransplantation with high reproducibility. Here, we describe the IPTT procedure and its expected results.

زرع القصبة الهوائية داخل الرغام: نموذج للتحقيق في مرض مجرى الهواء بعد زرع الرئة

Murine intrapulmonary tracheal transplantation (IPTT) is used as a model of obliterative airway disease (OAD) following lung transplantation. Initially ...