כדי להתחיל, הפעל את תוכנת לכידת התמונה של המיקרוסקופ. חשב את מספר האריחים הדרושים לכיסוי לב העכבר כולו. צלם את התמונות של הלב החל מאריח אחד.
צלם ברצף תמונות של שאר האריחים עם חפיפה של 10% בין אריחים רצופים עד לכיסוי הלב כולו. כעת, פתח את תוסף BigStitcher וייבא את כל האריחים הדרושים דרך ספריית קבצי התמונה. שמור את ערכת הנתונים כקובץ HDF5.
השתמש באריח ההזזה לפי פונקציית רשת רגילה כדי לארגן את האריחים. לאחר מכן בחרו בדוגמת המילוי המשמשת להזזת הלב ובחרו חפיפה של 10% בין כל אריח. תפור את האריחים באמצעות האפשרות אשף התפירה.
צור קובץ TIFF באמצעות מיזוג תמונות לייצוא הנתונים שנתפרו. עבור deconvolution multi-view של המדגם. השתמש בחרוזים פלואורסצנטיים לרישום תמונה של שחזור מרובה תצוגות לאורך הלב.
סרוק את מכלול הלב לאורך ציר הזיהוי כדי ללכוד תמונות רציפות של לב העכבר מהחלק המואר. סובב את לב העכבר ב- 60 מעלות לאורך ציר Y כדי ללכוד את הערימות הבאות מזוויות מרובות. לאחר מכן פתח את תוסף BigStitcher וייבא את כל התמונות דרך ספריית קבצי התמונות.
שמור את ערכת הנתונים כקובץ HDF5. בחר זיהוי נקודות עניין ובחר ידנית חרוזי עניין לרישום. בחרו במודל שינוי הצורה העדין לרישום והקצו PSF לכל התצוגות.
לחץ על Multi-view Deconvolution ובחר את סוג האיטרציה כ- Efficient Bayesian. הגדר את מספר האיטרציות כ- 10 ובצע אותו. לבסוף, לחץ על מיזוג תמונה כדי לייצא קובץ TIFF.
שיטת הדה-קונבולוציה מרובת התצוגות השיגה רזולוציה איזוטרופית קרובה לאחר 15 שעות חישוב. מיקרוסקופ גיליון אור סחף בית השחי מבוסס ETL הצליח למזער את הרקע מחוץ למיקוד ולשפר את ניגודיות התמונה. שילוב התפירה עם מיקרוסקופ יריעות אור שנסחף באופן אקסיאלי איפשר כיסוי של לב עכבר שלם בן שמונה שבועות ברזולוציה אחידה.
