אנו מודים להומאירה נוואבי, פרדריק מורט ואיזבל סניאס על עזרתם. עבודה זו נתמכת על ידי CNRS, האגודה פרנסיס contre les מיופתיות (AFM), ANR YADDLE, Labex DevWeCan, Labex Cortex, ERC YODA כדי V.C.; C.D-B ו- A.J נתמכים על ידי מלגות לה ליגה קונטרה לה סרטן Labex DevWeCan, בהתאמה.

1. אסטרטגיית שיבוט לתיוג קולטן PlexinA1 עם pHluorin
<ol><li>בחר וקטור ביטוי מתאים כעמוד שדרה(למשל, קולטן העכבר plexinA1 מבטא וקטור, מתנה מעין של ד"ר אנדריאס פושל11). הערה: וקטור plexinA1 זה תוכנן כדי להשיג החדרת קולטן יעילה HA- או VSV מתויג בקרום הפלזמה.</li>
	<li>להגביר על ידי PCR את רצף קידוד pHluorin האקליפטי באמצעות פלסמיד נאותה כתבנית(למשל pHluorin מתויג GABA A קולטן, מתנה מסוג של ד"ר יעקב2). במידת הצורך, הוסף אתר הגבלה לקצה 5 'של פריימר על מנת להקל על שלב השיבוט עמוד השדרה.</li>
	<li>הכנס את רצף ה- pHluorin למסגרת בין פפטיד האות לרצף קידוד הקולטן באמצעות אתרי הגבלה(למשל אתרי הגבלה של NruI/Kpn2I כמתואר באיור 1B). הערה: מכיוון שפפטיד האות המבטיח את המיקוד הנכון של הקולטנים הוא cleaved, pHluorin צריך להיות ממוקם אחריו. זה מצדיק את ההכרה של פפטיד האות ומונע מחשוף של pHluorin מן הקולטן של עניין.</li>
	<li>רצף המבנים שהושגו כדי להבטיח כי אין מוטציה הוצגה על ידי PCR.</li>
</ol>2. אפיון של קולטן pHluorin מתויג במבחנה בתאי COS7
היכולת של חלבון היתוך להגיע קרום הפלזמה ואובדן הפיך של פלואורסצנטיות כמו pH הוא הוריד ניתן לאשר באמצעות ההליך הבא.
<ol><li>היום הראשון. צלחת 1.5 x 105 תאי COS7 בצלחת 35 מ"מ תחתית זכוכית ב 2 מ"ל של מלא של Dulbecco של הנשר שונה בינוני (DMEM - 10% סרום שור עוברי - 1 מ"מ נתרן פירובט - 25 U /ml פניצילין/סטרטומיצין - 2.5 מיקרוגרם/מ"ל אמפוטריצין B - pH 7.4).</li>
	<li>היום הראשון. תאי תעתיק: הערה: תאים צריכים להיות 70-80% מפגש.<ol>
<li>הכן 200 μl NaCl 150 מ"מ ולהוסיף 3 מיקרוגרם DNA כלומר קולטן קידוד וקטור pHluorin מתויג. בעדינות מערבולת לסובב למטה בקצרה. הערה: מפה של וקטור pHluorin-plexinA1 המשמש בניסויים אלה מוצגת באיור 1B.</li>
		<li>הוסף 10 μl של מגיב transfection (או את הכמות המתאימה של ריאגנט בשימוש). וורטקס מיד.</li>
		<li>דגירה 10 דקות ב RT.</li>
		<li>הוסף 200 μl של תערובת reagent / DNA transfection לתאים.</li>
		<li>להזיז את הצלחת בעדינות כדי להשיג חלוקה מחדש של התערובת ומניחים את התאים בחזרה לאינקובטור 37 מעלות צלזיוס.</li>
	</ol>
</li>
	<li>יום 3. הסר מדיום transfection והחלף אותו ב- 2 מ"ל של DMEM שלם טרי.</li>
	<li>יום 4. בצע הדמיית תאים חיים של COS7 pHluorin-plexinA1 תאים transfected:<ol>
<li>הכן שני aliquots של DMEM להשלים בינוני ולהתאים pH ל 3.5 ו 9.5, בהתאמה. הערה: עבור צלחת אחת של 35 מ"מ, יש צורך ב-1.5 מ"ל מכל פתרון כדי לבצע את הניסוי.</li>
		<li>הסר את מדיום התא והחלף אותו ב- 1 מ"ל של DMEM pH בינוני מלא 7.4.</li>
		<li>הכינו מזרק 5 מ"ל עם סוג מתאים של צינורות על מנת להזריק רכיבים שונים ישירות לתוך מדיום תרבות התא מבלי לפתוח את תא המיקרוסקופ.</li>
		<li>השתמש במודול המאפשר תחזוקה של 37 °C (70 °F), 5% CO2 אווירת עבודה לחה. הערה: גישה חלופית לשימוש בתא CO2 היא להשתמש במדיום עם אגירת HEPES (בדרך כלל בטווח של 10-25 מ"מ בהתאם לסוג התא).</li>
		<li>מניחים תאים בתא ומתאימים את הצינור ואת המזרק. הערה: יש להשוות את המיקרוסקופ לפני שמתחילים להימנע מסחף מכני במהלך ההקלטה.</li>
		<li>פתח את תוכנת ההדמיה ובחר את תוכנית הרכישה הרב-ממדית.</li>
		<li>מצא תאי COS7 שעברו חוצה עם המטרה 40X וסמן מיקום בתוכנה עבור כל אחד מהם.</li>
		<li>הגדר מחסנית Z כדי לקבל רכישת עומק 15 מיקרומטר (המוקד יכול להשתנות בעת הוספת מדיה בלוח).</li>
		<li>הגדר חשיפה עבור מסנן GFP והשלב.</li>
		<li>קבע תצורה של תזמון רכישה. הערה: עבור כל הניסוי עם 5 תחומי עניין, רכישה כל 20 שניות במשך 10 דקות צריכה להספיק.</li>
		<li>התחל ברכישה וצלם 5 תמונות בקרה במדיום DMEM pH 7.4.</li>
		<li>השהה רכישה, להזריק 1.25 מ"ל של pH 3.5 DMEM מלא כדי להשיג pH של 5.5 במדיום התרבות, לסמן אירוע בתוכנה ולחדש את הרכישה עבור 5 נקודות זמן נוספות. הערה: פלואורסצנטיות ירוקה צריכה להיעלם בהדרגה.</li>
		<li>השהה את הרכישה, הזרק 1.2 מ"ל של PH 9.5 DMEM מלא כדי להשיג pH 7.4 במדיום התרבות, לסמן אירוע בתוכנה ולחדש את הרכישה עבור 5 נקודות זמן נוספות. הערה: פלואורסצנטיות ירוקה צריכה להופיע שוב בקרום הפלזמה.</li>
		<li>לנתח תמונות. איור 2 מציג תמונות מייצגות שהושגו באמצעות פרוטוקול כזה עם מבנה pHluorin-plexinA1.
</li>
	</ol>
</li>
</ol>3. ב אובו אלקטרופורציה של pHluorin-plexinA1 בנייה
<ol><li>טיפול בביצים לפני אלקטרופורציה:<ol>
<li>יש לאחסן ביצים מופרות במקרר ב-14 מעלות צלזיוס עד שבוע לפני הדגירה.</li>
		<li>דגירה ביצים ב 38 °C (101 °F) באינקובטור עם לחות רוויה במשך 50-52 שעות עד העוברים להגיע לשלב HH1412. הערה: הביצים חייבות להיות ממוקמות אופקית במהלך הדגירה, כך העובר ממוקם כראוי עבור electroporation, צף על החלק העליון של החלמון. שלב HH14 מתאים לקבל ביטוי של פלסמידים בנוירונים מובחנים בחוט השדרה ובגנגליון השורש הגבי עם שיעור הישרדות מתאים.</li>
	</ol>
</li>
	<li>עוברי אלקטרופורט8-10:<ol>
<li>הכן אלקטרופורציה:<ol>
<li>הכן פלסמידים DNA ללא אנדוטוקסין עם ריכוז עדיף על 2 מיקרוגרם / μl, כדי להיות מסוגל לדלל אותו כריכוז הרצוי.</li>
			<li>משוך מספיק נימי זכוכית כדי להזריק את פתרונות הדנ"א השונים.</li>
			<li>הכינו PBS סטרילי (-Ca2+; -Mg2+) - 100 U/ml פניצילין/סטרפטומיצין ושווי משקל ב-38°C.</li>
			<li>לעקר את מכסה המנוע, מספריים מעוגלות ומלקחיים עדינים.</li>
			<li>לשלוט בריווח האלקטרודה. הערה: רווח של 4 מ"מ בין האלקטרודות משמש בדרך כלל.</li>
		</ol>
</li>
		<li>חלון הביצה13 (איור 3A):<ol>
<li>השתמש במספריים מעוגלים כדי לנקב את הקליפה בצד הקהה של הביצה.</li>
			<li>הסר 2 מ"ל של אלבומן באמצעות מחט 0.9 מ"מ x 25 מ"מ ומזרק 5 מ"ל. לכוון את המחט אנכית על מנת למנוע פגיעה בשק החלמון.</li>
			<li>מכסים את החלק העליון של הביצה עם קלטת כדי לשמור על שלמות הקליפה.</li>
			<li>באמצעות מספריים מעוגלות, לנקב את הקליפה באמצע הסרט כדי להשוות את הלחץ בעת הסרת 2 מ"ל של אלבומן מהביצה. לאחר מכן, לחתוך חלון גדול מספיק כדי לדמיין את העובר ולהיות מסוגל לעבוד על זה.</li>
			<li>הוסף ~ 2 מ"ל PBS חם סטרילי (-Ca2 +; -Mg2+) - 100 U / ml פניצילין / סטרפטומיצין כדי למנוע התייבשות של העובר ולהפוך אותו לנגיש יותר למניפולטור.</li>
		</ol>
</li>
		<li>להזריק דנ"א ולאלקטרופורט את העובר<ol>
<li>לדלל פלסמיד PBS ( -Ca2 +; -Mg2 +) לריכוז בין 0.5-2 מיקרוגרם / μl ולהוסיף צבע ירוק מהיר כדי להגיע סופי 0.025% ריכוז. טען את תערובת הדנ"א ב נימי. מומלץ להשתמש במזרק. הערה: בדוק כי ההתנגדות נימי הוא לא גדול מדי (כלומר יכול להיות קשיים בעת הזרקת עוברים) ולא קטן מדי (כלומר נימי יכול להיות גדול מדי ועלול לגרום נזק לעובר). כמו כן, ריכוז של חומצות גרעין גבוה מ 2 מיקרוגרם / μl עלול לגרום להשפעות לא ספציפיות צריך להיות נשלט.</li>
			<li>לנקב את שק החלמון ואת הצינור העצבי בצד caudal עם נימי טעון. הזן את הצינור העצבי בזווית רדודה ומלא את הלומן מהזנב לראש בתמהיל הדנ"א(איור 3B). הערה: ירוק מהיר מאפשר שליטה על דיוק ההזרקה.</li>
			<li>מקם במהירות את אלקטרודות הפלטינה של 4 מ"מ משני צדי הצינור העצבי ברמה שברצונך לאלקטרופורט ולהחיל 3 פולסים ב- 31 וולט למשך 50 מ"ר עם מרווחים של 500 msec (איור 3C). הערה: הימנע מהנחת האלקטרודות על הלב או על כלי עובר גדולים נוספים כדי למנוע פגיעה בעובר המתפתח. בועות צריכות להיווצר על האלקטרודות.</li>
			<li>עם המחט, להסיר 2 מ"ל של אלבומן כדי להקטין את הרמה בקליפה.</li>
			<li>לאטום את החלון ואת הצד הקהה הרמטית עם קלטת.</li>
			<li>מחזירים את הביצים ב-38.5 מעלות צלזיוס לאינקובטור עד שהן מגיעות לשלב הרצוי.</li>
		</ol>
</li>
	</ol>
</li>
</ol>4. הטמעה והקפאה של עוברים
<ol><li>48 שעות לאחר electroporation, בזהירות לקצור עוברים electroporated (שלב HH24). חותכים את הקלטת וחצי של קרום chorioallantoid. כדי למנוע מעוברים לשקוע לתוך החלמון, מקם מסננת מתחת לעובר וחתך את החצי השני של קרום chorioallantoid.</li>
	<li>מעבירים את העובר לצלחת ניתוח מלאה ב-PBS קר כקרח.</li>
	<li>בדוק את יעילות האלקטרופורציה על-ידי חיפוש פלואורסצנטיות בצינור העצבי באמצעות מיקרוסקופ סטריאו פלואורסצנטי. הערה : Coelectroporation של קידוד פלסמיד פקד RFP עשוי לעזור לדמיין את האזור electroporated.</li>
	<li>לנתח עוברים באמצעות microscalpel על מנת לבחור את האזור electroporated של חוט השדרה.</li>
	<li>העבר עוברים מנותחים לצלחת של 24 באר ותקן ב- pH 7.4 4% Paraformaldehyde (PFA) - מלוחים מאגר פוספט (PBS), O / N ב 4 °C (69 °F). הערה: שלב קיבוע הוא חיוני כדי לאפשר את הייצוב של pHluorin שלה "לחיות" קונפורמציה ובכך להיות מסוגל להשתמש pHluorin ברקמה קבועה / חדירה. למרות הקיבעון מאט באופן דרסטי pH תלוי שינוי של פלואורסצנטיות, יש לקחת בחשבון כי שינויים קונפורמציה / פרוטוניה עדיין יכול להתרחש לאחר קיבעון. לכן, הפרוטוקול הבא (הטבעה, cryosections ותצפית) יש לבצע בתוך 3 ימים לאחר שלב הקיבעון, עם כל המאגרים ב pH 7. אם אין צורך בתיקון, מומלץ לבצע תצפית על מקטעי רקמה חיה.</li>
	<li>הסר 4% PFA ולשטוף עוברים ב- pH 7.4 PBS.</li>
	<li>דגירה עוברים PBS-15% סוכרוז ולשמור על 4 מעלות צלזיוס עד העוברים לשקוע.</li>
	<li>דגירה עוברים קבועים ב- pH 7.4 7.5% ג'לטין- 15% סוכרוז במשך 45 דקות ב 37 מעלות צלזיוס כך העוברים מוטבעים לחלוטין.</li>
	<li>מניחים תבניות הטמעה על קרח ומוסיפים 400 μl של pH 7.4 7.5% ג'לטין- 15% סוכרוז כדי להשיג בסיס מוצק 2 מ"מ.</li>
	<li>שואפים את העובר המוטבע עם קצה חתוך ומניחים את העובר על בסיס הג'לטין המוצק.</li>
	<li>מכסים ב-pH 7.4 7.5% ג'לטין- 15% סוכרוז וממקם את העובר במלקחיים לפני שהג'לטין מתמצק.</li>
	<li>לאחר הג'לטין הוא מוצק, להכין -40 מעלות צלזיוס isopropanol אמבטיה (להשתמש קרח יבש או חנקן נוזלי) ולהקפיא את בלוק ג'לטין במשך 5 דקות.</li>
	<li>שמור על בלוקים קפואים ב -80 מעלות צלזיוס.</li>
	<li>מניחים את הבלוק הקפוא ב -20 מעלות צלזיוס למשך שעה.</li>
	<li>הסר את התבנית ולתקן את הבלוק על צ'אק עם מדיום גליקול פוליאתילן.</li>
	<li>לאחר הבלוק הוא קבוע בחוזקה, למקם את צ'אק במערכת cryostat. הערה: השתמש בשקופיות מצופות כדי למנוע אובדן רקמות במהלך הכתמתם.</li>
	<li>בצע cryosections סדרתי (20 μm cryosections מבוצעים בדרך כלל).</li>
	<li>תן את cryosections להתייבש במשך 15 דקות ב RT. הערה: יש להגן מפני חשיפה מיותרת לאור על מנת למנוע הלבנה של פלואורסצנטיות GFP.</li>
</ol>5. ניתוח מיקרוסקופי של קריוסקציות
<ol><li>התלכדות מחדש ב- pH 7.4 PBS ב- RT למשך 10 דקות. הערה: במידת הצורך, גרעינים יכולים להיות מוכתמים Hoechst.</li>
	<li>השתמש 0.5 מיקרוגרם / מיליליטר הויסט פתרון PBS ו cryosections דגירה במשך 15 דקות.</li>
	<li>שטף את השקופיות 3x עם pH 7.4 PBS במשך 5 דקות.</li>
	<li>המשך להרכבת שקופיות. pH 7.4 (או בסיסי יותר) פתרון הרכבה אלכוהול פוליוויניל כי מתקשה O / N ניתן להשתמש: בזהירות למקם את הכיסוי כדי למנוע היווצרות של בועות אוויר בין השקופית ואת כיסוי.</li>
	<li>תן למדיום ההרכבה להקשיח O/N ב 4 מעלות צלזיוס בחושך.</li>
	<li>השתמש במיקרוסקופ קונפוקל הפוך כדי לדמיין במדויק את חלבון ההיתוך pHluorin-plexinA1: בצע מחסנית z ברזולוציה האופטית האופטית של חור הסיכה האופטי והשתמש בעדשות 20X (NA 0.75) או 40X (NA 1.3). הערה: pHluorin ניתן לגילוי עם אותם פרמטרים המשמשים לגילוי GFP(כלומר שיא פליטה ב 509 ננומטר). הגדרות מסנן עירור וזיהוי אורך גל מוגדרות בצורה אופטימלית על-ידי תוכנת הדימות. Hoechst מזוהה בין 425-460 ננומטר (עירור הוא ב 405 ננומטר), GFP או pHluorin מזוהה בין 485-545 ננומטר (עירור הוא ב 473 ננומטר) ו RFP מזוהה בין 575-675 ננומטר (עירור הוא ב 559 ננומטר).</li>
</ol>תמונות מייצגות של ביטוי pHluorin-plexinA1 ו-eGFP בחוט השדרה של העובר מוצגות באיור 4.

<ol>
	<li>Winckler, B., Mellman, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Trafficking+guidance+receptors.">Trafficking guidance receptors.</a> Cold Spring Harb. Perspect. Biol. 2, (2010).</li><li>Jacob, T. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> J. Neurosci. 25, 10469-10478 (2005).</li><li>Nawabi, H., Castellani, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Axonal+commissures+in+the+central+nervous+system:+how+to+cross+the+midline.">Axonal commissures in the central nervous system: how to cross the midline.</a> Cell Mol. Life Sci. 68, 2539-2553 (2011).</li><li>Keleman, K., Ribeiro, C., Dickson, B. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comm+function+in+commissural+axon+guidance:+cell-autonomous+sorting+of+Robo+in+vivo.">Comm function in commissural axon guidance: cell-autonomous sorting of Robo in vivo.</a> Nat. Neurosci. 8, 156-163 (2005).</li><li>Nawabi, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+midline+switch+of+receptor+processing+regulates+commissural+axon+guidance+in+vertebrates.">A midline switch of receptor processing regulates commissural axon guidance in vertebrates.</a> Genes Dev. 24, 396-410 (2010).</li><li>Miesenbock, G., De Angelis, D. A., Rothman, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Visualizing+secretion+and+synaptic+transmission+with+pH-sensitive+green+fluorescent+proteins.">Visualizing secretion and synaptic transmission with pH-sensitive green fluorescent proteins.</a> Nature. 394, 192-195 (1998).</li><li>Miesenbock, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synapto-pHluorins:+genetically+encoded+reporters+of+synaptic+transmission.">Synapto-pHluorins: genetically encoded reporters of synaptic transmission.</a> Cold Spring Harb. Protoc.. 2012, 213-217 (2012).</li><li>Avraham, O., Zisman, S., Hadas, Y., Vald, L., Klar, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Deciphering+axonal+pathways+of+genetically+defined+groups+of+neurons+in+the+chick+neural+tube+utilizing+in+ovo+electroporation.">Deciphering axonal pathways of genetically defined groups of neurons in the chick neural tube utilizing in ovo electroporation.</a> J. Vis. Exp. (39), 1792-17 (2010).</li><li>Blank, M. C., Chizhikov, V., Millen, K. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+ovo+electroporations+of+HH+stage+10+chicken+embryos.">In ovo electroporations of HH stage 10 chicken embryos.</a> J. Vis. Exp. (9), (2007).</li><li>Wilson, N. H., Stoeckli, E. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+ovo+electroporation+of+miRNA-based+plasmids+in+the+developing+neural+tube+and+assessment+of+phenotypes+by+DiI+injection+in+open-book+preparations.">In ovo electroporation of miRNA-based plasmids in the developing neural tube and assessment of phenotypes by DiI injection in open-book preparations.</a> J. Vis. Exp. (68), (2012).</li><li>Rohm, B., Ottemeyer, A., Lohrum, M., Puschel, A. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Plexin/neuropilin+complexes+mediate+repulsion+by+the+axonal+guidance+signal+semaphorin+3A.">Plexin/neuropilin complexes mediate repulsion by the axonal guidance signal semaphorin 3A.</a> Mech. Dev. 93, 95-104 (2000).</li><li>Hamburger, V., Hamilton, H. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+series+of+normal+stages+in+the+development+of+the+chick+embryo.+1951.">A series of normal stages in the development of the chick embryo. 1951.</a> Dev. Dyn.. 195, 231-272 (1992).</li><li>Korn, M. J., Cramer, K. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Windowing+chicken+eggs+for+developmental+studies.">Windowing chicken eggs for developmental studies.</a> J. Vis. Exp. (8), (2007).</li><li>Alberts, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cdc42+and+actin+control+polarized+expression+of+TI-VAMP+vesicles+to+neuronal+growth+cones+and+their+fusion+with+the+plasma+membrane.">Cdc42 and actin control polarized expression of TI-VAMP vesicles to neuronal growth cones and their fusion with the plasma membrane.</a> Mol. Biol. Cell. 17, 1194-1203 (2006).</li><li>Perret, E., Lakkaraju, A., Deborde, S., Schreiner, R., Rodriguez-Boulan, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evolving+endosomes:+how+many+varieties+and+why.">Evolving endosomes: how many varieties and why.</a> Curr. Opin. Cell Biol. 17, 423-434 (2005).</li><li>Li, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Imaging+pHluorin-tagged+receptor+insertion+to+the+plasma+membrane+in+primary+cultured+mouse+neurons.">Imaging pHluorin-tagged receptor insertion to the plasma membrane in primary cultured mouse neurons.</a> J. Vis. Exp. (69), (2012).</li><li>Tojima, T., Itofusa, R., Kamiguchi, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Asymmetric+clathrin-mediated+endocytosis+drives+repulsive+growth+cone+guidance.">Asymmetric clathrin-mediated endocytosis drives repulsive growth cone guidance.</a> Neuron. 66, 370-377 (2010).</li><li>Matsui, A., Yoshida, A. C., Kubota, M., Ogawa, M., Shimogori, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mouse+in+utero+electroporation:+controlled+spatiotemporal+gene+transfection.">Mouse in utero electroporation: controlled spatiotemporal gene transfection.</a> J. Vis. Exp. (54), 3024-30 (2011).</li><li>Falk, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Electroporation+of+cDNA/Morpholinos+to+targeted+areas+of+embryonic+CNS+in+Xenopus.">Electroporation of cDNA/Morpholinos to targeted areas of embryonic CNS in Xenopus.</a> BMC Dev. Biol. 7 (107), (2007).</li><li>Holzhausen, L. C., Lewis, A. A., Cheong, K. K., Brockerhoff, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Differential+role+for+synaptojanin+1+in+rod+and+cone+photoreceptors.">Differential role for synaptojanin 1 in rod and cone photoreceptors.</a> J. Comp. Neurol. 517, 633-644 (2009).</li><li>Shang, Y., Claridge-Chang, A., Sjulson, L., Pypaert, M., Miesenbock, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Excitatory+local+circuits+and+their+implications+for+olfactory+processing+in+the+fly+antennal+lobe.">Excitatory local circuits and their implications for olfactory processing in the fly antennal lobe.</a> Cell. 128, 601-612 (2007).</li><li>Dittman, J. S., Kaplan, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Factors+regulating+the+abundance+and+localization+of+synaptobrevin+in+the+plasma+membrane.">Factors regulating the abundance and localization of synaptobrevin in the plasma membrane.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103, 11399-11404 (2006).</li><li>Bozza, T., McGann, J. P., Mombaerts, P., Wachowiak, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+vivo+imaging+of+neuronal+activity+by+targeted+expression+of+a+genetically+encoded+probe+in+the+mouse.">In vivo imaging of neuronal activity by targeted expression of a genetically encoded probe in the mouse.</a> Neuron. 42, 9-21 (2004).</li><li>Sankaranarayanan, S., Ryan, T. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Real-time+measurements+of+vesicle-SNARE+recycling+in+synapses+of+the+central+nervous+system.">Real-time measurements of vesicle-SNARE recycling in synapses of the central nervous system.</a> Nat. Cell. Biol. 2, 197-204 (2000).</li><li>Stark, D. A., Kasemeier-Kulesa, J. C., Kulesa, P. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Photoactivation+cell+labeling+for+cell+tracing+in+avian+development.">Photoactivation cell labeling for cell tracing in avian development.</a> CSH Protoc.. 2008, (2008).</li><li>Hildick, K. L., Gonzalez-Gonzalez, I. M., Jaskolski, F., Henley, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lateral+diffusion+and+exocytosis+of+membrane+proteins+in+cultured+neurons+assessed+using+fluorescence+recovery+and+fluorescence-loss+photobleaching.">Lateral diffusion and exocytosis of membrane proteins in cultured neurons assessed using fluorescence recovery and fluorescence-loss photobleaching.</a> J. Vis. Exp. (60), (2012).</li><li>Hanson, G. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Green+fluorescent+protein+variants+as+ratiometric+dual+emission+pH+sensors.+1.+Structural+characterization+and+preliminary+application.">Green fluorescent protein variants as ratiometric dual emission pH sensors. 1. Structural characterization and preliminary application.</a> Biochemistry. 41, 15477-15488 (2002).</li><li>Rose, T., Schoenenberger, P., Jezek, K., Oertner, T. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Developmental+refinement+of+vesicle+cycling+at+schaffer+collateral+synapses.">Developmental refinement of vesicle cycling at schaffer collateral synapses.</a> Neuron. 77, 1109-1121 (2013).</li><li>Li, Y., Tsien, R. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=pHTomato,+a+red,+genetically+encoded+indicator+that+enables+multiplex+interrogation+of+synaptic+activity.">pHTomato, a red, genetically encoded indicator that enables multiplex interrogation of synaptic activity.</a> Nat. Neurosci. 15, 1047-1053 (2012).</li><li>de Wit, J., Toonen, R. F., Verhage, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Matrix-dependent+local+retention+of+secretory+vesicle+cargo+in+cortical+neurons.">Matrix-dependent local retention of secretory vesicle cargo in cortical neurons.</a> J. Neurosci. 29, 23-37 (2009).</li></ol>

למחברים אין מה לחשוף.

פרוטוקול זה מספק הליך שלב אחר שלב כדי לעקוב אחר הדינמיקה של קולטן הדרכה אקסון הן בתרבות התא והן בהקשר ההתפתחותי של חוט השדרה עובר אפרוח.
כדי לעצב חלבון מתויג דה נובו pHluorin, שתי נקודות צריך להילקח בחשבון לגבי אסטרטגיית השיבוט. ראשית, תג pHluorin צריך להיחשף לומן של אנדוזומים ח...

במהלך הניווט שלהם, אקסונים משלבים רמזים סביבתיים מרובים המנחים אותם לעבר המטרה שלהם. רמזים אלה להפעיל קולטני הדרכה על פני השטח של מסופי אקסון, קונוסים הצמיחה, אשר בתורו ליזום מסלול איתות מתאים. לכן, הרגולציה הזמנית והמרחבית של התפלגות פני התא של הקולטנים היא קריטית כדי להגדיר את הרגישות של חרוט הצמיחה1. בהקשר זה, חציית קו האמצע על ידי אקסונים קומיסרים היא מודל מצוין לחקור את הרגולציה של רמות פני התא הקולטן. בחוט השדרה המתפתח, אקסונים קומיסרים נמשכים בתחילה לכיוון צלחת הרצפה הגחונית שבה הם חוצים את קו האמצע. לאחר חציית הגבול, הם מאבדים את ההיענות שלהם למשיכת צלחת הרצפה ולקבל תגובה דוחי צלחת הרצפה, כך שהם יכולים לצאת צלחת הרצפה לנווט לכיוון היעד הסופי שלהם בצד הנגדי של מערכת העצבים2,3. ויסות זמינות הקולטן על משטח חרוט הצמיחה הוא אחד המנגנונים שבבסיס המתג של היענות רמזים קו האמצע4,5. לכן, ניטור סלקטיבי של הקולטנים נוכח קרום הפלזמה של קונוסים צמיחה הוא בעל חשיבות עליונה. אנו מתארים כאן שיטה המבוססת על מאפיין פלואורסצנטי תלוי pH של חלבון פלואורסצנטי ירוק (GFP) גרסה כדי לדמיין באופן ספציפי את קולטני הדרכה אקסון הממוענים קרום פלזמה במבחנה in vivo, בחוט השדרה אפרוח המתפתח.
רוטמן ועמיתיו מהונדסים על ידי מוטציות נקודתיות גרסאות רגישות pH של GFP כולל pHluorin האקליפטי6. pHluorin האקליפטי יש את המאפיין של להיות nonfluorescent כאשר נחשף pH חומצי (<6), תוך היותו פלואורסצנטי ב- pH ניטרלי. זה מאפשר להבחין קולטנים שאינם פלואורסצנטיים מקומיים בתאים חומציים תאיים(כלומר אנדוזומים, סחר בשלפוחיות) מקולטנים פלואורסצנטיים המשולבים בקרום הפלזמה ובכך נחשפים ל- pH ניטרלי חוץ-תאי7. ניצלנו זאת כדי לנטר את לוקליזציית קרום הפלזמה של plexinA1, קולטן הדרכה אקסון המתווך את תגובת חרוט הצמיחה לסמפורין דוחה קו האמצע 3B5 (איור 1A). אנו מתארים כאן אפיון במבחנה של מבנה pHluorin-plexinA1, יחד עם ב- ovo electroporation8-10 של מבנה זה בחוט השדרה אפרוח המתפתח ואחריו ניתוח מיקרוסקופי של cryosections המאפשרים לעקוב אחר הדינמיקה קולטן הדרכה אקסון ב vivo עם רזולוציות מרחביות וטמפורליות כאחד.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="1007">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">COS7 cells</td>
			<td style="width:147px;">ATCC</td>
			<td style="width:219px;">CRL-1651</td>
			<td style="width:379px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">DMEM GlutaMAX</td>
			<td style="width:147px;">GIBCO</td>
			<td style="width:219px;">61965-026</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Sodium pyruvate</td>
			<td style="width:147px;">GIBCO</td>
			<td style="width:219px;">11360-039</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Amphotericin B</td>
			<td style="width:147px;">Sigma</td>
			<td style="width:219px;">A2942</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Fetal bovine serum</td>
			<td style="width:147px;">GIBCO</td>
			<td style="width:219px;">10270-106</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Penicillin/Streptomycin</td>
			<td style="width:147px;">GIBCO</td>
			<td style="width:219px;">15140-122</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:264px;">Exgen500 reagent</td>
			<td style="width:147px;">Euromedex Fermentas</td>
			<td style="width:219px;">ET0250</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">PBS -Ca2+ -Mg2+</td>
			<td style="width:147px;">GIBCO</td>
			<td style="width:219px;">14190-094</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Fast green dye</td>
			<td style="width:147px;">Sigma</td>
			<td style="width:219px;">F7252</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:264px;">32% Paraformaldehyde aqueous solution</td>
			<td style="width:147px;">Electron Microscopy</td>
			<td style="width:219px;">15714-S</td>
			<td>Dilute extemporaneously in PBS to achieve a 4% solution</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Gelatin from cold water fish skin</td>
			<td style="width:147px;">Sigma</td>
			<td style="width:219px;">G7041</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Sucrose</td>
			<td style="width:147px;">Sigma</td>
			<td style="width:219px;">S0389</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Cryomount</td>
			<td style="width:147px;">Histolab</td>
			<td style="width:219px;">00890</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Hoechst 34580</td>
			<td style="width:147px;">Invitrogen</td>
			<td style="width:219px;">H21486</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Mowiol 4-88</td>
			<td style="width:147px;">Fluka</td>
			<td style="width:219px;">81381</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td colspan="4" height="21" style="height:21px;width:1008px;">Consumables</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Bottom-glass 35 mm dish</td>
			<td style="width:147px;">MatTek</td>
			<td style="width:219px;">P35G-1.5-14-C</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">5 ml Syringe</td>
			<td style="width:147px;">Terumo</td>
			<td style="width:219px;">SS-05S</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Needles 0.9 mm x 25 mm</td>
			<td style="width:147px;">Terumo</td>
			<td style="width:219px;">NN-2025R</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Capillaries</td>
			<td style="width:147px;">CML</td>
			<td style="width:219px;">PP230PO</td>
			<td>capillaries are stretched manually in the flame</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Superfrost Plus Slides</td>
			<td style="width:147px;">Thermo Scientific</td>
			<td>4951PLUS</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td colspan="4" height="21" style="height:21px;width:1008px;">Material</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Curved scissors</td>
			<td style="width:147px;">FST</td>
			<td style="width:219px;">129-10</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Microscalpel</td>
			<td style="width:147px;">FST</td>
			<td style="width:219px;">10316-14</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Forceps</td>
			<td style="width:147px;">FST</td>
			<td style="width:219px;">Dumont #5 REF#11254</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td colspan="4" height="21" style="height:21px;width:1008px;">Equipment/software</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Time lapse microscope</td>
			<td style="width:147px;">Zeiss</td>
			<td style="width:219px;">Observer 1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:264px;">Temp module S</td>
			<td style="width:147px;">PECON for Zeiss</td>
			<td style="width:219px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">CO2 module S</td>
			<td style="width:147px;">PECON for Zeiss</td>
			<td style="width:219px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Metamorph software</td>
			<td style="width:147px;">Metamorph</td>
			<td style="width:219px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:264px;">Eggs incubator</td>
			<td style="width:147px;">Sanyo</td>
			<td style="width:219px;">MIR154</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Electroporator apparatus</td>
			<td style="width:147px;">Nepa Gene CO., LTD</td>
			<td style="width:219px;">CUY21</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Electrodes</td>
			<td style="width:147px;">Nepa Gene CO., LTD</td>
			<td style="width:219px;">CUY611P7-4</td>
			<td>4 mm platinum electrodes</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Fluorescence stereomicroscope</td>
			<td style="width:147px;">LEICA</td>
			<td style="width:219px;">MZ10F</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Cryostat</td>
			<td style="width:147px;">MICROM</td>
			<td style="width:219px;">HM550</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Confocal microscope</td>
			<td style="width:147px;">Olympus</td>
			<td style="width:219px;">FV1000, X81</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:264px;">Fluoview software</td>
			<td style="width:147px;">Olympus</td>
			<td style="width:219px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">CLC Main Workbench software</td>
			<td style="width:147px;">CLC Bio</td>
			<td style="width:219px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

use of phluorin to assess the dynamics of axon guidance receptors in cell culture and in the chick embryo

במהלך הפיתוח, קולטני הדרכה אקסון לשחק תפקיד מכריע בוויסות רגישות אקסונים רמזים אטרקטיביים ודוחה כאחד. ואכן, הפעלת קולטני ההנחיה היא הצעד הראשון של מנגנוני האיתות המאפשרים לאקסון טיפים, קונוסים לצמיחה, להגיב לליגנדים. ככזה, אפנון הזמינות שלהם על פני התא הוא אחד המנגנונים המשתתפים בקביעת רגישות חרוט הצמיחה. אנו מתארים כאן שיטה כדי לדמיין במדויק את הדינמיקה פני השטח של תא spatio-temporal של קולטן הדרכה אקסון הן במבחנה in vivo בחוט השדרה אפרוח המתפתח. ניצלנו את מאפיין הפלואורסצנטיות תלוי ה- pH של וריאנט חלבון פלואורסצנטי ירוק (GFP) כדי לזהות באופן ספציפי את השבר של קולטן ההנחיה של האקסון הממוען לקרום הפלזמה. אנו מתארים לראשונה את אימות במבחנה של מבנים תלויי pH כאלה ואנו מפרטים עוד יותר את השימוש בהם ב- vivo, באקורד עמוד השדרה של הגוזל, כדי להעריך את הדינמיקה המרחבית-טמפורלית של קולטן ההדרכה של האקסון.

<img alt="Figure 1" fo:content-width="5in" fo:src="/files/ftp_upload/50883/50883fig1highres.jpg" src="/files/ftp_upload/50883/50883fig1.jpg"> איור 1. א. ערכת תכונות הפלואורסצנטיות pHluorin-plexinA1 בהקשר סלולרי. PHluorin הוא nonfluorescent בתאים תאיים שבהם ה- pH הוא חומצי (<6) כגון בסחר בשלסים או באנדוזומים והוא פלואורסצנטי כאשר נחשף ...

Watch this Scientific Journal Video about Use of pHluorin to Assess the Dynamics of Axon Guidance Receptors in Cell Culture and in the Chick Embryo at JoVE.com

Use of pHluorin to Assess the Dynamics of Axon Guidance Receptors in Cell Culture and in the Chick Embryo

אנו מתארים כאן את השימוש בגרסת חלבון פלואורסצנטי ירוק רגיש pH, pHluorin, כדי לחקור את הדינמיקה המרחבית-זמנית של קולטני הדרכה אקסון סחר על פני התא. הקולטן pHluorin מתויג מתבטא הן בתרבות התא in vivo, באמצעות electroporation של העובר אפרוח.

שימוש pHluorin כדי להעריך את הדינמיקה של קולטני הדרכה אקסון בתרבות התא בעובר אפרוח

During development, axon guidance receptors play a crucial role in regulating axons sensitivity to both attractive and repulsive cues. Indeed, activation ...

use-phluorin-to-assess-dynamics-axon-guidance-receptors-cell-culture

Research

JoVE Journal

Neuroscience

8.2K Views.  University of Lyon. אנו מתארים כאן את השימוש בגרסת חלבון פלואורסצנטי ירוק רגיש pH, pHluorin, כדי לחקור את הדינמיקה המרחבית-זמנית של קולטני הדרכה אקסון סחר על פני התא. הקולטן pHluorin מתויג מתבטא הן בתרבות התא in vivo, באמצעות electroporation של העובר אפרוח.

Video: Use of pHluorin to Assess the Dynamics of Axon Guidance Receptors in Cell Culture and in the Chick Embryo

Dissection and Culture of Commissural Neurons from Embryonic Spinal Cord

Commissural neurons have been widely used to investigate the mechanisms underlying axon guidance during embryonic spinal cord development. The cell bodies of these neurons are located in the dorsal spinal cord and their axons follow stereotyped trajectories during embryonic development. Commissural axons initially project ventrally towards the floorplate. After crossing the midline, these axons turn anteriorly and project towards the brain. Each of these steps is regulated by the action of several guidance cues. Cultures highly enriched in commissural neurons are ideally suited for many experiments addressing the mechanisms of axon pathfinding, including turning assays, immunochemistry and biochemistry. Here, we describe a method to dissect and culture commissural neurons from E13 rat dorsal spinal cord. First, the spinal cord is isolated and dorsal strips are dissected out. The dorsal tissue is then dissociated into a cell suspension by trypsinization and mechanical disruption. Neurons are plated onto poly-L-lysine-coated glass coverslips or tissue-culture dishes. After 30 hours in vitro, most neurons have extended an axon. The purity of the culture (Yam et al. 2009), typically over 90%, can be assessed by immunolabeling with the commissural neuron markers DCC, LH2 and TAG1 (Helms and Johnson, 1998). This neuronal preparation is a useful tool for in vitro studies of the cellular and molecular mechanisms of commissural axon growth and guidance during spinal cord development.

This video demonstrates a method to dissect and culture commissural neurons from E13 rat dorsal spinal cord. Dissociated commissural neurons are useful to study the cellular and molecular mechanisms of axon growth and guidance.

Dissection והתרבות של נוירונים Commissural מחוט השדרה עובריים

Commissural neurons have been widely used to investigate the mechanisms underlying axon guidance during embryonic spinal cord development. The cell bodies ...

Visualization of Proprioceptors in Drosophila Larvae and Pupae

Proprioception is the ability to sense the motion, or position, of body parts by responding to stimuli arising within the body. In fruitflies and other insects proprioception is provided by specialized sensory organs termed chordotonal organs (ChOs) 2. Like many other organs in Drosophila, ChOs develop twice during the life cycle of the fly. First, the larval ChOs develop during embryogenesis. Then, the adult ChOs start to develop in the larval imaginal discs and continue to differentiate during metamorphosis.
The development of larval ChOs during embryogenesis has been studied extensively 10,11,13,15,16. The centerpiece of each ChO is a sensory unit composed of a neuron and a scolopale cell. The sensory unit is stretched between two types of accessory cells that attach to the cuticle via specialized epidermal attachment cells 1,9,14. When a fly larva moves, the relative displacement of the epidermal attachment cells leads to stretching of the sensory unit and consequent opening of specific transient receptor potential vanilloid (TRPV) channels at the outer segment of the dendrite 8,12. The elicited signal is then transferred to the locomotor central pattern generator circuit in the central nervous system.
Multiple ChOs have been described in the adult fly 7. These are located near the joints of the adult fly appendages (legs, wings and halters) and in the thorax and abdomen. In addition, several hundreds of ChOs collectively form the Johnston's organ in the adult antenna that transduce acoustic to mechanical energy 3,5,17,4.
In contrast to the extensive knowledge about the development of ChOs in embryonic stages, very little is known about the morphology of these organs during larval stages. Moreover, with the exception of femoral ChOs 18 and Johnston's organ, our knowledge about the development and structure of ChOs in the adult fly is very fragmentary.
Here we describe a method for staining and visualizing ChOs in third instar larvae and pupae. This method can be applied together with genetic tools to better characterize the morphology and understand the development of the various ChOs in the fly.

Visualization of Proprioceptors in Drosophila Larvae and Pupae

A method to immunostain and visualize chordotonal organs in larvae and pupae of Drosophila melanogaster is described.

ויזואליזציה של Proprioceptors ב<em&gt; תסיסנית</em&gt; זחלים וגלמים

Proprioception is the ability to sense the motion, or position, of body parts by responding to stimuli arising within the body. In fruitflies and other ...

Electroporation of the Hindbrain to Trace Axonal Trajectories and Synaptic Targets in the Chick Embryo

Electroporation of the chick embryonic neural tube has many advantages such as being quick and efficient for the expression of foreign genes into neuronal cells. In this manuscript we provide a method that demonstrates uniquely how to electroporate DNA into the avian hindbrain at E2.75 in order to specifically label a subset of neuronal progenitors, and how to follow their axonal projections and synaptic targets at much advanced stages of development, up to E14.5. We have utilized novel genetic tools including specific enhancer elements, Cre/Lox - based plasmids and the PiggyBac-mediated DNA transposition system to drive GFP expression in a subtype of hindbrain cells (the dorsal most subgroup of interneurons, dA1). Axonal trajectories and targets of dA1 axons are followed at early and late embryonic stages at various brainstem regions. This strategy contributes advanced techniques for targeting cells of interest in the embryonic hindbrain and for tracing circuit formation at multiple stages of development.

How neuronal networks are established in the embryonic brain is a fundamental question in developmental neurobiology. Here we combined an electroporation technique with novel genetic tools, such as Cre/Lox&#x2013;plasmids and PiggyBac-mediated DNA transposition system in the avian hindbrain to label dorsal interneurons and track their axonal projections and synaptic targets at various developmental stages.

Electroporation של המוח האחורי כדי לעקוב אחר מסלולים ויעדי axonal Synaptic בעובר האפרוח

Electroporation of  the chick embryonic neural tube has many advantages such as being quick and efficient  for the expression of foreign genes into ...

Inducing Plasticity of Astrocytic Receptors by Manipulation of Neuronal Firing Rates

Close to two decades of research has established that astrocytes in situ and in vivo express numerous G protein-coupled receptors (GPCRs) that can be stimulated by neuronally-released transmitter. However, the ability of astrocytic receptors to exhibit plasticity in response to changes in neuronal activity has received little attention. Here we describe a model system that can be used to globally scale up or down astrocytic group I metabotropic glutamate receptors (mGluRs) in acute brain slices. Included are methods on how to prepare parasagittal hippocampal slices, construct chambers suitable for long-term slice incubation, bidirectionally manipulate neuronal action potential frequency, load astrocytes and astrocyte processes with fluorescent Ca2+ indicator, and measure changes in astrocytic Gq GPCR activity by recording spontaneous and evoked astrocyte Ca2+ events using confocal microscopy. In essence, a &#8220;calcium roadmap&#8221; is provided for how to measure plasticity of astrocytic Gq GPCRs. Applications of the technique for study of astrocytes are discussed. Having an understanding of how astrocytic receptor signaling is affected by changes in neuronal activity has important implications for both normal synaptic function as well as processes underlying neurological disorders and neurodegenerative disease.

Here we describe an adaptation of protocols used to induce homeostatic plasticity in neurons for the study of plasticity of astrocytic G protein-coupled receptors. Recently used to examine changes in astrocytic group I mGluRs in juvenile mice, the method can be applied to measure scaling of various astrocytic GPCRs, in tissue from adult mice in situ and in vivo, and to gain a better appreciation of the sensitivity of astrocytic receptors to changes in neuronal activity.

גרימת פלסטיות של astrocytic רצפטורים על ידי מניפולציה של מחירים ירי עצביים

Close to two decades of research has established that astrocytes in situ and in vivo express numerous G protein-coupled receptors (GPCRs) that can be ...

Whole-mount Imaging of Mouse Embryo Sensory Axon Projections

The visualization of full-length neuronal projections in embryos is essential to gain an understanding of how mammalian neuronal networks develop. Here we describe a method to label in situ a subset of dorsal root ganglion (DRG) axon projections to assess their phenotypic characteristics using several genetically manipulated mouse lines. The TrkA-positive neurons are nociceptor neurons, dedicated to the transmission of pain signals. We utilize a TrkAtaulacZ mouse line to label the trajectories of all TrkA-positive peripheral axons in the intact mouse embryo. We further breed the TrkAtaulacZ line onto a Bax null background, which essentially abolishes neuronal apoptosis, in order to assess growth-related questions independently of possible effects of genetic manipulations on neuronal survival. Subsequently, genetically modified mice of interest are bred with the TrkAtaulacZ/Bax null line and are then ready for study using the techniques described herein. This presentation includes detailed information on mouse breeding plans, genotyping at the time of dissection, tissue preparation, staining and clearing to allow for visualization of full-length axonal trajectories in whole-mount preparation.

We present here an optimized protocol to genotype, stain and prepare fetal mice for the imaging of peripheral nociceptor axon projections in the whole animal, as an effective method to assess sensory axon growth phenotypes in developing genetically engineered mice.

הדמיה הר-כל תחזיות החושיות אקסון העובר העכבר

The visualization of full-length neuronal projections in embryos is essential to gain an understanding of how mammalian neuronal networks develop. Here we ...

Imaging Ca2+ Dynamics in Cone Photoreceptor Axon Terminals of the Mouse Retina

Retinal cone photoreceptors (cones) serve daylight vision and are the basis of color discrimination. They are subject to degeneration, often leading to blindness in many retinal diseases. Calcium (Ca2+), a key second messenger in photoreceptor signaling and metabolism, has been proposed to be indirectly linked with photoreceptor degeneration in various animal models. Systematically studying these aspects of cone physiology and pathophysiology has been hampered by the difficulties of electrically recording from these small cells, in particular in the mouse where the retina is dominated by rod photoreceptors. To circumvent this issue, we established a two-photon Ca2+ imaging protocol using a transgenic mouse line that expresses the genetically encoded Ca2+ biosensor TN-XL exclusively in cones and can be crossbred with mouse models for photoreceptor degeneration. The protocol described here involves preparing vertical sections (&#8220;slices&#8221;) of retinas from mice and optical imaging of light stimulus-evoked changes in cone Ca2+ level. The protocol also allows &#8220;in-slice measurement&#8221; of absolute Ca2+ concentrations; as the recordings can be followed by calibration. This protocol enables studies into functional cone properties and is expected to contribute to the understanding of cone Ca2+ signaling as well as the potential involvement of Ca2+ in photoreceptor death and retinal degeneration.

Imaging Ca2+ Dynamics in Cone Photoreceptor Axon Terminals of the Mouse Retina

We describe a protocol to monitor Ca2+ dynamics in the axon terminals of cone photoreceptors using an ex-vivo&#160;slice preparation of the mouse retina. This protocol allows comprehensive studies of cone Ca2+ signaling in an important mammalian model system, the mouse.

ההדמיה Ca<sup&gt; 2 +</sup&gt; Dynamics בסופי קון קולטי האור אקסון של רשתית העכבר

Retinal cone photoreceptors (cones) serve daylight vision and are the basis of color discrimination. They are subject to degeneration, often leading to ...

Utilizing Combined Methodologies to Define the Role of Plasma Membrane Delivery During Axon Branching and Neuronal Morphogenesis

During neural development, growing axons extend to multiple synaptic partners by elaborating axonal branches. Axon branching is promoted by extracellular guidance cues like netrin-1 and results in dramatic increases to the surface area of the axonal plasma membrane. Netrin-1-dependent axon branching likely involves temporal and spatial control of plasma membrane expansion, the components of which are supplied through exocytic vesicle fusion. These fusion events are preceded by formation of SNARE complexes, comprising a v-SNARE, such as VAMP2 (vesicle-associated membrane protein 2), and plasma membrane t-SNAREs, syntaxin-1 and SNAP25 (synaptosomal-associated protein 25). Detailed herein isa multi-pronged approach used to examine the role of SNARE mediated exocytosis in axon branching. The strength of the combined approach is data acquisition at a range of spatial and temporal resolutions, spanning from the dynamics of single vesicle fusion events in individual neurons to SNARE complex formation and axon branching in populations of cultured neurons. This protocol takes advantage of established biochemical approaches to assay levels of endogenous SNARE complexes and Total Internal Reflection Fluorescence (TIRF) microscopy of cortical neurons expressing VAMP2 tagged with a pH-sensitive GFP (VAMP2-pHlourin) to identify netrin-1 dependent changes in exocytic activity in individual neurons. To elucidate the timing of netrin-1-dependent branching, time-lapse differential interference contrast (DIC) microscopy of single neurons over the order of hours is utilized. Fixed cell immunofluorescence paired with botulinum neurotoxins that cleave SNARE machinery and block exocytosis demonstrates that netrin-1 dependent axon branching requires SNARE-mediated exocytic activity.

Light microscopy techniques coupled with biochemical assays elucidate the involvement of SNARE-mediated exocytosis in netrin-dependent axon branching. This combination of techniques permits identification of molecular mechanisms controlling axon branching and cell shape change.

ניצול מתודולוגיות משולב להגדיר את התפקיד של משלוח ממברנה פלזמה במהלך אקסון מסעף ו העצבית המורפוגנזה

During neural development, growing axons extend to multiple synaptic partners by elaborating axonal branches. Axon branching is promoted by extracellular ...

The Use of Trace Eyeblink Classical Conditioning to Assess Hippocampal Dysfunction in a Rat Model of Fetal Alcohol Spectrum Disorders

Neonatal rats were administered a relatively high concentration of ethyl alcohol (11.9% v/v) during postnatal days 4-9, a time when the fetal brain undergoes rapid organizational change and is similar to accelerated brain changes that occur during the third trimester in humans. This model of fetal alcohol spectrum disorders (FASDs) produces severe brain damage, mimicking the amount and pattern of binge-drinking that occurs in some pregnant alcoholic mothers. We describe the use of trace eyeblink classical conditioning (ECC), a higher-order variant of associative learning, to assess long-term hippocampal dysfunction that is typically seen in alcohol-exposed adult offspring. At 90 days of age, rodents were surgically prepared with recording and stimulating electrodes, which measured electromyographic (EMG) blink activity from the left eyelid muscle and delivered mild shock posterior to the left eye, respectively. After a 5 day recovery period, they underwent 6 sessions of trace ECC to determine associative learning differences between alcohol-exposed and control rats. Trace ECC is one of many possible ECC procedures that can be easily modified using the same equipment and software, so that different neural systems can be assessed. ECC procedures in general, can be used as diagnostic tools for detecting neural pathology in different brain systems and different conditions that insult the brain.

Trace eyeblink classical conditioning (ECC) was used to assess hippocampal-dependent associative learning in adult rats that were administered a high concentration (11.9% v/v) of alcohol during early neonatal brain development. In general, ECC procedures are sound diagnostic tools for detecting brain dysfunction across many psychological and biomedical settings.

השימוש של התניה קלאסית Eyeblink מעקב כדי להעריך תפקוד בהיפוקמפוס במודל של עכברים של אלכוהול עוברית ספקטרום הפרעות

Neonatal rats were administered a relatively high concentration of ethyl alcohol (11.9% v/v) during postnatal days 4-9, a time when the fetal brain ...

Ballistic Labeling of Pyramidal Neurons in Brain Slices and in Primary Cell Culture

It has been reported that the size and shape of dendritic spines is related to their structural plasticity. To identify the morphological structure of pyramidal neurons and dendritic spines, a ballistic labeling technique can be utilized. In the present protocol, pyramidal neurons are labeled with DilC18(3) dye and analyzed using neuronal reconstruction software to assess neuronal morphology and dendritic spines. To investigate neuronal structure, dendritic branching analysis and Sholl analysis are performed, allowing researchers to draw inferences about dendritic branching complexity and neuronal arbor complexity, respectively. The evaluation of dendritic spines is conducted using an automatic assisted classification algorithm integral to the reconstruction software, which classifies spines into four categories (i.e., thin, mushroom, stubby, filopodia). Furthermore, an additional three parameters (i.e., length, head diameter, and volume) are also chosen to assess alterations in dendritic spine morphology. To validate the potential of wide application of the ballistic labeling technique, pyramidal neurons from in vitro cell culture were successfully labeled. Overall, the ballistic labeling method is unique and useful for visualizing neurons in different brain regions in rats, which in combination with sophisticated reconstruction software, allows researchers to elucidate the possible mechanisms underlying neurocognitive dysfunction.

We present a protocol to label and analyze pyramidal neurons, which is critical for evaluating potential morphological alterations in neurons and dendritic spines that may underlie neurochemical and behavioral abnormalities.

בליסטי לתיוג של הנוירונים בתוך המוח בפרוסות ובתרבות התא הראשוני

It has been reported that the size and shape of dendritic spines is related to their structural plasticity. To identify the morphological structure of ...

Use of Primary Cultured Hippocampal Neurons to Study the Assembly of Axon Initial Segments

Neuronal axon initial segments (AIS) are sites of initiation of action potentials and have been extensively studied for their molecular structure, assembly and activity-dependent plasticity. Giant ankyrin-G, the master organizer of AIS, directly associates with membrane-spanning voltage gated sodium (VSVG) and potassium channels (KCNQ2/3), as well as 186 kDa neurofascin, a L1CAM cell adhesion molecule. Giant ankyrin-G also binds to and recruits cytoplasmic AIS molecules including beta-4-spectrin, and the microtubule-binding proteins, EB1/EB3 and Ndel1. Giant ankyrin-G is sufficient to rescue AIS formation in ankyrin-G deficient neurons. Ankyrin-G also includes a smaller 190 kDa isoform located at dendritic spines instead of the AIS, which is incapable of targeting to the AIS or rescuing the AIS in ankyrin-G-deficient neurons. Here, we described a protocol using cultured hippocampal neurons from ANK3-E22/23-flox mice, which, when transfected with Cre-BFP exhibit loss of all isoform of ankyrin-G and impair the formation of AIS. Combined a modified Banker glia/neuron co-culture system, we developed a method to transfect ankyrin-G null neurons with a 480 kDa ankyrin-G-GFP plasmid, which is sufficient to rescue the formation of AIS. We further employ a quantification method, developed by Salzer and colleagues to deal with variation in AIS distance from the neuronal cell bodies that occurs in hippocampal neuron cultures. This protocol allows quantitative studies of the de novo assembly and dynamic behavior of AIS.

Here, we described a protocol to quantitatively study the assembly and structure of the axon initial segments (AIS) of hippocampal neurons that lack pre-assembled AIS due to the absence of a giant ankyrin-G.

שימוש pHluorin כדי להעריך את הדינמיקה של קולטני הדרכה אקסון בתרבות התא בעובר אפרוח

Summary

Explore More Videos

Chapters in this video