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ここでは、最適化された FlashPack キャピラリーカラムパッキング手順のプロトコルを紹介します。一般的な100バー圧力爆弾セットアップに最適化されたプロトコルを適用することで、長い超高性能キャピラリーカラムの10倍のパッキングと製造が可能になります。
キャピラリー超高性能液体クロマトグラフィー(UHPLC)は、現在、LC-MSベースプロテオミクスにおけるサンプル分離工程に選択される方法です。ただし、キャピラリーカラムは、その高いフローカウンタータイプに比べてはるかに堅牢ではありません。汚染やブロッキングが容易なため、交換が必要な場合が多い。これにより、LC-MS 分析コストの大幅なコストが大幅に高くなります。UHPLC毛細管柱の社内梱包は、多くのお金を節約し、カスタマイズすることができます。しかし、100棒圧力爆弾の標準的な梱包手順はHPLCカラムに対してのみ有効ですが、UHPLC吸着剤には遅すぎます。ここでは、同じ100バー圧力爆弾の設定に適用される最適化されたFlashPackプロトコルの説明を提供します。この方法は、超高吸着剤濃度スラリーからのパッキングに基づいており、合理的な時間で無制限の長さのUHPLCキャピラリーカラムの社内製造のために開発されています。
現代のプロテオミクスは、液体クロマトグラフィー結合質量分析法に基づいており、超高性能ナノフロークロマトグラフィー(50〜150 μmカラム内径(ID))分離により、最良の分析速度と感度1を提供する。多数の市販のUHPLCキャピラリーカラムが利用可能ですが、特に複数の多様なプロジェクトが実験室で実行され、プロジェクト固有のカラム汚染が頻繁に問題となっている場合、その価格は消耗品コストの大部分を占めています。また、列を社内で梱包することで、カスタム実験専用の吸着剤(例えば、polyCAT-A吸着剤2)や、既製カラムとして購入できないカラム特性を使用できます。
それに対処するために、多くの研究所はキャピラリーカラムを社内に詰め込んでいます。しかし、100棒圧力爆弾(圧力注入電池)3 を用いた一般的な充填手順は、2μm以下のUHPLC吸着剤の高い背圧によるUHPLCカラムパッキンに適していないため、大型のHPLC吸着剤と比較して劇的な充填率低下を生じる。短いUHPLCカラムはまだ非常にゆっくりと詰め込むことができますが、長いUHPLCカラムの製造は物理的に不可能です4.
標準的な毛管コラムの詰め物は100までの棒まで比較的低い圧力で、そして非常に低い吸着スラリーの集中で行われる。したがって、プロセスを高速化する2つの可能な方向が利用可能です。充填圧力5を高くすることができる。しかし、これは特別な装置を必要とし、実際には、実験室で新しい方法のインストール。もう一つの方法は、吸着スラリー濃度6を増加させることである。高い吸着スラリー濃度パッキングは、前の出版物7で超高いパッキング圧力と組み合わせて説明される。しかし、既存の梱包爆弾のほとんどで使用されている100バー圧では、より高い吸着剤濃度は、充填率が遅くなるか、またはあからさまな梱包停止につながります。この効果は、最近、カラムの入り口での吸着剤のクラスタリングによるものであることが実証され、吸着バイアル内に磁石バーを持つ柱の入り口を叩いて吸着性のキューポラ不安定化の簡単なトリックが示唆された4。FlashPack という名前の方法は、同じ 100 棒圧爆弾のパッキング設定を使用します。同時に、パッキング手順のマイナーだが重大な変化は、非常に高い吸着スラリー濃度からのパッキングを可能にし、非常に長いUHPLCカラム(50〜70cm、および長い)を1時間未満で製造し、短いカラムは同じパラメータ4の商業カラムに等しい分離品質で数分で製造することができる。FlashPackアプローチは、逆相(RP)8、9、10、11、12、13、14および親水性相互作用(HILIC)2毛管柱の両方の調製のために、すでに複数のプロテオミクスプロジェクトで使用されています。
ここでは、FlashPackアプローチを標準の100バー圧力爆弾梱包手順に適応させるために必要な変更について詳しく説明します。
梱包プロトコルは5つのステップ(図1):1)パッキングステーションの準備、2)毛管調製、3)吸着スラリー製剤、4)圧力爆弾内のキャピラリーパッキング、および5)HPLCシステム内のカラムパッキングで構成され、サイズとUHPLC接続の設置に切り取られます。FlashPack 最適化では、共通プロトコルと比較してセクション 3 および 4 で調整を行う必要があります。
1. パッキングステーションアセンブリ
2. 毛細血管製剤
3. ソルベントスラリー製剤
4. 圧力爆弾でキャピラリーパッキング
注意:圧力爆弾を使用する場合は、常に保護メガネを着用してください。手袋をはめないでください。これらは、小径の毛細血管の適切な取り扱いに必要な触覚を著しく低下させ、間違いにつながります。
5. HPLC カラムのパッキング
FlashPack アプローチは標準のパッキング設定に基づいており、同じパッキングパイプラインに従います。パッキングは標準的なフリットまたは引っ張られたエミッタの毛細管に行われる。主な最適化は吸着スラリー濃度にあります:標準的な方法はFlashPackで使用される高濃度の吸着剤懸濁液と互換性がありません。結果は、長いUHPLCカラムの高速生産方法、例えば、1.9μmの吸着剤を1h未満で50cm長く詰めたカラム(図2)である。
FlashPackアプローチの応用例を示すために、30cm 100 μm IDキャピラリーカラムを用意しました(表6)。ReprosilPur C18 1.9 μmの吸着剤のパッキングは、P2000レーザープーラーによって調製された50 cm長い100 μm ID引き出されたエミッタキャピラリーに60バーで行われました。毛細管は40分で〜40cmに詰め込まれ、毛細管の中にもう少し緩い吸着剤が残った。パックされたキャピラリーは、HPLCシステムに接続され、溶媒B(80%アセトニトリル、0.1%FA)で300 nL /分で実行されました。5 sの超音波処理の2ラウンド後、最終的なパックされた長さは43センチメートルでした。カラムを切断し、30cmに切断し、UHPLC接続を使用してHPLCシステムに接続した。私達は360 μmのノースリーブのPEEKナットフェルールおよび360 μmのステンレス鋼の組合を日常的に使用する。この組み合わせは、強く締め付けた場合、少なくとも700バーまで保持します。製造カラムは、期待値範囲と一致する2%溶媒Bで520バーのバックプレッシャを有しており、これは期待値範囲と一致している(表5)。
カラム効率のデモンストレーションとして、製造された30cmカラムを用いて、シトクロムCタンパク質のトリプティック消化器の50fmolを2%から50%Bに15分の勾配で分離し、抽出されたイオンクロマトグラムは最小テーリングで極めて対称性のピークを示した。平均FWHMは約3s(図3)でした。
表1:カラムの高い作業バックプレッシャのトラブルシューティングこのテーブルをダウンロードするには、ここをクリックしてください。
表2:P2000/Fレーザープーラープログラム.P2000/Fレーザープーラープログラムは、360 μm ODから引っ張られたエミッタ毛細血管の調製のための 360 μm ID 融合シリカポリイミドコーティングキャピラリを室温で内部コーティングせず 23-25 °C この 表をダウンロードしてください。
表 3: FlashPack 固有のパッキングの問題と、パッキング処理中に制御するチェックポイント。このテーブルをダウンロードするには、ここをクリックしてください。
表 4: 異なるカラムIDおよび長さの例示的なパッキングおよび作業流量。このテーブルをダウンロードするには、ここをクリックしてください。
表5:2 μ m球状の吸着剤を詰め込んだカラムの予想バックプレッシャは、RTのRP溶媒システムで(列IDに従って)作業流量で実行されます。
表6:30cm UHPLCカラムの例示的なパッキング。このテーブルをダウンロードするには、ここをクリックしてください。
図1:キャピラリーカラムのパッキング方式 ステージ1~3は準備段階で、次いで圧力爆弾の梱包が完了し、HPLCのパッキングで仕上げられます。ステージ 3 と 4 は、超効率的な FlashPack プロトコル用に変更されています。 この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
図2:メタノール100バーでReprosilPur C18 AQ 1.9 μmのフリットキャピラリー100 μm IDの充填率を示 します。
図3:シトクロームCのトリプティックペプチドのイオンクロマトグラムを抽出した。 シトクロムCのトリプティックペプチドの抽出されたイオンクロマトグラムは、長さ30cmの100mm IDで50fmolを分離した後、バッファーBの勾配でReprosilPur C18 AQ 1.9μmを詰めたキャピラリーカラムを引き出した(80%アセトニトリル、 0.1%FA)および緩衝A(2%アセトニトリル、0.1%FA)で15分で2%から40%B、RTで500nL/分で検出を行い、質量分析計を用いて行った。各ペプチドの絶対強度および抽出されたm/z範囲は、スペクトルの右側に示されています。 この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
社内キャピラリーカラムパッキングは、複数の独立したプロジェクトに取り組む大規模な研究所で非常に人気があります。しかし、低濃度の吸着剤懸濁液からの一般的な充填方法は、速度に大きな制限があり、長いUHPLCカラムを生成することができません。
FlashPackは、非常に高い吸着剤濃度から梱包を可能にする標準的な梱包手順の変更です。この方法の理論的基礎は、全体の梱包期間の柱入口での連続吸着性キューポラ不安定化にあります。後者は、磁石バーで連続的に打たれる列の入り口によって技術的に達成される。キューポラの不安定化の方法は、一般的な梱包プロセスと完全に類似した梱包設定を持つために意図的に開発されていますが、FlashPackのトリックは、充填プロセス中の吸着スラリー製剤、毛管位置、およびマグネットバーの使用の詳細にあります。
この吸着スラリーは、大きな溶媒容積で沈着剤の吸着層として調製される。圧力爆弾ベースの梱包は、列から列に同じ梱包条件を必要としないことは興味深いです。FlashPackでは、列の入り口の周りの正確な吸着スラリー濃度は決してわかりません。梱包プロセス中にも変化するため、正確に測定および制御することは不可能です。しかし、最終的な列は、梱包がどのように達成されたかに関係 なく、まだ非常に再現可能です。
速いパッキングのための基礎は有効な吸着のキューポラ不安定化にある。そのため、毛細管に入る吸着剤を制御し、全体の充填期間全体にわたって最適なキューポラ不安定化条件を維持することが重要です。効率的な吸着物の配信を妨げる可能性のある問題がいくつかあります。これらの幾つかの例は、高速磁気棒回転による吸着層リサスペンション、マグネットバーの位置決めに対する誤った相対毛細血管またはあまりにも遅いマグネットバー回転に起因する非効率的なキューポラ不安定化である。問題自体と、その対処方法については、プロトコルのセクションで詳しく説明します。
列がパックされた後、チェックする主要な列パラメーターは列の背圧です。 表5 に示す圧力値は、一般的なサブ2 μmビーズサイズの吸着剤-ReproSil PUR C18 AQ(1.9 μm)の1つに期待されるものの基準点を提供します。同時に、追加のバックプレッシャは、フリットまたはあまりにも狭く引っ張られたエミッタによって追加され、1つは常にそれを監視する必要があります。充填が引かれたエミッタに入る場合、我々はまだ最初にフリットキャピラを詰めることによって使用されている特定の吸着剤のための期待されるカラムの背圧を測定し、次に自己組立フリットが過剰に追加されるかどうかを確認することを提案する。高圧的な問題については、 表 1 に示すガイドラインを使用して問題を特定します。
私たちの経験では、変色、ギャップ、および適切なバックプレッシャのないパックされたカラムは、ケースの100%で動作し、カラム長さと吸着特性から期待されるものに近い分離品質を与えます。変色を伴う列は、正常に動作するとは限りませんが、満足のいく結果を得ることができます。
ほとんどの場合、分離品質に問題がある場合、それらはカラム自体からではなく、分離システムの他の部分、すなわちポンプ、溶剤、または接続から来ています。特に、列後の接続は、特に有害な可能性があります。エミッタとフリットカラムの間のデッドボリュームとの接続が悪いと、毛細管クロマトグラフィーの流量が非常に低いため、大きなピークの広がりとテーリングにつながります。
FlashPack アプローチに特有のもう 1 つの重要な問題は、作業用の吸着スラリーバイアルに高価な吸着剤を多く使用することです。フラッシュパックの吸着スラリーは、複数の使用を意図していることを覚えておいてください。吸着剤の世話をします。不要なマグネットバーの攪拌を避けて、充填が終了したらすぐに回転を止め、吸着剤の粉砕を減らしてください。そして、吸着剤の乾燥を避けるために圧力爆弾に開いた吸着剤バイアルを残さない。その後も吸着剤は使用できますが、吸着スラリーのリメイクには時間がかかります。
この方法は、フリット毛細血管とプルドエミッタ毛細血管の両方に対して同様にうまく機能します。FlashPack の原則は、キャピラリー ID のパッキング率を 20 ~ 250 μm に増やします(小さく、より大きくテストされていません)。また、完全かつ表面的に多孔質の全ての吸着剤にも適用可能であり、我々は試験することができる(高い吸着スラリー濃度における吸着剤の形成は、RP吸着剤に特に限定されない)。また、溶媒パラメータは、物理的および化学的特性に応じて、明確にパッキングに影響を与えます。例えば、粘性の低いアセトンは、同じパッキング圧力でメタノールよりも高い充填率を与えます。しかし、メタノールよりも極性が低く、互いに付着する吸着剤粒子も減少します。それ自体で、流量が高いときに梱包の初めに吸着性のキューポラ形成を防ぐことができます。しかし、吸着剤粒子相互作用の減少はまた、信頼性の低い自己アセンブルフリット形成および充填中のより頻繁なプルドエンドブロッキングをもたらす。したがって、アセトンはフリットキャピラリーのパッキングに適していますが、プルドエミッタキャピラリーには適していませんが、スラリー溶媒としてのメタノールは遅くなりますが、両方のタイプの結末に適しています。ヘキサンやジクロロメタン(DCM)からのパッキングは、メタノールからアセトンに切り替える極端なケースです:彼らはさらに少ない極性であるため、吸着性キューポラの形成を完全に防ぎますが、プルドエミッタパッキングには全く適していません。また、極度の低いDCM極性は、内部キャピラリー壁に付着し、その上に厚い層を作る吸着粒子につながることに留意された。層の厚さが徐々に大きくなり、ランダムなローカルブロックが形成され、その結果、列は、吸着のない領域で区切られたいくつかの部分に詰め込まれます。このような効果は、C18ペプチド・エーリス・吸着剤に対して観察された。
もう一つの観察された問題は、YMCトリアートC18の吸着剤がメタノールで適切に懸濁されていないが、何らかのフレークを形成することであった。しかし、それはFlashPackでパックされ、非常にまともな分離効率(未公開のデータ)を与えることを妨げるものではありません。したがって、いくつかのケースでは最適ではありませんが、メタノールは、テストされたすべての吸着剤およびカラムに対して最も普遍的な溶媒でした。スラリー溶媒の違いがカラム分離効率に与える影響を分析していないということは、まだ明示する必要があります。同時に、メタノールから詰め込まれたカラムの効率は、すでに同じ吸着剤4の商用カラムと完全に等しい。
UHPLC カラムの充填率を向上させる既存のアプローチは、FlashPack だけではありません。超高圧パッキング7の使用により、高い吸着スラリー濃度からの高速梱包も可能です。FlashPackの利点は、吸着剤の送達と毛細血管接続のための特別な超高圧ポンプと圧力爆弾を必要としないため、はるかに簡単です。同時に、極圧で詰め込まれたカラムは、低圧パックカラム17よりも高い分離効率を有することが実証された。また、FlashPack は比較4で使用される商用列と同じ列を生成していますが、パッキング方法はわかりませんが、FlashPack カラムが超高圧パック列に対してどのように立ち向かうのかはまだテストされていませんでした。
要約すると、説明されたFlashPackメソッドは、セットアップが完全に同じままで、プロトコルにいくつかの調整を加えて、実験室内の既存のパッキングプロトコルに簡単に適応させることができます。HPLCキャピラリーカラムのパッキングを数分にスピードアップし、標準のパッキング手順では明らかに不可能である長いUHPキャピラリーカラムの生産を可能にします。FlashPackアプローチの適用による実験室のための時間とお金の全体の経済は、年間数万ユーロで数えることができます。さらに、UHP毛細血管柱をローカルに生産する能力は、利用可能な商用製品では不可能な実験カスタマイズの可能性を開きます。
著者らは、競合する財政的利益はないと宣言している。
この作業は、RSF助成金20-14-00121によってサポートされました。著者らは、P.V.シュリアハ(メモリアルスローンケタリングがんセンター)に実りある議論に感謝しています。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Acetonitrile with 0.1% (v/v) Formic acid | Merck | 1.59002 | |
centrifuge tube 1.5 mL | Eppendorf | ||
Ceramic Scoring Wafer | Restek | 20116 | any ceramic wafer is suitable for capillary polishing |
Diamond-chip bladed scribe | NewObjective | Diamond-chip bladed scribe | recommended for capillary cutting |
fused silica capillary 100 mm ID 375 mm OD | CM Scientific | TSP100375 | |
GELoader tips | Eppendorf | 30001222 | |
HPLC system | ThermoScientific | Ultimate3000 RSLCnano | |
laser puller | Sutter | P2000/F | |
magnet bar 2x5 mm | Merck | Z283819 | |
MeOH | Merck | 1.06018 | |
microspatula | Merck | Z193216 | |
PEEK ferrule 360 mm | VICI | JR-C360NFPK | use to connect the column to UPLC union |
pipette tip, 1000 uL | Merck | Z740095 | |
pipette, 1000 uL | Gilson | Pipetman L P1000L | |
pressure bomb | NextAdvance | PC-77 MAG | |
regulator | GCE | Jetcontrol 600 200/103 | |
Reprosil Pur C18 AQ 120 1.9 mm | Dr. Maisch | r13.aq.0001 | |
Screw cap tubes without caps, conical bottom, self-standing, 0.5 mL | Merck | AXYST050SS | |
Screw cap tubes without caps, conical bottom, self-standing, 1.5 mL | Merck | AXYST150SS | |
Screw caps with O-rings | Merck | AXYSCOC | |
sonication bath | Elma | Elmasonic S30 H | |
union HPLC | VICI | JR-C360RU1PK6 | HPLC connection from 1/16 OD HPLC capillary to 360 um capillary column |
union UPLC | VICI | JR-C360RU1FS6 | UPLC connection from 1/16 OD HPLC capillary to 360 um capillary column |
vortex | BioSan | V-1plus | |
Water with 0.1% (v/v) Formic acid | Merck | 1.59013 |
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