מימון למחקר זה מסופק על ידי קרן אפילפסיה של אמריקה, ביילור לרפואת חישובית ואינטגרטיבית מרכז המחקר ביו זרע (CIBR) פרסים גרנט (ZH); NIH-NINDS K23 גרנט NS044936 (JMS); . והקרן לף המשפחה (JMS) רכישת נתונים נעזרה ב: אליזבת פירס (UCLA).

1. נושאים <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> אוכלוסיית המחקר של 36 נושאים כוללת 3 קבוצות: ימין TLE (n = 11), עזב TLE (n = 12), ונבדקים בריאים (n = 13). השג כתב הסכמה מדעת מכל הנושאים. המחקר עוקב אחר הקווים המנחים של אוניברסיטת קליפורניה, לוס אנג&#39;לס (UCLA) מוסדי מועצה לביקורת. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> קבוצות נושא אפילפסיה צריכה להיות חולים שהם מועמדים לכריתת אונה הטמפורלית קדמית כפי שנקבע על ידי ניטור וידאו-EEG, MRI המוח, בבדיקת PET, ובדיקות נוירופסיכולוגיות. חולים צריכים להמשיך ותרופות הרגילות שלהם במהלך סריקת fMRI ולא צריך להיות סרוקים מייד לאחר התקף. ודא שלכל הנבדקים בבדיקות MRI מוח נורמליות וחופשיים ממחלות נוירולוגיות (מלבד אפילפסיה בקבוצות החולה) או משתמשים בתרופות נוירולוגיות. </li></ol> 2. הדמיה <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> השתמש במערכת 3 טסלה MRI להדמיה. השג פרוסות צירי לתמונות תפקודיות באמצעות מתאר לעצמי מישוריים הדרצף ing (EPI) ועבור תמונות אנטומיים באמצעות שיפוע מפונק נזכר רצף (SPGR). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לבצע הדמיה תפקודית באמצעות הפרמטרים הבאים: TR = 2,000 אלפיות שני, TE = 30 אלפיות שני, FOV = 210 מ&quot;מ, מטריצה ​​= 64 x 64, מ&quot;מ עובי פרוס 4, 34 פרוסות. השתמש בפרמטרים הבאים להדמיה מבנית ברזולוציה גבוהה: TR = 20 אלפיות השני, TE = 3 אלפיות שניים, FOV = 256 מ&quot;מ, מטריצה ​​= 256 x 256, עובי פרוס 1 מ&quot;מ, 160 פרוסות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כל פגישת הדמיה צריכה להימשך 20 דקות. שאל את המשתתפים להירגע בעיניים עצומות. לא קלט שמיעתי מיוחד נדרשים. </li></ol> 3. עיבוד מקדים של Data BOLD <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Preprocess את נתוני ה-fMRI באמצעות FSL (ספריית תוכנת fMRIB) גרסת תוכנה 4.1.6 (אוקספורד, בריטניה, www.fmrib.ox.ac.uk / FSL) 13,14. צעדי עיבוד מקדימים צריכים לכלול את הפעולות הבאות: השימוש FSL MCFLIRT להסיר חפץ תנועת ראש 15. השתמש BET FSL להסרת רקמת nonbrain 16 עם BET האופציה-F לקבצי BOLD. זה עוזר F אחד לרוץצעדי ניתוח urther על רקמת המוח בלבד. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בFEAT, המנוהל על ניתוח עיבוד מינימאלי עם הרשמה. בחר &quot;ניתוח ברמה הראשונה&quot; ולשנות את &quot;ניתוח מלא&quot; ל &quot;טרום סטטיסטיקות&quot; משני כפתורים העליונים. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> תחת לשונית טרום נתונים סטטיסטיים, בטל &quot;מיצוי מוח BET&quot; ובחר באפשרות &quot;אף אחד&quot; של &quot;תיקון תנועה&quot; (כמו אלה שכבר עשו לעיל). הירשם תמונות תפקודיות (BOLD) לאנטומיים (SPGR) תמונות, ולאחר מכן ברמה תמונה (משרד תשתיות הלאומית). התוצאה היא הדור של מטריצות שינוי, המשמשים מאוחר יותר במהלך ניתוח לעיוות הזרעים שנבחרו בחלל סטנדרטי לחלל מוחו של הנושא. </li></ol></li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> השתמש במטריצה ​​שנוצרה השינוי (בשם &quot;standard2example_func.mat&quot;) ולהפוך CSF וROIs חומר לבן לחלל BOLD בודד. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> חלץ את סדרת הזמן מCSF וROIs חומר הלבנה באמצעות פקודת fslmeants,באמצעות ההחזר על ההשקעה בחלל נושא האדם כמסכה. לנרמל את סדרת הזמן הופק באמצעות התוכנה &quot;R&quot;. סדרת זמן אלה משמשות כregressors בGLM מאוחר יותר כדי להסיר את אותות artifactual המתאימים מהניתוח. </li></ol></li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> השלב הבא הוא ההסרה של חפצים הקשורים בתנועת נושא. לרגרסיה של הפרמטרים התנועה, להגדיר את הפעולות הבאות בתוך FEAT FSL לפני הפעלתו. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בכרטיסיית נתונים, השתמש תיקן תנועה וקבצים שחולצו מוח כתשומות, הגדר את ערך TR למתאים לבסיס הנתונים שלך. הגדר גבוהה לעבור סינון באמצעות מסנן שניות 100. הסינון לעבור הגבוה יסיר אותות של כל עניין, שיש בם בתדירות נמוכה מאוד. מסנן מעביר נמוך כדי להסיר אותות בתדר גבוהים ייושם מאוחר יותר בשלב 4.1. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בתוך הכרטיסייה טרום נתונים סטטיסטיים, לבחור &quot;ללא&quot; תחת &quot;תיקון תנועה&quot;, כפי שכבר נעשה. בטל &quot;מיצוי מוח BET&quot;, כפי שכבר נעשה. לבצע החלקה המרחביתבאמצעות חצי מרבי ברוחב מלא 5 מ&quot;מ (FWHM). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בכרטיסיית נתונים סטטיסטיים, לסגת הפרמטרים תנועת 6 ונגזרים זמניים שלהם. בחר באפשרות &quot;אף אחד&quot; לפיתול וסמן את &quot;החל סינון זמני.&quot; השתמש בפלט של FSL MCFLIRT לקבל קבצי טקסט של פרמטרים תנועה, שיכול להיות ואז קלט לתוך מודל ניתוח FEAT לסגת אלה בכלליים לינארי דגם (GLM) </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> גם להוסיף CSF ואותות חומר לבנים שמופקים ומנורמלים בשלבים קודמים לGLM. בחר באפשרות &quot;אף אחד&quot; לפיתול, להוסיף נגזר זמני, ולהוריד את הסימון &quot;החל סינון זמני&quot;. </li></ol></li></ol> 4. שיטות סטטיסטי <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> יש להשתמש בשאריות מהעיבוד מקדים שתואר לעיל עבור מתאם מבוסס זרע. צריכים להיות מועברות שאריות אלה ראשון דרך מסנן נמוך לעבור מ0.1 הרץ, אז מושפל על ידי הפחתה הממוצעת, חלוקה בסטיית התקן, ולאחר מכן טיפס על ידי הוספה100. זרעים צריכים להיות מוגדרים בקוטר של 6 מ&quot;מ בחלל הסטנדרטי משרד התשתיות הלאומי באמצעות תוכנת MRICron. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> האחורית והקדמיים צריכים הזרעים מתאימות לקואורדינטות הבאות: (1) RSP / PCUN האזור (x = 2, y = -60, z = 36) ו (2) ventromedial קליפת המוח הקדם חזיתית (vmPFC; x = 3, y = 60, z = -1). מקומות זרעים אלו הוגדרו במסגרת ביקורת בריאה והופכים למרחב הנושא בשלב הבא 17-19. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הזרעים צריכים לאחר מכן להפוך לחלל הפונקציונלי האישי של כל נושא המוח מהחלל משרד התשתיות הלאומי הסטנדרטי. לשם כך, השתמש במטריצת השינוי שנוצרה לעיל (בשם &quot;standard2example_func.mat&quot;) כדי להפוך את הזרע מהחלל סטנדרטי (משרד תשתיות הלאומי) למרחב האישי התפקודי (BOLD). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> השתמש fslmeants הפקודה כדי לחלץ את סדרת הזמן ממושפל בעבר ולשנותם שייר, באמצעות הזרע במרחב נושא האדם כמסכה. לנרמל את סדרת זמן חילוץ באמצעות רךכלי &quot;R&quot;. </li></ol></li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מתאמים חלקיים בין voxels הזרע וכל voxels האחרים במוח צריכים להיות מחושבים בנפרד לכל נושא לכל סיבוב. לשם כך, בתוך GUI FEAT FSL, בחר &quot;ניתוח ברמה הראשונה&quot;, ולאחר מכן &quot;סטטיסטיקה + פוסט סטטיסטיקות&quot;. בכרטיסיית נתונים, יש להשתמש שיורי המושפלים בעבר ולשנותם כקלט לFeat. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> קבע את הפסקת לעבור סינון גבוהה ל -10,000, כשיורים כבר עברו גבוה ב100 שניות. בתוך כרטיסיית הסטטיסטיקות, ביטול בחירה &quot;השתמש prewhitening סרט&quot;, ולהשתמש בסדרת זמן זרע חילוץ ומנורמלת בעבר בGLM. בכרטיסיית הודעה-נתונים סטטיסטיים, לקבוע את סף Z-Stat הרצוי לערך של 2.0. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לפני הפעלת ניתוח קבוצת שילוב ריצות בתוך נושאים, Z של פישר להפוך צריכה להתבצע על הקובץ להתמודד (ניגודיות של אומדני פרמטרים) שהופק מהניתוח מנוהל בעבר המתאם (השלב ​​4.3). fr נתוני רישום עותקאום הספרייה &quot;רג&quot; מניתוח FEAT נעשתה בשלב 3.1 לטווח המתאם של שלב 4.3. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הפעל ניתוח ברמה גבוהה יותר על ידי שילוב של ריצות בכל נושא. לשם כך, בתוך GUI FEAT FSL, בחר &quot;ניתוח ברמה גבוהה&quot;, ולאחר מכן &quot;סטטיסטיקה + פוסט סטטיסטיקות&quot;. בתוך הכרטיסייה &quot;נתונים&quot;, בחר &quot;תשומות הן ספריות FEAT ברמה נמוכה יותר&quot; והזן הריצות של הנושא מצעד 4.4. בתוך הלשונית &quot;הסטטיסטיקות&quot;, לבחור &quot;השפעות מעורבות: OLS פשוט&quot;. הגדר את ההשפעה ממוצעת כמודל; הכנס את הערך של 1 לכל אחד מהריצה של הנושא. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כדי לשלב נתונים על ריצות בין נושאים, ריבועים פחותים רגילים (OLS) יש להשתמש בניתוח מעורב אפקטים פשוטים. לשם כך, בתוך GUI FEAT FSL, בחר &quot;ניתוח ברמה גבוהה יותר&quot;, וגם &quot;סטטיסטיקות + פוסט סטטיסטיקות&quot;. בכרטיסיית נתונים, בחר &quot;תשומות הן ספריות FEAT ברמה נמוכה יותר&quot; והזן פועל בשילוב של נבדקים משלב 4.5. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בתוך כרטיסיית הסטטיסטיקות, בחר &quot;השפעות מעורבות: OLS פשוט&quot; &quot;הגדירו את מודל כ3 קבוצות; הכנס את ערך 1 עבור הקבוצה כל נושא שייך, 0 אחרת. ניתוח קבוצה צריך להיעשות על כל voxel באמצעות ניתוח שונה חד כיווני עם שלוש רמות שתואמות לשלוש קבוצות (מימין TLE, ייתכנו עזב, וקבוצת ביקורת בריאה). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לסף תמונות נתון Z להשתמש אשכול יוצרות סף Z&gt; 2.0 ותיקנו סף אשכול משמעותי של p = 0.05 20. כדי להשיג Z-ערכים נכונים על מפת המתאם, Z של פישר הפוך להפוך צריכה להתבצע על התוצאות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> יש להשוות הניגודים הספציפיים הבאים (1) בקרות TLE תקין&gt;; (2) עזב TLE&gt; פקדים; (3) תקין ייתכנו&gt; עזב TLE; (4) עזב TLE&gt; TLE הנכון; (5) שליטה&gt; תקין TLE; (6) בקרה&gt; עזבה TLE; (7) TLE (מימין בשילוב ושמאל)&gt; שליטה; ו( 7) שליטה&gt; TLE (ימין ושמאל גם יחד). </li></ol>

<ol>
	<li>Biswal, B. B., Yetkin, F. Z., Haughton, V. M., Hyde, J. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Functional+connectivity+in+the+motor+cortex+of+resting+human+brain+using+echo-planar+MRI.">Functional connectivity in the motor cortex of resting human brain using echo-planar MRI.</a> Magn. Reson. Med. 34, 537-541 (1995).</li><li>Fox, M. D., Greicius, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Clinical+applications+of+resting+state+functional+connectivity.">Clinical applications of resting state functional connectivity.</a> Front. Syst. Neurosci. 4, 1-13 (2010).</li><li>Laufs, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Electroencephalographic+signatures+of+attentional+and+cognitive+default+modes+in+spontaneous+brain+activity+fluctuations+at+rest.">Electroencephalographic signatures of attentional and cognitive default modes in spontaneous brain activity fluctuations at rest.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100, 11053-11058 (1073).</li><li>Shmuel, A., Leopold, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neuronal+correlates+of+spontaneous+fluctuations+in+fMRI+signals+in+monkey+visual+cortex:+Implications+for+functional+connectivity+at+rest.">Neuronal correlates of spontaneous fluctuations in fMRI signals in monkey visual cortex: Implications for functional connectivity at rest.</a> Hum. Brain Mapp. 29, 751-761 (2008).</li><li>Margulies, D. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Resting+developments:+a+review+of+fMRI+post-processing+methodologies+for+spontaneous+brain+activity.">Resting developments: a review of fMRI post-processing methodologies for spontaneous brain activity.</a> Magn. Mater. Phys. Biol. 23, 289-307 (2010).</li><li>Biswal, B. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Toward+discovery+science+of+human+brain+function.">Toward discovery science of human brain function.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107, 4734-4739 (2010).</li><li>Haneef, Z., Lenartowicz, A., Yeh, H. J., Engel, J., Stern, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effect+of+lateralized+temporal+lobe+epilepsy+on+the+default+mode+network.">Effect of lateralized temporal lobe epilepsy on the default mode network.</a> Epilepsy Behav. 25, 350-357 (2012).</li><li>Pillai, J. J., Williams, H. T., Faro, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Functional+imaging+in+temporal+lobe+epilepsy.">Functional imaging in temporal lobe epilepsy.</a> Semin. Ultrasound. CT MR. 28, 437-450 (2007).</li><li>Blumenfeld, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Positive+and+negative+network+correlations+in+temporal+lobe+epilepsy.">Positive and negative network correlations in temporal lobe epilepsy.</a> Cereb. Cortex. 14, 892-902 (2004).</li><li>Dupont, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dynamic+perfusion+patterns+in+temporal+lobe+epilepsy.">Dynamic perfusion patterns in temporal lobe epilepsy.</a> Eur. J. Nucl. Med. Imaging. 36, 823-830 (2009).</li><li>Fransson, P., Marrelec, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+precuneus/posterior+cingulate+cortex+plays+a+pivotal+role+in+the+default+mode+network:+Evidence+from+a+partial+correlation+network+analysis.">The precuneus/posterior cingulate cortex plays a pivotal role in the default mode network: Evidence from a partial correlation network analysis.</a> Neuroimage. 42, 1178-1184 (2008).</li><li>Buckner, R. L., Andrews-Hanna, J. R., Schacter, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+brain's+default+network.">The brain's default network.</a> Ann. N. Y. Acad. Sci. 1124, 1-38 (2008).</li><li>Woolrich, M. W., Ripley, B. D., Brady, M., Smith, S. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Temporal+autocorrelation+in+univariate+linear+modeling+of+FMRI+data.">Temporal autocorrelation in univariate linear modeling of FMRI data.</a> Neuroimage. 14, 1370-1386 (2001).</li><li>Forman, S. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Improved+assessment+of+significant+activation+in+functional+magnetic+resonance+imaging+(fMRI):+use+of+a+cluster+size+threshold.">Improved assessment of significant activation in functional magnetic resonance imaging (fMRI): use of a cluster size threshold.</a> Magn. Reson. Med. 33, 636-647 (1995).</li><li>Jenkinson, M., Bannister, P., Brady, M., Smith, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Improved+optimization+for+the+robust+and+accurate+linear+registration+and+motion+correction+of+brain+images.">Improved optimization for the robust and accurate linear registration and motion correction of brain images.</a> Neuroimage. 17, 825-841 (2002).</li><li>Smith, S. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fast+robust+automated+brain+extraction.">Fast robust automated brain extraction.</a> Hum. Brain Mapp. 17, 143-155 (2002).</li><li>Raichle, M. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+default+mode+of+brain+function.">A default mode of brain function.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98, 676-682 (2001).</li><li>Uddin, L. Q., Kelly, A. M., Biswal, B. B., Castellanos, F. X., Milham, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Functional+connectivity+of+default+mode+network+components:+correlation.">Functional connectivity of default mode network components: correlation.</a> Hum. Brain Mapp. 30, 625-637 (2009).</li><li>Singh, K. D., Fawcett, I. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Transient+and+linearly+graded+deactivation+of+the+human+default-mode+network+by+a+visual+detection+task.">Transient and linearly graded deactivation of the human default-mode network by a visual detection task.</a> Neuroimage. 41, 100-112 (2008).</li><li>Worsley, K. J., Evans, A., Marrett, S., Neelin, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+three-dimensional+statistical+analysis+for+CBF+activation+studies+in+human+brain.">A three-dimensional statistical analysis for CBF activation studies in human brain.</a> J. Cereb. Blood Flow Metab. 12, 900-918 (1992).</li><li>Spencer, S. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neural+networks+in+human+epilepsy:+evidence+of+and+implications+for+treatment.">Neural networks in human epilepsy: evidence of and implications for treatment.</a> Epilepsia. 43, 219-227 (2002).</li><li>Greicius, M. D., Srivastava, G., Reiss, A. L., Menon, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Default-mode+network+activity+distinguishes+Alzheimer's+disease+from+healthy+aging:+evidence+from+functional+MRI.">Default-mode network activity distinguishes Alzheimer's disease from healthy aging: evidence from functional MRI.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101, 4637-4642 (2004).</li><li>Kennedy, D. P., Redcay, E., Courchesne, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Failing+to+deactivate:+resting+functional+abnormalities+in+autism.">Failing to deactivate: resting functional abnormalities in autism.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103, 8275-8280 (2006).</li><li>Garrity, A. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Aberrant+&amp;#34;default+mode&amp;#34;+functional+connectivity+in+schizophrenia.">Aberrant &amp;#34;default mode&amp;#34; functional connectivity in schizophrenia.</a> Am. J. Psychiatry. 164, 450-457 (2007).</li><li>Mannell, M. V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Resting+state+and+task-induced+deactivation:+A+methodological+comparison+in+patients+with+schizophrenia+and+healthy+controls.">Resting state and task-induced deactivation: A methodological comparison in patients with schizophrenia and healthy controls.</a> Hum. Brain Mapp. 31, 424-437 (2010).</li><li>Jones, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Age-related+changes+in+the+default+mode+network+are+more+advanced+in+Alzheimer+disease.">Age-related changes in the default mode network are more advanced in Alzheimer disease.</a> Neurology. 77, 1524-1531 (2011).</li><li>Kobayashi, Y., Amaral, D. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Macaque+monkey+retrosplenial+cortex+II.+Cortical+afferents.">Macaque monkey retrosplenial cortex II. Cortical afferents.</a> J. Comp. Neurol. 466, 48-79 (2003).</li><li>Dupont, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dynamic+perfusion+patterns+in+temporal+lobe+epilepsy.">Dynamic perfusion patterns in temporal lobe epilepsy.</a> Eur. J. Nuclear Med. Mol. Imaging. 36, 823-830 (2009).</li><li>Laufs, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Temporal+lobe+interictal+epileptic+discharges+affect+cerebral+activity+in+&#8220;default+mode&#8221;+brain+regions.">Temporal lobe interictal epileptic discharges affect cerebral activity in &#8220;default mode&#8221; brain regions.</a> Hum. Brain Mapp. 28, 1023-1032 (2007).</li><li>Morgan, V. L., Gore, J. C., Abou-Khalil, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Functional+epileptic+network+in+left+mesial+temporal+lobe+epilepsy+detected+using+resting+fMRI.">Functional epileptic network in left mesial temporal lobe epilepsy detected using resting fMRI.</a> Epilepsy Res. 88, 168-178 (2010).</li><li>Gotman, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Generalized+epileptic+discharges+show+thalamocortical+activation+and+suspension+of+the+default+state+of+the+brain.">Generalized epileptic discharges show thalamocortical activation and suspension of the default state of the brain.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102, 15236-15240 (2005).</li><li>Hamandi, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=EEG-fMRI+of+idiopathic+and+secondarily+generalized+epilepsies.">EEG-fMRI of idiopathic and secondarily generalized epilepsies.</a> Neuroimage. 31, 1700-1710 (2006).</li><li>Pittau, F., Grova, C., Moeller, F., Dubeau, F., Gotman, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Patterns+of+altered+functional+connectivity+in+mesial+temporal+lobe+epilepsy.">Patterns of altered functional connectivity in mesial temporal lobe epilepsy.</a> Epilepsia. 53, 1013-1023 (2012).</li><li>Liao, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Default+mode+network+abnormalities+in+mesial+temporal+lobe+epilepsy:+a+study+combining+fMRI+and+DTI.">Default mode network abnormalities in mesial temporal lobe epilepsy: a study combining fMRI and DTI.</a> Hum. Brain Mapp. 32, 883-895 (2011).</li><li>Pereira, F. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Asymmetrical+hippocampal+connectivity+in+mesial+temporal+lobe+epilepsy:+evidence+from+resting+state+fMRI.">Asymmetrical hippocampal connectivity in mesial temporal lobe epilepsy: evidence from resting state fMRI.</a> BMC Neurosci. 11, 1-13 (2010).</li><li>Dupont, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bilateral+hemispheric+alteration+of+memory+processes+in+right+medial+temporal+lobe+epilepsy.">Bilateral hemispheric alteration of memory processes in right medial temporal lobe epilepsy.</a> J. Neurol. Neurosurg. Psychiatr. 73, 478-485 (2002).</li><li>Vlooswijk, M. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Functional+MRI+in+chronic+epilepsy:+associations+with+cognitive+impairment.">Functional MRI in chronic epilepsy: associations with cognitive impairment.</a> Lancet Neurol. 9, 1018-1027 (2010).</li><li>McCormick, C., Quraan, M., Cohn, M., Valiante, T. A., McAndrews, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Default+mode+network+connectivity+indicates+episodic+memory+capacity+in+mesial+temporal+lobe+epilepsy.">Default mode network connectivity indicates episodic memory capacity in mesial temporal lobe epilepsy.</a> Epilepsia. 54, (2013).</li><li>Zhang, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Altered+spontaneous+neuronal+activity+of+the+default-mode+network+in+mesial+temporal+lobe+epilepsy.">Altered spontaneous neuronal activity of the default-mode network in mesial temporal lobe epilepsy.</a> Brain Res. 1323, 152-160 (2010).</li><li>Horovitz, S. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Decoupling+of+the+brain's+default+mode+network+during+deep+sleep.">Decoupling of the brain's default mode network during deep sleep.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106, 11376-11381 (2009).</li><li>Deshpande, G., Kerssens, C., Sebel, P. S., Hu, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Altered+local+coherence+in+the+default+mode+network+due+to+sevoflurane+anesthesia.">Altered local coherence in the default mode network due to sevoflurane anesthesia.</a> Brain Res. 1318, 110-121 (2010).</li></ol>

ד&quot;ר אנגל ממומן על ידי NIH מענקים P01 NS02808, R01 NS33310, וU01 NS42372, יש פטנטים WO 2009/123734A1, וWO 2009/123735A1, מקבל תמלוגים מMedLink, וולטרס Kluwer, בלקוול, וElsevier, וקיבל שכר טרחה מMedtronics , וולטרס Kluwer, ומיטב רופאים. ד&quot;ר שטרן שימש כיועץ בשכר לUCB ולונדבק. ד&quot;ר שטרן הוא עורך MedLink נוירולוגיה, וקיבל תמלוגים מוולטרס Kluwer ומMcGraw-Hill. יש סופרים שנותרו ללא גילויים או ניגודי עניינים להכריז.

הוא חשב אפילפסיה להיות מחלה רשת, וחריגות של הרשתות מעורבות נוכחים במהלך התקפים ובמצב interictal 21. fMRI המבוסס על משימות נעשה שימוש כדי לנתח את הליקויים של השפה וזיכרון ברשתות TLE 8. יש FcMRI יתרונות הגלומים בלימוד DMN 12 כפי שהוא רשת פעילה בעיקר במצב המנוחה. DMN הוא...

פונקציונלי קישוריות ה-MRI (fcMRI) היא גישה אנליטית חדשה יחסית לנתוני ה-fMRI, שמכמת את הקשר בין אזורי מוח השונים המבוסס על הדמיון של רמת חמצון הדם שלהם בסדרה תלויה (BOLD) אות זמן - זה נקרא קישוריות &quot;פונקציונלית&quot;, והוא להבדיל מקישוריות אנטומי המתארת ​​את קיומם של חיבורים פיזיים בין האזורים (למשל, סיבי חומר לבן). ביישום מיוחד של גישה זו, סדרת הזמן נאספות כאשר המשתתף לא עוסקת במשימה או ב&quot; מצב המנוחה &quot;מה שנקרא. למרות שתואר לראשונה בשנת 1995 1, חלה התעניינות עצומה בfcMRI וכתוצאה מכך כ -1,000 פרסומים הקשורים לטכניקה ב2012. יש fcMRI יתרונות מהותיים על פני fMRI המבוסס על משימות ב( 1) שאין משימה ספציפית שיש לבצע, ( 2) שיתוף פעולה היא נושאלא הכרחי, (3) מערכי נתונים יכולים לשמש לשאילתא מספר רשתות שונות, (4) אות טובה יותר יחס רעש היא הווה הנראה בשל הבדלים בהנדסת החשמל במוח המעורב, ו( 5) עקיפה של בלבול הקשורים למשימה 2. כהוכחה של הקונספט שלה, שינויי fcMRI הוכחו להתכתב עם שינויים ב-EEG 3 ופוטנציאל בתחום מקומי 4 במוח. טכניקות של ניתוח fcMRI כוללות טכניקות ROI / מבוסס זרע, ניתוח עצמאי רכיב (רשפ&quot;ת), ניתוח תורת גרפים, ניתוח סיבתיות גריינג&#39;ר, שיטות מקומיות (המשרעת של תנודות בתדירות נמוכות, ניתוח ההומוגניות אזורי), ואחרים 5. אין טכניקה אחת עדיין הוכיחה עליונות ברורה על פני אחר, אם כי השיטות הפופולריות ביותר הן מבוסס זרעים ושיטות ICA 6. המבוסס על הזרעים fcMRI קורלציה תנודות זמניות באות מודגשת מחלק שנבחר מראש של הרשת המשוערת תחת מחקר המכונים &quot;הזרע1; או &quot;אזור של עניין (ROI)&quot; לכל חלקים האחרים של המוח. אזורים במוח מראה התאמת אות BOLD לאזור הזרע נחשבים לסמן חלקים של הרשת מעורבת. לעומת זאת, ICA משתמש בניתוח נתונים מונחה ללא מודל לחלץ אזורים במוח בקורלציה במרחב ובזמן נתונה (עצמאיים רכיבים, מעגלים משולבים) על ידי ניתוח מאפייני אותות המודינמית של המוח כולו 5. בכתב היד הנוכחי, תיאור של שיטות ששמשו במחקר שפורסם בעבר של ניתוח מנוחת מדינה המבוסס על זרעי קישוריות של DMN בTLE מוצג 7. TLE הוא הצורה הנפוצה ביותר של אפילפסיה מבוגר. בנוסף להתקפים, ייתכנו גורם לתפקוד לקוי של רשתות מוח מרובות, כולל זיכרון, התנהגות, מחשבה, ותפקוד חושי 8. DMN היווה ידי אזורים במוח subserving הכרה מודעת,-מנוחת מדינה. DMN כבר דיווח להיות מעורב בהתקפים הקשורים consc מופחתiousness 9,10. בנוסף, ההיפוקמפוס הוא המבנה המרכזי המעורב בTLE וכבר חשב להיות מרכיב של DMN. עם זאת, הקישוריות של PCC להיווצרות בהיפוקמפוס היא חלשה יותר עם רכיבי DMN אחרים, כגון הקדם חזיתית המדיאלי וקליפת מוח הקודקודית נחותה. הדבר מצביע על כך ההיפוקמפוס הוא גם subnetwork של DMN או 11,12 רשת אינטראקציה. משותפים אלה בין TLE וDMN מעלה את האפשרות כי DMN קישוריות תפקודית משתנה בTLE. ניתוח זה משווה DMN של נושאים עם TLE לביקורת בריאה כדי לקבל תובנה המעורבות של DMN בTLE. הקישוריות של זרעים להציב רכזות הראשיים של DMN - אזורי הרכזת הקדמית וגם האחוריים נותחו 12. זרעים הונחו במרכז האחורי המורכב מretrosplenium / precuneus (RSP / PCUN), כמו גם את הרכזת הקדמית המורכבת מקליפת מוח הקדם חזיתית ventromedial (vmPFC) בחולים שיש TLE ובבריא שולט לזהות רשתות המשנה האחורית והקדמית של DMN.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
	<tbody>
		<tr>
			<td>MRI machine</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Linux workstation with image analysis software installed</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

network analysis of the default mode network using functional connectivity mri in temporal lobe epilepsy

קישוריות MRI תפקודית (fcMRI) הוא שיטת fMRI הבוחנת את הקישוריות של אזורי מוח שונים המבוססים על המתאם של תנודות אות BOLD לאורך זמן. Temporal האונה אפילפסיה (TLE) היא הסוג הנפוץ ביותר של אפילפסיה למבוגרים וכוללת רשתות מוח מרובות. ברירת המחדל של רשת המצב (DMN) מעורבת בהכרת מדינה בהכרה, מנוחה, והוא חשב להיות מושפע בייתכנו בי התקפים לגרום לירידת ערך של תודעה. DMN באפילפסיה נבדק באמצעות זרע fcMRI מבוסס. רכזות הקדמית והאחוריות של DMN שימשו כזרעים בניתוח זה. התוצאות מראות ניתוק בין הקדמי ואחוריות של רכזות DMN בייתכנו במדינת הבסיס. בנוסף, קישוריות DMN מוגברת לאזורים אחרים במוח בTLE השמאל יחד עם הירידה בקישוריות בזכות TLE מתגלה. הניתוח מדגים כיצד ניתן להשתמש fcMRI מבוסס זרע לבדיקת רשתות מוחיות בהפרעות במוח כגון TLE.

איור 1 מציג את DMN חשף עם קישוריות מזרע אחורי (RSP / PCUN צבעים, אדום, צהוב) וזרעים קדמי (vmPFC, צבעים כחולים ירוקים) ומשווה את הרשתות שנמצאו בקבוצות הנושא השונות (איורים 1 א-C) ובין זה לזה, ביקורת בריאה כלומר בהשוואה לכל החולים עם TLE (1D דמויות ו1E), ולאחר מ?...

Watch this Scientific Journal Video about Network Analysis of the Default Mode Network Using Functional Connectivity MRI in Temporal Lobe Epilepsy at JoVE.com

Network Analysis of the Default Mode Network Using Functional Connectivity MRI in Temporal Lobe Epilepsy

מצב ברירת המחדל של הרשת (DMN) באונה הטמפורלית אפילפסיה (ייתכנו) הוא ניתח במצב המנוחה של המוח באמצעות קישוריות פונקציונלית המבוסס על זרעי MRI (fcMRI).

ניתוח רשת של ברירת מחדל מצב הרשת באמצעות קישוריות ה-MRI התפקודי באונה הטמפורלית אפילפסיה

Functional connectivity MRI (fcMRI) is an fMRI method that examines the connectivity of different brain areas based on the correlation of BOLD signal ...

network-analysis-default-mode-network-using-functional-connectivity

Research

JoVE Journal

Medicine

17.8K Views.  Baylor College of Medicine.  מצב ברירת המחדל של הרשת (DMN) באונה הטמפורלית אפילפסיה (ייתכנו) הוא ניתח במצב המנוחה של המוח באמצעות קישוריות פונקציונלית המבוסס על זרעי MRI (fcMRI). 

Video: Network Analysis of the Default Mode Network Using Functional Connectivity MRI in Temporal Lobe Epilepsy

Generation of Subcutaneous and Intrahepatic Human Hepatocellular Carcinoma Xenografts in Immunodeficient Mice

In vivo experimental models of hepatocellular carcinoma (HCC) that recapitulate the human disease provide a valuable platform for research into disease pathophysiology and for the preclinical evaluation of novel therapies. We present a variety of methods to generate subcutaneous or orthotopic human HCC xenografts in immunodeficient mice that could be utilized in a variety of research applications. With a focus on the use of primary tumor tissue from patients undergoing surgical resection as a starting point, we describe the preparation of cell suspensions or tumor fragments for xenografting. We describe specific techniques to xenograft these tissues i) subcutaneously; or ii) intrahepatically, either by direct implantation of tumor cells or fragments into the liver, or indirectly by injection of cells into the mouse spleen. We also describe the use of partial resection of the native mouse liver at the time of xenografting as a strategy to induce a state of active liver regeneration in the recipient mouse that may facilitate the intrahepatic engraftment of primary human tumor cells. The expected results of these techniques are illustrated. The protocols described have been validated using primary human HCC samples and xenografts, which typically perform less robustly than the well-established human HCC cell lines that are widely used and frequently cited in the literature. In comparison with cell lines, we discuss factors which may contribute to the relatively low chance of primary HCC engraftment in xenotransplantation models and comment on technical issues that may influence the kinetics of xenograft growth. We also suggest methods that should be applied to ensure that xenografts obtained accurately resemble parent HCC tissues.

Human tumor xenografts in immunodeficient mice are valuable tools to study cancer biology. Specific protocols to generate subcutaneous and intrahepatic xenografts from human hepatocellular carcinoma cells or tumor fragments are described. Liver regeneration induced by partial hepatectomy in recipient mice is presented as a strategy to facilitate intrahepatic engraftment.

דור של תת עורי וintrahepatic אדם xenografts קרצינומה hepatocellular בעכברים עם מערכת חיסון חלשים

In  vivo experimental models of hepatocellular carcinoma (HCC) that recapitulate  the human disease provide a valuable platform for research into disease  ...

Developing Neuroimaging Phenotypes of the Default Mode Network in PTSD: Integrating the Resting State, Working Memory, and Structural Connectivity

Complementary structural and functional neuroimaging techniques used to examine the Default Mode Network (DMN) could potentially improve assessments of psychiatric illness severity and provide added validity to the clinical diagnostic process. Recent neuroimaging research suggests that DMN processes may be disrupted in a number of stress-related psychiatric illnesses, such as posttraumatic stress disorder (PTSD).
Although specific DMN functions remain under investigation, it is generally thought to be involved in introspection and self-processing. In healthy individuals it exhibits greatest activity during periods of rest, with less activity, observed as deactivation, during cognitive tasks, e.g., working memory. This network consists of the medial prefrontal cortex, posterior cingulate cortex/precuneus, lateral parietal cortices and medial temporal regions.
Multiple functional and structural imaging approaches have been developed to study the DMN. These have unprecedented potential to further the understanding of the function and dysfunction of this network. Functional approaches, such as the evaluation of resting state connectivity and task-induced deactivation, have excellent potential to identify targeted neurocognitive and neuroaffective (functional) diagnostic markers and may indicate illness severity and prognosis with increased accuracy or specificity. Structural approaches, such as evaluation of morphometry and connectivity, may provide unique markers of etiology and long-term outcomes. Combined, functional and structural methods provide strong multimodal, complementary and synergistic approaches to develop valid DMN-based imaging phenotypes in stress-related psychiatric conditions. This protocol aims to integrate these methods to investigate DMN structure and function in PTSD, relating findings to illness severity and relevant clinical factors.

This protocol describes the complementary neuroimaging techniques of resting state structural connectivity, task-induced deactivation, and structural connectivity analyses to examine the default network in post-traumatic stress disorder. The use of synergistic methods could potentially lead to improved diagnostics and assessments of severity, outcome, and other relevant clinical factors.

פיתוח הדמייה פנוטיפים של מצב ברירת המחדל של הרשת בPTSD: שילוב מצב המנוחה, זיכרון עבודה, וקישוריות מבנית

Complementary structural and functional neuroimaging techniques used to examine the Default Mode Network (DMN) could potentially improve assessments of ...

MRI-guided dmPFC-rTMS as a Treatment for Treatment-resistant Major Depressive Disorder

Here we outline the protocol for magnetic resonance imaging (MRI) guided repetitive transcranial magnetic stimulation (rTMS) to the dorsal medial prefrontal cortex (dmPFC) in patients with major depressive disorder (MDD). Technicians used a neuronavigation system to process patient MRIs to generate a 3-dimensional head model. The head model was subsequently used to identify patient-specific stimulatory targets. The dmPFC was stimulated daily for 20 sessions. Stimulation intensity was titrated to address scalp pain associated with rTMS. Weekly assessments were conducted on the patients using the Hamilton Rating Scale for Depression (HamD17) and Beck Depression Index II (BDI-II). Treatment-resistant MDD patients achieved significant improvements on both HAMD and BDI-II. Of note, angled, double-cone coil rTMS at 120% resting motor threshold allows for optimal stimulation of deeper midline prefrontal regions, which results in a possible therapeutic application for MDD. One major limitation of the rTMS field is the heterogeneity of treatment parameters across studies, including duty cycle, number of pulses per session and intensity. Further work should be done to clarify the effect of stimulation parameters on outcome. Future dmPFC-rTMS work should include sham-controlled studies to confirm its clinical efficacy in MDD.

Here we outline the procedure for MRI-guided repetitive transcranial magnetic stimulation to the dorsomedial prefrontal cortex as an experimental treatment for major depressive disorder.

MRI מודרך dmPFC-rTMS כטיפול להפרעת דיכאון עמיד לטיפול

Here we outline the protocol for magnetic resonance imaging (MRI) guided repetitive transcranial magnetic stimulation (rTMS) to the dorsal medial ...

Network Analysis of Foramen Ovale Electrode Recordings in Drug-resistant Temporal Lobe Epilepsy Patients

Approximately 30% of epilepsy patients are refractory to antiepileptic drugs. In these cases, surgery is the only alternative to eliminate/control seizures. However, a significant minority of patients continues to exhibit post-operative seizures, even in those cases in which the suspected source of seizures has been correctly localized and resected. The protocol presented here combines a clinical procedure routinely employed during the pre-operative evaluation of temporal lobe epilepsy (TLE) patients with a novel technique for network analysis. The method allows for the evaluation of the temporal evolution of mesial network parameters. The bilateral insertion of foramen ovale electrodes (FOE) into the ambient cistern simultaneously records electrocortical activity at several mesial areas in the temporal lobe. Furthermore, network methodology applied to the recorded time series tracks the temporal evolution of the mesial networks both interictally and during the seizures. In this way, the presented protocol offers a unique way to visualize and quantify measures that considers the relationships between several mesial areas instead of a single area.

This protocol describes a procedure to track the evolution of mesial network measures in temporal lobe epilepsy (TLE) patients. It is based on the combination of intracranial recordings with a novel numerical technique for data analysis. Specifically, we present a protocol for network analyses of foramen ovale recordings.

ניתוח רשת של הקלטות אלקטרודה foramen ovale בחולים עמידים בפני תרופות Temporal Lobe אפילפסיה

Approximately 30% of epilepsy patients are refractory to antiepileptic drugs. In these cases, surgery is the only alternative to eliminate/control ...

The Pilocarpine Model of Temporal Lobe Epilepsy and EEG Monitoring Using Radiotelemetry System in Mice

Temporal lobe epilepsy (TLE) is a common neurological disorder in adulthood. For translational studies of chronic epilepsy, pilocarpine-induced status epilepticus (SE) is frequently selected to recapitulate spontaneous recurrent seizures (SRS). Here we present a protocol of SE induction by intraperitoneal (i.p.) injection of pilocarpine and monitoring of chronic recurring seizures in live animals using a wireless telemetry video and electroencephalogram (EEG) system. We demonstrated notable behavioral changes that need attention after pilocarpine injection and their correlation with hippocampal neuronal loss at 7 days and 6 weeks post-pilocarpine. We also describe the experimental procedures of electrode implantation for video and EEG recording, and analysis of the frequency and duration of chronic recurrent seizures. Finally, we discuss the possible reasons why the expected results are not achieved in each case. This provides a basic overview of modeling chronic epilepsy in mice and guidelines for troubleshooting. We believe this protocol can serve as a baseline for suitable models of chronic epilepsy and epileptogenesis.

This manuscript describes a method of inducing status epilepticus by systemic pilocarpine injection and of monitoring spontaneous recurrent seizures in live animals using a wireless telemetry video and electroencephalogram system. This protocol can be utilized for studying the pathophysiologic mechanisms of chronic epilepsy, epileptogenesis, and acute seizures.

המודל פילוקרפין של אפילפסיה של אונה רקתית EEG ניטור באמצעות מערכת Radiotelemetry בעכברים

Temporal lobe epilepsy (TLE) is a common neurological disorder in adulthood. For translational studies of chronic epilepsy, pilocarpine-induced status ...

Whole-brain Segmentation and Change-point Analysis of Anatomical Brain MRI&#8212;Application in Premanifest Huntington's Disease

Recent advances in MRI offer a variety of useful markers to identify neurodegenerative diseases. In Huntington&#39;s disease (HD), regional brain atrophy begins many years prior to the motor onset (during the &#34;premanifest&#34; period), but the spatiotemporal pattern of regional atrophy across the brain has not been fully characterized. Here we demonstrate an online cloud-computing platform, &#34;MRICloud&#34;, which provides atlas-based whole-brain segmentation of T1-weighted images at multiple granularity levels, and thereby, enables us to access the regional features of brain anatomy. We then describe a regression model that detects statistically significant inflection points, at which regional brain atrophy starts to be noticeable, i.e. the &#34;change-point&#34;, with respect to a disease progression index. We used the CAG-age product (CAP) score to index the disease progression in HD patients. Change-point analysis of the volumetric measurements from the segmentation pipeline, therefore, provides important information of the order and pattern of structural atrophy across the brain. The paper illustrates the use of these techniques on T1-weighted MRI data of premanifest HD subjects from a large multicenter PREDICT-HD study. This design potentially has wide applications in a range of neurodegenerative diseases to investigate the dynamic changes of brain anatomy.

Whole-brain Segmentation and Change-point Analysis of Anatomical Brain MRI&amp;#8212;Application in Premanifest Huntington&#039;s Disease

This paper describes a statistical model for volumetric MRI data analysis, which identifies the &#34;change-point&#34; when brain atrophy begins in premanifest Huntington&#39;s disease. Whole-brain mapping of the change-points is achieved based on brain volumes obtained using an atlas-based segmentation pipeline of T1-weighted images.

מוח-כל פילוח וניתוח נקודת השינוי האנטומי במוח MRI – היישום ב- Premanifest של מחלת הנטינגטון

Recent advances in MRI offer a variety of useful markers to identify neurodegenerative diseases. In Huntington&#39;s disease (HD), regional brain atrophy ...

Harvest of Endothelial Cells from the Balloon Tips of Swan-Ganz Catheters after Right Heart Catheterization

A variety of pathologies lead to pulmonary hypertension (PH), which is defined as a mean pulmonary artery pressure exceeding 25 mmHg at rest. To further diagnose and manage PH, patients undergo repeated right heart catheterizations (RHC) wherein a Swan-Ganz catheter is advanced into a branch of the pulmonary artery and a balloon is inflated to wedge the catheter tip. This article illustrates a protocol whereby pulmonary artery endothelial cells (PAECs) may be harvested from the balloon tips of Swan-Ganz catheters after RHC, and purified with an anti- CD146 affinity column technique to purify putative PAECs. These cells might be used to provide an in situ snapshot of the biological state of the pulmonary vasculature endothelium to complement hemodynamic measurements obtained during RHC. Harvested and purified PAECs may be used for either cell culture or for subsequent analytical assays such as flow cytometery.

This protocol describes the removal and purification of pulmonary artery endothelial cells (PAECs) that adhere to the balloon tips of Swan-Ganz catheters while they are wedged in the pulmonary artery during right heart catheterization and remain adherent to the deflated balloon following removal from the patient's body.

הקציר של תאי אנדותל של קצות בלון קטטר Swan-גנץ לאחר צנתור הלב הימני

A variety of pathologies lead to pulmonary hypertension (PH), which is defined as a mean pulmonary artery pressure exceeding 25 mmHg at rest. To further ...

Normothermic Ex Vivo Pancreas Perfusion for the Preservation of Pancreas Allografts before Transplantation

Pancreas transplantation (PTx) is a curative treatment for people who live with the burden of a diagnosis of diabetes mellitus (DM). However, due to organ shortages and increasing numbers of patients being listed for PTx, new strategies are needed to increase the number of available grafts for transplantation. 
Static cold storage (SCS) is considered the gold standard for standard criteria organs. However, standard criteria donors (SCD) are becoming scarce and new strategies that can increase the rate of organ acceptance from extended criteria donors (ECD) are urgently needed. 
Normothermic ex vivo perfusion (NEVP) is one of the strategies that has become increasingly popular over the past couple of decades. This preservation method has already been used successfully in other organs (liver, kidneys, and lungs) but has been minimally explored in pancreas transplantation. The few papers that describe the method for pancreas show little success, edema being one of the major issues. The following manuscript describes the successful NEVP method and setup developed by our group to perfuse swine pancreas.

Normothermic Ex Vivo Pancreas Perfusion for the Preservation of Pancreas Allografts before Transplantation

Normothermic ex vivo machine perfusion (NEVP) has scarcely been explored for the preservation of pancreas allografts. We present an innovative preservation technique for pancreas allografts before transplantation.

זילוח לבלב Normothermic Ex Vivo לשימור אלושתלי לבלב לפני השתלה

Pancreas transplantation (PTx) is a curative treatment for people who live with the burden of a diagnosis of diabetes mellitus (DM). However, due to organ ...

חקר מחלת דרכי הנשימה בהשתלות ריאה

Murine Intrapulmonary Tracheal Transplantation: A Model for Investigating Obliterative Airway Disease After Lung Transplantation

Murine intrapulmonary tracheal transplantation (IPTT) is used as a model of obliterative airway disease (OAD) following lung transplantation. Initially reported by our team, this model has gained use in the study of OAD due to its high technical reproducibility and suitability for investigating immunological behaviors and therapeutic interventions.
In the IPTT model, a rodent tracheal graft is directly inserted into the recipient's lung through the pleura. This model is distinct from the heterotopic tracheal transplantation (HTT) model, wherein grafts are transplanted into subcutaneous or omental sites, and from the orthotopic tracheal transplantation (OTT) model in which the donor trachea replaces the recipient's trachea. 
Successful implementation of the IPTT model requires advanced anesthetic and surgical skills. Anesthetic skills include endotracheal intubation of the recipient, setting appropriate ventilatory parameters, and appropriately timed extubation after recovery from anesthesia. Surgical skills are essential for precise graft placement within the lung and for ensuring effective sealing of the visceral pleura to prevent air leakage and bleeding. In general, the learning process takes approximately 2 months.
In contrast to the HTT and OTT models, in the IPTT model, the allograft airway develops airway obliteration in the relevant lung microenvironment. This allows investigators to study lung-specific immunological and angiogenic processes involved in airway obliteration after lung transplantation. Furthermore, this model is also unique in that it exhibits tertiary lymphoid organs (TLOs), which are also seen in human lung allografts. TLOs are comprised of T and B cell populations and characterized by the presence of high endothelial venules that direct immune cell recruitment; therefore, they are likely to play a crucial role in graft acceptance and rejection. We conclude that the IPTT model is a useful tool for studying intrapulmonary immune and profibrotic pathways involved in the development of airway obliteration in the lung transplant allograft.

מחבר זרקור: חקירת הגורמים העיקריים של ברונכיוליטיס אובליטרטיבי לאחר השתלת ריאות

The murine intrapulmonary tracheal transplantation (IPTT) model is valuable for studying obliterative airway disease (OAD) after lung transplantation. It offers insights into lung-specific immunological and angiogenic behavior in airway obliteration after allotransplantation with high reproducibility. Here, we describe the IPTT procedure and its expected results.

השתלת קנה נשימה תוך ריאתי: מודל לחקר מחלת דרכי הנשימה לאחר השתלת ריאות

Murine intrapulmonary tracheal transplantation (IPTT) is used as a model of obliterative airway disease (OAD) following lung transplantation. Initially ...