海水采样和收集

摘要

这个视频文件沿海海水样品收集和处理各种下游应用，包括生物量浓度，核酸纯化，细胞丰度，营养和微量气体分析的方法。

摘要

这个视频文件沿海海水样品收集和处理各种下游应用，包括生物量浓度，核酸纯化，细胞丰度，营养和微量气体分析的方法。对于今天的示范样本收集从甲板HMS施德Saanich入口经营。一个A型架，井架与多用途绞车和电缆系统，是结合使用Niskin或GO - FLO水质采样瓶。电导率，温度和深度（CTD）的传感器也可用于样品的底层水的质量。为了尽量减少出气，微量气体样品的采集。然后，营养，水化学，细胞计数确定。最后，水域所收集的生物质过滤。为一个单一的投设置和采集时间是在最大深度215米〜1.5小时。因此，共6小时，一般需要完成这里所描述的收集系列。

研究方案

第1部分：水收集

1. 分配给每个投深渊。
2. 进行采样和当前投收集的总量是确定的深渊。
3. 这是确保的Go - Flo和Niskin瓶是开放的，和被关闭的阀门和spigots。
4. CTD是装上线的底部和入水。
5. 一个最深的深度在投采样瓶先装上线后的CTD​​，它是确保该行已正确安装到支架和螺钉拧。
6. 连接到每个瓶子的使者（最深的除外）前降低。
7. 该生产线是降低第一的深度和未来之间的距离;然后装入另一瓶。应该指出，20L收集过滤深处，12L瓶共2 .75米装载约连续除。
8. 一旦所有的瓶子就行了，行下调至所需深度和2分钟允许通过。
9. 派下来的使者，几分钟被允许通过，以确保所有瓶密切。
10. 该生产线是举步为艰瓶卸载，因为他们到机架。
11. 对于需要20L样本DNA和RNA的深处，两个Niskin瓶收集。一瓶用于样品的化学参数（见下文），而另一个则是carboy倒掉。 RNA是立即从第二Niskin收集。到carboy〜20L最终成交量第一的其余部分也耗尽。对于低分辨率样本只有1L水过滤预留设置为在无菌NALGENE瓶。

第2部分：气体样品收集

1. 如果需要的氧气样本，他们是第一次收集。
2. 一块薄管连接到Niskin / GO - FLO插口和油管的另一端被置于玻璃血清瓶。
3. 血清瓶冲洗3次水样，装到满溢，无气泡存在。
4. 50μL氯化汞（HgCl _2）被添加到的血清瓶的方式，不引入样品气泡。
5. 用胶塞和铝盖轧花的瓶子是密封的，然后储存在​​一个凉爽的冰。

第3部分：营养样品采集

1. 60毫升注射器冲洗，水样（0.2微米）连接线和一些水是通过acrodisc推。
2. 聚乙烯瓶〜10毫升过滤后的水冲洗3次（摇瓶，冲洗时）。
3. 添加到过滤水样的瓶子，约¾充分。
4. 样本存储在凉爽的冰。

第4部分：氨样本采集

1. 样品管冲洗水样。
2. 完全装满水样样品管。
3. 水样5毫升使用10毫升吸管取出的水在管内的其余部分将被丢弃，吸管尖5毫升进样管取代。
4. 铵工作试剂7.5毫升被添加到每个管，一旦所有深度的样本已收集。

第5部分：样本收集细胞枚举

1. 一个标记的前50毫升猎鹰管含有5.4毫升37％的甲醛是充满顶端终浓度为4％。护理是采取不泄漏。

第6部分：硫化氢测量样品的收集

1. 一个标记的前50毫升猎鹰管含20％醋酸锌（以Zn（O ₂ CCH _3）2）充满顶端。护理是采取不泄漏。

第7部分：体积小，收集生物量浓度

1. 1升瓶充满顶端。

第8部分：大体积收集生物量浓度

1. 20公升carboys是充满。

第9部分：代表结果

海水在约12溶解氧样品，32-48气体样品，16营养样品，32铵样品，16个硫化氢样品，16个样本细胞计数，6个20公升carboys，16个1升瓶采样结果的最终结果和4 Sterivex0.22μm的过滤器含有微生物生物量的保存与RNA后面。

讨论

总体而言，是一个有大量这种类型的抽样所需的准备和规划，使预算2天前行，为了有一天得到了清洁一切事后。在一般情况下，不要让盐水接触与蠕动泵或成铝Zarges箱用于运输设备领域。尊重地对待设备，它将很长一段时间来执行。

材料

Material Name	Type	Company	Catalogue Number	Comment
Name	Company	Catalog Number	Comments
20L Carboys		Fisher	02-960-15
3/8" Tygon		Cole Parmer	06429-36
Sterivex filters		Fisher	SVG010RS
Prefilter Housing Unit		AMD	501200
Luer Fitting		Cole Parmer	31507-27
1/4" Tygon tubing		Cole Parmer	06429-24
1/4" Tygon tubing		Cole Parmer	06429-24
1/4" Tygon tubing		Cole Parmer	06429-24
50ml Plastic tubes
Glass Serum Bottles				Glass Sample Collection
Septa and aluminum caps for glass serum bottles
Hand Crimper
20-200ul Pipette and Tips
Glass Tubes				Ammonium Sample Collection
30ml Plastic Bottles				Nutrient Collection
Acrodisc Filters		Millipore
5 ml Tubes				Nitrite Sample Collection
37% Formaldehyde	Reagent			For cell count samples
20% Zinc Acetate	Reagent			For sulfide samples
Mercuric Chloride	Reagent			For gas samples
milliQ water	Reagent
Ammonium Working Reagent	Reagent			Borate buffer, sodium sulfite, orthophaladialdehyde
Sulfanilamide	Reagent			5g into 450ml water and 50ml HCl
N-(1-naphthy)-ethylenediamine dihydrochloride solution	Reagent			0.5g into 500ml water