ヒトとマウスにおける脳室周囲の組織の側脳室および組織学的特性の3次元モデリング

要約

Using MRI scans (human), 3D imaging software, and immunohistological analysis, we document changes to the brain’s lateral ventricles. Longitudinal 3D mapping of lateral ventricle volume changes and characterization of periventricular cellular changes that occur in the human brain due to aging or disease are then modeled in mice.

要約

The ventricular system carries and circulates cerebral spinal fluid (CSF) and facilitates clearance of solutes and toxins from the brain. The functional units of the ventricles are ciliated epithelial cells termed ependymal cells, which line the ventricles and through ciliary action are capable of generating laminar flow of CSF at the ventricle surface. This monolayer of ependymal cells also provides barrier and filtration functions that promote exchange between brain interstitial fluids (ISF) and circulating CSF. Biochemical changes in the brain are thereby reflected in the composition of the CSF and destruction of the ependyma can disrupt the delicate balance of CSF and ISF exchange. In humans there is a strong correlation between lateral ventricle expansion and aging. Age-associated ventriculomegaly can occur even in the absence of dementia or obstruction of CSF flow. The exact cause and progression of ventriculomegaly is often unknown; however, enlarged ventricles can show regional and, often, extensive loss of ependymal cell coverage with ventricle surface astrogliosis and associated periventricular edema replacing the functional ependymal cell monolayer. Using MRI scans together with postmortem human brain tissue, we describe how to prepare, image and compile 3D renderings of lateral ventricle volumes, calculate lateral ventricle volumes, and characterize periventricular tissue through immunohistochemical analysis of en face lateral ventricle wall tissue preparations. Corresponding analyses of mouse brain tissue are also presented supporting the use of mouse models as a means to evaluate changes to the lateral ventricles and periventricular tissue found in human aging and disease. Together, these protocols allow investigations into the cause and effect of ventriculomegaly and highlight techniques to study ventricular system health and its important barrier and filtration functions within the brain.

概要

上衣細胞単層系脳脊髄液（CSF）と間質液^（ISF）1-3との間で双方向のバリア及び輸送機能を提供する脳の脳室系。これらの機能は、脳が毒物を含まない、生理バランス^2,3で維持するのに役立ちます。ヒトでは怪我や病気を通してこのライニングの部分の損失は他の上皮ライニングに見られるような、再生、交換をもたらすように表示されません。むしろ上衣細胞カバレッジの損失は、心室表面における上衣細胞の無欠陥領域を覆う星状細胞の網目構造と脳室周囲アストログリオーシスをもたらすと思われます。重要CSF / ISF交換やクリアランス機構に深刻な影響は、この上皮層^1,2,4-7の喪失に起因すると予測されます。

人間の老化の共通の特徴は、側脳室（脳室）とobservなどの関連する脳室周囲の浮腫を拡大していますMRIおよび流体弱毒化反転回復MRI（MRI / ^FLAIR）8-14により編。脳室と心室ライニングの細胞組織との関係を調べるために、死後の人間のMRIシーケンスは、側脳室の脳室周囲組織の組織学的調製物と一致しました。脳室拡大例では、神経膠症の実質的な領域は、側脳室の壁に沿って上衣細胞カバレッジを交換していました。心室拡張がMRIベースのボリューム分析によって検出されなかった場合には、上衣細胞のライニングは無傷であったとグリオーシスは心室ライニング⁶に沿って検出されませんでした。このコンビナトリアルアプローチは、部分のホールマウントの準備や全体の側脳室の壁と心室容積⁶の3Dモデリングを使用して、側脳室のライニングの細胞の完全性の変化を詳細に最初の包括的なドキュメントを表します。いくつかの疾患（アルツハイマー病、統合失調症）、および外傷（外傷性脳損傷）初期の神経病理学的特徴として脳室拡大を示します。上衣細胞ライニングの領域の裸出は、それによって、通常の上衣細胞機能を妨害し、CSF / ISF流体と溶質交換機との間の恒常性バランスを損なうことが予測されるであろう。したがって、脳室系への変更の、より精密検査、その細胞組成、およびその下または隣接する脳構造の結果は、最終的に心室肥大に関連した神経病理の詳細を明らかにするために開始されます。

一緒に組織学的組織サンプルを対応へのアクセスが制限されたマルチモーダルイメージングデータの不足、特に縦方向のデータ列には、人間の脳の病理の解析を困難にします。ヒトの老化や病気に見られるモデリングの表現型は、多くの場合、マウスモデルを用いて達成することができ、動物モデルは、ヒト疾患の開始および進行についての質問を探検するために最善の手段の一つになります。でいくつかの研究健康な若いマウスは、側脳室の壁の細胞構築とその下の幹細胞ニッチ^4,7-15を記載しています。これらの研究は、高齢化^6,15を介して3Dモデリングおよび心室壁の細胞分析を含むように拡張されています。マウスは比較的堅牢subventicularゾーン（SVZ）は、無傷の上衣細胞ライニング^6,15に細胞ニッチの下にある幹表示むしろ脳室周囲グリオーシスも脳室のいずれもが、老齢マウスで観察されます。このように、印象的な種特異的な違いは^、6,15の老化過程における側脳室のライニングの一般的なメンテナンスと整合性の両方に存在します。したがって、ヒトで見られる条件を調べるための最良の使用マウスに、2種間の違いは、任意のモデリングパラダイムを特徴とし、適切に考慮される必要があります。ここでは、人間とMの両方で側脳室および関連する脳室周囲組織に長手方向の変化を評価するための手順を提示しますウーズ。私たちの手順は、細胞、組織と構造の両方を特徴づけるために、3Dレンダリングとマウスおよびヒトの心室の両方の容積測定、および脳室周囲組織の全載標本の免疫組織化学的分析の使用を含みます。一緒にこれらの手順は、脳室系の変化と関連する脳室周囲の組織を特徴付けるための手段を提供します。

プロトコル

注：動物の手順はIACUCコネチカット大学によって承認され、NIHガイドラインに準拠しました。ヒト組織およびデータ分析や手順が遵守していたし、コネチカット大学IRBによって承認され、NIHガイドラインに準拠しています。

1.マウス：側脳室の脳室周囲細胞の完全性と3Dモデリングの分析

マウス側脳室の壁のホールマウントの1.1）準備

1. 免疫組織化学（IHC）のために、マウス側脳室全体のマウントの準備は前に^16,17を説明しました。

側脳室の分析のための1.2）免疫組織化学

1. 以前に^18,19に記載されているように、マウスの脳組織を修正してください。
   1. 室温、4％パラホルムアルデヒド、続いて経通常、室温の生理食塩水で簡単に説明すると、フラッシュマウス、臓器がクリアするまで（淡い着色で示されています）、組織までの0.1 Mリン酸緩衝生理食塩水で（PFA）（PBS）が硬直しています。
   2. 頭蓋骨から脳を削除します。矢状縫合に沿って頭蓋底からカットするアイリス解剖ハサミを使用してください。
   3. 頭蓋骨を露出させ、ピンセットで脳を削除します。一晩4℃で、4％PFA固定液で脳を浸し。そしてPBSで20分間3回洗浄します。
2. 免疫組織化学およびボリューム分析のための連続切片を準備します。
   1. 顕微メスを用いて、浮遊切片を免疫染色する際に右半球から左半球の同定を可能にするために、左半球の皮質に沿って縦方向に小さな切開を行います。
   2. ビブラトーム切片中に添加し、構造的支持のために、3％アガロースで固定脳を包みます。蒸留水でウォーム3％アガロース（w / vで）完全になるまで電子レンジやホットプレートのいずれかを使用して溶解しました。
   3. かみそりの刃で、と小脳で脳の尾部を除去冠状カットでも、平坦な表面を残します。組織ステージに瞬間接着剤を適用し、上向きに嗅球で新たに切断面に脳を置きます。
   4. 液体アガロース溶液が触れないようにちょうど暖かい温度に冷却したとき、完全に脳全体を包むために、脳の上に均等に適用されます。アガロースが固化することができます。
   5. セクションでは、アガロース順序を維持するためにPBSを含む24ウェルプレートにシリアルに置かセクションで、50μmの切片にビブラトームに冠脳を包ま。
      注：一般的に12ウェルは、ウェルA1から始まる側脳室の出現を見B6に通って数値的に移動するとバックA1にサイクリングの前に5つのセクションを開始する組織の集まりで、1脳のために使用されています。これは、同じ脳から複数の識別可能なセクションでは、同一ウェル内で処理することができます。側脳室の容積の分析のために、組織採取時には、側脳室停止しましたSと第3脳室は、ウェルまたは36のセクションの総当たり約3つのセクションで、その結果、マージします。
   6. フローティングのセクションでは、誤って吸引されていないことを確認するために、20〜200μlのマイクロピペットチップを貼付トランスファーピペットを用いてPBSを吸引します。ブロックし、室温で1時間、PBS（PBS-TX）10％血清、0.1％トリトンX-100（TX）中に浮遊切片を透過します。 24ウェルプレート中で自由に浮遊組織切片をカバーし、揺動板上のセクションの全てのインキュベーションを行うために、ウェルあたりの溶液300μLを使用してください。
   7. 4℃でブロッキング溶液を吸引し、PBS-TXで一晩（少なくとも12時間）で一次抗体と共に切片をインキュベートします。冠状切片を用いて、心室容積のトレースについては、上衣細胞を標識するために、抗S100β抗体を使用しています。
   8. 吸引一次抗体溶液、およびPBS-TXで切片を10分間3回ずつ洗浄します。
   9. 部屋のテンペラで1時間、暗所でのセクションをインキュベート1の濃度で蛍光二次抗体とトゥーレ、10％血清、PBS-TX 1,000。残りのすべてのインキュベーションステップ、暗所でのセクションを保持。
   10. 吸引二次抗体溶液を、5分間、細胞核を対比染色するためにPBS中に4 '、6-ジアミジノ-2-フェニルインドール（DAPI、を10μg/ ml）で切片をインキュベートします。 DAPI溶液を吸引除去し、PBSで10分間3回ずつのセクションをすすぎます。
   11. 右半球の向きに対して左を維持するために皮質のマークを使用して、スライド上に直列マウントセクション。次いで空気乾燥し、暗所でのセクションとスライドに取り付けメディアの薄い層を適用することにより、カバースリップし、穏やかに上にカバーガラスを配置します。カバースリップスライドを室温で一晩乾燥することができます。

3D再建のための1.3）側脳室のセグメンテーション

注：直立エピ蛍光microscoにマッピングソフトウェアを使用して、側脳室のトレースを実行します蛍光検出のための自動化されたステージとデジタルCCDカメラでPE。

1. 蛍光顕微鏡装置の電源をオンにし、蛍光モードでマッピングソフトウェアを起動します。開く」表示オプションは、「トレースのために必要な適切なツールバーとドッキングツールパネルをロードします。オプション>表示オプション>アクセサリ、および「メイン​​」と「マーカー」ツールバーを選択します。同じメニューでは、下にある「カメラヒストグラム」、「マルチチャンネル·コントロール」、「カメラ設定」、および「画像取得」を選択して「ドッキングツールパネル」。
2. 側脳室を裏打ちする上衣細胞を標識する強力なS-100βの蛍光に基づいて、心室の始まりを確認します。側脳室を含む組織の最初の部分を特定します。
3. 新しいデータファイルを作成し、左側脳室上記の画像ウィンドウ内をクリックしてステージ移動の基準点を指定します。小さな探し切開は右半球から左配向します。シリアル再構成のための輪郭をインポートするときに役立つように、ファイルをトレース全体の側脳室への相対的な一貫性のある場所に基準点にしてください。
4. 例えば 、ドロップダウンメニューから適切なプリセット輪郭輪郭の種類を選択し「左側脳室を」。左右の側脳室の追跡のそれぞれについて、固有の色を使用してください。輪郭名と色の変更が必要な場合は、「輪郭タイプを追加 '次に、輪郭の色の名前を変更するか選択し、[オプション]> [表示設定]> [輪郭に移動します。
5. 「左側脳室」輪郭が選択した状態で、トレース輪郭を開始し上衣ライニングの頂端面に沿ってクリックします。頂端面に沿って連続してクリックし続けることで心室をトレースします。
   1. より多くの技巧を必要とする不規則な分野については、クリックして、フリーハンドを追跡するために、マウスの左ボタンを押したままにします。 Ctrlキーを押しながらZ、または行くTOオプション>は、前の輪郭点を元に戻す元に戻します。画面の輪郭点をオフにすることと、ウィンドウが自動的にセンタリングすることを可能にすることによって、矢印キーを使用するか、トレースウィンドウを移動します。右クリックを追跡する心室を終了し、[閉じる輪郭」を選択します。
6. ドロップダウンメニューを使用して、右側脳室のための新たな輪郭の色（輪郭タイプ）を選択します。左のためのステップ1.3.4のように右心室をトレースします。
7. 輪郭名と色の変更が必要な場合は、右の輪郭をクリックして、適切な色を選択するために、変更輪郭タイプを選択します。
8. 3D再構成用のシリアル輪郭を整列させるのを助けるために正中線に沿ってマーカーを追加します。マーカーを追加するには、左側のマーカーツールバーから適切なマーカーを（ 'X'を使用）を選択し、トレース画面にドロップする]をクリックします。各組織切片トレースの輪郭と一緒にインポートマーカー。
9. 組織トレース、[ファイル]> [保存]を保存するにはデータファイルとして、新しいフォルダとファイル名を作成します。番号追跡[スライド＃] - [組織＃]連続切片からのトレースを簡単に識別するため。例えば、第2のスライド上に第3の組織切片は、各脳のディレクトリ内のファイル名 '2-3'を有します。
10. 繰り返して、心室壁の付着の領域を除いて、脳全体を通して心室をトレースする脳組織の各シリアルセクションの1.3.9に1.3.4をステップ実行します。
11. 心室は、接着部位にそれらの背側と腹側から接着、サブセグメント前方領域の領域を持っている場合。各心室のための2つの新しい輪郭型を作成します（ 例えば 、「背左心室」と「腹左心室'）。接着性を有する第一の組織切片上で、完全な心室再構築を作成することができることを確認するために、元の側脳室の輪郭と新しい背と腹の輪郭の両方で側脳室をトレースします。
12. セクションでventriclに後方Eの壁面付着、各心室（ 例えば 、「後部左心室'）の後部のための新たな輪郭の色のセットを作成します。現在の密着性と新しい後部の輪郭タイプの両方で、この第1の再接合部をダブルトレースします。

1.4）側脳室3D再構成

1. 3D再構成し、ボリュームデータを生成するために、マウス側脳室のシリアル輪郭追跡を合わせて、コンパイルします。
2. 3D再構成プログラムを開きます。 [ファイル]> [開く]をクリックし、最初のトレースのシリアルセクションの輪郭ファイルを選択します。左と右心室の輪郭追跡ならびに任意の追加のマーカーをインポートします。
3. 輪郭を選択するには、「オブジェクトの選択」ボタン（カーソルのアイコン）をクリックして、「Ctrlキー」を保持することにより、2つの心室とのマーカーを選択します。右クリックして選択し、輪郭のZ位置を確立するために、「Z位置を変更します」。 0μmの最初の組織切片を設定します。
<李は>復興として、[ファイル]> [保存データファイルを保存します。間違いが行われた場合、回復は、再ロードする前のファイルを同じように簡単になるように、すべてのファイルをインポートした後に保存します。
4. 復興に次の組織切片を追加するには、表示する追加> [ファイル]をクリックします。付加する.DATファイルを選択し、「マージ」チェックボックスをオンにします。
5. 再び新しくインポートしたトレースファイルのZ位置を調整するステップ1.4.3に従ってください。他のトレースの移動を回避するには、メインウィンドウで新しく追加された左右の輪郭だけを選択します。 50μmのセクションの前輪郭線のZ位置から50μmの連続する各トレースファイルを設定します。 （1番目の輪郭、Z = 0、第2等高線：Z = 50、第三の輪郭：などのz = 100）
6. 選択した輪郭とマーカーのX、Y位置を調整するには、以前の組織の輪郭に合わせてボタン "マウスで翻訳を有効にする」と輪郭をドラッグをクリックします。選択した現在のトレースの左右輪郭の両方を保ちます同期移動を可能にします。
7. トレースは正中線マーカーをラインアップするために時計回りまたは反時計回りに回転するには、「Z軸回転」ボタンを選択します。 、右クリックして、インポートされた輪郭とマーカーの両方を選択し「設定された回転角度」を選択し、「Y回転」に「180」と入力します（左輪郭が右にある場合）、Y軸を横切る輪郭を反転します。
8. 心室と中線マーカーは最高のステップ1.4.4のように、再構成ファイルを保存する前に整列していることを確認してください。
9. 手順を繰り返し、後続の各組織切片のための1.4.9に1.4.5をすべてインポートし、適切に整列されるまで。
10. シリアル復興のボリュームデータを表示するには、分析>「マーカーをし、地域分析」クリックして、「3D等高線の概要」を選択します。左側のパネルですべての輪郭を選択し、最終的な3次元再構成を表示する「3D可視化」ボタンをクリックします。

2.ヒト：側脳室の脳室周囲細胞の完全性の分析と3次元モデリング

2.1）ヒトMRIデータ解析

注：プロトコルは、3D画像再構成と側脳室の容積の定量化を作成し、縦方向のオーバーレイ解析を使用して、時間をかけて体積変化を評価するために記載されています。これは、データを含めると^20を設定するための非常に重要な基準であるMRデータ収集（ 例えば 、機械と磁石の強さ、切片厚、配向および解像度）とポスト取得処理でその整合性に留意することが重要です。

1. 心室セグメンテーション
   注：ITK /スナップ高分解能T1加重MR画像からセグメントに心室に使用されています。あるいは、Freesurferのような他のフリーウェアを使用することができます。
   1. ITK /スナップ、[ファイル]> [開く]グレースケール画像を開きます。 .niiファイル（NITFIファイル）として所望のファイルとオープンを選択します。
   2. 各アナトをスクロールomical面、注目に心室の異常（狭窄領域、大きいか小さい一時的なホーン、 など ）。メインツールボックスで「スネークROIツール」をクリックします。 「セグメント3D]をクリックします。 「強度領域」オプションを選択します。
   3. 「プリプロセスイメージ」をクリックします。白でROIを強調するために、特定の強度閾値以下の領域を含むように、「上」を選択します。スライドバーを使用して最大強度を記録します。最大強度（レコードこの値）の15％にしきい値を設定します。 10.「OK」をクリックし、次に「次へ」を平滑化パラメータを設定します。
   4. 前方正面の角に2つ、7は、側脳室体の上面に沿って等間隔で、後頭部ホーンの1との時間的なホーンの1：10〜12小（サイズ2）は、各心室に「バブル」を追加します側脳室。 「選択パラメータ 'と0.4に湾曲力を設定します。アクティブ輪郭進化を開始するプレイ記号をクリックします。
   5. 表面を可視化するために「更新メッシュ]をクリックします。 「自動アップデート」をご確認ください。側脳室のすべての領域を関心領域（ROI）に含まれている場合にセグメンテーションを停止します。第三脳室の混入を避けます。 「完了」をクリックします。
   6. 以下の方法で望ましくない領域を除去するために、必要に応じて手動で画像を編集する（典型的には、第三脳室の漏れを消去する必要があります）。手動で余分な領域を削除するか、または手動でROIを越える混入を消去するアクティブな図面のラベルとして「クリアラベル」と「ペイントブラシ」ツールを使用する「3Dメス」ツールを使用します。
   7. .nii画像（ 'NIFTI'ファイル形式）として分割結果を保存します。
   8. 総心室容積を得るためには、「セグメンテーション>ボリューム 'と統計を選択します。セットカラーラベルを使用して、心室の総容積を得ます。
2. MRIScansから側脳室の長手方向の表現
   注：使用しますマンゴーソフトウェアは、長手方向のROIを定性的および定量的に経時的に被験者内心室体積の変化を示すために重ねられます。
   1. マンゴーを開きます。 GREENのように[ファイル]> [最初のROI時点（ベースライン）のロードROIをクリックします。 [ファイル]> [REDとして第2のROI時点の負荷ROI。ファイルを選択することにより、長手方向のオーバーレイを保存>として保存します。 ' - [秒時点の年齢] .niiファイル名_ [第1の時点の年齢]」として各画像を割り当てます。
   2. ITK-SNAPを開きます。画像>組み合わせROIファイルからセグメンテーション>ロード]を選択して、「グレースケール画像」として組み合わせROIを再度開きます。縦ボリュームデータを取得するには、次のコマンドを実行します。セグメンテーション>ボリュームと統計情報]> [ラベル1（赤）は膨張容積を=。ラベル2（緑）=狭窄ボリューム。ラベル3（青）=ベースボリューム。

2.2）ヒト脳室周囲の組織調製および分析

1. ヒト組織を操作するための安全対策注意事項
   1. appropを取得riate安全教育（ 例えば 、血液媒介病原体コース）。
   2. 標準（ユニバーサル）安全上の注意事項を守ってください。手袋を着用してください。使い捨てではない任意の一般的な機器や表面に触れる前に手袋を変更します。 「ヒト組織の使用」の名称でヒト組織での作業時に日常扱うすべての項目にラベルを付けます。
   3. ヒト組織と接触するすべてのアイテムの除染慣行に従ってください。 （ 例えば、鉗子）漂白剤に浸したタオル（ 例えば 、ベンチトップ）または漂白剤で直接オブジェクトを配置することによって汚染された表面を処理、処分前に24時間の最小値のため、すべての汚染された液体を漂白。
   4. 漂白剤で紙タオルを浸し患部（5〜10分）に保持含むことができる皮膚に直接ヒト組織と接触するためのコンティンジェンシー·プランを準備します。
   5. ヒト組織に接触し、すべての項目のための適切な廃棄物処理を使用してください。
2. 側脳室全体のマウントの準備
   1. B無傷の半球（10％ホルマリンで固定し、0.1 M PBSで十分に洗浄）でeginning、大きなナイフを使用して半球全体を通して1.5センチメートル厚の冠状切片をスライス。
      注：すべての固定プロトコルは、従来の抗体の確認が必要です。
   2. ラベルのセクションでは、フロント側脳室を含む最初のセクションで始まるバックアップします。番号（トップダウン）と文字（後部に前方）およびサブセク​​ションでスライスを標識、英数字ラベリングシステムを使用してください。上衣表面を破壊することは避けてください。
   3. 顕微メスを用いて、全体の横方向の壁のための1つの連続した​​部分を維持し、1センチメートル深い心室壁を分析。よく染色するために適切なサイズのセクションを作成するために、必要に応じて壁を分割。心室壁の反対側の切り欠き部は、上/下方向を特定します。
   4. ダブルboileを用い10~20分間、100℃で、10mMのクエン酸ナトリウム緩衝液（pH6.0）中で組織切片をインキュベートすることによって抗原回復を実行しますR（最適なインキュベーション時間は、経験的に決定されます）。 PBS / 0.1％トリトンX-100（PBS-TX）で3回洗浄します。
   5. 室温で1時間、PBS / PBS-TXを用いて、10％ウマ血清でブロック。
   6. 4℃で48時間、一次抗体でインキュベートします。マウス抗βカテニン（1：250）心室壁のライニングを可視化するために、免疫染色の全体は、以下の抗体の組み合わせを用いてマウントし、ヤギ抗GFAP（1：250）。ウサギ抗AQP4（1：400）。
   7. 暗闇の中で、後続のすべての手順を実行します。二次抗体（1：500）と共にインキュベートし、PBS中で組織を3回リンスし、4℃で24時間または室温で2時間インキュベートし、そしてPBSでさらに3回洗浄します。 PBSでさらに3回のすすぎに続いて室温で7分間DAPIで組織をインキュベートします。
   8. パラフィルムでワックスボトムディッシュを覆うことによって、最終的な解剖のために組織を準備します。 、微細な鉗子を使用して皿の中の組織を置く上衣壁に接触することを回避、PBSで皿を埋めます。
   9. 解剖顕微鏡下で、しっかりとSECUその側使ってピン上の組織再。 22.5°顕微刺すナイフで、側脳室の壁の均一な薄切片（約厚さ300μm）を作成します。難しい曲率を持つ大規模なセクションまたはセクションでは、場所を装着し、ノートの最終セクションに切断する前に、より小さな立方体にカット。
   10. 慎重に、微細な鉗子を使用して、スライド上に地域の位置と向きをメモを取るまでスライド上に解剖セクション上衣側に配置します。気泡を避けるように注意しながら、aquapolymountの薄い層で組織をカバーしています。組織の上にカバーガラスを置き、カバーガラスの下で任意のギャップを埋めるために、必要に応じて追加aquapolymountを追加します。
   11. 室温で2〜3日間暗所とドライに搭載されたセクションを配置します。 4℃でslideboxで保管してください。
3. 免疫組織化学および組織学的分析
   1. 利用Oによって決定されるように、蛍光免疫組織化学を表示するために、共焦点顕微鏡を使用して、心室表面における撮像焦点面を設定しますFのβカテニン（上衣細胞の頂端接着結合タンパク質のマーカー）。上衣セルカバレッジ及び表面アストログリオーシス（心室表面におけるGFAP染色）の領域の輪郭を描きます。
   2. 全体心室表面文書にし、モンタージュ、全面を覆うように重なり合う画像を使用しています。連続画像のモンタージュを作成するには、Adobe Photoshopのを開きます。必要に応じて手動で調整をする、オーバーレイする画像を選択するには、ファイル>自動処理> Photomergeの>インタラクティブレイアウトを使用してください。
   3. 無傷の上衣細胞のカバレッジまたは心室面グリオーシスの漫画の表現を生成するモンタージュをトレースするために、新しいレイヤーを作成します。各スライドまたはROIについて、この手順を繰り返します。 MRI再構成上の領域を対応する心室壁やリンクのマップを再構築するためにすべてのセクションをコンパイルします。

結果

免疫染色50μmの冠状切片と3次元再構成（ 図3）に基づいて、マウス側脳室の輪郭追跡は、ボリュームデータは、病気やけがのためのモデル系としてマウスを使用して、異なる実験パラダイムに収集することができるようになります。この手順に重要な側脳室の壁が互いに付着領域の除外です。心室の領域をsubsegmenting各領域（ 図3C）のために別の色を指定することによ...

ディスカッション

我々は、マウスおよびヒトにおいて、脳の脳室系の完全性を評価するために使用できるツールおよびプロトコルを提示します。これらのツールは、しかし、また^、14,21,22または^老化プロセス中に損傷、疾患に起因する変化を受ける他の脳構造または器官系にも適用することができます。戦略は断面および縦MRI配列のアラインメントは、特定の領域または対象の構造の3次元体積...

資料

Name	Company	Catalog Number	Comments
Phosphate buffered saline (PBS)	Life Technologies	21600-069
Paraformaldehyde (PFA)	Electron Microscopy Sciences	19210	Use at 4% in PBS, 4 °C
Normal Horse Serum	Life Technologies	16050	10% in PBS-TX (v/v)
Normal Goat Serum	Life Technologies	16210	10% in PBS-TX (v/v)
Triton X-100 (TX)	Sigma-Aldrich	T8787	0.1% in PBS (v/v)
Vibratome	Leica	VT1000S
Fluorescence Microscope	Zeiss	Imager.M2
Camera	Hamamatsu	ORCA R2
Microscope Stage Controller	Ludl Electronic Products	MAC 6000
Stereology software	MBF Bioscience	Stereo Investigator 11
Stereology software	ImageJ/NIH	NIH freeware
3D Reconstruction software	MBF Bioscience	Neurolucida Explorer
Confocal Microscope	Leica	TCS SP2
MRI Software
Freesurfer	https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/DownloadAndInstall	Segmentation and Volume
ITK-Snap	http://www.itksnap.org/pmwiki/pmwiki.php		Segmentation and Volume
Multi-image Analysis GUI (Mango)	http://ric.uthscsa.edu/mango/		Longitudinal overlay
Whole Mount Equipment
22.5° microsurgical straight stab knife	Fisher Scientific	NC9854830
parafilm
wax bottom dissecting dish
pins
fine forceps
aquapolymount
Dissecting Microscope	Leica	MZ95
Whole Mount Antibodies
mouse anti-b-catenin	BD Bioschiences, San Jose, CA, USA		1:250
goat anti-GFAP	Santa Cruz Biotechnology		1:250
rabbit anti-AQP4 (aquaporin-4)	Sigma-Aldrich		1:400
Coronal Antibodies
Anti-S100β antibody	Sigma-Aldrich		1:500
4’,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI)	Life Technologies	D-1306	10 µg/ml in PBS