HBX-DDB1相互作用是促进从ccDNA进行HPV转录的关键步骤,因此该协议可能成为发现HPV功能治疗新治疗剂的关键资产。我们的程序很简单,只需很短的时间进行筛选。我混合的相互作用可以实时检测,而无需细胞解解。
此外,筛选质量令人满意,Z等分高。HBX-DDB1 相互作用的抑制导致 Smc5/6 的恢复,从而抑制 HPV 转录、蛋白质表达和 ccDNA 生产。这种新型的抗病毒作用机制可以克服目前HPV疗法的不足。
蛋白质-蛋白质相互作用是药物靶点的重要类别。此处描述的基于分裂-荧光酶的酸,针对病毒和有S蛋白之间的相互作用,可能为开发其他传染病的治疗方法提供一种新的策略。尽管我们的协议简单易懂,但如果没有可视化演示,某些步骤可能很难重现。
因此,可视化演示对理解我们的协议有很大的帮助。首先将5倍10至第5个 HEK293T 细胞播种到 100 毫米的培养皿中,并孵育在 37 摄氏度下过夜。第二天,稀释每微克的HBx-LgBit和SmBit-DDB1表达DNA质粒和DNA凝结缓冲液,总体积为300微升。
加入16微升增强剂溶液,通过涡流混合管一秒钟。在室温下孵育样品三分钟,然后加入60微升转染试剂。旋转管10秒钟,再孵育样品8分钟。
同时,用细胞从培养皿中吸出介质,用五毫升PVS洗涤。吸升PVS并添加7毫升DMEM。将三毫升DMEM加入导管,用转染复合物,上下移液器混合,并将混合物加入细胞中。
然后,在37摄氏度和5%的二氧化碳下孵育细胞10小时。孵育后,取出已花的培养培养,用五毫升PVS清洗细胞。在0.25%的尝试素EDTA的一毫升下取出PVS,并在37摄氏度下孵育细胞以分离它们。
接下来,加入四毫升DMEM,通过多次在细胞层表面移液来分散介质,并将悬浮液转移到管中。将细胞在500次G下离心5分钟,然后丢弃上最后一代,并在PVS的一毫升中重新悬浮细胞颗粒。重复四分法并丢弃上经剂。
然后,用缓冲细胞培养培养剂重新悬浮细胞颗粒,辅以10%FBS,使每毫升100万个细胞的种子密度。将50微升的细胞悬浮液放入96井板的每个井中,将细胞返回37摄氏度的培养箱10小时。当细胞孵育时,将筛选化合物和溶剂稀释至13.5 X浓度。
在每个井中加入12.5微升的发光基板,并在室温下孵育板5分钟。使用发光计测量基线亮度,并在后立即将化合物的五微升和受控的 DMSO 添加到每个井中。每30分钟测量一次发光两小时,然后计算与DMSO处理相比化合物的抑制作用。
测量了基线发光信号,计算信号与背景比大于80。Z 等数值大于 0.5,表明此检测系统可接受高通量筛选。通过将阈值设置为大于 40% 的抑制比与仅 DMSO 控制相比,硝基多糖胺被确定为候选药物。
我们之前通过用这种方法筛选反应性小规模化合物库,将硝氮氧化物确定为HBX-DDB1相互作用的抑制剂。使用硝基多糖酰胺,我们确认抑制HBX-DDB1相互作用,减少病毒转录,以及随后的病毒产品水平。必须事先确定分裂荧光素酶与目标蛋白质融合的最佳部分。
在这种情况下,HPX 在 HPX 的 C 终点与大位融合,DDB1 的末元位将 DDB1 的 DDB1 融合到小位,提供了最佳结果。