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在这里,我们描述了一个新的方法来研究蛋白导入叶绿体中分离的压力下。该方法是快速和简单的,并且可以应用于研究的叶绿体蛋白质导入不同胁迫条件的后果,以及相应的调节机制。
叶绿体与在植物中的许多重要的角色,它不仅包括光合作用但许多其它的代谢和信令功能的细胞器。此外,叶绿体是植物对各种非生物胁迫,如盐度和渗透胁迫的关键。叶绿体可含有高达约3000种不同的蛋白质,其中的一些是由它自己的基因组编码。然而,大多数叶绿体蛋白质被编码在细胞核和细胞质合成,并且这些蛋白需要通过translocons在叶绿体被膜导入到叶绿体。最近的研究已经表明,叶绿体蛋白质导入可以通过应力积极调节。为了研究生物化学胁迫条件下蛋白质导入这样的规定,我们制定这里描述为可以很容易地在任何实验室可以实现快速,简单的程序方法。在该方法中,植物在正常conditio生长纳秒,然后暴露于强调在液体培养条件。植物材料被收集,和叶绿体然后通过均化释放。粗匀浆是通过密度梯度离心分离,使完整的叶绿体的隔离。叶绿体收率由计数评估,并叶绿体完整性是在显微镜下检查。该蛋白质导入测定中,纯化的叶绿体与35号放射性标记在体外翻译前体蛋白温育,和时程实验中进行,以使胁迫条件下基因型之间导入率的比较。我们目前使用这种方法,它表明,蛋白质进口的速度进入叶绿体从监管突变渗透胁迫条件下,特别是改变所产生的数据。
叶绿体是存在于植物的绿色组织高度丰富的细胞器。他们是在光合作用中的关键作用,使用光能量将二氧化碳转化为糖,从而支持地球上的1几乎所有的生命过程知名。此外,叶绿体(以及更广泛的家庭称为质体相关的细胞器)起到在植物的许多其他重要的角色,包括氨基酸,脂类,色素的生物合成,和环境信号如重力和病原体挑战的感测。光合作用产生的活性氧(ROS)的作为副产物,这在某些情况下具有有益的作用,但如果过量产生可能导致损害或甚至致死作用。 ROS的生产过剩尤其不利的环境条件提升,因此叶绿体是密切相关的非生物胁迫,如盐度和渗透胁迫2响应。
通道loroplasts具有复杂的结构。每个叶绿体被称为包络线的双膜的外层,它由外和内膜包围。在内部,有另一个被称为类囊体,其中,光合作用的光反应发生膜系统。两个膜系统之间有一个水隔室呼叫基质,这是参与碳固定。叶绿体可含有高达约3000种不同的蛋白质,并且绝大多数这些蛋白质是在前体形式的细胞溶胶合成并需要通过在外壳膜1专用蛋白translocons导入到细胞器。有趣的是,最近的工作已表明,叶绿体蛋白质导入正在积极调节,所以能够在叶绿体蛋白质组施加控制的重要程度。例如,据报道,2015年的进口蛋白可通过丰富的日的直接调控非生物胁迫响应在叶绿体(TOC)的由泛素-蛋白酶体系统3的外被膜ë位子。
使用纯化的叶绿体并在体外合成的前体蛋白质,蛋白质导入可以在体外 4,5重构。因此, 在体外方法可以用于评估不同突变植物6,这一直是该蛋白质导入机械的推定成分的分析和用于发现蛋白质导入及其调节基础的机制的关键方法导入的速率。此外,叶绿体可以进一步分馏或蛋白酶消化, 下列体外进口,其可以促进在叶绿体蛋白质7,8的子细胞器的定位和拓扑研究处理。
为了研究由应激蛋白进口的调控,我们已经修改了常规的叶绿体隔离方法,我们将介绍这里。重要的是,叶绿体从已被生长在琼脂培养基标准Murashige和Skoog(MS)的8天,然后转移到补充有压力源的液体MS培养基中,提供了一个相对短的,受控的应力处理植物中分离。从这样的应力处理的植物中分离的叶绿体的产率和能力与体外蛋白质导入测定3下游兼容。除了叶绿体隔离协议中,我们提出我们的体外蛋白进口,这已被证明是健壮和被广泛使用3,9-12常规方法。
1.拟南芥植物生长和应力处理
2. 通过体外转录制作前体蛋白/翻译
注意:此协议假定使用拟南芥光系统的I亚单位ð前体(pPsaD)为模板/前蛋白,但该方法是与其他兼容。
3.分离叶绿体
4.叶绿体的产量和完备性分析
5.叶绿体蛋白导入
一个例子叶绿体蛋白质导入实验用3时间点示于图1。PSAD是光系统的一个〜18 kD的分量I暴露于基质,具有〜23 kD的16的前体形式。 PSAD在这里为体外蛋白质测定进口选择,因为它的稳态水平是在SP1突变,相对于WT升高,压力条件下,这表明在突变3的进口效率的变化。在SP1突变体携带在叶绿体蛋白质导入机械的重要调节的缺陷-的SP1蛋白3。用于从在正常条件下生长的植物中分离的叶绿体,有在SP1和WT之间PSAD进口无明显差异(数据未显示)3。但是,使用此处描述的方法来评估PSAD导入从渗透分离叶绿体强调植物,检测到明显的差异。虽然我们观察到在用两种基因型一个时间依赖性成熟蛋白质形式的积累,进口的速率是WT叶绿体比SP1叶绿体( 图1),这与我们以前的结果3一致显著降低,揭示在胁迫条件下调节PSAD的叶绿体进口为SP 1蛋白具有重要作用。
图1.蛋白质含量导入利用下渗透胁迫条件。叶绿体从10日龄WT(Col-0中)隔离种植的植物隔离叶绿体和SP1的拟南芥突变体植株胁迫条件下生长传导英寸(200毫米甘露醇) 2天。 ( 一 )进口蛋白使用进行[35 S] -Methionine标记pPsaD并允许通过SDS-PAGE和荧光成像分析之前进行4,8和12分钟。并联,包括在体外 pPsaD 10%的输入控制翻译的蛋白质(IVT)进行了分析。前体(前)和成熟(垫)pPsaD的形式表示,而在两者之间有两个波段的可能对应截断或蛋白水解翻译产品,因为它们的强度没有时间过程(*)过程中更改。 (B)导入的速率比较成从胁迫条件下生长的WT和SP1植物叶绿体中,对应于所述的导入的成熟蛋白质的每个条带的强度进行定量。所有数据都表示为从WT植物叶绿体蛋白进口的后12分钟的金额百分比。 请点击此处查看该图的放大版本。
我们最近发现,叶绿体蛋白质导入可以通过压力,这是叶绿体功能和植物生存3临界积极调节。在这项研究中,监测这些规定,我们修改的叶绿体的分离和体外实验的进口手续,以使胁迫条件下生长的植物的进口能力的评估。结果表明在叶绿体蛋白质导入调节SP1中起重要作用。
常规体外导入测定使用生长标准的MS琼脂培养基6,17,18上的植物。在这里所描述的SP1突变体的情况下,这种传统的检测没有发现在相对蛋白质导入到WT 3的任何差异。但是,当蛋白质导入使用本文所述( 图1)的方法胁迫条件下评估SP1在调节蛋白质导入的作用是清楚地表明。虽然中号唉不可能直接从压力条件测定与来自常规测定法(如在方法采用分别在液体培养在琼脂培养基上生长,植物)获得的那些进行比较导入数据,胁迫和非胁迫条件之间的比较提供的可行将植物所有生长在相同的液体培养基中,有或没有压力。
用琼脂培养基上的应力处理相比,液体培养对于大量需要在体外导入测定植物的治疗更方便。此外,它方便了压力源到所有的植物,这是短期的胁迫处理特别重要的均匀应用。这里介绍的方法已经应用甘露醇使用治疗研究渗透胁迫,但可以很容易地适应范围广等应力;例如,短期盐胁迫和氧化应激,为此,相应的压力可以bË同样通过液体MS培养基中的应用。对于其他类型的应力,我们建议应力的程度,首先优化;过于严重的治疗可能对分离细胞器的产率和/或进口能力的不利影响。
有协议内的几个重要步骤,哪一个应特别注意,详情如下。
为MS培养基的最佳琼脂浓度可以不同(0.6 - 0.9%,重量/体积)取决于制造商。因此,建议在开始实验之前,凭经验优化琼脂浓度。介质不应该这么软的,它坚持在收获步骤(步骤1.9)组织,也不应该是这么辛苦,它抑制植物根系发育。蔗糖浓度,也可根据所使用的植物调节。当具有特别病的突变体的工作,MS培养基补充有2 - 3%(重量/体积)蔗糖可有助于植物生长更好。当应用程序躺在胁迫处理,这是不好的很老厂转移到液体介质( 如 > 14天)。这是因为老厂的较为发达的根transferral过程中更容易损坏。
关于转录/翻译系统,有2个主要系统:基于小麦胚芽,和那些基于兔网织红细胞。这些试剂盒可使用不同的模板,例如线性化质粒,unlinearized质粒或PCR产物。该试剂盒也具体的T3,T7和SP6启动子。需要注意的是,我们在这里建议的试剂盒,是仅适用于PCR产物和T7启动子的使用。然而,不知什么原因,这个系统做了一些放射性preproteins可能无法有效地导入检测工作;在这种情况下,可以考虑尝试小麦胚芽提取物的系统或意味着质粒模板网织红细胞裂解物系统。一个也可改善转录/翻译再结果通过根据制造商的手册修改反应条件的动作。
它开始在清晨叶绿体隔离是很重要的(或在生长室的光周期的早期),以避免叶绿体由于光合作用,从而可以阻碍完整细胞器的隔离内部的淀粉积累。叶绿体分离过程,必须没有任何不必要的延迟快速完成,并分离出叶绿体必须始终保持低温。这是为了减轻针对该分离的叶绿体将逐渐失去其可行性,这是不好的观察。如果使用新解冻CIB或HMS缓冲区时,一定要使用前混合缓冲区,以获得均匀的溶液。对于植物材料的同质化的最佳条件已经凭经验确定,并且如果使用不同的组织匀浆可以变化。
如果不同的植物含有基因型similař叶绿素水平,叶绿素量化可以用来作为一种替代方式进行导入测定之前正常化样品。可以分光光度测定下列中的80%的分离的叶绿体的样品的提取叶绿素(体积/体积)含水丙酮19,20。然而,如果植物的导入率表示不同叶绿素含量( 例如 ,用褪绿表型的突变体)的进行比较,可以使用叶绿体数计数正常化叶绿体样品在导入实验。它是重悬叶绿体在步骤3.11彻底尤为重要。悬浮不足可能会留下叶绿体,这将使它很难准确计算数量的聚集,从而会阻碍正确装载进口的反应。如果严重聚集在显微镜下看到的( 例如 ,聚合> 10叶绿体连接在一起),继续摇冰叶绿体样品,直到骨料ES被除去。这是比较容易悬浮叶绿体中缓冲的一个较小的体积。
要知道,蛋白质导入反应(第5部分)必须以适当的预防措施,因为它们的放射性性质进行是很重要的。必要的预防措施包括:戴着一次性手套,实验服和护目镜,监测和净化工作表面和设备,并在批准的废物容器的所有放射性废物处置。也请记住,正确的渗透压是在导入反应维持叶绿体的完整性至关重要,这主要是由HMS缓冲维持。因为10倍HMS是粘性的,它应首先升温至RT,然后充分混合,并使用切枪头,以确保准确体积的测量的应用。在导入反应,冷中加入甲硫氨酸抑制游离放射性标记的甲硫氨酸掺入无关chloropl通过在温育步骤细胞器翻译AST蛋白,而牛血清白蛋白是用来通过作为蛋白酶的基板,以尽量减少蛋白水解。
Authors have nothing to disclose.
这项工作是由来自生物技术和生物科学研究理事会资助,以支持PJ(BBSRC;授予裁判BB / K018442 / 1)。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Murashige and Skoog basal salt | Melford | M0221 | |
phytoagar | Melford | P1003 | |
2-(N-morpholino) ethane sulfonic acid (MES) | Melford | B2002 | |
triton X-100 | Fisher | BPE151-500 | |
surgical tape (e.g., Micropore, 3M) | 3M | 1530-1 | |
filter paper | Fisher | FB59023 | |
Percoll | Fisher | 10607095 | |
ethylene glycol tetraacetic acid (EGTA) | Sigma | E4378 | |
ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) | Fisher | D/0700/53 | |
4-(2-hydroxyethyl)piperazine-1-ethanesulfonic acid (HEPES) | Melford | B2001 | |
filtration cloth (Miracloth) | Calbiochem | 475855 | |
50 mL centrifuge tube | Fisher | CFT-595-040M | |
250 mL centrifuge bottle | Fisher | CFT-891-V | |
Polytron (e.g., Kinematica PT10-35) | Fisher | 11010070 | |
Polytron probe (e.g., Kinematica PTA20S) | Fisher | 11030083 | |
centrifuge (e.g., Beckman Coulter Avanti JXN-26, for 50 and 250 mL tubes) | Beckman Coulter | B34182 | |
fixed-angle rotor for 250 mL bottles (e.g., JLA-16.250) | Beckman Coulter | 363930 | |
fixed-angle rotor for 50 mL tubes (e.g., JA-25.50) | Beckman Coulter | 363058 | |
swinging-bucket rotor for 50 mL tubes (e.g., JS-13.1) | Beckman Coulter | 346963 | |
radiolabeled [35S] methionine | Perkin Elmer | NEG072002MC | |
rabbit reticulocyte lysate based cell-free translation system (TNT T7 Quick kit for PCR DNA) | Promega | L5540 | |
phase-contrast microscope (e.g., Nikon Eclipse 80i) | Nikon | unavailable | |
haemocytometer (Improved Neubauer BS748 chamber) | Hawksley Technology | AC1000 | 0.1 mm depth, 1/400 mm2 |
cover glasses | VWR | 16004-094 | 22 mm × 22 mm, thickness 0.13-0.17 mm |
1.5 mL microfuge tubes | Sarstedt | 72.690.001 | |
2 mL microfuge tubes | Starlab | S1620-2700 | |
microfuge (e.g., Eppendorf 5415D) | Eppendorf | unavailable | |
Nanodrop 2000 spectrophotometer or similar | Thermo Fisher | SPR-700-310L | |
gluconic acid (potassium salt) | Fisher | 22932-2500 | |
bovine serum albumin (BSA) | Sigma | A7906 | |
MgATP | Sigma | A9187 | |
methionine | Sigma | M6039 | |
bromophenol blue | Fisher | B/P620/44 | |
glycerol | Fisher | G/0650/17 | |
SDS | Fisher | S/5200/53 | |
Tris Base | Melford | B2005 | |
dithiothreitol (DTT) | Melford | MB1015 | |
image analysis software (e.g., Aida Image Analyzer) | Raytest | unavailable |
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