כדי להתחיל, להכין דגימות רקמת כליה ברורות. לאחר מכן הפעל את המיקרוסקופ הקונפוקלי על ידי הפעלת כוח הלייזר תחילה ולאחר מכן הפעלת מתג הבקרה הקונפוקלית. לאחר מכן, הפעל את המחשב, הפעל את המיקרוסקופ והפעל את החומרה הקונפוקלית.
לאחר הפעלת הבדיקה העצמית, הפעל את תוכנת confocal. בחר את העדשה המתאימה. שלוף את הדגימה מגיב R מעוקב ומניחים אותו בצלחת קונפוקלית.
כסו אותו כדי למנוע מהמגיב R המעוקב להתייבש. הזז את הדגימה למרכז שדה הראייה וכוונן את המוקד עד שהמדגם יהיה ממוקד. לשחזור תלת-ממדי, התאימו את מישור הזום בכיוון אחד עד שלא תהיה פלואורסצנטיות נראית לעין, והגדירו מיקום זה כחלקו העליון.
לאחר מכן כוונן את מישור הזום בכיוון ההפוך עד שלא נראית פלואורסצנטיות, והגדר מיקום זה כתחתית. לחץ על לחצן ההפעלה בפינה השמאלית התחתונה של תיבת הדו-שיח כדי להתחיל בסריקה. לשחזור תמונה גדולה, מקמו את שדה הראייה במרכז הדגימה וקבעו אותו כמרכז.
בחר שדה ראייה של שניים על שניים. בממשק הרב-תכליתי ND, בחר במחסנית Z כדי לבנות מחדש תמונות גדולות. התאם את האפשרויות השונות בחלונית לפי הצורך, ולחץ על לחצן ההפעלה כדי להתחיל בסריקה.
הצמד את הכליה השקופה למתאם תיקון הדגימה עם דבק והמתן עד שהכליה מחוברת היטב. לאחר מכן טבלו את הכליה בפח הדגימה והחליקו את סל הדגימה למערכת המיקרוסקופ. אטמו את הצוהר.
בממשק האיתור, התאימו את הדגימה למיקום תצפית מתאים. עבור לממשק הרכישה, הגדר את הנתיב האופטי. בחר את הלייזר 488 ננומטר.
בחר מסנן קרן אור של 405-488-561-640, ולאחר מכן הגדר את בלוק מסנן הפיצול האופטי ל- SBS LP 490. בחר מצלמה שתיים ושנה את הצבע המדומה לירוק. הזן את הסטת Z השמאלית ולאחר מכן הימנית המתקבלת מתפריט המשנה של הערוץ.
בחר את הזום הקטן ביותר וכוונן אותו לקבלת בהירות אופטית. זהה את גבול XY ואת טווח Z עבור האיבר כולו. לאחר מכן לווסת את עוצמת הלייזר ואת זמן החשיפה לפחות מ -10 אלפיות השנייה.
התחל את התהליך על-ידי לחיצה על התחל ניסוי. אם הרקמה גדולה מדי, שלב שתי תמונות או יותר עם תפירת תמונה באמצעות תוכנת המיקרוסקופ. פתח את הקובץ שנתפס ובחר עיבוד.
לאחר מכן שיטה ותפירה, ואחריה פרמטר שיטה. לחץ על החל כדי לסיים את תפירת התמונה. גדיל fitindex מוזרק תוך כלי דם שימש לתיוג glomeruli.
בכליה המנוקה, ניתן היה לראות בבירור את הגלומרולי באמצעות מיקרוסקופ גיליון אור או מיקרוסקופ קונפוקלי.