此方法可以操作和量化细胞如何集体组织。这一点很重要，因为我们可以在体外建模模式，并在体内分离紧密耦合的暗示。该技术需要最少的专业设备，允许在标准生物学实验室中建立，并且它是定量的，因此有可能发现子视觉模式事件。
此方法可以很容易地应用于任何可以出现模式的细胞系统，并发现非随机的分化、增殖和细胞对细胞竞争模式。该方法的主要方法是系统优化新细胞类型的微模式参数。例如，图案大小和形状、矩阵类型和单元格粘附时间。
戴上手套，将一块实验室薄膜放入10厘米见方的培养皿底部。使用 12 毫米孔冲头切割疏水塑料滑梯，以创建 12 毫米左右的盖滑，并将盖滑放在新的 Petri 盘中。使用钳子小心地从盖滑道上取下保护膜。
将照片面罩放在干净稳定的表面上，镀铬侧向上，并在所需芯片设计的位置添加两微升的双蒸馏水滴。轻轻按盖滑到跌落处，将支架放在塑料滑梯的顶部。小心地用夹子固定这个三明治，以保持塑料碎片与照片面罩接触。
将组件放在距离光源约 2 厘米的紫外线臭氧灯中，进行 10 分钟的照明。在照明期结束时，用底部的照片面罩抓住三明治，小心地取下夹子，同时用一只手保持压力，以防止滑轨在拆卸三明治时移动。拆下所有夹子后，拆下支架，注意所有塑料件仍放在面罩上，不粘在支架上，并将双蒸馏水添加到芯片中，轻轻地将芯片从照片面罩中分离。
将光型芯片放在基质沉积室内，向上照明，并将 200 微升涂层溶液添加到每个芯片上。然后，在室内加入一个三厘米的培养皿，里面装满了双蒸馏水，以在四摄氏度的温度下限制蒸发。为了将胚胎细胞播种到芯片上，每次洗涤用两个至少五分钟的新鲜无菌PBS清洗芯片，然后在每个芯片上分配1倍10至第5细胞，其中200微升的细胞培养培养。
然后关闭播种室。孵育一小时，让细胞粘附在芯片上。当细胞连接后，将多井板的井中每孔填充500微升热介质，并使用无菌钳子将芯片转移到单个板孔中。
大力摇动板以分离任何非粘附细胞，并立即用新鲜、温暖的介质更换上一液。然后在显微镜下检查图案是否可见。电镀48小时后，细胞应形成密集的菌落，严格遵循图案的形状。
将芯片留在板中，除足够介质外，除足够介质外，可防止芯片干燥，每井添加至少 500 微升的半形式醛或基于 PFA 的固定溶液。十分钟后，用洗涤液短暂洗井三次，然后用洗涤溶液中稀释的50毫摩尔氯化铵洗涤，以淬火残留PFA交联活性。最后一次洗涤后，用阻解溶液处理样品至少30分钟。
对于芯片培养物的免疫染色，将芯片转移到染色室细胞侧向上，并立即向每个芯片添加100微升的原抗体溶液。在室温下旋转平台上一小时后，如演示的洗涤溶液洗涤芯片三次，并在旋转平台上用适当的二级抗体孵育芯片一小时。在二次抗体孵育结束时，在洗涤溶液中清洗芯片三次，并在显微镜幻灯片上安装芯片，并安装任何标准安装介质的 20 微升。
要对芯片进行成像，请首先调整扫描速度、图像分辨率、帧平均和探测器增益，以确定图像质量和成像时间之间的最佳效果。然后获取每个芯片的图像。获取所有映像后，按照联机可用的文档安装并运行 PickCell，创建新实验，然后将映像导入程序。
使用Nessys 模块根据核包络信号对核进行分段。使用基本分段模块识别阵列的自荧光信号。然后单击"完成"并等待处理所有图像。
若要创建核对象并计算基本对象要素，请从任务栏启动"内部要素"模块，并关闭椭圆体拟合体和曲面提取器面板，使"基本要素"面板保持打开状态。选择"原子核"作为对象类型，然后选择为分段图像提供的前缀。然后单击"计算"并等待处理所有图像。
在此阶段，在导出数据以进行分析之前，需要将其他功能写入原子核。例如，要存储每个核心所属的图像名称，请在弹出式对话中单击"数据"和"新属性"并选择"核"。单击"确定""选择从连接到节点的其他对象收集数据"，然后单击"左面板中的下一步"，选择"图像"，然后双击询问标记以将图像节点设置为路径的目标。
展开"缩减操作"窗格并选择"获取一个"展开可用属性窗格并选择"名称"属性。然后单击"更改"和"下一步"输入图像名称，按 Tab 键，然后单击"完成"，然后将数据导出到选项卡分隔的值文件。为了我们的分析，将导出的数据循环到 R-Script 文件夹的数据文件夹中。
打开我们的工作室"并打开装箱的地图模板 R-Script"，然后将工作目录设置为源文件位置，然后运行脚本生成密度图。在细胞播种后一小时，单个细胞培养的培养片可能不会完全汇合，因为细胞会随着时间而增殖。然而，这些图案将完全殖民，只有很少的细胞外粘合表面。
播种后两小时不清楚的模式表示过程失败。小鼠胚胎干细胞的空间禁闭在大圆盘或环微模式上，引导表达中皮胸毛标记的细胞子群的形态。例如，当小鼠胚胎干细胞生长在大磁盘微模式上时，胸膜阳性细胞被优先限制在局部细胞密度最低的模式的外围。
这种模式是由脑筋奇力的地图证实的。这些数据表明，该方法可以揭示子视觉信息，因为对一个群体的检查不足以识别任何形式的空间组织，以标记利益表达。这一点明显地由重要的殖民地到殖民地的变异性所解释。
该技术还表明，DNA结合抑制剂不存在可检测的模式，这可能表明T型板不是由骨形态遗传蛋白信号驱动的。始终记住盖滑的哪一侧已经消除和涂层，并确保细胞在洗掉多余的细胞之前正确粘附。这种方法允许在指导细胞自我组织方面重要的环境线索的研究，也可以为数学模型提供信息，在基本模式下更好地帮助我们。
