凝胶纯化

Overview

胶纯化用于回收电泳分离的DNA片段。从琼脂糖凝胶中回收DNA包括三个基本步骤:在硅胶柱上进行结合,清洗和洗脱。高盐环境下,DNA会通过盐桥结合到硅胶上,清洗掉不纯的物质后,再用低盐条件破坏这种相互作用从而将DNA洗脱下来。

本短片讲述了常用胶回收的基本步骤,从胶中将DNA带切割出来,溶解胶,用硅胶柱结合并洗脱下纯化的DNA。此外,该短片还讨论了要保证胶回收成功的几个技巧,包括跑胶中用上已知分子量大小的DNA标准样的重要性。

Procedure

胶纯化是用来在琼脂糖凝胶中回收电泳分离的DNA片段的标准步骤。将胶溶解后,让它通过一种特殊的滤膜,这一步骤使得DNA与其他杂质,如盐,游离核苷酸,酶等分离开,从而可以进行下游的应用操作。

从琼脂糖凝胶中回收DNA的基本原理涉及到一系列的结合,清洗和洗脱步骤。当胶完全溶解在溶解缓冲液中后,上样到一个“离心柱”上,它通过离心可使DNA分子特异性的结合到硅胶膜上,而其他的杂质则通过柱子到了收集管。

由于凝胶溶解缓冲液中的高盐浓度,使得DNA可以结合到硅胶上。该缓冲液会破坏膜周围的水合结构,在强阴性的膜和阴性的DNA之间建立一个阳离子盐桥。剩余的杂质则被乙醇清洗去掉。

水或低盐缓冲液加到柱子上,被认为会打断阳离子盐桥而将DNA洗脱下来。这样DNA就从胶中被纯化出来。

胶纯化步骤中的第一步是要制备琼脂糖凝胶和对DNA样品跑电泳。跑胶完成后,在紫外灯下观察DNA片段并通过与分子量标准样进行比较来选择要回收的片段。

如果凝胶未被染色,可通过DNA标准样来大致判断带的位置。当用刀

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Gel PurificationDNA RecoveryAgarose GelElectrophoretic SeparationSpecialized FilterImpuritiesDownstream ApplicationsBindWashEluteSilica filterCentrifugationSolubilizing BufferSalt ConcentrationCation Salt BridgeNegative ChargesEthanol WashElutionPurified DNACasting Agarose GelElectrophoresisUV Light VisualizationMolecular Weight Comparison

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Overview

0:39

Gel Purification: Basic Principles

1:51

The Gel Purification Procedure

4:51

Application

6:04

Summary

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