Preparation of Viral DNA from Nucleocapsids

Viruses are obligate cellular parasites, and thus the study of their DNA requires isolating viral material away from host cell contaminants and DNA. ...

Differentiation of the SH-SY5Y Human Neuroblastoma Cell Line

Having appropriate in vivo and in vitro systems that provide translational models for human disease is an integral aspect of research in neurobiology and ...

Princeton University

The Pennsylvania State University

The molecular cues that regulate neurite morphology within the target environment are key to the formation of complex neural circuitry. During development of the ponto-cerebellar projection, pontine fibers sprout and form elaborate arbors within the inner cerebellar layer prior to arrival of their target cells, the cerebellar granule neurons. Here, we describe the biochemical fractionation of two granule neuron-derived factors that stimulate elaboration of pontine neurites. These factors were identified using a dissociated pontine bioassay and biochemically fractionated from granule cell (GC) conditioned medium (GCCM). One of the factors, STIM1, is a protein with a molecular weight greater than 30 kDa that is distinct from known neurotrophins. The other, STIM2, is a small, protease-resistant molecule with an estimated molecular weight below 1 kDa. We show that these factors stimulate pontine neurite elongation both independently and cooperatively and thus may contribute to the formation of elaborate pontine arbors within the cerebellar cortex.

Regulation of pontine neurite morphology by target-derived signals.

&#x89C4;&#x7BA1;&#x5728;&#x76EE;&#x6807;&#x73AF;&#x5883;&#x4E2D;&#x7684;&#x8F74;&#x7A81;&#x5F62;&#x6001;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x7EBF;&#x7D22;&#x662F;&#x5F62;&#x6210;&#x590D;&#x6742;&#x7684;&#x795E;&#x7ECF;&#x56DE;&#x8DEF;&#x7684;&#x5173;&#x952E;&#x3002;&#x6865;&#x8111;&#x5C0F;&#x8111;&#x6295;&#x5F71;&#x7684;&#x53D1;&#x5C55;&#xFF0C;&#x5728;&#x8111;&#x6865;&#x7EA4;&#x7EF4;&#x840C;&#x82BD;&#x548C;&#x5F62;&#x6210;&#x4E4B;&#x524D;&#x5230;&#x8FBE;&#x5176;&#x76EE;&#x6807;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#xFF0C;&#x5C0F;&#x8111;&#x9897;&#x7C92;&#x795E;&#x7ECF;&#x5143;&#x7684;&#x5C0F;&#x8111;&#x5185;&#x5C42;&#x5185;&#x7CBE;&#x5FC3;&#x4E54;&#x6728;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x63CF;&#x8FF0;&#x9897;&#x7C92;&#x795E;&#x7ECF;&#x5143;&#x6D3E;&#x751F;&#x7684;&#x4E24;&#x9879;&#x56E0;&#x7D20;&#x523A;&#x6FC0;&#x6865;&#x8111; neurites &#x62DF;&#x8BA2;&#x7684;&#x751F;&#x5316;&#x7684;&#x5206;&#x998F;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x56E0;&#x7D20;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E86;&#x4F7F;&#x7528;&#x6E38;&#x79BB;&#x6865;&#x8111;&#x751F;&#x7269;&#x548C;&#x751F;&#x5316;&#x9897;&#x7C92;&#x7EC6;&#x80DE; (GC) &#x6761;&#x4EF6;&#x57F9;&#x517B;&#x57FA; (GCCM) &#x4ECE;&#x5206;&#x7EA7;&#x3002;&#x5176;&#x4E2D;&#x4E00;&#x4E2A;&#x56E0;&#x7D20;&#xFF0C;STIM1&#xFF0C;&#x662F;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x91CF;&#x5927;&#x4E8E; 30 kDa&#xFF0C;&#x6709;&#x522B;&#x4E8E;&#x5DF2;&#x77E5;&#x7684;&#x795E;&#x7ECF;&#x8425;&#x517B;&#x56E0;&#x5B50;&#x3002;&#x53E6;&#xFF0C;STIM2&#xFF0C;&#x4E00;&#x79CD;&#x662F;&#x4F4E;&#x4E8E; 1 kDa &#x4F30;&#x8BA1;&#x5206;&#x5B50;&#x91CF;&#x5C0F;&#x3001; &#x6297;&#x86CB;&#x767D;&#x9176;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x663E;&#x793A;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x56E0;&#x7D20;&#x523A;&#x6FC0;&#x6865;&#x8111;&#x8F74;&#x7A81;&#x65AD;&#x88C2;&#x4F38;&#x957F;&#x7387;&#x5747;&#x72EC;&#x7ACB;&#x548C;&#x5408;&#x4F5C;&#xFF0C;&#x4ECE;&#x800C;&#x53EF;&#x80FD;&#x6709;&#x52A9;&#x4E8E;&#x5F62;&#x6210;&#x7CBE;&#x5FC3;&#x6865;&#x8111;&#x4E54;&#x6728;&#x6811;&#x79CD;&#x7684;&#x5C0F;&#x8111;&#x76AE;&#x5C42;&#x5185;&#x3002;

&#x6865;&#x8111;&#x8F74;&#x7A81;&#x5F62;&#x6001;&#x76EE;&#x6807;&#x6D3E;&#x751F;&#x7684;&#x4FE1;&#x53F7;&#x6240;&#x89C4;&#x7BA1;&#x3002;

Les signaux mol&eacute;culaires qui r&eacute;gulent la morphologie des neurites dans l&#39;environnement cible sont essentiels &agrave; la formation des circuits neuronaux complexes. Au cours du d&eacute;veloppement de la projection ponto-c&eacute;r&eacute;belleuse, fibres Pontines germent et forment des tonnelles &eacute;labor&eacute;es au sein de la couche interne du cervelet avant l&#39;arriv&eacute;e de leurs cellules cibles, les neurones du cervelet granules. Ici, nous d&eacute;crivons le fractionnement biochimique de deux facteurs d&eacute;riv&eacute;s de neurone granule qui stimulent l&#39;&eacute;laboration des neurites pontiques. Ces facteurs ont &eacute;t&eacute; identifi&eacute;s &agrave; l&#39;aide d&#39;un bioessai Pontin dissoci&eacute; et biochimiquement fractionn&eacute;s de milieu de cellules (GC) conditionn&eacute; de granule (GCCM). Un des facteurs, STIM1, est une prot&eacute;ine de poids mol&eacute;culaire sup&eacute;rieur &agrave; 30 kDa qui se distingue des neurotrophines connus. L&#39;autre, STIM2, est une petite mol&eacute;cule r&eacute;sistantes &agrave; la prot&eacute;ase avec un poids mol&eacute;culaire inf&eacute;rieur 1 kDa. Nous montrons que ces facteurs stimulent l&#39;&eacute;longation des neurites pontine que fois ind&eacute;pendamment et en collaboration et donc peuvent contribuer &agrave; la formation de tonnelles de Pontines &eacute;labor&eacute;s dans le cortex c&eacute;r&eacute;belleux.

R&eacute;gulation de la morphologie des neurites pontique de signaux d&eacute;riv&eacute;s de cible.

Verordnung des pontinen Neuriten Morphologie von Ziel-abgeleiteten Signale.

I segnali molecolari che regolano la morfologia dei neuriti all&#39;interno dell&#39;ambiente di destinazione sono la chiave per la formazione di complessi circuiti neurali. Durante lo sviluppo della proiezione ponto-cerebellare, fibre pontine germogliano e formano pergole elaborati all&#39;interno dello strato cerebellare interno prima dell&#39;arrivo delle loro cellule bersaglio, i neuroni cerebellari del granello. Qui, descriviamo il frazionamento biochimico di due granuli neurone-derivato fattori che stimolano l&#39;elaborazione di neuriti pontine. Questi fattori sono stati identificati utilizzando un dissociato bioassay pontine e biochimicamente frazionato da mezzo di granulo cellulare (GC) condizionato (GCCM). Uno dei fattori, STIM1, &egrave; una proteina con peso molecolare maggiore di 30 kDa che &egrave; distinto dal noto neurotrofine. L&#39;altro, STIM2, &egrave; una molecola piccola, resistente alle proteasi con un peso molecolare stimato di sotto di 1 kDa. Mostriamo che questi fattori stimolano allungamento dei neuriti pontine che sia in modo indipendente e in modo cooperativo e cos&igrave; possono contribuire alla formazione di pergole pontine elaborate all&#39;interno della corteccia cerebellare.

Regolamento della morfologia dei neuriti pontine da segnali di destinazione-derivato.

&#x795E;&#x7D4C;&#x7A81;&#x8D77;&#x306E;&#x5F62;&#x614B;&#x3001;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x74B0;&#x5883;&#x5185;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3059;&#x308B;&#x5206;&#x5B50;&#x306E;&#x624B;&#x304C;&#x304B;&#x308A;&#x306F;&#x3001;&#x8907;&#x96D1;&#x306A;&#x795E;&#x7D4C;&#x56DE;&#x8DEF;&#x306E;&#x5F62;&#x6210;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x6A4B;&#x5C0F;&#x8133;&#x6295;&#x5C04;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x3001;&#x4E2D;&#x306B;&#x30DD;&#x30F3;&#x30C6;&#x30A3;&#x30FC;&#x30CD;&#x7E4A;&#x7DAD;&#x82BD;&#x3057;&#x3001;&#x5C0F;&#x8133;&#x306E;&#x5185;&#x5074;&#x306E;&#x5C64;&#x306E;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8; &#x30BB;&#x30EB;&#x5C0F;&#x8133;&#x9846;&#x7C92;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x5230;&#x7740;&#x524D;&#x306B;&#x5185;&#x306E;&#x7CBE;&#x5DE7;&#x306A;&#x30A2;&#x30FC;&#x30D0;&#x30FC;&#x3092;&#x5F62;&#x6210;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x30DD;&#x30F3;&#x30C6;&#x30A3;&#x30FC;&#x30CD;&#x795E;&#x7D4C;&#x7A81;&#x8D77;&#x306E;&#x7CBE;&#x7DFB;&#x5316;&#x3092;&#x523A;&#x6FC0;&#x3059;&#x308B; 2 &#x9846;&#x7C92;&#x30CB;&#x30E5;&#x30FC;&#x30ED;&#x30F3;&#x7531;&#x6765;&#x56E0;&#x5B50;&#x306E;&#x751F;&#x5316;&#x5B66;&#x5206;&#x753B;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x8AAC;&#x660E;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x8981;&#x56E0;&#x306F;&#x89E3;&#x96E2;&#x30DD;&#x30F3;&#x30C6;&#x30A3;&#x30FC;&#x30CD; &#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30A2;&#x30C3;&#x30BB;&#x30A4;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x305F;&#x540C;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x751F;&#x5316;&#x5B66;&#x5206;&#x753B;&#x306E;&#x9846;&#x7C92;&#x7D30;&#x80DE; (GC) &#x30A8;&#x30A2;&#x30B3;&#x30F3;&#x5A92;&#x4F53; (GCCM).1 &#x3064;&#x306E;&#x8981;&#x56E0;&#x306F;&#x3001;STIM1&#x3001;&#x65E2;&#x77E5;&#x30CB;&#x30E5;&#x30FC;&#x30ED;&#x30C8;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A3;&#x30F3;&#x304B;&#x3089;&#x533A;&#x5225;&#x3055;&#x308C;&#x308B; 30 &#x306E; kDa &#x3088;&#x308A;&#x5927;&#x304D;&#x3044;&#x5206;&#x5B50;&#x91CF;&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x4ED6;&#x3001;STIM2&#x3001;&#x5C0F;&#x3055;&#x306A;&#x3001;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC;&#x8010;&#x6027;&#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x306F;&#x5206;&#x5B50;&#x91CF; 1 kDa &#x4EE5;&#x4E0B;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x79C1;&#x9054;&#x306F;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x8981;&#x56E0;&#x304C;&#x4E21;&#x65B9;&#x72EC;&#x7ACB;&#x3068;&#x5354;&#x8ABF;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x3053;&#x3046;&#x3057;&#x3066;&#x5C0F;&#x8133;&#x76AE;&#x8CEA;&#x5185;&#x306E;&#x7CBE;&#x5DE7;&#x306A;&#x30DD;&#x30F3;&#x30C6;&#x30A3;&#x30FC;&#x30CD; &#x30A2;&#x30FC;&#x30D0;&#x30FC;&#x306E;&#x5F62;&#x6210;&#x306B;&#x8CA2;&#x732E;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x30DD;&#x30F3;&#x30C6;&#x30A3;&#x30FC;&#x30CD;&#x795E;&#x7D4C;&#x7A81;&#x8D77;&#x4F38;&#x9577;&#x3092;&#x523A;&#x6FC0;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30DD;&#x30F3;&#x30C6;&#x30A3;&#x30FC;&#x30CD;&#x795E;&#x7D4C;&#x7A81;&#x8D77;&#x5F62;&#x614B;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x7531;&#x6765;&#x306E;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3002;

&#xB300;&#xC0C1; &#xD658;&#xACBD;&#xC5D0;&#xC11C; neurite &#xD615;&#xD0DC;&#xD559;&#xC744; &#xC870;&#xC808; &#xD558;&#xB294; &#xBD84;&#xC790; &#xC2E0;&#xD638;&#xB294; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; &#xC2E0;&#xACBD; &#xD68C;&#xB85C;&#xC758; &#xD615;&#xC131;&#xC5D0;&#xC758; &#xC5F4;&#xC1E0;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#x6597; &#xC18C; &#xB1CC; &#xD22C;&#xC601;&#xC758; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; pontine &#xC12C;&#xC720; &#xC0C8;&#xC2F9; &#xBC0F; &#xC18C; &#xB1CC;&#xACFC; &#xB9BD; &#xB274;&#xB7F0; &#xB300;&#xC0C1; &#xC140;&#xC758; &#xB3C4;&#xCC29; &#xC804;&#xC5D0; &#xB0B4;&#xBD80; &#xC18C; &#xB1CC; &#xB808;&#xC774;&#xC5B4; &#xB0B4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC815;&#xAD50;&#xD55C; &#xC544; &#xBC84;&#xB97C; &#xD615;&#xC131;. &#xC5EC;&#xAE30;&#xC5D0;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; pontine neurites&#xC758; &#xB3D9;&#xD654;&#xB97C; &#xC790;&#xADF9; &#xD558;&#xB294; &#xB450; &#xC2E0;&#xACBD; &#xD30C;&#xC0DD; &#xD558;&#xB294; &#xB9BD; &#xC694;&#xC778;&#xC758; &#xC0DD; &#xD654; &#xD559;&#xC801; &#xBD84;&#xB958; &#xC124;&#xBA85;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC694;&#xC18C;&#xB294; &#xCC9C;&#xC5F0;&#xB41C; pontine bioassay &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xACE0;&#xACFC; &#xB9BD; &#xC138;&#xD3EC; (GC) &#xB2E8;&#xB828; &#xC911;&#xAC04; (GCCM)&#xC5D0;&#xC11C; fractionated &#xD654;&#xD559;&#xC801; &#xD655;&#xC778; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. STIM1, &#xC694;&#xC778; &#xC911; &#xD558;&#xB098;&#xAC00; &#xB2E4;&#xB978; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4;&#xB41C; neurotrophins 30 kDa &#xC774;&#xC0C1;&#xC758; &#xBD84;&#xC790;&#xB7C9;&#xC744; &#xAC00;&#xC9C4; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;. STIM2, &#xB2E4;&#xB978; 1 kDa &#xC544;&#xB798; &#xC608;&#xC0C1;&#xB41C; &#xBD84;&#xC790;&#xB7C9;&#xACFC; &#xC791;&#xC740;, protease &#xC800;&#xD56D; &#xBD84;&#xC790; &#xC774;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC694;&#xC18C; &#xB458; &#xB2E4; &#xB3C5;&#xB9BD;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xD558; &#xACE0; &#xD611;&#xB825; &#xD558; &#xACE0; &#xB530;&#xB77C;&#xC11C; &#xC18C; &#xB1CC; &#xD53C; &#xC9C8; &#xB0B4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC815;&#xAD50;&#xD55C; pontine &#xC544; &#xBC84;&#xC758; &#xD615;&#xC131;&#xC5D0; &#xAE30;&#xC5EC;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; pontine neurite &#xC2E0;&#xC7A5; &#xC790;&#xADF9;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xADDC;&#xC81C; &#xB300;&#xC0C1; &#xD30C;&#xC0DD; &#xB41C; &#xC2E0;&#xD638;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; pontine neurite &#xD615;&#xD0DC;&#xD559;.

Las se&ntilde;ales moleculares que regulan la morfolog&iacute;a neurita dentro del entorno de destino son clave para la formaci&oacute;n de los circuitos neuronales complejos. Durante el desarrollo de la proyecci&oacute;n de ponto-cerebeloso, fibras Pontinas germinar y forman cenadores elaborados dentro de la capa interna cerebelosa antes de la llegada de sus c&eacute;lulas blanco, las neuronas de gr&aacute;nulo cerebeloso. Aqu&iacute;, describimos el fraccionamiento bioqu&iacute;mico de dos factores de neurona-derivado del gr&aacute;nulo los que estimulan la elaboraci&oacute;n de neuritas Pontinas. Estos factores fueron identificados mediante un bioensayo del pontine disociado y bioqu&iacute;micamente fraccionado de medio condicionada de la c&eacute;lula (GC) de gr&aacute;nulo (GCCM). Uno de los factores, STIM1, es una prote&iacute;na con un peso molecular mayor de 30 kDa que es distinta de neurotrofinas conocido. El otro, STIM2, es una mol&eacute;cula peque&ntilde;a, resistente a la proteasa con un peso molecular estimado por debajo de 1 kDa. Mostramos que estos factores estimulan la elongaci&oacute;n del pontine neurita que ambos independientemente y cooperativamente y as&iacute; pueden contribuir a la formaci&oacute;n de cenadores del pontine elaborados dentro de la corteza cerebelosa.

Regulaci&oacute;n de la morfolog&iacute;a del pontine neurita por se&ntilde;ales derivadas de destino.

&#x5728;&#x5176;&#x73AF;&#x5883;&#x4E2D;&#x63D0;&#x793A;&#x540E;&#x53D7;&#x5230;&#x635F;&#x4F24;&#x662F;&#x7531;&#x5176;&#x4E24;&#x4E2A;&#x5185;&#x5728;&#x7684;&#x72B6;&#x6001;&#x548C;&#x5F71;&#x54CD;&#x4E5F;&#x5916;&#x5728;&#x518D;&#x751F;&#x529F;&#x80FD;&#x8FDE;&#x63A5;&#x795E;&#x7ECF;&#x5143;&#x7684;&#x80FD;&#x529B;&#x3002;&#x5728;&#x4F53;&#x5185;&#x6A21;&#x578B;&#x635F;&#x4F24;&#x548C;&#x518D;&#x751F;&#x7684;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x7ECF;&#x5386;&#x4E86;&#x7531;&#x795E;&#x7ECF;&#x5143;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x53D8;&#x5316;&#x7684;&#x8C03;&#x67E5;&#x63ED;&#x793A;&#x4E0E;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x8FDB;&#x7A0B;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x7684;&#x8BB8;&#x591A;&#x6210;&#x7EE9;&#x5355;&#x3002;&#x7531;&#x4E8E;&#x4F53;&#x5185;&#x7684;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x7684;&#x590D;&#x6742;&#x73AF;&#x5883;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7ED3;&#x679C;&#x5305;&#x62EC;&#x4E0D;&#x4EC5;&#x76F4;&#x63A5;&#x6709;&#x5173;&#x7684;&#x84C4;&#x70ED;&#x5F0F;&#x4EA7;&#x7269;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x53D8;&#x5316;&#x548C;&#x4F46;&#x4E5F;&#x65E0;&#x5173;&#x5230;&#x5468;&#x56F4;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x548C;&#x4FE1;&#x53F7;&#x7684;&#x54CD;&#x5E94;&#x3002;&#x7A81;&#x8D77;&#x7684;&#x4F53;&#x5916;&#x6A21;&#x578B;&#x63D0;&#x4F9B;&#x4E00;&#x79CD;&#x624B;&#x6BB5;&#xFF0C;&#x7814;&#x7A76;&#x4ECE;&#x9644;&#x8FD1;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x548C;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x7684;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x5916;&#x5728;&#x7EBF;&#x7D22;&#x6CA1;&#x6709;&#x7A81;&#x8D77;&#x7684;&#x5185;&#x5728;&#x8F6C;&#x5F55;&#x6A21;&#x5F0F;&#x3002;

&#x8F74;&#x7A81;&#x548C;&#x518D;&#x751F;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x4E2D;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x5206;&#x6790;&#x3002;

The ability of a neuron to regenerate functional connections after injury is influenced by both its intrinsic state and also by extrinsic cues in its surroundings. Investigations of the transcriptional changes undergone by neurons during in vivo models of injury and regeneration have revealed many transcripts associated with these processes. Because of the complex milieu of interactions in vivo, these results include not only expression changes directly related to regenerative outgrowth and but also unrelated responses to surrounding cells and signals. In vitro models of neurite outgrowth provide a means to study the intrinsic transcriptional patterns of neurite outgrowth in the absence of extensive extrinsic cues from nearby cells and tissues.

Analysis of gene expression during neurite outgrowth and regeneration.

La capacit&eacute; d&#39;un neurone de r&eacute;g&eacute;n&eacute;rer les connexions fonctionnelles apr&egrave;s que blessure est influenc&eacute;e par les deux son &eacute;tat intrins&egrave;que et par extrins&egrave;que cues dans ses environs. Enqu&ecirc;tes sur l&#39;&eacute;volution transcriptionnelle de neurones au cours de mod&egrave;les in vivo de blessures et de r&eacute;g&eacute;n&eacute;ration ont r&eacute;v&eacute;l&eacute; plusieurs transcriptions associ&eacute;es &agrave; ces processus. En raison du milieu complex d&#39;interactions in vivo, ces r&eacute;sultats comprennent non seulement les changements expression directement li&eacute;s &agrave; l&#39;excroissance r&eacute;g&eacute;n&eacute;ratrice et mais &eacute;galement sans rapport avec r&eacute;ponses &agrave; qui entoure les cellules et les signaux. Mod&egrave;les in vitro de la croissance des neurites fournissent un moyen d&#39;&eacute;tudier les patrons de transcriptionnelles intrins&egrave;ques des neurites en l&#39;absence de vastes signaux extrins&egrave;ques d&#39;&agrave; proximit&eacute; des cellules et des tissus.

Analyse de l&#39;expression g&eacute;nique au cours de la r&eacute;g&eacute;n&eacute;ration et la croissance des neurites.

Die F&auml;higkeit eines Neurons, funktionale Verbindungen zu regenerieren, nachdem Verletzungen durch beide seinen inneren Zustand und auch durch extrinsische beeinflusst wird Hinweise in seiner Umgebung. Untersuchungen der transcriptional &Auml;nderungen w&auml;hrend der in-vivo-Modelle der Sch&auml;digung und Regeneration von Neuronen unterzogen haben ergeben, dass viele Abschriften dieser Prozesse zugeordnet. Wegen dem komplexen Umfeld von Interaktionen in-vivo, diese Ergebnisse sind nicht nur Ausdruck &Auml;nderungen unmittelbar auf regenerative Auswuchs und aber auch unabh&auml;ngige Antworten zu umgebenden Zellen und Signale. In-vitro-Modelle der Neurit Auswuchs bieten eine M&ouml;glichkeit, die systeminterne transkriptionelle Muster der Neurit Auswuchs ohne umfangreiche extrinsische Signale von nahe gelegenen Zellen und Gewebe zu studieren.

Analyse der Genexpression w&auml;hrend Neurit Auswuchs und Regeneration.

La capacit&agrave; di un neurone di rigenerare connessioni funzionali dopo l&#39;infortunio &egrave; influenzata dal suo stato sia intrinseco e anche da estrinseca spunti nei suoi dintorni. Le indagini dei cambiamenti transcriptional subiti dai neuroni nel corso di modelli in vivo delle lesioni e della rigenerazione hanno rivelato molte trascrizioni associate con questi processi. A causa del complesso milieu di interazioni in vivo, questi risultati includono non solo i cambiamenti di espressione direttamente correlati a escrescenza rigenerativa e ma anche estranei responses to che circonda le cellule e i segnali. Modelli in vitro di escrescenza dei neuriti forniscono un mezzo per studiare i modelli di transcriptional intrinseci di crescita dei neuriti in assenza di spunti estrinseci estesi da vicino cellule e tessuti.

Analisi dell&#39;espressione genica durante la crescita dei neuriti e rigenerazione.

&#x50B7;&#x5BB3;&#x304C;&#x4E21;&#x65B9;&#x3092;&#x7D44;&#x307F;&#x8FBC;&#x307F;&#x72B6;&#x614B;&#x3068;&#x5916;&#x56E0;&#x6027;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x3082;&#x5F71;&#x97FF;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x5F8C;&#x6A5F;&#x80FD;&#x306E;&#x63A5;&#x7D9A;&#x3092;&#x518D;&#x751F;&#x6210;&#x3059;&#x308B;&#x80FD;&#x529B;&#x3092;&#x30CB;&#x30E5;&#x30FC;&#x30ED;&#x30F3;&#x306E;&#x5468;&#x8FBA;&#x3067;&#x5408;&#x56F3;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x50B7;&#x5BB3;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x518D;&#x751F;&#x4E2D;&#x306B; in vivo &#x3067;&#x306E;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x30CB;&#x30E5;&#x30FC;&#x30ED;&#x30F3;&#x3092;&#x53D7;&#x3051;&#x3066;&#x8EE2;&#x5199;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x306E;&#x8ABF;&#x67FB;&#x306F;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30BB;&#x30B9;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x6210;&#x7E3E;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;In vivo &#x3067;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306E;&#x8907;&#x96D1;&#x306A;&#x74B0;&#x5883;&#x305F;&#x3081;&#x3001;&#x306B;&#x306F;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x304B;&#x3089;&#x306B;&#x306F;&#x76F4;&#x63A5;&#x518D;&#x751F;&#x306E;&#x526F;&#x7523;&#x7269;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x5F0F;&#x5909;&#x66F4;&#x3060;&#x3051;&#x3067;&#x306A;&#x304F;&#x304C;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3001;&#x3057;&#x304B;&#x3057;&#x3001;&#x5468;&#x56F2;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x3068;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x3078;&#x306E;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3082;&#x7121;&#x95A2;&#x4FC2;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x795E;&#x7D4C;&#x7A81;&#x8D77;&#x4F38;&#x9577;&#x306E; in vitro &#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x795E;&#x7D4C;&#x7A81;&#x8D77;&#x4F38;&#x9577;&#x306E;&#x8FD1;&#x304F;&#x306E;&#x30BB;&#x30EB;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30C6;&#x30A3;&#x30C3;&#x30B7;&#x30E5;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x5E83;&#x7BC4;&#x306A;&#x5916;&#x56E0;&#x6027;&#x624B;&#x304C;&#x304B;&#x308A;&#x306E;&#x4E0D;&#x5728;&#x3067;&#x7D44;&#x307F;&#x8FBC;&#x307F;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x3059;&#x308B;&#x624B;&#x6BB5;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x795E;&#x7D4C;&#x7A81;&#x8D77;&#x4F38;&#x5C55;&#x3068;&#x518D;&#x751F;&#x6642;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x5206;&#x6790;&#x3002;

&#xC0C1;&#xD574; &#xBAA8;&#xB450; &#xB0B4;&#xBD80; &#xC0C1;&#xD0DC; &#xBC0F; &#xC678;&#xBD80;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xBC1B;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xD6C4; &#xAE30;&#xB2A5; &#xC5F0;&#xACB0;&#xC744; &#xB2E4;&#xC2DC; &#xC0DD;&#xC131; &#xD558;&#xB294; &#xC2E0;&#xACBD;&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC5D0; &#xADF8; &#xC8FC;&#xBCC0; &#xB2E8;&#xC11C;. In vivo &#xBAA8;&#xB378;&#xC758; &#xBD80;&#xC0C1; &#xBC0F; &#xC7AC;&#xC0DD;&#xC131; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xC2E0;&#xACBD; &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xBC1B;&#xC740; transcriptional &#xBCC0;&#xD654;&#xC758; &#xC870;&#xC0AC; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xD504;&#xB85C;&#xC138;&#xC2A4;&#xC640; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xB9CE;&#xC740; &#xC0AC;&#xBCF8;&#xC744; &#xBC1D;&#xD600;&#xC84C;&#xB2E4;. Vivo&#xC5D0;&#xC11C; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC758; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; &#xD658;&#xACBD; &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xACB0;&#xACFC; &#xC7AC;&#xC0DD; &#xD30C;&#xC0DD;&#xBB3C; &#xC9C1;&#xACB0; &#xC2DD; &#xBCC0;&#xACBD; &#xBFD0;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xACE0; &#xB610;&#xD55C; &#xC8FC;&#xC704; &#xC138;&#xD3EC; &#xBC0F; &#xC2E0;&#xD638;&#xC5D0; &#xC751;&#xB2F5;&#xC744; &#xAD00;&#xB828;&#xC774; &#xC5C6;&#xB294;. Neurite &#xD30C;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC758; &#xCCB4; &#xC678; &#xBAA8;&#xB378; &#xC8FC;&#xBCC0; &#xC138;&#xD3EC;&#xC640; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD55C; &#xC678;&#xBD80; &#xC2E0;&#xD638; &#xC5C6;&#xC774; neurite &#xD30C;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC758; &#xBCF8;&#xC9C8;&#xC801;&#xC778; transcriptional &#xD328;&#xD134;&#xC744; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xD558;&#xB294; &#xC218;&#xB2E8;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Neurite &#xD30C;&#xC0DD;&#xBB3C; &#xBC0F; &#xC7AC;&#xC0DD;&#xC131; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604; &#xBD84;&#xC11D;.

La capacidad de una neurona para regenerar las conexiones funcionales despu&eacute;s de lesi&oacute;n est&aacute; influenciada por tanto su estado intr&iacute;nseco y extr&iacute;nseco de se&ntilde;ales en su entorno. Las investigaciones de las transformaciones transcripcionales por neuronas en modelos in vivo de la lesi&oacute;n y regeneraci&oacute;n han revelado muchas transcripciones asociadas con estos procesos. Debido al ambiente complejo de interacciones in vivo, estos resultados incluyen no s&oacute;lo cambios de expresi&oacute;n relacionados con consecuencia regenerativa y pero tambi&eacute;n, no relacionado con las respuestas a las c&eacute;lulas y las se&ntilde;ales. Modelos in vitro de neurita consecuencia proporcionan un medio para estudiar los patrones transcripcionales intr&iacute;nsecos de neurita consecuencia en la ausencia de se&ntilde;ales extr&iacute;nsecas extensas de c&eacute;lulas y tejidos cercanos.

An&aacute;lisis de expresi&oacute;n g&eacute;nica en consecuencia neurita y regeneraci&oacute;n.

&#x534F;&#x8C03;&#x6D3B;&#x52A8;&#x4E2D;&#x795E;&#x7ECF;&#x5143;&#x7535;&#x8DEF;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x65B9;&#x6CD5;&#x6CA1;&#x6709;&#x6311;&#x6218;&#x6027;&#xFF0C;&#x540C;&#x65F6;&#x62A5;&#x544A;&#x6D3B;&#x52A8;&#x548C;&#x8FDE;&#x901A;&#x6027;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5728;&#x5EA7;&#x4F2A;&#x72C2;&#x72AC;&#x75C5;&#x75C5;&#x6BD2; &#xFF08;&#x4E0A;&#x4E00;&#x9875;&#xFF09;&#xFF0C;&#x901A;&#x8FC7; synaptically &#x8FDE;&#x63A5;&#x795E;&#x7ECF;&#x5143;&#xFF0C;&#x8868;&#x8FBE;&#x8367;&#x5149;&#x9499;&#x6307;&#x6807;&#x86CB;&#x767D;&#x548C;&#x76D1;&#x89C6;&#x5668;&#x4E2D;&#x7684;&#x795E;&#x7ECF;&#x5143;&#x6D3B;&#x52A8;&#x751F;&#x6D3B;&#x52A8;&#x7269;&#x4F20;&#x64AD;&#x7684;&#x7B2C;&#x4E00;&#x6B21;&#x7684;&#x4F7F;&#x7528;&#x3002;&#x52A8;&#x4F5C;&#x7535;&#x4F4D;&#x6570;&#x76EE;&#x6210;&#x6B63;&#x6BD4;&#x8367;&#x5149;&#x4FE1;&#x53F7;&#x4E5F;&#x80FD;&#x53EF;&#x9760;&#x5730;&#x68C0;&#x6D4B;&#x5230;&#x4F53;&#x5916;&#x7684;&#x5355;&#x4E2A;&#x52A8;&#x4F5C;&#x7535;&#x4F4D;&#x3002;&#x53CC;&#x5149;&#x5B50;&#x6210;&#x50CF;&#x4F53;&#x5185;&#xFF0C;&#x89C2;&#x5BDF;&#x5230;&#x4E24;&#x8005;&#x7684;&#x81EA;&#x53D1;&#x548C;&#x523A;&#x6FC0;&#x7684;&#x6D3B;&#x52A8;&#x7684;&#x795E;&#x7ECF;&#x5143;&#x611F;&#x67D3;&#x5C0F;&#x9F20;&#x5916;&#x5468;&#x8840;&#x81EA;&#x4E3B;&#x795E;&#x7ECF;&#x988C;&#x4E0B;&#x817A;&#x795E;&#x7ECF;&#x8282; (SMG)&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5149;&#x5F55; SMG &#x54CD;&#x5E94;&#x76F4;&#x63A5;&#x7535;&#x523A;&#x6FC0;&#x7A81;&#x89E6;&#x524D;&#x795E;&#x7ECF;&#x8F74;&#x7A81;&#x548C;&#x751F;&#x7406;&#x6709;&#x5173;&#x611F;&#x5B98;&#x523A;&#x6FC0;&#x53E3;&#x8154;&#x5185;&#x7684;&#x553E;&#x6DB2;&#x7535;&#x8DEF;&#x3002;&#x5728;&#x63A5;&#x79CD;&#x540E;&#x7684; 48 &#x5C0F;&#x65F6;&#x7684;&#x65F6;&#x95F4;&#x7A97;&#x53E3;&#xFF0C;&#x51E0;&#x4E2A;&#x81EA;&#x53D1;&#x77AC;&#x53D8;&#x53D1;&#x751F;&#x3002;72 &#x5C0F;&#x65F6;&#x5185;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x786E;&#x5B9A;&#x66F4;&#x52A0;&#x9891;&#x7E41;&#x548C;&#x957F;&#x65F6;&#x95F4;&#x81EA;&#x53D1;&#x9499;&#x8FC7;&#x5BA2;&#xFF0C;&#x6697;&#x793A;&#x6027;&#x7684;&#x795E;&#x7ECF;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6216;&#x53D7;&#x611F;&#x67D3;&#x7684;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x53CD;&#x5E94;&#x5F71;&#x54CD;&#x9499;&#x4FE1;&#x53F7;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x5DE5;&#x4F5C;&#x89C4;&#x5B9A;&#x4E86;&#x4F53;&#x5185;&#x7684;&#x751F;&#x7406;&#x795E;&#x7ECF;&#x5143;&#x56DE;&#x8DEF;&#x6D3B;&#x52A8;&#x7684;&#x8C03;&#x67E5;&#x548C;&#x540E;&#x7EED;&#x5F71;&#x54CD;&#x611F;&#x67D3;&#x7684;&#x5355;&#x4E2A;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7684;&#x51B3;&#x8BAE;&#x3002;

&#x57FA;&#x4E8E;&#x8367;&#x5149;&#x7684;&#x4F53;&#x5185;&#x795E;&#x7ECF;&#x6D3B;&#x52A8;&#x4F7F;&#x7528;&#x7535;&#x8DEF;&#x8DDF;&#x8E2A;&#x732A;&#x4F2A;&#x72C2;&#x72AC;&#x75C5;&#x75C5;&#x6BD2;&#x7684;&#x76D1;&#x6D4B;&#x3002;

The study of coordinated activity in neuronal circuits has been challenging without a method to simultaneously report activity and connectivity. Here we present the first use of pseudorabies virus (PRV), which spreads through synaptically connected neurons, to express a fluorescent calcium indicator protein and monitor neuronal activity in a living animal. Fluorescence signals were proportional to action potential number and could reliably detect single action potentials in vitro. With two-photon imaging in vivo, we observed both spontaneous and stimulated activity in neurons of infected murine peripheral autonomic submandibular ganglia (SMG). We optically recorded the SMG response in the salivary circuit to direct electrical stimulation of the presynaptic axons and to physiologically relevant sensory stimulation of the oral cavity. During a time window of 48 hours after inoculation, few spontaneous transients occurred. By 72 hours, we identified more frequent and prolonged spontaneous calcium transients, suggestive of neuronal or tissue responses to infection that influence calcium signaling. Our work establishes in vivo investigation of physiological neuronal circuit activity and subsequent effects of infection with single cell resolution.

Fluorescence-based monitoring of in vivo neural activity using a circuit-tracing pseudorabies virus.

L&#x26;#39;&#xE9;tude de l&#x26;#39;activit&#xE9; coordonn&#xE9;e dans les circuits neuronaux a &#xE9;t&#xE9; difficile sans une m&#xE9;thode &#xE0; la fois les rapports d&#x26;#39;activit&#xE9; et de la connectivit&#xE9;. Nous pr&#xE9;sentons ici la premi&#xE8;re utilisation de virus de la pseudo (PRV), qui se propage &#xE0; travers les neurones connect&#xE9;s synaptique, d&#x26;#39;exprimer une prot&#xE9;ine fluorescente de calcium et de surveiller l&#x26;#39;indicateur de l&#x26;#39;activit&#xE9; neuronale chez un animal vivant. Signaux de fluorescence &#xE9;tait proportionnelle au nombre potentiel d&#x26;#39;action et pourrait d&#xE9;tecter de mani&#xE8;re fiable des potentiels d&#x26;#39;action simples in vitro. Avec deux photons d&#x26;#39;imagerie in vivo, nous avons observ&#xE9; &#xE0; la fois l&#x26;#39;activit&#xE9; spontan&#xE9;e et stimul&#xE9;e dans les neurones de ganglions infect&#xE9;s murin submandibulaire p&#xE9;riph&#xE9;rique autonome (SMG). On enregistre optiquement la r&#xE9;ponse dans le circuit SMG salivaire &#xE0; une stimulation &#xE9;lectrique directe des axones pr&#xE9;synaptiques et &#xE0; une stimulation sensorielle physiologiquement pertinente de la cavit&#xE9; buccale. Lors d&#x26;#39;une fen&#xEA;tre de temps de 48 heures apr&#xE8;s l&#x26;#39;inoculation, quelques transitoires spontan&#xE9;es s&#x26;#39;est produite. En 72 heures, nous avons identifi&#xE9; plus fr&#xE9;quentes et prolong&#xE9;es transitoires calciques spontan&#xE9;es, sugg&#xE9;rant des r&#xE9;ponses neuronales ou des tissus &#xE0; l&#x26;#39;infection que le calcium influence de signalisation. Notre travail &#xE9;tablit &#xE9;tude in vivo de l&#x26;#39;activit&#xE9; neuronale physiologique circuit et les effets ult&#xE9;rieurs de l&#x26;#39;infection avec une r&#xE9;solution cellulaire unique.

Bas&#xE9;es sur la fluorescence de surveillance de l&#x26;#39;activit&#xE9; neurale in vivo utilisant un virus Circuit de tra&#xE7;age pseudorage

Das Studium der koordinierte Aktivit&auml;t in neuronale Schaltkreise hat ohne eine Methode schwierig wurde, gleichzeitig Aktivit&auml;t und Konnektivit&auml;t zu melden. Hier pr&auml;sentieren wir die erste Verwendung des Pseudorabies Virus (PRV), die sich durch synaptisch verbundenen Neuronen eine fluoreszierende Kalzium Indikator-Protein und Monitor neuronale Aktivit&auml;t in ein lebendes Tier ausdr&uuml;cken verbreitet. Fluoreszenzsignale waren proportional zur Anzahl Aktionspotential und konnten einzelne Aktionspotentiale in-vitro-zuverl&auml;ssig erkennen. Mit zwei-Photonen-Bildgebung in-vivo, beobachteten wir beide spontane und stimulierte Aktivit&auml;t in Neuronen des infizierten muriner peripherer autonomer submandibular Ganglien (SMG). Optisch verzeichneten wir die SMG-Antwort in die Speicheldr&uuml;sen Schaltung elektrische Stimulation des pr&auml;synaptischen Axons und physiologisch relevanten sensorische Stimulation der Mundh&ouml;hle zu lenken. W&auml;hrend ein Zeitfenster von 48 Stunden nach der Impfung aufgetreten sind einige spontane Transienten. Von 72 Stunden, die wir identifiziert mehr h&auml;ufige und lang anhaltende spontane Kalzium Transienten, suggestive der neuronalen oder Gewebe Antworten auf eine Infektion, die Signalisierung von Kalzium beeinflussen. Unsere Arbeit gr&uuml;ndet in-vivo-Untersuchung der physiologischen neuronaler Schaltkreise Aktivit&auml;t und nachfolgenden Effekte einer Infektion mit einer einzelnen Zelle Aufl&ouml;sung.

Fluoreszenz-basierte &Uuml;berwachung der in-vivo neuronale Aktivit&auml;t, wobei einen Stromkreis-Ablaufverfolgung Pseudorabies Virus.

Lo studio di attivit&agrave; coordinato nei circuiti neuronali ha stato impegnativo senza un metodo per segnalare contemporaneamente attivit&agrave; e connettivit&agrave;. Qui vi presentiamo il primo uso del virus Pseudorabbia (PRV), che si diffonde attraverso i neuroni sinapticamente connessi, di esprimere un calcio fluorescente indicatore della proteina e monitor attivit&agrave; neuronale in un animale vivente. Segnali di fluorescenza sono proporzionali al numero di potenziale d&#39;azione e potrebbero rilevare attendibilmente singoli potenziali d&#39;azione in vitro. Con due-fotone imaging in vivo, abbiamo osservato sia spontanea e stimolata attivit&agrave; nei neuroni di infetti murini gangli sottomandibolari autonomici periferici (SMG). Abbiamo registrato otticamente la risposta SMG nel circuito salivaria per diretta stimolazione elettrica di assoni presinaptico e alla stimolazione sensoriale fisiologicamente rilevante della cavit&agrave; orale. Durante una finestra temporale di 48 ore dopo l&#39;inoculazione, alcuni transitori spontanei si &egrave; verificato. Da 72 ore, abbiamo identificato pi&ugrave; frequenti e prolungate calcio spontaneo transitori, suggestive di un neurone o risposte dei tessuti all&#39;infezione che influenzano la segnalazione di calcio. Il nostro lavoro stabilisce indagine in vivo dell&#39;attivit&agrave; fisiologica circuito neuronale e successivi effetti di infezione con risoluzione della singola cella.

Monitoraggio dell&#39;attivit&agrave; neurale in vivo usando un circuito-tracing Pseudorabbia virus basato su fluorescenza.

&#x795E;&#x7D4C;&#x56DE;&#x8DEF;&#x306E;&#x5354;&#x8ABF;&#x6D3B;&#x52D5;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x306F;&#x3001;&#x540C;&#x6642;&#x306B;&#x6D3B;&#x52D5;&#x3068;&#x306E;&#x63A5;&#x7D9A;&#x6027;&#x3092;&#x5831;&#x544A;&#x3059;&#x308B;&#x65B9;&#x6CD5;&#x306A;&#x3057;&#x3067;&#x6311;&#x6226;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x86CD;&#x5149;&#x30AB;&#x30EB;&#x30B7;&#x30A6;&#x30E0;&#x6307;&#x793A;&#x85AC;&#x306E;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x3092;&#x767A;&#x73FE;&#x3057;&#x3001;&#x751F;&#x304D;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x52D5;&#x7269;&#x306E;&#x795E;&#x7D4C;&#x6D3B;&#x52D5;&#x3092;&#x30E2;&#x30CB;&#x30BF;&#x30FC;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30B7;&#x30CA;&#x30D7;&#x30B9;&#x63A5;&#x7D9A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30CB;&#x30E5;&#x30FC;&#x30ED;&#x30F3;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x62E1;&#x6563;&#x3057;&#x3001;&#x4EEE;&#x6027;&#x72C2;&#x72AC;&#x75C5;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#xFF08;PRV&#xFF09;&#x3001;&#x306E;&#x6700;&#x521D;&#x306E;&#x4F7F;&#x7528;&#x3092;&#x63D0;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x86CD;&#x5149;&#x4FE1;&#x53F7;&#x306F;&#x6D3B;&#x52D5;&#x96FB;&#x4F4D;&#x306E;&#x6570;&#x306B;&#x6BD4;&#x4F8B;&#x3057;&#x305F;&#x3068;&#x78BA;&#x5B9F;&#x306B;in vitro&#x3067;&#x306E;&#x5358;&#x4E00;&#x6D3B;&#x52D5;&#x96FB;&#x4F4D;&#x3092;&#x691C;&#x51FA;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x3002; in vivo&#x3067;&#x306E;2&#x5149;&#x5B50;&#x30A4;&#x30E1;&#x30FC;&#x30B8;&#x30F3;&#x30B0;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x611F;&#x67D3;&#x3057;&#x305F;&#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x306E;&#x672B;&#x68A2;&#x81EA;&#x5F8B;&#x984E;&#x4E0B;&#x795E;&#x7D4C;&#x7BC0;&#xFF08;SMG&#xFF09;&#x306E;&#x795E;&#x7D4C;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x81EA;&#x767A;&#x7684;&#x523A;&#x6FC0;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x6D3B;&#x6027;&#x3092;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x5149;&#x5B66;&#x7684;&#x306B;&#x30B7;&#x30CA;&#x30D7;&#x30B9;&#x524D;&#x8EF8;&#x7D22;&#x306E;&#x76F4;&#x63A5;&#x96FB;&#x6C17;&#x523A;&#x6FC0;&#x3068;&#x53E3;&#x8154;&#x306E;&#x751F;&#x7406;&#x5B66;&#x7684;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x3059;&#x308B;&#x611F;&#x899A;&#x523A;&#x6FC0;&#x306B;&#x553E;&#x6DB2;&#x56DE;&#x8DEF;&#x306E;SMG&#x306E;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3092;&#x8A18;&#x9332;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x63A5;&#x7A2E;&#x5F8C;48&#x6642;&#x9593;&#x306E;&#x6642;&#x9593;&#x5E2F;&#x306B;&#x3001;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x81EA;&#x767A;&#x7684;&#x306A;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B8;&#x30A7;&#x30F3;&#x30C8;&#x304C;&#x767A;&#x751F;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002; 72&#x6642;&#x9593;&#x3067;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306B;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x4E0E;&#x3048;&#x308B;&#x30AB;&#x30EB;&#x30B7;&#x30A6;&#x30E0;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x3001;&#x611F;&#x67D3;&#x306B;&#x795E;&#x7D4C;&#x7D30;&#x80DE;&#x3084;&#x7D44;&#x7E54;&#x306E;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3001;&#x3088;&#x308A;&#x983B;&#x7E41;&#x304B;&#x3064;&#x9577;&#x6642;&#x9593;&#x306E;&#x81EA;&#x767A;&#x7684;&#x306A;&#x30AB;&#x30EB;&#x30B7;&#x30A6;&#x30E0;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B8;&#x30A7;&#x30F3;&#x30C8;&#x3092;&#x540C;&#x5B9A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x79C1;&#x305F;&#x3061;&#x306E;&#x4ED5;&#x4E8B;&#x306F;&#x3001;&#x751F;&#x7406;&#x7684;&#x306A;&#x795E;&#x7D4C;&#x56DE;&#x8DEF;&#x306E;&#x6D3B;&#x52D5;&#x3068;&#x5358;&#x4E00;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x3067;&#x611F;&#x67D3;&#x306E;&#x305D;&#x306E;&#x5F8C;&#x306E;&#x52B9;&#x679C;&#x306E;in vivo&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x78BA;&#x7ACB;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x56DE;&#x7DDA;&#x30C8;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B9;&#x4EEE;&#x6027;&#x72C2;&#x72AC;&#x75C5;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x305F;in vivo&#x795E;&#x7D4C;&#x6D3B;&#x52D5;&#x3067;&#x306E;&#x86CD;&#x5149;&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x76E3;&#x8996;

&#xC2E0;&#xACBD; &#xD68C;&#xB85C; &#xC870;&#xC815;&#xB41C; &#xD65C;&#xB3D9;&#xC758; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xD65C;&#xB3D9; &#xBC0F; &#xC5F0;&#xACB0;&#xC744; &#xB3D9;&#xC2DC;&#xC5D0; &#xBCF4;&#xACE0; &#xBA54;&#xC11C;&#xB4DC; &#xC5C6;&#xC774; &#xB3C4;&#xC804; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30;&#xC5D0; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xD604;&#xC7AC; &#xD615;&#xAD11; &#xC131; &#xCE7C;&#xC298; &#xD45C;&#xC2DC;&#xAE30; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xACFC; &#xBAA8;&#xB2C8;&#xD130; &#xC2E0;&#xACBD; &#xD65C;&#xB3D9;&#xC744; &#xC0B4;&#xC544;&#xC788;&#xB294; &#xB3D9;&#xBB3C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD45C;&#xD604; &#xD558;&#xB294; synaptically &#xC5F0;&#xACB0; &#xB41C; &#xB274;&#xB7F0;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574; &#xD655;&#xC0B0; pseudorabies &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; (PRV)&#xB97C; &#xCC98;&#xC74C;&#xC73C;&#xB85C; &#xC0AC;&#xC6A9;. &#xD615;&#xAD11; &#xC2E0;&#xD638; &#xD65C;&#xB3D9; &#xC804;&#xC704; &#xC218;&#xC5D0; &#xBE44;&#xB840; &#xD588;&#xB2E4; &#xACE0; &#xC548;&#xC815;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC0DD;&#xCCB4; &#xC678;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB2E8;&#xC77C; &#xC561;&#xC158; &#xC7A0;&#xC7AC;&#xB825;&#xC744; &#xAC10;&#xC9C0;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB450; &#xAD11;&#xC790; &#xC601;&#xC0C1;&#xACFC; &#xC0DD;&#xCCB4; &#xC870;&#xAC74;, &#xBAA8;&#xB450; &#xC790;&#xC5F0; &#xAD00;&#xCC30; &#xD558; &#xACE0; &#xB274;&#xB7F0;&#xC758; &#xC790;&#xADF9;&#xB41C; &#xD65C;&#xB3D9; &#xAC10;&#xC5FC; murine &#xC8FC;&#xBCC0; &#xC790;&#xC728; submandibular &#xC911;&#xCD94; (SMG). &#xC6B0;&#xB9AC; &#xAD11;&#xD559; presynaptic axons&#xC758; &#xBC0F; &#xAD6C;&#xAC15;&#xC758; &#xC21C;&#xC218; &#xAD00;&#xB828; &#xAC10;&#xAC01; &#xC790;&#xADF9;&#xC744; &#xC804;&#xAE30; &#xC790;&#xADF9;&#xC744; &#xC9C1;&#xC811; &#xCE68; &#xD68C;&#xB85C;&#xC5D0; SMG &#xC751;&#xB2F5;&#xC744; &#xAE30;&#xB85D; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC811;&#xC885; &#xD6C4; 48 &#xC2DC;&#xAC04;&#xC758; &#xAE30;&#xAC04; &#xB3D9;&#xC548; &#xBA87; &#xAC00;&#xC9C0; &#xC790;&#xBC1C;&#xC801;&#xC778; &#xACFC;&#xB3C4; &#xBC1C;&#xC0DD; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. 72 &#xC2DC;&#xAC04;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xB354; &#xC790;&#xC8FC; &#xD558; &#xACE0; &#xC7A5;&#xAE30;&#xAC04; &#xC790;&#xC5F0; &#xCE7C;&#xC298; &#xACFC;&#xB3C4;, &#xC2E0;&#xACBD;&#xC758; &#xC554;&#xC2DC; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xB610;&#xB294; &#xCE7C;&#xC298; &#xC2E0;&#xD638;&#xC5D0; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xC8FC;&#xB294; &#xAC10;&#xC5FC; &#xC870;&#xC9C1; &#xC751;&#xB2F5;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xC77C; &#xC0DD;&#xB9AC; &#xC801; &#xC2E0;&#xACBD; &#xD68C;&#xB85C; &#xD65C;&#xB3D9;&#xC758; vivo&#xC5D0;&#xC11C; &#xC870;&#xC0AC; &#xBC0F; &#xB2E8;&#xC77C; &#xC140; &#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4;&#xC640; &#xAC10;&#xC5FC;&#xC758; &#xD6C4;&#xC18D; &#xD6A8;&#xACFC; &#xC124;&#xC815;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xD615;&#xAD11; &#xAE30;&#xBC18; &#xD68C;&#xB85C; &#xCD94;&#xC801; pseudorabies &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC0DD;&#xCCB4; &#xC870;&#xAC74; &#xC2E0;&#xACBD; &#xD65C;&#xB3D9;&#xC758; &#xBAA8;&#xB2C8;&#xD130;&#xB9C1;.

El estudio de la actividad coordinada en los circuitos neuronales ha sido un desaf&#xED;o sin un m&#xE9;todo para informar al mismo tiempo la actividad y conectividad. Aqu&#xED; les presentamos el primer uso de virus de la pseudorrabia (PRV), que se propaga a trav&#xE9;s de las neuronas conectadas sin&#xE1;pticamente, para expresar una prote&#xED;na de calcio indicador fluorescente y controlar la actividad neuronal en un animal vivo. Las se&#xF1;ales de fluorescencia eran proporcionales al n&#xFA;mero potencial de acci&#xF3;n y fiable puede detectar los potenciales individuales de acci&#xF3;n in vitro. Con dos fotones de im&#xE1;genes in vivo, se observ&#xF3; tanto en la actividad espont&#xE1;nea y estimulada en las neuronas de los ganglios perif&#xE9;ricos de rat&#xF3;n infectado submandibular auton&#xF3;mica (SMG). Se registr&#xF3; la respuesta &#xF3;pticamente SMG en el circuito salival a la estimulaci&#xF3;n el&#xE9;ctrica directa de los axones presin&#xE1;pticos y para la estimulaci&#xF3;n sensorial fisiol&#xF3;gicamente relevantes de la cavidad oral. Durante una ventana de tiempo de 48 horas despu&#xE9;s de la inoculaci&#xF3;n, se produjo pocos transe&#xFA;ntes espont&#xE1;neos. Por 72 horas, se identificaron los transitorios espont&#xE1;neas m&#xE1;s frecuentes y prolongadas de calcio, lo que sugiere las respuestas neuronales o tejido a la infecci&#xF3;n que el calcio influencia de se&#xF1;alizaci&#xF3;n. Nuestro trabajo se establece en la investigaci&#xF3;n in vivo de la actividad fisiol&#xF3;gica del circuito neuronal y los efectos posteriores de la infecci&#xF3;n con una resoluci&#xF3;n &#xFA;nica c&#xE9;lula.

Basado en la fluorescencia de Monitoreo de la Actividad neuronal in vivo con un virus de trazado de circuito de la pseudorrabia

&#x5355;&#x7EAF;&#x75B1;&#x75B9;&#x75C5;&#x6BD2; (HSV-1&#xFF09; 1 &#x662F;&#x81EA;&#x7136;&#x754C;&#x7684;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x75C5;&#x539F;&#x4F53;&#xFF0C;&#x53EF;&#x4EE5;&#x4FB5;&#x5165;&#x5468;&#x56F4;&#x795E;&#x7ECF;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x5E76;&#x4E14;&#x575A;&#x6301;&#x6709;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x7EC8;&#x8EAB;&#x7684;&#x6F5C;&#x4F0F;&#x611F;&#x67D3;&#x3002;&#x5C3D;&#x7BA1;&#x5176;&#x65E0;&#x6240;&#x4E0D;&#x5728;&#x7684;&#x7279;&#x6027;&#xFF0C;&#x88AB;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x7684;&#x5355;&#x7EAF;&#x75B1;&#x75B9;&#x75C5;&#x6BD2; 1 &#xFF08;17 &#x682A;&#xFF09; &#x53EA;&#x6709;&#x4E00;&#x4E2A;&#x81EA;&#x7136;&#x9694;&#x79BB;&#x5F00;&#x6765;&#x3002;&#x4F7F;&#x7528;&#x7167;&#x6392;&#x80F6;&#x7247;&#x9AD8;&#x541E;&#x5410;&#x91CF;&#x7684;&#x75C5;&#x6BD2; DNA &#x6D4B;&#x5E8F;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x83B7;&#x5F97;&#x4E86;&#x8FD9;&#x4E24;&#x4E2A;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x5BA4;&#x5E94;&#x53D8; (F) &#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5E8F;&#x5217;&#x548C;&#x4F4E;&#x901A;&#x8FC7;&#x4E34;&#x5E8A;&#x5206;&#x79BB; (H129)&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x6570;&#x636E;&#x8868;&#x660E; interstrain &#x53D8;&#x5F02;&#x7684;&#x7A0B;&#x5EA6;&#x5728;&#x4E24;&#x8005;&#x4E2D;&#x7684;&#x5355;&#x7EAF;&#x75B1;&#x75B9;&#x75C5;&#x6BD2; 1 &#x7684;&#x6574;&#x4E2A;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7F16;&#x7801;&#x548C;&#x975E;&#x7F16;&#x7801;&#x533A;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x53D1;&#x73B0;&#x8BB8;&#x591A;&#x6C28;&#x57FA;&#x9178;&#x5DEE;&#x5F02;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x7684;&#x65B0;&#x83CC;&#x682A; F &#x5E8F;&#x5217;&#x548C;&#x5148;&#x524D;&#x5DF2;&#x77E5;&#x7684;&#x5E94;&#x53D8; 17&#xFF0C;&#x5206;&#x5E03;&#x8868;&#x660E;&#x91CE;&#x751F;&#x578B;&#x5355;&#x7EAF;&#x75B1;&#x75B9;&#x75C5;&#x6BD2; 1 &#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x53D8;&#x5F02;&#x6027;&#x7684;&#x9891;&#x8C31;&#x3002;&#x4E34;&#x5E8A;&#x5206;&#x79BB;&#x3001; &#x5E94;&#x53D8; H129&#x3001; &#x663E;&#x793A;&#x8868;&#x56E0;&#x679C;&#x7684;&#x7A81;&#x53D8;&#x4E3A;&#x5B8C;&#x5168;&#x672A;&#x77E5;&#x7684;&#x72EC;&#x7279;&#x987A;&#x884C;&#x8513;&#x5EF6;&#x578B;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5DF2;&#x5B9A;&#x4E49; H129 &#x7684;&#x5E8F;&#x5217;&#x5DEE;&#x5F02;&#xFF0C;&#x5E76;&#x5EFA;&#x8BAE;&#x4E00;&#x4E9B;&#x6F5C;&#x5728;&#x56E0;&#x679C;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x795E;&#x7ECF;&#x86CB;&#x767D; ICP34.5 &#xFF08;RL1&#xFF09;&#x3002;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x5C06;&#x9700;&#x8981;&#x8BC1;&#x660E;&#x7684;&#x66F4;&#x6539;&#x662F;&#x4E0D;&#x8DB3;&#x4EE5;&#x590D;&#x8FF0;&#x7684;&#x5E94;&#x53D8; H129 &#x8513;&#x5EF6;&#x7F3A;&#x9677;&#x3002;&#x610F;&#x5916;&#x7684;&#x662F;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x6570;&#x636E;&#x4E5F;&#x8868;&#x660E;&#x5728;&#x6211;&#x4EEC;&#x5E94;&#x53D8; F UL13 &#x6FC0;&#x9176;&#x7A81;&#x53D8;&#x7A81;&#x53D8;&#x9694;&#x79BB;&#xFF0C;&#x6F14;&#x793A;&#x5982;&#x4F55;&#x6DF1;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x53EF;&#x4EE5;&#x63ED;&#x793A;&#x51FA;&#x8DB3;&#x989D;&#x7684;&#x5728;&#x4EFB;&#x4F55;&#x7ED9;&#x5B9A;&#x7684;&#x5E94;&#x53D8;&#xFF0C;&#x5C24;&#x5176;&#x662F;&#x90A3;&#x4E9B;&#x4F20;&#x4EE3;&#x80CC;&#x666F;&#x7A81;&#x53D8;&#x6216;&#x6591;&#x5757;&#x51C0;&#x5316;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x5BA4;&#x8BBE;&#x7F6E;&#x4E2D;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x6570;&#x636E;&#x589E;&#x52A0;&#x6211;&#x4EEC;&#x5BF9;&#x5927; DNA &#x75C5;&#x6BD2;&#x5E8F;&#x5217;&#x53D8;&#x5F02;&#x7684;&#x77E5;&#x8BC6;&#xFF0C;&#x5E76;&#x8868;&#x660E;&#x6DF1;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x7684;&#x6F5C;&#x529B;&#xFF0C;&#x4EA7;&#x91CF;&#x6D1E;&#x5BDF; DNA &#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x8FDB;&#x5316;&#x548C;&#x4E0D;&#x540C;&#x75C5;&#x539F;&#x5206;&#x79BB;&#x682A;&#x53D8;&#x5F02;&#x3002;

&#x5E8F;&#x5217;&#x53D8;&#x5F02;&#x6027;&#x7684;&#x4E34;&#x5E8A;&#x548C;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x5BA4;&#x5206;&#x79BB;&#x682A;&#x7684;&#x5355;&#x7EAF;&#x75B1;&#x75B9;&#x75C5;&#x6BD2; 1 &#x53D1;&#x73B0;&#x65B0;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7A81;&#x53D8;&#x3002;

Herpes simplex virus 1 (HSV-1) is a well-adapted human pathogen that can invade the peripheral nervous system and persist there as a lifelong latent infection. Despite their ubiquity, only one natural isolate of HSV-1 (strain 17) has been sequenced. Using Illumina high-throughput sequencing of viral DNA, we obtained the genome sequences of both a laboratory strain (F) and a low-passage clinical isolate (H129). These data demonstrated the extent of interstrain variation across the entire genome of HSV-1 in both coding and noncoding regions. We found many amino acid differences distributed across the proteome of the new strain F sequence and the previously known strain 17, demonstrating the spectrum of variability among wild-type HSV-1 proteins. The clinical isolate, strain H129, displays a unique anterograde spread phenotype for which the causal mutations were completely unknown. We have defined the sequence differences in H129 and propose a number of potentially causal genes, including the neurovirulence protein ICP34.5 (RL1). Further studies will be required to demonstrate which change(s) is sufficient to recapitulate the spread defect of strain H129. Unexpectedly, these data also revealed a frameshift mutation in the UL13 kinase in our strain F isolate, demonstrating how deep genome sequencing can reveal the full complement of background mutations in any given strain, particularly those passaged or plaque purified in a laboratory setting. These data increase our knowledge of sequence variation in large DNA viruses and demonstrate the potential of deep sequencing to yield insight into DNA genome evolution and the variation among different pathogen isolates.

Sequence variability in clinical and laboratory isolates of herpes simplex virus 1 reveals new mutations.

Herpes simplex virus 1 (HSV-1) est un agent pathog&#xE8;ne bien adapt&#xE9; humaine qui peut envahir le syst&#xE8;me nerveux p&#xE9;riph&#xE9;rique et y persister comme une infection latente &#xE0; vie. En d&#xE9;pit de leur omnipr&#xE9;sence, un seul isolat naturel du virus HSV-1 (souche 17) a &#xE9;t&#xE9; s&#xE9;quenc&#xE9;. Utilisation Illumina &#xE0; haut d&#xE9;bit de s&#xE9;quen&#xE7;age de l&#x26;#39;ADN viral, on obtient les s&#xE9;quences de g&#xE9;nome de fois une souche de laboratoire (F) et une clinique faible passage isoler (H129). Ces donn&#xE9;es ont d&#xE9;montr&#xE9; l&#x26;#39;ampleur des variations interstrain travers l&#x26;#39;ensemble du g&#xE9;nome de HSV-1 dans les r&#xE9;gions de codage et de non codante deux. Nous avons trouv&#xE9; de nombreuses diff&#xE9;rences d&#x26;#39;acides amin&#xE9;s r&#xE9;partis &#xE0; travers le prot&#xE9;ome de la s&#xE9;quence F nouvelle souche et la souche d&#xE9;j&#xE0; connu 17, d&#xE9;montrant le spectre de la variabilit&#xE9; parmi les sauvages de type HSV-1 prot&#xE9;ines. Le isolat clinique, la souche H129, affiche un ph&#xE9;notype unique de propagation ant&#xE9;rograde pour lesquelles les mutations causales &#xE9;taient compl&#xE8;tement inconnus. Nous avons d&#xE9;fini les diff&#xE9;rences de s&#xE9;quence dans H129 et de proposer un certain nombre de g&#xE8;nes potentiellement causales, y compris la prot&#xE9;ine ICP34.5 neurovirulence (RL1). D&#x26;#39;autres &#xE9;tudes seront n&#xE9;cessaires pour d&#xE9;montrer que le changement (s) est suffisante pour r&#xE9;capituler le d&#xE9;faut propagation de la souche H129. De fa&#xE7;on inattendue, ces donn&#xE9;es ont &#xE9;galement r&#xE9;v&#xE9;l&#xE9; une mutation du cadre de lecture dans la kinase UL13 dans notre souche F isoler, d&#xE9;montrant comment le s&#xE9;quen&#xE7;age du g&#xE9;nome de profondeur peut r&#xE9;v&#xE9;ler la gamme compl&#xE8;te des mutations de fond dans n&#x26;#39;importe quelle souche donn&#xE9;e, en particulier ceux passages ou de la plaque purifi&#xE9;e dans un environnement de laboratoire. Ces donn&#xE9;es accro&#xEE;tre notre connaissance de la variation de la s&#xE9;quence en grands virus &#xE0; ADN et de d&#xE9;montrer le potentiel de s&#xE9;quen&#xE7;age en profondeur pour donner un aper&#xE7;u de l&#x26;#39;&#xE9;volution du g&#xE9;nome de l&#x26;#39;ADN et la variation entre les diff&#xE9;rents isolats pathog&#xE8;nes.

La variabilit&#xE9; des s&#xE9;quences dans les isolats cliniques et de laboratoire du virus herp&#xE8;s simplex 1 r&#xE9;v&#xE8;le nouvelles mutations

Herpes-Simplex-Virus 1 (HSV-1) ist ein gut angepasster menschlichen Krankheitserreger, die das periphere Nervensystem einzudringen und beibehalten kann dort als eine lebenslange latente Infektion. Trotz ihrer Allgegenw&auml;rtigkeit hat nur eine nat&uuml;rliche Isolat von HSV-1 (17-Stamm) sequenziert. Mit Illumina Hochdurchsatz-viraler DNA Sequenzierung, wir erhalten die Genomsequenzen von einem Labor-Stamm (F) und eine niedrig-Passage klinischen isolieren (H129). Diese Daten zeigte das Ausma&szlig; der interstrain Variation &uuml;ber das gesamte Genom von HSV-1 in beiden Kodierung und nichtkodierende Regionen. Wir fanden viele Aminos&auml;ure Unterschiede &uuml;ber das Proteom der neuen Belastung F-Sequenz und die bisher bekannten Belastung 17, verteilt, zeigen das Spektrum der Variabilit&auml;t unter Wildtyp-HSV-1-Proteine. Die klinischen isolieren, Stamm H129, zeigt einen einzigartige Anterograde Ausbreitung Ph&auml;notyp, f&uuml;r die die urs&auml;chlichen Mutationen v&ouml;llig unbekannt waren. Wir haben die Sequenz Unterschiede in H129 definiert und eine Reihe von potentiell urs&auml;chlichen Gene, darunter das Neurovirulence-Protein ICP34.5 (RL1) schlagen. Weitere Studien m&uuml;ssen zeigen, welche &Auml;nderung(en) ausreicht, um die Verbreitung Mangels Belastung H129 rekapitulieren. Unerwartet, zeigte diese Daten auch eine Frameshift-Mutation in der UL13-Kinase in unserem Stamm F isolieren, demonstrieren, wie tief die Sequenzierung des Genoms erkennen l&auml;sst, umfassenden Hintergrund Mutationen in jede m&ouml;gliche gegebene Belastung, besonders jene passaged oder Plakette im Labor gereinigt. Diese Daten erh&ouml;hen unsere Kenntnisse der Sequenz Unterschiede in gro&szlig;e DNA-Viren und zeigen das Potenzial der Ultratiefe Sequenzierung, Einblick in die DNA-Genom-Evolution und die Variation zwischen den verschiedenen Erreger Isolate zu erbringen.

Sequenz Variabilit&auml;t klinischer und Labor-Isolaten von Herpes-Simplex-Virus 1 enth&uuml;llt neue Mutationen.

Herpes simplex virus 1 (HSV-1) &egrave; un patogeno umano daltonico che pu&ograve; invadere il sistema nervoso periferico e persistono l&igrave; come un&#39;infezione latente permanente. Nonostante la loro ubiquit&agrave;, solo un isolato naturale di HSV-1 (strain 17) &egrave; stato sequenziato. Utilizzando Illumina high-throughput di sequenziamento del DNA virale, abbiamo ottenuto le sequenze di genoma di entrambe un ceppo di laboratorio (F) e un basso-passaggio clinico isolare (H129). Questi dati hanno dimostrato l&#39;entit&agrave; della variazione interstrain attraverso l&#39;intero genoma di HSV-1 sia in regioni codificanti e non codificante. Abbiamo trovato molte differenze di aminoacidi distribuite tra il proteoma della nuova sequenza di ceppo F e il ceppo precedentemente conosciuto 17, dimostrando lo spettro di variabilit&agrave; tra le proteine di HSV-1 wild-type. La clinica isolare, ceppo H129, viene visualizzato un fenotipo di diffusione anterograda unico per cui le mutazioni causali erano completamente sconosciute. Ci hanno definito le differenze di sequenza in H129 e proporre un certo numero di geni potenzialmente causali, tra cui la proteina neurovirulence ICP34.5 (RL1). Saranno necessari ulteriori studi per dimostrare quali modifiche &egrave; sufficiente a riassumere il difetto di diffusione del ceppo H129. Inaspettatamente, questi dati hanno rivelato anche una mutazione frameshift la chinasi UL13 nel nostro ceppo F isolare, dimostrando quanto in profondit&agrave; il sequenziamento del genoma pu&ograve; rivelare il complemento completo di mutazioni di sfondo in qualsiasi determinato ceppo, particolarmente quelle secondarie o placca purificato in un ambiente di laboratorio. Questi dati, aumentano la nostra conoscenza della variazione di sequenza in grandi virus a DNA e dimostrano il potenziale di deep sequencing di cedere la comprensione della evoluzione del genoma del DNA e la variazione tra i diversi agenti patogeni isolati.

Variabilit&agrave; clinica di sequenza e isolati del laboratorio del virus herpes simplex 1 rivela nuove mutazioni.

&#x30D8;&#x30EB;&#x30DA;&#x30B9;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;1&#x578B;&#x3001;&#x5358;&#x7D14;&#x578B;&#xFF08;HSV-1&#xFF09;&#x672B;&#x68A2;&#x795E;&#x7D4C;&#x7CFB;&#x306B;&#x4FB5;&#x5165;&#x3057;&#x3001;&#x751F;&#x6DAF;&#x306B;&#x308F;&#x305F;&#x308B;&#x6F5C;&#x4F0F;&#x611F;&#x67D3;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x305D;&#x3053;&#x306B;&#x4FDD;&#x6301;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3088;&#x304F;&#x9069;&#x5FDC;&#x3057;&#x3001;&#x4EBA;&#x9593;&#x306E;&#x75C5;&#x539F;&#x4F53;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x305D;&#x306E;&#x666E;&#x904D;&#x6027;&#x306B;&#x3082;&#x304B;&#x304B;&#x308F;&#x3089;&#x305A;&#x3001;HSV-1&#xFF08;&#x682A;17&#xFF09;&#x306E;&#x5206;&#x96E2;&#x3060;&#x3051;&#x306E;&#x81EA;&#x7136;&#x304C;&#x914D;&#x5217;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;DNA&#x306E;&#x30A4;&#x30EB;&#x30DF;&#x30CA;&#x306E;&#x30CF;&#x30A4;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x30C3;&#x30C8;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x3066;&#x3001;&#x5B9F;&#x9A13;&#x5BA4;&#x682A;&#xFF08;F&#xFF09;&#x3068;&#x81E8;&#x5E8A;&#x5206;&#x96E2;&#x682A;&#x306E;&#x4F4E;&#x901A;&#x8DEF;&#xFF08;H129&#xFF09;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x914D;&#x5217;&#x3092;&#x5F97;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306F;&#x3001;&#x7B26;&#x53F7;&#x5316;&#x3068;&#x975E;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x9818;&#x57DF;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x3067;HSV-1&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x5168;&#x4F53;&#x7CFB;&#x7D71;&#x9593;&#x306E;&#x3070;&#x3089;&#x3064;&#x304D;&#x306E;&#x7A0B;&#x5EA6;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x91CE;&#x751F;&#x578B;HSV-1&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x9593;&#x3067;&#x5909;&#x52D5;&#x306E;&#x30B9;&#x30DA;&#x30AF;&#x30C8;&#x30EB;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x3001;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x682A;F&#x306E;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30FC;&#x30E0;&#x3068;&#x4EE5;&#x524D;&#x304B;&#x3089;&#x77E5;&#x200B;&#x200B;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x682A;&#x3092;17&#x306B;&#x5206;&#x6563;&#x3057;&#x3066;&#x591A;&#x6570;&#x306E;&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x9178;&#x306E;&#x9055;&#x3044;&#x3092;&#x767A;&#x898B;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x81E8;&#x5E8A;&#x7684;&#x306B;&#x306F;H129&#x3092;&#x75DB;&#x3081;&#x3001;&#x5207;&#x308A;&#x5206;&#x3051;&#x3001;&#x539F;&#x56E0;&#x5909;&#x7570;&#x306F;&#x5B8C;&#x5168;&#x306B;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x306A;&#x304B;&#x3063;&#x305F;&#x3068;&#x306A;&#x308B;&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;&#x9806;&#x884C;&#x6027;&#x306E;&#x5E83;&#x304C;&#x308A;&#x306E;&#x8868;&#x73FE;&#x304C;&#x8868;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;H129&#x306E;&#x914D;&#x5217;&#x306E;&#x9055;&#x3044;&#x3092;&#x5B9A;&#x7FA9;&#x3057;&#x3001;&#x795E;&#x7D4C;&#x6BD2;&#x6027;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;ICP34.5&#xFF08;RL1&#xFF09;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x539F;&#x56E0;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x6570;&#x3092;&#x63D0;&#x6848;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3055;&#x3089;&#x306A;&#x308B;&#x7814;&#x7A76;&#x304C;&#x5B9F;&#x8A3C;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5FC5;&#x8981;&#x3068;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x5909;&#x5316;&#xFF08;S&#xFF09;&#x682A;H129&#x306E;&#x666E;&#x53CA;&#x6B20;&#x9665;&#x3092;&#x518D;&#x73FE;&#x3059;&#x308B;&#x306E;&#x306B;&#x5341;&#x5206;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x4E88;&#x671F;&#x305B;&#x305A;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306F;&#x3001;&#x307E;&#x305F;&#x6DF1;&#x3044;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306F;&#x5B9F;&#x9A13;&#x5BA4;&#x306E;&#x8A2D;&#x5B9A;&#x3067;&#x7CBE;&#x88FD;&#x7279;&#x306B;&#x7D99;&#x4EE3;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x30D7;&#x30E9;&#x30FC;&#x30AF;&#x306F;&#x3001;&#x4EFB;&#x610F;&#x306E;&#x4E0E;&#x3048;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x682A;&#x3067;&#x80CC;&#x666F;&#x7A81;&#x7136;&#x5909;&#x7570;&#x306E;&#x5B8C;&#x5168;&#x306A;&#x88DC;&#x5B8C;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306E;&#x682A;F&#x5206;&#x96E2;&#x306E;UL13&#x30AD;&#x30CA;&#x30FC;&#x30BC;&#x3067;&#x30D5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30E0;&#x30B7;&#x30D5;&#x30C8;&#x5909;&#x7570;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306F;&#x3001;&#x5927;&#x578B;&#x306E;DNA&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x3067;&#x914D;&#x5217;&#x5909;&#x7570;&#x306E;&#x77E5;&#x8B58;&#x3092;&#x5411;&#x4E0A;&#x3055;&#x305B;&#x3001;&#x5225;&#x306E;&#x75C5;&#x539F;&#x4F53;&#x306E;&#x83CC;&#x682A;&#x9593;&#x306E;DNA&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x9032;&#x5316;&#x3068;&#x5909;&#x5316;&#x3078;&#x306E;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x3092;&#x3082;&#x305F;&#x3089;&#x3059;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x6DF1;&#x3044;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x5358;&#x7D14;&#x30D8;&#x30EB;&#x30DA;&#x30B9;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;1&#x306E;&#x81E8;&#x5E8A;&#x7684;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x5B9F;&#x9A13;&#x5206;&#x96E2;&#x682A;&#x306E;&#x914D;&#x5217;&#x5909;&#x52D5;&#x306F;&#x65B0;&#x305F;&#x306A;&#x5909;&#x7570;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;

&#xD5E4; &#xB974; &#xD398; &#xC2A4;&#xC758; &#xB2E8;&#xC21C; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; 1 (HSV-1)&#xB294; &#xB9D0; &#xCD08; &#xC2E0; &#xACBD;&#xACC4;&#xB97C; &#xCE68;&#xBC94; &#xD558; &#xACE0; &#xC720;&#xC9C0;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xC798; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xBCD1;&#xC6D0; &#xCCB4; &#xD3C9;&#xC0DD; &#xC7A0;&#xC7AC; &#xAC10;&#xC5FC;&#xC73C;&#xB85C;. &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xD3B8; &#xC7AC;&#xC5D0;&#xB3C4; &#xBD88;&#xAD6C; &#xD558; &#xACE0; &#xD558;&#xB098;&#xC758; &#xC790;&#xC5F0; &#xBD84;&#xB9AC; HSV-1 (&#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC778; 17)&#xC758; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. Illumina &#xB192;&#xC740; &#xCC98;&#xB9AC;&#xB7C9;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC2E4; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC778; (F)&#xC758; &#xAC8C;&#xB188; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xB97C; &#xC5BB;&#xC740; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xC131; dna &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1; &#xBC0F; &#xB0AE;&#xC740; &#xD1B5;&#xB85C; &#xC784;&#xC0C1; &#xBD84;&#xB9AC; (H129). &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xBAA8;&#xB450;&#xC5D0; HSV-1&#xC758; &#xC804;&#xCCB4; &#xAC8C;&#xB188;&#xC5D0; &#xAC78;&#xCCD0; interstrain &#xBCC0;&#xD615; &#xC815;&#xB3C4; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC900; &#xCF54;&#xB529; &#xBC0F; noncoding &#xC601;&#xC5ED;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC57C;&#xC0DD;-&#xD0C0;&#xC785; HSV-1 &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xAC00;&#xC6B4;&#xB370; &#xB2E4;&#xC591;&#xC131;&#xC758; &#xC2A4;&#xD399;&#xD2B8;&#xB7FC;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC8FC;&#xB294; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC778; F &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xBC0F; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4;&#xB41C; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC778; 17, &#xD504;&#xB85C;&#xD14C;&#xC634; &#xBD84;&#xC0B0;&#xC5D0; &#xB9CE;&#xC740; &#xC544;&#xBBF8;&#xB178;&#xC0B0; &#xCC28;&#xC774; &#xBC1C;&#xACAC;. &#xC784;&#xC0C1; &#xBD84;&#xB9AC;, H129 &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC778;, &#xACE0;&#xC720; &#xCC38;&#xAC00;&#xC790; &#xD655;&#xC0B0; &#xD615; &#xC778;&#xACFC; &#xBCC0;&#xC774; &#xC644;&#xC804;&#xD788; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C0;&#xC9C0; &#xB418;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC740; &#xD45C;&#xC2DC; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. H129 &#xC21C;&#xC11C; &#xCC28;&#xC774; &#xC815;&#xC758; &#xD558; &#xACE0; &#xC81C;&#xC548; &#xD558;&#xB294; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; neurovirulence &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; ICP34.5 (RL1)&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xC5EC; &#xC7A0;&#xC7AC;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC778;&#xACFC; &#xC720;&#xC804;&#xC790;. H129 &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC778;&#xC758; &#xD655;&#xC0B0; &#xACB0;&#xD568; &#xC815;&#xB9AC; &#xD558;&#xAE30;&#xC5D0; &#xCDA9;&#xBD84; &#xD55C;&#xB294; &#xC801;&#xC808;&#xC131;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC8FC;&#xB294; &#xB354; &#xB9CE;&#xC740; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xAC00; &#xD544;&#xC694; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC608;&#xAE30;&#xCE58; &#xC54A;&#xAC8C;, &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xB294; &#xB610;&#xD55C; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xD53C;&#xB85C; F UL13 &#xB2C8; frameshift &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; &#xBD84;&#xB9AC;, &#xC5BC;&#xB9C8;&#xB098; &#xAE4A;&#xC740; &#xAC8C;&#xB188; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1; &#xC5B4;&#xB5A4; &#xC8FC;&#xC5B4;&#xC9C4;&#xB41C; &#xBCC0;&#xD615;, &#xD2B9;&#xD788; &#xADF8; passaged&#xC5D0; &#xBC30;&#xACBD; &#xBCC0;&#xC774;&#xC758; &#xC644;&#xC804; &#xD55C; &#xBCF4;&#xC644;&#xC744; &#xBC1D;&#xD790; &#xC218; &#xC788;&#xB2E4; &#xC2DC;&#xC5F0; &#xB610;&#xB294; &#xD50C; &#xB77C;&#xD06C; &#xC815;&#xD654; &#xD558; &#xACE0; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC2E4; &#xC124;&#xC815;&#xC5D0;&#xC11C; &#xACF5;&#xAC1C; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xB294; &#xD070; DNA &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xC758; &#xC21C;&#xC11C; &#xBCC0;&#xD654;&#xC758; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xC9C0;&#xC2DD;&#xC744; &#xC99D;&#xAC00; &#xD558; &#xACE0; DNA &#xAC8C;&#xB188; &#xC9C4;&#xD654; &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xB2E4;&#xB978; &#xBCD1;&#xC6D0; &#xCCB4; &#xBD84;&#xB9AC; &#xC911; &#xBCC0;&#xD615;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825;&#xC744; &#xC5BB;&#xC744; &#xAE4A;&#xC740; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1;&#xC758; &#xAC00;&#xB2A5;&#xC131;&#xC744; &#xC785;&#xC99D;.

&#xC784;&#xC0C1;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB2E4;&#xC591;&#xC131;&#xC744; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1; &#xD558; &#xACE0; &#xD5E4; &#xB974; &#xD398; &#xC2A4;&#xC758; &#xB2E8;&#xC21C; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; 1&#xC758; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC2E4; &#xACA9;&#xB9AC; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774;.

Virus del herpes simple 1 (VHS-1) es un pat&#xF3;geno bien adaptado humana que pueden invadir el sistema nervioso perif&#xE9;rico y persistir all&#xED; como una infecci&#xF3;n latente permanente. A pesar de su ubicuidad, s&#xF3;lo uno natural aislar de HSV-1 (cepa 17) ha sido secuenciado. Uso de Illumina secuenciaci&#xF3;n de alto rendimiento de ADN viral, hemos obtenido las secuencias del genoma de una cepa de laboratorio tanto (F) y una cl&#xED;nica de bajo pasaje aislado (H129). Estos datos demostraron el grado de variaci&#xF3;n interstrain a trav&#xE9;s de la totalidad del genoma del VHS-1 en ambas regiones codificantes y no codificantes. Hemos encontrado muchas diferencias en los amino&#xE1;cidos distribuidos en todo el proteoma de la secuencia de la cepa F nueva y la cepa conocida anteriormente 17, lo que demuestra el espectro de variabilidad entre los de tipo salvaje HSV-1 prote&#xED;nas. El aislado cl&#xED;nico, la cepa H129, muestra un fenotipo &#xFA;nico propagaci&#xF3;n anter&#xF3;grada para el cual las mutaciones causales eran completamente desconocidas. Hemos definido las diferencias en las secuencias en H129 y proponer una serie de genes potencialmente causales, incluyendo la prote&#xED;na neurovirulencia ICP34.5 (RL1). M&#xE1;s estudios ser&#xE1;n necesarios para demostrar que el cambio (s) es suficiente para recapitular el defecto de propagaci&#xF3;n de la cepa H129. Inesperadamente, estos datos tambi&#xE9;n revelaron una mutaci&#xF3;n en el marco de lectura quinasa UL13 en nuestro aislar la cepa F, demostrando c&#xF3;mo la secuenciaci&#xF3;n del genoma profunda puede revelar el complemento completo de las mutaciones de fondo en cualquier cepa dada, en particular los passaged o placa purificada en el laboratorio. Estos datos aumentan nuestro conocimiento de la variaci&#xF3;n de la secuencia de los virus grandes de ADN y demostrar el potencial de secuenciaci&#xF3;n profunda de arrojar luz sobre la evoluci&#xF3;n del genoma de ADN y la variaci&#xF3;n entre los diferentes agentes pat&#xF3;genos.

Variabilidad de la secuencia en aislados cl&#xED;nicos y de laboratorio del virus herpes simplex 1, revela nuevas mutaciones

Alphaherpesviruses are a subfamily of the Herpesviridae that can invade the nervous system and establish either lytic or latent infections. The establishment of latent infection can occur only in neurons, indicating a unique virus-host interaction in these cells. Here, we compare results from seven microarray studies that focused on the host response of either neural tissue or isolated neurons to alphaherpesvirus infection. These studies utilized either herpes simplex virus type 1 or pseudorabies virus as the infectious agent. From these data, we have found common host responses spanning a variety of infection models in different species, with different herpesvirus strains, and during all phases of infection including lytic, latent, and reactivation. The repeated observation of transcriptional effects on these genes and gene families indicates their likely importance in host defenses or the viral infectious process. We discuss the possible role of these different genes and genes families in alphaherpesvirus infection.

A common neuronal response to alphaherpesvirus infection.

Alphaherpesviruses &#x662F; Herpesviridae&#xFF0C;&#x53EF;&#x4EE5;&#x4FB5;&#x5165;&#x4E2D;&#x67A2;&#x795E;&#x7ECF;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x5E76;&#x4E14;&#x5EFA;&#x7ACB;&#x6EB6;&#x6216;&#x9690;&#x6027;&#x611F;&#x67D3;&#x7684;&#x4E9A;&#x79D1;&#x3002;&#x6F5C;&#x4F0F;&#x611F;&#x67D3;&#x7684;&#x5EFA;&#x7ACB;&#x53EF;&#x4EE5;&#x53EA;&#x5728;&#x795E;&#x7ECF;&#x5143;&#xFF0C;&#x8868;&#x660E;&#x5728;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4E2D;&#x7684;&#x552F;&#x4E00;&#x75C5;&#x6BD2;&#x4E0E;&#x5BBF;&#x4E3B;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x53D1;&#x751F;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x5C06;&#x4FA7;&#x91CD;&#x4E8E;&#x5BF9; alphaherpesvirus &#x611F;&#x67D3;&#x795E;&#x7ECF;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x6216;&#x5B64;&#x7ACB;&#x7684;&#x795E;&#x7ECF;&#x5143;&#x7684;&#x4E3B;&#x673A;&#x54CD;&#x5E94;&#x7684;&#x4E03;&#x4E2A;&#x57FA;&#x56E0;&#x82AF;&#x7247;&#x7814;&#x7A76;&#x7684;&#x7ED3;&#x679C;&#x8FDB;&#x884C;&#x6BD4;&#x8F83;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7814;&#x7A76;&#x5229;&#x7528;&#x6216;&#x8005;&#x5355;&#x7EAF;&#x75B1;&#x75B9;&#x75C5;&#x6BD2;&#x7C7B;&#x578B; 1 &#x6216;&#x4F2A;&#x72C2;&#x72AC;&#x75C5;&#x75C5;&#x6BD2;&#x4F20;&#x67D3;&#x6027;&#x7684;&#x4EE3;&#x7406;&#x3002;&#x4ECE;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x6570;&#x636E;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x53D1;&#x73B0;&#x5E38;&#x89C1;&#x7684;&#x5BBF;&#x4E3B;&#x53CD;&#x5E94;&#x8DE8;&#x8D8A;&#x5404;&#x79CD;&#x611F;&#x67D3;&#x6A21;&#x578B;&#x5728;&#x4E0D;&#x540C;&#x7269;&#x79CD;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x4E0E;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x75B1;&#x75B9;&#x75C5;&#x6BD2;&#x682A;&#x548C;&#x5728;&#x6240;&#x6709;&#x9636;&#x6BB5;&#x90FD;&#x5305;&#x62EC;&#x6EB6;&#x3001; &#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x611F;&#x67D3;&#x548C;&#x91CD;&#x65B0;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x3002;&#x5BF9;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x57FA;&#x56E0;&#x548C;&#x57FA;&#x56E0;&#x5BB6;&#x65CF;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x5F71;&#x54CD;&#x7684;&#x53CD;&#x590D;&#x7684;&#x89C2;&#x5BDF;&#x6307;&#x793A;&#x4ED6;&#x4EEC;&#x53EF;&#x80FD;&#x5177;&#x6709;&#x91CD;&#x8981;&#x610F;&#x4E49;&#x7684;&#x4E3B;&#x673A;&#x9632;&#x5FA1;&#x6216;&#x75C5;&#x6BD2;&#x6027;&#x4F20;&#x67D3;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x8BA8;&#x8BBA;&#x7684;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x548C;&#x57FA;&#x56E0;&#x5BB6;&#x5EAD; alphaherpesvirus &#x611F;&#x67D3;&#x53EF;&#x80FD;&#x53D1;&#x6325;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;

&#x5E38;&#x89C1;&#x795E;&#x7ECF;&#x5143;&#x611F;&#x67D3;&#x53CD;&#x5E94;&#x7684; alphaherpesvirus&#x3002;

Alphaherp&#xE8;svirus sont une sous-famille de l&#x26;#39;Herpesviridae qui peut envahir le syst&#xE8;me nerveux et d&#x26;#39;&#xE9;tablir soit des infections lytiques ou latente. La mise en place d&#x26;#39;une infection latente peut se produire seulement dans les neurones, ce qui indique une unique interaction virus-h&#xF4;te dans ces cellules. Ici, nous comparons les r&#xE9;sultats de sept &#xE9;tudes microarray qui portaient sur la r&#xE9;ponse de l&#x26;#39;h&#xF4;te soit le tissu neural ou des neurones isol&#xE9;s &#xE0; l&#x26;#39;infection alphaherp&#xE8;svirus. Ces &#xE9;tudes utilis&#xE9;es soit l&#x26;#39;herp&#xE8;s simplex virus de type 1 ou de virus de la pseudo que l&#x26;#39;agent infectieux. A partir de ces donn&#xE9;es, nous avons trouv&#xE9; des r&#xE9;ponses d&#x26;#39;accueil communs couvrant une vari&#xE9;t&#xE9; de mod&#xE8;les d&#x26;#39;infection chez les diff&#xE9;rentes esp&#xE8;ces, avec des souches diff&#xE9;rentes herp&#xE8;svirus, et pendant toutes les phases de l&#x26;#39;infection, y compris lytique, latente, et la r&#xE9;activation. L&#x26;#39;observation r&#xE9;p&#xE9;t&#xE9;e des effets transcriptionnels sur ces g&#xE8;nes et des familles de g&#xE8;nes indique leur importance probable dans les d&#xE9;fenses de l&#x26;#39;h&#xF4;te ou le processus infectieux viral. Nous discutons le r&#xF4;le possible de ces diff&#xE9;rents g&#xE8;nes et les familles des g&#xE8;nes de l&#x26;#39;infection &#xE0; alphaherp&#xE8;svirus.

Une r&#xE9;ponse commune &#xE0; l&#x26;#39;infection neuronale alphaherp&#xE8;svirus

Alphaherpesviruses sind eine Unterfamilie der Herpesviridae, die das Nervensystem einzudringen und entweder lytische oder latente Infektionen herstellen kann. Die Einrichtung der latenten Infektion kann nur in Neuronen, die Angabe einer eindeutigen Virus-Host-Interaktion in diesen Zellen auftreten. Hier vergleichen wir die Ergebnisse aus sieben Microarray-Studien, die auf der Wirtsantwort Nervengewebe oder isolierte Neuronen auf eine Alphaherpesvirus Infektion ausgerichtet. Diese Studien entweder Herpes-Simplex-Virus Typ 1 oder Pseudorabies Virus als Erreger genutzt. Aus diesen Angaben fanden wir gemeinsame Host-Antworten auf eine Vielzahl von Infektion Modelle in verschiedenen Arten, mit verschiedenen Herpesvirus-St&auml;mme und in allen Phasen der Infektion, einschlie&szlig;lich lytische, latente und Reaktivierung. Die wiederholte Beobachtung transkriptionelle Auswirkungen auf diese Gene und gen Familien gibt wahrscheinlich Bedeutung Hostverteidigungsma&szlig;nahmen oder die virale Infektionskrankheiten Prozess. Wir besprechen die m&ouml;gliche Rolle von diesen verschiedenen Genen und Gene Familien in Alphaherpesvirus-Infektion.

Eine gemeinsame neuronale Antwort auf eine Alphaherpesvirus Infektion.

Alphaherpesviruses sono una sottofamiglia di Herpesviridae che pu&ograve; invadere il sistema nervoso e stabilire le infezioni latenti o litiche. L&#39;istituzione dell&#39;infezione latente pu&ograve; verificarsi solo nei neuroni, che indica un&#39;interazione virus-ospite unico in queste cellule. Qui, confrontiamo i risultati di sette studi microarray che focalizzata sulla risposta dell&#39;ospite del tessuto neurale o neuroni isolati a alphaherpesvirus infezione. Questi studi utilizzati o herpes simplex virus di tipo 1 o Pseudorabbia virus come l&#39;agente infettivo. Da questi dati, abbiamo trovato risposte comuni host che attraversa una variet&agrave; di modelli di infezione in specie diverse, con ceppi di herpesvirus differenti e durante tutte le fasi di infezione tra cui litico, latente e riattivazione. L&#39;osservazione ripetuta di transcriptional effetti su questi geni e famiglie gene indica loro probabile importanza nelle difese ospite o il processo virale infettivo. Discutiamo il possibile ruolo di questi geni differenti e le famiglie di geni in alphaherpesvirus infezione.

Una risposta comune neuronale a alphaherpesvirus infezione.

Alphaherpesviruses&#x306F;&#x795E;&#x7D4C;&#x7CFB;&#x306B;&#x4FB5;&#x5165;&#x3057;&#x3001;&#x6EB6;&#x89E3;&#x6027;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x306A;&#x611F;&#x67D3;&#x75C7;&#x306E;&#x3044;&#x305A;&#x308C;&#x304B;&#x3092;&#x78BA;&#x7ACB;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x30D8;&#x30EB;&#x30DA;&#x30B9;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x4E9C;&#x79D1;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6F5C;&#x4F0F;&#x611F;&#x67D3;&#x306E;&#x78BA;&#x7ACB;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9; - &#x5BBF;&#x4E3B;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x795E;&#x7D4C;&#x7D30;&#x80DE;&#x3067;&#x306E;&#x307F;&#x767A;&#x751F;&#x3059;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;alphaherpesvirus&#x611F;&#x67D3;&#x306B;&#x5BFE;&#x3059;&#x308B;&#x795E;&#x7D4C;&#x7D44;&#x7E54;&#x53C8;&#x306F;&#x5358;&#x96E2;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30CB;&#x30E5;&#x30FC;&#x30ED;&#x30F3;&#x306E;&#x3044;&#x305A;&#x308C;&#x304B;&#x306E;&#x30DB;&#x30B9;&#x30C8;&#x306E;&#x5FDC;&#x7B54;&#x306B;&#x7126;&#x70B9;&#x3092;&#x5F53;&#x3066;&#x305F;7&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x7814;&#x7A76;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x3092;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x306F;&#x3001;&#x611F;&#x67D3;&#x6027;&#x75C5;&#x539F;&#x4F53;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x5358;&#x7D14;&#x30D8;&#x30EB;&#x30DA;&#x30B9;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;1&#x578B;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x4EEE;&#x6027;&#x72C2;&#x72AC;&#x75C5;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x3044;&#x305A;&#x308C;&#x304B;&#x3092;&#x5229;&#x7528;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x304B;&#x3089;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x5225;&#x306E;&#x30D8;&#x30EB;&#x30DA;&#x30B9;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x682A;&#x3068;&#x3001;&#x3068;&#x3001;&#x6EB6;&#x89E3;&#x6F5C;&#x71B1;&#x3001;&#x3068;&#x518D;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x611F;&#x67D3;&#x75C7;&#x306E;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x6BB5;&#x968E;&#x3067;&#x3001;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x7A2E;&#x306B;&#x611F;&#x67D3;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x306E;&#x3055;&#x307E;&#x3056;&#x307E;&#x306A;&#x30B9;&#x30D1;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0;&#x30C4;&#x30EA;&#x30FC;&#x5171;&#x901A;&#x306E;&#x30DB;&#x30B9;&#x30C8;&#x306E;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3092;&#x767A;&#x898B;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3084;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30D5;&#x30A1;&#x30DF;&#x30EA;&#x30FC;&#x306B;&#x8EE2;&#x5199;&#x52B9;&#x679C;&#x306E;&#x7E70;&#x308A;&#x8FD4;&#x3057;&#x89B3;&#x6E2C;&#x306F;&#x5BBF;&#x4E3B;&#x9632;&#x5FA1;&#x3084;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x611F;&#x67D3;&#x306E;&#x904E;&#x7A0B;&#x3067;&#x5F7C;&#x3089;&#x306E;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x9AD8;&#x3044;&#x91CD;&#x8981;&#x6027;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;alphaherpesvirus&#x611F;&#x67D3;&#x3067;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3084;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30D5;&#x30A1;&#x30DF;&#x30EA;&#x30FC;&#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x306E;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x3092;&#x8B70;&#x8AD6;&#x3059;&#x308B;&#x3002;

Alphaherpesvirus&#x611F;&#x67D3;&#x306B;&#x5171;&#x901A;&#x3059;&#x308B;&#x795E;&#x7D4C;&#x5FDC;&#x7B54;

Alphaherpesviruses&#xB294; &#xC2E0; &#xACBD;&#xACC4;&#xB97C; &#xCE68;&#xBC94; &#xD558; &#xACE0; &#xC6A9;&#xADE0;&#xC131; &#xB610;&#xB294; &#xC7A0;&#xC7AC;&#xC801;&#xC778; &#xAC10;&#xC5FC;&#xC744; &#xC124;&#xC815;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xB294; Herpesviridae&#xC758; &#xC544;. &#xC7A0;&#xC7AC; &#xAC10;&#xC5FC;&#xC758; &#xC124;&#xB9BD;&#xC774;&#xC774; &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0; &#xB3C5;&#xD2B9;&#xD55C; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4;-&#xD638;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC744; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; &#xB274;&#xB7F0;&#xC5D0;&#xB9CC; &#xBC1C;&#xC0DD;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC6B0;&#xB9AC; alphaherpesvirus &#xAC10;&#xC5FC; &#xC2E0;&#xACBD; &#xC870;&#xC9C1; &#xB610;&#xB294; &#xACA9;&#xB9AC; &#xB41C; &#xB274;&#xB7F0;&#xC758; &#xD638;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xC751;&#xB2F5;&#xC5D0; &#xCD08;&#xC810;&#xC744; &#xB9DE;&#xCD98; 7 microarray &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xACB0;&#xACFC; &#xBE44;&#xAD50; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xC911; &#xD5E4; &#xB974; &#xD398; &#xC2A4;&#xC758; &#xB2E8;&#xC21C; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xD0C0;&#xC785; 1 &#xB610;&#xB294; pseudorabies &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xC804;&#xC5FC;&#xC131;&#xC774; &#xC5D0;&#xC774;&#xC804;&#xD2B8; &#xD65C;&#xC6A9;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xAC10;&#xC5FC; &#xBAA8;&#xB378; &#xC885; &#xB2E4;&#xB978; herpesvirus &#xC885;&#xC790;&#xC640; &#xAC10;&#xC5FC; &#xC6A9;&#xADE0;&#xC131;, &#xC7A0;&#xC7AC;&#xC131;, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xC7AC; &#xD65C;&#xC131;&#xD654;&#xC758; &#xBAA8;&#xB4E0; &#xB2E8;&#xACC4;&#xC5D0; &#xAC78;&#xCE5C; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xD638;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xC751;&#xB2F5;&#xC744; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC640; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xAC00;&#xC871; transcriptional &#xD6A8;&#xACFC;&#xC758; &#xBC18;&#xBCF5;&#xB41C; &#xAD00;&#xCC30; &#xD638;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xBC29;&#xC5B4;&#xC5D0; &#xAC00;&#xB2A5;&#xC131;&#xC774; &#xC911;&#xC694;&#xB3C4; &#xB610;&#xB294; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xC131; &#xAC10;&#xC5FC; &#xD504;&#xB85C;&#xC138;&#xC2A4;&#xB97C; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0C5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB2E4;&#xB978; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC640; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xAC00;&#xC871; alphaherpesvirus &#xAC10;&#xC5FC;&#xC758; &#xAC00;&#xB2A5;&#xD55C; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xB17C;&#xC758;.

Alphaherpesvirus &#xAC10;&#xC5FC;&#xC5D0; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xC2E0;&#xACBD; &#xC751;&#xB2F5;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Herpesvirus alfa son una subfamilia de la Herpesviridae que puede invadir el sistema nervioso y establecer o bien infecciones l&#xED;ticas o latente. El establecimiento de la infecci&#xF3;n latente puede producirse s&#xF3;lo en las neuronas, lo que indica un &#xFA;nico virus-hu&#xE9;sped interacci&#xF3;n en estas c&#xE9;lulas. En este sentido, comparar los resultados de siete estudios de microarrays que se centraron en la respuesta del hu&#xE9;sped de cualquiera de tejido neural o neuronas aisladas a la infecci&#xF3;n alphaherpesvirus. Estos estudios utilizaron tanto virus herpes simplex tipo 1 o virus de la pseudorrabia como el agente infeccioso. A partir de estos datos, hemos encontrado respuestas comunes de acogida que abarcan una gran variedad de modelos de infecci&#xF3;n en diferentes especies, con las cepas del virus del herpes diferentes, y durante todas las fases de la infecci&#xF3;n latente, incluyendo l&#xED;tica, y la reactivaci&#xF3;n. La observaci&#xF3;n repetida de los efectos de la transcripci&#xF3;n de estos genes y familias de genes indica su importancia probable en las defensas del hu&#xE9;sped o del proceso infeccioso viral. Se discute el posible papel de estos genes diferentes y familias de genes en la infecci&#xF3;n por alphaherpesvirus.

Una respuesta com&#xFA;n a la infecci&#xF3;n neuronal alphaherpesvirus

&#x5355;&#x7EAF;&#x75B1;&#x75B9;&#x75C5;&#x6BD2; (HSV) pUL34 &#x8F66;&#x884C; nucleocapsids &#x4ECE;&#x53D7;&#x611F;&#x67D3;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6838;&#x7684;&#x51FA;&#x53E3;&#x75C5;&#x6BD2;&#x590D;&#x5236;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x4E2D;&#x53D1;&#x6325;&#x7740;&#x5173;&#x952E;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E86;&#x4E00;&#x79CD;&#x7A81;&#x53D8; pUL34 (Y68A) &#x4E3B;&#x8981;&#x4EA7;&#x751F;&#x75C5;&#x6BD2;&#x590D;&#x5236;&#x4E2D;&#x7684;&#x7F3A;&#x9677;&#x548C;&#x53D7;&#x635F;&#x6838;&#x51FA;&#x53E3;&#x4F46;&#x8FD8;&#x6DF1;&#x523B;&#x5730;&#x6291;&#x5236;&#x7EC6;&#x80DE;-&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x6269;&#x6563;&#x548C;&#x8D29;&#x8FD0;&#x7684; gE&#x3002;&#x75C5;&#x6BD2;&#x9897;&#x7C92;&#x91CA;&#x653E;&#x5230;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5916;&#x4ECB;&#x8D28;&#x4E0D;&#x53D7; Y68A &#x7A81;&#x53D8;&#xFF0C;&#x7A81;&#x53D8;&#x4E13;&#x95E8;&#x6291;&#x5236;&#x7EC6;&#x80DE;-&#x7EC6;&#x80DE;&#x8513;&#x5EF6;&#xFF0C;&#x8BE5;&#x503C;&#x6307;&#x793A;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5B64;&#x7ACB; extragenic &#x6291;&#x5236;&#x5242; Y68A &#x6591;&#x5757;&#x5F62;&#x6210;&#x7F3A;&#x9677;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x548C;&#x6620;&#x5C04;&#x5B83;&#x4EEC;&#x7684;&#x9AD8;&#x541E;&#x5410;&#x91CF;&#x7167;&#x6392;&#x80F6;&#x7247;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x548C;&#x57FA;&#x4E8E;&#x805A;&#x5408;&#x9176;&#x94FE;&#x53CD;&#x5E94;&#x7B5B;&#x9009;&#x7684;&#x7EC4;&#x5408;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x53D1;&#x73B0;&#x5236;&#x6B62;&#x4E0E;&#x7A81;&#x53D8;&#x5BFC;&#x81F4; US9 &#x57FA;&#x56E0;&#xFF0C;&#x5728;&#x795E;&#x7ECF;&#x5143;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8513;&#x5EF6;&#x7684;&#x5355;&#x7EAF;&#x75B1;&#x75B9;&#x75C5;&#x6BD2; 1 &#x4E2D;&#x53D1;&#x6325;&#x5173;&#x952E;&#x4F5C;&#x7528;&#x7684;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x76F8;&#x5173;&#x3002;&#x5355;&#x72EC;&#x7684; US9 &#x7A81;&#x53D8;&#x5E76;&#x4E0D;&#x8DB3;&#x4EE5;&#x5236;&#x6B62;&#x8513;&#x5EF6;&#x7684; Y68A &#x578B;&#xFF0C;&#x8868;&#x793A;&#x4E3A;&#x591A;&#x4E2A;&#x75C5;&#x6BD2;&#x56E0;&#x7D20;&#x7684;&#x53EF;&#x80FD;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;

&#x5355;&#x7EAF;&#x75B1;&#x75B9;&#x75C5;&#x6BD2; 1 pUL34 &#x4E2D;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x75C5;&#x6BD2;&#x7684;&#x8513;&#x5EF6;&#x9664;&#x4E86;&#x5728;&#x75C5;&#x6BD2;&#x590D;&#x5236;&#x4E2D;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x5177;&#x6709;&#x5173;&#x952E;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;

Herpes simplex virus (HSV) pUL34 plays a critical role in virus replication by mediating egress of nucleocapsids from the infected cell nucleus. We have identified a mutation in pUL34 (Y68A) that produces a major defect in virus replication and impaired nuclear egress but also profoundly inhibits cell-to-cell spread and trafficking of gE. Virion release to the extracellular medium is not affected by the Y68A mutation, indicating that the mutation specifically inhibits cell-to-cell spread. We isolated extragenic suppressors of the Y68A plaque formation defect and mapped them by a combination of high-throughput Illumina sequencing and PCR-based screening. We found that suppression is highly correlated with a nonsense mutation in the US9 gene, which plays a critical role in cell-to-cell spread of HSV-1 in neurons. The US9 mutation alone is not sufficient to suppress the Y68A spread phenotype, indicating a likely role for multiple viral factors.

Herpes simplex virus 1 pUL34 plays a critical role in cell-to-cell spread of virus in addition to its role in virus replication.

Herpes simplex virus (HSV) pUL34 joue un r&#xF4;le essentiel dans la r&#xE9;plication du virus par la m&#xE9;diation de sortie des nucl&#xE9;ocapsides du noyau de la cellule infect&#xE9;e. Nous avons identifi&#xE9; une mutation dans pUL34 (Y68A) qui produit un d&#xE9;faut majeur dans la r&#xE9;plication du virus et une alt&#xE9;ration de l&#x26;#39;&#xE9;vacuation nucl&#xE9;aire, mais aussi inhibe profond&#xE9;ment la cellule &#xE0; cellule propagation et le trafic de gE. Lib&#xE9;ration virion dans le milieu extracellulaire n&#x26;#39;est pas affect&#xE9;e par la mutation Y68A, indiquant que la mutation inhibe sp&#xE9;cifiquement la cellule &#xE0; cellule propagation. On isole suppresseurs extrag&#xE9;niques du d&#xE9;faut Y68A formation de la plaque et les mapp&#xE9; par une combinaison de haut d&#xE9;bit Illumina s&#xE9;quen&#xE7;age et reposant sur la PCR pr&#xE9;alable. Nous avons constat&#xE9; que la suppression est fortement corr&#xE9;l&#xE9;e avec une mutation non-sens dans le g&#xE8;ne US9, qui joue un r&#xF4;le essentiel dans la cellule &#xE0; cellule propagation du virus HSV-1 dans les neurones. La mutation US9 seule n&#x26;#39;est pas suffisante pour supprimer le ph&#xE9;notype propagation Y68A, indiquant un r&#xF4;le probable de plusieurs facteurs viraux.

Herpes Simplex Virus 1 PUL34 joue un r&#xF4;le essentiel dans la cellule &#xE0; cellule propagation du virus dans plus de son r&#xF4;le dans la r&#xE9;plication du virus

Herpes Simplex Virus (HSV) pUL34 spielt eine wichtige Rolle bei der Virus-Replikation durch Vermittlung der Ausstieg von Nucleocapsids vom infizierten Zellenkern. Wir haben ermittelt, dass eine Mutation in pUL34 (Y68A), produziert eine gro&szlig;e in der Virus-Replikation M&auml;ngel und nuklearen Ausstieg beeintr&auml;chtigt aber auch zutiefst hemmt Ausbreitung von Zelle zu Zelle und den Handel mit gE. Virion Freigabe auf das extrazellul&auml;re Medium wird nicht durch die Y68A-Mutation, die darauf hinweist, dass die Mutation speziell hemmt die Ausbreitung von Zelle zu Zelle beeinflusst. Wir extragenic D&auml;mpfer der Y68A Plakette Bildung Mangels isoliert und sie durch eine Kombination von hohem Durchsatz Illumina Sequenzierung und PCR-basierten Screening zugeordnet. Wir fanden, dass Unterdr&uuml;ckung hochgradig mit Unsinn Mutation im Gen US9 korreliert sind, das eine entscheidende Rolle in der Zell-Zell-Verbreitung von HSV-1 in Neuronen spielt. Die US9-Mutation allein reicht nicht, die Y68A verbreiten-Ph&auml;notyp, angibt, eine wahrscheinlich Rolle f&uuml;r mehrere virale Faktoren zu unterdr&uuml;cken.

Herpes-Simplex-Virus 1 pUL34 spielt eine wichtige Rolle in der Zell-Zell-Ausbreitung des Virus zus&auml;tzlich zu ihrer Rolle in der Virus-Replikation.

Herpes simplex virus (HSV) pUL34 svolge un ruolo critico nella replicazione del virus di mediazione egress di nucleocapsidi dal nucleo della cellula infetta. Abbiamo identificato una mutazione nel pUL34 (Y68A) che produce un maggior difetto nella replicazione del virus e alterata egress nucleare ma anche profondamente inibisce la diffusione cellula-cellula e il traffico di gE. Rilascio del virione al medium extracellulare non subisce la mutazione Y68A, che indica che la mutazione inibisce specificamente alla cella diffusione. Abbiamo isolato extragenic soppressori del difetto di formazione di placca Y68A e li mappato da una combinazione di sequenziamento Illumina high-throughput e screening basati sulla PCR. Abbiamo trovato che la soppressione &egrave; altamente correlata con una mutazione nonsenso nel gene US9, che svolge un ruolo critico nella cella a diffusione di HSV-1 in neuroni. La mutazione US9 da sola non &egrave; sufficiente per sopprimere il fenotipo Y68A diffusa, che indica un probabile ruolo per molteplici fattori virali.

Herpes simplex virus 1 pUL34 svolge un ruolo critico nella cella di diffusione del virus oltre al suo ruolo nella replicazione del virus.

&#x5358;&#x7D14;&#x30D8;&#x30EB;&#x30DA;&#x30B9;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#xFF08;HSV&#xFF09;pUL34&#x306F;&#x3001;&#x611F;&#x67D3;&#x3057;&#x305F;&#x7D30;&#x80DE;&#x6838;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30AB;&#x30D7;&#x30B7;&#x30C9;&#x306E;&#x51FA;&#x53E3;&#x3092;&#x5A92;&#x4ECB;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x8907;&#x88FD;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x679C;&#x305F;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x8907;&#x88FD;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x969C;&#x5BB3;&#x306E;&#x6838;&#x51FA;&#x529B;&#x306E;&#x4E3B;&#x8981;&#x306A;&#x6B20;&#x9665;&#x3092;&#x751F;&#x6210;&#x3059;&#x308B;&#x3060;&#x3051;&#x3067;&#x306A;&#x304F;&#x3001;&#x6DF1;&#x304F;&#x7D30;&#x80DE;&#x9593;&#x62E1;&#x6563;&#x304A;&#x3088;&#x3073;gE&#x306E;&#x4EBA;&#x8EAB;&#x58F2;&#x8CB7;&#x3092;&#x6291;&#x5236;&#x3059;&#x308B;pUL34&#xFF08;Y68A&#xFF09;&#x306E;&#x5909;&#x7570;&#x3092;&#x540C;&#x5B9A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x7D30;&#x80DE;&#x5916;&#x5A92;&#x4F53;&#x3078;&#x306E;&#x30D3;&#x30EA;&#x30AA;&#x30F3;&#x306E;&#x30EA;&#x30EA;&#x30FC;&#x30B9;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x5909;&#x7570;&#x304C;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x306B;&#x7D30;&#x80DE;&#x9593;&#x62E1;&#x6563;&#x3092;&#x6291;&#x5236;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x3001;Y68A&#x5909;&#x7570;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x5F71;&#x97FF;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;Y68A&#x306E;&#x30D7;&#x30E9;&#x30FC;&#x30AF;&#x5F62;&#x6210;&#x6B20;&#x640D;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x5916;&#x30B5;&#x30D7;&#x30EC;&#x30C3;&#x30B5;&#x30FC;&#x3092;&#x5206;&#x96E2;&#x3057;&#x3001;&#x9AD8;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x30C3;&#x30C8;&#x30A4;&#x30EB;&#x30DF;&#x30CA;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x3068;PCR&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30FC;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x3092;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x6291;&#x5236;&#x304C;&#x975E;&#x5E38;&#x306B;&#x795E;&#x7D4C;&#x7D30;&#x80DE;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;HSV-1&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x9593;&#x62E1;&#x6563;&#x306B;&#x304A;&#x3044;&#x3066;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x679C;&#x305F;&#x3057;US9&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306B;&#x30CA;&#x30F3;&#x30BB;&#x30F3;&#x30B9;&#x5909;&#x7570;&#x3068;&#x76F8;&#x95A2;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x304C;&#x898B;&#x3064;&#x304B;&#x308A;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5358;&#x72EC;&#x3067;US9&#x7A81;&#x7136;&#x5909;&#x7570;&#x306F;&#x3001;&#x8907;&#x6570;&#x306E;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x56E0;&#x5B50;&#x306E;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x9AD8;&#x3044;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x3001;Y68A&#x306E;&#x5E83;&#x304C;&#x308A;&#x306E;&#x8868;&#x73FE;&#x578B;&#x3092;&#x6291;&#x5236;&#x3059;&#x308B;&#x306E;&#x306B;&#x5341;&#x5206;&#x3067;&#x306F;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3002;

&#x5358;&#x7D14;&#x30D8;&#x30EB;&#x30DA;&#x30B9;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;1 PUL34&#x306F;&#x3001;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x8907;&#x88FD;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x5F79;&#x5272;&#x306B;&#x52A0;&#x3048;&#x3066;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x9593;&#x62E1;&#x6563;&#x306B;&#x304A;&#x3044;&#x3066;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x679C;&#x305F;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x5358;&#x7D14;

&#xB2E8;&#xC21C; &#xD3EC;&#xC9C4; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; (HSV) pUL34 nucleocapsids &#xAC10;&#xC5FC;&#xB41C; &#xC138;&#xD3EC; &#xD575;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC758; &#xD0C8;&#xCD9C;&#xAD6C;&#xB97C; &#xC911;&#xC7AC; &#xD558; &#xC5EC; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xBCF5;&#xC81C;&#xC5D0; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xD55C;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; Pul34&#xC5D0; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; &#xD655;&#xC778; (Y68A) &#xC8FC;&#xB97C; &#xC0DD;&#xC0B0; &#xD558; &#xACE0; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xBCF5;&#xC81C;&#xB97C; &#xC81C;&#xAC70; &#xD558; &#xACE0; &#xD575; &#xC1A1;&#xC2E0; &#xC7A5;&#xC560; &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xB610;&#xD55C; &#xC2EC;&#xD788; &#xC140;&#xC744; &#xD655;&#xC0B0; &#xD558; &#xACE0; Ge&#xC758; &#xC778;&#xC2E0; &#xB9E4;&#xB9E4;&#xB97C; &#xC5B5;&#xC81C;&#xB294;. &#xC138;&#xD3EC; &#xC678; &#xB9E4;&#xCCB4; virion &#xCD9C;&#xC2DC; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; &#xD2B9;&#xD788; &#xC140; &#xD655;&#xC0B0; &#xC5B5;&#xC81C;&#xB97C; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; Y68A &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; &#xC758;&#xD574; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xBC1B;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. Y68A &#xD50C; &#xB77C;&#xD06C; &#xD615;&#xC131; &#xACB0;&#xD568;&#xC758; extragenic &#xC9C4;&#xC555;&#xC744; &#xC808;&#xC5F0; &#xD558; &#xACE0; &#xB192;&#xC740; &#xCC98;&#xB9AC;&#xB7C9; Illumina&#xC758; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1; &#xBC0F; PCR &#xAE30;&#xBC18; &#xAC80;&#xC0AC;&#xC758; &#xC870;&#xD569;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xB9E4;&#xD551;&#xB41C;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC5B5;&#xC81C; &#xB9E4;&#xC6B0; &#xC2E0;&#xACBD;&#xC5D0; &#xC788;&#xB294; HSV-1 &#xC140; &#xD655;&#xC0B0;&#xC5D0; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xD55C;&#xB2E4; US9 &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xB10C;&#xC13C;&#xC2A4; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774;&#xC640; &#xC0C1;&#xAD00; &#xAD00;&#xACC4;&#xAC00; &#xBC1C;&#xACAC;. &#xD63C;&#xC790; US9 &#xBCC0;&#xC774; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xC131; &#xC694;&#xC778;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAC00;&#xB2A5;&#xC131;&#xC774; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; Y68A &#xD655;&#xC0B0; &#xD615; &#xD45C;&#xC2DC; &#xD558;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC73C;&#xB824;&#xBA74; &#xCDA9;&#xBD84; &#xD558;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xD5E4; &#xB974; &#xD398; &#xC2A4;&#xC758; &#xB2E8;&#xC21C; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; 1 pUL34 &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xBCF5;&#xC81C;&#xC5D0; &#xC788;&#xB294; &#xADF8;&#xAC83;&#xC758; &#xC5ED;&#xD560;&#xC758; &#xC140; &#xD655;&#xC0B0;&#xC5D0; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xD55C;&#xB2E4;.

Virus del herpes simple (VHS) pUL34 desempe&#xF1;a un papel fundamental en la replicaci&#xF3;n del virus por la mediaci&#xF3;n de la salida de nucleoc&#xE1;pside del n&#xFA;cleo de la c&#xE9;lula infectada. Hemos identificado una mutaci&#xF3;n en pUL34 (Y68A) que produce un defecto importante en la replicaci&#xF3;n del virus y la salida nuclear alterada, pero tambi&#xE9;n profundamente inhibe la c&#xE9;lula a c&#xE9;lula de difusi&#xF3;n y el tr&#xE1;fico de GE. Viri&#xF3;n liberaci&#xF3;n al medio extracelular no se ve afectada por la mutaci&#xF3;n Y68A, lo que indica que la mutaci&#xF3;n inhibe espec&#xED;ficamente la c&#xE9;lula a c&#xE9;lula propagaci&#xF3;n. Se aislaron supresores extrag&#xE9;nicas del defecto formaci&#xF3;n Y68A placa y mapeado ellos por una combinaci&#xF3;n de alto rendimiento Illumina secuenciaci&#xF3;n y detecci&#xF3;n basado en la PCR. Hemos encontrado que la supresi&#xF3;n est&#xE1; altamente correlacionada con una mutaci&#xF3;n sin sentido en el gen de US9, que desempe&#xF1;a un papel fundamental en la c&#xE9;lula a c&#xE9;lula de difusi&#xF3;n de HSV-1 en las neuronas. La mutaci&#xF3;n US9 por s&#xED; sola no es suficiente para suprimir el fenotipo propagaci&#xF3;n Y68A, indicando un papel probable para m&#xFA;ltiples factores virales.

Herpes Simplex Virus 1 PUL34 desempe&#xF1;a un papel fundamental en la c&#xE9;lula a c&#xE9;lula de diseminaci&#xF3;n del virus, adem&#xE1;s de su papel en la replicaci&#xF3;n del virus

Alphaherpesviruses &#x662F;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x5B58;&#x5728;&#x4E8E;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x7684;&#x6570;&#x91CF;&#xFF0C;&#x5E76;&#x5305;&#x62EC;&#x5355;&#x7EAF;&#x75B1;&#x75B9;&#x75C5;&#x6BD2; (HSV-1&#xFF09; 1 &#x548C;&#x7B2C; 2 &#x6B3E;&#x548C;&#x6C34;&#x75D8;&#x5E26;&#x72B6;&#x75B1;&#x75B9;&#x75C5;&#x6BD2; &#xECFD;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x75C5;&#x6BD2;&#x75C5;&#x539F;&#x4F53;&#x5BFC;&#x81F4;&#x4E0A;&#x76AE;&#x75C5;&#x53D8;&#xFF0C;&#x7136;&#x540E;&#x611F;&#x67D3;&#x4E2D;&#x67A2;&#x795E;&#x7ECF;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x4F1A;&#x9020;&#x6210;&#x7EC8;&#x8EAB;&#x7684;&#x6EDE;&#x540E;&#x65F6;&#x95F4;&#x3001; &#x91CD;&#x65B0;&#x6FC0;&#x6D3B;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA;&#x4F20;&#x64AD;&#x3002;&#x6709;&#x5173;&#x517D;&#x533B;&#x75B1;&#x75B9;&#x75C5;&#x6BD2;&#x3001; &#x732A;&#x4F2A;&#x72C2;&#x72AC;&#x75C5; &#xFF08;&#x4E0A;&#x4E00;&#x9875;&#xFF09;&#xFF0C;&#x5BFC;&#x81F4;&#x7C7B;&#x4F3C;&#x75BE;&#x75C5;&#x5BFC;&#x81F4;&#x91CD;&#x5927;&#x7ECF;&#x6D4E;&#x635F;&#x5931;&#x7684;&#x7272;&#x755C;&#x3002;&#x75AB;&#x82D7;&#x5F00;&#x53D1;&#x7684; VZV &#x548C;&#x4F2A;&#x72C2;&#x72AC;&#x75C5;&#x6BD2;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x53D1;&#x5C55;&#x7684;&#x4E00;&#x79CD;&#x5355;&#x7EAF;&#x75B1;&#x75B9;&#x75C5;&#x6BD2; 1 &#x75AB;&#x82D7;&#x7684;&#x6709;&#x76CA;&#x6A21;&#x5F0F;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x76EE;&#x524D;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5E8F;&#x5217;&#x6BD4;&#x8F83;&#x7684;&#x4F2A;&#x72C2;&#x72AC;&#x75C5;&#x6BD2;&#x75AB;&#x82D7;&#x682A;&#x5DF4;&#x5C14;&#x5854;&#x548C;&#x4E24;&#x4E2A;&#x6BD2;&#x4F2A;&#x72C2;&#x72AC;&#x75C5;&#x6BD2;&#x682A;&#xFF0C;&#x5361;&#x666E;&#x5170;&#x548C;&#x8D1D;&#x514B;&#x5C14;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5E8F;&#x5217;&#x5B9A;&#x7684;&#x9AD8;&#x901A;&#x91CF;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x548C;&#x96C6;&#x4F1A;&#xFF0C;&#x8870;&#x51CF;&#x7684;&#x54FA;&#x4E73;&#x52A8;&#x7269; alphaherpesvirus &#x75AB;&#x82D7;&#x682A;&#x672C;&#x65B0;&#x7684;&#x89C1;&#x89E3;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x53D1;&#x73B0;&#x5F88;&#x591A;&#x4EE5;&#x524D;&#x672A;&#x77E5;&#x7F16;&#x7801;&#x5DEE;&#x522B;&#x4E0A;&#x4E00;&#x9875;&#x5DF4;&#x5C14;&#x5854;&#x548C;&#x5F3A;&#x6BD2;&#x682A;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x878D;&#x5408;&#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x66F4;&#x6539;&#x4E4B;&#x95F4; gH &#x548C; gB &#x548C;&#x56DB;&#x5341;&#x591A;&#x5176;&#x4ED6;&#x75C5;&#x6BD2;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x3002;&#x4F2A;&#x72C2;&#x72AC;&#x75C5;&#x6BD2;&#x86CB;&#x767D;&#x5E8F;&#x5217; inter-strain &#x53D8;&#x5316;&#x662F;&#x66F4;&#x63A5;&#x8FD1;&#x4E8E;&#x4EE5;&#x524D;&#x89C2;&#x5BDF;&#x5230;&#x7684;&#x5355;&#x7EAF;&#x75B1;&#x75B9;&#x75C5;&#x6BD2; 1 &#x6BD4;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x7A33;&#x5B9A;&#x7684; VZV &#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x5B66;&#x7684;&#x6C34;&#x5E73;&#x3002;&#x51E0;&#x4E4E; 20%&#x7684;&#x4F2A;&#x72C2;&#x72AC;&#x75C5;&#x6BD2;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5305;&#x542B;&#x4E32;&#x8054;&#x7684;&#x77ED;&#x5E8F;&#x5217;&#x91CD;&#x590D;&#x5E8F;&#x5217; &#xFF08;SSRs&#xFF09;&#xFF0C;&#x5176;&#x957F;&#x5EA6;&#x53D8;&#x5316;&#x5DF2;&#x7ECF;&#x4E0E; DNA &#x7ED3;&#x5408;&#x7AD9;&#x70B9;&#x6548;&#x7387;&#x3001; &#x8F6C;&#x5F55;&#x8C03;&#x63A7;&#x548C;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x7684;&#x53D8;&#x5316;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x7684;&#x6838;&#x9178;&#x5E8F;&#x5217;&#x7684;&#x4E00;&#x7C7B;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5728;&#x75B1;&#x75B9;&#x75C5;&#x6BD2;&#x5BB6;&#x65CF;&#xFF0C;&#x6574;&#x4E2A;&#x67E5;&#x627E; SSRs &#x548C;&#x63D0;&#x4F9B; SSRs &#x4E2D;&#x75C5;&#x6BD2;&#x5185;, &#x548C;&#x83CC;&#x682A;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7B2C;&#x4E00;&#x6B21;&#x5168;&#x7403;&#x8868;&#x5F81;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x627E;&#x5230; SSR &#x957F;&#x5EA6;&#x5DEE;&#x5F02;&#x7684;&#x4E0D;&#x540C;&#x5206;&#x79BB;&#x682A;&#x4F2A;&#x72C2;&#x72AC;&#x75C5;&#x6BD2;&#x7684;&#x548C;&#x5355;&#x7EAF;&#x75B1;&#x75B9;&#x75C5;&#x6BD2;-1&#xFF0C;&#x53EF;&#x63D0;&#x4F9B;&#x7684;&#x8868;&#x578B;&#x53D8;&#x5F02;&#x682A;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x65B0;&#x673A;&#x5236;&#x3002;&#x6700;&#x540E;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x68C0;&#x6D4B;&#x5230;&#x5C11;&#x91CF;&#x7684;&#x591A;&#x6001;&#x57FA;&#x5730;&#x5185;&#x6BCF;&#x4E00;&#x6591;&#x5757;&#x7EAF;&#x51C0;&#x7684;&#x4F2A;&#x72C2;&#x72AC;&#x75C5;&#x6BD2;&#x682A;&#xFF0C;&#x548C;&#x6211;&#x4EEC;&#x662F;&#x5BF9;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x57FA;&#x56E0;&#x591A;&#x6001;&#x6027;&#x5F71;&#x54CD;&#x901A;&#x884C;&#x548C;&#x83CC;&#x6591;&#x7EAF;&#x5316;&#x7684;&#x7279;&#x70B9;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x6570;&#x636E;&#x5C06;&#x6DFB;&#x52A0;&#x5230;&#x8D8A;&#x6765;&#x8D8A;&#x591A;&#x7684;&#x751A;&#x81F3;&#x6591;&#x5757;&#x51C0;&#x5316;&#x80A1;&#x5E02;&#x7A33;&#x5B9A; DNA &#x75C5;&#x6BD2;&#x7684;&#x5C55;&#x89C8;&#x6709;&#x9650;&#x7684;&#x5E8F;&#x5217;&#x975E;&#x5747;&#x8D28;&#x6027;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x53EF;&#x80FD;&#x79CD;&#x5B50;&#x672A;&#x6765;&#x5E94;&#x53D8;&#x6F14;&#x5316;&#x7684;&#x8BC1;&#x636E;&#x3002;

Inter-strain &#x591A;&#x6837;&#x6027;&#x7684;&#x6076;&#x6BD2;&#x7684;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x7A0B;&#x5EA6;&#x548C; alphaherpesviruses &#x75AB;&#x82D7;&#x682A;&#x3002;

Alphaherpesviruses are widespread in the human population, and include herpes simplex virus 1 (HSV-1) and 2, and varicella zoster virus (VZV). These viral pathogens cause epithelial lesions, and then infect the nervous system to cause lifelong latency, reactivation, and spread. A related veterinary herpesvirus, pseudorabies (PRV), causes similar disease in livestock that result in significant economic losses. Vaccines developed for VZV and PRV serve as useful models for the development of an HSV-1 vaccine. We present full genome sequence comparisons of the PRV vaccine strain Bartha, and two virulent PRV isolates, Kaplan and Becker. These genome sequences were determined by high-throughput sequencing and assembly, and present new insights into the attenuation of a mammalian alphaherpesvirus vaccine strain. We find many previously unknown coding differences between PRV Bartha and the virulent strains, including changes to the fusion proteins gH and gB, and over forty other viral proteins. Inter-strain variation in PRV protein sequences is much closer to levels previously observed for HSV-1 than for the highly stable VZV proteome. Almost 20% of the PRV genome contains tandem short sequence repeats (SSRs), a class of nucleic acids motifs whose length-variation has been associated with changes in DNA binding site efficiency, transcriptional regulation, and protein interactions. We find SSRs throughout the herpesvirus family, and provide the first global characterization of SSRs in viruses, both within and between strains. We find SSR length variation between different isolates of PRV and HSV-1, which may provide a new mechanism for phenotypic variation between strains. Finally, we detected a small number of polymorphic bases within each plaque-purified PRV strain, and we characterize the effect of passage and plaque-purification on these polymorphisms. These data add to growing evidence that even plaque-purified stocks of stable DNA viruses exhibit limited sequence heterogeneity, which likely seeds future strain evolution.

A wide extent of inter-strain diversity in virulent and vaccine strains of alphaherpesviruses.

Alphaherp&#xE8;svirus sont tr&#xE8;s r&#xE9;pandues dans la population humaine, et incluent le virus de l&#x26;#39;herp&#xE8;s simplex 1 (HSV-1) et 2, et le virus varicelle zona (VZV). Ces agents pathog&#xE8;nes viraux causer des l&#xE9;sions &#xE9;pith&#xE9;liales, puis infecter le syst&#xE8;me nerveux de provoquer la latence tout au long, la r&#xE9;activation, et la propagation. Un virus de l&#x26;#39;herp&#xE8;s li&#xE9;es v&#xE9;t&#xE9;rinaire, pseudorage (PRV), provoque une maladie similaire &#xE0; l&#x26;#39;&#xE9;levage qui se traduisent par des pertes &#xE9;conomiques importantes. Les vaccins d&#xE9;velopp&#xE9;s pour le VZV et PRV servir de mod&#xE8;les utiles pour l&#x26;#39;&#xE9;laboration d&#x26;#39;un vaccin contre le HSV-1. Nous pr&#xE9;sentons &#xE0; part enti&#xE8;re des comparaisons de s&#xE9;quences du g&#xE9;nome de la souche vaccinale PRV Bartha, et deux isolats virulents PRV, Kaplan et Becker. Ces s&#xE9;quences g&#xE9;nomiques ont &#xE9;t&#xE9; d&#xE9;termin&#xE9;es par s&#xE9;quen&#xE7;age &#xE0; haut d&#xE9;bit et d&#x26;#39;assemblage, et de pr&#xE9;senter de nouvelles connaissances sur l&#x26;#39;att&#xE9;nuation d&#x26;#39;une souche vaccinale alphaherp&#xE8;svirus mammif&#xE8;res. Nous trouvons de nombreux jusque-l&#xE0; inconnues des diff&#xE9;rences de codage entre PRV Bartha et les souches virulentes, y compris les modifications apport&#xE9;es &#xE0; la gH prot&#xE9;ines de fusion et GB, et plus de quarante autres prot&#xE9;ines virales. Inter-souche variation de s&#xE9;quences de prot&#xE9;ines PRV est beaucoup plus proche des niveaux observ&#xE9;s auparavant pour le HSV-1 que pour le tr&#xE8;s stable prot&#xE9;ome VZV. Pr&#xE8;s de 20% du g&#xE9;nome de PRV contient des r&#xE9;p&#xE9;titions en tandem de courtes s&#xE9;quences (SSRS), une classe de motifs d&#x26;#39;acides nucl&#xE9;iques dont la longueur de variation a &#xE9;t&#xE9; associ&#xE9;e &#xE0; des changements dans l&#x26;#39;efficacit&#xE9; du site de liaison d&#x26;#39;ADN, la r&#xE9;gulation transcriptionnelle et les interactions entre prot&#xE9;ines. Nous trouvons tout au long de SSR la famille des herp&#xE8;svirus, et de fournir la premi&#xE8;re caract&#xE9;risation globale de SSR dans les virus, tant &#xE0; l&#x26;#39;int&#xE9;rieur et entre les souches. Nous trouvons variation de longueur SSR entre les diff&#xE9;rents isolats de PRV et le HSV-1, qui peuvent fournir un nouveau m&#xE9;canisme de variation ph&#xE9;notypique entre souches. Enfin, on a d&#xE9;tect&#xE9; un petit nombre de bases polymorphes &#xE0; l&#x26;#39;int&#xE9;rieur de chaque souche purifi&#xE9;e de plaque PRV, et on caract&#xE9;rise l&#x26;#39;effet de passage et la plaque-purification sur ces polymorphismes. Ces donn&#xE9;es s&#x26;#39;ajoutent aux preuves de plus en plus que m&#xEA;me la plaque-purifi&#xE9; des stocks de virus &#xE0; ADN stables pr&#xE9;sentent h&#xE9;t&#xE9;rog&#xE9;n&#xE9;it&#xE9; de s&#xE9;quence limit&#xE9;e, dont l&#x26;#39;&#xE9;volution probable des graines souche avenir.

Dans une large mesure de l&#x26;#39;Inter-souche diversit&#xE9; dans les souches virulentes et les vaccins des alphaherp&#xE8;svirus

Alphaherpesviruses sind in der menschlichen Bev&ouml;lkerung weit verbreitet und sind Herpes-Simplex-Virus 1 (HSV-1) und 2 und Varicella-Zoster-Virus (VZV). Diese virale Erreger epithelialen L&auml;sionen und dann infizieren das Nervensystem um lebenslange Latenz, Reaktivierung und Verbreitung zu verursachen. Eine verwandte tier&auml;rztliche Herpesvirus, Pseudorabies (PRV), verursacht &auml;hnliche Krankheit im Vieh, die zu erheblichen wirtschaftlichen Verlusten f&uuml;hren. Impfstoffe f&uuml;r VZV und PRV als n&uuml;tzliche Modelle f&uuml;r die Entwicklung einer HSV-1-Impfung dienen entwickelt. Wir pr&auml;sentieren vollst&auml;ndige Genom Sequenz Vergleiche der PRV Vakzinstammes Bartha und zwei virulenten PRV-Isolaten, Kaplan und Becker. Diese Genomsequenzen wurden von Hochdurchsatz-Sequenzierung und Assembly und vorliegende neue Einblicke in die D&auml;mpfung von S&auml;ugetier-Alphaherpesvirus Impfstoff Belastung bestimmt. Wir finden viele bisher unbekannte Kodierung Unterschiede zwischen PRV-Bartha und die virulenten St&auml;mmen, einschlie&szlig;lich &Auml;nderungen an die Fusionsproteine gH und gB und &uuml;ber 40 andere virale Proteine. Inter-Strain Schwankungen der PRV Proteinsequenzen ist viel n&auml;her an Ebenen, die zuvor f&uuml;r HSV-1 als das hochstabile VZV Proteome beobachtet. Fast 20 % des Genoms PRV enth&auml;lt Tandem kurze Sequenz Wiederholungen (SSRs), einer Klasse von Nukleins&auml;uren-Motiven, deren L&auml;nge-Variation Ver&auml;nderungen in DNA Bindung Website Effizienz, Transkriptionsregulation und Proteininteraktionen zugeordnet wurde. Wir SSRs w&auml;hrend der Herpesvirus-Familie zu finden, und die erste globale Charakterisierung der SSRs Viren, sowohl innerhalb als auch zwischen den St&auml;mmen. Wir finden die SSR L&auml;nge Variation zwischen verschiedenen Isolaten des PRV und HSV-1, die einen neuen Mechanismus f&uuml;r die ph&auml;notypische Variation zwischen St&auml;mmen vorsehen. Schlie&szlig;lich erkannten wir eine kleine Anzahl von polymorphen Basen innerhalb jeder Tafel-gereinigt PRV-Stamm, und wir charakterisieren die Wirkung der Passage und Plakette-Reinigung auf diese Polymorphismen. Diese Daten hinzuf&uuml;gen zu beweisen, dass sogar Plakette gereinigt Best&auml;nde stabil DNA-Viren begrenzte Folge Heterogenit&auml;t, zeigen die wahrscheinlich zuk&uuml;nftige Belastung Entwicklung Samen wachsen.

Einem breiten Umfang der inter-strain Vielfalt in virulenten Impfstoff Strapazen des Alphaherpesviruses.

Alphaherpesviruses sono diffusi nella popolazione umana e comprendono l&#39;herpes simplex virus 1 (HSV-1) e 2 e il virus varicella-zoster (VZV). Questi agenti patogeni virali provocano lesioni epiteliali e quindi infettano il sistema nervoso per causare la diffusione, la riattivazione e la latenza permanente. Un herpesvirus veterinarie correlate, Pseudorabbia (PRV), causa malattia simile nel bestiame che si traducono in notevoli perdite economiche. Vaccini sviluppati per VZV e PRV servono come modelli utili per lo sviluppo di un vaccino contro HSV-1. Vi presentiamo il genoma completo i confronti di sequenza del ceppo vaccino PRV Bartha e due isolati virulenti PRV, Kaplan e Becker. Queste sequenze di genoma sono state determinate da high-throughput sequencing e assemblaggio presenti nuove intuizioni l&#39;attenuazione di un ceppo del vaccino alphaherpesvirus dei mammiferi. Troviamo molte differenze codificante sconosciute tra PRV Bartha e ceppi virulenti, incluse le modifiche alle proteine di fusione gH e gB e pi&ugrave; di quaranta altre proteine virali. Inter-Strain variazione in PRV sequenze della proteina &egrave; molto pi&ugrave; vicino ai livelli precedentemente osservati per HSV-1 che per il proteoma VZV altamente stabile. Quasi il 20% del genoma PRV contiene tandem breve sequenza ripete (SSRs), una classe di acidi nucleici motivi cui variazione di lunghezza &egrave; stata associata con i cambiamenti in DNA binding sito efficienza, regolazione trascrizionale e le interazioni della proteina. Troviamo SSRs per tutta la famiglia herpesvirus e fornire la prima caratterizzazione globale di SSRs in virus, sia all&#39;interno sia tra ceppi. Troviamo la variazione di lunghezza SSR tra diversi isolati di PRV e HSV-1, che pu&ograve; fornire un nuovo meccanismo per variazione fenotipica tra ceppi. Infine, abbiamo rilevato un piccolo numero di polimorfici basi all&#39;interno di ogni ceppo PRV placca purificata e ci caratterizzano l&#39;effetto del passaggio e targa-purificazione su questi polimorfismi. Questi dati aggiungere alla crescente evidenza che anche purificato placca stock di virus a DNA stabile esibiscono eterogeneit&agrave; sequenza limitata, quale probabile evoluzione futura ceppo i semi.

Una misura ampia diversit&agrave; inter-strain in virulento e ceppi di vaccino di alphaherpesviruses.

Alphaherpesviruses&#x306F;&#x3001;&#x4EBA;&#x9593;&#x306E;&#x96C6;&#x56E3;&#x306B;&#x5E83;&#x7BC4;&#x3067;&#x3042;&#x308A;&#x3001;&#x5358;&#x7D14;&#x30D8;&#x30EB;&#x30DA;&#x30B9;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;1&#xFF08;HSV-1&#xFF09;&#x304A;&#x3088;&#x3073;2&#x3001;&#x6C34;&#x75D8;&#x5E2F;&#x72B6;&#x75B1;&#x75B9;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#xFF08;VZV&#xFF09;&#x304C;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x75C5;&#x539F;&#x4F53;&#x306F;&#x3001;&#x4E0A;&#x76AE;&#x6027;&#x75C5;&#x5909;&#x3092;&#x5F15;&#x304D;&#x8D77;&#x3053;&#x3057;&#x3001;&#x305D;&#x306E;&#x5F8C;&#x751F;&#x6DAF;&#x5F85;&#x3061;&#x6642;&#x9593;&#x3001;&#x518D;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x3001;&#x53CA;&#x3073;&#x307E;&#x3093;&#x5EF6;&#x3092;&#x5F15;&#x304D;&#x8D77;&#x3053;&#x3059;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x795E;&#x7D4C;&#x7CFB;&#x306B;&#x611F;&#x67D3;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x95A2;&#x9023;&#x306E;&#x7363;&#x533B;&#x30D8;&#x30EB;&#x30DA;&#x30B9;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x3001;&#x4EEE;&#x6027;&#x72C2;&#x72AC;&#x75C5;&#xFF08;PRV&#xFF09;&#x306F;&#x3001;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x7D4C;&#x6E08;&#x7684;&#x640D;&#x5931;&#x3067;&#x3001;&#x305D;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x5BB6;&#x755C;&#x3067;&#x540C;&#x69D8;&#x306E;&#x75BE;&#x60A3;&#x3092;&#x5F15;&#x304D;&#x8D77;&#x3053;&#x3059;&#x3002; VZV&#x3068;PRV&#x7528;&#x306B;&#x958B;&#x767A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30EF;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3;&#x306F;&#x3001;HSV-1&#x30EF;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3;&#x958B;&#x767A;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x6709;&#x7528;&#x306A;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;PRV&#x30EF;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3;&#x682A;&#x30D0;&#x30FC;&#x30B5;&#x3001;&#x4E8C;&#x3064;&#x306E;&#x5F37;&#x6BD2;PRV&#x5206;&#x96E2;&#x3001;&#x30AB;&#x30D7;&#x30E9;&#x30F3;&#x3068;&#x30D9;&#x30C3;&#x30AB;&#x30FC;&#x306E;&#x5168;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x914D;&#x5217;&#x306E;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3092;&#x63D0;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x914D;&#x5217;&#x306F;&#x3001;&#x54FA;&#x4E73;&#x52D5;&#x7269;alphaherpesvirus&#x30EF;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3;&#x682A;&#x306E;&#x6E1B;&#x8870;&#x3078;&#x306E;&#x30CF;&#x30A4;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x30C3;&#x30C8;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30A2;&#x30BB;&#x30F3;&#x30D6;&#x30EA;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x73FE;&#x5728;&#x306E;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x529B;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x878D;&#x5408;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306F;GH&#x3068;GB&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;40&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x4ED6;&#x306E;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3078;&#x306E;&#x5909;&#x66F4;&#x3092;&#x542B;&#x3080;PRV&#x30D0;&#x30FC;&#x30B5;&#x3068;&#x5F37;&#x6BD2;&#x682A;&#x306E;&#x9593;&#x306B;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x672A;&#x77E5;&#x306E;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x9055;&#x3044;&#x3092;&#x3001;&#x898B;&#x3064;&#x3051;&#x308B;&#x3002; PRV&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x914D;&#x5217;&#x306E;&#x9593;&#x306E;&#x3072;&#x305A;&#x307F;&#x5909;&#x5316;&#x306F;&#x3001;&#x4EE5;&#x524D;&#x306F;&#x975E;&#x5E38;&#x306B;&#x5B89;&#x5B9A;&#x3057;&#x305F;VZV&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30FC;&#x30E0;&#x3088;&#x308A;&#x3082;HSV-1&#x306B;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306B;&#x306F;&#x308B;&#x304B;&#x306B;&#x8FD1;&#x3044;&#x3067;&#x3059;&#x3002; PRV&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x307B;&#x307C;20&#xFF05;&#x306F;&#x30BF;&#x30F3;&#x30C7;&#x30E0;&#x77ED;&#x3044;&#x914D;&#x5217;&#x306E;&#x7E70;&#x308A;&#x8FD4;&#x3057;&#xFF08;SSRS&#xFF09;&#x3001;&#x9577;&#x200B;&#x200B;&#x3055;&#x5909;&#x5316;&#x306E;DNA&#x7D50;&#x5408;&#x90E8;&#x4F4D;&#x52B9;&#x7387;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x3001;&#x8EE2;&#x5199;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3001;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x6838;&#x9178;&#x306E;&#x30E2;&#x30C1;&#x30FC;&#x30D5;&#x306E;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x304C;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x30D8;&#x30EB;&#x30DA;&#x30B9;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x30D5;&#x30A1;&#x30DF;&#x30EA;&#x30FC;&#x5168;&#x4F53;&#x3067;SSR&#x306E;&#x3092;&#x898B;&#x3064;&#x3051;&#x3001;&#x5185;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x7CFB;&#x7D71;&#x9593;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306B;SSR&#x306E;&#x6700;&#x521D;&#x306E;&#x30B0;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D0;&#x30EB;&#x306A;&#x7279;&#x6027;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x79C1;&#x305F;&#x3061;&#x306F;&#x3001;&#x7CFB;&#x7D71;&#x9593;&#x306E;&#x8868;&#x73FE;&#x578B;&#x5909;&#x7570;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x308B;PRV&#x304A;&#x3088;&#x3073;HSV-1&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x83CC;&#x682A;&#x9593;&#x3067;SSR&#x306E;&#x9577;&#x3055;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x3092;&#x898B;&#x3064;&#x3051;&#x308B;&#x3002;&#x6700;&#x5F8C;&#x306B;&#x3001;&#x79C1;&#x305F;&#x3061;&#x306F;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C;&#x306E;&#x30D7;&#x30E9;&#x30FC;&#x30AF;&#x7CBE;&#x88FD;PRV&#x682A;&#x5185;&#x3067;&#x30DD;&#x30EA;&#x30E2;&#x30FC;&#x30D5;&#x30A3;&#x30C3;&#x30AF;&#x306A;&#x62E0;&#x70B9;&#x306E;&#x5C11;&#x6570;&#x3092;&#x691C;&#x51FA;&#x3057;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x591A;&#x578B;&#x306E;&#x901A;&#x8DEF;&#x3068;&#x30D7;&#x30E9;&#x30FC;&#x30AF;&#x7CBE;&#x88FD;&#x306E;&#x52B9;&#x679C;&#x3092;&#x7279;&#x5FB4;&#x3065;&#x3051;&#x308B;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306F;&#x3042;&#x3063;&#x3066;&#x3082;&#x5B89;&#x5B9A;&#x3057;&#x305F;DNA&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x682A;&#x3092;&#x30D7;&#x30E9;&#x30FC;&#x30AF;&#x7CBE;&#x88FD;&#x3059;&#x308B;&#x3068;&#x3001;&#x9650;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x4E0D;&#x5747;&#x4E00;&#x6027;&#x306F;&#x3001;&#x304A;&#x305D;&#x3089;&#x304F;&#x7A2E;&#x5B50;&#x5C06;&#x6765;&#x306E;&#x682A;&#x306E;&#x9032;&#x5316;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x6210;&#x9577;&#x306E;&#x8A3C;&#x62E0;&#x306B;&#x8FFD;&#x52A0;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

Alphaherpesviruses&#x306E;&#x6BD2;&#x6027;&#x3068;&#x30EF;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3;&#x682A;&#x306E;&#x9593;&#x306E;&#x3072;&#x305A;&#x307F;&#x306E;&#x591A;&#x69D8;&#x6027;&#x306E;&#x5E83;&#x3044;&#x7BC4;&#x56F2;

Alphaherpesviruses&#xC740; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC778;&#xAD6C;&#xC5D0; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD558; &#xAC8C; &#xD558; &#xACE0;&#xB294; 1 (HSV-1)&#xACFC; 2, &#xD5E4; &#xB974; &#xD398; &#xC2A4;&#xC758; &#xB2E8;&#xC21C; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xBC0F; &#xC218; &#xB450; &#xB300;&#xC0C1; &#xD3EC;&#xC9C4; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; (VZV). &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xC131; &#xBCD1;&#xC6D0; &#xCCB4; &#xC0C1;&#xD53C; &#xBCD1; &#xBCC0; &#xBC1C;&#xC0DD; &#xD558; &#xACE0; &#xD3C9;&#xC0DD; &#xB300;&#xAE30; &#xC2DC;&#xAC04;, &#xC7AC; &#xD65C;&#xC131;&#xD654;, &#xD655;&#xC0B0;&#xC744; &#xC77C;&#xC73C;&#xD0AC; &#xD558; &#xC2E0; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC744; &#xAC10;&#xC5FC;. &#xAD00;&#xB828;&#xB41C; &#xC218;&#xC758;&#xD559; herpesvirus, pseudorabies (PRV) &#xC0C1;&#xB2F9;&#xD55C; &#xACBD;&#xC81C;&#xC801; &#xC190;&#xC2E4;&#xC774; &#xBC1C;&#xC0DD;&#xD560; &#xAC00;&#xCD95;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBE44;&#xC2B7;&#xD55C; &#xC9C8;&#xBCD1;&#xC758; &#xC6D0;&#xC778;. &#xBC31;&#xC2E0; VZV &#xBC0F; PRV &#xC5ED;&#xD560; HSV-1 &#xBC31;&#xC2E0;&#xC758; &#xAC1C;&#xBC1C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC720;&#xC6A9;&#xD55C; &#xBAA8;&#xB378;&#xC744; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC804;&#xCCB4; &#xAC8C;&#xB188; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xBE44;&#xAD50; PRV &#xBC31;&#xC2E0; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC778; Bartha, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xB450; &#xAC1C;&#xC758; &#xC545;&#xC131; PRV &#xACA9;&#xB9AC;, &#xCE74; &#xD50C; &#xB780;&#xACFC; &#xBCA0; &#xCEE4;&#xC758; &#xD604;&#xC7AC;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xAC8C;&#xB188; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xB294; &#xB192;&#xC740; &#xCC98;&#xB9AC;&#xB7C9; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1; &#xBC0F; &#xC870;&#xB9BD;&#xACFC; &#xD3EC;&#xC720;&#xB958; alphaherpesvirus &#xBC31;&#xC2E0; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC778;&#xC758; &#xAC10;&#xC1C4;&#xC5D0; &#xD604;&#xC7AC; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xACB0;&#xC815; &#xD588;&#xB2E4;. PRV Bartha &#xC735;&#xD574; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC744; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558;&#xB294; &#xC545;&#xC131; &#xBCC0;&#xC885; &#xC0AC;&#xC774; &#xB9CE;&#xC740; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C0;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC740; &#xCF54;&#xB529; &#xCC28;&#xC774;&#xC810;&#xC744; &#xCC3E;&#xC744; &#xC218; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; Gh&#xC640; g b, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xB2E4;&#xB978; &#xC774;&#xC0C1; 40 &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xC131; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;. PRV &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; inter-strain &#xD3B8;&#xCC28; &#xC218;&#xC900; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xB9E4;&#xC6B0; &#xC548;&#xC815;&#xC801;&#xC778; VZV &#xD504;&#xB85C;&#xD14C;&#xC634;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xBCF4;&#xB2E4; HSV-1&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAD00;&#xCC30;&#xC5D0; &#xD6E8;&#xC52C; &#xAC00;&#xAE5D;&#xB2E4;. PRV &#xAC8C;&#xB188;&#xC758; &#xAC70;&#xC758; 20% &#xD0E0;&#xB364; &#xC9E7;&#xC740; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xBC18;&#xBCF5; (SSRs)&#xC758; &#xAE38;&#xC774; &#xBCC0;&#xD654; DNA &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8; &#xD6A8;&#xC728;&#xC131;, transcriptional &#xADDC;&#xC81C;, &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC758; &#xBCC0;&#xD654;&#xC640; &#xC5F0;&#xACB0; &#xB418;&#xC5B4; &#xD575; &#xC0B0; &#xBAA8;&#xD2F0;&#xD504;&#xC758; &#xD074;&#xB798;&#xC2A4;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC; SSRs herpesvirus &#xC81C;&#xD488;&#xAD70;&#xC5D0; &#xAC78;&#xCCD0; &#xCC3E;&#xC544; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4;, &#xB0B4;&#xBD80;&#xC640; &#xC885;&#xC790; &#xC0AC;&#xC774;&#xC5D0;&#xC11C; Ssrs&#xC758; &#xCCAB; &#xBC88;&#xC9F8; &#xAE00;&#xB85C;&#xBC8C; &#xD2B9;&#xC131;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xCC3E;&#xC744; SSR &#xAE38;&#xC774; &#xBCC0;&#xD615; PRV&#xC758; &#xB2E4;&#xB978; &#xACA9;&#xB9AC;&#xC640; HSV-1, &#xC885;&#xC790; &#xC0AC;&#xC774; phenotypic &#xBCC0;&#xD615;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB9C8;&#xC9C0;&#xB9C9;&#xC73C;&#xB85C;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xAC01; &#xD328; &#xC815;&#xD654; PRV &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC778;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB2E4;&#xD615; &#xAE30;&#xC9C0;&#xC758; &#xC801;&#xC740; &#xC218; &#xAC10;&#xC9C0; &#xD558; &#xACE0; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; polymorphisms&#xC5D0; &#xD1B5;&#xB85C; &#xD50C; &#xB77C;&#xD06C;-&#xC815;&#xD654;&#xC758; &#xD6A8;&#xACFC; &#xD2B9;&#xC9D5;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xCD94;&#xAC00; &#xC99D;&#xAC70; &#xC548;&#xC815;&#xC801;&#xC778; DNA &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xC758; &#xC8FC;&#xC2DD;&#xB3C4; &#xC0C1; &#xD328; &#xC815;&#xD654; &#xC804;&#xC2DC; &#xC81C;&#xD55C; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xAC00; &#xC9C8; &#xAC00;&#xB2A5;&#xC131;&#xC774; &#xC788;&#xB294; &#xBBF8;&#xB798;&#xC758; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC778; &#xC9C4;&#xD654; &#xC528;&#xC557; &#xC131;&#xC7A5;.

&#xC545;&#xC131; inter-strain &#xB2E4;&#xC591;&#xC131;&#xC758; &#xB113;&#xC740; &#xBC94;&#xC704;&#xC640; alphaherpesviruses&#xC758; &#xBC31;&#xC2E0; &#xBCC0;&#xC885;.

Herpesvirus alfa est&#xE1;n muy extendidos en la poblaci&#xF3;n humana, e incluyen el virus del herpes simplex 1 (HSV-1) y 2, y la varicela zoster (VZV). Estos pat&#xF3;genos virales causan lesiones epiteliales, y luego infectar el sistema nervioso que causa la latencia de toda la vida, la reactivaci&#xF3;n y expansi&#xF3;n. Un virus del herpes relacionado con veterinaria, pseudorrabia (PRV), causa una enfermedad similar en el ganado que se traducen en importantes p&#xE9;rdidas econ&#xF3;micas. Las vacunas desarrolladas para VVZ y PRV servir como modelos &#xFA;tiles para el desarrollo de una vacuna de HSV-1. Se presenta completo de comparaci&#xF3;n de secuencias del genoma de la cepa Bartha vacuna VLP, y dos cepas virulentas de PRV, Kaplan y Becker. Estas secuencias del genoma se determinaron mediante secuenciaci&#xF3;n de alto rendimiento y de reuni&#xF3;n, y presentar nuevas ideas sobre la atenuaci&#xF3;n de una cepa de la vacuna alphaherpesvirus mam&#xED;feros. Encontramos muchas diferencias de codificaci&#xF3;n previamente desconocidas entre PRV Bartha y las cepas virulentas, incluyendo cambios en el GH prote&#xED;nas de fusi&#xF3;n y GB, y m&#xE1;s de cuarenta otras prote&#xED;nas virales. Inter-deformaci&#xF3;n variaci&#xF3;n en las secuencias de prote&#xED;nas PRV es mucho m&#xE1;s cercano a los niveles observados anteriormente para el HSV-1 que para la gran estabilidad proteoma VZV. Casi el 20% del genoma PRV contiene repeticiones en t&#xE1;ndem cortas secuencias (SSR), una clase de motivos &#xE1;cidos nucleicos cuya longitud-la variaci&#xF3;n ha sido asociado con cambios en la eficiencia del sitio de uni&#xF3;n al ADN, la regulaci&#xF3;n de la transcripci&#xF3;n, y las interacciones de prote&#xED;nas. Encontramos SSR en toda la familia de los herpesvirus, y proporcionar la primera caracterizaci&#xF3;n global de la SSR en los virus, tanto dentro como entre las cepas. Encontramos variaci&#xF3;n RSS de longitud entre los diferentes aislamientos de PRV y el VHS-1, que pueden proporcionar un nuevo mecanismo para la variaci&#xF3;n fenot&#xED;pica entre las cepas. Finalmente, se detect&#xF3; un peque&#xF1;o n&#xFA;mero de bases polim&#xF3;rficas dentro de cada cepa de placa purificado PRV, y caracterizar el efecto de paso y la placa de purificaci&#xF3;n-en estos polimorfismos. Estos datos se a&#xF1;aden a la creciente evidencia de que incluso la placa-purificado de las poblaciones de virus de ADN estables presentan heterogeneidad de la secuencia limitada, lo que es probable evoluci&#xF3;n futura semillas cepa.

Una amplia extensi&#xF3;n del Inter-deformaci&#xF3;n diversidad en las cepas virulentas y la vacuna de herpesvirus alfa

Herpes simplex virus 1 (HSV-1) causes a chronic, lifelong infection in >60% of adults. Multiple recent vaccine trials have failed, with viral diversity likely contributing to these failures. To understand HSV-1 diversity better, we comprehensively compared 20 newly sequenced viral genomes from China, Japan, Kenya, and South Korea with six previously sequenced genomes from the United States, Europe, and Japan. In this diverse collection of passaged strains, we found that one-fifth of the newly sequenced members share a gene deletion and one-third exhibit homopolymeric frameshift mutations (HFMs). Individual strains exhibit genotypic and potential phenotypic variation via HFMs, deletions, short sequence repeats, and single-nucleotide polymorphisms, although the protein sequence identity between strains exceeds 90% on average. In the first genome-scale analysis of positive selection in HSV-1, we found signs of selection in specific proteins and residues, including the fusion protein glycoprotein H. We also confirmed previous results suggesting that recombination has occurred with high frequency throughout the HSV-1 genome. Despite this, the HSV-1 strains analyzed clustered by geographic origin during whole-genome distance analysis. These data shed light on likely routes of HSV-1 adaptation to changing environments and will aid in the selection of vaccine antigens that are invariant worldwide.

Evolution and diversity in human herpes simplex virus genomes.

We used paired-end Illumina deep sequencing and de novo assembly to determine the genome sequence of herpes simplex virus 1 (HSV-1) strain MacIntyre (aka McIntyre). The MacIntyre strain originated from the brain of a patient with lethal HSV encephalitis and has a unique limitation in its neuronal spread, moving solely in the retrograde direction.

Genome Sequence of the Anterograde-Spread-Defective Herpes Simplex Virus 1 Strain MacIntyre.

Herpes simplex virus (HSV) is a widespread pathogen that causes epithelial lesions with recurrent disease that manifests over a lifetime. The lifelong aspect of infection results from latent viral infection of neurons, a reservoir from which the virus reactivates periodically. Recent work has demonstrated the breadth of genetic variation in globally distributed HSV strains. However, the amount of variation or capacity for mutation within one strain has not been well studied. Here we developed and applied a streamlined new approach for assembly and comparison of large DNA viral genomes such as HSV-1. This viral genome assembly (VirGA) workflow incorporates a combination of de novo assembly, alignment, and annotation strategies to automate the generation of draft genomes for large viruses. We applied this approach to quantify the amount of variation between clonal derivatives of a common parental virus stock. In addition, we examined the genetic basis for syncytial plaque phenotypes displayed by a subset of these strains. In each of the syncytial strains, we found an identical DNA change, affecting one residue in the gB (UL27) fusion protein. Since these identical mutations could have appeared after extensive in vitro passaging, we applied the VirGA sequencing and comparison approach to two clinical HSV-1 strains isolated from the same patient. One of these strains was syncytial upon first culturing; its sequence revealed the same gB mutation. These data provide insight into the extent and origin of genome-wide intrastrain HSV-1 variation and present useful methods for expansion to in vivo patient infection studies.

Rapid genome assembly and comparison decode intrastrain variation in human alphaherpesviruses.

Advances in next generation sequencing make it possible to obtain high-coverage sequence data for large numbers of viral strains in a short time. However, since most bioinformatics tools are developed for command line use, the selection and accessibility of computational tools for genome assembly and variation analysis limits the ability of individual labs to perform further bioinformatics analysis.

Moriah L. Szpara

Department of Molecular Biology

Princeton University

Preparation of Viral DNA from Nucleocapsids

Differentiation of the SH-SY5Y Human Neuroblastoma Cell Line

Moriah L. Szpara

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Princeton University

Preparation of Viral DNA from Nucleocapsids

Differentiation of the SH-SY5Y Human Neuroblastoma Cell Line

Department of Molecular Biology