A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Method Article
הפרוטוקול המוצג מתאר הליך לכימות תאים ברי קיימא אך לא ניתנים לתרבית (VBNC) בתרביות חיידקים שטופלו בדבש מאנוקה.
עמידות לאנטיביוטיקה וסבילות בקרב חיידקים מהווים איום משמעותי על הבריאות העולמית. מנגנונים התורמים לעמידות וסבילות לאנטיביוטיקה כוללים מוטציות גנטיות, רכישת גנים עמידים, ומעבר למצבי תרדמה ברי קיימא אך לא ניתנים לתרבות (VBNC) ומצבי תרדמה אחרים, בהתאמה. למרות שהם זהים גנטית לעמיתיהם שאינם עמידים לאנטיביוטיקה, תאי VBNC מתחמקים מהשפעות אנטיביוטיות על ידי הישארות לא פעילים מבחינה מטבולית. אנטיביוטיקה יעילה רק כאשר תהליכי היעד שלה, כגון שכפול או שעתוק DNA, פעילים. מאחר שגורמי לחץ סביבתיים, במיוחד אנטיביוטיקה, יכולים לגרום לחיידקים להיכנס לתרדמה, יש צורך באנטי-מיקרוביאלים חלופיים כדי למזער או למנוע את התגובה הזו. דבש מנוקה אנטי-בקטריאלי (MH) יעיל נגד חיידקים רבים, עם התפתחות נדירה של עמידות. המנגנונים האנטי-מיקרוביאליים הרב-גוניים שלו הופכים אותו לסוכן רב ערך לטיפול בזיהומים חיידקיים. מחקר זה חקר את סרבנות MH להתפתחות עמידות לאנטיביוטיקה על ידי בדיקת ההשערה ש-MH משרה פחות תאי VBNC מאשר אנטיביוטיקה קונבנציונלית. כדי לחקור זאת, פותח פרוטוקול לטיפול בחיידקים הגורמים לפצעים Staphylococcus aureus ו-Pseudomonas aeruginosa עם ריכוזים מעכבים מינימליים של MH או האנטיביוטיקה הקונבנציונלית tobramycin או meropenem, שהשתמשו בספירת הצלחות הקיימא כדי לזהות תאים פעילים מטבולית וצביעה חיה/מתה כדי לזהות את כל התאים הברי קיימא. מספר תאי ה-VBNC היה שווה למספר התאים הקיים פחות מספר התא הניתן לתרבית. בניסויים מסוימים, מספר התאים הניתנים לתרבית היה גבוה ממספר התאים הבר-קיימא, מה שנתן מספר שלילי של תאי VBNC; לפיכך, מספרי תאי VBNC לא הושוו ישירות. במקום זאת, הושוו מספרי תאים ניתנים לתרבות וברי-קיימא עבור כל טיפול. רק ל-P. aeruginosa שטופל בטוברמיצין היו פחות תאים ניתנים לתרבית באופן משמעותי מאשר תאים ברי קיימא, מה שמעיד על מספר גבוה יותר של תאי VBNC. פרוטוקול זה מהיר וקל וניתן להשתמש בו כדי להעריך אינדוקציה MH של תאי VBNC בחיידקים פתוגניים אחרים.
חיידקים במצב תרדמה בר-קיימא אך לא מתורבת (VBNC) שורדים טיפול אנטיביוטי וגורמים למחלות זיהומיות חוזרות ולעיתים קטלניות 1,2,3. מוכרת לנו יותר היא עמידות לאנטיביוטיקה, המתרחשת באמצעות שינוי גנטי תורשתי4. השינוי הגנטי מספק עמידות לאנטיביוטיקה ספציפית על ידי מספר מנגנונים, כולל הגבלת ספיגת אנטיביוטיקה, הגדלת פליטת האנטיביוטיקה, שינוי מטרת האנטיביוטיקה או השבתת האנטיביוטיקה4. לעומת זאת, חיידקים במצבי תרדמה מציגים סבילות אנטיביוטית רחבה יותר ולא תורשתית על ידי הפחתת חילוף החומרים שלהם 2,3. אנטיביוטיקה מכוונת לתהליכים מטבוליים ספציפיים, כולל שכפול DNA וסינתזת דופן התא, ואינה יעילה נגד תאי VBNC לא פעילים מבחינה מטבולית4. תאי VBNC קיימים באופן סטוכסטי במספרים נמוכים לצד אחיהם הזהים גנטית הרגישים לאנטיביוטיקה ברוב אוכלוסיות החיידקים5. עם זאת, גורמי לחץ סביבתיים, כולל חשיפה לאנטיביוטיקה, גורמים לתאי חיידקים רגישים להיכנס למצב VBNC סובלני לאנטיביוטיקה 3,6. טיפול אנטיביוטי יהרוג תאים רגישים לאנטיביוטיקה בתוך האוכלוסייה, בעוד שתאי VBNC רדומים יישארו. כפי ששמם מרמז, תאי VBNC אינם ניתנים לתרבות על מדיה המתאימה לגידול אחיהם הפעילים מטבולית. עם זאת, הממברנות והחומר הגנטי שלהם אינם פגומים, והם יכולים להתרבות 7,8. כאשר מסירים אנטיביוטיקה, נדרשים גירויים ספציפיים כגון חומרים מזינים, טמפרטורה או גורמי מארח כדי להעיר את תאי VBNC ממצב התרדמה שלהם ולהחזיר את הצמיחה 3,9. תאי VBNC תועדו במיני חיידקים פתוגניים רבים, כולל P. aeruginosa ו- S. aureus, גורמים אטיולוגיים עיקריים לזיהומי פצעים10,11.
דבש שימש זה מכבר ביישומים רפואיים, כולל טיפול בפצעים, בגלל תכונותיו האנטיבקטריאליות12. דבש מנוקה (MH), המופק מפרחי שיח מנוקה (Leptospermum scoparium), ידוע בזכות פעילותו הקוטלת חיידקים רחבת טווח (נסקר ב-13,14,15). הוא הורג בהצלחה את רוב החיידקים הגורמים לזיהום אנושי שנבדקו, כולל זני חיידקים כגון סטפילוקוקוס זהוב עמיד למתיצילין ואנטרוקוקוס עמיד לוונקומיצין המפגינים עמידות תורשתית לאנטיביוטיקה מסורתית16,17. בנוסף, עמידות חיידקים מושרית ל-MH היא נדירה, ומתגלה רק בביופילמים של P. aeruginosa ו-Escherichia coli שנחשפו לדבש שגודלו בריכוזים הולכים וגדלים של תת-קבוצה של הדבש שנבדק 18,19,20,21. זה מצביע על כך שהמנגנונים האנטי-מיקרוביאליים של MH נבדלים מאנטיביוטיקה קונבנציונלית ועשויים לגרום לפחות תאי VBNC או ללא תאי VBNC. השערה זו נבדקה על ידי קביעת האופן שבו MH משפיע על אוכלוסיות VBNC בהשוואה לאנטיביוטיקה קונבנציונלית.
יש להבחין בין תאי VBNC לבין אחיהם הפעילים מטבולית ותאים מתים. תאים הניתנים לתרבית נספרים באמצעות טכניקת ספירת הצלחות הקיימת, שבה תאים מועברים לאמצעי תרבית שגרתיים ומודגרים לתקופה המספיקה למספיק חלוקות תאים כדי לגרום למושבות נצפות. פותחו מספר שיטות להבחנה בין תאי VBNC לתאים מתים על סמך הממברנות השלמות שלהם ושעתוק ברמה נמוכה. ספיגת מצע וצבע פלואורסצנטי, בשילוב עם מיקרוסקופיה או ציטומטריית זרימה, מאפשרת ספירה ישירה של תאים על ידי מיקרוסקופיה או ציטומטריית זרימה עם צבע המעיד על ממברנות שלמות22,23. בדיקות נשימה הדורשות ששרשרת הובלת האלקטרונים תהיה נוכחת בקרום תא שלם שימשו גם כדי להבחין בין תאים ברי קיימא לתאים מתים24. פותחו גם שיטות PCR כמותיות (qPCR) בשילוב עם צבעים משני DNA המונעים הגברה; רק DNA מתאים ברי קיימא יוגבר מכיוון שהממברנות השלמות אינן כוללות את הצבע25. למרות שתאי VBNC רדומים, הם עדיין משעתקים גנים ברמה נמוכה, וזה יכול לשמש גם כדי להבדיל אותם מתאים מתים באמצעות שעתוק הפוך PCR26.
בעבודה זו פותחה בדיקה לכימות תאי VBNC בשני חיידקים פתוגניים הגורמים לפצעים, S. aureus ו- P. aeruginosa, שטופלו ב- MH. הוא מתאר את הטיפול בחיידקים עם MH ואנטיביוטיקה קונבנציונלית ושימוש בספירת צלחות בת קיימא וצביעה חיה/מתה כדי לזהות תאים מתורבתים וברי-קיימא. פרוטוקול קל וזול זה יאפשר ניתוח של יכולתו של MH לגרום לתאי VBNC עמידים לאנטיביוטיקה בפתוגנים חיידקיים רבים.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
מכיוון ש-P. aeruginosa (ATCC9721) ו-S. aureus (ATCC29213) מסווגים כסוכני בטיחות ביולוגית ברמה 2, החדרים שבהם מתבצעת העבודה חייבים להיות בעלי גישה מוגבלת ולהיות מצוידים בארון בטיחות ביולוגית למניפולציות שעלולות ליצור התזות או אירוסולים, כגון תרביות תסיסה וצנטריפוגות. בכל השלבים של פרוטוקול זה, יש ללבוש ציוד מגן אישי (PPE), כולל חלוק מעבדה, משקפי מגן וכפפות. כל הריאגנטים והציוד המשמשים בניסויים רשומים בטבלת החומרים.
1. הכנת מרק סטרילי ומדיה לתרבות אגר
2. אחזור הזנים Staphylococcus aureus ו-Pseudomonas aeruginosa המאוחסנים בארכיון מ-80 מעלות צלזיוס (יום 1)
3. הכנת S. aureus ו-P. aeruginosa לטיפול בדבש מאנוקה (MH) ובאנטיביוטיקה (יום 2)
4. הכנת MH והקמת MH וטיפולים אנטיביוטיים של S. aureus ו- P. aeruginosa (T = 0) (יום 3)
5. קביעת התאים הניתנים לתרבית בדגימות בשיטת ספירת צלחות בת קיימא (ימים 3 - 5)
6. קביעת התאים הקיימים בדגימות באמצעות צביעה חיה/מתת ומיקרוסקופיה פלואורסצנטית (יום 3 או 4)
7. קביעת מספר התאים ברי קיימא אך לא ניתנים לתרבות (VBNCs)
הערה: השתמש במספרי התאים הניתנים לתרבות המתקבלים מספירת הלוחות הקיימא ובמספר התא הבר-קיימא המתקבל מצביעה חיה/מתה כדי לקבוע את מספר ה-VBNCs.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
צורות חיים חיידקיות ברות קיימא אך לא ניתנות לתרבות (VBNC) נגרמות על ידי גורמי לחץ, כולל טיפול אנטיביוטי, וגורמות לזיהומים חוזרים בשל הסבילות שלהם לאנטיביוטיקה. מכיוון ש-MH הוא אנטי-מיקרוביאלי רחב טווח שאליו זוהתה עמידות רק לעתים רחוקות, הועלתה השערה ש-MH גרם לפחות VBNCs מאשר אנט...
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
הפרוטוקול המתואר כאן מאפשר זיהוי של אוכלוסיות תאי VBNC בחיידקים גורמי פצעים המטופלים בריכוזים מעכבים מינימליים (MICs) של MH ואנטיביוטיקה קונבנציונלית. שלבים קריטיים בפרוטוקול כללו הכנת דילול MH ביום הניסוי, מניעת אובדן דגימה במהלך צביעה חיה/מתה, וחישוב נכון של הנפח המנותח. עב...
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
למחברים אין ניגודי אינטרסים לחשוף.
עבודה זו מומנה על ידי שני מענקים מאוניברסיטת מזרח וושינגטון, מענק המחקר והיצירה של הפקולטה ל-A.R.C ומענק המחקר והפעילויות היצירתיות לתואר ראשון ל-L.T.B. ביל וקוני קרוס תרמו כספים ל-EWU לרכישת מיקרוסקופ פלואורסצנטי הפוך Leica DMIL עם מצלמה דיגיטלית.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Mueller Hinton broth | Fisher Bioreagents | B12322 | |
Luria Bertani (LB) broth | Fisher Bioreagents | BP142602 | |
BD Difco Agar | Fisher Scientific | DF0812-07-1 | |
sodium chloride | Sigma | S3014-500g | |
meropenem | TargetMol | T0224 | |
tobramycin | Selleck Chemicals | S2514 | |
Staphylococcus aureus | ATCC | ATCC29213 | |
Pseudomonas aeruginosa | ATCC | ATCC9721 | |
shaking incubator | Eppendorf | M13520000 | |
incubator | Benchmark Scientific | H2200-H | |
Manukaguard Manuka Honey | Amazon | NA | |
DMIL inverted fluorescent microscope | Leica Microsystems | 11521265 | |
Digital camera | Leica Microsystems | 12730522 | |
15 mL falcon tubes | Genesee Scientific | 28-103 | |
serological pipets | Diagnocine | DP-LB0100005, DP-LB010010 | |
Pipet Aid Pipettor | Drummond Scientific Company | 4-000-101 | |
Bunsen burner | Fisher Scientific | S48108 | |
Rainin pipets | Pipette.com | L-20, L-200, L-1000 | |
balance | Mettler Toledo | XS603S | |
96-well plate | Falcon | 351172 | |
inoculating loop | Fisher Scientific | 13-104-5 | |
isopropanol | Fisher Scientific | BP2618-1 | |
glass spreader | homemade | NA | |
Live dead staining kit for bacteria | Invitrogen | L7012 | |
microfuge tubes | Biologix Research Company | SKU 80-1500/P80-1500 | |
tin foil | Costco | NA | |
Figure making software | GraphPad | NA | GraphPad Prism was used for making figures and conducting statistical analyses. |
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved