シングルセル分解能でのエピゲノムおよび遺伝子発現プロファイリングのためのマウス心臓前駆細胞からの核分離(英語)

このプロトコルの主な目的は、心臓の発達と先天性心疾患へのそれらの寄与の文脈における遺伝的要因と環境要因の相互作用を研究することです。一核RNA-seqや一核運動失調などの単核アプローチは、心臓の発達中の健康と病気における細胞の不均一性を研究するための重要な方法として浮上しています。これらの実験の制限ステップの1つは、すべてのサンプルを同時に実行する必要があることです。

すべての実験条件で作業している間、すべての条件に対して同時に十分に新鮮な材料を収集することは困難な場合があります。近年、シングルセルの分野では大きな進歩がありましたが、主な困難は無料サンプルの処理です。困難を回避することは、先天性心疾患の欠陥の根底にある分子メカニズムを特定するために非常に有益です。

このプロトコルでは、マウス胚から得られた凍結心筋細胞懸濁液から高品質の核を正常に単離するための手順について説明します。また、私たちのプロトコルは、下流の一核RNA-seqおよび一核運動失調と互換性があります。この手順が関心のある研究者に役立ち、この強力な方法を研究に使用することを奨励することを願っています。