Controllo del Cluster iniziale delle cellule 3D in un ibrido Gel cubo dispositivo per reticolo ripetibile formazioni

Riepilogo

Presentiamo una procedura per controllare la forma di cluster iniziale delle cellule in una matrice extracellulare 3D per ottenere una formazione di reticolo ripetibile. Un dispositivo cubico contenente due diversi idrogeli è impiegato per realizzare multi-direzionale imaging per la formazione del reticolo di tessuto.

Abstract

L'importanza delle colture in vitro di 3D notevolmente è sottolineata nella coltura del tessuto e delle cellule. Tuttavia, la mancanza di ripetibilità sperimentale è una delle sue restrizioni. Producendo pochi risultati ripetibili di formazione di pattern si deteriora l'analisi dei meccanismi di auto-organizzazione. Ridurre la variazione in condizioni di coltura iniziale, come ad esempio la densità delle cellule e la distribuzione nella matrice extracellulare (ECM), è fondamentale per migliorare la ripetibilità di una cultura 3D. In questo articolo, dimostriamo una procedura semplice ma robusta per controllare la forma di cluster iniziale delle cellule in una matrice extracellulare 3D per ottenere formazioni reticolo altamente ripetibile. Un micromold con una forma desiderata è stato fabbricato utilizzando fotolitografia o un processo di lavorazione, e formava una tasca 3D in ECM contenuta in un cubo di gel ibrido (HGC). Le cellule altamente concentrate quindi sono state iniettate nella tasca affinché la forma di cluster di cellule abbinato con la forma di stampo fabbricato. Il lavoratore HGC ammessi multi-direzionale scansione dalla sua rotazione, che permetteva a imaging ad alta risoluzione e la cattura di struttura del tessuto intero anche se è stato utilizzato un basso ingrandimento lente. Cellule epiteliali bronchiali umane normali sono state usate per illustrare la metodologia.

Introduzione

Notevolmente è sottolineata l'importanza di una cultura 3D, che imita meglio ambienti biologici rispetto a una cultura 2D, in cellule/tessuti cultura^1,2,3. L'interazione tra cellule e matrice extracellulare (ECM) fornisce importanti indicazioni riguardanti la morfogenesi^4,5. Molti tessuti formazioni possono emergere solo in ambienti 3D, quali la piegatura processo^6,7, invaginazione⁸e formazione tubolare^9,10. Tuttavia, numerose difficoltà impediscono i ricercatori di spostamento agli esperimenti 3D da esperimenti 2D su un piatto. Una delle difficoltà principali in esperimenti di 3D è la questione dei campioni 3D imaging. Confrontati con gli esperimenti planari, acquisizione di immagini 3D appropriate è ancora difficile in molti casi. In particolare, ottenendo un'immagine 3D appropriata è un compito difficile quando la dimensione del campione raggiunge l'intervallo di millimetro a causa della grande profondità focale di lenti a basso ingrandimento. Ad esempio, la profondità focale raggiunge più di 50 µm quando una lente di ingrandimento di 10x è usato mentre la dimensione della cella singola è normalmente inferiore a 10 µm. Per migliorare la qualità delle immagini, sistemi di microscopia ad alta tecnologia sono in fase di sviluppo (per esempio, microscopia del due-fotone¹¹ e microscopia luce-foglio sistema¹²), ma la loro disponibilità è limitata a causa del loro prezzo costoso. In alternativa, in precedenza abbiamo sviluppato un ibrido gel cubo (HGC) dispositivo¹³. Il dispositivo è costituito da due tipi di idrogeli: agarosio come un gel di supporto e un ECM come il collagene o Matrigel come un gel di cultura. La HGC permette di raccogliere il campione durante la messa in coltura e ruotare il cubo per ottenere immagini multi-direzionale, che affronta il problema di profondità focale¹⁴.

Un'altra difficoltà in esperimenti di 3D è loro ripetibilità bassa a causa della scarsa controllabilità degli ambienti 3D. A differenza di una coltura planare su un piatto di plastica, variazioni delle condizioni di coltura iniziale si verificano facilmente in uno spazio 3D, circondato da un materiale morbido. Una variazione significativa nei risultati sperimentali si deteriora la seguente analisi e maschera i meccanismi di fondo. Molte tecnologie di ingegneria sono stati sviluppati per allineare spazialmente cellule singole, ad esempio multimateriali^15,16, fibra tessitura¹⁷e ponteggi¹⁸, ma richiedono pre-elaborazione complessa o specificamente apparecchiature progettate. Al contrario, abbiamo sviluppato una metodologia per realizzare l'allineamento di cella 3D in un HGC¹⁹.

In questo protocollo, abbiamo illustrato una procedura semplice con attrezzature comunemente usate per controllare la forma di cluster iniziale 3D delle cellule in un HGC. In primo luogo, il processo di fabbricazione dell'HGC è stato dimostrato. Quindi, micromolds fabbricato di fotolitografia o un processo di lavorazione sono stati collocati in HGC per produrre una tasca con una forma arbitraria a un ECM. Successivamente, cellule altamente dense dopo centrifugazione sono state iniettate nella tasca per controllare la forma di cluster iniziale delle cellule nel HGC. Il cluster precisamente controllata delle cellule potrebbe essere imaged da molte direzioni a causa della HGC. Cellule (NHBE) di epiteliali bronchiali umane normali sono state usate per dimostrare il controllo della forma di cluster iniziale delle cellule e la formazione immagine dei rami da più direzioni per migliorare la qualità delle immagini.

Protocollo

1. fabbricazione di dispositivo ibrido gel cubo

1. Preparare un telaio cubico di policarbonato (PC) tramite un processo di lavorazione o una stampante 3D. La dimensione del telaio PC dipende la dimensione del campione. In questo studio, abbiamo utilizzato un telaio di 5 mm su ciascun lato affinché i rami avevano spazio sufficiente per allungare durante la coltura.
2. Posizionare il telaio del PC su una lastra di vetro pre-raffreddata o un'altra superficie liscia in una scatola di ghiaccio (< 0 ° C) (Figura 1A).
3. Aggiungere 12 µ l di pre-riscaldata agarosio al 1.5% (p/v) dalla faccia superiore del telaio cubico alla superficie inferiore con una pipetta. Corsa la pipetta affinché l'agarosio si diffonde per creare una superficie piana (Figura 1B).
4. In pochi minuti, l'agarosio sarà guarito. Ritirare il telaio PC facendolo scorrere al bordo del vetrino con una pinzetta. Si noti che verticalmente, raccogliendo il telaio dal vetrino può provocare lo scollegamento di agarosio dal telaio cubico a causa della forza di attrazione tra l'agarosio e il vetrino (Figura 1).
5. Ruotare la cornice di cubica per rendere il viso aperto verso il basso e poi posto su nuovamente la lastra di vetro (Figura 1).
6. Ripetere i passaggi 1,3 – 1,5 tre superfici sono pieni di agarosio (Figura 1E).
7. Per formare un muro di agarosio sui volti di quarto e quinto, cada l'agarosio da un viso aperto (Figura 1F). Una volta che una parete dell'agarosi è formata sulla Quinta faccia, la preparazione dell'HGC è completata.

2. fabbricazione di micromolds di fotolitografia o un processo di lavorazione

1. Fabbricazione di fotolitografia
   1. Pulire un wafer di silicio (Si) tramite lavaggio ad ultrasuoni con acetone, alcool isopropilico (IPA), poi distillata (DI) di acqua per 5 minuti ciascuno. Dopo azoto che soffia la cialda Si con azoto, disidratare in forno a 140 ° C per 20 min (Figura 2A(i)).
   2. Spin-cappotto uno strato sacrificale come LOR e Az resiste sul wafer Si (2.000 giri/min, 30 s) utilizzando un spin-coater sotto luce gialla. Immediatamente dopo il rivestimento per rotazione, riscaldare la cialda su un piatto caldo a 90 ° C per 3 min (Figura 2A(ii)). Lo spessore desiderato dello strato sacrificale è più di 1 µm, affinché l'ascensore fuori processo possa essere eseguito facilmente, ma non è necessario uno spessore preciso.
   3. Posizionare la cialda su un piatto caldo a 70 ° C e quindi un foglio di spessore photoresist negativo di laminato con lo spessore desiderato sullo strato sacrificale con rullo a mano (Figura 2A(iii))
   4. Cinque minuti dopo la laminazione, posizionare la cialda su un aligner maschera per esposizione ai raggi UV. Impostare un photomask con il modello desiderato il fotoresist foglio ed esporre con luce UV per una durata di tempo appropriato. Il tempo di esposizione è determinato dallo spessore di photoresist e l'intensità della luce UV. Successivamente, inserire la cialda su un piatto caldo per una post-esposizione di cuocere in forno a 60 ° C per 5 minuti, seguito da cottura a 90 ° C per 10 min (Figura 2A(iv))
   5. Sviluppare un photoresist negativo immergendo la cialda in propilene glicole monometil etere acetato (PGMEA) fino a quando l'area non esposta è completamente sciolto (circa 20 min) (Figura 2A(v)).
   6. Sciogliere lo strato sacrificale utilizzando IPA per la pulizia ad ultrasuoni per sollevare la microstruttura. Una volta che la microstruttura è sbucciata fuori da wafer, sciacquare con acqua DI pulizia ad ultrasuoni per 10 min (Figura 2A(vi)).
   7. Immergere lo stampo in 30 µ l del polimero MPC per 30 min a temperatura ambiente (circa 20 ° C) per asciugarlo completamente. Figura 2B Mostra lo stampo fabbricato prisma.
2. Fabbricazione di uno stampo cilindro
   1. Realizzare uno stampo cilindro d'acciaio con dimensione desiderata da un processo di lavorazione. In alternativa, utilizzare commercialmente disponibili in acciaio inox. (In questo studio, un cilindro di 600 µm φ è usato.)
   2. Immergere l'acciaio cilindro in 30 µ l del polimero MPC per 30 min a temperatura ambiente (circa 20 ° C) per asciugarlo completamente.
   3. Preparare il liquido polidimetilsilossano (PDMS) mescolando base resina e il catalizzatore (Vedi Tabella materiali) in un rapporto di 10:1 seguito da degasaggio con un vuoto degasaggio sistema per 20 min. Poi versare il PDMS in una piastra a 12 pozzetti.
   4. Impostare il cilindro d'acciaio perpendicolare alla superficie di riferimento e fissa su una z-fase lineare così che può essere inserito perpendicolarmente sulla superficie di PDMS non polimerizzato in un 12-pozzo-targhetta posizionata sulla stessa superficie datum spostando il z-stage. Incubare il PDMS con l'acciaio del cilindro in un forno per 20 min a 90 ° C per la polimerizzazione. Tagliare il PDMS per formare una superficie di fianco, in modo che la pipetta può essere inserita nel seguente processo (Figura 2).

3. controllo della forma di cluster iniziale delle cellule in un idrogel

1. Iniettare un ECM appropriato per la cultura di cella desiderata, come il collagene e artificiale della membrana dello scantinato, il HGC per riempire lo spazio di cultura (Figura 3A).
2. Impostare il micromold fabbricato sull'HGC direttamente o indirettamente con un supporto adeguato, come mostrato nella Figura 3B. Successivamente, posizionare il HGC in incubatore a CO₂ per 25 min a 37 ° C per curarlo.
3. Sollevare delicatamente il micromold modo che l'ECM non si deteriora (Figura 3). La tasca, come la forma di stampo desiderato, sarà fabbricata in ECM.
4. Raccogliere le cellule dal piatto colta di tripsina-EDTA o il suo equivalente a seconda dei tipi di cella. Successivamente, centrifugare le cellule per ottenere cellule altamente concentrate (per cultura NHBE, applicare 0,25% tripsina-EDTA e incubare le cellule per 3 min, quindi neutralizzare con FBS-contenente medio e centrifugazione a 300 x g per 4 minuti).
5. Dopo centrifugazione, rimuovere il surnatante medium per condensare le cellule e iniettare le cellule altamente concentrate (3,0 × 10⁴ cellule / µ l per le cellule NHBE) nella tasca in ECM (Figura 3D).
6. Incubare il HGC con cellule in incubatore a CO₂ per 20 min a 37 ° C affinché le cellule cadono nella tasca ECM per riempire lo spazio creato dal micromolds. Se sono presenti sulla superficie superiore medio eccessivo o cellule, rimuovere con cautela usando una pipetta.
7. Posizionare il HGC su una piastra a 24 pozzetti e aggiungere 100 µ l di terreno appropriato (Figura 3E). Per le celle NHBE, utilizzare una miscela di 1:1 di mezzo disponibile nel commercio specializzato per NHBE e cellule endoteliali (Vedi Tabella materiali).
8. Iniettare ulteriori ECM per chiudere la tasca in ECM e poi incubare a 37 ° C per 25 min.
9. Raffreddare preriscaldato agarosio al 1.5% a temperatura ambiente (circa 20 ° C). Goccia circa 10 µ l di agarosio sulla superficie superiore dell'HGC per chiudere la superficie e impedire la caduta fuori il HGC durante imaging (Figura 3F) e coltura di ECM. Quindi, incubare la HGC per un altro 20 min a 37 ° C per curare l'agarosio.
10. Aggiungere il terreno per coprire l'intero HGC in modo che la pressione osmotica può contribuire a fornire la nutrizione per le cellule dentro il HGC.

4. multi-direzionale imaging

1. Riconoscimento di forme 3D non invasiva tramite osservazione multi-direzionale
   1. Posizionare la piastra di coltura o ben piastra contenente il HGC su un microscopio e orientare il HGC al telaio della macchina fotografica. Quindi, ottenere un'immagine di esempio di contrasto di fase o campo luminoso.
   2. Pick up e ruotare il HGC per posare una superficie diversa.
   3. Ripetere i passaggi 4.1.1 e 4.1.2 immagini da tutti i sei lati sono ottenuti.
2. Formazione immagine di immuno-fluorescenza di osservazione multi-direzionale
   1. Per il fissaggio, applicare paraformaldeide al 4% al campione sopra HGC a temperatura ambiente (circa 20 ° C) per 20 min, seguito da due risciacqui di PBS per 10 minuti ciascuno.
   2. Permeabilize le HGC con PBS contenente 0.5% Triton X-100 per 10 min a 4 ° C, poi lavare 3x per 10 min con PBS.
   3. Incubare il HGC con 10% siero di capra nel tampone IF (0,2% Triton X-100, 0,1% di albumina di siero bovino e 0.05% Tween-20 in PBS) per 60 min a temperatura ambiente per un passaggio di blocco primario.
   4. Per la colorazione di una molecola specifica, utilizzare l'anticorpo appropriato. Per osservare la geometria della cella collettiva, Alexa Fluor 488 falloidina può essere utilizzato per colorare l'actina.
   5. Posizionare il HGC su un piatto fondo di vetro sotto un microscopio laser o fluorescenti ed eseguire la scansione da sei lati per ottenere l'immagine dell'intero campione.

Risultati

Cellule (NHBE) di epiteliali bronchiali umane normali sono state utilizzate per dimostrare la metodologia illustrata e controllare la geometria iniziale delle cellule collettiva per ottenere la forma di un cilindro e una forma di prisma, rispettivamente in un ambiente di ECM. Vengono presentati i risultati di imaging multi-direzionali ottenuti dal contrasto di fase, nonché falloidina macchiatura della forma di un cilindro (fig. 4AB) e la for...

Discussione

Il metodo presentato in questa carta è semplice e può essere eseguito senza attrezzature ad alta tecnologia. Contemporaneamente, un risultato di controllo cella precisa forma cluster nello spazio 3D di idrogel è ottenibile. Dopo il controllo iniziale, le cellule possono crescere nel HGC tanto quanto sono coltivate su un piatto. L'imaging multi-direzionale viene eseguita ruotando il campione con l'HGC utilizzando qualsiasi sistema di microscopia, e migliora significativamente la qualità delle immagini. La scelta dei m...

Materiali

Name	Company	Catalog Number	Comments
12-well-plate	Corning  Inc.	3513
2-Methoxy-1-methylethyl Acetate	FUJIFILM Wako Pure Chemical Co.	130-10505	PGMEA, CAS: 108-65-6
4% paraformaldehyde	FUJIFILM Wako Pure Chemical Co.	161-20141	CAS: 30525-89-4
Agarose, low gelling temperature  BioReagent	Sigma-Aldrich	A9414
Alexa fluor 488 phalloidin	Thermo Fisher Scientific	A12379
AZ1512	Merck
BEGM bullet kit	Lonza	CC-3170	Specialized medium for NHBE cells
Bovine Serum Albumin solution (10 %)	Sigma-Aldrich	A1595
EGM-2 bullet kit	Lonza	CC-3162	Specialized medium for endothelial cells
Lipidure	NOF co.		MPC polymer
Matrigel growth factor reduced basement membrane matrix	Corning  Inc.	354230
Normal Goat Serum (10%)	Thermo Fisher Scientific	50197Z
Normal human bronchial epithelial cells	Lonza	CC-2541
SILPOT 184 W/C	Dow Corning Co.	3255981	Base resin and catalyst for PDMS
SUEX D300		DJ MicroLaminates, Inc	Thick negative photoresist (thichness: 300 mm)
Triton X-100 (1%)	Thermo Fisher Scientific	HFH10
Trypsin-EDTA (0.25%)	Thermo Fisher Scientific	25200056
TWEEN 20	Sigma-Aldrich	P9416