Ce travail a été soutenu par la récompense American Heart Association 13SDG14500046 à PD, une éducation à l&#39;énergie durable et Centre de recherche Prix (Univ. du Tennessee) à PD, et par la formation médicale des médecins et la Fondation de recherche (Université de Tennessee) prix à JM Le auteurs remercient Caroline Leplante (Yale Univ.) pour le protocole pour convertir la levure à fission à sphéroplastes; Eric T. Boder (Univ. du Tennessee) pour l&#39;usage de ses incubateurs, serrant la table centrifugeuse, et Western Blot équipement d&#39;analyse et le Centre pour Biotechnologie de l&#39;Environnement (Univ. Tennessee) pour l&#39;utilisation de leur ultra-centrifugeuse; Günther Daum pour les anticorps de levure (Graz University of Technology, en Autriche.); le personnel du Département d&#39;obstétrique et de gynécologie (Univ. Tennessee Medical Center) pour l&#39;assistance technique .

Une. Isoler gouttelettes lipidiques (de fission) cellules de levure Isolation des gouttelettes de l&#39;organisme modèle populaire en herbe levure Saccharomyces cerevisiae est presque identique au protocole 6 suivant. Différences dans les préparatifs sont notées. Une. Des cellules de levure de croissance <ol><li> Préparer les médias. Combiner 36 g de poudre par litre YE5S de dH 2 O dans des bouteilles en verre ou des fioles de culture. Environ 2 L de médias sera nécessaire. Autoclave les médias à 121 ° C pendant 20 min. Autoriser les médias à refroidir à température ambiante. Pour S. cerevisiae remplacer YE5S avec YPD. </li><li> Placez 10-20 ml de médias YE5S refroidis dans un flacon de 250 ml de culture en utilisant des techniques stériles. Ensemencer le support avec une petite quantité de cellules de levure à partir d&#39;une plaque de gélose à l&#39;aide d&#39;un bâton en bois ou équivalent stérile. Laissez les cellules se développent à la densité optique désirée à 30 ° C. Mesurer la densité optique à unelongueur d&#39;onde de 595 nm en utilisant un spectrophotomètre. </li><li> Placez le support restant dans les 2,8 L flacons. Ne pas utiliser plus de 1 L de support par 2,8 L fiole pour assurer un mélange approprié pendant la croissance des cellules dans l&#39;incubateur sous agitation. Le rendement final de cellules humides devrait être d&#39;environ 10 g de pouvoir acquérir suffisamment de gouttelettes lipidiques pour l&#39;analyse protéomique et lipidomiques. </li><li> Présentez les cellules de l&#39;étape 1.2 dans les 2,8 L flacons ayant chacun 1 L de médias qui ont été préparés à l&#39;étape 1.1. </li><li> Cultiver les cellules à la densité souhaitée à 30 ° C. </li><li> Assurez-vous que les cellules ont des gouttelettes lipidiques. Réserve 1 ml de cellules. Mesurer la densité optique (OD) de l&#39;échantillon. Ajouter 0,1 ml d&#39;une 100 mM de BODIPY 493/503 dans de l&#39;éthanol par DO de cellules de l&#39;échantillon. Placez 3 pi de l&#39;échantillon entre une lame de verre et une lamelle de verre. Visualiser au microscope à fluorescence avec un filtre de GFP (Figure 1A). </li><li> Pellet les cellules de l&#39;étape 1.5 à 4 &amp; #176, C à 3800 g pendant 10 min. Travailler par lots en fonction de la capacité des tubes à centrifuger. </li><li> Verser les médias YE5S et laver les cellules avec un tampon de EMM + 600 mM de sorbitol. Sorbitol fournit un soutien osmotique. </li><li> Transférer les cellules dans un tube de 50 ml à centrifuger stérile et sédimenter les cellules à 4 ° C à 2000 xg pendant 10 min. Retirer le surnageant. Peser les cellules humides. Remettre en suspension les cellules dans 2 ml de (EMM + 600 mM de sorbitol) tampon par gramme de cellules. </li></ol> 2. La conversion des cellules de levure de fission en sphéroplastes et la lyse ultérieure <ol><li> Ajouter 5 mg chacune 1) levure enzyme lytique et 2) de levure de lyse enzymes de Trichoderma harzianum par gramme de cellules humides qui ont été pesés à l&#39;étape 1.9. Pour S. cerevisiae augmenter ces enzymes avec la même quantité de Zymolyase. </li><li> Incuber les cellules à 30 ° C sous agitation à 100 rpm pendant 60 min douce. </li><li> Assurez-vous que les sphéroplastes ont dr lipidesoplets. Par étape de 1,6 (figure 1B) répéter. </li></ol> 3. Centrifugation en gradient de densité <ol><li> Pellet les sphéroplastes par centrifugation à 4 ° C à 2000 x g pendant 5 min. </li><li> Retirez délicatement le surnageant à l&#39;aide d&#39;une pipette de transfert en plastique. </li><li> Resuspendre doucement les sphéroplastes granulés avec de la glace froid 10 mM Tris-HCl, 600 mM de sorbitol, et 200 pM EDTA. Gardez à l&#39;esprit que les sphéroplastes sont très fragiles. </li><li> Pellet les sphéroplastes à nouveau en utilisant les mêmes paramètres que dans l&#39;étape 3.1. Retirer soigneusement le surnageant et remettre en suspension les sphéroplastes à l&#39;aide d&#39;une pipette de transfert en plastique dans 12% de Ficoll, 10 mM Tris-HCl, et 200 uM d&#39;EDTA à une concentration de 2 ml / g de cellules. </li><li> Transférer les sphéroplastes remises en suspension dans un homogénéisateur en verre et homogénéiser doucement sur la glace, 20-30 coups, avec le pilon lâche de l&#39;homogénéisateur en verre. </li><li> Transférer les sphéroplastes lysées à tubes de centrifugation et superposer avec la même volume de 12% de Ficoll, 10 mM Tris-HCl, et 200 uM de tampon EDTA. Choisissez le nombre de tubes de centrifugation à utiliser de sorte que chaque tube est d&#39;environ deux tiers plein. </li><li> Centrifuger à 4 ° C à 100 000 xg pendant 1,5 h dans un rotor SW28 ou équivalent. Autoriser rotor à l&#39;autre à un arrêt (rotor décélération = 0). </li><li> Transférer doucement la couche supérieure flottant blanc (figure 2A), qui contient des gouttelettes, dans un nouveau tube (s) de la centrifugeuse en utilisant soit une pipette ou une pipette Pasteur plié. Ajouter suffisamment de volume de 12% de Ficoll, 10 mM Tris-HCl, et un tampon de 200 uM d&#39;EDTA à l&#39;échantillon de façon à ce qu&#39;il remplisse environ le tiers du tube de centrifugation. </li><li> Ajouter le volume équivalent de 8% de Ficoll, 10 mM Tris-HCl, et un tampon de 200 uM d&#39;EDTA à la partie supérieure de l&#39;échantillon (s) dans le nouveau tube (s) de centrifugation. Après addition de ce tampon les tubes doivent être d&#39;environ deux-tiers. </li><li> Centrifuger à 4 ° C à 100 000 xg pendant 1 h dans un rotor SW28 ou équivalent. Autoriser rotor à l&#39;autre à un arrêt (rOtor décélération = 0). </li><li> Transférer doucement la couche supérieure flottant blanc (figure 2B), qui contiendra les gouttelettes, dans un nouveau tube (s) de la centrifugeuse en utilisant soit une pipette ou une pipette Pasteur plié. Ajouter 600 mM de sorbitol, 8% de Ficoll, 10 mM Tris-HCl, et un tampon de 200 uM d&#39;EDTA à l&#39;échantillon de façon à ce qu&#39;il remplisse environ le tiers du tube de centrifugation. </li><li> Ajouter le volume équivalent de 250 mM de sorbitol, 10 mM Tris-HCl, et un tampon 200 uM d&#39;EDTA à la partie supérieure de l&#39;échantillon (s) dans le nouveau tube (s) de centrifugation. Après addition de ce tampon les tubes doivent être d&#39;environ deux-tiers. </li><li> Centrifuger à 4 ° C à 100 000 xg pendant 1 h dans un rotor SW28 ou équivalent. Autoriser rotor à l&#39;autre à un arrêt (rotor décélération = 0). </li><li> Transférer la couche supérieure blanche (figure 2C), qui doit contenir que les gouttelettes de lipides et les protéines liées, à un tube de dialyse, et on dialyse O / N dans 10 mM de Tris-HCl et 200 uM de tampon EDTA pour éliminer le Ficoll. </li></ol><pclass = &quot;jove_title&quot;&gt; 2. Isoler gouttelettes lipidiques à partir de cellules des villosités placentaire humain Placentas ont été recueillies auprès des femmes en bonne santé avec les grossesses uniques qui subissent une section césarienne avant le début du travail spontané à terme. Sujets ont écrit, le consentement éclairé pour la collecte de leur placenta. La collection et l&#39;utilisation ultérieure, de placentas a été réalisée avec l&#39;approbation de l&#39;Université du Tennessee et de l&#39;Université du Tennessee Graduate School of Medicine à l&#39;Institutional Review Board Knoxville (# 8757B et # 3338, respectivement). Une. Isoler les cellules des villosités placentaires humains Partie 1 du protocole est une modification d&#39;un protocole publié plus tôt par Petroff et al. 26 Préparer les solutions suivantes: <ul><li> De NaCl (1 L): dissoudre 9 g de NaCl (M 58,4 g / mol) dans dH 2 O pour obtenir une solution à 1 L. Stériliser par filtration (0,2; Um membrane). </li><li> Solution saline équilibrée de 10x Hank (10x HBSS) (1 litre): 4 g de KCl (M 74,5 g / mol); 0,6 g KH 2 PO 4 (M 136,086 g / mol), 80 g de NaCl (M 58,44 g / mol); Na 2 HPO 4 (M 141,96 g / mol), 10 g de D-glucose (M 180,16 g / mol). Dissoudre chacun des constituants dans dH 2 O pour donner une solution de 1 litre. Stériliser par filtration (membrane de 0,2 um). </li><li> Un tampon de digestion enzymatique (0,6 ml): combiner 70 ml de HBSS 10x avec 3,3 ml de 7,5% de Na biscarbonate, 17,5 ml 1 M HEPES, et 266,1 ml dH 2 O; stériliser par filtration (membrane de 0,2 um). Stocker à 4 ° C. </li><li> DNase I: juste avant utilisation, ajouter 5 ml de NaCl 0,9% stérile dans un flacon de DNase. Garder sur la glace jusqu&#39;à utilisation ou conserver à -20 ° C. </li></ul><ol><li> Placenta préparation pour la dissection <ol><li> Obtenir un placenta et processus au plus près du moment de la livraison que possible humaine. Utiliser un récipient fermé tel qu&#39;un refroidisseur pour transporter le placenta. Soyez toujours prudent lorsque la mainling matériels biologiques humains. </li><li> Dans la hotte de sécurité biologique, transférer le placenta dans un récipient autoclavable stérile, et laver soigneusement sang de placenta et les membranes à l&#39;aide de NaCl 0,9% stérile (solution saline) solution. Jeter saline sanglante dans le bécher de 1 L de déchets biologiques liquides. </li><li> Placer le placenta sur un champ stérile, avec la surface portant le cordon ombilical vers le haut. Avec tranchants, ciseaux pointes fines et pince retirer les membranes foetales et cordon ombilical. </li><li> Retournez le placenta de sorte que la surface maternelle (surface rugueuse) est orientée vers le haut. Enlever le tissu de la plaque de base sus-jacente, d&#39;environ 3 mm de la surface. </li></ol></li><li> Disséquer le placenta <ol><li> Disséquer un cotylédon à la fois d&#39;éviter la plaque chorionique. Recueillir des villosités dans un bécher de 250 ml avec une solution saline. </li><li> Rincer tissu plusieurs fois dans un bêcher séparé avec 0,9% de NaCl par tourbillonnement avec une pince, à l&#39;aide du bêcher de 1 litre pour les déchets liquides. </li><li> Transférer un cotylédon à la fois pour un plat de 150 mm de Pétri. Tenir avec une pince et gratter le tissu avec une lame de rasoir de navires sur boîte de Pétri. Placez le tissu gratté dans le bécher séparé contenant 0,9% de NaCl. Répétez l&#39;opération pour tous les morceaux de tissu. </li><li> Transfert petite partie du tissu au tamis de dissociation cellulaire et rincer à 0,9% de NaCl largement jusqu&#39;à l&#39;éluat devient clair. Répétez l&#39;opération pour tous les tissus. </li><li> Après rinçage du tissu gratté dans le tamis de dissociation cellulaire, la vider de liquide et l&#39;excès de poids. A ce stade, le tissu peut être conservé O / N dans un ballon d&#39;Erlenmeyer stérile à 4 ° C dans du DMEM. </li></ol></li><li> Digestion enzymatique du tissu placentaire <ol><li> Préparer le mélange de digestion du tissu: 100 ml de tampon de dilution de l&#39;enzyme préchauffé, 1 ml de DNase I et de 20 ml de trypsine à 2,5% 10x. </li><li> Diviser le tissu, le transfert de 60 g de tissu recueilli au total (habituellement d&#39;environ 250 à 300 g) à un ballon de 500 ml d&#39;Erlenmeyer stérile. </li><li&gt; Ajouter le mélange de digestion du tissu à l&#39;erlenmeyer contenant le tissu et incuber à 37 ° C dans un agitateur pendant 45 min à 150 rpm. </li></ol></li><li> La collecte des cellules dissociées <ol><li> Après le premier 45 min dissociation, mettre le ballon de digestion à une inclinaison jusqu&#39;à ce que le tissu s&#39;installe. </li><li> Recueillir le surnageant, en prenant soin de ne pas percevoir les tissus non dissocié. Ajouter une quantité égale de HBSS au surnageant recueilli et les transférer dans des tubes de 15 ml à centrifuger stériles. Pour des portions supplémentaires de tissu non dissocié, répéter la procédure à partir de l&#39;étape 3.2 avec le tissu non dissocié. </li><li> Centrifuger l&#39;homogénat à 4 ° C à 1000 xg pendant 15 min. </li><li> Pour chaque lot, après centrifugation, aspirer le surnageant sans perturber le culot. Les cellules des villosités placentaires sont en majorité dans la partie blanche de la pastille, recouvrant les globules rouges. </li><li> Transférer les cellules des villosités (partie blanche de la pastille) à une sterile 50 ml tube à centrifuger conique et garder sur la glace. </li><li> Après avoir recueilli les cellules à partir de chacune des trois étapes de digestion, un filtrage de la suspension en utilisant un tamis cellulaire en nylon de 100 um inséré dans la partie supérieure de 50 ml d&#39;un tube de centrifugation conique stérile. Si la filtration de la suspension cellulaire ralentit, soulevez sur le filtre pour créer un vide dans le tube. </li><li> Centrifuger à 4 ° C à 1000 xg pendant 10 min. Retirez délicatement le surnageant sans déranger le culot. </li></ol></li></ol> 2. Homogénéisation des cellules des villosités placentaires <ol><li> Avant de commencer le processus d&#39;isolement, de préparer 50 ml de lyse hypotonique moyen (HLM) contenant 20 mM de Tris-HCl, pH 7,4 et EDTA 1 mM. Ajouter inhibiteurs de la protéase à HLM juste avant utilisation et conserver le milieu de la glace. </li><li> Dans le capot de protection biologique, ajouter 4 fois le volume du culot cellulaire d&#39;glacée HLM aux cellules. Doucement et entièrement remettre les cellules par pipetage des cellules jusqu&#39;à-und-bas à l&#39;aide d&#39;une pipette de 10 ml. </li><li> Incuber les cellules en suspension sur de la glace pendant 10 min. </li><li> Transférer les cellules à l&#39;homogénéisateur Dounce, qui devrait se retrouver sur la glace. Homogénéiser lentement les cellules en appliquant 20-25 caresses avec le pilon ample de l&#39;homogénéisateur. </li><li> Centrifuger le lysat de cellules à 4 ° C à 3000 xg pendant 10 min pour éliminer les cellules non rompues, des débris cellulaires et les noyaux. </li><li> Recueillir le surnageant et transférer dans un tube SW28 (ou alternative qui peut être centrifugé à 25 000 xg). Centrifuger à 4 ° C à 25000 g pendant 20 min pour éliminer les mitochondries. </li></ol> 3. Isolement de gouttelettes lipidiques par ultracentrifugation <ol><li> Préparer 50 ml de carbonate de sodium 100 mM (M 106 g / mol) tampon (pH 11,5) et 50 ml de saccharose à 60% (m / m) solution. Ajouter des inhibiteurs de la protéase dans le tampon de carbonate de sodium, juste avant l&#39;utilisation et la maintenir sur de la glace. </li><li> Recueillir le surnageant de l&#39;étape 2.6 dans un tube de centrifugeuse de 50 ml, ajusterà 20% de saccharose et de transfert dans la partie inférieure d&#39;un tube d&#39;ultracentrifugation pour un rotor SW28, ou l&#39;équivalent. Surnageant densité Overlay ajusté avec ~ 10 ml de tampon de carbonate de sodium 100 mM glacé (pH 11,5) et 0,5-1 ml de glace-froid HLM pour remplir le tube. </li><li> Centrifugeuse à 4 ° C à 130 000 g pendant 45 min à l&#39;aide SW28 oscillant seau rotor. Autoriser rotor à l&#39;autre à un arrêt (rotor décélération = 0). </li><li> Recueillir la couche flottante, ajuster à 10% de saccharose et le transférer dans le fond d&#39;un tube d&#39;ultracentrifugation 13,2 ml pour un rotor SW41Ti, ou l&#39;équivalent. Superposition densité ajustée surnageant avec environ 5 ml de tampon carbonate de sodium 100 mM glacé (pH 11,5) et 0,5 ml de HLM glacée. </li><li> Centrifugeuse à 4 ° C à 274 000 g pendant 60 min à l&#39;aide SW41Ti oscillant seau rotor. Autoriser rotor à l&#39;autre à un arrêt (rotor décélération = 0) pour minimiser la perturbation de la couche lipidique de gouttelettes. </li><li> Recueillir soigneusement la couche flottante supérieure (figure 2D) contenantgouttelettes lipidiques avec une pipette de 1 ml et répéter l&#39;étape 3.4. </li><li> Centrifugeuse à 4 ° C à 274 000 g pendant 30 min à l&#39;aide SW41Ti oscillant seau rotor. Autoriser rotor à l&#39;autre à un arrêt (rotor décélération = 0). </li><li> Recueillir soigneusement la couche flottante de couleur blanche supérieure contenant des gouttelettes lipidiques avec une pipette Pasteur plié en trois tubes de 1,5 ml contenant 100 ul HLM. </li></ol> Gouttelettes lipidiques caractérisant fraction (protocoles n ° 1 et 2) La récupération et la pureté de la fraction lipidique de la gouttelette peut être vérifiée par Western Blot combinée avec de la lumière ou par microscopie électronique. En outre, des parties aliquotes après différentes étapes de centrifugation peuvent être recueillis et conservés pour la détermination de l&#39;efficacité de la purification. En Western blot, il est plus approprié pour comparer un volume de la fraction des gouttelettes de lipides qui représente un équivalent de l&#39;ensemble du lysat de cellules que l&#39;on compare les gouttelettes lipidiques à d&#39;autres fractions membranaires de tIl base de la teneur totale en protéines 24.

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L., Dolios, G., Shapiro, L., Wang, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proteomic+analysis+of+proteins+associated+with+lipid+droplets+of+basal+and+lipolytically+stimulated+3T3-L1+adipocytes.">Proteomic analysis of proteins associated with lipid droplets of basal and lipolytically stimulated 3T3-L1 adipocytes.</a> J. Biol. Chem. 279, 46835-46842 (2004).</li><li>Liu, P. S., Ying, Y. S., Zhao, Y. M., Mundy, D. I., Zhu, M. F., Anderson, R. G. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chinese+hamster+ovary+K2+cell+lipid+droplets+appear+to+be+metabolic+organelles+involved+in+membrane+traffic.">Chinese hamster ovary K2 cell lipid droplets appear to be metabolic organelles involved in membrane traffic.</a> J. Biol. Chem. 279, 3787-3792 (2004).</li><li>Fujimoto, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+major+proteins+in+the+lipid+droplet-enriched+fraction+isolated+from+the+human+hepatocyte+cell+line+HuH7.">Identification of major proteins in the lipid droplet-enriched fraction isolated from the human hepatocyte cell line HuH7.</a> Biochim. Biophys. Acta. , 47-59 (2004).</li><li>Sato, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proteomic+profiling+of+lipid+droplet+proteins+in+hepatoma+cell+lines+expressing+hepatitis+C+virus+core+protein.">Proteomic profiling of lipid droplet proteins in hepatoma cell lines expressing hepatitis C virus core protein.</a> J. Biochem. 139, 921-930 (2006).</li><li>Umlauf, E., Csaszar, E., Moertelmaier, M., Schuetz, G. J., Parton, R. G., Prohaska, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Association+of+stomatin+with+lipid+bodies.">Association of stomatin with lipid bodies.</a> J. Biol. Chem. 279, 23699-23709 (2004).</li><li>Zhang, H. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proteome+of+skeletal+muscle+lipid+droplet+reveals+association+with+mitochondria+and+apolipoprotein+A-I.">Proteome of skeletal muscle lipid droplet reveals association with mitochondria and apolipoprotein A-I.</a> J. Proteome Res. 10, 4757-4768 (2011).</li><li>Wu, C. C., Howell, K. E., Neville, M. C., Yates, J. R., McManaman, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proteomics+reveal+a+link+between+the+endoplasmic+reticulum+and+lipid+secretory+mechanisms+in+mammary+epithelial+cells.">Proteomics reveal a link between the endoplasmic reticulum and lipid secretory mechanisms in mammary epithelial cells.</a> Electrophoresis. 21, 3470-3482 (2000).</li><li>Brasaemle, D. L., Wolins, N. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation+of+lipid+droplets+from+cells+by+density+gradient+centrifugation.">Isolation of lipid droplets from cells by density gradient centrifugation.</a> Curr. Protoc. Cell Biol. , 3.15.1-3.15.12 (2005).</li><li>Long, A. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lipid+droplet+de+novo+formation+and+fission+are+linked+to+the+cell+cycle+in+fission+yeast.">Lipid droplet de novo formation and fission are linked to the cell cycle in fission yeast.</a> Traffic. 13, 705-714 (2012).</li><li>Petroff, M. G., Phillips, T. A., Ka, H., Pace, J. L., Hunt, J. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation+and+culture+of+term+human+trophoblast+cells.">Isolation and culture of term human trophoblast cells.</a> Methods Mol. Med. 121, 203-217 (2006).</li><li>Cho, S. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+mouse+Prp19p+as+a+lipid+droplet-associated+protein+and+its+possible+involvement+in+the+biogenesis+of+lipid+droplets.">Identification of mouse Prp19p as a lipid droplet-associated protein and its possible involvement in the biogenesis of lipid droplets.</a> J. Biol. Chem. 282, 2456-2465 (2007).</li><li>Ding, Y. B., Wu, Y. B., Zeng, R., Liao, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proteomic+profiling+of+lipid+droplet-associated+proteins+in+primary+adipocytes+of+normal+and+obese+mouse.">Proteomic profiling of lipid droplet-associated proteins in primary adipocytes of normal and obese mouse.</a> Biochim. Biophys. Acta. 44, 394-406 (2012).</li><li>Jagerstrom, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lipid+droplets+interact+with+mitochondria+using+SNAP23.">Lipid droplets interact with mitochondria using SNAP23.</a> Cell Biol. Int. 33, 934-940 (2009).</li><li>Xu, N. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+FATP1-DGAT2+complex+facilitates+lipid+droplet+expansion+at+the+ER-lipid+droplet+interface.">The FATP1-DGAT2 complex facilitates lipid droplet expansion at the ER-lipid droplet interface.</a> J. Cell Biol. 198, 895-911 (2012).</li><li>Ozeki, S., Cheng, J. L., Tauchi-Sato, K., Hatano, N., Taniguchi, H., Fujimoto, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rab18+localizes+to+lipid+droplets+and+induces+their+close+apposition+to+the+endoplasmic+reticulum-derived+membrane.">Rab18 localizes to lipid droplets and induces their close apposition to the endoplasmic reticulum-derived membrane.</a> J. Cell Sci. 118, 2601-2611 (2005).</li><li>Yang, H. Y., Galea, A., Sytnyk, V., Crossley, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Controlling+the+size+of+lipid+droplets:+lipid+and+protein+factors.">Controlling the size of lipid droplets: lipid and protein factors.</a> Curr. Opin. Cell Biol. 24, 509-516 (2012).</li><li>Jacquier, N., Choudhary, V., Mari, M., Toulmay, A., Reggiori, F., Schneiter, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lipid+droplets+are+functionally+connected+to+the+endoplasmic+reticulum+in+Saccharomyces+cerevisiae.">Lipid droplets are functionally connected to the endoplasmic reticulum in Saccharomyces cerevisiae.</a> J. Cell Sci. 124, 2424-2437 (2011).</li><li>Pu, J., Ha, C. W., Zhang, S., Jung, J. P., Huh, W. K., Liu, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Interactomic+study+on+interaction+between+lipid+droplets+and+mitochondria.">Interactomic study on interaction between lipid droplets and mitochondria.</a> Protein Cell. 2, 487-496 (2011).</li><li>Shaw, C. S., Jones, D. A., Wagemakers, A. J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Network+distribution+of+mitochondria+and+lipid+droplets+in+human+muscle+fibres.">Network distribution of mitochondria and lipid droplets in human muscle fibres.</a> Histochem. Cell Biol. 129, 65-72 (2008).</li><li>Goodman, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+gregarious+lipid+droplet.">The gregarious lipid droplet.</a> J. Biol. Chem. 283, 28005-28009 (2008).</li><li>Brasaemle, D. L., Wolins, N. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Packaging+of+fat:+an+evolving+model+of+lipid+droplet+assembly+and+expansion.">Packaging of fat: an evolving model of lipid droplet assembly and expansion.</a> J. Biol. Chem. 287, 2273-2279 (2012).</li></ol>

Les auteurs déclarent aucun intérêt financier concurrents.

<html> Les étapes critiques de ce protocole Assurez-vous d&#39;être cohérent avec les médias et les densités cellulaires au cours de la croissance des cellules en culture. Gouttelettes lipidiques cellulaires sont uniques que leurs protéines associées dépendent fortement de l&#39;environnement dans lequel les cellules sont cultivées 17. Par conséquent, les médias, dans lequel les cellules sont cultivées et la densité des cellules doiven...

Gouttelettes lipidiques sont des organites cellulaires dynamiques qui servent plusieurs fonctions dans les cellules. Ce sont des concentrateurs de stockage pour les lipides neutres, qui peuvent être converties en énergie ou utilisés pour la synthèse des phospholipides. Les gouttelettes jouent un rôle central dans des conditions physiologiques et pathologiques, y compris l&#39;athérosclérose, l&#39;obésité et les maladies métaboliques, ainsi que les maladies infectieuses 1,2. En outre, ils sont des sources intéressantes pour le biodiesel. Beaucoup d&#39;informations sur les rôles cellulaires de gouttelettes lipidiques a été obtenu à partir de l&#39;analyse protéomique et lipidomiques de gouttelettes purifiés à partir d&#39;organismes de grande envergure 3. Ces organismes ont inclus des bactéries, des levures 4,5 6-11, plantes 12,13, 14 nématodes et les mouches 15,16. Compte tenu de l&#39;intérêt dans le rôle de gouttelettes lipidiques dans les maladies métaboliques de l&#39;homme, les gouttelettes ont également été isolés à partir de cellules animales cultivées et untissus Nimal. Les lignées cellulaires cultivées ont inclus les adipocytes 3T3-L1, 17 ovariennes de hamster chinois (CHO) ou des cellules de K2 18, 19,20 hepatocyes humains et des lignées de cellules epitheliales 21. Les tissus animaux dont les gouttelettes ont été isolées ont inclus la souris muscle squelettique 22, 23 foie et les glandes mammaires 23. Comme mentionné ci-dessus, le but de la plupart des études d&#39;isolement de gouttelettes est d&#39;effectuer l&#39;analyse protéomique sur les facteurs liés lipidomiques et analyse sur le neutre et les phospholipides. Etant donné que les lipides neutres - les plus nombreux composants de gouttelettes lipidiques - sont moins denses que la plupart des autres matériaux cellulaires, l&#39;isolement des gouttelettes a été traditionnellement effectuées en utilisant la centrifugation en gradient de densité. Cette technique est la pièce maîtresse des deux préparations présentées ici. Les techniques précédentes sont réunies et 6,24 modifiés dans une présentation visuelle de la séparation de gouttelettes à partir de cellules de levure de fission cultivéeset les cellules humaines noncultured obtenues à partir de tissu placentaire. L&#39;objectif est de montrer la large applicabilité de cette technique en choisissant deux types de cellules très différentes comme points de départ pour l&#39;isolement des gouttelettes. Cette technique devrait être utile pour ceux qui souhaitent isoler des gouttelettes de la plupart des organismes. Protocole 1 décrit l&#39;isolement de gouttelettes de lipides à partir de la levure à fission, Schizosaccharomyces pombe, qui a été utilisé comme modèle pour l&#39;observation de la formation de gouttelettes au cours de la division cellulaire eucaryote 25. La levure bourgeonnante Saccharomyces cerevisiae a été largement utilisée comme un organisme modèle pour l&#39;étude de la biologie des gouttelettes de lipide. Protocole 1 est applicable à la fois aux organismes et les différences dans les préparatifs sont mis en évidence. Protocole n ° 2 décrit l&#39;isolation de gouttelettes de lipides à partir de cellules villeuses placentaires, qui sont à leur tour obtenu à partir de placentas humains à terme. Lacollection de placentas à terme offre une occasion unique d&#39;obtenir en toute sécurité et éthique 200-250 g de tissu humain facilement disponibles 26, qui contient un nombre important de gouttelettes lipidiques. Ceci est en contraste avec la plupart des travaux d&#39;isolation de gouttelettes de lipides chez les eucaryotes supérieurs, où les gouttelettes provenant de cellules cultivées. Dans ces études, les acides gras sont souvent ajoutés à la culture pour favoriser la synthèse des lipides neutres et donc la croissance de gouttelettes. Ceci est en contraste avec le travail ici où des gouttelettes lipidiques sont formées dans des conditions natives dans le tissu placentaire. Les puretés des fractions lipidiques de gouttelettes sont déterminées par analyse par transfert de Western en utilisant des anticorps marqueurs organelles. Ces deux protocoles donneront lipidiques fractions de gouttelettes qui sont appropriés pour l&#39;analyse protéomique et lipidomiques ultérieure.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="802">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">PROTOCOL #1:&#160;</td>
			<td style="width:163px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">1.Growing yeast cells and converting to spheroplasts</td>
			<td style="width:163px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Edinburgh Minimal Media (EMM)</td>
			<td>Sunrise Science Products</td>
			<td style="width:119px;">2005</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="147">
			<td height="147" style="height:147px;">Yeast extract with 5 supplements (YE5S)</td>
			<td>Sunrise Science Products</td>
			<td style="width:119px;">2011</td>
			<td style="width:167px;">YE5S media with 225 mg/ml of each supplement: adeninie, histidine, leucine, lysine, uracil. The equivalent for budding yeast would be YPD.</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">YPD powder</td>
			<td>Sunrise Science Products</td>
			<td style="width:119px;">1875</td>
			<td>For S. cerevisiae&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Sorbitol</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP439</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Yeast Lytic Enzyme</td>
			<td>MP Biomedicals</td>
			<td style="width:119px;">215352610</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Lysing Enzymes from Trichoderma harzianum</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">L1412</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Zymolayse-20T</td>
			<td>Sunrise Science Products</td>
			<td style="width:119px;">N0766391</td>
			<td>For S. cerevisiae&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">BODIPY 493/503</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td style="width:119px;">D-3922</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Microscope Slides</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">12-544-7</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Microscope Cover Glass</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">12-542-B</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Plastic transfer pipette</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">137115AM</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">1 liter glass bottle</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">250 ml flask</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">2.8 liter flasks</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;"></td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">2. Yeast lipid droplet isolation</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Tris-HCl</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP153</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">EDTA</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP120</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Ficoll 400</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP525</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">12-14k Spectra/Por Dialysis Membrane</td>
			<td>SpectrumLabs</td>
			<td style="width:119px;">132680</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">EDTA-free Protease Inhibitor Cocktail Tablets</td>
			<td>Roche Diagnostics</td>
			<td style="width:119px;">11873580001</td>
			<td>irritant</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Dounce Homogenizer&#160;</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">D9938</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Ultracentrifuge Tubes 25x89mm (for SW28)</td>
			<td>Beckman-Coulter</td>
			<td style="width:119px;">355642</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">12-14k Spectra/Por Dialysis Membrane</td>
			<td>SpectrumLabs</td>
			<td style="width:119px;">132680</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;"></td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">Name of Equipment</td>
			<td style="width:163px;">Company</td>
			<td style="width:119px;">Catalog Number</td>
			<td>Comments/Description</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">&#160;Temperature-controlled shaker</td>
			<td>New Brunswick Scientific</td>
			<td style="width:119px;">C25KC</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Thermo Sorvall Legend XTR centrifuge</td>
			<td>Thermo-Scientific</td>
			<td style="width:119px;">75004521</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Swinging Bucket Centrifuge Rotor</td>
			<td>Thermo-Scientific</td>
			<td style="width:119px;">75003607</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Fiberlite* F15-6x100y Fixed-Angle Rotor</td>
			<td>Thermo-Scientific</td>
			<td style="width:119px;">75003698</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Ultracentrifuge LB-M</td>
			<td>Beckman-Coulter</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">SW28 Ultracentrifuge Rotor</td>
			<td>Beckman-Coulter</td>
			<td style="width:119px;">342204</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;"></td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">PROTOCOL #2&#160;</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">1. Placental villous cells isolation</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Disposable underpads</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">23666062</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">Autoclavable pan (container), 3L</td>
			<td style="width:163px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">1336110</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Fine scissors, sharp-sharp, straight</td>
			<td>Fine science tools</td>
			<td style="width:119px;">1406011</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">London Forceps</td>
			<td>Fine science tools</td>
			<td style="width:119px;">1108002</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Dumont #7b Forceps</td>
			<td>Fine science tools</td>
			<td style="width:119px;">1127020</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Razor blades</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">S65921</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Screen cup for CD-1</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">S1145</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">40 mesh screen&#160;</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">S0770</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Fisherbrand cell stainers 100&#956;m</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">22363549</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">150 mm Petri Dishes</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">NC9054771</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">NaCl</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">S642</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">KCl</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">P333</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">KH2PO4</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">P386</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Na2HPO4</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">S374</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">D-glucose</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">D16</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">HEPES</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP310</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">2.5% trypsin 10x</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td style="width:119px;">15090046</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">DNase I grade II, from bovine pancreas</td>
			<td>Roche Applied Science</td>
			<td style="width:119px;">10104159001</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Sodium bicarbonate solution</td>
			<td>Sigma-aldrich</td>
			<td style="width:119px;">S8761</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">500 ml Erlenmeyer flasks</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">250 ml beakers</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">15 ml centrifuge tubes</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">10 ml serological pipettes</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">50 ml centrifuge tubes</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">DMEM</td>
			<td style="width:163px;">Invitrogen</td>
			<td style="width:119px;">11965084</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">2. Lipid droplets isolation from villous placental cells</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Tris-HCl</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP153</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">EDTA</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP120</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">D-Sucrose</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP220</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Sodium Carbonate&#160;</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP357</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">EDTA-free protease inhibitor cocktail tablets</td>
			<td>Roche Diagnostics</td>
			<td style="width:119px;">11873580001</td>
			<td>irritant</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Dounce homogenizer&#160;</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">D9938</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Ultracentrifuge tubes 25x89mm (for SW28)</td>
			<td>Beckman-Coulter</td>
			<td style="width:119px;">355642</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Ultra-Clear centrifuge tubes 14x89mm (for SW41)</td>
			<td>Beckman-Coulter</td>
			<td style="width:119px;">344059</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Disposable borosilicate glass pasteur pipets</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">1367820C</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;"></td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">Name of Equipment</td>
			<td style="width:163px;">Company</td>
			<td style="width:119px;">Catalog Number</td>
			<td>Comments/Description</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">Biological safety hood&#160;</td>
			<td style="width:163px;">Thermo-Scientific</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Waterbath</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">&#160;Temperature-controlled shaker</td>
			<td>New Brunswick Scientific</td>
			<td style="width:119px;">C25KC</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Thermo Sorvall Legend XTR centrifuge</td>
			<td>Thermo-Scientific</td>
			<td style="width:119px;">75004521</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Swinging Bucket Centrifuge Rotor</td>
			<td>Thermo-Scientific</td>
			<td style="width:119px;">75003607</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Ultracentrifuge LB-M</td>
			<td>Beckman-Coulter</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">SW28 Ultracentrifuge Rotor</td>
			<td>Beckman-Coulter</td>
			<td style="width:119px;">342204</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">SW41 Ti Ultracentrifuge Rotor</td>
			<td>Beckman-Coulter</td>
			<td style="width:119px;">331336</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;"></td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;"></td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">Western blot</td>
			<td style="width:163px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">IRDye 680 Goat Anti-Rabbit IgG</td>
			<td style="width:163px;">LI-COR</td>
			<td style="width:119px;">926-68071</td>
			<td>dilution 1:15000</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">IRDye&#160; 800CW Goat Anti-Mouse IgG</td>
			<td style="width:163px;">LI-COR</td>
			<td style="width:119px;">926-32210</td>
			<td>dilution 1:5000</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">NuPAGE&#174; Novex&#174; 12% Bis-Tris gels</td>
			<td style="width:163px;">Invitrogen</td>
			<td style="width:119px;">NP0341</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">primary antibodies for PROTOCOL #1</td>
			<td style="width:163px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="60">
			<td height="60" style="height:60px;width:353px;">Erg6p</td>
			<td style="width:163px;">gift from Dr. G. Daum</td>
			<td style="width:119px;">Graz University of Technology, Austria</td>
			<td>dilution 1:5000</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">Dpm1p</td>
			<td style="width:163px;">Abcam</td>
			<td style="width:119px;">ab113686</td>
			<td>4 &#956;g/ml</td>
		</tr>
		<tr height="60">
			<td height="60" style="height:60px;width:353px;">Por1p</td>
			<td style="width:163px;">gift from Dr. G. Daum</td>
			<td style="width:119px;">Graz University of Technology, Austria</td>
			<td>dilution 1:5000</td>
		</tr>
		<tr height="60">
			<td height="60" style="height:60px;width:353px;">Pma1p</td>
			<td style="width:163px;">gift from Dr. G. Daum</td>
			<td style="width:119px;">Graz University of Technology, Austria</td>
			<td>dilution 1:10000</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">Vma1p (anti-ATP6V1A)</td>
			<td style="width:163px;">Abcam</td>
			<td style="width:119px;">ab113745</td>
			<td>0.5 &#956;g/ml</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;"></td>
			<td style="width:163px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">primary antibodies for PROTOCOL #2</td>
			<td style="width:163px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">perilipin 2 (anti-ADFP)</td>
			<td style="width:163px;">Abcam</td>
			<td style="width:119px;">ab52355</td>
			<td>2 &#956;g/ml</td>
		</tr>
		<tr height="25">
			<td height="25" style="height:25px;width:353px;">calnexin</td>
			<td style="width:163px;">Cell Signaling technology</td>
			<td style="width:119px;">2679</td>
			<td>dilution 1:1000</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">GM130</td>
			<td style="width:163px;">Biorbyt</td>
			<td style="width:119px;">orb40533</td>
			<td>dilution 1:25</td>
		</tr>
		<tr height="25">
			<td height="25" style="height:25px;width:353px;">COX IV</td>
			<td style="width:163px;">Cell Signaling technology</td>
			<td style="width:119px;">4850</td>
			<td>dilution 1:1000</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">MEK1</td>
			<td style="width:163px;">Biorbyt</td>
			<td style="width:119px;">orb38775</td>
			<td>dilution 1:50</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

isolation of cellular lipid droplets: two purification techniques starting from yeast cells and human placentas

Les gouttelettes lipidiques sont des organites dynamiques qui peuvent être trouvés dans la plupart des cellules procaryotes eucaryotes et certaines. Structurellement, les gouttelettes sont constitués d&#39;un noyau de lipides neutres entouré par une monocouche de phospholipides. Une des techniques les plus utiles pour déterminer les rôles cellulaires de gouttelettes a été identification protéomique des protéines liées, qui peuvent être isolées avec les gouttelettes. Ici, deux méthodes sont décrites pour isoler des gouttelettes lipidiques et leurs protéines liées de deux vastes eucaryotes: fission levure et les cellules des villosités placentaires humains. Bien que les deux techniques présentent des différences, la principale méthode - centrifugation en gradient de densité - est partagée par les deux préparations. Ceci démontre la grande applicabilité des techniques d&#39;isolement de gouttelettes présentés. Dans le premier protocole, des cellules de levure sont transformées en sphéroplastes par digestion enzymatique de leurs parois cellulaires. Les sphéroplastes résultants sont ensuite Gentment lysées dans un homogénéisateur ample. Ficoll est ajouté au lysat de fournir un gradient de densité, et le mélange est centrifugé trois fois. Après la première rotation, les gouttelettes lipidiques sont localisées sur la couche flottante de couleur blanche des tubes de centrifugeuse en même temps que le réticulum endoplasmique (RE), de la membrane plasmique, et vacuoles. Deux tours suivants sont utilisés pour enlever ces trois autres organites. Le résultat est une couche qui ne comporte que des gouttelettes et des protéines liées. Dans le second protocole, les cellules des villosités placentaires sont isolés à partir de placentas à terme humain par digestion enzymatique à la trypsine et la DNase I. Les cellules sont homogénéisées dans un homogénéisateur ample. Étapes à basse vitesse et de centrifugation à vitesse moyenne sont utilisés pour éliminer les cellules intactes, des débris cellulaires, noyaux et des mitochondries. Le saccharose est ajouté à l&#39;homogénat de fournir un gradient de densité et le mélange est centrifugé pour séparer les gouttelettes de lipides à partir de l&#39;autre cellulafractions de r. La pureté des gouttelettes lipidiques dans les deux protocoles est confirmée par analyse Western Blot. Les fractions de gouttelettes de deux préparations sont adaptés à l&#39;analyse protéomique et lipidomiques ultérieure.

Si la centrifugation en gradient de densité a fonctionné comme prévu, la couche flottante doit contenir des gouttelettes lipidiques et être épuisé d&#39;autres organites tout au long de la progression des tours à grande vitesse. Pour le protocole 1, les Western blots ont été réalisées avec des anticorps de marqueurs à des gouttelettes lipidiques (Erg6p), et des organites qui ont été trouvés pour interagir avec les gouttelettes lipidiques dans la levure, ER (Dpm1p), les mitocho...

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Isolation of Cellular Lipid Droplets: Two Purification Techniques Starting from Yeast Cells and Human Placentas

Deux techniques pour isoler des gouttelettes lipidiques cellulaires à partir de 1) cellules de levure et 2) placentas humains sont présentés. L&#39;élément central de ces deux procédés est centrifugation en gradient de densité, où la couche flottante résultant contenant les gouttelettes peuvent être facilement visualisés à l&#39;oeil nu, on extrait et quantifié par analyse par transfert de Western pour la pureté.

Isolation des gouttelettes lipidiques cellulaires: deux techniques de purification partir de cellules de levure et placentas humains

Lipid droplets are dynamic organelles that can be found in most eukaryotic and certain prokaryotic cells. Structurally, the droplets consist of a core of ...

isolation-cellular-lipid-droplets-two-purification-techniques

Research

JoVE Journal

Bioengineering

19.5K vues.  University of Tennessee.  Deux techniques pour isoler des gouttelettes lipidiques cellulaires à partir de 1) cellules de levure et 2) placentas humains sont présentés. L'élément central de ces deux procédés est centrifugation en gradient de densité, où la couche flottante résultant contenant les gouttelettes peuvent être facilement visualisés à l'oeil nu, on extrait et quantifié par analyse par transfert de Western pour la pureté. 

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Rotating Cell Culture Systems for Human Cell Culture: Human Trophoblast Cells as a Model

The field of human trophoblast research aids in understanding the complex environment established during placentation. Due to the nature of these studies, human in vivo experimentation is impossible. A combination of primary cultures, explant cultures and trophoblast cell lines1 support our understanding of invasion of the uterine wall2 and remodeling of uterine spiral arteries3,4 by extravillous trophoblast cells (EVTs), which is required for successful establishment of pregnancy. Despite the wealth of knowledge gleaned from such models, it is accepted that in vitro cell culture models using EVT-like cell lines display altered cellular properties when compared to their in vivo counterparts5,6. Cells cultured in the rotating cell culture system (RCCS) display morphological, phenotypic, and functional properties of EVT-like cell lines that more closely mimic differentiating in utero EVTs, with increased expression of genes mediating invasion (e.g. matrix metalloproteinases (MMPs)) and trophoblast differentiation7,8,9. The Saint Georges Hospital Placental cell Line-4 (SGHPL-4) (kindly donated by Dr. Guy Whitley and Dr. Judith Cartwright) is an EVT-like cell line that was used for testing in the RCCS.
The design of the RCCS culture vessel is based on the principle that organs and tissues function in a three-dimensional (3-D) environment. Due to the dynamic culture conditions in the vessel, including conditions of physiologically relevant shear, cells grown in three dimensions form aggregates based on natural cellular affinities and differentiate into organotypic tissue-like assemblies10,11,12 . The maintenance of a fluid orbit provides a low-shear, low-turbulence environment similar to conditions found in vivo. Sedimentation of the cultured cells is countered by adjusting the rotation speed of the RCCS to ensure a constant free-fall of cells. Gas exchange occurs through a permeable hydrophobic membrane located on the back of the bioreactor. Like their parental tissue in vivo, RCCS-grown cells are able to respond to chemical and molecular gradients in three dimensions (i.e. at their apical, basal, and lateral surfaces) because they are cultured on the surface of porous microcarrier beads. When grown as two-dimensional monolayers on impermeable surfaces like plastic, cells are deprived of this important communication at their basal surface. Consequently, the spatial constraints imposed by the environment profoundly affect how cells sense and decode signals from the surrounding microenvironment, thus implying an important role for the 3-D milieu13.
We have used the RCCS to engineer biologically meaningful 3-D models of various human epithelial tissues7,14,15,16. Indeed, many previous reports have demonstrated that cells cultured in the RCCS can assume physiologically relevant phenotypes that have not been possible with other models10,17-21. In summary, culture in the RCCS represents an easy, reproducible, high-throughput platform that provides large numbers of differentiated cells that are amenable to a variety of experimental manipulations. 
In the following protocol, using EVTs as an example, we clearly describe the steps required to three-dimensionally culture adherent cells in the RCCS.

Traditional, two dimensional cell culture techniques often result in altered characteristics with respect to differentiation markers, cytokines and growth factors. Three-dimensional cell culture in the rotating cell culture system (RCCS) reestablishes expression of many of these factors as shown here with an extravillous trophoblast cell line.

Rotation systèmes de culture cellulaire de la culture de cellules humaines: les cellules du trophoblaste humain comme modèle

The field of human trophoblast research aids in  understanding the complex environment established during placentation. Due to the  nature of these ...

Recherche

Bio-ingénierie

Cellular Lipid Extraction for Targeted Stable Isotope Dilution Liquid Chromatography-Mass Spectrometry Analysis

The metabolism of fatty acids, such as arachidonic acid (AA) and linoleic acid (LA), results in the formation of oxidized bioactive lipids, including numerous stereoisomers1,2. These metabolites can be formed from free or esterified fatty acids. Many of these oxidized metabolites have biological activity and have been implicated in various diseases including cardiovascular and neurodegenerative diseases, asthma, and cancer3-7. Oxidized bioactive lipids can be formed enzymatically or by reactive oxygen species (ROS). Enzymes that metabolize fatty acids include cyclooxygenase (COX), lipoxygenase (LO), and cytochromes P450 (CYPs)1,8. Enzymatic metabolism results in enantioselective formation whereas ROS oxidation results in the racemic formation of products.
While this protocol focuses primarily on the analysis of AA- and some LA-derived bioactive metabolites; it could be easily applied to metabolites of other fatty acids. Bioactive lipids are extracted from cell lysate or media using liquid-liquid (l-l) extraction. At the beginning of the l-l extraction process, stable isotope internal standards are added to account for errors during sample preparation. Stable isotope dilution (SID) also accounts for any differences, such as ion suppression, that metabolites may experience during the mass spectrometry (MS) analysis9. After the extraction, derivatization with an electron capture (EC) reagent, pentafluorylbenzyl bromide (PFB) is employed to increase detection sensitivity10,11. Multiple reaction monitoring (MRM) is used to increase the selectivity of the MS analysis. Before MS analysis, lipids are separated using chiral normal phase high performance liquid chromatography (HPLC). The HPLC conditions are optimized to separate the enantiomers and various stereoisomers of the monitored lipids12. This specific LC-MS method monitors prostaglandins (PGs), isoprostanes (isoPs), hydroxyeicosatetraenoic acids (HETEs), hydroxyoctadecadienoic acids (HODEs), oxoeicosatetraenoic acids (oxoETEs) and oxooctadecadienoic acids (oxoODEs); however, the HPLC and MS parameters can be optimized to include any fatty acid metabolites13.
Most of the currently available bioanalytical methods do not take into account the separate quantification of enantiomers. This is extremely important when trying to deduce whether or not the metabolites were formed enzymatically or by ROS. Additionally, the ratios of the enantiomers may provide evidence for a specific enzymatic pathway of formation. The use of SID allows for accurate quantification of metabolites and accounts for any sample loss during preparation as well as the differences experienced during ionization. Using the PFB electron capture reagent increases the sensitivity of detection by two orders of magnitude over conventional APCI methods. Overall, this method, SID-LC-EC-atmospheric pressure chemical ionization APCI-MRM/MS, is one of the most sensitive, selective, and accurate methods of quantification for bioactive lipids.

This protocol will demonstrate the extraction and analysis of free and esterified bioactive fatty acids from cells. Fatty acids are accurately quantified using stable isotope dilution, chiral liquid chromatography, electron capture atmospheric chemical ionization multiple reaction monitoring mass spectrometry (SID-LC-ECAPCI-MRM/MS).

L&#39;extraction des lipides cellulaires pour ciblées dilution isotopique stable analyse de spectrométrie de masse chromatographie liquide-

The metabolism of fatty acids, such as arachidonic acid (AA) and linoleic acid (LA), results in the formation of oxidized bioactive lipids, including ...

Development, Expansion, and In vivo Monitoring of Human NK Cells from Human Embryonic Stem Cells (hESCs) and Induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs)

We present a method for deriving natural killer (NK) cells from undifferentiated hESCs and iPSCs using a feeder-free approach. This method gives rise to high levels of NK cells after 4 weeks culture and can undergo further 2-log expansion with artificial antigen presenting cells. hESC- and iPSC-derived NK cells developed in this system have a mature phenotype and function. The production of large numbers of genetically modifiable NK cells is applicable for both basic mechanistic as well as anti-tumor studies. Expression of firefly luciferase in hESC-derived NK cells allows a non-invasive approach to follow NK cell engraftment, distribution, and function. We also describe a dual-imaging scheme that allows separate monitoring of two different cell populations to more distinctly characterize their interactions in vivo. This method of derivation, expansion, and dual in vivo imaging provides a reliable approach for producing NK cells and their evaluation which is necessary to improve current NK cell adoptive therapies.

Development, Expansion, and In vivo Monitoring of Human NK Cells from Human Embryonic Stem Cells hESCs and Induced Pluripotent Stem Cells iPSCs

This protocol describes the development, expansion, and in vivo imaging of NK cells derived from hESCs and iPSCs.

Le développement, l&#39;expansion et<em&gt; In vivo</em&gt; Suivi des cellules NK humaines à partir de cellules souches embryonnaires humaines (CSEh) et et induit des cellules souches pluripotentes (CISP)

We present a method for deriving natural killer (NK) cells from undifferentiated hESCs and iPSCs using a feeder-free approach. This method gives rise to ...

Lipid Bilayer Vesicle Generation Using Microfluidic Jetting

Bottom-up synthetic biology presents a novel approach for investigating and reconstituting biochemical systems and, potentially, minimal organisms. This emerging field engages engineers, chemists, biologists, and physicists to design and assemble basic biological components into complex, functioning systems from the bottom up. Such bottom-up systems could lead to the development of artificial cells for fundamental biological inquiries and innovative therapies1,2. Giant unilamellar vesicles (GUVs) can serve as a model platform for synthetic biology due to their cell-like membrane structure and size. Microfluidic jetting, or microjetting, is a technique that allows for the generation of GUVs with controlled size, membrane composition, transmembrane protein incorporation, and encapsulation3. The basic principle of this method is the use of multiple, high-frequency fluid pulses generated by a piezo-actuated inkjet device to deform a suspended lipid bilayer into a GUV. The process is akin to blowing soap bubbles from a soap film. By varying the composition of the jetted solution, the composition of the encompassing solution, and/or the components included in the bilayer, researchers can apply this technique to create customized vesicles. This paper describes the procedure to generate simple vesicles from a droplet interface bilayer by microjetting.

Microfluidic jetting against a droplet interface lipid bilayer provides a reliable way to generate vesicles with control over membrane asymmetry, incorporation of transmembrane proteins, and encapsulation of material. This technique can be applied to study a variety of biological systems where compartmentalized biomolecules are desired.

Bicouche lipidique des vésicules génération utilisant microfluidique jets

Bottom-up synthetic biology presents a novel approach for investigating and reconstituting biochemical systems and, potentially, minimal organisms. This ...

Isolation of Primary Human Colon Tumor Cells from Surgical Tissues and Culturing Them Directly on Soft Elastic Substrates for Traction Cytometry

Cancer cells respond to matrix mechanical stiffness in a complex manner using a coordinated, hierarchical mechano-chemical system composed of adhesion receptors and associated signal transduction membrane proteins, the cytoskeletal architecture, and molecular motors1, 2. Mechanosensitivity of different cancer cells in vitro are investigated primarily with immortalized cell lines or murine derived primary cells, not with primary human cancer cells. Hence, little is known about the mechanosensitivity of primary human colon cancer cells in vitro. Here, an optimized protocol is developed that describes the isolation of primary human colon cells from healthy and cancerous surgical human tissue samples. Isolated colon cells are then successfully cultured on soft (2 kPa stiffness) and stiff (10 kPa stiffness) polyacrylamide hydrogels and rigid polystyrene (~3.6 GPa stiffness) substrates functionalized by an extracellular matrix (fibronectin in this case). Fluorescent microbeads are embedded in soft gels near the cell culture surface, and traction assay is performed to assess cellular contractile stresses using free open access software. In addition, immunofluorescence microscopy on different stiffness substrates provides useful information about primary cell morphology, cytoskeleton organization and vinculin containing focal adhesions as a function of substrate rigidity.

A protocol is described to extract primary human cells from surgical colon tumor and normal tissues. The isolated cells are then cultured on soft elastic substrates (polyacrylamide hydrogels) functionalized by an extracellular matrix protein, and embedded with fluorescent microbeads. Traction cytometry is performed to assess cellular contractile stresses.

Isolation des droits de cellules primaires de tumeurs du côlon à partir de tissus chirurgicaux et les cultivant directement sur élastique souple substrats pour Traction cytométrie

Cancer cells respond to matrix mechanical stiffness in a complex manner using a coordinated, hierarchical mechano-chemical system composed of adhesion ...

Techniques for the Evolution of Robust Pentose-fermenting Yeast for Bioconversion of Lignocellulose to Ethanol

Lignocellulosic biomass is an abundant, renewable feedstock useful for production of fuel-grade ethanol and other bio-products. Pretreatment and enzyme saccharification processes release sugars that can be fermented by yeast. Traditional industrial yeasts do not ferment xylose (comprising up to 40% of plant sugars) and are not able to function in concentrated hydrolyzates. Concentrated hydrolyzates are needed to support economical ethanol recovery, but they are laden with toxic byproducts generated during pretreatment. While detoxification methods can render hydrolyzates fermentable, they are costly and generate waste disposal liabilities. Here, adaptive evolution and isolation techniques are described and demonstrated to yield derivatives of the native Scheffersomyces stipitis strain NRRL Y-7124 that are able to efficiently convert hydrolyzates to economically recoverable ethanol despite adverse culture conditions. Improved individuals are enriched in an evolving population using multiple selection pressures reliant on natural genetic diversity of the S. stipitis population and mutations induced by exposures to two diverse hydrolyzates, ethanol or UV radiation. Final evolution cultures are dilution plated to harvest predominant isolates, while intermediate populations, frozen in glycerol at various stages of evolution, are enriched on selective media using appropriate stress gradients to recover most promising isolates through dilution plating. Isolates are screened on various hydrolyzate types and ranked using a novel procedure involving dimensionless relative performance index (RPI) transformations of the xylose uptake rate and ethanol yield data. Using the RPI statistical parameter, an overall relative performance average is calculated to rank isolates based on multiple factors, including culture conditions (varying in nutrients and inhibitors) and kinetic characteristics. Through application of these techniques, derivatives of the parent strain had the following improved features in enzyme saccharified hydrolyzates at pH 5-6: reduced initial lag phase preceding growth, reduced diauxic lag during glucose-xylose transition, significantly enhanced fermentation rates, improved ethanol tolerance and accumulation to 40 g/L.

Adaptive evolution and isolation techniques are described and demonstrated to yield derivatives of Scheffersomyces stipitis strain NRRL Y-7124 that are able to rapidly consume hexose and pentose mixed sugars in enzyme saccharified undetoxified hydrolyzates and to accumulate over 40 g/L ethanol.

Techniques pour l&#39;évolution de la levure robuste Pentose-fermentation pour la bioconversion de lignocellulose en éthanol

Lignocellulosic biomass is an abundant, renewable feedstock useful for production of fuel-grade ethanol and other bio-products. Pretreatment and enzyme ...

Isolation of Mesenchymal Stem Cells from Human Alveolar Periosteum and Effects of Vitamin D on Osteogenic Activity of Periosteum-derived Cells

Mesenchymal stem cells (MSCs) are present in a variety of tissues and can be differentiated into numerous cell types, including osteoblasts. Among the dental sources of MSCs, the periosteum is an easily accessible tissue, which has been identified to contain MSCs in the cambium layer. However, this source has not yet been widely studied.
Vitamin D3 and 1,25-(OH)2D3 have been demonstrated to stimulate in vitro differentiation of MSCs into osteoblasts. In addition, vitamin C facilitates collagen formation and bone cell growth. However, no study has yet investigated the effects of Vitamin D3 and Vitamin C on MSCs.
Here, we present a method of isolating MSCs from human alveolar periosteum and examine the hypothesis that 1,25-(OH)2D3 may exert an osteoinductive effect on these cells. We also investigate the presence of MSCs in the human alveolar periosteum and assess stem cell adhesion and proliferation. To assess the ability of vitamin C (as a control) and various concentrations of 1,25-(OH)2D3 (10&#8722;10, 10&#8722;9, 10&#8722;8, and 10&#8722;7 M) to alter key mRNA biomarkers in isolated MSCs mRNA expression of alkaline phosphatase (ALP), bone sialoprotein (BSP), core binding factor alpha-1 (CBFA1), collagen-1, and osteocalcin (OCN) are measured using real-time polymerase chain reaction (RT-PCR).

We present a protocol to investigate the mRNA expression biomarkers of periosteum-derived cells (PDCs) induced by vitamin C (vitamin C) and 1,25-dihydroxy vitamin D [1,25-(OH)2D3]. In addition, we evaluate the ability of PDCs to differentiate into osteocytes, chondrocytes, and adipocytes.

Isolement des cellules souches mésenchymateuses du périoste alvéolaire humaine et les effets de la vitamine D sur activité ostéogène du périoste dérivées des cellules

Mesenchymal stem cells (MSCs) are present in a variety of tissues and can be differentiated into numerous cell types, including osteoblasts. Among the ...

Uptake of New Lipid-coated Nanoparticles Containing Falcarindiol by Human Mesenchymal Stem Cells

Nanoparticles are the focus of an increased interest in drug delivery systems for cancer therapy. Lipid-coated nanoparticles are inspired in structure and size by low-density lipoproteins (LDLs) because cancer cells have an increased need for cholesterol to proliferate, and this has been exploited as a mechanism for delivering anticancer drugs to cancer cells. Moreover, depending on drug chemistry, encapsulating the drug can be advantageous to avoid degradation of the drug during circulation in vivo. Therefore, in this&#160;study, this design is used to fabricate lipid-coated nanoparticles of the anticancer drug falcarindiol, providing a potential new delivery system of falcarindiol in order to stabilize its chemical structure against degradation and improve its uptake by tumors. Falcarindiol nanoparticles, with a phospholipid and cholesterol monolayer encapsulating the purified drug core of the particle, were designed. The lipid monolayer coating consists of 1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DSPC), cholesterol (Chol), and 1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[methoxy(polyethylene glycol)-2000] (DSPE PEG 2000) along with the fluorescent label DiI (molar ratios of 43:50:5:2). The nanoparticles are fabricated using the rapid injection method, which is a fast and simple technique to precipitate nanoparticles by good-solvent for anti-solvent exchange. It consists of a rapid injection of an ethanol solution containing the nanoparticle components into an aqueous phase. The size of the fluorescent nanoparticles is measured using dynamic light scattering (DLS) at 74.1 &#177; 6.7 nm. The uptake of the nanoparticles is tested in human mesenchymal stem cells (hMSCs) and imaged using fluorescence and confocal microscopy. The uptake of the nanoparticles is observed in hMSCs, suggesting the potential for such a stable drug delivery system for falcarindiol.

This article describes the encapsulation of falcarindiol in lipid-coated 74 nm nanoparticles. The cellular uptake of the nanoparticles&#160;by human stem cells into lipid droplets is monitored by fluorescent and confocal imaging. Nanoparticles are fabricated by the rapid injection method of solvent shifting, and their size is measured with the dynamic light scattering technique.

Absorption de nouvelles nanoparticules lipides enduit contenant Falcarindiol par des cellules souches mésenchymateuses humaines

Nanoparticles are the focus of an increased interest in drug delivery systems for cancer therapy. Lipid-coated nanoparticles are inspired in structure and ...

Isolation of Adult Human Dermal Fibroblasts from Abdominal Skin and Generation of Induced Pluripotent Stem Cells Using a Non-Integrating Method

Induced pluripotent stem cells (iPSCs) could be considered, to date, a promising source of pluripotent cells for the management of currently untreatable diseases, for the reconstitution and regeneration of injured tissues and for the development of new drugs. Despite all the advantages related to the use of iPSCs, such as the low risk of rejection, the lessened ethical issues, and the possibility to obtain them from both young and old patients without any difference in their reprogramming potential, problems to overcome are still numerous. In fact, cell reprogramming conducted with viral and integrating viruses can cause infections and the introduction of required genes can induce a genomic instability of the recipient cell, impairing their use in clinic. In particular, there are many concerns about the use of c-Myc gene, well-known from several studies for its mutation-inducing activity. Fibroblasts have emerged as the suitable cell population for cellular reprogramming as they are easy to isolate and culture and are harvested by a minimally invasive skin punch biopsy. The protocol described here provides a detailed step-by-step description of the whole procedure, from sample processing to obtain cell cultures, choice of reagents and supplies, cleaning and preparation, to cell reprogramming by the means of a commercial non-modified RNAs (NM-RNAs)-based reprogramming kit. The chosen reprogramming kit allows an effective reprogramming of human dermal fibroblast to iPSCs and small colonies can be seen as early as 24 h after the first transfection, even with modifications with the respect to the standard datasheet. The reprogramming procedure used in this protocol offers the advantage of a safe reprogramming, without the risk of infections caused by viral vector-based methods, reduces the cellular defense mechanisms, and allows the generation of xeno-free iPSCs, all critical features that are mandatory for further clinical applications.

Cell reprogramming requires the introduction of key genes, which regulate and maintain the pluripotent cell state. The protocol described enables the formation of induced pluripotent stem cells (iPSCs) colonies from human dermal fibroblasts without viral/integrating methods but using non-modified RNAs (NM-RNAs) combined with immune evasion factors reducing cellular defense mechanisms.

Isolement des fibroblastes dermiques humains adultes de la peau abdominale et génération de cellules souches pluripotentes induites à l'aide d'une méthode de non-intégration

Induced pluripotent stem cells (iPSCs) could be considered, to date, a promising source of pluripotent cells for the management of currently untreatable ...

Single-Cell Optical Action Potential Measurement in Human Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes

Conventional intracellular microelectrode techniques to quantify cardiomyocyte electrophysiology are extremely complex, labor intensive, and typically carried out in low throughput. Rapid and ongoing expansion of induced pluripotent stem cell (iPSC) technology presents a new standard in cardiovascular research and alternate methods are now necessary to increase throughput of electrophysiological data at a single cell level. VF2.1Cl is a recently derived voltage sensitive dye which provides a rapid single channel, high magnitude response to fluctuations in membrane potential. It possesses kinetics superior to those of other existing voltage indicators and makes available functional data equivalent to that of traditional microelectrode techniques. Here, we demonstrate simplified, non-invasive action potential characterization in externally paced human iPSC derived cardiomyocytes using a modular and highly affordable photometry system.

Here we describe optical acquisition and characterization of action potentials from induced pluripotent stem cell derived cardiomyocytes using a high-speed modular photometry system.

Mesure du potentiel d’action optique unicellulaire dans les cardiomyocytes dérivés de cellules souches pluripotentes induites par l’homme

Conventional intracellular microelectrode techniques to quantify cardiomyocyte electrophysiology are extremely complex, labor intensive, and typically ...