Il nostro obiettivo è quello di fornire alla comunità accademica uno strumento che faciliti la preparazione e la simulazione utilizzando la dinamica molecolare. È possibile fornire questo obiettivo nella nostra applicazione web? È possibile per un principiante usarlo in modo efficace?

Cerchiamo di rispondere a queste domande con il nostro software. Ci sono molte sfide nella dinamica molecolare. Tra questi spiccano la preparazione nella parametrizzazione dei ligandi, la curva di apprendimento delle linee guida per la simulazione, il tempo di simulazione e l'implementazione di nuove analisi.

Stiamo principalmente affrontando la curva di apprendimento per iniziare la ricerca nella creazione di una pipeline segreta per guidare tutti gli utenti, dai principianti agli avanzati. L'elevata domanda di accesso a questo strumento dimostra una lacuna nella ricerca bioscientifica. Riteniamo che lo sviluppo di questo strumento rappresenti un progresso significativo nell'uso e nell'apprendimento della dinamica molecolare.

Di conseguenza, più persone saranno in grado di implementare questi test nella loro ricerca. In futuro, intendiamo espandere la parametrizzazione e l'esecuzione di simulazioni complesse con più campi di forza.