光学的光熱赤外蛍光In Situハイブリダイゼーション(OPTIR-FISH)

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04:07 min

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February 23rd, 2024

DOI :

10.3791/66562-v

February 23rd, 2024

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Zhongyue Guo*¹, Yeran Bai*²^,³, Fátima C. Pereira⁴, Ji-Xin Cheng¹^,⁵

¹Department of Biomedical Engineering, Boston University, ²Neuroscience Research Institute, Department of Molecular, Cellular, and Developmental Biology, University of California Santa Barbara, ³Photothermal Spectroscopy Corp., ⁴School of Biological Sciences, University of Southampton, ⁵Department of Electrical & Computer Engineering, Photonics Center, Boston University

文字起こし

私たちの研究範囲は、OPTIR-FISHを開発・応用して個々の細胞を特定し、その代謝をシングルセルレベルで解析することです。私たちは、個々の細胞が複雑な環境の中でどのように相互作用するかを理解し、その生理機能や道筋を理解することを目指しています。個々の細胞レベル、特に天然環境における代謝を解析することで、生体システムの不均一な複雑な活動を明らかにするための貴重な洞察が得られる可能性があります。

しかし、細胞の同一性を分化することと、単一細胞レベルでの代謝を解明するという同時進行の課題は依然として課題です。当社の高度な振動イメージングプラットフォームである光学光熱赤外は、シングルセル代謝の研究を提供します。同時に、微生物種の同定のために、確立された森林のin situハイブリダイゼーションと自然に高い適合性があります。

したがって、簡単な統合により、代謝と同定を同じイメージング解像度で同時に行うことができます。

要約

ここでは、光学的光熱赤外蛍光 in situ ハイブリダイゼーション(OPTIR-FISH)、別名中赤外光熱魚(MIP-FISH)を使用して、個々の細胞を特定し、その代謝を理解するためのプロトコルを紹介します。この方法論は、単一細胞分解能による細胞代謝のマッピングなど、さまざまなアプリケーションに幅広く適用できます。

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この動画の章

0:00

Introdution

1:10

Hybridizing Bacterial Cells with Oligonucleotide Probe Labeled with a Fluorophore Using Fluorescence In Situ Hybridization (FISH)

2:34

Sample Preparation for OPTIR‐FISH to Probe Glucose Metabolism in Bacterial Communities

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