Sign In

פטריות נלאמנטיות

Overview

מקור: מעבדות של ד"ר איאן פפר וד"ר צ'ארלס גרבה - אוניברסיטת אריזונה
מחבר מפגין: בראדלי שמיץ

פטריות הן אורגניזמים אאוקריוטים הטרוטרופיים, למעט שמרים, הם אירוביים. הם שופעים בקרקעות פני השטח וחשובים לתפקידם ברכיבה על אופניים מזינים ופירוק של חומר אורגני ומזהמים אורגניים. פטריות ריקבון לבנות(phanerochaete chryosporium)למשל, (איור 1) ידועים להשפיל ארומטיקה.

Figure 1
איור 1. ריקבון לבן על ליבנה.

Principles

קרקעות מכילות בדרך כלל מיליוני פטריות לגרם, כך שהאדמה מדוללת בדרך כלל באמצעות סדרת דילול. סדרת דילול נעשית על ידי השעיית כמות נתונה של אדמה בתמיסת פיזור, כגון מים דה-יוינו. ההשעיות מועברות לפתרון טרי, עד שהמתלה מדולל מספיק כדי לאפשר למושבות פטריות נפרדות לגדול על לוחות אגר. (איור 2)

לאחר חיסון על כמה לוחות אגר לשכפל, הצלחות הם דגירה ב 25 °C (5 °F). לאחר יצירת המושבות הפטרייתיות המקרוסקופיות, הן נספרות, כפי שמוצג באיור 3. מכיוון שההנחה היא שמושבה פטרייתית אחת נגזרת מאורגניזם אחד, המונח יחידות יוצרות מושבה (יחידות יוצרות מושבה) משמש בניתוח הסופי, כאשר התוצאות באות לידי ביטוי במונחים של CFUs לגרם של אדמה יבשה בתנור.

ספירות פטרייתיות רגילות מאדמה פורייה נמצאות בטווח של 106-106 "מפיצים" פטרייתיים (נבגים, hyphae, או שברי hyphal) לכל גרם של אדמה יבשה. ספירת לוחות פולטורלית שימשה לספירת אורגניזמים מאז המאה התשע עשרה. הם ממשיכים לשמש גם היום, מכיוון שהם זולים לביצוע, דורשים מעט עבודה, הם מהירים, והם ניתנים לשחזור למדי. עם זאת, הם סובלים ממספר שגיאות, אשר יש לקחת בחשבון בעת הערכת התוצאות. המשמעותית ביותר של טעויות אלה היא העובדה כי אורגניזמים רבים לא תרבות על לוחות מדיה.

Figure 2
איור 2. טכניקת דילול ו ציפוי. כאן, השעיית הקרקע המדוללת משולבת ישירות במדיום אגר ולא להיות משטח מוחל כמו במקרה של ציפוי התפשטות. מדע הסביבה והזיהום, 2nd Ed., עיתונות אקדמית, סן דייגו, קליפורניה

Figure 3
איור 3. פטריות אדמה מבודדות מאדמת פני השטח הגדלה בצלחת פטרי המכילה את רוז בנגל אגר. התמונה באדיבות ק.ל. ג'וזפסון. ממדע הסביבה והזיהום, 2nd Ed., עיתונות אקדמית, סן דייגו, קליפורניה.

Procedure

1. הכנת דגימת קרקע

  1. ראשית, לקבוע את תכולת הלחות הראשונית של הקרקע על ידי ייבוש בן לילה של כמות ידועה של האדמה לחה, ו reweigh על האדמה היבשה. המשוואה לקביעת תכולת הלחות הראשונית של האדמה היא:
    Equation 1
    (משוואה 1)
    איפה:
    MC = תכולת לחות
    W = משקל נטו
    D = משקל יבש
  2. חשב את כמות המים שיש להוסיף ל 25 גרם של אדמה כדי להגדיל את תכולת הלחות הקרקע ל 10% על בסיס משקל יבש.
  3. לאחר מכן, להוסיף את כמות המים ל 25 גרם של הקרקע.
  4. לכסות את המיכל בניילון נצמד ולנקב את הסרט מספר פעמים עם בדיקה כדי לאפשר aeration במהלך הדגירה. אבטחו את הסרט עם גומייה.
  5. שוקלים את האדמה ועוטפים, ואז מדגירים את הדגימה בטמפרטורת החדר במשך שבוע.

2. חיסון חנק ופטריות

  1. לאחר הדגירה הושלמה, לשקול את דגימת הקרקע עם העטיפה ואת הגומייה. לחשב את הירידה במשקל עקב ירידה בלחות.
  2. חשב את תכולת הלחות החדשה בקרקע.
  3. לאחר מכן, הכינו סדרת דילול של 1/10 של הקרקעות כפי שמוצג באיור 2. התוצאה תהיה דילול של 10-1 (בקבוק A), 10-2 (צינור B), 10-3 (צינור C), 10-4 (צינור D), ו 10-5 (צינור E) g קרקע לכל מתלים mL.
  4. הכינו צלחות אגר סטריליות של רוז בנגל-סטרפטומיצין. הן רוז בנגל והן סטרפטומיצין מעכבים צמיחה חיידקית. עבור קרקעות פוריות מאוד שבהן אוכלוסיות מיקרוביות הקרקע גבוהות, הדילול הנבחר צריך להיות גבוה יותר, כלומר,10-3,10-4, ו 10-5, אדמה g לכל צלחת.
  5. לכל אחתמ-10-3 הצלחות, הוסיפו 0.1 מ"ל מצינור דילול 10-2, והתפשטו על פני אגר באמצעות מפזר זכוכית מעוקר להבת אתנול. מכיוון שכמות של 0.1 מ"ל מצופה, זה הופך את הדילול היעיל 10-3. חזור על שלבים אלה עבור כל הדילולים.
  6. צלחות דגירה בטמפרטורת החדר במשך שבוע.

3. ספירת מושבות ובדיקה על ידי מיקרוסקופיה

  1. הפוך מושבה לספור באחד ורק דילול אחד של כל אדמה. הלוחיות שנספרות צריכות להיות מושבות דיסקרטיות שניתן לספור. אין לספור צלחות מגודלות. כמו כן, אין לספור לוחות עם פחות מ -10 מושבות. שים לב ותיאר את המאפיינים התרבותיים של שלוש מושבות שונות.
  2. הכן קלטת לחץ (סרט שקוף) טעינה על שקופיות למחקר מיקרוסקופ מפורט באמצעות ההליך הבא:
    1. הפקדת טיפה של נוזל הרכבה לקטופנול במרכז מגלשת זכוכית נקייה
    2. חותכים רצועה של סרט צלופן שקוף באורך של כ-3 ס"מ מגליל המניות. כדי למנוע זיהום משטח הדבק, השתמש במלקחיים בעת הטיפול בסרט. מחט ניתוח תסייע בשחרר את הקלטת מהמלקחיים.
    3. הצד הדביק של הסרט מוחל על פני השטח של מושבת פטריות מנקבת. יש להקפיד להימנע מלחץ מוגזם על הקלטת או צפופה מדי תיאסף מסה של הייפאה ונבגים.
    4. הסר את הקלטת ממגע עם מושבת הפטרייה ולהחיל אותו, צד דבק כלפי מטה, על טיפת נוזל הרכבה על שקופית הזכוכית. לשפשף את הקלטת בעדינות עם כלי חלק, שטוח כדי לבטא בועות אוויר.
    5. בדוק את הסרט הרכבה מיקרוסקופית תחת המטרה טבילת שמן עם שמן.
    6. זהה שני סוגים פטרייתיים שונים באמצעות מפתח הזיהוי הפטרייתי שסופק(איור 4).

Figure 4
איור 4. מפתח זיהוי פטרייתי.

Results

מחוזות המושבה

מספר המושבות הפטרייתיות לגרם אדמה שווה למספר המושבות הנספרות על הלוח המוכפל על ידי ההדדיות של הדילול מצופה. לדוגמה, אם 46 מושבות נספרות בדילול של 10-5, אז CFU לגרם של אדמה הוא 46 x 105 או 4.6 x 106.

זיהוי של שלושה סוגים פטרייתיים שונים

פטריות ניתן לזהות מיקרוסקופית על ידי בדיקה של גופי הפרי ואת הנבגים. מפתח זיהוי פטריות יכול לסייע בתהליך זה. (איור 4) סוגי פטריות נפוצים שנצפו כוללים פניציליום ואספרגילוס.

Application and Summary

דילול ו ציפוי של פטריות קרקע יכול לשמש אינדיקציה לבריאות של אדמה. בדרך כלל אדמה פורייה "בריאה" תהיה 105 עד 106 פטריות לכל גרם של אדמה. זה יכול גם להיות מנוצל כדי לבודד תרבויות טהורות של פטריות ספציפיות, לאחר מכן מוערך עבור תכונות ספציפיות, כגון היכולת לבזות תרכובות אורגניות. אלה יכולים להיות מזיקים כמו במקרה של פטריות ריקבון לבן, או מועיל כאשר אורגנים רעילים מושפלים באמצעות מתכלה. שימושים אחרים של תרביות טהורות של פטריות כוללים בידוד של פטריות לאנטיביוטיקה. לדוגמה, האנטיביוטיקה הראשונה אי פעם היה פניצילין, המיוצר על ידי פטרייה המועברת בקרקע פניציליום. זה התגלה לראשונה על ידי סר אלכסנדר פלמינג בשנת 1929.

References

  1. Pepper, I.L., Gerba, C.P., Brusseau, M. Environmental & Pollution Science, 2nd Ed. Academic Press, San Diego, CA. (2006).
  2. Pepper, I.L., Gerba, C.P. Environmental Microbiology, A Laboratory Manual, 2nd Ed. Academic Press, Boston, MA. (2005).

Tags

Filamentous FungiMulticellular OrganismsEukaryoticSoilEcosystemIsolationQuantificationLaboratory ExaminationNutrient CyclingDecompositionOrganic MatterContaminantsHeterotrophicAerobicOxygen RequirementCulture FungiSoil SamplesDilutionSterile WaterAgar PlatesIncubationFungal ColoniesCountingIdentificationVideo DemonstrationSoil AnalysisSerial DilutionsDispersing SolutionBuffer SolutionDiscrete Fungal ColoniesAgar MediaVisible Fungal ColoniesCounting CFUs Colony Forming UnitsHyphae Growth

Skip to...

0:00

Overview

1:04

Principles of Isolating and Identifying Filamentous Fungi

4:02

Soil Sample Preparation

4:43

Fungus Inoculation and Incubation

5:51

Colony Counting and Examination by Microscopy

7:21

Applications

8:33

Summary

Videos from this collection:

article

Now Playing

פטריות נלאמנטיות

Environmental Microbiology

57.2K Views

article

קביעת תכולת הלחות בקרקע

Environmental Microbiology

359.2K Views

article

טכניקה אספטית במדעי הסביבה

Environmental Microbiology

126.3K Views

article

כתמי גרם של חיידקים ממקורות סביבתיים

Environmental Microbiology

100.1K Views

article

הדמיית מיקרואורגניזמים קרקע באמצעות מצג שקופיות מגע ומיקרוסקופיה

Environmental Microbiology

42.2K Views

article

הפקת דנ"א קהילתי ממושבות חיידקים

Environmental Microbiology

28.8K Views

article

זיהוי מיקרואורגניזמים סביבתיים עם תגובת שרשרת פולימראז ואלקטרופורזה ג'ל

Environmental Microbiology

44.5K Views

article

ניתוח RNA של דגימות סביבתיות באמצעות RT-PCR

Environmental Microbiology

40.3K Views

article

כימות מיקרואורגניזמים סביבתיים ווירוסים באמצעות qPCR

Environmental Microbiology

47.8K Views

article

ניתוח איכות מים באמצעות אורגניזמים מחוון

Environmental Microbiology

29.5K Views

article

בידוד חיידקים צואתיים מדגימות מים על ידי סינון

Environmental Microbiology

39.3K Views

article

זיהוי בקטריופאג'ים בדגימות סביבתיות

Environmental Microbiology

40.7K Views

article

פולחן ופירום חיידקים מדגימות קרקע

Environmental Microbiology

184.1K Views

article

ניתוח עקומת גדילה חיידקית והיישומים הסביבתיים שלה

Environmental Microbiology

295.7K Views

article

1 200 אצות באמצעות מתודולוגיה של Culturable

Environmental Microbiology

13.8K Views

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Research

Education

ABOUT JoVE

Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved