Arricchimento di mRNA e preparazione della libreria bisolfito-mRNA per il sequenziamento di nuova generazione

Questa ricerca ha lo scopo di studiare il ruolo della metilazione dell'RNA, in particolare la modificazione della 5-metilcitosina, nel cancro del pancreas. Le domande a cui vogliamo rispondere sono come la sovraregolazione o la sottoregolazione di alcune metiltransferasi dell'RNA influenzi i fenotipi delle cellule tumorali e anche attraverso quali substrati dell'RNA. Questo studio fornisce il panorama completo dell'RNA m5C a una risoluzione a base singola con apparecchiature standardizzate.

Da questo studio che utilizza bisolfito RNA seq, i risultati collegano l'associazione della modifica dell'RNA m5C con la scarsa differenziazione delle cellule tumorali. Ciò dovrebbe aprire la strada a studi futuri per discernere gli effetti del passeggero rispetto al driver della malattia di m5C specifici nei trascritti dell'RNA. Con questa tecnica, possiamo identificare l'insieme di RNA differenzialmente metilati che possono partecipare alla progressione del tumore.

Inoltre, gli esperimenti di base a singola molecola possono fornire un ruolo regolatorio più dettagliato dell'RNA specifico m5C.