המחברים מודים Kendrea Focht, CScD, CCC-SLP, ואוולין Trammell המכון לקול ובליעה באוניברסיטה הרפואית של דרום קרוליינה, לשיתוף קבצי MBS הדמיה משמשים כדי להדגים במתודולוגיה זו. נתוני MBS אלו נאספו באמצעות תמיכה מחוץ לכותל ממומנת על ידי גרנט מספר TL1TR000061 (PI: Focht) מהמרכז הלאומי לקידום מדעי Translational ועל ידי גרנט מספר 1K24DC12801 (PI: מרטין האריס) מהמכון הלאומי לחירשות והפרעות תקשורת אחרות, ו תמיכת חומות ממארק ואוולין Trammell האמון. שיטות אלו פותחו במקור על ידי החוקר הראשי בזמן שנתמך על ידי גרנט מספר F31DC011705 מהמכון הלאומי לחירשות והפרעות תקשורת אחרות. התוכן הוא באחריות בלעדית של הכותבים ולא בהכרח מייצג את הדעות הרשמיות של המכון הלאומי לחירשות והפרעות תקשורת אחרות או המכון הלאומיבריאות.

1. הגדרת תצורה של מחשב <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> למקינטוש, להוריד את הקוד פתוח או תוכנה חופשית הבאים: ImageJ, MacX ממיר וידאו חינם Edition (Mac), וQuickTime (ראה טבלה של חומר / ציוד). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להורדה למחשב, הקוד פתוח או תוכנה חופשית הבאים: ImageJ, MPEG Streamclip (PC), וQuickTime (ראה טבלה של חומר / ציוד). </li></ol> 2. הכנת סרטוני וידאו <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> המרת קובץ. להמיר קבצי וידאו גולמיים ל. mov לאיסוף נתונים בImageJ. הערה: קטעי וידאו שמישים צריכים לכלול את חיך הלסת התחתונה, קשה, C1-C4 חוליות, גרון ולוע בשדה הראייה. כלים לעיבוד ImageJ יכולים לשפר את בעיות איכות תמונה. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> עם מחשב, השתמש MPEG Streamclip, לטעון את קובץ וידאו. Avi הגלם באמצעות קובץ &gt;&gt; לפתוח קבצים ובחירת הסרטון הרצוי. בחר קובץ &gt;&gt; יצוא ל-QuickTime. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> עם מק, השתמש MacX ממיר וידאו, לחץ על &quot;הוסף קובץ&quot; ובחר וידאו (ים) לשיתוףnversion. ניתן להמיר קטעי וידאו מרובים בשימוש ביישום זה פעם אחת. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בסעיף הגדרות פלט, לחץ על כפתור Browse ולבחור את המיקום הרצוי לשמירת הקובץ המומר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לחץ על לשונית &quot;לMOV&quot;. ודא פורמט הפלט תחת סעיף &quot;הגדרות וידאו&quot; הוא MOV. לחץ על התחל. </li></ol></li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> אורך סרטון עריכה. זיכרון מוגבל עם ImageJ. מומלץ שקובץ של כל לבלוע להתבצע. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> MOV הפתוח. קובץ וידאו שנוצר בשלב 2.1 באמצעות QuickTime (PC או MAC). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> זהה 5 מיליליטר סנוניות דק נוזל ופודינג ידי תורי אודיו או על ידי רצף סנונית שהותווה על ידי פרוטוקול MBS משמש במהלך איסוף הנתונים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בחר Edit &gt;&gt; Trim ולהתאים את סרגל זמירה כך שסנונית נוזל 5 מיליליטר כל דקה היא מדמיין. לחץ לקצץ. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בחר באפשרות יצוא קובץ &gt;&gt; וליצור שם קובץ שישמש לקשר נתונים נושא (מין, גיל, אטיולוגיה, סוג בולוס) לסמנכ&quot;ל תפעולrdinate תוצאות מיפוי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> חזור לסנונית הפודינג (או לכל בולוס נוסף של ריבית). </li></ol></li></ol> 3. De-זיהוי תמונות <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> אם קובץ מכיל כל מידע אישי בריאות (אובדן כושר עבודה) וצריך להיות דה מזוהה, להעלות את הקובץ באמצעות התמונה J (ראה 4.1-4.2). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> השתמש בכלי המלבן למסגרת מחקר הבליעה להוציא אובדן כושר עבודה. בחר לחתוך את התמונה. &gt;&gt; לאחר מכן בחר קובץ &gt;&gt; שמירה בשם &gt;&gt; QuickTime סרט. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הגדר את תיבת הדיאלוג כדלקמן: דחיסת &gt;&gt; סורנסון 3; איכות &gt;&gt; מקסימאלי, להיכנס לקצב המתאים המסגרת (בדרך כלל 30 fps). </li></ol> 4. הכנה למדידה <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ImageJ הפתוח. לחץ על הסמל &quot;&gt;&gt;&quot; בסרגל הכלים. בחר &gt;&gt; כלי סימון חץ. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> העלאת תמונות. לחץ על סמל QuickTime. בחר באפשרות &quot;סרט פתח כערימה&quot; מתפריט הנפתח ולאתר סרטון QuickTime ערוך. אמאge J לא יפתח את מחקר הסנונית כולו בשל מגבלות זיכרון (ראה שלב 2.2). זיכרון ניתן להרחבה מינימאלית על ידי בחירת Edit &gt;&gt; אפשרויות &gt;&gt; זיכרון ואשכולות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> עיבוד תמונות כדי לשפר את איכות תמונה. תהליך בחירת &gt;&gt; מתמטיקה &gt;&gt; הוסף. בדוק את תיבת התצוגה המקדימה ולהתאים את המספרים לאיכות תמונה רצויה. תגובה כן לעבד את כל הערימה של תמונות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הגדרת מדידות. בחר לנתח &gt;&gt; מדידות סט מתפריט ImageJ. בסימן תיבת הדיאלוג &quot;סטאק עמדה&quot; ו &quot;קואורדינטות מרחב Y&quot;. הכל בטל סימון אחר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בחר את הכלי מרובת מסרגל הכלים. לחץ על ציוני דרך אנטומיים ברצף (ראה 5.0) </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שימוש באפשרות מרובת האתרים. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> קח מדידה של כל הנקודות על ידי בחירת מדד לנתח &gt;&gt; מהתפריט או פקודת המקלדת + M (השליטה + M למחשבים). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסר את כל נקודות עם הפקודה + (שליטה + עבור מחשבים אישיים). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסרת נקודות בודדות על ידי מרחף over נקודה, ואז להחזיק את מפתחות הפקודה האפשרות ולחץ על הנקודה שיש להסירו. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להעביר נקודתי סינגולריות ידי ריחוף מעל נקודה, לחיצה, גרירה ושחרור של הצבע על מיקום חדש. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להעביר את כל הנקודות יחד עם מקשי חצים. </li></ol></li></ol> 5. ציוני דרך המיפוי <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בגין במסגרת הראשונה ולהתקדם למסגרת ברורה בשלב טרום הפה. שים לב לעמדתו של בולוס בשוליים הקדמי, מעולים של הלשון לפני תחילת התחבורה האוראלית של הסנונית. השתמש במסגרת זו כדי להגדיר תשע הקואורדינטות הראשונות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> השתמש בכלי ריבוי נקודות ImageJ למפה תשע הקואורדינטות הראשונות בציונים דרך אנטומיים הבאים (ראה 3 א ו 3 ב דמויות) </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הקלט תשע קואורדינטות הראשונות באמצעות הפקודה + M מפתחות (שליטה + M למחשבים). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מראש מסגרות עד הגיעה לעצם לשון עמדה המרבית בקדמי וכיוונים מעולים. לאשר מרבי על ידי קידום מסגרות לכל הפרטיםהירידה של יור hyoid מתחילה במסגרת הבאה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שינוי מיקום נקודות 5 - 1 לתפקידים החדשים שלהם. תפקידים החדשים אלה יירשמו כמרכזת 10-14. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להעביר 9 פוינט, אשר בתורו הופך לתאם 18 הערה:. מסגרות צפויות להשתנות לשתי השלבים הבאים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> אתר מתארות את גובה מסגרת מקסימאלי בגרון. התאם נקודות 7 ו -8, אשר ישמשו כמרכזת 16 ו17. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מצא את המסגרת (ים) המייצגת את הטיול המרבי של UES, הצבע 6 (לתאם 15). ממסגרת hyoid המרבית, אתר שבו מסגרת בולוס היא הקשתה על ידי UES בhypopharynx. התאם לתאם נקודה לUES ממסגרת מינימאלית כדי לייצג את מקסימום UES לתאם 18. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הקלט תשע קואורדינטות השניה באמצעות הפקודה + M מפתחות (שליטה + M למחשבים). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לקואורדינטות 19 ו20 לסמן את הקצוות של סקלר (אגורה או 1.9 טבעת סנטימטר) בציר המייצג את הקוטר הארוך ביותר של סמן radiopaque. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שיא סקלר קואורדינטות באמצעות מפתח M + פיקודs (שליטה + M למחשבים). </li></ol> 6. להפוך לתאם נתונים למדידות kinematic של עניין באמצעות מאקרו אפשר קובץ אקסל (ההוראות למקרו זה כלולים בקובץ) הערה: חישובים טריגונומטריות שנעוצים בפקודות מאקרו לחשב מדידות kinematic (איור 4). <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הורד &quot;CoordinateMapping.xlsm&quot; מהעמוד המאמר יופיטר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> עקוב אחר הוראות בגיליון האלקטרוני כדי לאתחל את הקובץ. מאקרו האתחול ייצור שלושה גיליונות ובם: תוצאות, נתונים, וגיליונות. הערה: משתמשי מקינטוש צריכים לאפשר כלי פיתוח ב-Excel כדי להפעיל פקודות מאקרו. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> העתק קואורדינטות מחלון תוצאות ImageJ ולהדביק לתוך התא המיועד ב&quot; גיליונות &quot;. הפעל את המאקרו &quot;datacaptureline&quot;. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> תוצאות יופיעו בגיליון &quot;תוצאות&quot;. שורות של נתונים לתאם יופיעו בגיליון &quot;נתונים&quot;. </li></ol>

<ol>
	<li>Leonard, R. J., Kendall, K. A., McKenzie, S., Gon&#231;alves, M. I., Walker, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Structural+Displacements+in+Normal+Swallowing:+A+Videofluoroscopic+Study.">Structural Displacements in Normal Swallowing: A Videofluoroscopic Study.</a> Dysphagia. 15, 146-152 (2000).</li><li>Molfenter, S. M., Steele, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Physiological+Variability+in+the+Deglutition+Literature:+Hyoid+and+Laryngeal+Kinematics.">Physiological Variability in the Deglutition Literature: Hyoid and Laryngeal Kinematics.</a> Dysphagia. 26, 67-74 (2010).</li><li>Pearson, W. G., Hindson, D. F., Langmore, S. E., Zumwalt, A. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evaluating+Swallowing+Muscles+Essential+for+Hyolaryngeal+Elevation+by+Using+Muscle+Functional+Magnetic+Resonance+Imaging.">Evaluating Swallowing Muscles Essential for Hyolaryngeal Elevation by Using Muscle Functional Magnetic Resonance Imaging.</a> International Journal of Radiation Oncology* Biology* Physics. 85, 735-740 (2013).</li><li>Pearson, W. G., Langmore, S. E., Yu, L. B., Zumwalt, A. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Structural+Analysis+of+Muscles+Elevating+the+Hyolaryngeal+Complex.">Structural Analysis of Muscles Elevating the Hyolaryngeal Complex.</a> Dysphagia. 27, 445-451 (2012).</li><li>Kim, Y., McCullough, G. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Maximum+hyoid+displacement+in+normal+swallowing.">Maximum hyoid displacement in normal swallowing.</a> Dysphagia. 23, 274-279 (2008).</li><li>Steele, C. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+relationship+between+hyoid+and+laryngeal+displacement+and+swallowing+impairment.">The relationship between hyoid and laryngeal displacement and swallowing impairment.</a> Clin. Otolaryngol. 36, 30-36 (2011).</li><li>Logemann, J. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Temporal+and+Biomechanical+Characteristics+of+Oropharyngeal+Swallow+in+Younger+and+Older+Men.">Temporal and Biomechanical Characteristics of Oropharyngeal Swallow in Younger and Older Men.</a> Journal of Speech, Language and Hearing Research. 43, 1264-1274 (2000).</li><li>Pearson, W., Langmore, S., Zumwalt, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evaluating+the+Structural+Properties+of+Suprahyoid+Muscles+and+their+Potential+for+Moving+the+Hyoid.">Evaluating the Structural Properties of Suprahyoid Muscles and their Potential for Moving the Hyoid.</a> Dysphagia. 26, 345-351 (2011).</li><li>Hopkins, W. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Measures+of+reliability+in+sports+medicine+and+science.">Measures of reliability in sports medicine and science.</a> Sports Med. 30, 1-15 (2000).</li><li>Bingjie, L., Zhang, T., Sun, X., Xu, J., Jiang, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitative+videofluoroscopic+analysis+of+penetration-aspiration+in+post-stroke+patients.">Quantitative videofluoroscopic analysis of penetration-aspiration in post-stroke patients.</a> Neurol. India. 58, 42-47 (2010).</li><li>Webster, M., Sheets, H. D., Alroy, J., Hunt, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+practical+introduction+to+landmark-based+geometric+morphometrics.">A practical introduction to landmark-based geometric morphometrics.</a> Quantitative Methods in Paleobiology. Paleontological Society Papers. 16, 163-188 (2010).</li><li>Inamoto, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evaluation+of+swallowing+using+320-detector-row+multislice+CT.+Part+II:+Kinematic+analysis+of+laryngeal+closure+during+normal+swallowing.">Evaluation of swallowing using 320-detector-row multislice CT. Part II: Kinematic analysis of laryngeal closure during normal swallowing.</a> Dysphagia. 26, 209-217 (2011).</li></ol>

החוקרים מצהירים כי אין להם אינטרסים כלכליים מתחרים.

מחקר זה מדגים את התועלת של שיטה באמצעות לתאם נתונים של ציוני דרך אנטומיים לחישוב מדידות kinematic מרובות של תנועת hyolaryngeal בבליעה. אמינות בין מדרג של שישה מדרגים, כולל שני מדרגי טירון, לקואורדינטות ומשתנים מחושבים הייתה חזקה (ICC&gt; 0.90). נציג תוצאות ממדגם של מבוגרים שאינם dysphagi...

שלב בלוע של בליעה הוא תהליך מורכב הכולל למעלה מעשרים שרירים ושלד אלמנטים רבים להעביר בולוס מחלל הפה לוושט, תוך הגנה על דרכי הנשימה. שקדמו התכווצות בלוע, אלמנטים של מתחם hyolaryngeal (עצם הלשון, הגרון, ומבנים הקשורים ביניהם הסוגר העליון של הוושט) הם עקורים להמיר צינור נשימה לתוך מערכת עיכול. הגרון מחדש ממוקם anteriorly הרחק ממסלולו של בולוס מתקרב, וסוגר הוושט העליון נמתח פתוח. מדידות קינמטית נלקחו מתוך מחקרי וידאו fluoroscopic בליעה (הידוע גם MBS או השתנה בריום סנונית ללימודים) הן שיטת המחקר העיקרית לכימות התנועות מרובות של מתחם hyolaryngeal 1. בעוד מדידות fluoroscopic וידאו כמותיים יעילות למדידת תפקוד בליעה, צירים שונים של התייחסותוscalars של תוצאת מדידה בממצאים שאינם תואמים בין השיטות השונות של מדידות kinematic 2. התנועה של המטופל ופלואורוסקופ תחת שליטת מטפל ידנית גם מקעקעת את הדיוק של מדידת תהליך פיסיולוגי מורכב זו. חשוב מכך, מדידות kinematic לא בהכרח משקפות מערכות יחסים מבנה לפונקציה חשובות להערכת בליעת הפרעות. קינמטיקה של hyoid בפרט תוכנן כדי לעקוב אחר תנועה בקדמית או כיוון מעולה בהתייחסות למטוס אנטומיים מיושר עם החוליות. עם זאת, תצורה זו אינה מייצגת את קו פעולה של שרירים הלהשעות hyoid. מנגנון דו קלע של העלאת hyolaryngeal בשלב בלוע של בליעה זוהה (איור 1) 3,4. שרירי suprahyoid מרכיבים את מנשא השרירים הקדמי, ושרירי בלוע ארוכים מהווים את posterior קלע שרירי. שרירים אלה לרומם את האלמנטים שונים של מתחם hyolaryngeal כוללים hyoid, גרון, ומבנים היוצרים את הסוגר העליון של הוושט. מיפוי לתאם מכניקת hyolaryngeal מנצל תשעה ציוני דרך אנטומיים לזיהוי בקלות למפה שלושה מנופים ותכונות שלד של נקודות hyolaryngeal מורכבות המייצגות את הקובץ המצורף של קדמי ומתלי שרירים האחוריים (איור 2). במהלך בליעה, כל מנוף ותכונה שלד של מתחם hyolaryngeal נמצאת בתנועה. על ידי איסוף נקודות ציון, המערכת יכולה להיות שנתפסו בכל מסגרת זמן. המרה טריגונומטריות של קואורדינטות יכולה לשמש כדי ליצור מדידות kinematic מרובות של תנועת hyolaryngeal בבליעה. משתנים יכולים להיות מחושבים לצורך השוואה עם ממצאים שדווחו בספרות, או משמשים להפקת מדידות חדשות המייצגות את מערכות יחסים של מבנה לפונקציה של ריבית. המטרה העיקרית של מאמר זה היא להדגים שיטה ליצירת מספר רב של מדידות kinematic מחושבים מסט אחד של קואורדינטות נקודת ציון אנטומיים שנאספו מבריום סנונית (MBS) לימודים השתנה. אנו מתעדים את אמינותה של שיטה זו על ידי שימוש במקדמי מתאם Intraclass כדי לקבוע את האמינות בין המדרג של 6 חוקרים שונים, כולל מומחה אחד, שלושה מדרגים עם ניסיון, ושני טירונים. מתוצאות kinematic, הבדלים בבליעת מכניקה ידי עקביות בולוס מוערכים. לבסוף, השאלה שהוצעה על ידי Molefenter וסטיל, על חשיבות ציר ההתייחסות המשמשת במדידת תנועת hyoid היא ממוענת. כדי לגשת לשאלה זו אנו משווים את המדידות של טיול hyoid בהתייחסות לחוליות ובהתייחסות ללסת התחתונה, המחושבת מאותו הסט של קואורדינטות עבור שני סוגי בולוס. אם שתי שיטות למדידת תנועת hyoid אלה מייצגים את אותו מבנה לתפקד יחסיםמפרק ירך, ואז התוצאה היה צריך להיות מתואמת חזק. במחקר זה, 40 מחקרי MBS תצוגה לרוחב נבחרו באופן אקראי מתוך אוסף של 139 לימודים נורמלים תחת פרוטוקול מחקר שאושר על ידי גאורגיה העוצרים אוניברסיטת דירקטוריון סקירה מוסדית ובשיתוף פעולה מחקרי עם אוולין Trammell המכון לקול ובליעה באוניברסיטה הרפואית של דרום קרוליינה. כדי להדגים את התועלת של שיטה זו, עשרה משתנים המאפיינים קינמטיקה hyolaryngeal חושבו מתוך אותה הקבוצה של נתונים לתאם (טבלת 1). שבעה מתוך מדידות אלה מחושבים בעבר בשימוש בספרות וביניהם: קדמי ומדידות מרחק hyoid מעולים בהתייחסות לחוליות 5; קדמי ועקירת hyoid מעולה כמו יחס בין C2-4 אורך, גם בהתייחסות לחוליות 6; תנועה מעולה של הגרון בהתייחסות לחוליות 7; approximat hyolaryngeal1 יון; וטיול hyoid מרבי בהתייחסות לחוליות 1. בנוסף, שלוש מדידות רומן חושבו: קיצור בלוע שלהן דומים לקבצים המצורפים של שריר palatopharyngeus, גובה הגרון הבא קו פעולה המייצג את stylopharyngeus, וטיול hyoid דומים לקבצים המצורפים של השרירים suprahyoid 4,8. ראש המומחה ואנטומיה צוואר (WP), שלושה חוקרים עם מדידות מוגבלות חוויה לוקחת (CJ, SR, TT), ושני חוקרי טירון (RS, JT) הושגו לתאם נתוני מיפוי באמצעות הפרוטוקול המתואר להלן. המומחה (WP) שהוכשר שלושה מדרגים עם ניסיון, והוא בתור מאומן אלה שני מדרגי הטירון. אמינות בין מדרג של נתונים לתאם ותוצאות מחושבים מקואורדינטות לפי נושא נקבעה על ידי מקדמי מתאם Intraclass 9. שני מבחני t זנב בוצעו על כל משתנה כדי לקבוע statisticallהבדלים משמעותיים y בסוגי בולוס. מקדם מתאם פירסון ומקדם של נחישות שימשו כדי להעריך את ההסכם בין התוצאות של טיול hyoid מחושבים עם החוליות כציר התייחסות לעומת טיול hyoid עם הלסת התחתונה כציר התייחסות לסנונית דק נוזל 5 מיליליטר ו 5 מיליליטר סנונית פודינג.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:864px;" width="865">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:288px;">Name of Material/ Equipment</td>
			<td style="width:71px;">Company</td>
			<td style="width:339px;">Catalog Number</td>
			<td style="width:167px;">Comments/Description</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">ImageJ&#160;&#160;</td>
			<td style="width:71px;">NIH</td>
			<td style="width:339px;">http://rsbweb.nih.gov/ij/download.html</td>
			<td>For Macintosh</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">MacX Video Converter Free Edition (Mac)</td>
			<td style="width:71px;">Digiarty</td>
			<td style="width:339px;">&#160;http://www.macxdvd.com/mac-video-converter-free/</td>
			<td>For Macintosh</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">QuickTime&#160;</td>
			<td style="width:71px;">Apple</td>
			<td style="width:339px;">http://support.apple.com/downloads/#QuickTime</td>
			<td>For Macintosh</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">ImageJ&#160;&#160;</td>
			<td style="width:71px;">NIH</td>
			<td style="width:339px;">http://rsbweb.nih.gov/ij/download.html</td>
			<td>For a PC</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">MPEG Streamclip (PC)&#160;</td>
			<td style="width:71px;">Squared 5</td>
			<td style="width:339px;">http://www.squared5.com</td>
			<td>For a PC</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">QuickTime</td>
			<td style="width:71px;">Apple</td>
			<td style="width:339px;">http://support.apple.com/downloads/#QuickTime</td>
			<td>For a PC</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

coordinate mapping of hyolaryngeal mechanics in swallowing

אפיון תנועת hyolaryngeal חשוב למחקר הבליעה. שיטות לפני דורשות מדידות מרובות כדי להשיג מדידה אחת kinematic אילו לתאם מיפוי של מכניקת hyolaryngeal באמצעות סנונית השתנה בריום (MBS) משתמש בסט אחד של קואורדינטות לחישוב משתנים מרובים של עניין. למטרות הדגמה, עשר מדידות kinematic נוצרו מסט אחד של קואורדינטות כדי לקבוע את ההבדלים בבליעת שני סוגים שונים בולוס. חישובים של טיול hyoid נגד החוליות והלסת התחתונה, אשר מתואמים לקבוע את החשיבות של צירים של התייחסות. כדי להדגים לתאם המתודולוגיה מיפוי, 40 מחקרי MBS נבחרו באופן אקראי ממאגר נתונים של נבדקים בריאים בריאים ללא ליקוי בבליעה ידוע. בולוס דק נוזל 5 מיליליטר ו 5 מיליליטר סנוניות פודינג נמדדו מכל נושא. תשע קואורדינטות, מיפוי בסיס הגולגולת, לסת תחתונה, החוליות והאלמנטים של Hyoמורכב בגרון, נרשמו במסגרות של טיול hyolaryngeal מינימום ומקסימום. קואורדינטות הוסבו מבחינה מתמטית לעשרה משתנים של מכניקת hyolaryngeal. אמינות בין מדרג הוערכה על ידי מקדמי Intraclass מתאם (ICC). מבחני t שני זנב שימשו כדי להעריך את ההבדלים בקינמטיקה ידי צמיגות בולוס. מדידות טיול Hyoid נגד צירים שונים של התייחסות היו מתואמות. אמינות בין מדרג בין שישה מדרגים ל18 קואורדינטות נעה בין ICC = 0.90-0.97. צפחה של עשר מדידות kinematic הושוותה לפי נושא בין שישה המדרגים. נתון חריג אחד נדחה, ואת הממוצע של ציוני אמינות שנותרו היה ICC = 0.91, 0.84-0.96, 95% CI. מבחני t שני זנב עם תיקוני Bonferroni השוואת עשרה משתני kinematic (5 מיליליטר סנוניות לעומת 5 פודינג מיליליטר דק נוזלית) הראו הבדלים משמעותיים מבחינה סטטיסטית בטיול hyoid, תנועה בגרון מעולה, וshortenin בלועg (p &lt;0.005). מתאמי פירסון של מדידות טיול hyoid משני צירים שונים של התייחסות היו: r = 0.62, r 2 = 0.38, (דק נוזל); r = 0.52, r 2 = 0.27, (פודינג). קבלת קואורדינטות נקודת ציון היא שיטה אמינה כדי לייצר משתני kinematic מרובים מתמונות שיקוף וידאו שימושיות במחקר בבליעה.

מקדמי מתאם Intraclass (ICC) של קואורדינטות שנאספו על ידי שישה חוקרים שנתחו באופן עצמאי 80 קבצי שיקוף וידאו (שני משפט בולוס מ40 נושאים) נע בין ICC = .90-.97. התמוטטות של בית הדין הפלילי הבינלאומי של קואורדינטות על ידי קבוצה היא כדלקמן: קואורדינטות # 1 - 5 (אלמנטי שלד בטיול hyolaryngeal מינימום...

Watch this Scientific Journal Video about Coordinate Mapping of Hyolaryngeal Mechanics in Swallowing at JoVE.com

Coordinate Mapping of Hyolaryngeal Mechanics in Swallowing

לתאם מיפוי הוא שיטה לתיעוד מאפיינים בולטים של ביומכניקה hyolaryngeal בשלב בלוע של בליעה. מתודולוגיה זו משתמשת בתוכנת ניתוח תמונה כדי להקליט את קואורדינטות של נקודתי ציון האנטומיות. נקודות ציון אלה מיובאים למאקרו של אקסל ותורגמו למשתני kinematic עניין שימושי במחקר בבליעה.

לתאם מיפוי של מכניקת Hyolaryngeal בבליעה

Characterizing hyolaryngeal movement is important to dysphagia research. Prior methods require multiple measurements to obtain one kinematic measurement ...

coordinate-mapping-of-hyolaryngeal-mechanics-in-swallowing

Research

Education

JoVE Core

JoVE Journal

Medical-Surgical Nursing

Medicine

Unit 1

An Overview of the Gastrointestinal System: Anatomy, Physiology, and Assessment

SCIENTISTS IN ACTION

17.2K Views.  Georgia Regents University.  לתאם מיפוי הוא שיטה לתיעוד מאפיינים בולטים של ביומכניקה hyolaryngeal בשלב בלוע של בליעה. מתודולוגיה זו משתמשת בתוכנת ניתוח תמונה כדי להקליט את קואורדינטות של נקודתי ציון האנטומיות. נקודות ציון אלה מיובאים למאקרו של אקסל ותורגמו למשתני kinematic עני...

Video: Coordinate Mapping of Hyolaryngeal Mechanics in Swallowing

Guide Wire Assisted Catheterization and Colored Dye Injection for Vascular Mapping of Monochorionic Twin Placentas

Monochorionic (MC) twin pregnancies are associated with significantly higher morbidity and mortality rates than dichorionic twins. Approximately 50% of MC twin pregnancies develop complications arising from the shared placenta and associated vascular connections1. Severe twin-to-twin syndrome (TTTS) is reported to account for approximately 20% of these complications2,3. Inter-twin vascular connections occur in almost all MC placentas and are related to the prognosis and outcome of these high-risk twin pregnancies. The number, size and type of connections have been implicated in the development of TTTS and other MC twin conditions. Three types of inter-twin vascular connections occur: 1) artery to vein connections (AVs) in which a branch artery carrying deoxygenated blood from one twin courses along the fetal surface of the placenta and dives into a placental cotyledon. Blood flows via a deep intraparenchymal capillary network into a draining vein that emerges at the fetal surface of the placenta and brings oxygenated blood toward the other twin. There is unidirectional flow from the twin supplying the afferent artery toward the twin receiving the efferent vein; 2) artery to artery connections (AAs) in which a branch artery from each twin meets directly on the superficial placental surface resulting in a vessel with pulsatile bidirectional flow, and 3) vein to vein connections (VVs) in which a branch vein from each twin meets directly on the superficial placental surface allowing low pressure bidirectional flow. In utero obstetric sonography with targeted Doppler interrogation has been used to identify the presence of AV and AA connections4. Prenatally detected AAs that have been confirmed by postnatal placental injection studies have been shown to be associated with an improved prognosis for both twins5. Furthermore, fetoscopic laser ablation of inter-twin vascular connections on the fetal surface of the shared placenta is now the preferred treatment for early, severe TTTS. 
Postnatal placental injection studies provide a valuable method to confirm the accuracy of prenatal Doppler ultrasound findings and the efficacy of fetal laser therapy6. Using colored dyes separately hand-injected into the arterial and venous circulations of each twin, the technique highlights and delineates AVs, AAs, and VVs. This definitive demonstration of MC placental vascular anatomy may then be correlated with Doppler ultrasound findings and neonatal outcome to enhance our understanding of the pathophysiology of MC twinning and its sequelae. Here we demonstrate our placental injection technique.

Vascular mapping of monochorionic (MC) twin placentas after birth provides a means for detailed demonstration of vascular connections between the twins&#x2019; circulations. 
Imbalance of these connections is thought to play a pivotal role in the development of complications of MC twinning including twin-to-twin transfusion syndrome.

מדריך צנתור Wire בסיוע הזרקת צבע צבעוני עבור מיפוי כלי דם של השליות התאומים Monochorionic

Monochorionic (MC) twin pregnancies are associated with significantly higher morbidity and mortality rates than dichorionic twins. Approximately 50% of MC ...

High-Resolution Endocardial and Epicardial Optical Mapping in a Sheep Model of Stretch-Induced Atrial Fibrillation

Atrial fibrillation (AF) is a complex cardiac arrhythmia with high morbidity and mortality.1,2 It is the most common sustained cardiac rhythm disturbance seen in clinical practice and its prevalence is expected to increase in the coming years.3 Increased intra-atrial pressure and dilatation have been long recognized to lead to AF,1,4 which highlights the relevance of using animal models and stretch to study AF dynamics. Understanding the mechanisms underlying AF requires visualization of the cardiac electrical waves with high spatial and temporal resolution. While high-temporal resolution can be achieved by conventional electrical mapping traditionally used in human electrophysiological studies, the small number of intra-atrial electrodes that can be used simultaneously limits the spatial resolution and precludes any detailed tracking of the electrical waves during the arrhythmia. The introduction of optical mapping in the early 90's enabled wide-field characterization of fibrillatory activity together with sub-millimeter spatial resolution in animal models5,6 and led to the identification of rapidly spinning electrical wave patterns (rotors) as the sources of the fibrillatory activity that may occur in the ventricles or the atria.7-9 Using combined time- and frequency-domain analyses of optical mapping it is possible to demonstrate discrete sites of high frequency periodic activity during AF, along with frequency gradients between left and right atrium. The region with fastest rotors activates at the highest frequency and drives the overall arrhythmia.10,11 The waves emanating from such rotor interact with either functional or anatomic obstacles in their path, resulting in the phenomenon of fibrillatory conduction.12 Mapping the endocardial surface of the posterior left atrium (PLA) allows the tracking of AF wave dynamics in the region with the highest rotor frequency. Importantly, the PLA is the region where intracavitary catheter-based ablative procedures are most successful terminating AF in patients,13 which underscores the relevance of studying AF dynamics from the interior of the left atrium. Here we describe a sheep model of acute stretch-induced AF, which resembles some of the characteristics of human paroxysmal AF. Epicardial mapping on the left atrium is complemented with endocardial mapping of the PLA using a dual-channel rigid borescope c-mounted to a CCD camera, which represents the most direct approach to visualize the patterns of activation in the most relevant region for AF maintenance.

This report provides a detailed description of the methodology and results of simultaneous endocardial and epicardial optical mapping of electrical excitation in the intact left atrium of a Langendorff-perfused sheep heart during stretch-induced atrial fibrillation.

ברזולוציה גבוהה מיפוי אופטי Endocardial ו Epicardial במודל הכבשים של פרפור פרוזדורי למתוח-induced

 Atrial fibrillation (AF) is a complex cardiac arrhythmia with high morbidity and mortality.1,2 It is the most common sustained cardiac rhythm disturbance ...

Heterogeneity Mapping of Protein Expression in Tumors using Quantitative Immunofluorescence

Morphologic heterogeneity within an individual tumor is well-recognized by histopathologists in surgical practice. While this often takes the form of areas of distinct differentiation into recognized histological subtypes, or different pathological grade, often there are more subtle differences in phenotype which defy accurate classification (Figure 1). Ultimately, since morphology is dictated by the underlying molecular phenotype, areas with visible differences are likely to be accompanied by differences in the expression of proteins which orchestrate cellular function and behavior, and therefore, appearance. The significance of visible and invisible (molecular) heterogeneity for prognosis is unknown, but recent evidence suggests that, at least at the genetic level, heterogeneity exists in the primary tumor1,2, and some of these sub-clones give rise to metastatic (and therefore lethal) disease. 
Moreover, some proteins are measured as biomarkers because they are the targets of therapy (for instance ER and HER2 for tamoxifen and trastuzumab (Herceptin), respectively). If these proteins show variable expression within a tumor then therapeutic responses may also be variable. The widely used histopathologic scoring schemes for immunohistochemistry either ignore, or numerically homogenize the quantification of protein expression. Similarly, in destructive techniques, where the tumor samples are homogenized (such as gene expression profiling), quantitative information can be elucidated, but spatial information is lost. Genetic heterogeneity mapping approaches in pancreatic cancer have relied either on generation of a single cell suspension3, or on macrodissection4. A recent study has used quantum dots in order to map morphologic and molecular heterogeneity in prostate cancer tissue5, providing proof of principle that morphology and molecular mapping is feasible, but falling short of quantifying the heterogeneity. Since immunohistochemistry is, at best, only semi-quantitative and subject to intra- and inter-observer bias, more sensitive and quantitative methodologies are required in order to accurately map and quantify tissue heterogeneity in situ.
We have developed and applied an experimental and statistical methodology in order to systematically quantify the heterogeneity of protein expression in whole tissue sections of tumors, based on the Automated QUantitative Analysis (AQUA) system6. Tissue sections are labeled with specific antibodies directed against cytokeratins and targets of interest, coupled to fluorophore-labeled secondary antibodies. Slides are imaged using a whole-slide fluorescence scanner. Images are subdivided into hundreds to thousands of tiles, and each tile is then assigned an AQUA score which is a measure of protein concentration within the epithelial (tumor) component of the tissue. Heatmaps are generated to represent tissue expression of the proteins and a heterogeneity score assigned, using a statistical measure of heterogeneity originally used in ecology, based on the Simpson's biodiversity index7.
To date there have been no attempts to systematically map and quantify this variability in tandem with protein expression, in histological preparations. Here, we illustrate the first use of the method applied to ER and HER2 biomarker expression in ovarian cancer. Using this method paves the way for analyzing heterogeneity as an independent variable in studies of biomarker expression in translational studies, in order to establish the significance of heterogeneity in prognosis and prediction of responses to therapy.

Here we describe a method to quantify molecular heterogeneity in histological sections of tumor material using quantitative immunofluorescence, image analysis, and a statistical measure of heterogeneity. The method is intended for use in clinical biomarker development and analysis.

הטרוגניות מיפוי של ביטוי חלבון בתוך גידולים באמצעות immunofluorescence כמותי

Morphologic heterogeneity within an individual tumor is well-recognized by histopathologists in surgical practice. While this often takes the form of ...

Label-free Isolation and Enrichment of Cells Through Contactless Dielectrophoresis

Dielectrophoresis (DEP) is the phenomenon by which polarized particles in a non-uniform electric field undergo translational motion, and can be used to direct the motion of microparticles in a surface marker-independent manner. Traditionally, DEP devices include planar metallic electrodes patterned in the sample channel. This approach can be expensive and requires a specialized cleanroom environment. Recently, a contact-free approach called contactless dielectrophoresis (cDEP) has been developed. This method utilizes the classic principle of DEP while avoiding direct contact between electrodes and sample by patterning fluidic electrodes and a sample channel from a single polydimethylsiloxane (PDMS) substrate, and has application as a rapid microfluidic strategy designed to sort and enrich microparticles. Unique to this method is that the electric field is generated via fluidic electrode channels containing a highly conductive fluid, which are separated from the sample channel by a thin insulating barrier. Because metal electrodes do not directly contact the sample, electrolysis, electrode delamination, and sample contamination are avoided. Additionally, this enables an inexpensive and simple fabrication process.
cDEP is thus well-suited for manipulating sensitive biological particles. The dielectrophoretic force acting upon the particles depends not only upon spatial gradients of the electric field generated by customizable design of the device geometry, but the intrinsic biophysical properties of the cell. As such, cDEP is a label-free technique that avoids depending upon surface-expressed molecular biomarkers that may be variably expressed within a population, while still allowing characterization, enrichment, and sorting of bioparticles.
Here, we demonstrate the basics of fabrication and experimentation using cDEP. We explain the simple preparation of a cDEP chip using soft lithography techniques. We discuss the experimental procedure for characterizing crossover frequency of a particle or cell, the frequency at which the dielectrophoretic force is zero. Finally, we demonstrate the use of this technique for sorting a mixture of ovarian cancer cells and fluorescing microspheres (beads).

Contactless dielectrophoresis (cDEP) achieves sorting and enrichment of particles via their intrinsic dielectric properties. Fluidic electrode channels replace metallic electrodes traditional to DEP, suiting cDEP to non-damaging sterile characterization and sorting of biological particles. We demonstrate how to prepare a cDEP microdevice and conduct cell characterization and sorting experiments.

בידוד ללא תווית והעשרה של תאים דרך מגע dielectrophoresis

Dielectrophoresis (DEP) is the phenomenon by which polarized particles in a non-uniform electric field undergo translational motion, and can be used to ...

MRI Mapping of Cerebrovascular Reactivity via Gas Inhalation Challenges

The brain is a spatially heterogeneous and temporally dynamic organ, with different regions requiring different amount of blood supply at different time. Therefore, the ability of the blood vessels to dilate or constrict, known as Cerebral-Vascular-Reactivity (CVR), represents an important domain of vascular function. An imaging marker representing this dynamic property will provide new information of cerebral vessels under normal and diseased conditions such as stroke, dementia, atherosclerosis, small vessel diseases, brain tumor, traumatic brain injury, and multiple sclerosis. In order to perform this type of measurement in humans, it is necessary to deliver a vasoactive stimulus such as CO2 and/or O2 gas mixture while quantitative brain magnetic resonance images (MRI) are being collected. In this work, we presented a MR compatible gas-delivery system and the associated protocol that allow the delivery of special gas mixtures (e.g., O2, CO2, N2, and their combinations) while the subject is lying inside the MRI scanner. This system is relatively simple, economical, and easy to use, and the experimental protocol allows accurate mapping of CVR in both healthy volunteers and patients with neurological disorders. This approach has the potential to be used in broad clinical applications and in better understanding of brain vascular pathophysiology. In the video, we demonstrate how to set up the system inside an MRI suite and how to perform a complete experiment on a human participant.

Non-invasive imaging of the brain vasculature&#8217;s ability to dilate or constrict may allow a better understanding of cerebrovascular pathophysiology in various neurological diseases. The present report describes a reproducible and patient-comfortable protocol to perform vascular reactivity imaging in humans using magnetic resonance imaging (MRI).

MRI מיפוי של כלי הדם במוח Reactivity באמצעות אתגרי משאיפת גז

The brain is a spatially heterogeneous and temporally dynamic organ, with different regions requiring different amount of blood supply at different time. ...

Surgical Models of Gastroesophageal Reflux with Mice

Multiple surgical procedures have been reported to induce gastroesophageal reflux in animals. Herein, we report three surgical models with mice aiming to induce reflux of gastric contents, duodenal contents or mixed contents. Surgical procedures and general principles have been described in detail. A researcher with surgical experience should be able to grasp the technique after a short period of practice. After surgery, most mice can survive and develop reflux esophagitis similar to that in humans. However, it should be noted that histological differences between mouse and human esophagus are the inherent limitations of these surgical models. If used for research on Barrett&#8217;s esophagus and adenocarcinoma, these procedures may need to be combined with genetic modifications.

This article demonstrates surgical procedures of gastroesophageal reflux with mice. These models are useful tools for research on mechanisms and treatment of gastroesophageal reflux disease and potentially Barrett&#8217;s esophagus and esophageal adenocarcinoma.

מודלי כירורגי של Gastroesophageal Reflux עם עכברים

Multiple surgical procedures have been reported to induce gastroesophageal reflux in animals. Herein, we report three surgical models with mice aiming to ...

Electrophysiological Assessment of Murine Atria with High-Resolution Optical Mapping

Recent genome-wide association studies targeting atrial fibrillation (AF) have indicated a strong association between the genotype and electrophysiological phenotype in the atria. That encourages us to utilize a genetically-engineered mouse model to elucidate the mechanism of AF. However, it is difficult to evaluate the electrophysiological properties in murine atria due to their small size. This protocol describes the electrophysiological evaluation of atria using an optical mapping system with a high temporal and spatial resolution in Langendorff perfused murine hearts. The optical mapping system is assembled with dual high-speed complementary metal oxide semiconductor cameras and high magnification objective lenses, to detect the fluorescence of a voltage-sensitive dye and Ca2+ indicator. To focus on the assessment of murine atria, optical mapping is performed with an area of 2 mm &#215; 2 mm or 10 mm x 10 mm, with a 100 &#215; 100 resolution (20 &#181;m/pixel or 100 &#181;m/pixel) and sampling rate of up to 10 kHz (0.1 ms) at maximum. A 1-French size quadripolar electrode pacing catheter is placed into the right atrium through the superior vena cava avoiding any mechanical damage to the atrium, and pacing stimulation is delivered through the catheter. An electrophysiological study is performed with programmed stimulation including constant pacing, burst pacing, and up to triple extrastimuli pacing. Under a spontaneous or pacing rhythm, the optical mapping recorded the action potential duration, activation map, conduction velocity, and Ca2+ transient individually in the right and left atria. In addition, the programmed stimulation also determines the inducibility of atrial tachyarrhythmias. Precise activation mapping is performed to identify the propagation of the excitation in the atrium during an induced atrial tachyarrhythmia. Optical mapping with a specialized setting enables a thorough electrophysiological evaluation of the atrium in murine pathological models.

This protocol describes the electrophysiological evaluation of murine atria utilizing an optical mapping system with a high temporal and spatial resolution, including dual recordings of the membrane voltage and Ca2+ transient under programmed stimulation through a specialized electrode catheter.

אלקטרופיזיולוגיות להערכת אטריה מאתר עם מיפוי אופטי ברזולוציה גבוהה

Recent genome-wide association studies targeting atrial fibrillation (AF) have indicated a strong association between the genotype and ...

Quantitative Mapping of Specific Ventilation in the Human Lung using Proton Magnetic Resonance Imaging and Oxygen as a Contrast Agent

Specific ventilation imaging (SVI) is a functional magnetic resonance imaging technique capable of quantifying specific ventilation &#8213; the ratio of the fresh gas entering a lung region divided by the region&#8217;s end-expiratory volume &#8213; in the human lung, using only inhaled oxygen as a contrast agent. Regional quantification of specific ventilation has the potential to help identify areas of pathologic lung function. Oxygen in solution in tissue shortens the tissue&#8217;s longitudinal relaxation time (T1), and thus a change in tissue oxygenation can be detected as a change in T1-weighted signal with an inversion recovery acquired image. Following an abrupt change between two concentrations of inspired oxygen, the rate at which lung tissue within a voxel equilibrates to a new steady-state reflects the rate at which resident gas is being replaced by inhaled gas. This rate is determined by specific ventilation. To elicit this sudden change in oxygenation, subjects alternately breathe 20-breath blocks of air (21% oxygen) and 100% oxygen while in the MRI scanner. A stepwise change in inspired oxygen fraction is achieved through use of a custom three-dimensional (3D)-printed flow bypass system with a manual switch during a short end-expiratory breath hold. To detect the corresponding change in T1, a global inversion pulse followed by a single shot fast spin echo sequence was used to acquire two-dimensional T1-weighted images in a 1.5&#160;T MRI scanner, using an eight-element torso coil. Both single slice and multi-slice imaging are possible, with slightly different imaging parameters. Quantification of specific ventilation is achieved by correlating the time-course of signal intensity for each lung voxel with a library of simulated responses to the air/oxygen stimulus. SVI estimations of specific ventilation heterogeneity have been validated against multiple breath washout and proved to accurately determine the heterogeneity of the specific ventilation distribution.

Specific ventilation imaging is a functional magnetic resonance imaging technique that allows for quantification of regional specific ventilation in the human lung, using inhaled oxygen as a contrast agent. Here, we present a protocol to collect and analyze specific ventilation imaging data.

מיפוי כמותי של אוורור ספציפי בריאה האנושית באמצעות דימות תהודה מגנטית פרוטון וחמצן כסוכן ניגודיות

Specific ventilation imaging (SVI) is a functional magnetic resonance imaging technique capable of quantifying specific ventilation &#8213; the ratio of ...

High-Throughput Analysis of Optical Mapping Data Using ElectroMap

Optical mapping is an established technique for high spatio-temporal resolution study of cardiac electrophysiology in multi-cellular preparations. Here we present, in a step-by-step guide, the use of ElectroMap for analysis, quantification, and mapping of high-resolution voltage and calcium datasets acquired by optical mapping. ElectroMap analysis options cover a wide variety of key electrophysiological parameters, and the graphical user interface allows straightforward modification of pre-processing and parameter definitions, making ElectroMap applicable to a wide range of experimental models. We show how built-in pacing frequency detection and signal segmentation allows high-throughput analysis of entire experimental recordings, acute responses, and single beat-to-beat variability. Additionally, ElectroMap incorporates automated multi-beat averaging to improve signal quality of noisy datasets, and here we demonstrate how this feature can help elucidate electrophysiological changes that might otherwise go undetected when using single beat analysis. Custom modules are included within the software for detailed investigation of conduction, single file analysis, and alternans, as demonstrated here. This software platform can be used to enable and accelerate the processing, analysis, and mapping of complex cardiac electrophysiology.

This protocol describes the setup and use of ElectroMap, a MATLAB-based open-source software platform for analysis of cardiac optical mapping data. ElectroMap provides a versatile high-throughput tool for analysis of optical mapping voltage and calcium datasets across a wide range of cardiac experimental models.

ניתוח תפוקה גבוהה של נתוני מיפוי אופטי באמצעות מידע אלקטרומגנט

Optical mapping is an established technique for high spatio-temporal resolution study of cardiac electrophysiology in multi-cellular preparations. Here we ...

Sarcomere Shortening of Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes using Fluorescent-Tagged Sarcomere Proteins.

Pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes (PSC-CMs) can be produced from both embryonic and induced pluripotent stem (ES/iPS) cells. These cells provide promising sources for cardiac disease modeling. For cardiomyopathies, sarcomere shortening is one of the standard physiological assessments that are used with adult cardiomyocytes to examine their disease phenotypes. However, the available methods are not appropriate to assess the contractility of PSC-CMs, as these cells have underdeveloped sarcomeres that are invisible under phase-contrast microscopy. To address this issue and to perform sarcomere shortening with PSC-CMs, fluorescent-tagged sarcomere proteins and fluorescent live-imaging were used. Thin Z-lines and an M-line reside at both ends and the center of a sarcomere, respectively. Z-line proteins &#8212;&#160;&#945;-Actinin (ACTN2), Telethonin (TCAP), and actin-associated LIM protein (PDLIM3) &#8212; and one M-line protein &#8212; Myomesin-2 (Myom2) &#8212;&#160;were tagged with fluorescent proteins. These tagged proteins can be expressed from endogenous alleles as knock-ins or from adeno-associated viruses (AAVs). Here, we introduce the methods to differentiate mouse and human pluripotent stem cells to cardiomyocytes, to produce AAVs, and to perform and analyze live-imaging. We also describe the methods for producing polydimethylsiloxane (PDMS) stamps for a patterned culture of PSC-CMs, which facilitates the analysis of sarcomere shortening with fluorescent-tagged proteins. To assess sarcomere shortening, time-lapse images of the beating cells were recorded at a high framerate (50-100 frames per second) under electrical stimulation (0.5-1 Hz). To analyze sarcomere length over the course of cell contraction, the recorded time-lapse images were subjected to SarcOptiM, a plug-in for ImageJ/Fiji. Our strategy provides a simple platform for investigating cardiac disease phenotypes in PSC-CMs.

This method can be used to examine sarcomere shortening using pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes with fluorescent-tagged sarcomere proteins.

קיצור סרקומר של קרדיומיוציטים שמקורם בתאי גזע פלוריפוטנטים באמצעות חלבוני סרקומר מתויגים פלואורסצנטיים.

Pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes (PSC-CMs) can be produced from both embryonic and induced pluripotent stem (ES/iPS) cells. These cells ...