単核RNA-seqおよびATAC-seqのための新鮮な凍結脳腫瘍からの核分離

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06:22 min

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August 25th, 2020

DOI :

10.3791/61542-v

August 25th, 2020

•

Ashwin Narayanan¹, Enrique Blanco-Carmona², Engin Demirdizen¹, Xueyuan Sun¹^,³, Christel Herold-Mende⁴, Matthias Schlesner², Sevin Turcan¹

¹Neurology Clinic and National Center for Tumor Diseases, University Hospital Heidelberg, ²Bioinformatics and Omics Data Analytics, German Cancer Research Center (DKFZ), ³Clinical Cooperation Unit Neurooncology, German Cancer Research Center (DKFZ), ⁴Division of Experimental Neurosurgery, Department of Neurosurgery, University of Heidelberg, INF 400, Heidelberg, Germany

要約

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162 snRNA seq snATAC seq 10x

この動画の章

0:04

Introduction

1:01

Tissue Dissection and Dissociation

3:20

Gradient Centrifugation and Isolation of Nuclei

4:56

Results: Comparison of UMIs and Genes Obtained from Different Human Brain snRNA-seq Datasets

5:57

Conclusion

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