Development of this protocol was supported by the Advancing a Healthier Wisconsin and the National Center for Advancing Translational Sciences, National Institutes of Health, through Grant Number 8UL1TR000055. Its contents are solely the responsibility of the authors and do not necessarily represent the official views of the NIH.

הערה: חולים ו / או האפוטרופוסים שלהם צריכים לתת הסכמה מדעת להשתתפות במועצה לביקורת מוסדית אישרו מחקר. 1. חוצצים והכנות מדיה <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> חיץ כביסה: כדי להכין של חיץ כביסה 100 מיליליטר, להוסיף 1 מיליליטר של עט 100x / פתרון סטרפטוקוקוס (100 U / ml פניצילין + 100 / מיליליטר מיקרוגרם של סטרפטומיצין) 99 מיליליטר של תמיסת מלח פוספט חיץ (PBS). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> תא אב שתן בינוני (UPC): כדי להכין מדיום UPC, לערבב כמויות שווה של תא בינוני keratinocyte סרום חינם (KSF) בינוני + אב. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> KSF בינוני: כדי להכין מדיום keratinocyte, להוסיף 5 / מיליליטר ng של גורם הגדילה באפידרמיס (EGF), 50 / מיליליטר ng של תמצית בלוטת יותרת המוח שור (BPE), 30 / מיליליטר ng של רעלן הכולרה, ופתרון העט / סטרפטוקוקוס (100 U / פניצילין מיליליטר, 100 מיקרוגרם / סטרפטומיצין מיליליטר) ל 500 מיליליטר בינוני KSF. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> תא אב בינוני: להוסיף שלושה רבעים של DMEM עם רבע מתקשורת Ham-F12 ולהשלים עם 10% FBS, 0.4 מיקרוגרם / מיליליטר הידרוקורטיזון, 0.1רעלן הכולרה ננומטר, 5 ng / ml אינסולין, 1.8 x 10 -4 אדנין M, 5 מיקרוגרם / מיליליטר transferrin, 2 x 10 thyronine M triiodo, 10 ng / ml EGF, והעט / סטרפטוקוקוס פתרון -9. </li></ol></li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הס בינוני: הוסף 20% החלפת KO-סרום (K-SR), חומצות אמינו לא חיוניות 1x ממ, l-גלוטמין 2 מ&quot;מ, β-mercaptoethanol 100 מיקרומטר, 20 ng / ml bFGF ועט / סטרפטוקוקוס 400 מיליליטר DMEM / בינוני F12. </li></ol> אוסף דוגמאות 2. שתן <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להורות לחולים לשתות נוזלים 30 דקות לפני איסוף שתן על מנת להבטיח כי כמות מספקת (~ 30-40 מיליליטר) של שתן יכולה להיות שנאספו. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> תן חולים ו / או האפוטרופוסים שלהם ערכת איסוף שתן המכילה את הפריטים הבאים: (1) הוראות בכתב על איך להשיג דגימת שתן לתפוס סטרילי או נקייה, (2) toilettes אנטי בקטריאלי הלח, ו- (3) 100 מיליליטר סטרילי כוס אוסף דגימה. להורות חולים כדי לאסוף דגימה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מייד למקם את דגימות שתן על קרח ולהעביר לlaboraטורים בצידנית. לעבד את השתן לבידוד תא באופן מיידי. אם עיכוב הוא בלתי נמנע, לאחסן את הדגימה על קרח במשך שעה עד 4 עם הפסד מינימאלי של כדאיות תא. </li></ol> 3. בידוד והרחבת תאים שתן הערה: בצע את השלבים הבאים בתנאים סטריליים בBSL2 בטיחות ביולוגית קבינט. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שימוש בטפטפות סטרילי, דגימות שתן להעברת סטרילי צינורות צנטריפוגה 50 מ&quot;ל. צנטריפוגה בg × 400 במשך 10 דקות ב RT. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לשאוב supernatant עוזב 1 מיליליטר בצינור; להיזהר לא להפריע תא גלולה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Resuspend ולשלב את כדורים מצינורות מרובים לתוך 7 מיליליטר של חיץ כביסה וחזור צנטריפוגה ב 400 × גרם במשך 10 דקות ב RT. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בזהירות לשאוב supernatant, עוזב את התא גלולה ו~ 0.2-0.5 מיליליטר של supernatant. Resuspend ב 2-3 מיליליטר של תא אב שתן בינוני (UPC) ולהעביר את ההשעיה ל4-6 בארות של האו&quot;םצלחת 24 מצופה היטב. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאחר 72 שעות, להשלים את התרבות עם 0.5 מיליליטר של מדיום UPC טרי בכל טוב ולשנות בינוני כל 2-3 ימים לאחר. אריתרוציטים ותאי קשקש שלא לצרף הצלחת יוסרו עם השינויים בינוניים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> צג התרבות לאחר 4-6 ימים. הערה: מושבות תאים קטנות 2-4 יתחילו להופיע. תאים יעוגלו או מאורכים המייצגים סוג I או II סוג של האפיתל כליות (RE) תאי בהתאמה 3. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לשנות את המדיום כל 2-3 ימים מאז פעם התאים מופיעים, הם יעברו שלב התרחבות מהיר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ברגע שהתאים מגיעים 80-90 מפגש%, סביב 9-15 ימים לאחר ציפוי, לנתק והמעבר התאים (15,000-18,000 תאים / 2 סנטימטר) על 2-4 בארות של 24 צלחת גם להתרחבות נוספת. מסמן זאת כתא מעבר 1 (P1). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאפיין תאי שתן למפרטי שושלת באמצעות ניתוח התזרים cytometric, immunohistochemצביעת iCal או באמצעות תגובת שרשרת transcriptase-פולימראז הפוכה (RT-PCR). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לתכנת מחדש תאי שתן מבודדים (סעיף 4) או להקפיא אותם בהקפאה בינונית (DMEM בתוספת סרום 10% ו -10% DMSO) לcryostorage לטווח ארוך. </li></ol> תכנות מחדש Cell 4. תנו שימוש וירוס סנדאי הערה: הטיפול הנכון והשימוש בPPE (ציוד מגן אישי) מומלצת בעוד מניפולציה סוכני transfecting. בצע את השלבים בתנאים סטריליים בBSL2 בטיחות ביולוגית קבינט הבא. הסילוק נאות של transfecting תאי סוכן ו / או transfected מומלץ להימנע מסיכון של סכנות בריאותיות וסביבתיות. לתכנות מחדש של תאי שתן, להשתמש סנדאי תכנות מחדש קיט עם שינויים לפרוטוקול המזין תלוי של היצרן כפי שיפורט להלן. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כדי להבטיח תכנות מחדש יעילות גבוהה באמצעות וירוס סנדאי, שימוש קטעים 1-5 תאי שתן שמהיריםly החלוקה. אם התאים לא לשכפל היטב או להיות senescent, להשליך אותם כפי שהם לא לתכנת מחדש את יעילות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> זרע 60,000 תאים לכל גם בשתי בארות של צלחת 6 היטב. מארק זה כמו יום -2. התאם צפיפות זריעת תאים (5 x 4-9 אוקטובר x 10 4 תאים לכל טוב) לפי צורך כדי להגיע 80-90% על ידי מפגש יום 0. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ביום 0 (48 שעות לאחר ציפוי התאים), להכין את וקטורי סנדאי תכנות מחדש (sev) המכילים כל אחד מגורמי OSKM ארבעה. להוסיף כל אחד מהווקטורים עד 1 מיליליטר של מדיום UPC מחומם מראש. השתמש במשרד פנים של 1-1.5 (5-7.5 x 10 5 CIU), אשר הוא מספק לתאי שתן תכנות מחדש. לשאוב הבינוני ומוסיף באיטיות 1 מיליליטר UPC + sev לטוב אחד תאי השתן. השתמש גם השני כשליטת התמרה שלילית. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ביום 1, להחליף את מדיום UPC + sev עם מדיום UPC טרי. מוות של תאים מסוימים נתפס לאחר 24 שעות בשל cytotoxicity ויראלי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בהתאם ליעילות של תכנות מחדש clonתצורות דואר והמורפולוגיה הקומפקטית, לשמור על שינוי הבינוני מדי יום עד שהיום 6 או 7. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> יום אחד לפני הניתוק של תאי transduced (יום 5 או 6), להכין צלחות מזין MEF ידי ציפוי mitomycin-C (10 מיקרוגרם / מיליליטר במשך 3 שעות) שטופל MEFs בצפיפות של 5 x 10 4 תאים / 2 סנטימטר, על 0.1 ג&#39;לטין% מצופה 100 מנות מ&quot;מ 2 תרבות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> למחרת (יום 6 או 7), לנתק את התאים עם טריפסין 0.25%, resuspend התאים במדיום UPC וצלחת 5 x 10 4 - צלחת מזין 2 x 10 5 תאים / 100 מ&quot;מ 2 MEF. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> למחרת, לעבור למדיום הס ולשנות את המדיום בכל יום. שים לב לתאים תחת מיקרוסקופ כדי לפקח על תאים הפכו. הערה: התאים ליצור אגרגטים משובטים עם מורפולוגיה אופיינית מרוצפת ויש להם גרעין גבוה יחס cytoplasmic (לאחר התמרה 12-18 ימים). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בתוך שבועות עד שלושה שבועות לאחר התמרה, לאסוף מושבות ולהעביר לצלחות חדשות לclonהרחבת אל. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לבצע מכתים תא חי לבחירת השיבוטים iPSC ידי דוגרים תאים עם TRA-1-81 נוגדן עבור שעה 1 ב 37 מעלות צלזיוס בCO 2 באינקובטור ואחריו מכתים דלפק עם נוגדנים משני מצומדות צבע ניאון ספציפי עבור שעה 1 ב 37 מעלות צלזיוס בCO 2 באינקובטור. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שימוש במחט אינץ &#39;G ½ 1 26 לצלב-לבקוע TRA-1-81 שיבוטים גדולים יותר החיוביים iPSC לחתיכות בגודל שווה קטנות (4-6 חתיכות לשיבוט). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> השתמש פיפטה טיפ סטרילי כדי לאסוף ולהעביר 10-20 חתיכות צלב בקע משיבוטים מרובים לבאר כל Matrigel (10 מיקרוגרם / 2 סנטימטר) -coated 24 צלחת היטב עם מדיום הס. הערה: פיסות משיבוט אחד מצופה בנפרד לתוך באר אחד לא להרחיב או לשמור על pluripotency. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לשנות מהס עד בינוני iPSC 24-48 שעות לאחר השיבוטים לתכנות מחדש מחוברים אל פני השטח Matrigel. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> במהלך תחזוקה על צלחות Matrigel מצופה, ידני scraPE-את כל תאים מובחנים או תאים מזינים MEF לזהם בעזרת פיפטה טיפ להעשיר לשיבוטי dystrophic לתכנות מחדש וpluripotent מלא iPSC (MD-iPSC). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאחר שיבוטים בודדים שהגיעו לגודל מיקרומטר ~ 100, להרחיב את השיבוטים על ידי מתנער עם 0.48 mM EDTA (חומצת ethylenediaminetetraacetic) פתרון במשך 3 דקות וציפוי אגרגטים תא קטנים של MD-iPSCs התלוי במדיום iPSC (בתוספת 5 מיקרומטר Y27632, Rho קינאז מעכב ) על matrigel הטרי (10 מיקרוגרם / 2 סנטימטר) מצופה 12 צלחת גם. שנה בינונית iPSC יומי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> תכנות מחדש מלא של כל שיבוט יכול להיקבע על ידי שני ניתוח ביטוי גנים של גני OSKM ומכתים immunohistochemical של סמני pluripotency (Oct3 / 4 וTRA-1-81). הערכה קפדני של פוטנציאל pluripotency צריך להיות מועסק כדי לאשר קווי iPSC לתכנות מחדש באופן מלא יכולים להתמיין לשלוש שכבות נבט. זה יכול להיות מושלם גם על ידי גוף embryoid assay (EB) היווצרות והבידול או terassay היווצרות Atoma. </li></ol>

<ol>
	<li>Guan, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dystrophin-deficient+cardiomyocytes+derived+from+human+urine:+New+biologic+reagents+for+drug+discovery.">Dystrophin-deficient cardiomyocytes derived from human urine: New biologic reagents for drug discovery.</a> Stem Cell Research. 12 (2), 467-480 (2014).</li><li>Dick, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Exon+Skipping+and+Gene+Transfer+Restore+Dystrophin+Expression+in+Human+Induced+Pluripotent+Stem+Cells-Cardiomyocytes+Harboring+DMD+Mutations.">Exon Skipping and Gene Transfer Restore Dystrophin Expression in Human Induced Pluripotent Stem Cells-Cardiomyocytes Harboring DMD Mutations.</a> Stem Cells Dev. 22 (20), 2714-2724 (2013).</li><li>Zhou, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Generation+of+human+induced+pluripotent+stem+cells+from+urine+samples.">Generation of human induced pluripotent stem cells from urine samples.</a> Nat Protoc. 7 (12), 2080-2089 (2012).</li><li>Bellin, M., Marchetto, M. C., Gage, F. H., Mummery, C. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Induced+pluripotent+stem+cells:+the+new+patient.">Induced pluripotent stem cells: the new patient.</a> Nat Rev Mol Cell Biol. 13 (11), 713-726 (2012).</li><li>Carvajal-Vergara, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Patient-specific+induced+pluripotent+stem-cell-derived+models+of+LEOPARD+syndrome.">Patient-specific induced pluripotent stem-cell-derived models of LEOPARD syndrome.</a> Nature. 465 (7299), 808-812 (2010).</li><li>Sun, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Patient-Specific+Induced+Pluripotent+Stem+Cells+as+a+Model+for+Familial+Dilated+Cardiomyopathy.">Patient-Specific Induced Pluripotent Stem Cells as a Model for Familial Dilated Cardiomyopathy.</a> Science Translational Medicine. 4 (130), 130ra147 (2012).</li><li>Zhang, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Urine+derived+cells+are+a+potential+source+for+urological+tissue+reconstruction.">Urine derived cells are a potential source for urological tissue reconstruction.</a> J Urol. 180 (5), 2226-2233 (2008).</li><li>Bayart, E., Cohen-Haguenauer, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Technological+overview+of+iPS+induction+from+human+adult+somatic+cells.">Technological overview of iPS induction from human adult somatic cells.</a> Curr Gene Ther. 13 (2), 73-92 (2013).</li><li>Malik, N., Rao, M. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+review+of+the+methods+for+human+iPSC+derivation.">A review of the methods for human iPSC derivation.</a> Methods Mol Biol. 997, 23-33 (2013).</li><li>Nakanishi, M., Otsu, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Development+of+Sendai+virus+vectors+and+their+potential+applications+in+gene+therapy+and+regenerative+medicine.">Development of Sendai virus vectors and their potential applications in gene therapy and regenerative medicine.</a> Curr. Gene Ther. 12 (5), 410-416 (2012).</li><li>Gonz&#225;lez-Ram&#237;rez, R., Morales-L&#225;zaro, S. L., Tapia-Ram&#237;rez, V., Mornet, D., Cisneros, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nuclear+and+nuclear+envelope+localization+of+dystrophin+Dp71+and+dystrophin-associated+proteins+(DAPs)+in+the+C2C12+muscle+cells:+DAPs+nuclear+localization+is+modulated+during+myogenesis.">Nuclear and nuclear envelope localization of dystrophin Dp71 and dystrophin-associated proteins (DAPs) in the C2C12 muscle cells: DAPs nuclear localization is modulated during myogenesis.</a> J Cell Biochem. 105 (3), 735-745 (2008).</li><li>Villarreal-Silva, M., Centeno-Cruz, F., Su&#225;rez-S&#225;nchez, R., Garrido, E., Cisneros, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Knockdown+of+dystrophin+Dp71+impairs+PC12+cells+cycle:+localization+in+the+spindle+and+cytokinesis+structures+implies+a+role+for+Dp71+in+cell+division.">Knockdown of dystrophin Dp71 impairs PC12 cells cycle: localization in the spindle and cytokinesis structures implies a role for Dp71 in cell division.</a> PloS One. 6 (8), e23504 (2011).</li></ol>

The authors declare that they have no competing financial interests.

דוגמנות מחלות לב וכלי דם באמצעות iPSCs הופכת גישה נפוצה להבין את התרומה הגנטית 4-6. כמה קשיים בלתי צפויים של קבלת דגימות תאים מחולים, ילדים צעירים במיוחד, יכולים להימנע על ידי המציע את האפשרות של גישה לא פולשנית כגון איסוף שתן. באוכלוסיית חולים הצעירה הזה, הוא לעתים ...

קרדיומיופתיה היא הסיבה המובילה השניה למוות בחולים עם מחלת ניוון שרירים דושן והבקר (MD). למרות שמוטציות בגן דיסטרופין צמוד X להתרחש ב 1: 3,500 לידות של זכרים, מעט מאוד ידוע על האירועים המולקולריים ותאיים שמוביל לנזק לשרירי לב מתקדם. תאי גזע אנושיים pluripotent מושרה נגזרים מחולי ניוון שרירים צמחו ככלי רומן כדי לחקור את מנגנוני מחלה הבסיסיים ולהשתמש בסמים להקרנת 1,2. אי הנוחות הצפויה של ביופסיות עור או דגימות דם עלול להניא חולים צעירים ו / או האפוטרופוסים שלהם לתת את ההסכמה להשתתפות במחקר. דגימות שתן הן מקור בלתי פולשנית של תאים סומטיים שamendable לשיטות תכנות מחדש. הראינו לאחרונה כי תאי שתן שנאספו מחולי ניוון שרירים יכולים להיות מתורבתים וביעילות לתכנות מחדש לiPSCs באמצעות התמרה retroviral עם גורמי יאמאנאקה (Oct3 / 4, Sox2, Klf4, ו- c-Myc; OSKM) 1. החסרון של מסירת גן retroviral הוא שילוב של גני תכנות מחדש לכרומוזומים המארח האקראי. כדי להתגבר על מגבלה זו, השתמשנו וירוס סנדאי הלא שילוב לתכנות מחדש של תאי שתן. פרוטוקול זה מפרט את תכנות מחדש של תאי וירוס סנדאי שתן מבודדים מחולי ניוון שרירים אז מה שיכול להיות מובחן לתוך שריר לב או סוגי תאים אחרים למחקר נוסף. פרוטוקול זה גם יכול להיות מותאם למחלות ספציפיות מטופל אחרים.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="1143">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td colspan="4" height="21" style="height:21px;width:1144px;">List of Materials</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Name of Reagent/Material/Equipment</td>
			<td>Company</td>
			<td>Catalog Number</td>
			<td>Comments</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">4 Oz. Specimen Cup with Lid</td>
			<td>STL Medical Supply</td>
			<td>M9AMSAS340</td>
			<td>For Urine Sample Collection</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">15 mL BD-Falcon Tubes</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>352097</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">50 mL BD-Falcon Tubes</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>352098</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Round Glass Coverslips</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>12-545-81</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">CytoTune-iPS Sendai Reprogramming Kit</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>A1378-001</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">PBS, pH 7.4</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>10010-023</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Pen-Strep w/o Glutamine&#160;</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>15140-122</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">RPMI Medium 1640</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>11875-093</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">B-27 Supplement w/Insulin (50x)</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>17504-044</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">B-27 Supplement w/o Insulin (50x)</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>0050129SA</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">DMEM/F12 (1:1)</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>11330-032</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Versene, 1:5000&#160;</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>15040066</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">bFGF (10 &#181;g)</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>13256-029</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Cell Counter Cartridges</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>C10228</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Knockout Serum (500 mL Bottle)</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>10828-028</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Recovery Cell Culture Freezing Medium</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>12648-010</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Keratinocyte-SFM (1X), Liquid</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>17005-042</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">DMEM, High Glucose, Glutamax</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>10566-016</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Ham&#39;s F-12 Nutrient Mix&#160;</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>11765-054</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">EGF Recombinant Human Protein, Liquid Form</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>PHG0311L</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Insulin, Human Recombinant, Zinc Soln</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>12585-014</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">TeSR-E8</td>
			<td>Stem Cell Technologies</td>
			<td>5940</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">ROCK Inhibitor (Y-27632)</td>
			<td>Selleck</td>
			<td>S1049</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Matrigel</td>
			<td>BD Biosciences</td>
			<td>354277</td>
			<td>hESC Qualified Matrix, LVED Free</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">RNeasy Mini Kit&#160;</td>
			<td>Qiagen</td>
			<td>74104</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">iScript cDNA Synthesis Kit</td>
			<td>Bio-Rad</td>
			<td>170-8890</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">DreamTaq Green PCR Master Mix (2X)</td>
			<td>Thermo-Scientific</td>
			<td>K1081</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">FBS-Qualified</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>F6178</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">ADENINE BIOREAGENT</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>A2786-5G</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">CHOLERA TOXIN FROM VIBRIO CHOLERAE</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>C8052-.5MG</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">HYDROCORTISONE</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>H0888-1G</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">HOLO-TRANSFERRIN FROM HUMAN</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>T0665-50MG</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">3,3&#39;,5-TRIIODO-L-THYRONINE SODIUM SALT&#160;</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>T6397-100MG</td>
			<td>Warm in 37 &#176;C water bath before use</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">DAPI&#160;</td>
			<td>Santa Cruz Biotechnology</td>
			<td>SC-3598</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Fluoromount Aquous mounting medium</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>F4680</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">16% Paraformaldehyde</td>
			<td>Alfa-Aesar</td>
			<td>43368</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;"></td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td colspan="4" height="21" style="height:21px;">List of Antibodies</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Name of Reagent/Material/Equipment</td>
			<td>Company</td>
			<td>Catalog Number</td>
			<td>Comments</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Mouse anti CD44 - labelled with FITC&#160;</td>
			<td>BD Biosciences</td>
			<td>560977</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Mouse anti CD146 - labelled with PE</td>
			<td>BD Biosciences</td>
			<td>561013</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Mouse anti CD73 - labelled with PE</td>
			<td>BD Biosciences</td>
			<td>561014</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Mouse anti-&#945;-smooth muscle actin</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>A2547</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Mouse anti-Vimentin</td>
			<td>Abcam</td>
			<td>ab8978-100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Mouse Anti - TRA-1-81</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>411100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Rabbit anti Oct 3/4</td>
			<td>Santa Cruz Biotechnology</td>
			<td>SC-9081</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:415px;">Mouse Anti Dystrophin</td>
			<td>Leica Biosystems</td>
			<td>NCL-DYSB</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

generation of induced pluripotent stem cells from muscular dystrophy patients: efficient integration-free reprogramming of urine derived cells

cardiomyopathy dystrophic הוא תוצאה הבינה היטב של ניוון שרירים. יצירת תאים מושרה pluripotent גזע (iPSCs) מחולים עם מחלת ניוון שרירים היא מקור רב ערך לסלולרי במבחנה מערכות מודל מחלה ויכולה לשמש למחקרי הקרנת סמים. תאי שמקורם בחולה שתן כבר בשימוש בתכנות מחדש מוצלח בתאי גזע pluripotent מושרה במטרה לבנות מודל cardiomyopathy dystrophic 1. בהתייחסו לחששות הבטיחות של שילוב מערכות וקטור, אנו מציגים פרוטוקול באמצעות וקטור וירוס שאינו שילוב סנדאי לתמרה של יאמאנאקה גורמים לתאי שתן שנאספו מחולים עם מחלת ניוון שרירים. פרוטוקול זה יוצר לתכנות מחדש באופן מלא שיבוטים תוך 2-3 שבועות. תאי pluripotent הם נטול וקטור על ידי מעבר-13. יכול להיות מובחן iPSCs dystrophic אלה לתוך שריר לב ומשמש גם ללמוד מנגנוני מחלה או להקרנת סמים.

רוב התאים המבודדים משתן אנושי הם חיוביים לסמני אב וpericyte uroepithelial כגון CD44, CD73, וCD146 (97.37%, 97.09%, ו97.3% בהתאמה; איור 1 א ו -1 B). תאים אלה באו לידי ביטוי גם סמני mesenchymal אחרים כגון אקטין אלפא-שריר החלק וvimentin (איור 1). ניתוח RT-PCR נותן עדות לאוכלוסייה מעורבת של...

Watch this Scientific Journal Video about Generation of Induced Pluripotent Stem Cells from Muscular Dystrophy Patients: Efficient Integration-free Reprogramming of Urine Derived Cells at JoVE.com

Generation of Induced Pluripotent Stem Cells from Muscular Dystrophy Patients: Efficient Integration-free Reprogramming of Urine Derived Cells

This protocol entails detailed procedures for isolation of urine derived cells from muscular dystrophy patients; their efficient and rapid reprogramming through Sendai virus transduction.

דור של גזע תאים המושרה pluripotent מחולי ניוון שרירים: תכנות מחדש ללא אינטגרציה יעילה של תאים שתן נגזר

Dystrophic cardiomyopathy is a poorly understood consequence of muscular dystrophy. Generating induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs) from patients with ...

generation-induced-pluripotent-stem-cells-from-muscular-dystrophy

Research

JoVE Journal

Medicine

11.1K Views.  Medical College of Wisconsin. This protocol entails detailed procedures for isolation of urine derived cells from muscular dystrophy patients; their efficient and rapid reprogramming through Sendai virus transduction. 

Video: Generation of Induced Pluripotent Stem Cells from Muscular Dystrophy Patients: Efficient Integration-free Reprogramming of Urine Derived Cells

Isolation, Characterization and Comparative Differentiation of Human Dental Pulp Stem Cells Derived from Permanent Teeth by Using Two Different Methods

Developing wisdom teeth are easy-accessible source of stem cells during the adulthood which could be obtained by routine orthodontic treatments. Human pulp-derived stem cells (hDPSCs) possess high proliferation potential with multi-lineage differentiation capacity compare to the ordinary source of adult stem cells1-8; therefore, hDPSCs could be the good candidates for autologous transplantation in tissue engineering and regenerative medicine. Along with these benefits, possessing the mesenchymal stem cells (MSC) features, such as immunolodulatory effect, make hDPSCs more valuable, even in the case of allograft transplantation6,9,10. Therefore, the primary step for using this source of stem cells is to select the best protocol for isolating hDPSCs from pulp tissue. In order to achieve this goal, it is crucial to investigate the effect of various isolation conditions on different cellular behaviors, such as their common surface markers &amp; also their differentiation capacity.
Thus, here we separate human pulp tissue from impacted third molar teeth, and then used both existing protocols based on literature, for isolating hDPSCs,11-13 i.e. enzymatic dissociation of pulp tissue (DPSC-ED) or outgrowth from tissue explants (DPSC-OG). In this regards, we tried to facilitate the isolation methods by using dental diamond disk. Then, these cells characterized in terms of stromal-associated Markers (CD73, CD90, CD105 &amp; CD44), hematopoietic/endothelial Markers (CD34, CD45 &amp; CD11b), perivascular marker, like CD146 and also STRO-1. Afterwards, these two protocols were compared based on the differentiation potency into odontoblasts by both quantitative polymerase chain reaction (QPCR) &amp; Alizarin Red Staining. QPCR were used for the assessment of the expression of the mineralization-related genes (alkaline phosphatase; ALP, matrix extracellular phosphoglycoprotein; MEPE &amp; dentin sialophosphoprotein; DSPP).14

The method described isolation and characterization of human Dental Pulp Stem Cells (hDPSCs) by using either enzymatic dissociation of pulp (DPSC-ED) or direct outgrowth of stem cells from pulp tissue explants (DPSC-OG). Then followed by in vitro comparative differentiation of both types of hDPSCs into odontoblasts.

בידוד, אפיון והשוואתי התמיינות של תאי גזע אנושיים שיניים זולות נגזרה שיניים קבועות על ידי שימוש בשתי שיטות שונות

Developing wisdom teeth are easy-accessible source of stem cells during the adulthood which could be obtained by routine orthodontic treatments. Human ...

Patient Derived Cell Culture and Isolation of CD133+ Putative Cancer Stem Cells from Melanoma

Despite improved treatments options for melanoma available today, patients with advanced malignant melanoma still have a poor prognosis for progression-free and overall survival. Therefore, translational research needs to provide further molecular evidence to improve targeted therapies for malignant melanomas. In the past, oncogenic mechanisms related to melanoma were extensively studied in established cell lines. On the way to more personalized treatment regimens based on individual genetic profiles, we propose to use patient-derived cell lines instead of generic cell lines. Together with high quality clinical data, especially on patient follow-up, these cells will be instrumental to better understand the molecular mechanisms behind melanoma progression.
Here, we report the establishment of primary melanoma cultures from dissected fresh tumor tissue. This procedure includes mincing and dissociation of the tissue into single cells, removal of contaminations with erythrocytes and fibroblasts as well as primary culture and reliable verification of the cells' melanoma origin.
Recent reports revealed that melanomas, like the majority of tumors, harbor a small subpopulation of cancer stem cells (CSCs), which seem to exclusively fuel tumor initiation and progression towards the metastatic state. One of the key markers for CSC identification and isolation in melanoma is CD133. To isolate CD133+ CSCs from primary melanoma cultures, we have modified and optimized the Magnetic-Activated Cell Sorting (MACS) procedure from Miltenyi resulting in high sorting purity and viability of CD133+ CSCs and CD133- bulk, which can be cultivated and functionally analyzed thereafter.

Patient Derived Cell Culture and Isolation of CD133+ Putative Cancer Stem Cells from Melanoma

This article describes the preparation of freshly obtained melanoma tissue into primary cell cultures, and how to remove contaminations of erythrocytes and fibroblasts from the tumor cells. Finally, we describe how CD133+ putative melanoma stem cells are sorted from the CD133- bulk using Magnetic Activated Cell Sorting (MACS).

תרבות מטופל נגזר סלולרי ובידוד של CD133<sup&gt; +</sup&gt; תאי גזע סרטני משוערים מלנומה

Despite improved treatments options for melanoma available today, patients with advanced malignant melanoma still have a poor prognosis for ...

Studying Pancreatic Cancer Stem Cell Characteristics for Developing New Treatment Strategies

Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) contains a subset of exclusively tumorigenic cancer stem cells (CSCs) which have been shown to drive tumor initiation, metastasis and resistance to radio- and chemotherapy. Here we describe a specific methodology for culturing primary human pancreatic CSCs as tumor spheres in anchorage-independent conditions. Cells are grown in serum-free, non-adherent conditions in order to enrich for CSCs while their more differentiated progenies do not survive and proliferate during the initial phase following seeding of single cells. This assay can be used to estimate the percentage of CSCs present in a population of tumor cells. Both size (which can range from 35 to 250 micrometers) and number of tumor spheres formed represents CSC activity harbored in either bulk populations of cultured cancer cells or freshly harvested and digested tumors 1,2. Using this assay, we recently found that metformin selectively ablates pancreatic CSCs; a finding that was subsequently further corroborated by demonstrating diminished expression of pluripotency-associated genes/surface markers and reduced in vivo tumorigenicity of metformin-treated cells. As the final step for preclinical development we treated mice bearing established tumors with metformin and found significantly prolonged survival. Clinical studies testing the use of metformin in patients with PDAC are currently underway (e.g., NCT01210911, NCT01167738, and NCT01488552). Mechanistically, we found that metformin induces a fatal energy crisis in CSCs by enhancing reactive oxygen species (ROS) production and reducing mitochondrial transmembrane potential. In contrast, non-CSCs were not eliminated by metformin treatment, but rather underwent reversible cell cycle arrest. Therefore, our study serves as a successful example for the potential of in vitro sphere formation as a screening tool to identify compounds that potentially target CSCs, but this technique will require further in vitro and in vivo validation to eliminate false discoveries.

Pancreatic cancer stem cells (CSCs) can be expanded in vitro using the anchorage-independent sphere culture technique, which represents a powerful tool to study CSC biology and can serve as the first step to develop novel CSC-targeting therapies. Here the methodology for expanding, analyzing and targeting of pancreatic CSCs is provided.

לומד סרטן לבלב גזע מאפייני תא לפיתוח טיפול חדש אסטרטגיות

Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) contains a subset of exclusively tumorigenic cancer stem cells (CSCs) which have been shown to drive tumor ...

Generation of Prostate Cancer Patient Derived Xenograft Models from Circulating Tumor Cells

Patient derived xenograft (PDX) models are gaining popularity in cancer research and are used for preclinical drug evaluation, biomarker identification, biologic studies, and personalized medicine strategies. Circulating tumor cells (CTC) play a critical role in tumor metastasis and have been isolated from patients with several tumor types. Recently, CTCs have been used to generate PDX experimental models of breast and prostate cancer. This manuscript details the method for the generation of prostate cancer PDX models from CTCs developed by our group. Advantages of this method over conventional PDX models include independence from surgical sample collection and generating experimental models at various disease stages. Density gradient centrifugation followed by red blood cell lysis and flow cytometry depletion of CD45 positive mononuclear cells is used to enrich CTCs from peripheral blood samples collected from patients with metastatic disease. The CTCs are then injected into immunocompromised mice; subsequently generated xenografts can be used for functional studies or harvested for molecular characterization. The primary limitation of this method is the negative selection method used for CTC enrichment. Despite this limitation, the generation of PDX models from CTCs provides a novel experimental model to be applied to prostate cancer research.

This manuscript details a method used to generate prostate cancer patient derived xenografts (PDXs) from circulating tumor cells (CTCs). The generation of PDX models from CTCs provides an alternative experimental model to study prostate cancer; the most commonly diagnosed tumor and a frequent cause of death from cancer in men.

דור של חולה סרטן הערמונית נגזר מודלי xenograft ממחזור תאים סרטניים

Patient derived xenograft (PDX) models are gaining popularity in cancer research and are used for preclinical drug evaluation, biomarker identification, ...

Modeling Myotonic Dystrophy 1 in C2C12 Myoblast Cells

Myotonic dystrophy 1 (DM1) is a common form of muscular dystrophy. Although several animal models have been established for DM1, myoblast cell models are still important because they offer an efficient cellular alternative for studying cellular and molecular events. Though C2C12 myoblast cells have been widely used to study myogenesis, resistance to gene transfection, or viral transduction, hinders research in C2C12 cells. Here, we describe an optimized protocol that includes daily maintenance, transfection and transduction procedures to introduce genes into C2C12 myoblasts and the induction of myocyte differentiation. Collectively, these procedures enable best transfection/transduction efficiencies, as well as consistent differentiation outcomes. The protocol described in establishing DM1 myoblast cell models would benefit the study of myotonic dystrophy, as well as other muscular diseases.

In this protocol, we present the procedures in establishing myotonic dystrophy 1 myoblast models, including optimized C2C12 cell maintenance, gene transfection/transduction, and myocyte differentiation.

דוגמנות Myotonic ניוון 1 בתאים C2C12 myoblast

Myotonic dystrophy 1 (DM1) is a common form of muscular dystrophy. Although several animal models have been established for DM1, myoblast cell models are ...

Rapid and Efficient Generation of Recombinant Human Pluripotent Stem Cells by Recombinase-mediated Cassette Exchange in the AAVS1 Locus

Even with the revolution of gene-targeting technologies led by CRISPR-Cas9, genetic modification of human pluripotent stem cells&#160;(hPSCs)&#160;is still time consuming. Comparative studies that use recombinant lines with transgenes integrated into safe harbor loci could benefit from approaches that use site-specific targeted recombinases, like Cre or FLPe, which are more rapid and less prone to off-target effects. Such methods have been described, although they do not significantly outperform gene targeting in most aspects. Using Zinc-finger nucleases, we previously created a master cell line in the AAVS1 locus of hPSCs&#160;that contains a GFP-Hygromycin-tk expressing cassette, flanked by heterotypic FRT sequences. Here, we describe the procedures to perform FLPe recombinase-mediated cassette exchange (RMCE) using this line. The master cell line is transfected with a RMCE donor vector, which contains a promoterless Puromycin resistance, and with FLPe recombinase. Application of both a positive (Puromycin) and negative (FIAU) selection program leads to the selection of RMCE without random integrations. RMCE generates fully characterized pluripotent polyclonal transgenic lines in 15 d&#160;with 100% efficiency. Despite the recently described limitations of the AAVS1 locus, the ease of the system paves the way for hPSC transgenesis in isogenic settings, is necessary for comparative studies, and enables semi-high-throughput genetic screens for gain/loss of function analysis that would otherwise be highly time consuming.

Rapid and Efficient Generation of Recombinant Human Pluripotent Stem Cells by Recombinase-mediated Cassette Exchange in the AAVS1 Locus

Here we report a rapid and efficient gene editing method based on RMCE in the AAVS1 locus of human Pluripotent Stem Cells (hPSCs) that improves upon previously described systems. Using this technique, isogenic lines can be rapidly and reliably generated for proper comparative studies, facilitating transgenesis-mediated research with hPSCs.

הדור מהיר ויעיל של תאי גזע פלוריפוטנטיים רקומביננטי אנושי ידי recombinase בתיווך המרת קלטת ב<em&gt; AAVS1</em&gt; לוקוס

Even with the revolution of gene-targeting technologies led by CRISPR-Cas9, genetic modification of human pluripotent stem cells&#160;(hPSCs)&#160;is ...

Forskolin-induced Swelling in Intestinal Organoids: An In Vitro Assay for Assessing Drug Response in Cystic Fibrosis Patients

Recently-developed cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR)-modulating drugs correct surface expression and/or function of the mutant CFTR channel in subjects with cystic fibrosis (CF). Identification of subjects that may benefit from these drugs is challenging because of the extensive heterogeneity of CFTR mutations, as well as other unknown factors that contribute to individual drug efficacy. Here, we describe a simple and relatively rapid assay for measuring individual CFTR function and response to CFTR modulators in vitro. Three dimensional (3D) epithelial organoids are grown from rectal biopsies in standard organoid medium. Once established, the organoids can be bio-banked for future analysis. For the assay, 30-80 organoids are seeded in 96-well plates in basement membrane matrix and are then exposed to drugs. One day later, the organoids are stained with calcein green, and forskolin-induced swelling is monitored by confocal live cell microscopy at 37 &#176;C. Forskolin-induced swelling is fully CFTR-dependent and is sufficiently sensitive and precise to allow for discrimination between the drug responses of individuals with different and even identical CFTR mutations. In vitro swell responses correlate with the clinical response to therapy. This assay provides a cost-effective approach for the identification of drug-responsive individuals, independent of their CFTR mutations. It may also be instrumental in the development of future CFTR modulators.

Forskolin-induced Swelling in Intestinal Organoids: An In Vitro Assay for Assessing Drug Response in Cystic Fibrosis Patients

This protocol describes an assay for measuring CFTR function and CFTR modulator responses in cultured tissue from subjects with cystic fibrosis (CF). Biopsy-derived intestinal organoids swell in a cAMP-driven fashion, a response that is defective (or strongly reduced) in CF organoids and can be restored by exposure to CFTR modulators.

Forskolin-induced נפיחות מעיים Organoids: An<em&gt; במבחנה</em&gt; Assay עבור הערכת תגובה לתרופה בחולי סיסטיק פיברוזיס

Recently-developed cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR)-modulating drugs correct surface expression and/or function of the mutant ...

Evaluation of Exon Inclusion Induced by Splice Switching Antisense Oligonucleotides in SMA Patient Fibroblasts

Spinal muscular atrophy (SMA), a lethal neurological disease caused by the loss of SMN1, presents a unique case in the field of antisense oligonucleotide (AON)-mediated therapy. While SMN1 mutations are responsible for the disease, AONs targeting intronic splice silencer (ISS) sites in SMN2, including FDA-approved nusinersen, have been shown to restore SMN expression and ameliorate the symptoms. Currently, many studies involving AON therapy for SMA focus on investigating novel AON chemistries targeting SMN2 that may be more effective and less toxic than nusinersen. Here, we describe a protocol for in vitro evaluation of exon inclusion using lipotransfection of AONs followed by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR), quantitative polymerase chain reaction (qPCR), and Western blotting. This method can be employed for various types of AON chemistries. Using this method, we demonstrate that AONs composed of alternating locked nucleic acids (LNAs) and DNA nucleotides (LNA/DNA mixmers) lead to efficient SMN2 exon inclusion and restoration of SMN protein at a very low concentration, and therefore, LNA/DNA mixmer-based antisense oligonucleotides may be an attractive therapeutic strategy to treat splicing defects caused by genetic diseases. The in vitro evaluation method described here is fast, easy, and sensitive enough for the testing of various novel AONs.

Various antisense oligonucleotides (AONs) have been shown to induce exon inclusion (splice modulation) and rescue SMN expression for spinal muscular atrophy (SMA). Here, we describe a protocol for AON lipotransfection to induce exon inclusion in the SMN2 gene and the evaluation methods to determine the efficacy in SMA patient fibroblasts.

הערכה של הכללה אקסון שנגזרות אחוי Oligonucleotides Antisense מיתוג ב SMA החולה Fibroblasts

Spinal muscular atrophy (SMA), a lethal neurological disease caused by the loss of SMN1, presents a unique case in the field of antisense oligonucleotide ...

Ex Vivo Expansion of Hematopoietic Stem Cells from Human Umbilical Cord Blood-derived CD34+ Cells Using Valproic Acid

Umbilical cord blood (UCB) units provide an alternative source of human hematopoietic stem cells (HSCs) for patients who require allogeneic bone marrow transplantation. While UCB has several unique advantages, the limited numbers of HSCs within each UCB unit limits their use in regenerative medicine and HSC transplantation in adults. Efficient expansion of functional human HSCs can be achieved by ex vivo culturing of CD34+ cells isolated from UCBs and treated with a deacetylase inhibitor, valproic acid (VPA). The protocol detailed here describes the culture conditions and methodology to rapidly isolate CD34+ cells and expand to a high degree a pool of primitive HSCs. The expanded HSCs are capable of establishing both short-term and long-term engraftment and are able to give rise to all types of differentiated hematopoietic cells. This method also holds potential for clinical application in autologous HSC gene therapy and provides an attractive approach to overcome the loss of functional HSCs associated with gene editing.

Ex Vivo Expansion of Hematopoietic Stem Cells from Human Umbilical Cord Blood-derived CD34+ Cells Using Valproic Acid

Here, we describe the ex vivo expansion of hematopoietic stem cells from CD34+ cells derived from umbilical cord blood treated with a combination of a cytokine cocktail and VPA. This method leads to a significant degree of ex vivo expansion of primitive HSCs for either clinical or laboratory applications.

Ex-Vivo הרחבה של תאי גזע Hematopoietic מן הטבור האדם הנגזרות דם CD34+ תאים באמצעות חומצה ולפרואית

Umbilical cord blood (UCB) units provide an alternative source of human hematopoietic stem cells (HSCs) for patients who require allogeneic bone marrow ...

Single Myofiber Isolation and Culture from a Murine Model of Emery-Dreifuss Muscular Dystrophy in Early Post-Natal Development

Autosomal dominant Emery-Dreifuss muscular dystrophy (EDMD) is caused by mutations in the LMNA gene, which encodes the A-type nuclear lamins, intermediate filament proteins that sustain the nuclear envelope and the components of the nucleoplasm. We recently reported that muscle wasting in EDMD can be ascribed to intrinsic epigenetic dysfunctions affecting muscle (satellite) stem cells regenerative capacity. Isolation and culture of single myofibers is one of the most physiological ex-vivo approaches to monitor satellite cells behavior within their niche, as they remain between the basal lamina surrounding the fiber and the sarcolemma. Therefore, it represents an invaluable experimental paradigm to study satellite cells from a variety of murine models. Here, we describe a re-adapted method to isolate intact and viable single myofibers from post-natal hindlimb muscles (Tibialis Anterior, Extensor Digitorum Longus, Gastrocnemius and Soleus). Following this protocol, we were able to study satellite cells from Lamin &#916;8-11 -/- mice, a severe EDMD murine model, at only 19 days after birth.
We detail the isolation procedure, as well as the culture conditions for obtaining a good amount of myofibers and their associated satellite-cells-derived progeny. When cultured in growth-factors rich medium, satellite cells derived from wild type mice activate, proliferate, and eventually differentiate or undergo self-renewal. In homozygous Lamin &#916;8-11 -/- mutant mice these capabilities are severely impaired.
This technique, if strictly followed, allows to study all processes linked to the myofiber-associated satellite cell even in early post-natal developmental stages and in fragile muscles.

Here, we propose a method to efficiently obtain single muscle fibers at early post-natal developmental stages from homozygous mutant Lamin &#916;8-11 mouse model, a very severe model for Emery-Dreifuss muscular dystrophy (EDMD).

בידוד ותרבות בודדים מודל מורנה של קבצי נייל-דרייפוס ניוון שרירים בתחילת לאחר לידה פיתוח

Autosomal dominant Emery-Dreifuss muscular dystrophy (EDMD) is caused by mutations in the LMNA gene, which encodes the A-type nuclear lamins, intermediate ...