המחברים מבקשים להודות לכל הסטודנטים במעבדה בטיחות מזון ומתנדבים שסייעו בעבודה זו. מחקר זה מומן על ידי מענק של משרד חקלאות אמריקנית הלאומית משולבת בטיחות מזון היוזמה (NIFSI) (פרס # 10,507,316).

1. עקומת סטנדרט <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שוקל אבקת ניאון 37.5 מ&quot;ג ולהתמוסס ב6 מיליליטר 200 אתנול הוכחה. הפוך דילולים סדרתי פי 2 מפתרון זה ב200 אתנול הוכחה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מערבולת את כל הדגימות ל10 שניות ולמדוד את הספיגה ב 370 ננומטר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לחשב את כמות אבקת ניאון לכל 1 מיליליטר 200 אתנול הוכחה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכן את עקומת הסטנדרט (ריכוז ב/ מיליליטר מ&quot;ג על ציר ה-Y והספיגה ב 370 ננומטר על ציר ה-x) כדי להדגים את הספיגה המבוססת על ריכוז אבקת ניאון. </li></ol> 2. לחסן מעדניית בשר (בולוניה) עם אבקת פלורסנט <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> חותכים את הבשר למעדנייה כ 100 מ&quot;מ דגימות עבות בעזרת סכין נקי וקרש חיתוך. הכן שלוש דגימות שכותרתו A, B, ו-C </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מדגם מעיל באופן שווה עם אבקת ניאון באמצעות ספוג לח מעט, נקי. מורחים את האבקה על מדגם הבשר באופן שווה. לא לחסן דגימות B ו-C עם אבקת הניאון. </li&gt; <li style=";text-align:right;direction:rtl"> עטוף את הדגימות בניילון נצמד ותווית המדגם מצופה אבקת ניאון כמו א &#39;ונותר שתי דגימות כB ו-C עם קלטת. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מניחים את הדגימות במקרה המעדנייה או במקרר שנערך ב 4 ° C במטבח המדומה שבו הניסוי יבוצע. </li></ol> 3. מוק מעדניית מטבח הכנה <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לספק כפפות נקיות ו70% תרסיס אתנול במטבח. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הר אורות פלורסנט קומפקטי שחורים עם 13 נורות W סביב אזור המבצע. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכן 5 ס&quot;מ X 5 ס&quot;מ חיתוך של נייר אלומיניום, כדי לשמש כתבנית לשטיפה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכן 15 מיליליטר צינורות המכילים 6 מיליליטר אתנול 95%. </li></ol> 4. הגדרת וידאו הר שלוש מצלמות וידאו במקומות אסטרטגיים כדי לשמור על כל תחומי המעדנייה מדומה באותו הזמן. הפעל את המצלמות לפני שמדמה את הליך מבצעה (כפי שהוסבר בפרוטוקול 5) ולנתח את התוצאות בו זמנית (כפיהסביר ב -7 לפרוטוקול). 5. מדמה נהלי מעדניית חיתוך כדי לעקוב אחר צלב זיהום על מנת לשפר את גודל מדגם ולשלב וריאציה, לבצע מחקר זה על ידי משתתפי גיוס לאחר אישור הפרוטוקול על ידי דירקטוריון סקירה המוסדית של המוסד המתאים. המשתתף יכול להיות סטודנט אשר עשוי או לא עשוי להיות ניסיון בעבודה בסביבות מעדנייה הקמעונאי. ודא כי כל משתתף לובש כפפות ברגע שהם נכנסים למעדנייה. קח את &quot;לפני&quot; תמונה תחת אור הניאון השחור ואחריו &quot;אחרי&quot; תמונה עם השלמת המחקר. לספק הוראות בכתב ובעל פה ברורה לכל משתתף באופן הבא: <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> עבור למקרר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסר את הבשר שכותרתו &quot;&quot;. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לגולל בשר ולשמור בניילון נצמד. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מניחים בשר על מגש כרכרה של מבצעה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Secure בשר עם אחיזת בשר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להפעיל מתג הפעלה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> התאם SLIידית מדד CER ל&quot; 2 &quot;. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> פורסים ולוותר על 5 חתיכות של בשר על גבי נייר מעדנייה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הפעל מתג כיבוי ולשחרר את אחיזת בשר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מניחים פרוסות בשר בשקית ניילון שכותרתו &quot;&quot;. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Rewrap בשר &quot;&quot; ולחזור למקרר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> חזור על שלבי 2-11 עם בשר שכותרתו &quot;B&quot; ו &quot;C&quot;. </li></ol> 6. פלורסנט אבקת כימות לכמת את אבקת הניאון לאחר השלמת החיתוך המדומה (סעיף 5.4) במטבח המעדנייה. לשם כך בצע את הפעולות הבאות: <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> השתמש x 5 תבנית סטרילי 5 סנטימטר סנטימטר רדיד האלומיניום ומניח אותו על האזורים המסומנים באיור 1. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> השתמש במטלית הכותנה אלגינט סידן סטרילי הספוגה ב95% אתנול, ספוגית באזור, ומקום ב6 אתנול מיליליטר 95% בצינור פוליפרופילן סטרילי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מערבולת הצינור ביסודיות והעברה לקובט זכוכית לקרוא את הספיגה ב 370 ננומטר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> עיין בstandarעקומת ד כדי לקבוע את כמות אבקת ניאון (Y) באמצעות המשוואה הבאה: y = mx + b כאשר x הוא ספיגה, מ &#39;הוא השיפוע של העקומה סטנדרטית, ואילו b הוא ליירט. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לנורמליזציה של נתונים, לחשב את האחוזים של אבקת ניאון לכל אזור נדגמו באמצעות הנוסחה הבאה: </li></ol><img src="/files/ftp_upload/51402/51402eq1.jpg" alt="פורמולה 1" /> 7. ניתוח וידאו קלטת וידאו את המשתתפים כלהשלים משימות שהם 5.1-5.12. לסנכרן ולשמור את קלטות וידאו לתקליטורי DVD, כך שניתן להציג את כל הזוויות באותו הזמן. צפה בסרטוני הווידאו כדי להקליט את מספר נגיעות יד (את מספר הפעמים מתנדבים לגעת אזורים במעדנייה מדומה) על משטחים שונים בסביבת המעדנייה (4 חוקרים שונים ינתחו את הנתונים מלאים להגדיר באופן עצמאי).

<ol>
	<li>Sheen, S., Hwang, C. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mathematical+modeling+the+cross-contamination+of+Escherichia+coli+O157:+H7+on+the+surface+of+ready-to-eat+meat+product+while+slicing.">Mathematical modeling the cross-contamination of Escherichia coli O157: H7 on the surface of ready-to-eat meat product while slicing.</a> Food Microbiol. 27, 37-43 (2010).</li><li>Crandall, P., Neal, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Minimizing+the+risk+of+Listeria+monocytogenes+in+retail+delis+by+developing+employee+focused,+cost+effective+training.">Minimizing the risk of Listeria monocytogenes in retail delis by developing employee focused, cost effective training.</a> Agric. Food Anal. Bacteriol. 1, 159-174 (2011).</li><li>Koo, O. K., Sirsat, S. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Physical+and+chemical+control+of+Salmonella+in+ready-to-eat+products.">Physical and chemical control of Salmonella in ready-to-eat products.</a> Agric. Food Anal. Bacteriol. 2, 56-68 (2012).</li><li>Hanning, I. B., Johnson, M. G., Ricke, S. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Precut+prepackaged+lettuce:+a+risk+for+listeriosis?.">Precut prepackaged lettuce: a risk for listeriosis?.</a> Foodborne Pathog. Dis. 5, 731-746 (2008).</li><li>Hanning, I. B., Nutt, J. D., Ricke, S. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Salmonellosis+outbreaks+in+the+United+States+due+to+fresh+produce:+sources+and+potential+intervention+measures.">Salmonellosis outbreaks in the United States due to fresh produce: sources and potential intervention measures.</a> Foodborne Pathog. Dis. 6, 635-648 (2008).</li><li>Zhu, M., Du, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Control+of+Listeria+monocytogenes+contamination+in+ready&#8208;to&#8208;eat+meat+products.">Control of Listeria monocytogenes contamination in ready&#8208;to&#8208;eat meat products.</a> Compr. Rev. Food Sci. Food Safety. 4, 34-42 (2005).</li><li>Lianou, A., Sofos, J. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+review+of+the+incidence+and+transmission+of+Listeria+monocytogenes+in+ready-to-eat+products+in+retail+and+food+service+environments.">A review of the incidence and transmission of Listeria monocytogenes in ready-to-eat products in retail and food service environments.</a> J. Food Protect. 70, 2172-2198 (2007).</li><li>. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitative+risk+assessment+of+relative+risk+to+public+health+from+foodborne+Listeria+monocytogenes+among+selected+categories+of+ready-to-eat+foods.">Quantitative risk assessment of relative risk to public health from foodborne Listeria monocytogenes among selected categories of ready-to-eat foods.</a> , .</li><li>Endrikat, S., Gallagher, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+comparative+risk+assessment+for+Listeria+monocytogenes+in+prepackaged+versus+retail-sliced+deli+meat.">A comparative risk assessment for Listeria monocytogenes in prepackaged versus retail-sliced deli meat.</a> J. Food Protect. 73, 612-619 (2010).</li><li>Pradhan, A. K., Ivanek, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+public+health+impact+of+Listeria+monocytogenes+product-to-product+and+environment-to-product+contamination+of+deli+meats+at+retail.">Comparison of public health impact of Listeria monocytogenes product-to-product and environment-to-product contamination of deli meats at retail.</a> J. Food Protect. 74, 1860-1868 (2011).</li><li>Jones, C. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Handwashing+Technique+Analysis.">Handwashing Technique Analysis.</a> Patent number 5900067. , (1999).</li><li>Gibson, K. E., Koo, O. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Observation+and+relative+quantification+of+cross-contamination+within+a+mock+retail+delicatessen+environment.">Observation and relative quantification of cross-contamination within a mock retail delicatessen environment.</a> Food Control. 31, 116-124 (2013).</li><li>Xiao, M., Zheng, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Method+and+System+for+Fecal+Detection.">Method and System for Fecal Detection.</a> Patent number 5821546. , (1998).</li><li>Waldroup, A., Kirby, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Method+and+System+for+Fecal+Detection.">Method and System for Fecal Detection.</a> Patent number 5621215. , (1997).</li><li>Ashby, K. D., Wen, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fluorescence+of+dietary+porphyrins+as+a+basis+for+real-time+detection+of+fecal+contamination+on+meat.">Fluorescence of dietary porphyrins as a basis for real-time detection of fecal contamination on meat.</a> J. Agric. Food Chem. 51, 3502-3507 (2003).</li><li>Cabrera-Diaz, E., Moseley, T. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fluorescent+protein+marked+Escherichia+coli+biotype+I+strains+as+surrogates+for+enteric+pathogens+in+validation+of+beef+carcass+interventions.">Fluorescent protein marked Escherichia coli biotype I strains as surrogates for enteric pathogens in validation of beef carcass interventions.</a> J. Food Protect. 72, 295-303 (2009).</li><li>Byrd, J., Hargis, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fluorescent+marker+for+the+detection+of+crop+and+upper+gastrointestinal+leakage+in+poultry+processing+plants.">Fluorescent marker for the detection of crop and upper gastrointestinal leakage in poultry processing plants.</a> Poult. Sci. 81, 70-74 (2002).</li><li>Vorst, K. L., Todd, E. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Transfer+of+Listeria+monocytogenes+during+mechanical+slicing+of+turkey+breast+bologna,+and+salami..">Transfer of Listeria monocytogenes during mechanical slicing of turkey breast bologna, and salami..</a> J. Food Protect. 69, 619-626 (2006).</li></ol>

אין ניגודי האינטרסים הכריזו.

המטרה הכללית של מחקר זה הייתה כדי להדגים כיצד זיהום לחצות חיידקים יכול להתרחש בסביבת מעדנייה הקמעונאי על מנת לפתח אסטרטגיות כדי לשלוט ולהפחית את הסיכון למחלה במזון. יש סביבת המעדנייה הקמעונאי סיכון גבוה במיוחד לL. חיידקי לזיהום. משרד החקלאות-FSIS דיווח כי יש בשר מ?...

זיהום צולב של פתוגנים במזון בסביבת הכנת המזון, ובמיוחד בסעיף הקמעונאי, הוא דאגה העיקרית בשל סיכון מוגבר למחלה במזון ממגוון רחב של מקורות, כולל בשרים, כמו גם הירקות 1-5. לרוב, חיידקים פתוגנים להיכנס לסביבה הקמעונאית באמצעות מוצרי מזון מזוהמים 6. מזונות מוכנים לאכילה שהוכנו ברמה הקמעונאית, הם מדאיגים במיוחד כמו בדרך כלל אין שום התערבות או טיפול (כלומר בישול או חימום) עוד לפני הצריכה 7. יתר על כן, לאחר מכן ניתן להעביר פתוגנים הווה על מזון RTE מזוהם למוצרי מזון אחרים או משטחי מגע עם מזון בסביבת קמעונאית. בעוד זיהום לחצות יכול להתרחש בתוך כמעט כל הסוג של סביבת קמעונאות מזון, מעדניות הן בעלי עניין מיוחד דווקא בגלל הקשר של מעדני בשר RTE עם monocytog יסטריה הפתוגןEnes 2. בהתבסס על הערכת סיכוני ניתוחים שנערכו על ידי הרשות האמריקנית למזון והתרופות אמריקניות (FDA) והמחלקה לבטיחות מזון חקלאות ופיקוח שירות (USDA-FSIS) בארה&quot;ב, מעדני בשר מזוהם צפוי אחראי ל90% ממקרים של ליסטריה - נדיר מחלות של בני אדם עדיין חמורות הנגרמות על ידי ל חיידקי - בארצות הברית 8. באופן כללי, מעדני בשר הפרוס במפעלי שירות הקמעונאי ואוכל היה קשור לסיכון גבוה יותר של L. חיידקי בהשוואה למעדני בשר presliced ​​במפעל בדק משרד החקלאות האמריקאי על ידי היצרן 9. זה יכול להיות בגלל הסבירות המוגברת של הקדמה של פתוגנים על ידי מפעיליו מזון, חומרי גלם נכנסים, או מזון מעובד שעשויה להיות מזוהם לאחר טיפול 7. בסך הכל, ליסטריה מהווה כ 28% ממקרי המוות שנגרמו על ידי מחלה המוערכת במזון בשנה בארה&quot;ב בגלל בסיכון מקומט של L. חיידקי לזיהום במעדני הבשר הפרוס ברמה הקמעונאית, מבצעה המעדנייה עצמו זוהה כגורם חשוב להעברת שטח של פתוגנים במזון בסביבה הקמעונאית 2,10. כפי שצוין על ידי 1 שין, חיתוך הוא צעד העיבוד האחרון שלפני הצריכה, ולכן מבצעה המעדנייה צריך להיחשב נקודת בקרה קריטית להבנה ומניעת זיהום צולב 1. המטרה הכללית של מחקר זה הייתה לפתח מתודולוגיה למעקב אחר זיהום בסביבת המעדנייה הקמעונאי באמצעות אבקת ניאון כגון Glo נבט. זהו מתחם ניאון שכבר נעשה שימוש כדי לדמות זיהום לחצות חיידקים ושיטות סניטריות 11,12. מחקר זה תוכנן כדי לעקוב אחר העברת הפתוגן מבשר מזוהם למבצעה, את סביבתו, ומעדני בשר אחר. זה חיוני כדי להבין את המסלולים של המשךamination לפתח שני התערבויות יעילות וחומר חינוכי לעובדים ולמנהלים הקמעונאי. גישה דומה יכולה להיות מועסק כדי לדמות העברת הפתוגן בסביבות אחרות עיבוד (לדוגמא עופות ובקר), חוות ובתי חולים.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="637">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="43">
			<td height="43" style="height:43px;width:216px;">Glo-Germ Powder</td>
			<td style="width:71px;">Glo Germ Co</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;">Purchased from vendor</td>
			<td style="width:64px;"></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">Ethanol</td>
			<td style="width:71px;">Sigma</td>
			<td style="width:119px;">E7023</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">Permanent markets</td>
			<td style="width:71px;">Sharpie</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td colspan="2">Purchased from stationary store</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">Gloves</td>
			<td style="width:71px;">VWR</td>
			<td style="width:119px;">82026-424</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">Deli Meat</td>
			<td style="width:71px;">NA</td>
			<td style="width:119px;">NA</td>
			<td colspan="2">Bologna Chub from regular grocery store</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">Cutting Board</td>
			<td style="width:71px;">NA</td>
			<td style="width:119px;">NA</td>
			<td colspan="2">A regukar kitchen cutting board</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">Knife</td>
			<td style="width:71px;">NA</td>
			<td style="width:119px;">NA</td>
			<td>A regular kitchen knife&#160;</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">5 x 5 cm sterile templates</td>
			<td style="width:71px;">NA</td>
			<td style="width:119px;">NA</td>
			<td colspan="2">Aluminium foil templates cut into 5x 5 cm templates and sterilized&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="43">
			<td height="43" style="height:43px;width:216px;">15 ml polypropylene centrifuge tubes</td>
			<td style="width:71px;">VWR</td>
			<td style="width:119px;">89039-664</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">Cotton swabs</td>
			<td style="width:71px;">Puritan</td>
			<td style="width:119px;">25-806</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">Glass cuvettes</td>
			<td style="width:71px;">VWR</td>
			<td style="width:119px;">470019-186</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">Vortex</td>
			<td style="width:71px;">VWR</td>
			<td style="width:119px;">58816-121</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="43">
			<td height="43" style="height:43px;width:216px;">Flip camera</td>
			<td style="width:71px;">Flip Ultra HD</td>
			<td style="width:119px;">NA</td>
			<td>Purchased online</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">Deli slicer</td>
			<td style="width:71px;">Bizerba</td>
			<td style="width:119px;">SE-12</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="43">
			<td height="43" style="height:43px;width:216px;">Deli refrigerator</td>
			<td style="width:71px;">True company</td>
			<td style="width:119px;">TDBD-722</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">Scale</td>
			<td style="width:71px;"></td>
			<td style="width:119px;">NA</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="85">
			<td height="85" style="height:85px;width:216px;">Spectrophotometer</td>
			<td style="width:71px;">Milton Roy Spectronic 20D</td>
			<td style="width:119px;">NA</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

tracking microbial contamination in retail environments using fluorescent powder - a retail delicatessen environment example

זיהום צולב של פתוגנים במזון בסביבה הקמעונאית הוא בעיה משמעותית בבריאות הציבור לתרום לסיכון מוגבר למחלה במזון. מזון מוכן לאכילה (RTE) מעובד כגון מעדני בשר, גבינה, ובמקרים מסוימים תוצרת טרייה, היה מעורב בהתפרצות מחלות במזון עקב זיהום עם פתוגנים כגון חיידקי ליסטריה. עם כל כבוד לL. חיידקי, מכונה לחיתוך בשר מעדנייה הם לעתים קרובות המקור העיקרי של זיהום לחצות. מטרתו של מחקר זה הייתה להשתמש במתחם ניאון כדי לדמות זיהום חיידקים ולעקוב אחר זיהום זה בסביבה קמעונאית. מטבח מעדנייה מדומה שנועד לדמות את סביבת קמעונאית. בשר המעדנייה היה מחוסן עם מתחם הניאון ומתנדבים גויסו כדי להשלים סדרה של משימות דומה לאלה צפויים של עובד קמעונאות מזון. המתנדבים קבלו הוראה לחתוך, חבילה, ולאחסן את הבשר במקרר מעדנייה. הפוטנציאלזיהום לחצות היה במעקב בסביבה הקמעונאית מדומה על ידי ניגוב אזורים ספציפיים ומדידת הצפיפות האופטית של אזור swabbed עם ספקטרופוטומטר. התוצאות הצביעו על כך שאחיזת המקרר (כלומר מעדנייה מקרה) ובאזורים שונים במבצע היו בסיכון הגבוה ביותר לזיהום לחצות. התוצאות של מחקר זה עשויות לשמש לפיתוח חומרי הדרכה ממוקדים יותר לעובדים הקמעונאי. בנוסף, יכולים לשמש גם מתודולוגיות דומות כדי לעקוב אחר זיהום מיקרוביאלי בסביבות ייצור מזון (למשל משקים קטנים), בתי חולים, בתי אבות, ספינות שייט, ובתי מלון.

איור 1 מייצג את תחומי המבצע שחוטאו לאחר המתנדבים השלימו את המשימות שהוקצו. המתנדבים צולמו בוידאו כדי לנתח את התדירות של מגע יד הממוצעת על אלה משטחים שונים. התדירות של מגע יד נותחה על ידי ארבעה משקיפים שונים וממוצעת. תוצאות אלה הראו באיור 2. הנתונים מר...

Watch this Scientific Journal Video about Tracking Microbial Contamination in Retail Environments Using Fluorescent Powder - A Retail Delicatessen Environment Example at JoVE.com

Tracking Microbial Contamination in Retail Environments Using Fluorescent Powder - A Retail Delicatessen Environment Example

המטרה הכללית של מחקר זה הייתה כדי להדגים את מנגנון זיהום לחצות הפוטנציאלי של חיידקי ליסטריה הפתוגן במזון בהגדרת מעדנייה הקמעונאי. מתודולוגיה זו ניתן ליישם במגוון רחב של סביבות שונות כדי לעקוב אחר זיהום הפתוגן.

מעקב מיקרוביאלית זיהום בסביבות קמעונאיות באמצעות פלורסנט אבקה - קמעונאות מעדני סביבת דוגמא

Cross contamination of foodborne pathogens in the retail environment is a significant public health issue contributing to an increased risk for foodborne ...

tracking-microbial-contamination-retail-environments-using

Research

JoVE Journal

Environment

11.0K Views.  University of Houston.  המטרה הכללית של מחקר זה הייתה כדי להדגים את מנגנון זיהום לחצות הפוטנציאלי של חיידקי ליסטריה הפתוגן במזון בהגדרת מעדנייה הקמעונאי. מתודולוגיה זו ניתן ליישם במגוון רחב של סביבות שונות כדי לעקוב אחר זיהום הפתוגן. 

Video: Tracking Microbial Contamination in Retail Environments Using Fluorescent Powder - A Retail Delicatessen Environment Example

Determination of Microbial Extracellular Enzyme Activity in Waters, Soils, and Sediments using High Throughput Microplate Assays

Much of the nutrient cycling and carbon processing in natural environments occurs through the activity of extracellular enzymes released by microorganisms. Thus, measurement of the activity of these extracellular enzymes can give insights into the rates of ecosystem level processes, such as organic matter decomposition or nitrogen and phosphorus mineralization. Assays of extracellular enzyme activity in environmental samples typically involve exposing the samples to artificial colorimetric or fluorometric substrates and tracking the rate of substrate hydrolysis. Here we describe microplate based methods for these procedures that allow the analysis of large numbers of samples within a short time frame. Samples are allowed to react with artificial substrates within 96-well microplates or deep well microplate blocks, and enzyme activity is subsequently determined by absorption or fluorescence of the resulting end product using a typical microplate reader or fluorometer. Such high throughput procedures not only facilitate comparisons between spatially separate sites or ecosystems, but also substantially reduce the cost of such assays by reducing overall reagent volumes needed per sample.

Microplate based procedures are described for the colorimetric or fluorometric analysis of extracellular enzyme activity. These procedures allow for the rapid assay of such activity in large numbers of environmental samples within a manageable time frame.

קביעת מיקרוביאלית התאית אנזים הפעילות במים, קרקעות, ומשקעים באמצעות מבחני Microplate תפוקה גבוהה

Much of the nutrient cycling and carbon  processing in natural environments occurs through the activity of extracellular  enzymes released by ...

Technique for Studying Arthropod and Microbial Communities within Tree Tissues

Phloem tissues of pine are habitats for many thousands of organisms. Arthropods and microbes use phloem and cambium tissues to seek mates, lay eggs, rear young, feed, or hide from natural enemies or harsh environmental conditions outside of the tree. Organisms that persist within the phloem habitat are difficult to observe given their location under bark. We provide a technique to preserve intact phloem and prepare it for experimentation with invertebrates and microorganisms. The apparatus is called a &#8216;phloem sandwich&#8217; and allows for the introduction and observation of arthropods, microbes, and other organisms. This technique has resulted in a better understanding of the feeding behaviors, life-history traits, reproduction, development, and interactions of organisms within tree phloem. The strengths of this technique include the use of inexpensive materials, variability in sandwich size, flexibility to re-open the sandwich or introduce multiple organisms through drilled holes, and the preservation and maintenance of phloem integrity. The phloem sandwich is an excellent educational tool for scientific discovery in both K-12 science courses and university research laboratories.

We provide a technique to preserve intact tree phloem and prepare it for observation. We create an apparatus called a phloem sandwich that allows for the introduction and observation of arthropods, microbes, and other organisms that inhabit phloem tissues.

טכניקת לימוד של פרוקים-רגליים וקהילות חיידקים בתוך רקמות עץ

Phloem tissues of pine are habitats for many thousands of organisms.  Arthropods and microbes use phloem and cambium tissues to seek mates, lay eggs, rear ...

An Aquatic Microbial Metaproteomics Workflow: From Cells to Tryptic Peptides Suitable for Tandem Mass Spectrometry-based Analysis

Meta-omic technologies such as metagenomics, metatranscriptomics and metaproteomics can aid in the understanding of microbial community structure and metabolism. Although powerful, metagenomics alone can only elucidate functional potential. On the other hand, metaproteomics enables the description of the expressed in situ metabolism and function of a community. Here we describe a protocol for cell lysis, protein and DNA isolation, as well as peptide digestion and extraction from marine microbial cells collected on a cartridge filter unit (such as the Sterivex filter unit) and preserved in an RNA stabilization solution (like RNAlater). In mass spectrometry-based proteomics studies, the identification of peptides and proteins is performed by comparing peptide tandem mass spectra to a database of translated nucleotide sequences. Including the metagenome of a sample in the search database increases the number of peptides and proteins that can be identified from the mass spectra. Hence, in this protocol DNA is isolated from the same filter, which can be used subsequently for metagenomic analysis.

This protocol is for the extraction and concentration of protein and DNA from microbial biomass collected from seawater, followed by the generation of tryptic peptides suitable for tandem mass spectrometry-based proteomic analysis.

Metaproteomics זרימת עבודה Aquatic מיקרוביאלית: מתאים לtryptic פפטידים מתאימים לניתוח מבוסס ספקטרומטריית מסת טנדם

Meta-omic technologies such as metagenomics, metatranscriptomics and metaproteomics can aid in the understanding of microbial community structure and ...

Extraction and Analysis of Microbial Phospholipid Fatty Acids in Soils

Phospholipid fatty acids (PLFAs) are key components of microbial cell membranes. The analysis of PLFAs extracted from soils can provide information about the overall structure of terrestrial microbial communities. PLFA profiling has been extensively used in a range of ecosystems as a biological index of overall soil quality, and as a quantitative indicator of soil response to land management and other environmental stressors.
The standard method presented here outlines four key steps: 1. lipid extraction from soil samples with a single-phase chloroform mixture, 2. fractionation using solid phase extraction columns to isolate phospholipids from other extracted lipids, 3. methanolysis of phospholipids to produce fatty acid methyl esters (FAMEs), and 4. FAME analysis by capillary gas chromatography using a flame ionization detector (GC-FID). Two standards are used, including 1,2-dinonadecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (PC(19:0/19:0)) to assess the overall recovery of the extraction method, and methyl decanoate (MeC10:0) as an internal standard (ISTD) for the GC analysis.

Phospholipid fatty acids provide information about the structure of soil microbial communities. We present methods for extraction from soil samples with a single-phase chloroform mixture, fractionation of extracted lipids using solid phase extraction columns, and methanolysis to produce fatty acid methyl esters, which are analyzed by capillary gas chromatography.

הפקה וניתוח של פוספוליפידים מיקרוביאלית חומצות שומן בקרקעות

Phospholipid fatty acids (PLFAs) are key components of microbial cell membranes. The analysis of PLFAs extracted from soils can provide information about ...

Sampling, Sorting, and Characterizing Microplastics in Aquatic Environments with High Suspended Sediment Loads and Large Floating Debris

The ubiquitous presence of plastic debris in the ocean is widely recognized by the public, scientific communities, and government agencies. However, only recently have microplastics in freshwater systems, such as rivers and lakes, been quantified. Microplastic sampling at the surface usually consists of deploying drift nets behind either a stationary or moving boat, which limits the sampling to environments with low levels of suspended sediments and floating or submerged debris. Previous studies that employed drift nets to collect microplastic debris typically used nets with &#8805;300 &#181;m mesh size, allowing plastic debris (particles and fibers) below this size to pass through the net and elude quantification. The protocol detailed here enables: 1) sample collection in environments with high suspended loads and floating or submerged debris and 2) the capture and quantification of microplastic particles and fibers &lt;300 &#181;m. Water samples were collected using a peristaltic pump in low-density polyethylene (PE) containers to be stored before filtering and analysis in the lab. Filtration was done with a custom-made microplastic filtration device containing detachable union joints that housed nylon mesh sieves and mixed cellulose ester membrane filters. Mesh sieves and membrane filters were examined with a stereomicroscope to quantify and separate microplastic particulates and fibers. These materials were then examined using a micro-attenuated total reflectance Fourier transform infrared spectrometer (micro ATR-FTIR) to determine microplastic polymer type. Recovery was measured by spiking samples using blue PE particulates and green nylon fibers; percent recovery was determined to be 100% for particulates and 92% for fibers. This protocol will guide similar studies on microplastics in high velocity rivers with high concentrations of sediment. With simple modifications to the peristaltic pump and filtration device, users can collect and analyze various sample volumes and particulate sizes.

Most microplastic research to date has occurred in marine systems where suspended solid levels are relatively low. Focus is now shifting to freshwater systems, which may feature high sediment loads and floating debris. This protocol addresses collecting and analyzing microplastic samples from aquatic environments that contain high suspended solid loads.

דגימה, מיון של אפיון Microplastics בסביבות מימיות עם המון משקעים מושעה גבוהה ופסולת צף גדול

The ubiquitous presence of plastic debris in the ocean is widely recognized by the public, scientific communities, and government agencies. However, only ...

Detection of 3-Nitrotyrosine in Atmospheric Environments via a High-performance Liquid Chromatography-electrochemical Detector System

3-nitrotyrosine (3-NT) is generated from the tyrosine residue in atmospheric bio-aerosol proteins via a reaction with ozone (O3) and nitrogen dioxide (NO2). Stable 3-NT is a specific marker for oxidative damage and is reported to have a promotive effect to elicit allergies. In the present study, we report the development of a highly sensitive assay to quantify 3-NT in air sampler filters to collect &#60; 2.5 &#181;m of particulate matter (PM2.5) from urban environmental air, including bio-aerosol. In this method, a 6 mm-diameter round hole was cut from the filters of air samplers and mixed with a nonspecific protease cocktail in order to hydrolyze proteins. Protein samples digested to the amino acid level were tested for 3-NT using a high-performance liquid chromatography-electrochemical detector (HPLC-ECD). The maximum 3-NT content was detected in a prefilter for PM of sizes from 4.5 to 7.3 &#956;m, with a detection limit of 1.13 pg/m3.

Detection of 3-Nitrotyrosine in Atmospheric Environments via a High-performance Liquid Chromatography-electrochemical Detector System

We present a method to detect 3-nitrotyrosine chemical modifications of atmospheric proteins with 6 mm-diameter rounds cut from air sampler prefilters using a high-performance liquid chromatography-electrochemical detector (HPLC-ECD).

זיהוי של 3-Nitrotyrosine סביבות אטמוספרי דרך ביצועים גבוהים מערכת גלאי אלקטרוכימי-כרומטוגרפיה נוזלית

3-nitrotyrosine (3-NT) is generated from the tyrosine residue in atmospheric bio-aerosol proteins via a reaction with ozone (O3) and nitrogen dioxide ...

Fluorescently Labeled Bacteria as a Tracer to Reveal Novel Pathways of Organic Carbon Flow in Aquatic Ecosystems

Elucidating trophic interactions, such as predation and its effects, is a frequent task for many researchers in ecology. The study of microbial communities has many limitations, and determining a predator, prey, and predatory rates is often difficult. Presented here is an optimized method based on the addition of fluorescently labelled prey as a tracer, which allows for reliable quantitation of the grazing rates in aquatic predatory eukaryotes and estimation of nutrient transfer to higher trophic levels.

Presented here is a protocol for a single-cell, epifluorescence microscopy-based technique to quantify grazing rates in aquatic predatory eukaryotes with high precision and taxonomic resolution.

בקטריה מתויג חיידקים כנותב כדי לחשוף מסלולים הרומן של זרימת פחמן אורגנית במסגרת אקולוגית מימיים

Elucidating trophic interactions, such as predation and its effects, is a frequent task for many researchers in ecology. The study of microbial ...

Enrichment and Detection of Clostridium perfringens Toxinotypes in Retail Food Samples

Clostridium perfringens (C. perfringens) is a prolific toxin producer and causes a wide range of diseases in various hosts. C. perfringens is categorized into five different toxinotypes, A through E, based on the carriage of four major toxin genes. The prevalence and distribution of these various toxinotypes is understudied, especially their pervasiveness in American retail food. Of particular interest to us are the type B and D strains, which produce epsilon toxin, an extremely lethal toxin suggested to be the environmental trigger of multiple sclerosis in humans. To evaluate the presence of different C. perfringens toxinotypes in various food samples, we developed an easy method to selectively culture these bacteria without the use of an anaerobic container system only involving three culturing steps. Food is purchased from local grocery stores and transported to the laboratory under ambient conditions. Samples are minced and inoculated into modified rapid perfringens media (RPM) and incubated overnight at 37 &#176;C in a sealed, airtight conical tube. Overnight cultures are inoculated onto a bottom layer of solid Tryptose Sulfite Cycloserine (TSC) agar, and then overlaid with a top layer of molten TSC agar, creating a &#34;sandwiched&#34;, anaerobic environment. Agar plates are incubated overnight at 37 &#176;C and then evaluated for appearance of black, sulfite-reducing colonies. C. perfringens-suspected colonies are removed from the TSC agar using sterile eye droppers, and inoculated into RPM and sub-cultured overnight at 37 &#176;C in an airtight conical tube. DNA is extracted from the RPM subculture, and then analyzed for the presence of C. perfringens toxin genes via polymerase chain reaction (PCR). Depending on the type of food sampled, typically 15&#8211;20% of samples test positive for C. perfringens.

Enrichment and Detection of Clostridium perfringens Toxinotypes in Retail Food Samples

The objective of this protocol is to detect different Clostridium perfringens toxinotypes in locally purchased foods, particularly epsilon toxin producing strain types B and D, without the use of anaerobic chambers.

העשרה ואיתור הפרסטרידיום של רעלים בדגימות מזון קמעונאי

Clostridium perfringens (C. perfringens) is a prolific toxin producer and causes a wide range of diseases in various hosts. C. perfringens is categorized ...

In Situ Chemotaxis Assay to Examine Microbial Behavior in Aquatic Ecosystems

Microbial behaviors, such as motility and chemotaxis (the ability of a cell to alter its movement in response to a chemical gradient), are widespread across the bacterial and archaeal domains. Chemotaxis can result in substantial resource acquisition advantages in heterogeneous environments. It also plays a crucial role in symbiotic interactions, disease, and global processes, such as biogeochemical cycling. However, current techniques restrict chemotaxis research to the laboratory and are not easily applicable in the field. Presented here is a step-by-step protocol for the deployment of the in situ chemotaxis assay (ISCA), a device that enables robust interrogation of microbial chemotaxis directly in the natural environment. The ISCA is a microfluidic device consisting of a 20 well array, in which chemicals of interest can be loaded. Once deployed in aqueous environments, chemicals diffuse out of the wells, creating concentration gradients that microbes sense and respond to by swimming into the wells via chemotaxis. The well contents can then be sampled and used to (1) quantify strength of the chemotactic responses to specific compounds through flow cytometry, (2) isolate and culture responsive microorganisms, and (3) characterize the identity and genomic potential of the responding populations through molecular techniques. The ISCA is a flexible platform that can be deployed in any system with an aqueous phase, including marine, freshwater, and soil environments.

Presented here is the protocol for an in situ chemotaxis assay, a recently developed microfluidic device that enables studies of microbial behavior directly in the environment.

ב סיטו Chemotaxis אסאי לבחון התנהגות מיקרוביאלית במערכות אקולוגיות מימיות

Microbial behaviors, such as motility and chemotaxis (the ability of a cell to alter its movement in response to a chemical gradient), are widespread ...

Evaluating the Impact of Hydraulic Fracturing on Streams using Microbial Molecular Signatures

Hydraulic fracturing (HF), commonly called &#34;fracking&#34;, uses a mixture of high-pressure water, sand, and chemicals to fracture rocks, releasing oil and gas. This process revolutionized the U.S. energy industry, as it gives access to resources that were previously unobtainable and now produces two-thirds of the total natural gas in the United States. Although fracking has had a positive impact on the U.S. economy, several studies have highlighted its detrimental environmental effects. Of particular concern is the effect of fracking on headwater streams, which are especially important due to their disproportionately large impact on the health of the entire watershed. The bacteria within those streams can be used as indicators of stream health, as the bacteria present and their abundance in a disturbed stream would be expected to differ from those in an otherwise comparable but undisturbed stream. Therefore, this protocol aims to use the bacterial community to determine if streams have been impacted by fracking. To this end, sediment, and water samples, from streams near fracking (potentially impacted) and upstream or in a different watershed of fracking activity (unimpacted) must be collected. Those samples are then subjected to nucleic acid extraction, library preparation, and sequencing to investigate microbial community composition. Correlational analysis and machine learning models can subsequently be employed to identify which features are explanative of variation in the community, as well as identification of predictive biomarkers for fracking&#39;s impact. These methods can reveal a variety of differences in the microbial communities among headwater streams, based on the proximity to fracking, and serve as a foundation for future investigations on the environmental impact of fracking activities.

Here, we present a protocol to investigate the impacts of hydraulic fracturing on nearby streams by analyzing their water and sediment microbial communities.

הערכת ההשפעה של שבירה הידראולית על נחלים באמצעות חתימות מולקולריות מיקרוביאליות

Hydraulic fracturing (HF), commonly called &#34;fracking&#34;, uses a mixture of high-pressure water, sand, and chemicals to fracture rocks, releasing oil ...