Después de instalar Napari y Napari Animation, cree un nuevo archivo de bloc de notas de Jupyter. Para visualizar imágenes y crear películas del cerebro del pez cebra renderizado, cargue la imagen 3D y abra la ventana de Napari. Luego conecte el complemento de animación Napari.
A continuación, establezca los parámetros como el tamaño del vóxel, el mapa de color y los límites de contraste en los controles de capa. Ajuste la configuración del visor en el lienzo. A continuación, para capturar la imagen renderizada, pulse el botón de captura en el asistente de animación.
Para generar películas del volumen renderizado, modifique la configuración del visor y agregue fotogramas clave. Después de agregar fotogramas clave, establezca el número de fotogramas entre fotogramas clave en el asistente para animación. Finalmente, guarde la animación renderizada.
El campo de visión volumétrico de un cerebro larval de pez cebra que expresa GCaMP 7A panneuronal cubrió las regiones cerebrales del cerebro anterior, mesencéfalo y cerebro posterior. Los cuerpos celulares neuronales del bulbo raquídeo, la placa cerebelosa, el tectum óptico, la hebenula y el telencéfalo dorsal eran claramente visibles en todo el cerebro de una larva de pez cebra. En las imágenes funcionales 2D, los cuerpos celulares neuronales eran claramente visibles tanto en el fondo como en la actividad neuronal superpuesta.
